2AH2A

Trypanosoma cruzi trans-sialidase in complex with 2,3-difluorosialic acid (covalent intermediate)
Total Genus 188
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
188
sequence length
633
structure length
624
Chain Sequence
LAPGSSRVELFKRQSSKVPFEKDGKVTERVVHSFRLPALVNVDGVMVAIADARYETSFDNSLIDTVAKYSVDDGETWETQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYVLVGSYNSSRSYWTSHGDARDWDILLAVGEVTKSTAGGKITASIKWGSPVSLKEFFPAEMEGMHTNQFLGGAGVAIVASNGNLVYPVQVTNKKKQVFSKIFYSEDEGKTWKFGKGRSAFGCSEPVALEWEGKLIINTRVDYRRRLVYESSDMGNTWLEAVGTLSRVWGPSPKSNQPGSQSSFTAVTIEGMRVMLFTHPLNFKGRWLRDRLNLWLTDNQRIYNVGQVSIGDENSAYSSVLYKDDKLYCLHEINSNEVYSLVFARLVGELRIIKSVLQSWKNWDSHLSSICTPAGCGPAVTTVGLVGFLSHSATKTEWEDAYRCVNASTANAERVPNGLKFAGVGGGALWPVSQQGQNQRYHFANHAFTLVASVTIHEVPKGASPLLGASLDSSGGKKLLGLSYDKRHQWQPIYGSTPVTPTGSWEMGKRYHVVLTMANKIGSVYIDGEPLEGSGQTVVPDERTPDISHFYVGGYKRSGMPTDSRVTVNNVLLYNRQLNAEEIRTLFLSQDLIGTEAHM
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural Insights into the Catalytic Mechanism of Trypanosoma cruzi trans-Sialidase
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Trypanosoma cruzi
molecule keywords trans-sialidase
total genus 188
structure length 624
sequence length 633
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2005-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2ah2A02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 2ah2A01
1CJPA 1Q56A 1MS4A 1NMAN 2P3JA 1CONA 2YV8A 3O12A 5H9PA 2KM2A 5CNAA 5T5LA 3M3EA 1V0ZA 1LOGA 3ILRA 5GLVA 2GMPA 4AVSA 4YLZA 5KXCA 1JOJA 1FAYA 3M3CA 4GXLA 1S0BA 4YM3A 1INFA 2CL2A 2ARBA 3WOGA 2YA5A 4CPZA 4RA0A 4XMIA 1C1LA 1DGLA 1SACA 2D44A 1W21A 3WV6A 4LBQB 3ZXJA 2I2SA 4CZSA 1V6IA 4GB1A 2YA7A 4FPEA 2CWSA 2PHFA 2JE9A 2CWMA 1SLTA 3N35A 1X50A 5KXDA 2DTWA 3TB0A 2DV9A 1SCRA 2HU4A 4GZXA 3WHUA 4XDQA 4XXPA 3ZPYA 4BMBA 3TICA 4DQAA 2ZMKA 1LGCA 1XOGA 2A70A 2OUHA 1ULDA 1WD4A 2ZGUA 3ZXKA 4GZWA 2WQZC 3N7LA 4XJUA 4DS0A 4HZYA 2WSUA 4PBPA 4WEFA 5EYYA 2W5NA 3INBA 4FPYA 5F9TA 4M3MA 4XIOA 5JDBA 1MS0A 1VCJA 1HLCA 3AP5A 3FUQA 1G9BA 1QOTA 4ISRA 1SLLA 2CMLA 3AZYA 4WA5A 1UPSA 3O0XA 3FLRA 2VK7A 3O0VA 4M3CA 1RINA 4FZHA 3WG3A 1IS6A 2HT8A 5DUVA 3IM0A 5DXDA 2LALA 3VKMA 1MACA 1Z4ZA 2YZ4A 4QN3A 1YYNA 2PHRA 2WJSA 5B2DA 1AJKA 1LOFC 3ALWA 4HIZA 3V65A 5CB7A 2DVFA 1INXA 4GJTA 4B7NA 1EUSA 1HDKA 4ZKTB 1GSLA 2BATA 2E6VA 3FUOA 2E7QA 2PHUA 1FX5A 2V73A 1UZZA 1EURA 4BLJA 2YDTA 1GZCA 1KDKA 3MEPA 1Z50A 1W6QB 1HKDA 4XJQA 4JC1A 1APNA 3AZVA 1Y7BA 4FOYA 4Y22A 7NN9A 4JCKA 2ZGOA 3A0KA 1EUUA 1N1YA 2YA6A 4D8SA 2A6YA 1JUIA 1GZWB 3NV3A 4B7RA 3OGGA 2RKCA 4YM1A 4X47A 1RIRA 1ULGA 3ZYPA 3RMYA 4CTEA 2A6WA 4YZ3A 3B69A 1AXZA 5HUNA 1V6OA 1DYKA 4R9BA 5HCBA 3SANA 5IT6A 1W0OA 3AP7A 2WT1A 2EF6A 5HX0A 3AXEA 5GZFA 4B7MA 4FP3A 3OBTA 3AYCA 1DQ4A 3VV1A 5EYXA 4YW5A 5T5OA 4BPZA 3W58A 3ASIA 2ZGSA 4YG6A 2EXHA 5GLUA 2ZGLA 5M1ZA 4M3CB 1AXYA 1YRZA 2GN7A 2QWCA 1KQRA 2ZHKA 1S0GA 2D3SA 2P2KA 3IKWA 1SLCA 1MVEA 2ZHLA 5IK5A 1WW4A 2UWBA 3ZXLA 4DFSA 2E53A 1KJLA 3DUIA 1N3PA 4YM0A 1NLSA 1LU2A 3FFZA 4YFZA 1NNCA 3RRDA 4XJ8A 1JYIA 3CNAA 4YZ5A 2QWJA 3BOPA 5HUKA 3RSJA 1GLHA 2HYKA 3PMEA 1F8EA 4YG0A 5GZDA 4DRRA 3ZYRA 1FNYA 1DIMA 1GKBA 1J1TA 4K3YA 2CYFA 1ONAA 4FPGA 6NN9A 3IN9A 1VIWB 4RL7A 4Y22B 5F5QA 2D3RA 3INAA 4Y20B 2G4IA 2R0HA 3WDUA 1LHWA 2GMEA 5DZGA 1GICA 2ZABA 1F9KA 4M01A 3ZVXA 3H72A 2ZA9A 5DUXA 3U4XA 3SH3A 2WT2A 1PZ7A 1EUTA 1VLNA 4WV8A 2QWHA 4GA9A 1W0PA 4SLIA 4M00A 1IVBA 4LBQA 4QN5A 1SLBA 1LHOA 1KJRA 2R0FA 5FRAA 4MWYA 1MS3A 1WCSA 1S0FA 4BLIA 4C1WA 4WA4A 5DUUA 4KS5A 3WCSA 2ZGQA 4GZTA 1JN2P 4JRAA 2D6KA 4CPNA 2ZGRA 1E8UA 1AJOA 1ENSA 1Z4VA 2EALA 3USUA 2ZACA 4XOGA 3WLUA 1H30A 3RG0A 1LTEA 4ATFA 4XBQA 2ZB6A 3N7MA 1NCCN 4Y26A 3C2UA 1V3BA 1D0HA 1LHUA 4UW4A 1FV3A 1SO7A 3TI3A 2VSMA 1QNWA 3ILNA 4QNPA 2E7TA 2F29A 3M1HA 4YW3A 1G86A 1W8NA 2Q5TA 2ENRA 4FPKA 2A71A 5GZGA 4TZDA 3SNMA 4MZAA 2QWEA 1CQ9A 1LGBA 2VW0A 1V6JA 2YY1A 2VVZA 1YXWA 1NNAA 2A6VA 3N7KA 4MWWA 2ZHNA 5DUWA 3N36A 4AVTA 1AVBA 1G9FA 1A3KA 3IMNA 2F25A 1IVDA 4XMAA 4WVWA 1MVQA 1BJQA 1V3EA 4XBLA 5JYYA 5DG1A 1G9AA 4YGDA 2A5ZA 1IKQA 1NCBN 3VKOA 3WDXA 1KITA 2W68A 3POSA 1IS4A 4UW6A 1Q8QA 2D6NA 1OKQA 4LBMA 1NN2A 1W6MB 5T5PA 3RMXA 3RS6A 1NCAN 1V2IA 4MWRA 3WZ1A 2HTQA 4LBJA 1W6QA 2NZ9A 2NN8A 1D2SA 3GNEA 1WLCA 1DZQA 2VK6A 4FVVA 4I30A 2ZGNA 3M3OA 3O5SA 1WW5A 1Q8PA 3WVJA 3T1MA 2W20A 2F28A 2YROA 3AZZA 5H9RA 1USXA 1JBCA 2D6OX 1GZWA 4WZFA 1V6LA 3USUB 2ZGTA 1A8DA 2E51A 1C4RA 4GEZA 2ZZJA 4ISQA 4K1ZA 4Q26A 3GVKA 1QOOA 1V0EA 4FOVA 4XJAA 2QWAA 5AVAA 1LOFA 4GWNA 1O4YA 1W6PA 1NMCA 3KM5A 2HTVA 4XILA 3LSDA 4YW1A 3R4UA 1V0FA 1F8BA 4ITCA 1N1TA 1CPNA 3CKZA 1DBNA 5H9QA 4P9XA 1DQ1A 3QCWA 1RITA 3H0OA 4YZ4A 4M3CE 3OPZA 4BMEA 3B7EA 2D3PA 2UU8A 5T54A 4GZPA 3SILA 3CL2A 2CNAA 5NN9A 1IOAA 1I1EA 3GVLA 2YA8A 3TI4A 3T2TA 4HZVA 3ZSKA 4FPFA 4QN6A 1G7YA 1V3DA 1USRA 2YDPA 1MS9A 5JOWA 3HMYA 4Q2FA 1C1FA 4GZSA 4DGRA 4FPOB 1INWA 4B7QA 3ALXA 1PZ8A 2B7YA 4MWXA 2D43A 2GN3A 2ZGMA 1DQ0A 1AX1A 2F11A 4MWVA 2Z42A 1N3QA 2AUYA 2AYHA 2ZMNA 1DILA 1LEDA 1WBLA 3K36A 1VCUA 1G8WA 4GKXA 4CPOA 2D6MA 4LBKA 2W5OA 4XBNA 2CY6A 4GALA 3ZXEA 1YI7A 1CVNA 4K1IA 3PVOA 3V0AA 1S0JA 3K37A 3GVJA 1LECA 4Y20A 1QDOA 4PF5A 2UWCA 2W52A 1W8OA 2WNEA 1QF3A 4F83A 1CN1A 2CTVA 1IVGA 1G9CA 1SBFA 1WCQA 5HCFA 1MZ5A 2GNMA 3BIWE 3R05A 2D6PA 2W08A 5BYNA 5GLZA 5IK4A 3KQRA 1W6OB 1UL9A 3LSEA 1IVCA 1V6KA 3PVNA 1UAIA 3WUDA 5LK5A 1L7GA 4K1JA 1SFYA 1W6PB 1F31A 4LBNA 4Z8BA 3VKFC 1DQ2A 4XJZA 2EXKA 2B8HA 2JD4A 2NYYA 3AZXA 2AEPA 3APBA 1BYHA 2AR6A 2VW2A 2ZMLA 2DU0A 5B2CA 4MWUA 2A3WA 4K20A 2R1DA 2A6ZA 3MW3A 5CA6A 3AXDA 2VH9A 5GLWA 2X9MA 3V64A 3PJQA 4P9YA 4WVVA 1PZ9A 2VXRA 1HQLA 1SNTA 2ARXA 2QWFA 1H9WA 5E88A 4MX0A 1GANA 3H73A 1ZA4A 1GNHA 2P3KA 2PELA 4XJ9A 2AEQA 3FBYA 1LCLA 4FOQA 1LEMA 2EXJA 3ENRA 2UWAA 4YG3A 1F8CA 2JKBA 2LTNA 1N3OA 3OY8A 2XB6C 5JVVA 3AP4A 1AF9A 1INHA 1MR5A 2SBAA 3V0AB 1WW6A 5HCAA 2YMZA 3WHTA 5GM0A 3OYWA 1SBEA 3ILFA 5GJ6A 1LHVA 1JXNA 3I4IA 2JECA 1WLWA 2QWDA 4JF7A 1W6MA 2AENA 2DVGA 2HTWA 1Q8SA 1GYKA 1FATA 3HN1A 1EPWA 3SALA 4X6KA 2P34A 3O9KA 4K1YA 3D11A 4K1HA 2VSKA 1SLAA 2D7FA 1A4GA 4GWMA 1LULA 1Z78A 2HU0A 2AH2A 1UZYA 1CR7A 1NSBA 3H6JA 3WCRA 2C5DA 2DUOA 4Y1ZA 2HTRA 2NP0A 1Q8OA 4FQZA 4DRVA 2R49A 3SISA 1KDMA 1CPMA 2ERFA 3WG1A 2DVBA 5KXEA 3R4SA 1NXD1 1URXA 2XZKA 3GALA 3NV4A 3V0BB 3W59A 4M4VA 1FV2A 3L2YA 1FYUA 1S0IA 4U36A 1YIFA 3UJOA 1NCDN 3AX4A 2DURA 4W65A 3AP6A 4YGBA 1SCSA 2W38A 1E8VA 4KS2A 4YGEA 2C4AA 2DVAA 4FPHA 2GNTA 3NN9A 1S0DA 3K38A 3AJYA 1VAVA 3WDWA 4CRQA 1IKPA 1WLDA 1G9DA 4UF7A 2VY0A 3BEQA 1IS3A 1E8TA 1ULEA 4Y1UA 4M4NA 2DYCA 3OY8B 4ZXKA 3BODA 4WA3A 1DQ6A 1H9PA 4GDJA 4R9CA 5JOZA 2VWDA 4ASMB 4YW2A 3AK0A 2WT0A 3AZWA 4YZ1A 4GKYA 3TI5A 2EAKA 2UURA 1LOBA 1CIWA 3OYWB 4FPLA 1N1SA 3SH4A 3WDYA 2A7AA 4M4UA 1AZDA 5HUGA 3TAYA 4J9TA 2ZAAA 4UW5A 2DU1A 3N7JA 4H52A 1DIWA 1LJ7A 2QWIA 3MW4A 5DZFA 1LOCA 3IPVB 5CBLA 2GALA 4KS4A 2AGSA 4L8QA 1Z4WA 2XCYA 1R1ZA 4XTMA 1ULFA 4FPCA 2JJ6A 1NNBA 1L7HA 1DLLA 1UMZA 2P3IA 2HTUA 3NSSA 4K1KA 1V6NA 4WEGA 1S0CA 2GDFA 2QWBA 1N1VA 2F26A 4AGRA 2GMMA 3W09A 5GLTA 4NOTA 4NC5A 4MZEA 1W6NB 3NV1A 2XG3A 3B00A 3H71A 5T50A 3ZXFA 3WDVA 1W6OA 3ATGA 1JHNA 1VAMA 3UJQA 3HR9A 4Q8LA 4KS3A 5L73A 4AVVA 1OFSA 1IS5A 4XZPA 1MZ6A 3TI6A 4BM8A 4YFWA 3WUCA 4PBOA 4YW4A 2SLIA 2YXSA 1NMBN 2DUPA 2WLQA 4AWDA 4I00A 2PHWA 3MW2A 3N3HA 4MWLA 3LCPA 1LOEA 1LOAA 2ZBJA 3UK9A 4MJUA 1QMJA 4FQ4A 3WNXA 5KXBA 1S1AA 5JOYA 3AYDA 1N47A 3AJZA 1LODA 2AREA 2SIMA 1XOEA 4NCSA 4AYUA 4B7JA 2RHPA 5EXOA 1UX6A 1QGLA 2NMNA 1B9TA 1WUVA 2VUAA 4GDIA 1WD3A 1BJIA 4AGVA 3D12A 1DHKB 2PHXA 1BKZA 3ZSMA 4Y1VA 1V6MA 3AFKA 1XQNA 1U0AA 2BZDA 3JU9A 4XTPA 4GZOA 5GZCA 1GV9A 2FHRA 2OW4A 2VW1A 2HT5A 1SBDA 5T52A 3M3QA 2D6LX 4D69A 5CAZA 4YZ2A 3B9CA 1ENQA 1GZ9A 2DUQA 1VALA 3JUUA 3VKLA 2OVUA 2DTYA 2YA4A 2BERA 3AYEA 4GZQA 3B3QE 3SH5A 3Q9OA 1KRIA 3QLQA 1O4ZA 1QNYA 3WDTA 2BQPA 1W20A 1A78A 3AP9A 4H55A 3UL2A 2DVDA 1L7FA 4Q27A 1OQ1A 5IK8A 3PVEA 4HZZA 2H0BA 1WBFA 3ZSJA 1Q8VA 4XJRA 1LHNA 2WSVA 5GALA 1Z4YA 4X49A 3TIBA 3WG4A 1JYCA 1LESA 2GNDA 4H53A 1UN1A 3NV2A 2F27A 2W39A 3A4UA 4XXAA 1MS8A 2ES3A 3SLIA 1NSCA 5GZEA 4XYXA 4YGCA 4TYSA 4OZXA 1LGNA 4P9WA 5DZEA 2EIGA 2WKKA 5EWSA 2C9AA 3OJBA 2JDZA 2A75A 1GBGA 1B9SA 1QU0A 4XHXA 5SV8A 1MS1A 2JE7A 3CYEA 3POYA 2A3XA 5T5JA 4LBQD 1Z4XA 1I3HA 2QWGA 1TEIA 4LBOA 4MJVA 4Q1RA 3V0BA 4ATEA 4FOWA 1DYPA 4FP2A 4P14A 4M3CF 4LBLA 3O9JA 1F5FA 1QKQA 3SITA 1INVA 2XZIA 3T1EA 3MPPG 3OBRA 1B9VA 1IVFA 2EXIA 2VU9A 4Q6KA 4UW3A 3VUOA 4Y1YA 1B09A 4U2AA 3WG2A 1AX0A 2F24A 2A6XA 4BBWA 4CPMA 1JW6A 1INYA 2ZGKA 3K39A 4HANA 5T55A 4AGGA 1V3CA 1FNZA 2BF6A 1WW7A 5JOXA 3A71A 4MWQA 1Z0HA 2GNBA 1LU1A 4NO4A 1AXKA 1BQPA 4PCRA 2OUJA 2F12A 2XZJA 3TI8A 4QN4A 2HT7A 3I8TA 3AYAA 1GNZA 1AX2A 1YO8A 3M2MA 1ULCA 1QDCA 3O0WA 1UKGA 2QWKA 2A3YA 4MYEA 4XE9A 4CPLA 1BXHA 2F13A 3JU4A 4MC7A 1DFQA 3DGTA 3FLTA 4HZWA 2ZHMA 2C4LA 3CL0A 2NMOA 4HL0A 3D6EA 1W1XA 4Y1XA 5DG2A 4BQ1A 2ZKNA 1HQWA 1BZWA 1IVEA 4FJ6A 2F0ZA 3POWA 3A72A 3IPVA 2V5YA 4PQ9A 1C57A 1S0EA 1CESA 4Q1PA 5E89A 1QOSA 4MWJA 4BOWA 4NN9A 4FPJA 2PHTA 5JMCA 3VKNA 2DWRA 4XIKA 3TIAA 3B01A 3NWKA 4Q8KA 1W6NA 4IQPA 1NSDA 2NM1A 5H9SA 4YM2A 4R9AA 2F10A 4Y24A 4KBBA 2FMDA 3RQ0A 2HTYA 1DQ5A 3BTAA 4XJWA 2R16A 4R9DA 1ENRA 1A4QA 2ZB5A 1V00A 1F8DA 4XHBA 4DPNA 4X4AA 4K21A 3D5OA 2R1BA 5JLVA 1MWEA 2TEPA 5HUMA 5IUQA 2P37A 4QN7A 4HZXA 3A0NA 3K3AA 2ZGPA 1MS5A 1SLIA 3FLPA 2VK5A 4KS1A 1INGA 3D4KA 1LENA 1A14N 5IK7A 4C1XA 3ZSLA 1ZM1A 5FREA 3T1LA 2SILA 4FVKA 5E8AA 4CPYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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