2AH2A

Trypanosoma cruzi trans-sialidase in complex with 2,3-difluorosialic acid (covalent intermediate)
Total Genus 188
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
188
sequence length
633
structure length
624
Chain Sequence
LAPGSSRVELFKRQSSKVPFEKDGKVTERVVHSFRLPALVNVDGVMVAIADARYETSFDNSLIDTVAKYSVDDGETWETQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYVLVGSYNSSRSYWTSHGDARDWDILLAVGEVTKSTAGGKITASIKWGSPVSLKEFFPAEMEGMHTNQFLGGAGVAIVASNGNLVYPVQVTNKKKQVFSKIFYSEDEGKTWKFGKGRSAFGCSEPVALEWEGKLIINTRVDYRRRLVYESSDMGNTWLEAVGTLSRVWGPSPKSNQPGSQSSFTAVTIEGMRVMLFTHPLNFKGRWLRDRLNLWLTDNQRIYNVGQVSIGDENSAYSSVLYKDDKLYCLHEINSNEVYSLVFARLVGELRIIKSVLQSWKNWDSHLSSICTPAGCGPAVTTVGLVGFLSHSATKTEWEDAYRCVNASTANAERVPNGLKFAGVGGGALWPVSQQGQNQRYHFANHAFTLVASVTIHEVPKGASPLLGASLDSSGGKKLLGLSYDKRHQWQPIYGSTPVTPTGSWEMGKRYHVVLTMANKIGSVYIDGEPLEGSGQTVVPDERTPDISHFYVGGYKRSGMPTDSRVTVNNVLLYNRQLNAEEIRTLFLSQDLIGTEAHM
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural Insights into the Catalytic Mechanism of Trypanosoma cruzi trans-Sialidase
pubmed doi rcsb
molecule keywords trans-sialidase
molecule tags Hydrolase
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 188
structure length 624
sequence length 633
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2005-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2ah2A02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 2ah2A01
1LHNA 3H72A 3ENRA 5H9QA 5KXEA 5DUWA 1ENQA 4XOGA 1HQWA 2XZIA 3TICA 3VKOA 3AZYA 4WVVA 1NNBA 2QWJA 2ZGPA 4XXPA 1RIRA 4Y1VA 1N1VA 2D3RA 4X4AA 1A4GA 5GLZA 3WDUA 5M1ZA 3M1HA 1FNYA 2A71A 1D2SA 4OZXA 4AGRA 4MWRA 4FPCA 4DGRA 3MW3A 1N3OA 1VIWB 3SITA 1S0IA 1IVFA 1S0EA 1G8WA 2W20A 2AH2A 3H71A 2C4AA 3WVJA 2R1DA 1EUTA 4YGBA 3N35A 4KBBA 1Z4YA 3AP4A 3USUA 4MWXA 4CPOA 1LU2A 2WQZC 1HKDA 1W1XA 2R49A 1RINA 1G9BA 4HANA 1MS5A 1N1YA 3IPVB 4WEFA 4Q1RA 1QF3A 4CRQA 1OFSA 4FPEA 5DZEA 4P9YA 3B3QE 2YROA 4Y22A 5CB7A 3AZVA 4GZXA 3AP6A 2W68A 2VK6A 5KXDA 2Z42A 4UW3A 4JRAA 5GZGA 2YDTA 3ZXJA 1LODA 3M3CA 3WDXA 2VUAA 1JHNA 1VALA 4LBKA 1Q8QA 3W58A 2NMNA 4SLIA 1MS1A 4ATFA 1MVEA 2D43A 3D6EA 4XJZA 1B9TA 2C9AA 1GNZA 2PELA 3NV3A 4XJ9A 5HUMA 1GV9A 1FNZA 1N47A 4BLIA 3ZXEA 1CPNA 3IKWA 3WUDA 4GZOA 1MS4A 5GZEA 2D3PA 4ZKTB 2VWDA 4MYEA 2YA4A 1D0HA 3QLQA 1SLCA 4CPZA 1CONA 3N36A 4AGVA 5JDBA 1INGA 1VAVA 1ULEA 2VY0A 2WSVA 1LGBA 5JVVA 2W5OA 2AGSA 2GMEA 1LHWA 1UZYA 3PVNA 1MZ5A 4C1WA 4PQ9A 1NMBN 4WZFA 5H9SA 4GWNA 1LEMA 1Z50A 3TI6A 3A71A 1AXYA 5DZFA 3ZYRA 3K37A 1WD3A 2WJSA 4BQ1A 1RITA 3RMYA 4D69A 1S0GA 2PHUA 1IS6A 1V3CA 1IS4A 3IPVA 4MZAA 1G9CA 4Q1PA 1IVBA 5JOWA 1KDKA 2A5ZA 2ZGUA 3WHUA 4YG6A 3AYEA 1BYHA 3AZWA 2WNEA 2HTVA 1NCCN 3AP7A 1LOGA 4M3CF 3ZVXA 5T54A 3CKZA 1Z4WA 2B8HA 4Y26A 1W6PB 3INBA 1N1TA 2RKCA 1ULDA 4YM1A 3WDTA 1V6MA 3IMNA 1SNTA 3APBA 2QWDA 4YZ2A 1LGNA 2ZHKA 4GALA 4K1KA 4BPZA 3AZXA 1GSLA 4CTEA 1SCRA 1GZ9A 1BKZA 2DVDA 1CIWA 1DGLA 4XJRA 4M3CE 2SLIA 5EYYA 2DYCA 2YV8A 3U4XA 3B69A 4Z8BA 4KS1A 4K1HA 4FPYA 1AJOA 3BODA 4FPHA 4QN4A 1QOOA 1NSDA 3ILRA 3L2YA 2A7AA 4PCRA 4GDIA 3MW4A 2SILA 1I3HA 2PHWA 4QN3A 4YZ4A 1XQNA 2ZGTA 3T1LA 2E53A 1F31A 1DYPA 3FFZA 1DLLA 2ZABA 1R1ZA 4WEGA 4WA5A 3TI5A 2ZA9A 2D6LX 3LSDA 1N3PA 4DRVA 4KS4A 1WBFA 1GLHA 2AYHA 1F8BA 4YZ3A 1NN2A 4GEZA 2AENA 2FHRA 5HX0A 4PBPA 3SISA 1MACA 3QCWA 4MWUA 5DUUA 5T50A 4LBMA 4H53A 1IOAA 2GNBA 1B9VA 2P3KA 1YI7A 1Y7BA 3AP9A 3M3EA 2ERFA 4XHBA 1AJKA 5IK7A 2VK7A 3K36A 1W6PA 1SACA 4HZXA 1NMCA 1Q8SA 1IS5A 4DS0A 3N3HA 2DU1A 1Q8OA 2AR6A 4X47A 7NN9A 1F5FA 1ZM1A 2BATA 2JKBA 2UWCA 5HUKA 2NYYA 1UL9A 2W5NA 3D5OA 3V64A 5GZDA 2CNAA 4ZXKA 1Z4ZA 4AVSA 3TI3A 1LEDA 4DQAA 4XJQA 1GICA 4CPMA 2YXSA 3ZYPA 3CL0A 2QWKA 3T1MA 4MWYA 2ZMKA 4MWLA 3POYA 1KJRA 1FX5A 1BJIA 4MWQA 1NCBN 4M4NA 4WA3A 3TB0A 1JOJA 2VU9A 3VKNA 3CL2A 1WCSA 2P2KA 3BEQA 3NV2A 1VCJA 5GLWA 4YW2A 1V6IA 4R9CA 5H9RA 4LBNA 5CBLA 1SCSA 3LSEA 2ZHNA 1DILA 2ZB5A 1INWA 1Z4XA 1UZZA 4FVKA 3R4UA 4LBOA 1W8NA 1LECA 1WW6A 3WCSA 3H0OA 4K1IA 3ZSKA 1GZWB 5SV8A 3BOPA 3K38A 5EWSA 1JW6A 2WT2A 3V65A 2W52A 2WKKA 1NLSA 2BZDA 2VXRA 4R9DA 4NC5A 1NCDN 3GVLA 3RQ0A 4BOWA 2AREA 1DZQA 4GKYA 3AXDA 2DVGA 1INVA 2LALA 2GN7A 4AGGA 3ZXLA 1WUVA 2VH9A 1ONAA 1WCQA 3GALA 1DHKB 4FQZA 1GYKA 1MVQA 3RRDA 1VLNA 3R05A 4ASMB 2EXKA 3UJOA 1WBLA 1WW4A 3B00A 1AX1A 2V73A 1SFYA 2DTYA 4Y1XA 4XYXA 4FZHA 1LOCA 1QU0A 4GWMA 4IQPA 3K39A 3INAA 4JF7A 2GNDA 2DURA 2GNTA 2A6ZA 2YA6A 1AX2A 1INHA 2PHXA 4B7NA 4F83A 4XJ8A 3VKLA 1W6NB 4YW3A 1V00A 3A4UA 2NMOA 2HTRA 2VW0A 3O12A 1W21A 4FPJA 1NSCA 3N7LA 5GZFA 4DPNA 4XTPA 2A3YA 3D4KA 1USXA 1JXNA 3JU9A 1APNA 4Q26A 3ZSLA 4I30A 4MJUA 3WG2A 1DQ6A 2ENRA 1IVEA 1ULGA 3NSSA 1IVGA 2D6PA 3MEPA 1GZWA 3N7KA 2DUQA 1JBCA 2A6XA 3ZXFA 3PVOA 2PHFA 2XG3A 3ALXA 2W39A 5HCAA 1Q8VA 3H73A 4U36A 1SLLA 1WD4A 3TAYA 1LCLA 3A0NA 4YFZA 1V6OA 4FOVA 3WDWA 3VUOA 4ISQA 5IK8A 1MS0A 2EXHA 2R0FA 4FQ4A 3FBYA 2CTVA 1O4ZA 1UX6A 3DGTA 1QNYA 1EUSA 5EYXA 1F8EA 1SBEA 5JYYA 2F29A 1AXZA 4XE9A 4YLZA 3RG0A 3UK9A 3I4IA 4GDJA 1Q56A 3T2TA 4YGEA 4X6KA 4YZ5A 3O9JA 2GMPA 1URXA 1X50A 5JOYA 4QN5A 4XTMA 1LOBA 2D7FA 3A72A 4GXLA 1MS9A 2ZZJA 2ZACA 4YW4A 1CN1A 3SH5A 3KQRA 3BIWE 2SIMA 1ZA4A 2NN8A 2ZB6A 3R4SA 2ZBJA 2A6VA 3MPPG 1W6MB 1W6NA 3SLIA 4NN9A 1DFQA 1MZ6A 1CJPA 5GM0A 3V0AB 1B09A 5HCFA 2JJ6A 1UPSA 4K3YA 1NXD1 2VW1A 2DWRA 3O5SA 4M3MA 5FREA 3FUOA 5T5PA 2WLQA 4XJAA 3SH3A 3FUQA 5T52A 1KRIA 1SLTA 2HTWA 5KXCA 4Q8LA 3B9CA 2F10A 3B7EA 2GN3A 3RS6A 3HR9A 2E7TA 4GZSA 2KM2A 1W0PA 4MJVA 5FRAA 1YRZA 3WG1A 1CPMA 3JU4A 1YO8A 2ZGMA 5IUQA 3OYWB 4CPLA 5DG1A 1V2IA 2NM1A 3WCRA 1C1FA 4XXAA 3NV1A 4Y1ZA 5IK5A 5GALA 3OY8B 5AVAA 1SLAA 1ULCA 2OW4A 4NOTA 1IVCA 1JN2P 5DG2A 1NMAN 1C1LA 3ZSJA 4GB1A 4TYSA 2F11A 2UURA 3WUCA 4Y1UA 1INFA 1G9DA 3AYCA 5F5QA 4Q2FA 4L8QA 1SBFA 4MX0A 5CA6A 1LULA 2YMZA 1HLCA 4FPLA 1W6MA 4K21A 3D11A 3CNAA 4GA9A 4K1ZA 2BERA 4XIOA 2VSMA 3PVEA 4YZ1A 3V0AA 4XHXA 4PBOA 1V0FA 4M3CB 1W8OA 3W09A 1A3KA 4RL7A 4XMAA 2QWBA 1E8UA 1LHUA 2YA5A 2D6OX 4BBWA 5GZCA 3ASIA 4FOWA 2ZGRA 2CL2A 3VV1A 2EF6A 3IM0A 2Q5TA 4PF5A 1I1EA 2OVUA 2HU4A 2EIGA 4W65A 1UKGA 5HUGA 1V3EA 2QWEA 2DVFA 1NCAN 1ENSA 2YZ4A 4JCKA 1PZ7A 5E89A 4UW4A 1W20A 2ZGKA 5L73A 4LBQB 4LBLA 3WZ1A 4HZVA 1AZDA 3ALWA 3AFKA 1QMJA 3V0BB 2QWGA 1GBGA 5HCBA 1Q8PA 4Q6KA 2A75A 1Z4VA 5HUNA 2OUHA 3T1EA 2FMDA 3O9KA 1INXA 3OYWA 1PZ9A 2V5YA 1YIFA 4MZEA 1MS8A 2ZMNA 4MWVA 3N7JA 2DVAA 3WG3A 5JOZA 2PHTA 3OY8A 2ZHLA 2GALA 2QWFA 4ITCA 6NN9A 4HIZA 4XBLA 4BMEA 3M3QA 4H52A 2XZKA 2C5DA 1O4YA 2JECA 1DQ5A 1LHVA 5B2CA 2ZKNA 5GLUA 5GJ6A 2QWCA 4LBQD 3WLUA 2EXJA 2R0HA 4M3CA 3Q9OA 1W6QA 1F8DA 5JLVA 2F27A 1JYIA 2YY1A 1LESA 2NZ9A 2CMLA 4FPGA 2UWAA 1TEIA 2A3XA 1NNAA 1V6JA 2BQPA 3NV4A 2JE7A 3AYDA 1V6NA 3POWA 2GMMA 1BZWA 2CY6A 3SILA 3TIAA 1GANA 3OPZA 4KS3A 4BMBA 4R9AA 1EUUA 4BM8A 3JUUA 3NWKA 4AVTA 3H6JA 3GVKA 2HTUA 4M4VA 4LBQA 5IT6A 1IS3A 1C4RA 3V0BA 4FPKA 4FOQA 1V6KA 4XBQA 1A8DA 3N7MA 4WVWA 2G4IA 4Q27A 1MS3A 1SLBA 1IKQA 3KM5A 3PMEA 4YW5A 1G86A 1INYA 2ZGOA 2XCYA 1LTEA 1HDKA 1UAIA 2DUOA 1DQ4A 4XDQA 4B7MA 1QGLA 5CAZA 3AJYA 3WDYA 2VW2A 3ZXKA 3BTAA 4P14A 1QDOA 4M4UA 1PZ8A 1A4QA 4C1XA 3AZZA 1WLDA 5H9PA 1L7HA 2P3IA 4YW1A 1DIMA 4Q8KA 3W59A 5JMCA 4HL0A 2P3JA 4P9XA 4R9BA 3K3AA 4KS5A 4YGCA 1GKBA 2QWIA 4CPYA 2DUPA 4AYUA 4UW5A 4FP3A 2W38A 3OBRA 4GKXA 1CQ9A 4XILA 2DV9A 1DYKA 4MWJA 1B9SA 1U0AA 1IKPA 3SNMA 1S0CA 2AEQA 3ATGA 1QOTA 2DTWA 3SH4A 1F8CA 3O0XA 2F25A 4YG3A 4GZTA 2WT1A 4XZPA 1A14N 1S0JA 2R16A 4CPNA 2AEPA 5NN9A 1FV3A 4B7RA 2CYFA 4I00A 1GNHA 1Z78A 1N3QA 1MWEA 1QKQA 1G7YA 1LOAA 4AWDA 3AXEA 1ULFA 2P37A 2JDZA 1S0DA 3ZPYA 1WLWA 1DQ2A 3GNEA 1MR5A 2WT0A 1CESA 5BYNA 2QWHA 5F9TA 4FP2A 5CNAA 2OUJA 3AK0A 5E88A 4B7QA 2PHRA 3TI4A 1YXWA 4Y20B 1LOFA 3PJQA 3AYAA 4XBNA 1EPWA 2E6VA 4XMIA 1L7GA 3A0KA 3C2UA 4Y24A 4MC7A 2YA8A 2RHPA 2I2SA 4ISRA 1AX0A 3ZSMA 1JYCA 2D44A 3SANA 3TIBA 4GZWA 4XIKA 3POSA 2F0ZA 2SBAA 2ARBA 4YFWA 2ZGNA 1W6OB 2DU0A 1IVDA 1KITA 4YM0A 2XB6C 1AXKA 4K1JA 3HMYA 1BXHA 1CVNA 3WDVA 1OQ1A 1A78A 1E8VA 1KQRA 1USRA 2W08A 5JOXA 5DZGA 1H9WA 2AUYA 1JUIA 1V0EA 2A3WA 5GLVA 3B01A 2E7QA 2D3SA 1H9PA 4JC1A 5T5OA 5T5JA 2D6NA 3WNXA 4X49A 1V3DA 1NNCA 1OKQA 1J1TA 2HT5A 1QNWA 4H55A 1LENA 1YYNA 1LU1A 4YG0A 3M3OA 1QOSA 3WG4A 2NP0A 2QWAA 5T5LA 2E51A 2DVBA 4XJWA 4ATEA 1WLCA 2A6YA 1UMZA 1ENRA 1EURA 3ILNA 4B7JA 1FV2A 1SLIA 3OJBA 2C4LA 4NCSA 3VKFC 4Y20A 2F12A 2F26A 2D6MA 3WHTA 4HZYA 4CZSA 4DRRA 2GDFA 3OBTA 2YA7A 1WW7A 1V0ZA 1NSBA 1FAYA 4DFSA 1AVBA 2HT8A 3AP5A 1Z0HA 1UN1A 4BLJA 2VVZA 2YDPA 1FYUA 3IN9A 2ZGSA 2B7YA 4Y1YA 2X9MA 4TZDA 2ES3A 1L7FA 2VK5A 5GLTA 2F24A 1SO7A 1H30A 1WW5A 4YM2A 1W6QB 4U2AA 5E8AA 3TI8A 4FPOB 3SALA 3FLTA 1W6OA 1G9AA 2HYKA 3O0WA 5LK5A 3GVJA 4FVVA 1DIWA 4UW6A 1QDCA 1LJ7A 4J9TA 2HT7A 5DUXA 2HTYA 1BJQA 3NN9A 2ZMLA 1W0OA 3WOGA 3M2MA 2UU8A 1LOEA 1S1AA 2LTNA 4AVVA 2ZAAA 4KS2A 4QNPA 3HN1A 4FPFA 5EXOA 2A70A 3VKMA 2XZJA 1S0BA 2ARXA 4NO4A 3O0VA 1KDMA 3AX4A 2VSKA 4RA0A 1FATA 1DQ0A 4YGDA 3FLPA 4HZZA 2ZHMA 1LHOA 4YM3A 1F9KA 5B2DA 4WA4A 3CYEA 2TEPA 4QN6A 2BF6A 4HZWA 2HTQA 3AJZA 2GNMA 2ZGQA 3UJQA 2D6KA 4K20A 1HQLA 4K1YA 3RSJA 2JE9A 4M00A 1XOGA 4GZPA 3UL2A 1KJLA 4UF7A 3OGGA 4GZQA 4QN7A 1SBDA 4GJTA 1DQ1A 2F28A 3D12A 3MW2A 1XOEA 1VAMA 4MWWA 1S0FA 2A6WA 4FOYA 2EXIA 2EALA 4XJUA 1DBNA 5T55A 1GZCA 5DUVA 1G9FA 3USUB 2WSUA 3LCPA 5IK4A 2CWSA 2HU0A 1LGCA 3RMXA 4M01A 5KXBA 3DUIA 2R1BA 1C57A 2EAKA 1E8TA 3FLRA 4FJ6A 1BQPA 1VCUA 1V3BA 1V6LA 2P34A 3ILFA 4D8SA 4Y22B 4P9WA 3I8TA 4WV8A 2H0BA 2JD4A 2CWMA 1LOFC 1AF9A 2UWBA 1CR7A 3WV6A 2ZGLA 1N1SA 2F13A 4LBJA 5DXDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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