1WCSA

A mutant of trypanosoma rangeli sialidase displaying trans-sialidase activity
Total Genus 151
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
151
sequence length
634
structure length
628
Chain Sequence
AASLAPGSSRVELFKRKNSTVPFEESNGTIRERVVHSFRIPTIVNVDGVMVAIADARYETSFDNSFIETAVKYSVDDGATWNTQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYILVGSFNKTRNYWTQHRDGSDWEPLLVVGEVTKSAANGKTTATISWGKPVSLKPLFPAEFDGILTKEFVGGVGAAIVASNGNLVYPVQIADMGGRVFTKIMYSEDDGNTWKFAEGRSKFGCSEPAVLEWEGKLIINNRVDYNRRLVYESSDMGKTWVEALGTLSHVWTNSPTSNQPDCQSSFVAVTIEGKRVMLFTHPLNLKGRWMRDRLHLWMTDNQRIFDVGQISIGDENSGYSSVLYKDDKLYSLHEINTNDVYSLVFVRLIGELQLMKSVVRTWKEEDNHLASICTPVVPAACGAAVPTAGLVGFLSHSANGSVWEDVYRCVDANVANAERVPNGLKFNGVGGGAVWPVARQGQTRRYQFANYRFTLVATVTIDELPKGTSPLLGAGLEGPGDAKLLGLSYDKNRQWRPLYGAAPASPTGSWELHKKYHVVLTMADRQGSVYVDGQPLAGSGNTVVRGATLPDISHFYIGGPRSKGAPTDSRVTVTNVVLYNRRLNSSEIRTLFLSQDMIGTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A Sialidase Mutant Displaying Trans-Sialidase Activity
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Trypanosoma rangeli
molecule keywords SIALIDASE
total genus 151
structure length 628
sequence length 634
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2004-11-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1wcsA02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 1wcsA01
4NO4A 5GZDA 1QF3A 2F0ZA 4NC5A 1GKBA 2E7QA 4M4NA 4B7QA 1QMJA 2ZBJA 1W21A 2ZABA 5GM0A 1E8UA 4BQ1A 3VKOA 3MEPA 3B3QE 4BLJA 2UWBA 3TIAA 1G86A 1FNYA 3CL2A 1KQRA 3AXEA 2HU0A 2A6WA 2CY6A 4AVSA 3GVJA 4MJUA 4D69A 3FBYA 3USUB 4HANA 2BF6A 2XZJA 4XJ9A 3K38A 1YYNA 4NCSA 1CVNA 4Q1PA 1IVEA 1WBFA 1IS5A 1DQ1A 3A0NA 5HCAA 2YA5A 2GNBA 1DYKA 2ARXA 3WV6A 4U36A 4Q6KA 4HZZA 3R4UA 1E8VA 4M4VA 1LOEA 1N3QA 3BODA 1A14N 2HTWA 3V65A 2ZA9A 2PHXA 1W8NA 4XJ8A 2F24A 3WUCA 4FQZA 3SH4A 1NCDN 1GSLA 4YM2A 4GZOA 2PHWA 5DZEA 2NMOA 2YA7A 1C57A 2JJ6A 4M3CA 2F25A 2D44A 2QWDA 5CAZA 5H9RA 3RQ0A 2B8HA 3AP6A 4GXLA 2EXJA 4HZWA 2ZHKA 1VAMA 3BEQA 2DUPA 2SBAA 1LGNA 4WEGA 2EF6A 2QWAA 4AGVA 1G9BA 1EUUA 4NOTA 5HUNA 5DG1A 4PBOA 4CZSA 2DUOA 1CONA 1Q8OA 1G9AA 5IUQA 1YRZA 4K20A 5DUVA 3ZYPA 5B2DA 4Y22A 1G7YA 1SLAA 1UZYA 1WLDA 1AJKA 4CPOA 1VAVA 4MJVA 1V3CA 3HR9A 4JC1A 2XZIA 3R4SA 1A8DA 1SBDA 4IQPA 1V6MA 4M3MA 5KXDA 1FX5A 4RA0A 2A3XA 3ZXLA 1W0PA 4M3CB 5F5QA 3SALA 2ZACA 4JRAA 4F83A 2Q5TA 3ZXEA 1NSCA 3VKLA 1LHOA 4YG6A 2E6VA 3R05A 3NN9A 4R9BA 4HZYA 2WNEA 4MWWA 3NV2A 1UPSA 2JECA 1S0BA 1RIRA 4YFWA 4GJTA 3ATGA 1F8BA 4Y26A 3A0KA 1Z4WA 4GA9A 3TAYA 4XJUA 1KJLA 1BZWA 2NMNA 1AVBA 3FLTA 2YXSA 2F27A 4WVVA 5HX0A 1DHKB 1WUVA 3OYWA 2DU0A 2HTYA 2RKCA 4AGGA 1GICA 1HQLA 3WG3A 1LECA 1EUSA 1LOCA 5CB7A 1G9DA 4MYEA 2QWIA 3IPVA 1JOJA 1URXA 3I8TA 2P34A 1KDMA 3ZXKA 1NSDA 4NN9A 4KS2A 2RHPA 4LBOA 3AYAA 1U0AA 3WG1A 3BIWE 4YW2A 5F9TA 4P9WA 2VK5A 3K39A 4KBBA 1CIWA 3WOGA 3ZVXA 4XHXA 4PCRA 4QN5A 3TI3A 1Q8PA 4K1KA 1YO8A 4CTEA 4X4AA 2AUYA 3N7JA 2R1BA 2BERA 4RL7A 1AXYA 1JYIA 1V3DA 4XBLA 4Y1VA 1HKDA 1INFA 2W38A 4CPYA 3OYWB 1IS3A 1QOTA 5DZFA 2LALA 3D5OA 3MPPG 2ZMNA 1S0JA 1O4ZA 3IPVB 1F9KA 1XQNA 2P3IA 4GZPA 1SLCA 2VSKA 1Z4VA 1LJ7A 5JYYA 2WT2A 5L73A 4YGBA 1IKQA 3MW3A 2NYYA 1NNCA 2F12A 2W08A 3BOPA 1SLIA 1W1XA 3AZZA 4YFZA 4PF5A 4U2AA 5H9QA 5SV8A 1QNWA 2YDPA 1CPMA 1LOFA 1W6OB 1LGBA 1SLBA 4QN4A 2P3JA 4B7RA 1S0FA 2TEPA 2BZDA 3TI6A 1AF9A 1L7GA 1J1TA 4KS5A 1B9TA 3WLUA 1SO7A 4ATFA 3IMNA 4FPHA 1MZ6A 3FFZA 3AZVA 4YLZA 1APNA 2DYCA 4XTMA 3GVKA 4YW4A 2AENA 4QNPA 4XE9A 4C1XA 1INXA 3NWKA 2QWBA 2ZGKA 1V00A 2D6MA 2A7AA 3SILA 1LEMA 4HZVA 3O0XA 2I2SA 3BTAA 5JLVA 2HTQA 1PZ8A 4GWNA 1NMCA 3T1EA 1NN2A 4MC7A 1LOFC 5T5PA 5DUXA 4ATEA 1LODA 1F5FA 5GLVA 4FPLA 3O12A 2QWGA 4ISQA 3AXDA 1GNHA 4HL0A 3LSDA 1INWA 1NCAN 1WW6A 3RMYA 4ASMB 1N1VA 1UAIA 3SNMA 3AYCA 1W6QA 2PHFA 3O0VA 4FVKA 2E7TA 3WDYA 1R1ZA 2A3WA 4FZHA 4J9TA 2D6OX 2HT7A 4CRQA 4M3CF 1W6NA 4JF7A 5GJ6A 1EURA 1LOAA 5KXEA 3ALWA 3T1MA 3O5SA 4MWYA 4DRVA 5GLTA 1G8WA 1FV2A 2PHUA 1LHUA 1HDKA 2AEPA 2A75A 2D6PA 5CA6A 1JYCA 2YA4A 2QWJA 1Q8SA 1S0GA 1Z50A 4KS3A 4CPLA 3H72A 5GZGA 3WZ1A 2ZAAA 1NMAN 1SNTA 1W6QB 3AFKA 4CPZA 3UJOA 2A5ZA 3MW2A 1Z0HA 3W59A 3SLIA 1V6JA 1W6NB 4Q26A 4K3YA 2ZMKA 1W6MA 5GZCA 2ZZJA 2AYHA 2R0FA 5DUUA 1UMZA 4LBKA 4MX0A 5HUGA 1DZQA 1SACA 2A70A 4YGEA 1W20A 3AZWA 2NM1A 3OPZA 4UW5A 4LBNA 2JE9A 1QU0A 2GMEA 4XMAA 5CNAA 5GZFA 1KJRA 1UN1A 3L2YA 1CR7A 1DQ2A 1MZ5A 4FPKA 3OBRA 3W09A 2B7YA 1YXWA 2P37A 5AVAA 2QWKA 4AWDA 1SCRA 2D6KA 4GZQA 1IVGA 1LEDA 4C1WA 2UWAA 1DIWA 4TYSA 2YDTA 2ZB5A 3K36A 1LU1A 3WUDA 5T54A 2VW1A 2EIGA 3U4XA 2DWRA 2DURA 1NMBN 2A6VA 4YZ2A 2ZGQA 4Q2FA 1ZA4A 1Z4XA 2HYKA 3W58A 1H9PA 4Q8KA 2SIMA 1Q8VA 1QGLA 5GZEA 2E51A 1MS1A 3AP7A 4BBWA 2HU4A 2ES3A 3V0AA 1KDKA 4FPFA 5DZGA 1LGCA 1GNZA 1SLTA 1PZ7A 2F10A 2YZ4A 4W65A 1XOGA 3SANA 2XB6C 4Q1RA 4Q8LA 2QWCA 3V0BA 4YZ4A 2D6LX 1YIFA 1WW4A 5KXBA 4ZXKA 1MS9A 1LTEA 3CNAA 1NNAA 3PVNA 4X47A 4XTPA 4BPZA 1MVQA 1WCQA 4UW4A 1HLCA 4ITCA 3RRDA 3VKMA 3B01A 2CYFA 4Y1ZA 2UWCA 2GMMA 1A4GA 4FJ6A 4YGDA 2NP0A 3M2MA 5LK5A 2QWHA 3VKNA 1ENQA 3ZSKA 5T5JA 2OUHA 4KS1A 2DVBA 4Y22B 3K37A 2NN8A 3SH3A 2F11A 3V0AB 2OW4A 3TICA 1Q56A 3WCRA 1DBNA 2A6ZA 5IK7A 2ZHLA 3V0BB 1OQ1A 2CWSA 3TI5A 5GLWA 4LBMA 3PJQA 5JOZA 3WG2A 3B7EA 3PMEA 2AEQA 1V6KA 1MS3A 4K1IA 4AGRA 1QKQA 1C1LA 3AJZA 3B69A 4FQ4A 5GALA 2Z42A 1IVCA 5JOWA 3AX4A 1MVEA 3FUQA 4OZXA 2WT1A 4Q27A 1INYA 2X9MA 2EXKA 2ZGSA 1ULCA 2GNDA 4AYUA 1V6NA 2DVDA 1AX2A 1V6IA 2XZKA 3H73A 3OGGA 5EXOA 1ZM1A 3A4UA 4XDQA 3RS6A 2DTWA 4FOQA 3M3CA 4YG0A 2OUJA 2YV8A 3M3QA 2DVAA 3SITA 2QWEA 1Z78A 5DG2A 1S0CA 1WW7A 1SCSA 3QLQA 4XXAA 2EALA 3ENRA 1IKPA 2VSMA 2F28A 5GLZA 4BMBA 1C4RA 1JHNA 2VUAA 2D6NA 1IVBA 4GKXA 1W0OA 2WLQA 3JUUA 4XOGA 1ULDA 1GZCA 1KRIA 3WDXA 1DQ6A 3A71A 3WNXA 1INVA 4CPNA 1N3OA 1RITA 1LU2A 3Q9OA 5HUKA 1FAYA 4XBNA 4YZ5A 1S0IA 4XILA 4MWRA 1WCSA 1F8CA 4Y20A 1PZ9A 2F13A 2GALA 2WKKA 3IKWA 2R1DA 1DQ0A 4MWUA 3IM0A 2VW2A 5NN9A 6NN9A 1ULFA 1MS5A 3VKFC 5KXCA 2CNAA 3OBTA 5CBLA 1VCJA 2YROA 2GN3A 4XJWA 3N3HA 1D2SA 1B9VA 2HTRA 4XJRA 1MACA 4P9YA 1V3EA 5DUWA 1VIWB 2DVGA 2ZGMA 3NV1A 1N47A 3UK9A 4XIKA 3TI8A 2AH2A 4WA5A 4B7JA 3D4KA 3O9KA 2ZGOA 4GKYA 1IS6A 2ZGNA 1UKGA 1S1AA 1N1TA 2KM2A 4XYXA 4FPJA 2DTYA 4Y20B 1AX0A 1VLNA 4SLIA 4YM1A 1QDOA 4M4UA 4H52A 3M1HA 2YY1A 3K3AA 5HCFA 1F31A 2GNTA 1Q8QA 4DGRA 3GVLA 4YGCA 1JXNA 1NCBN 2ZGRA 1S0DA 4R9DA 4XJQA 1TEIA 1KITA 1VALA 1UL9A 1DIMA 3OY8A 2ENRA 4BLIA 2R16A 1SFYA 3T1LA 3WHTA 5E88A 2R0HA 3AYEA 3AYDA 4XZPA 4MWVA 1FATA 3WDTA 3AP9A 1WD3A 1AXZA 1QNYA 3PVOA 1MWEA 3AP4A 4XJAA 1MS8A 4GALA 3KQRA 2P2KA 2CMLA 3T2TA 2JDZA 3H0OA 1V3BA 4GDIA 1IS4A 1AXKA 2AGSA 4WA3A 4Y1XA 1ULEA 2VVZA 4K1ZA 3SISA 4LBQD 1IVFA 2HT5A 3NV4A 1USXA 4Y1YA 1Z4YA 1IVDA 4WEFA 2PELA 3TI4A 2ZB6A 4LBQA 1L7HA 5E89A 5T5LA 3OY8B 1OKQA 1INHA 3C2UA 2D3RA 4YG3A 2VK6A 2A3YA 1V2IA 1V0EA 4YZ1A 3RMXA 1LCLA 2W20A 3RG0A 2HT8A 1N1SA 4ZKTB 5T5OA 1BYHA 2JE7A 2XG3A 2W68A 1LHWA 3APBA 4BMEA 1GV9A 1ENRA 1FNZA 1NSBA 1QOSA 2VW0A 1EUTA 1XOEA 3D11A 3V64A 5IK4A 5JVVA 4GDJA 1G9FA 1DILA 2FHRA 4DPNA 1DFQA 2HTVA 2SILA 4DFSA 4LBQB 2VU9A 2LTNA 1WLCA 1H30A 1W6MB 5IT6A 4MZAA 2W5OA 2AR6A 2UURA 2QWFA 1GZ9A 1JW6A 4K1JA 1QOOA 3UL2A 3UJQA 4FP3A 1BKZA 4QN6A 2SLIA 1LHNA 4FPOB 1CJPA 4LBLA 1QDCA 4R9CA 3AK0A 5B2CA 2UU8A 1ENSA 5IK5A 1BQPA 3FLRA 1AJOA 2W39A 4WV8A 2HTUA 3FUOA 3PVEA 3NV3A 1C1FA 4I00A 2GN7A 2YA8A 3N35A 5E8AA 3WCSA 1DLLA 3NSSA 1JUIA 3POWA 2C4LA 1V6OA 1MR5A 1A3KA 2WJSA 4YM3A 1NNBA 4UF7A 1SBEA 5T50A 4P14A 4B7NA 1WLWA 1LENA 2D3SA 3MW4A 4WVWA 4FOYA 4XMIA 1B09A 1FYUA 2D3PA 5HUMA 5HCBA 4GWMA 1GYKA 3B00A 2ZGUA 1USRA 2DV9A 5JOYA 1WBLA 2ZGPA 2JKBA 4K1YA 3AJYA 2NZ9A 3AZYA 1Y7BA 1CN1A 2BATA 4XIOA 4I30A 1UZZA 1LOGA 2DU1A 4P9XA 3TB0A 3D12A 2GMPA 2R49A 1INGA 3JU4A 2XCYA 2GNMA 1DQ5A 1LHVA 2D7FA 4FP2A 4HZXA 1VCUA 3TIBA 1F8EA 1JN2P 3WG4A 2ZGTA 4Y24A 1SLLA 3GALA 1BXHA 2BQPA 4K21A 3LSEA 2EAKA 3WVJA 1N1YA 2EXHA 4WZFA 7NN9A 1X50A 1LOBA 1GBGA 1GLHA 4QN7A 2PHTA 4XBQA 3A72A 2VK7A 1W6PA 2ZKNA 2CWMA 3QCWA 2W52A 2CL2A 1RINA 4YW1A 4MWXA 3WDUA 4D8SA 4L8QA 2OVUA 1WW5A 4H55A 1Z4ZA 3ILFA 2VXRA 4UW6A 2C4AA 1G9CA 4YM0A 1D0HA 1A78A 4FVVA 3O9JA 3SH5A 4X6KA 3POYA 1WD4A 3B9CA 4BM8A 1GZWA 3VUOA 2DVFA 4MWQA 2D43A 3GNEA 3INBA 4GZSA 2PHRA 2F29A 4PQ9A 5JDBA 4GEZA 2A6YA 4Z8BA 4X49A 3KM5A 4M01A 1NXD1 1CESA 4ISRA 2JD4A 1W6OA 2ERFA 2CTVA 3POSA 1W6PB 5T52A 4MWLA 1MS4A 1NLSA 4YZ3A 5GLUA 1N3PA 4K1HA 3ZSJA 1HQWA 2YA6A 3VV1A 3N7MA 1ULGA 3O0WA 1GANA 4GZWA 3M3OA 4XJZA 3I4IA 4AVTA 1L7FA 4FPGA 3HN1A 1GZWB 3ASIA 2V73A 5EWSA 3N36A 3ZXFA 2ZHMA 2E53A 2AREA 4B7MA 3ALXA 1BJQA 4H53A 4MZEA 4FOVA 3ZSLA 4LBJA 1H9WA 2WQZC 1SBFA 1CPNA 3H6JA 1AX1A 5FREA 1F8DA 4DQAA 3INAA 5H9SA 3N7KA 2YMZA 4FPEA 2ZMLA 4TZDA 2V5YA 4JCKA 1NCCN 2ZHNA 1LULA 3D6EA 4YW3A 4QN3A 4CPMA 3N7LA 3CYEA 3WDVA 1V0ZA 3DGTA 1FV3A 4YW5A 4R9AA 4M00A 1DGLA 5EYYA 3OJBA 3ZYRA 4DS0A 1EPWA 4PBPA 2C9AA 1A4QA 1B9SA 1IOAA 1DYPA 4GB1A 1JBCA 1BJIA 2WSVA 3CKZA 3WHUA 1LESA 3ILNA 2WSUA 2C5DA 1I3HA 5IK8A 4AVVA 1AZDA 2ARBA 2A71A 3AP5A 3RSJA 4BOWA 2EXIA 3ZXJA 3CL0A 2F26A 3LCPA 4FPCA 1W8OA 3HMYA 2FMDA 3WDWA 3ZSMA 4DRRA 2H0BA 2VH9A 5BYNA 2WT0A 5JOXA 1MS0A 1YI7A 2W5NA 4XHBA 3AZXA 1CQ9A 3FLPA 1UX6A 1V6LA 4GZTA 5H9PA 5FRAA 4M3CE 2P3KA 2A6XA 3IN9A 4MWJA 4HIZA 1OFSA 3ZPYA 4FOWA 4FPYA 1I1EA 1E8TA 3JU9A 1DQ4A 4UW3A 5T55A 4Y1UA 4GZXA 5EYXA 1V0FA 3USUA 2DUQA 1S0EA 4XXPA 4KS4A 2ZGLA 1ONAA 3DUIA 5JMCA 3ILRA 4WA4A 2VWDA 2GDFA 1O4YA 5M1ZA 3M3EA 2VY0A 5DXDA 2G4IA 3H71A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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