2AH2A

Trypanosoma cruzi trans-sialidase in complex with 2,3-difluorosialic acid (covalent intermediate)
Total Genus 188
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
188
sequence length
633
structure length
624
Chain Sequence
LAPGSSRVELFKRQSSKVPFEKDGKVTERVVHSFRLPALVNVDGVMVAIADARYETSFDNSLIDTVAKYSVDDGETWETQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYVLVGSYNSSRSYWTSHGDARDWDILLAVGEVTKSTAGGKITASIKWGSPVSLKEFFPAEMEGMHTNQFLGGAGVAIVASNGNLVYPVQVTNKKKQVFSKIFYSEDEGKTWKFGKGRSAFGCSEPVALEWEGKLIINTRVDYRRRLVYESSDMGNTWLEAVGTLSRVWGPSPKSNQPGSQSSFTAVTIEGMRVMLFTHPLNFKGRWLRDRLNLWLTDNQRIYNVGQVSIGDENSAYSSVLYKDDKLYCLHEINSNEVYSLVFARLVGELRIIKSVLQSWKNWDSHLSSICTPAGCGPAVTTVGLVGFLSHSATKTEWEDAYRCVNASTANAERVPNGLKFAGVGGGALWPVSQQGQNQRYHFANHAFTLVASVTIHEVPKGASPLLGASLDSSGGKKLLGLSYDKRHQWQPIYGSTPVTPTGSWEMGKRYHVVLTMANKIGSVYIDGEPLEGSGQTVVPDERTPDISHFYVGGYKRSGMPTDSRVTVNNVLLYNRQLNAEEIRTLFLSQDLIGTEAHM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural Insights into the Catalytic Mechanism of Trypanosoma cruzi trans-Sialidase
pubmed doi rcsb
molecule keywords trans-sialidase
molecule tags Hydrolase
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 188
structure length 624
sequence length 633
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2005-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2ah2A02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 2ah2A01
1O4ZA 4FPEA 2ZBJA 3O9JA 2AREA 4B7MA 4LBOA 1N47A 1DLLA 4ITCA 3A4UA 4XBNA 4LBJA 2QWAA 1V6JA 1UL9A 3O5SA 1GYKA 2DU0A 1SLLA 3ZSLA 2EXIA 4UW6A 3POSA 3IMNA 4GB1A 4M3CA 4MC7A 4BPZA 1HLCA 4R9BA 4DRRA 2VW0A 2XCYA 3I8TA 1A4QA 4WEFA 2C4AA 4IQPA 4MX0A 2GALA 4HZYA 2CWMA 1A8DA 2DURA 1WBFA 4CPMA 2A6YA 1LOFC 2A5ZA 1W8OA 5HX0A 4GZQA 4M4UA 2F10A 1Q8OA 4ASMB 4QN6A 5IK4A 1MS5A 1R1ZA 2RKCA 3OYWB 1BJQA 1SBDA 2ARXA 4XIKA 2CY6A 1G86A 2DV9A 2VSKA 3AZYA 2UU8A 3AP9A 4P9XA 3TI4A 2C5DA 1HQWA 2F12A 3V0BA 4B7QA 2WT0A 1Z78A 1N1YA 2AYHA 1ULEA 1LOFA 1F31A 2VU9A 2P3JA 2CL2A 3UJQA 2JD4A 2SBAA 2QWGA 1VAVA 1WW4A 2FHRA 4TZDA 3AP4A 2D6LX 3O0XA 1C1LA 2WLQA 4Y24A 5DUVA 1V00A 1INVA 3OY8A 4Y22A 4FPKA 1W6NB 1A14N 2WQZC 4HZVA 4YGEA 2CMLA 4MWQA 3QLQA 5JMCA 2AGSA 2SILA 5KXEA 1DILA 2W39A 2AEQA 4K3YA 4SLIA 3FLRA 4NC5A 4RL7A 2QWBA 2D7FA 1FV3A 5KXDA 1SACA 3SISA 4Q6KA 1BQPA 3N7JA 3I4IA 2Q5TA 1V6MA 3AYDA 3PVNA 3NV4A 4XIOA 2R1BA 4FPHA 3UJOA 4LBKA 2F27A 3N36A 1JYCA 2YDPA 4GWNA 1N3PA 2FMDA 1IS4A 2ZGTA 4Q27A 5AVAA 3M2MA 4AWDA 2V73A 1NMBN 2XB6C 1VALA 3APBA 3M3OA 2YY1A 1SNTA 4Y1UA 2WSVA 2ZHKA 3SANA 2ZMNA 1MWEA 3K37A 3SLIA 4CPZA 3AYAA 3FUQA 3IPVB 2A75A 1FATA 4FJ6A 3RRDA 1NMCA 3ZPYA 1E8VA 1MZ6A 1NCCN 1UZZA 1MS1A 1W0OA 2R16A 2VW1A 3M3CA 1EPWA 1UZYA 2W5OA 1YXWA 2A3XA 3VKNA 4K21A 3OBRA 3LSEA 3WHTA 1IS6A 3WCSA 2ARBA 2AR6A 2W68A 5DZEA 5F5QA 3V64A 2HU0A 1V3BA 2PHTA 2D6MA 3WDVA 4GDIA 1LCLA 3HMYA 2VUAA 1DZQA 2NP0A 2NMOA 1OKQA 1X50A 1LHOA 5GZDA 4YW4A 3HR9A 2P34A 4M3CF 5JYYA 1YYNA 4MWJA 1NNCA 4XILA 2A6WA 1JOJA 3AJZA 2VH9A 5DUUA 5IUQA 3TB0A 4ATEA 4BM8A 2PHRA 1Z4YA 3NN9A 1SBFA 3BEQA 3SILA 1XQNA 2D3SA 2RHPA 2HTUA 4NCSA 3IM0A 1WUVA 2P3KA 3WDYA 2SLIA 5HUGA 1AXZA 3TI8A 3MPPG 4NOTA 5H9QA 3MW2A 4I00A 3V0AB 4WA5A 3TI3A 4FVKA 1SCSA 2JKBA 2UWAA 2EALA 3WDUA 2ES3A 4MWUA 5GLZA 2D44A 2YV8A 5L73A 1LHVA 1F8EA 2GMMA 1GNZA 2AH2A 1IVFA 4B7NA 4YZ3A 3W59A 4JCKA 2V5YA 4GKXA 4GWMA 3VKMA 4XBLA 5LK5A 1UX6A 2NN8A 1LHNA 2HTWA 1D2SA 1S0JA 4KS1A 2DYCA 3MW3A 1Q8VA 5KXBA 1CPNA 5GLUA 1INYA 1W6NA 1KRIA 4MJVA 1L7GA 1NSCA 1OQ1A 2ZGUA 2Z42A 4R9CA 3VUOA 2HTYA 4WVVA 1N3QA 1FV2A 2UWBA 3RG0A 1WW5A 1B9SA 4C1WA 2BATA 5T52A 3INBA 1ULFA 1N1SA 2HTQA 2ZGRA 1AZDA 2A70A 3USUB 3V65A 3TIBA 1V6OA 1BXHA 4DPNA 1MS4A 3BTAA 1F8DA 3ASIA 1H9WA 1WW6A 2DWRA 2VW2A 1G8WA 1HQLA 3GVJA 4D69A 4ZKTB 2EXHA 1A3KA 5IT6A 2JE7A 3SH3A 2YA4A 5GALA 4Q1PA 1DQ4A 1DQ1A 1N1TA 3T1MA 4YG6A 1AX2A 2A6ZA 2HT5A 3WHUA 4GEZA 1BKZA 1IVCA 3R4UA 1VCUA 3IPVA 1CONA 4FPCA 3WOGA 1V0FA 1JYIA 3KM5A 1F8CA 3NV3A 1W6MB 3AZWA 2E6VA 2R1DA 1YRZA 4Y1XA 3AK0A 2F25A 5DXDA 4YW2A 3D6EA 3BOPA 2YA7A 1VLNA 3B00A 5T5LA 4FZHA 3A0NA 2ZMKA 3B3QE 2X9MA 1PZ9A 4AGVA 2DUPA 4CPLA 5DZFA 1MACA 1QNWA 1UAIA 2E53A 4YW3A 5T55A 2F26A 1NSBA 1MVEA 2OVUA 2KM2A 1C57A 1W6QA 3SH4A 3K36A 3WCRA 1N1VA 2CTVA 3NSSA 4FOYA 2P37A 5CBLA 5HCBA 2GDFA 5E89A 1DQ0A 2QWHA 4OZXA 2P2KA 3TI5A 4BBWA 2PHFA 1QU0A 1SLBA 4LBLA 3V0AA 4YGCA 4UW3A 2HT7A 1APNA 3W58A 2BZDA 3H71A 3FFZA 3R05A 4FPGA 4K1ZA 1ENQA 5GLTA 3A71A 2B8HA 2AUYA 1W6PB 4XJUA 4GZOA 1YI7A 4DRVA 1INWA 1ULDA 2A3WA 2VVZA 3D5OA 3RMYA 3ZXEA 4GA9A 4MJUA 1GICA 1V6LA 3TAYA 3H0OA 4PBPA 4Q1RA 4FPFA 3L2YA 3WV6A 1VIWB 2EAKA 1SO7A 2HTRA 1S0EA 1IVBA 4MWRA 2ZABA 4H52A 3ENRA 4GXLA 4YM2A 2VXRA 1QGLA 3ZSJA 1FNZA 2D6OX 5F9TA 4FPYA 2QWIA 1S0IA 1MR5A 1GLHA 2ZHLA 2YROA 1MZ5A 2EIGA 2ZB6A 1W0PA 3GVKA 1NXD1 3BODA 3USUA 1ONAA 1NNAA 1L7FA 2A7AA 3WDWA 1EUTA 1G7YA 2GMPA 3O12A 1DYKA 4HIZA 5HUKA 1H30A 2R0HA 3NV1A 2QWDA 1CPMA 2JECA 4UW5A 1JUIA 4P9YA 3DUIA 2ZZJA 1WLWA 2GNBA 2ZGMA 2HYKA 3SH5A 4XMIA 2QWCA 4MWYA 2EXKA 2JJ6A 3GVLA 1DYPA 4GZXA 1S1AA 1B09A 3VKLA 5E8AA 2VK7A 4GZWA 4QN3A 1WD4A 3ALXA 4Z8BA 4XJWA 2F0ZA 3K39A 4Q8LA 1QOOA 1MVQA 1WBLA 2YMZA 2A3YA 1G9AA 2YDTA 1GBGA 1G9DA 1W6MA 3AXEA 4U2AA 1G9FA 2OW4A 3VKOA 5H9PA 1YIFA 3O9KA 2CNAA 4XJ8A 4ATFA 1GKBA 3CYEA 1IKQA 3WLUA 2CWSA 4WV8A 2ZB5A 2VK5A 2BF6A 1LGCA 1W6OB 1ULGA 3WG3A 4M3CE 3FBYA 4XYXA 3O0VA 3K38A 1LOBA 4Y20B 6NN9A 1FNYA 3DGTA 2A6XA 1UPSA 1Q8PA 4X6KA 4CPNA 1IS5A 3UK9A 5BYNA 3D12A 2G4IA 1LGBA 2JE9A 1LEDA 4B7JA 1W6QB 1QF3A 1NCAN 4ZXKA 1LENA 4R9DA 1IVEA 3RSJA 3D11A 1KJLA 5IK8A 1UKGA 3FLTA 1LU1A 1LHUA 4AVSA 1W20A 2C4LA 1AVBA 2E51A 5DUWA 3AYEA 1SBEA 1LODA 1LOCA 5NN9A 5JVVA 5JDBA 3M3QA 1WD3A 2HT8A 4GKYA 3T2TA 4TYSA 1C4RA 1F8BA 4MZAA 1LU2A 1D0HA 1FYUA 5HUMA 1RINA 2ZGLA 3FUOA 4CPOA 1BZWA 1KDKA 3B01A 3C2UA 2ZA9A 5H9RA 4FOVA 3M3EA 4H55A 1QDOA 4HZXA 2YA6A 4FP3A 4CZSA 1W6PA 2BERA 4Y1ZA 3R4SA 1F5FA 1JXNA 1JW6A 2AENA 4KS5A 2H0BA 5DZGA 2NM1A 4BOWA 2QWKA 2QWFA 4GALA 1QDCA 2ERFA 1S0FA 3CL0A 1GSLA 5T54A 2A71A 1DHKB 4P9WA 4KS2A 4B7RA 3HN1A 1RITA 1MS8A 1IVGA 2F28A 1SLIA 5GZFA 2F11A 4MZEA 1V6NA 1VCJA 3IKWA 2WT1A 2DUOA 4BMEA 3N7LA 4BQ1A 2GN3A 4P14A 1AX0A 5IK5A 2CYFA 4M01A 3N3HA 4K1HA 1LOAA 5GLWA 1SLTA 2GMEA 1USXA 7NN9A 3N35A 2ZMLA 3OBTA 2QWEA 3A72A 4QN5A 4XOGA 1C1FA 1TEIA 1O4YA 5JOZA 3U4XA 1JBCA 2ZGKA 3N7MA 2EF6A 4FOQA 2R49A 1V6KA 1U0AA 1RIRA 1CIWA 1ENRA 1XOGA 5DG1A 2A6VA 4CPYA 2VY0A 4FPJA 1KDMA 2PHXA 2DUQA 1INGA 5M1ZA 4AVTA 1GNHA 1Z4WA 1WLCA 3T1EA 4PQ9A 3AZVA 3IN9A 1BYHA 2TEPA 1KITA 2W52A 4HANA 3SITA 4UW4A 1WCQA 4PBOA 3WG2A 1Q8QA 4BMBA 2DVAA 1AX1A 2AEPA 4MWVA 1JN2P 3SNMA 3ZXJA 1Z4XA 4WEGA 2R0FA 2D43A 4QN7A 3JU4A 1PZ8A 4LBNA 2W5NA 1Z4ZA 1XOEA 2OUHA 1LOEA 2XZJA 1W6OA 5GZCA 2XG3A 2C9AA 2WSUA 4KS4A 1INFA 4Y20A 4YM0A 5JOXA 1DIWA 3RS6A 1AJKA 1USRA 2W38A 4Y1VA 1QKQA 1DQ6A 1NLSA 3INAA 3MW4A 2LALA 4HL0A 4XMAA 4DS0A 1V6IA 4U36A 1AJOA 1NCBN 1GZCA 1SLAA 3AX4A 3PVEA 2ZKNA 2GNTA 3RMXA 5HCAA 1AXYA 4M4VA 3K3AA 4R9AA 3W09A 5CNAA 4M00A 4MWWA 1A78A 4GDJA 4NN9A 4XZPA 4K20A 1B9VA 5JLVA 1V0ZA 4BLIA 4L8QA 1W21A 5B2CA 4GZPA 4FVVA 2D6KA 1GZWB 3WVJA 1IVDA 2UURA 2DVBA 1J1TA 2YZ4A 4M3MA 2VK6A 1GANA 5EXOA 1LGNA 2JDZA 4I30A 2DVDA 3M1HA 2F24A 3WG4A 4X47A 1H9PA 2DVGA 4AGGA 5CAZA 4QNPA 1LECA 1VAMA 1UN1A 1Y7BA 1HKDA 4GZSA 5HCFA 1QNYA 4Y1YA 2GN7A 4QN4A 2UWCA 4XTMA 1HDKA 1LTEA 2ZACA 4Q8KA 1CJPA 3NV2A 4HZZA 3D4KA 1Z50A 3OGGA 3AFKA 3JUUA 3B9CA 5KXCA 1DQ5A 2PHWA 3PJQA 1PZ7A 4YM1A 2DTWA 1AF9A 4YM3A 2YXSA 1MS0A 3MEPA 3LCPA 3POYA 2P3IA 4JRAA 1WW7A 1FAYA 2GNMA 1LESA 2OUJA 1S0CA 3H72A 1F9KA 4JC1A 3CKZA 2WT2A 4LBQB 5EYXA 1S0BA 5EYYA 3B7EA 1CESA 2I2SA 1Z0HA 1L7HA 2NYYA 3WG1A 3ZSMA 1LEMA 5FRAA 4C1XA 2VSMA 5H9SA 1SLCA 1INHA 5T5OA 1JHNA 4YGBA 3AXDA 4DGRA 4WZFA 4XTPA 3UL2A 4YW5A 1S0GA 1FX5A 2LTNA 1EUSA 1NCDN 5DG2A 4FQ4A 2F13A 3JU9A 5CB7A 2GNDA 4PF5A 1WCSA 1I3HA 4DFSA 1LOGA 4FOWA 1Q8SA 4YW1A 4WA3A 2NMNA 4YFZA 1ULCA 3ZXLA 1QMJA 4AYUA 2SIMA 1WLDA 3N7KA 5E88A 4XJ9A 2YA5A 4YFWA 4WVWA 1NSDA 4YZ5A 5IK7A 2NZ9A 3TIAA 1LULA 3B69A 1ZM1A 4K1IA 4Q2FA 1EUUA 2ZGPA 1CQ9A 4K1YA 1V3CA 1CR7A 3H73A 4FPLA 4ISRA 4KS3A 3WDTA 1S0DA 3A0KA 4WA4A 3KQRA 1ZA4A 4UF7A 1V3DA 4MWXA 2ZHMA 4M3CB 4K1KA 3ATGA 1INXA 5HUNA 4XJQA 3BIWE 3LSDA 1LHWA 3ZYRA 3ZYPA 3H6JA 1W8NA 2PELA 5GZGA 2ZGNA 4XE9A 1MS9A 4LBQD 4FP2A 3WDXA 3POWA 5EWSA 2ZHNA 2F29A 4YZ4A 1ENSA 2EXJA 4YGDA 1AXKA 3PMEA 3GALA 3AZXA 2ENRA 4K1JA 5JOYA 1NNBA 4ISQA 1GZWA 4AGRA 4HZWA 1QOSA 2BQPA 3OYWA 5GZEA 1DFQA 5GLVA 4GZTA 1IKPA 4GJTA 3AYCA 4XXPA 4XHXA 3WUDA 3RQ0A 2XZKA 3AP5A 3V0BB 1GV9A 1URXA 3AP6A 5DUXA 3WUCA 4MYEA 4XBQA 1OFSA 5SV8A 4LBMA 1I1EA 4PCRA 1BJIA 4KBBA 4Q26A 1LJ7A 4XDQA 4X4AA 2D3RA 1GZ9A 1B9TA 4D8SA 5B2DA 2HTVA 1UMZA 1MS3A 4CRQA 4Y26A 4MWLA 3OY8B 4Y22B 5CA6A 2WKKA 4YZ1A 1QOTA 4YG0A 2XZIA 5T50A 2ZGSA 3ZSKA 3CNAA 1DGLA 3VV1A 1NN2A 4AVVA 5T5JA 5T5PA 2W08A 4XJAA 3ZXFA 2B7YA 1NMAN 4XJZA 4LBQA 2YA8A 3CL2A 4YG3A 2QWJA 1V0EA 3GNEA 1KJRA 2DVFA 4NO4A 2DU1A 1G9CA 3T1LA 2WJSA 1EURA 1Z4VA 5GJ6A 3Q9OA 3ZXKA 3ILNA 3WNXA 1V2IA 3ZVXA 2VWDA 1V3EA 3ILFA 3AP7A 2D6NA 1A4GA 4CTEA 2D3PA 3NWKA 5FREA 4YZ2A 4JF7A 2ZAAA 4BLJA 1N3OA 1E8UA 2ZGQA 1KQRA 1SCRA 1IS3A 4XHBA 1YO8A 1W1XA 3OJBA 3FLPA 1CVNA 2HU4A 1IOAA 1DBNA 1G9BA 3QCWA 1Q56A 4X49A 3PVOA 5GM0A 3O0WA 4F83A 5JOWA 4XJRA 4YLZA 4DQAA 2D6PA 4W65A 2ZGOA 2WNEA 3VKFC 1SFYA 1DIMA 4XXAA 4J9TA 3AZZA 2W20A 3ILRA 3AJYA 3OPZA 3ALWA 2PHUA 3TI6A 3WZ1A 1E8TA 2E7QA 2DTYA 3TICA 2E7TA 4M4NA 4FQZA 4RA0A 1CN1A 3SALA 1DQ2A 4H53A 4FPOB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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