2AH2A

Trypanosoma cruzi trans-sialidase in complex with 2,3-difluorosialic acid (covalent intermediate)
Total Genus 188
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
188
sequence length
633
structure length
624
Chain Sequence
LAPGSSRVELFKRQSSKVPFEKDGKVTERVVHSFRLPALVNVDGVMVAIADARYETSFDNSLIDTVAKYSVDDGETWETQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYVLVGSYNSSRSYWTSHGDARDWDILLAVGEVTKSTAGGKITASIKWGSPVSLKEFFPAEMEGMHTNQFLGGAGVAIVASNGNLVYPVQVTNKKKQVFSKIFYSEDEGKTWKFGKGRSAFGCSEPVALEWEGKLIINTRVDYRRRLVYESSDMGNTWLEAVGTLSRVWGPSPKSNQPGSQSSFTAVTIEGMRVMLFTHPLNFKGRWLRDRLNLWLTDNQRIYNVGQVSIGDENSAYSSVLYKDDKLYCLHEINSNEVYSLVFARLVGELRIIKSVLQSWKNWDSHLSSICTPAGCGPAVTTVGLVGFLSHSATKTEWEDAYRCVNASTANAERVPNGLKFAGVGGGALWPVSQQGQNQRYHFANHAFTLVASVTIHEVPKGASPLLGASLDSSGGKKLLGLSYDKRHQWQPIYGSTPVTPTGSWEMGKRYHVVLTMANKIGSVYIDGEPLEGSGQTVVPDERTPDISHFYVGGYKRSGMPTDSRVTVNNVLLYNRQLNAEEIRTLFLSQDLIGTEAHM
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural Insights into the Catalytic Mechanism of Trypanosoma cruzi trans-Sialidase
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Trypanosoma cruzi
molecule keywords trans-sialidase
total genus 188
structure length 624
sequence length 633
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2005-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2ah2A02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 2ah2A01
1INWA 4Q26A 1GANA 4NC5A 5H9PA 4HIZA 2NYYA 5LK5A 2QWEA 5GLTA 1ZA4A 2R1BA 2GMPA 3H0OA 3N36A 3AZVA 5HCBA 4GZTA 1F8CA 2OUJA 5GM0A 1F31A 2HTWA 3T1MA 2JE9A 2NMOA 3TB0A 1NSBA 4BQ1A 5JDBA 2GALA 5JYYA 5JOYA 3NWKA 3WUDA 3JU4A 4GWNA 3UJOA 1S0CA 1UZZA 4YGBA 1A4GA 3A72A 2D6MA 5F5QA 3TICA 4GZSA 3V0BA 4M01A 1WLCA 3OGGA 1Z78A 5B2CA 4JF7A 4SLIA 4FPCA 1MR5A 4MX0A 3ILFA 1W6MA 3INBA 3TAYA 2ERFA 1SBEA 3FUQA 3FBYA 1DGLA 6NN9A 5HCAA 1PZ7A 4GZWA 3NN9A 3AJZA 2P34A 2A5ZA 4WVWA 1KRIA 4MZEA 4ATEA 4CPZA 2D43A 4AVVA 2NP0A 4MWVA 2WKKA 2ZBJA 3AYEA 3W09A 3A0NA 1LOGA 1DHKB 2GNBA 1EUTA 2HTUA 2JJ6A 1CQ9A 2AGSA 5DZEA 2EXJA 3WG3A 2C5DA 2D6LX 2ZGRA 3ZYRA 2UWBA 1W21A 1HLCA 1KJLA 2W08A 3QCWA 1WD4A 1LOEA 3UL2A 1CJPA 2HTQA 1Z0HA 2F0ZA 3ZPYA 2ZACA 3AP4A 1UL9A 4YM0A 3TI6A 2NM1A 4K21A 7NN9A 2A6YA 1V6LA 4XBNA 1B9TA 2JE7A 1LENA 2YDTA 1EURA 2D3RA 4GA9A 2W5NA 4JRAA 1IVBA 4CRQA 1H9PA 2ZGKA 4I00A 4BLIA 3TI5A 4HZXA 4FOWA 1NCBN 1IS5A 3WG1A 4Y22A 3OY8B 4YGCA 1BZWA 1B9VA 4GEZA 2VH9A 4MJUA 1BJQA 1TEIA 1IVFA 1LJ7A 2X9MA 2R0FA 2YY1A 1LEMA 4K1ZA 1V00A 2VU9A 2DVDA 1JUIA 1ULCA 1ULGA 1NSCA 1W6NA 5H9SA 3ALWA 2YDPA 1DQ4A 1LOBA 1OQ1A 2PELA 5JVVA 4XTMA 2D6NA 4X6KA 2E7QA 2ZMLA 1SO7A 3WNXA 2LALA 1ULEA 1G8WA 4YZ1A 4J9TA 3SILA 4L8QA 1QNWA 3QLQA 5IUQA 5DZFA 1UX6A 5DUWA 2ZGUA 2SILA 4ZKTB 4FP3A 4DGRA 2ZGTA 3O9JA 1W0OA 1SBFA 4XHXA 1GZWB 1H9WA 1E8TA 3L2YA 1WUVA 3BTAA 1V3BA 1KDMA 1WW6A 1KQRA 4F83A 2HT5A 1LECA 1V6NA 2QWGA 1OFSA 3RRDA 2WT2A 2ZMKA 2P3KA 5DZGA 2LTNA 4FOVA 1ENQA 3GNEA 4YM2A 3UK9A 2AEPA 1Z4ZA 1YYNA 1ENSA 2DU1A 3WDXA 1LGBA 3WV6A 4AVSA 2P37A 5T5LA 5T5PA 5T52A 4K1IA 4Q6KA 4P14A 4LBOA 2D6KA 4YW5A 1A78A 5GZCA 5HCFA 3B69A 2HTRA 4K20A 4KS1A 1H30A 1MACA 1MVQA 1O4YA 3WG2A 2ZGMA 1FNZA 5T55A 3AP7A 1UPSA 1WCQA 1XQNA 1VCJA 4FZHA 2E53A 2F26A 2CMLA 1JN2P 1LHWA 2P3JA 3APBA 1Y7BA 5DXDA 3SLIA 2W20A 1FYUA 2F13A 2ZB6A 1V6OA 3DGTA 3D5OA 3KQRA 5EYXA 1GYKA 1LTEA 5HUMA 3R4UA 3ZXLA 1E8VA 2JD4A 4CPYA 4YZ2A 1WLWA 4YG0A 1V6MA 5E88A 2A75A 4R9BA 1V6KA 3T2TA 1LODA 4MWJA 3CL0A 1V3EA 1JHNA 1S0IA 3LSDA 3R05A 4HZZA 1KDKA 4QN6A 4R9CA 1C57A 5B2DA 3WDWA 2VK7A 1A8DA 3ZXKA 3WDUA 1A14N 4XJRA 4XBLA 1INHA 2BF6A 4D69A 3FFZA 2CNAA 3JUUA 4ITCA 1INVA 4QN7A 4Q1RA 1S0DA 2VXRA 4OZXA 4BMEA 3T1EA 1S1AA 4GDJA 3ILNA 3N7LA 3K37A 1QF3A 1F5FA 2D44A 4K1JA 1XOEA 5CBLA 1DLLA 1MS1A 2PHRA 3M3OA 2ZMNA 3AXEA 4FPLA 1DILA 3NV1A 1INXA 4IQPA 1VCUA 2OVUA 4LBQB 3R4SA 1ULDA 3MW3A 4YZ4A 2GNTA 2F29A 1NXD1 1IVCA 1FNYA 3RG0A 2ARXA 2UWAA 3O12A 2XCYA 2WNEA 3OPZA 3BIWE 1X50A 3PVEA 3VKFC 2A6XA 2ZGSA 1IKQA 2VK5A 2QWBA 2VY0A 1QU0A 4FPFA 2EXIA 1EPWA 2DUPA 4GZOA 2VW2A 1L7GA 5HUGA 1LU2A 2A71A 2PHTA 1GNZA 1QOTA 1NNCA 1V6IA 4Q2FA 3V0AB 4GKYA 4YZ3A 1DIWA 4XYXA 5SV8A 4AGGA 4M4VA 4MWLA 3B00A 2VSKA 2B8HA 4BLJA 2FHRA 2SBAA 2WSVA 1LGCA 2BZDA 2ZGNA 4YGDA 3SNMA 2DUOA 3U4XA 1USXA 2QWAA 2A6VA 3PVOA 3D12A 3CL2A 2VW1A 4Q8KA 2TEPA 4PBPA 4LBJA 4K1YA 5T50A 3N7KA 3OYWB 3POSA 1AX0A 1APNA 4GB1A 2DVBA 1U0AA 4MJVA 4WA3A 2QWDA 2XG3A 3V64A 1CESA 1MS3A 1DQ2A 2F12A 1INFA 1YI7A 4U2AA 1GV9A 1DQ6A 1FAYA 1LULA 1O4ZA 2WT0A 1G9DA 1AJKA 3MEPA 1AVBA 1KJRA 2A3WA 3RMYA 3PMEA 2AREA 1FATA 2DTYA 3WLUA 3INAA 1MS8A 4XJUA 1RINA 4NN9A 3TI8A 1AX2A 1MZ5A 2VSMA 1DQ0A 4KS2A 2AUYA 3IPVB 5T5OA 2A3XA 3AZZA 1IKPA 4YM3A 1GSLA 4XIKA 1V2IA 3Q9OA 4UW3A 2E7TA 1Q8SA 3NSSA 3N35A 3USUA 4DQAA 1BJIA 4B7QA 2C4AA 1HQWA 1S0BA 4GZQA 2RHPA 5DUXA 4LBLA 4UW4A 3VV1A 4CPNA 5KXDA 2WT1A 3WHTA 1NNAA 1DQ1A 3MW4A 1Q8OA 4Y1VA 2FMDA 5GZFA 4Q1PA 2EXKA 1SCRA 4GXLA 2G4IA 4CZSA 5M1ZA 1C1LA 2JDZA 3HN1A 1MS4A 4CPLA 1LHNA 2OW4A 4GALA 3D6EA 4P9WA 1OKQA 4LBQA 4K1KA 4Y26A 3AP5A 5BYNA 1JXNA 1SBDA 5GZDA 1I1EA 1GLHA 2CWSA 1BQPA 1MVEA 2ZHMA 1L7HA 1QGLA 1NMAN 1S0GA 3IN9A 4GZPA 4AGVA 3TIAA 4GWMA 3C2UA 1MS5A 4M3CB 1AJOA 2HT7A 1DFQA 3ZSMA 3AYCA 1JYIA 2DVFA 2W39A 1SCSA 5FREA 3V0AA 3VKNA 2R1DA 3UJQA 1ULFA 1Q56A 4M3CE 3NV2A 4DPNA 2ENRA 3K3AA 2W5OA 2YA6A 4YW2A 5FRAA 3ZVXA 3WZ1A 3SANA 1UN1A 1WBFA 5JOXA 2YA4A 3FLRA 2PHWA 4CPMA 5JOWA 4YW1A 4YW4A 4LBKA 1G9AA 2AEQA 3POYA 4FVKA 1G9BA 1YIFA 1D0HA 2BATA 4DRVA 4PCRA 1CONA 4M4NA 4Y24A 4UF7A 3NV4A 3M3EA 3BOPA 1V6JA 3B9CA 4FVVA 2WSUA 1VLNA 3OYWA 5KXBA 5KXCA 2ZHLA 1C4RA 1N1TA 2OUHA 2R16A 2DV9A 1N3QA 4GZXA 4XZPA 2HTVA 2DUQA 1JBCA 4XMIA 3ILRA 4X49A 3A0KA 3AYDA 2DVGA 3VKOA 2I2SA 4FOQA 2WJSA 2XZIA 4WZFA 2WQZC 5HUKA 5H9RA 4H55A 3O0WA 1Q8QA 3D4KA 2R49A 3V65A 3K36A 2QWFA 3A71A 1YO8A 3OBRA 2YMZA 3KM5A 3DUIA 2AENA 3V0BB 3RQ0A 2R0HA 2UURA 3FLPA 4Y20B 1DQ5A 2GN3A 3ZYPA 5IK8A 1GICA 3IPVA 1Z50A 1Z4VA 4ISRA 2GMEA 4FPOB 4MWXA 4XJ8A 5T5JA 2W68A 4DS0A 1LOFA 4FP2A 3AXDA 1AX1A 1FV3A 2SIMA 3K38A 4BOWA 5KXEA 4LBNA 1MS9A 1UAIA 2GNMA 2GMMA 1DIMA 1CPMA 5CB7A 1GKBA 1DZQA 1V3DA 3WDTA 4QN5A 1VAVA 2D6PA 1MZ6A 2QWIA 4FQZA 3B01A 4MWYA 2PHXA 3O0XA 1S0FA 1Q8VA 1FX5A 3PJQA 3ENRA 4P9XA 1NCAN 4XE9A 3OY8A 3M3QA 3RS6A 1CVNA 4X47A 4PQ9A 1N1VA 4QNPA 4H53A 1QDOA 4XJAA 4GDIA 3BEQA 4YW3A 1DYKA 4Y1ZA 1URXA 1KITA 1ONAA 3AFKA 5GLWA 4R9AA 1IVGA 5IK7A 3AZXA 4DFSA 5GLVA 3ZXJA 4Q8LA 4M4UA 2ARBA 3VKLA 4C1XA 2HT8A 4WEFA 4QN3A 1R1ZA 3SH3A 4UW5A 1INGA 3I8TA 5IK5A 4XJQA 2ZGLA 1NCDN 5GZEA 1HQLA 3SH4A 2A3YA 4ATFA 4FJ6A 4AGRA 2F28A 5GLZA 2NMNA 1W20A 4JCKA 1AXZA 3AJYA 3CKZA 2E6VA 1NMCA 2CY6A 1E8UA 4Y22B 2EALA 1GZWA 2XB6C 1HDKA 1W6PB 1Z4YA 3AP6A 4C1WA 1UMZA 1J1TA 2V5YA 4W65A 1V0ZA 2A7AA 2F10A 4UW6A 1SLAA 1MS0A 4HANA 3H71A 3GALA 1WW5A 1W6NB 2Z42A 4XHBA 1A4QA 4BBWA 3MW2A 2EF6A 4XJZA 3K39A 2YZ4A 2CTVA 3WVJA 5H9QA 3SH5A 3LCPA 4NOTA 3FUOA 3ATGA 2P3IA 1WD3A 1D2SA 4TZDA 4M00A 4MWWA 1JYCA 3OJBA 4WV8A 3AZWA 2C9AA 5EYYA 2GNDA 4R9DA 5F9TA 2ZHNA 4XDQA 5JLVA 3MPPG 1JW6A 1NLSA 3N7JA 1HKDA 4XBQA 4WA4A 2QWKA 5EWSA 4HZVA 1WW4A 1WCSA 5JMCA 2ZB5A 1ZM1A 2NZ9A 4CTEA 3ALXA 1VALA 4U36A 1N1YA 1BXHA 1IS6A 5DUVA 4MC7A 1AZDA 4X4AA 1L7FA 2DVAA 2EIGA 2GDFA 4YG3A 4AWDA 4XXPA 2ZAAA 1W8NA 2F27A 2QWJA 4WA5A 2P2KA 4Y20A 5E89A 1LU1A 3ZXFA 2QWHA 4FPHA 2VUAA 1AXKA 2ZA9A 4YLZA 5IK4A 3B7EA 3WDYA 3ZSKA 1LESA 3GVJA 4HZWA 3VUOA 2Q5TA 4XXAA 4HL0A 2F24A 1G9FA 1LGNA 2E51A 4KS4A 3GVLA 4JC1A 3ZSLA 4B7NA 5CA6A 2H0BA 2SLIA 1N1SA 4MWQA 1S0EA 1QOSA 3HR9A 4K1HA 2BQPA 5GALA 4H52A 1LHVA 1INYA 3SALA 1B09A 1EUUA 1QKQA 3AYAA 2HU0A 1DBNA 2AR6A 1RITA 1SLIA 1V0FA 1V0EA 2PHFA 1G7YA 2D7FA 3LSEA 2D6OX 3WDVA 1W6OB 1SLTA 2JECA 1Q8PA 4M3MA 4KBBA 5CNAA 2VWDA 1WW7A 1F8BA 4PBOA 1W8OA 1YXWA 2DU0A 4ZXKA 4XJWA 4Y1UA 4YFZA 5NN9A 2DURA 1AF9A 2CWMA 1GNHA 3GVKA 2W52A 2DYCA 2QWCA 2F25A 4K3YA 2CL2A 4XTPA 4FPKA 2YA5A 2CYFA 1W6PA 2VVZA 4Z8BA 2YV8A 1S0JA 1NN2A 5E8AA 3M1HA 5JOZA 4FPJA 3IMNA 2F11A 5AVAA 1LHUA 4B7RA 2YXSA 2ES3A 2PHUA 1NSDA 3AK0A 1CIWA 3ZXEA 5DG2A 4XMAA 4ISQA 1LEDA 1FV2A 3BODA 4YGEA 2UU8A 1IS4A 4YZ5A 3H72A 3ASIA 4PF5A 2ZGOA 3WUCA 1JOJA 2YA8A 4MWUA 2XZKA 4XILA 1VIWB 4LBMA 5L73A 3WOGA 3CNAA 1W6QB 4XIOA 3AZYA 1NNBA 4XJ9A 2HU4A 1USRA 3CYEA 4Y1YA 4NO4A 1F8EA 2AH2A 4AVTA 4KS3A 1ENRA 1UKGA 4RL7A 1W1XA 1WBLA 3N7MA 4KS5A 2ZGPA 4NCSA 4HZYA 1XOGA 2ZKNA 4CPOA 5GLUA 2ZZJA 1A3KA 5HX0A 2EXHA 2VW0A 4I30A 1GZCA 1EUSA 1GZ9A 1LOCA 3PVNA 2BERA 2EAKA 2XZJA 1B9SA 1UZYA 4B7MA 4WEGA 1Z4WA 1SNTA 1GBGA 3A4UA 3O0VA 4FOYA 1CN1A 4QN4A 1LCLA 3WCRA 2B7YA 2WLQA 2HYKA 3M3CA 2RKCA 2HTYA 1AXYA 3TI4A 2JKBA 4ASMB 5GZGA 2D3SA 3W58A 4B7JA 1I3HA 1G9CA 2NN8A 1VAMA 5HUNA 1F9KA 4RA0A 5CAZA 4M3CF 1C1FA 4YG6A 2ZHKA 1F8DA 1QDCA 2AYHA 2VK6A 2V73A 3O5SA 2A6WA 5IT6A 1IVDA 1QMJA 2YROA 2C4LA 4WVVA 3RMXA 1RIRA 2DWRA 2A70A 3IM0A 1IVEA 3N3HA 3RSJA 5T54A 1LOAA 4MWRA 1W6MB 3OBTA 1W6OA 4GJTA 3M2MA 4FPEA 3H73A 1BYHA 2KM2A 4P9YA 4FQ4A 4BPZA 1DYPA 3SISA 3H6JA 3I4IA 1N3PA 3WG4A 4DRRA 1CPNA 1NCCN 2UWCA 3AP9A 1N47A 3D11A 1SFYA 3ZSJA 4MZAA 3JU9A 3B3QE 5DG1A 4FPGA 4D8SA 1LOFC 3W59A 1CR7A 3USUB 4TYSA 1QOOA 4YM1A 1BKZA 1YRZA 4M3CA 1IOAA 1V3CA 1SLLA 1NMBN 1IS3A 1N3OA 3NV3A 2D3PA 4GKXA 4FPYA 2A6ZA 3IKWA 1PZ9A 4LBQD 2ZGQA 3SITA 1Z4XA 5DUUA 4YFWA 1LHOA 1SLBA 3TI3A 1WLDA 1W6QA 3HMYA 4Y1XA 3AX4A 3TIBA 2GN7A 4BMBA 1G86A 4XOGA 3WCSA 2W38A 3VKMA 3O9KA 3POWA 3WHUA 5EXOA 2YA7A 4Q27A 3T1LA 3FLTA 4MYEA 1W0PA 4AYUA 2DTWA 1MWEA 1QNYA 5GJ6A 1SLCA 1PZ8A 1SACA 2ZABA 4BM8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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