2AH2A

Trypanosoma cruzi trans-sialidase in complex with 2,3-difluorosialic acid (covalent intermediate)
Total Genus 188
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
188
sequence length
633
structure length
624
Chain Sequence
LAPGSSRVELFKRQSSKVPFEKDGKVTERVVHSFRLPALVNVDGVMVAIADARYETSFDNSLIDTVAKYSVDDGETWETQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYVLVGSYNSSRSYWTSHGDARDWDILLAVGEVTKSTAGGKITASIKWGSPVSLKEFFPAEMEGMHTNQFLGGAGVAIVASNGNLVYPVQVTNKKKQVFSKIFYSEDEGKTWKFGKGRSAFGCSEPVALEWEGKLIINTRVDYRRRLVYESSDMGNTWLEAVGTLSRVWGPSPKSNQPGSQSSFTAVTIEGMRVMLFTHPLNFKGRWLRDRLNLWLTDNQRIYNVGQVSIGDENSAYSSVLYKDDKLYCLHEINSNEVYSLVFARLVGELRIIKSVLQSWKNWDSHLSSICTPAGCGPAVTTVGLVGFLSHSATKTEWEDAYRCVNASTANAERVPNGLKFAGVGGGALWPVSQQGQNQRYHFANHAFTLVASVTIHEVPKGASPLLGASLDSSGGKKLLGLSYDKRHQWQPIYGSTPVTPTGSWEMGKRYHVVLTMANKIGSVYIDGEPLEGSGQTVVPDERTPDISHFYVGGYKRSGMPTDSRVTVNNVLLYNRQLNAEEIRTLFLSQDLIGTEAHM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural Insights into the Catalytic Mechanism of Trypanosoma cruzi trans-Sialidase
pubmed doi rcsb
molecule keywords trans-sialidase
molecule tags Hydrolase
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 188
structure length 624
sequence length 633
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2005-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2ah2A02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 2ah2A01
3N7MA 2R16A 4XJWA 2P34A 1S0EA 1ENQA 2YV8A 2CWSA 1L7GA 2R0HA 2RHPA 1GZWB 1YIFA 4P9XA 1VCUA 2YA7A 4B7JA 4HZZA 1NSDA 1YXWA 1B9SA 1CJPA 4UW4A 2CTVA 2I2SA 1MS5A 1A4QA 2OUJA 2V73A 1LODA 4C1WA 5JMCA 3AP9A 3TB0A 4YZ1A 1LULA 5B2DA 1OFSA 1SO7A 2AEPA 3N7JA 2JJ6A 1SCSA 1LESA 2ARBA 3WLUA 4MWRA 5JLVA 1EURA 4MX0A 3POWA 5T54A 4ZXKA 2D43A 3WZ1A 4HZYA 3O0WA 4YZ5A 2F0ZA 3ZXFA 3T1MA 2R0FA 1J1TA 5GJ6A 1XQNA 4MWVA 3RS6A 1O4YA 7NN9A 1MVQA 4FZHA 2ZKNA 3MW3A 4XIKA 2DVBA 3IPVA 1JN2P 2DVAA 4Q8LA 1INGA 1SFYA 1YRZA 5GLUA 2JECA 1Z78A 2NN8A 2HTVA 2NP0A 1IKQA 5B2CA 1VLNA 4YGDA 4M00A 1IS3A 4FPYA 1MS8A 1LHNA 5KXCA 1BYHA 2W39A 3UL2A 3O9JA 5T5LA 4BM8A 4YM1A 2BF6A 5NN9A 5CAZA 1DQ2A 1FATA 2HU4A 4WVWA 3POSA 2A6VA 1Q8PA 4GWNA 2ENRA 1C1FA 1VALA 2D3RA 4BMEA 1V00A 5HCAA 3FBYA 3RRDA 2DUPA 2SILA 3FUOA 5JOYA 2QWJA 3D5OA 3W09A 4XTPA 1V6NA 3GVJA 1NCDN 1FYUA 1V6MA 3ZPYA 3HR9A 2AH2A 4YW3A 2QWKA 5JOZA 2VXRA 1I1EA 2DURA 3MEPA 2D6LX 3I8TA 1ULCA 4KS2A 1MS9A 3TI3A 5KXEA 2QWHA 2GN3A 3IPVB 3SH5A 1INVA 1UZYA 4XOGA 1UL9A 4C1XA 4WEFA 4D69A 2YDTA 1EUSA 3FLRA 3ZSKA 4MZEA 4AGGA 4LBQA 2ES3A 1QMJA 2OVUA 4LBOA 3SANA 3POYA 1N1TA 1DQ6A 4DGRA 1RIRA 3CL2A 3TIAA 4FP3A 2ZGOA 1W6QA 3AXDA 1V6JA 4YG3A 5T5JA 2ZZJA 1KJLA 2D6NA 5KXDA 4YW1A 2JE9A 2P3KA 1LHOA 2JD4A 1HLCA 1U0AA 3T1LA 2A6WA 4GZSA 4P14A 1LENA 1INFA 2EAKA 4XBLA 4PF5A 2XZKA 4AVVA 4CPNA 4HZXA 2WJSA 3WG1A 3FUQA 4Q2FA 1G9CA 1JYIA 1F5FA 4GJTA 1LU1A 2D3PA 1E8VA 4Y1UA 2F26A 1SCRA 1DZQA 2HTYA 1WCSA 1LOGA 4HIZA 2DYCA 2PHWA 1SLBA 3B01A 5FREA 4YZ4A 5GLZA 4MWUA 4X49A 3AYDA 1MVEA 1LOCA 3RQ0A 4TZDA 3INAA 4DFSA 3M3CA 4LBQB 1IVFA 2GMEA 3ALXA 3VKOA 4K1KA 1KQRA 1ZM1A 4GKYA 3NSSA 2YA6A 2DTYA 4GEZA 1W6QB 5F9TA 2Q5TA 4XJAA 4MWXA 3SH4A 4Y24A 3WG3A 1IS6A 4B7NA 1Q8SA 1QGLA 5JVVA 3TIBA 2WSVA 5L73A 2LTNA 3ILFA 4XJQA 3IN9A 3ASIA 1SLCA 1QU0A 3WG4A 2Z42A 5JDBA 4DRVA 2PHRA 4WA3A 4JRAA 1UPSA 1QOTA 4Y26A 1GBGA 1AX1A 2R1BA 1USXA 1Q8QA 1WD3A 1A8DA 1LGNA 4BOWA 1N1VA 1ULDA 4K1HA 3INBA 4MWYA 2E53A 2A6ZA 2EXJA 5CA6A 1Z4XA 3WHUA 2WNEA 4BLJA 3VKNA 5GZFA 3IKWA 5DUWA 2ARXA 3M2MA 1BXHA 3B3QE 4NN9A 1R1ZA 1JYCA 1JBCA 1F8CA 4XTMA 4FOVA 1LOBA 3TAYA 1WBLA 1UKGA 1KDMA 2A5ZA 1N3OA 2E51A 2F13A 4NOTA 3CL0A 1S0JA 4GZQA 4Y1VA 5H9QA 1E8UA 3A0NA 4AGVA 1G9BA 4XHXA 1W6PA 1Z4YA 1L7FA 5GALA 1GKBA 3V0BA 4XZPA 3FLPA 4DQAA 2YA5A 2ZHNA 2GMMA 4FVVA 3WDYA 3O9KA 4P9YA 3PVOA 4FPEA 3WHTA 3O0XA 4YM3A 4XE9A 1F8DA 2C5DA 2JE7A 2YY1A 1D0HA 5IK8A 2PHFA 2ZGKA 2VSKA 2HTQA 5H9SA 1EPWA 3A0KA 2AEQA 2F25A 4K1YA 4KS3A 2A70A 1Z0HA 2WT0A 1IVDA 3BODA 2HTRA 3UJQA 4U36A 4YW4A 2F27A 5F5QA 1QNYA 1E8TA 3N36A 4R9BA 4ISRA 1ZA4A 5DZFA 2D3SA 3ILNA 4XJUA 3RMYA 2VK5A 1N3QA 2AUYA 2F24A 2D6MA 1PZ8A 1NMBN 2XZIA 4YG0A 4XJZA 3SITA 2OW4A 1W8NA 3USUA 2A6XA 5EYXA 3ZXLA 1IVGA 2TEPA 2ZBJA 1NCCN 1H30A 1W6PB 1B9VA 1VAMA 1IKPA 1S0GA 5FRAA 1DIMA 3M3EA 2KM2A 2ZGUA 3ENRA 2VK6A 3GVKA 3V0BB 3WUCA 4FPJA 4XHBA 4WA4A 4GXLA 3SISA 1AXKA 5DZGA 5GZEA 1CPMA 2YA4A 3OYWA 5HUMA 3R4UA 3M3QA 1C57A 1V3BA 3WVJA 2VU9A 1O4ZA 1NCAN 2NZ9A 2ZHKA 2XZJA 2VK7A 3WDXA 3CYEA 1IVBA 3ZYPA 4CPLA 2GDFA 1MS0A 2W68A 1CPNA 2HU0A 4GDJA 1VCJA 4M4VA 3AZWA 4M4UA 1MWEA 2NMOA 4FPCA 1INXA 3WCRA 1Y7BA 2ZGSA 3USUB 4YW5A 3B7EA 3UK9A 5EXOA 1WUVA 5GLWA 2NYYA 5EWSA 2DUQA 1GYKA 2HTUA 4YGBA 1DYKA 2F11A 3R4SA 1GZCA 2P3IA 3D12A 1DQ4A 4DPNA 1S1AA 1RITA 2YROA 1G9FA 2QWFA 4AVSA 3GVLA 4K1JA 3OYWB 2CWMA 1Z4VA 2EALA 1WLDA 4FPFA 1G8WA 2GNMA 2HTWA 1V6IA 1IOAA 1GSLA 3NV3A 1INHA 3CNAA 1LJ7A 3WNXA 1SNTA 1DFQA 1V0ZA 1IVCA 3ZYRA 4MYEA 3WV6A 2HT7A 2F10A 1ULFA 4M3CF 3WDUA 3ALWA 1LHWA 2X9MA 3LCPA 1INYA 3WDWA 4FOWA 1INWA 1A4GA 1LHVA 3BTAA 2ZGMA 1V3EA 2BERA 3AX4A 1MS1A 2GNBA 1W21A 3T1EA 4HANA 3LSEA 1VIWB 1LGBA 4YFWA 5AVAA 3K3AA 3TI5A 3M3OA 4ZKTB 4MWJA 4YLZA 5HX0A 2PHXA 1JHNA 2F29A 1Z4ZA 2ZB6A 2CY6A 1FNYA 2V5YA 4M3CA 3N35A 2YMZA 2C4AA 4YG6A 1VAVA 1F8BA 4MWQA 1KITA 1HDKA 4Y1XA 2QWGA 4W65A 1AJKA 2ERFA 4ATFA 1SBDA 3H72A 4XXPA 2ZGTA 4CPYA 5GLVA 4CPZA 1LHUA 3AP5A 5E88A 3VUOA 1WW5A 3AZVA 2XG3A 4MC7A 2P3JA 1A3KA 4XXAA 1S0IA 1QF3A 4CZSA 2RKCA 1SLLA 1MZ6A 2PHUA 3GNEA 3HMYA 2XB6C 4GZPA 2UWAA 3H0OA 2ZMKA 1XOEA 4YW2A 1H9PA 5HUGA 2ZACA 1Q56A 1DGLA 4R9AA 1CVNA 3AJZA 4UW6A 4QNPA 5GZCA 2VH9A 3QLQA 1GANA 4FPLA 1L7HA 3W58A 2VUAA 5GLTA 4GA9A 4FP2A 4H53A 1USRA 4IQPA 4H55A 2VW2A 2D6OX 4M3CB 3BOPA 2SBAA 1F9KA 5T5OA 4M3CE 4LBLA 3C2UA 3MW4A 4XJ9A 1ONAA 3TI4A 3IMNA 3JUUA 1EUTA 4FOQA 1APNA 5DUUA 5IK7A 3Q9OA 2WKKA 2DVFA 4MWLA 3SILA 1GLHA 4XIOA 1W0PA 4QN3A 3AP6A 2C9AA 3PVEA 1H9WA 2WT1A 3M1HA 4U2AA 1S0CA 4HL0A 3V0AA 3T2TA 2D44A 1DBNA 1GZ9A 1QDCA 1FX5A 3AYCA 5E8AA 5DG2A 1V0FA 3RSJA 3APBA 2UU8A 1JOJA 4LBMA 3SH3A 1G7YA 3HN1A 4I00A 1URXA 4XJRA 4XILA 5IUQA 1NNBA 5DZEA 3K39A 5GM0A 4KS4A 4NCSA 1N1SA 1GV9A 4ATEA 2ZB5A 4K20A 5CNAA 1OKQA 1MS3A 4NC5A 1W6OA 1HKDA 5DUVA 5LK5A 2ZGLA 4XBNA 1FAYA 4RL7A 3UJOA 2A75A 3OPZA 4JC1A 2VWDA 1NNCA 4Q1PA 1WW6A 2CL2A 4Y22A 1B9TA 1LEMA 2A6YA 2GNTA 1WCQA 4UW5A 2E7QA 1S0DA 2AENA 3VKLA 1FNZA 5DUXA 1QOSA 4K1ZA 2UURA 4LBJA 4HZWA 1WBFA 1SLIA 1W6MA 1LGCA 2B7YA 3A71A 4Z8BA 3TI8A 3WCSA 1CESA 4LBKA 4BMBA 1V6OA 1W1XA 2HT5A 1A78A 4Y20A 1MR5A 2DWRA 1BQPA 1C1LA 1ULGA 1DQ5A 3ZSLA 2ZHLA 4AYUA 2P37A 2AREA 1BJQA 4M3MA 5GZGA 3NN9A 1ENRA 3NV1A 1V0EA 1DQ1A 1JXNA 2E7TA 1V2IA 5JOXA 2A71A 1QKQA 3B9CA 4PBPA 1W6OB 4XJ8A 3LSDA 4Q6KA 4GDIA 4YM0A 1NXD1 3V65A 1DLLA 1LECA 2AR6A 4GWMA 4AWDA 4Y22B 1WW4A 2QWIA 3KM5A 2FMDA 4FPGA 3SALA 1UN1A 1AVBA 4FQ4A 4AVTA 1V6LA 3IM0A 2VW0A 1UAIA 1TEIA 1HQWA 2H0BA 5DXDA 1W6MB 4JF7A 2GALA 5HCBA 1MZ5A 3AK0A 2DUOA 4NO4A 4SLIA 3B69A 1SBFA 5JYYA 1LOFC 2YZ4A 5IK4A 1C4RA 2DV9A 2ZABA 4Y20B 3ZXJA 1ENSA 3AXEA 3GALA 4UF7A 3N7LA 1AF9A 1G86A 1BJIA 1NN2A 3H71A 4F83A 4CRQA 4M01A 3VV1A 1W8OA 5HCFA 1F8EA 2QWBA 2ZGNA 2CMLA 3KQRA 3CKZA 3VKMA 5CB7A 2GMPA 4FPHA 1RINA 1ULEA 1G9DA 1YI7A 3ZVXA 4WEGA 3WOGA 4K3YA 4YGCA 3V64A 4R9DA 4KS5A 2EXHA 3A4UA 2JDZA 4X6KA 1SLTA 1B09A 1DQ0A 3NWKA 2PHTA 2DVGA 5T52A 3H6JA 5M1ZA 2D6PA 2CNAA 3RG0A 1QDOA 1MACA 3OY8A 4DRRA 3PVNA 2VVZA 4OZXA 4FJ6A 1MS4A 4KBBA 4HZVA 4TYSA 5E89A 4GZXA 1OQ1A 2YDPA 2WSUA 4CPOA 1GICA 5KXBA 4WA5A 3WDVA 5IK5A 4WZFA 4B7MA 2GNDA 2W52A 3O0VA 3K37A 2JKBA 1Z50A 1LOFA 4Q8KA 1DYPA 4FPOB 5JOWA 1S0FA 4AGRA 4Q27A 1AZDA 3JU4A 1NCBN 2PELA 5T55A 4WVVA 4XMAA 2YA8A 4PQ9A 2GN7A 2QWAA 5IT6A 2UWCA 4QN7A 4YZ3A 4ITCA 3WUDA 4XDQA 4GB1A 3AJYA 1HQLA 1AJOA 3FLTA 4ASMB 5HUKA 3K38A 4XBQA 1KDKA 3MW2A 3OY8B 3OBTA 4MJUA 3I4IA 3N7KA 4QN5A 2HYKA 3OGGA 4WV8A 4BBWA 4LBNA 4KS1A 2E6VA 4DS0A 1SLAA 4Q26A 1EUUA 3DGTA 5T5PA 2A3XA 1WD4A 2WT2A 2R49A 3D4KA 3NV4A 3AZYA 1AX0A 4Y1ZA 2D6KA 2XCYA 1W0OA 1BZWA 3ZSMA 1AXZA 1KRIA 4YM2A 2F28A 4LBQD 4CPMA 1NMAN 2AGSA 4MJVA 2VSMA 1QOOA 3DUIA 4X47A 1WLWA 4K21A 1IS4A 2C4LA 3WG2A 3SLIA 2BZDA 2YXSA 4Q1RA 3QCWA 3K36A 1PZ9A 3BEQA 1A14N 1NSBA 5CBLA 3FFZA 4J9TA 3OBRA 1LOEA 3O12A 3W59A 4YFZA 4M4NA 3TICA 2AYHA 5T50A 1IVEA 4X4AA 3PMEA 1NSCA 1QNWA 2UWBA 4P9WA 3BIWE 1DILA 2NM1A 2ZA9A 4YGEA 1BKZA 2QWDA 4GKXA 3ZXKA 5SV8A 4RA0A 1IS5A 4GZWA 2W5NA 1FV3A 2CYFA 2W38A 2VY0A 1Z4WA 2EF6A 3L2YA 1WW7A 1LCLA 2VW1A 5DG1A 1NNAA 4ISQA 2P2KA 2ZMLA 2QWCA 2DU0A 3AFKA 4L8QA 1CR7A 1GNZA 3AYAA 1N3PA 2A3WA 1I3HA 2W20A 2ZGQA 1NMCA 4B7QA 2LALA 3AP4A 5HUNA 1W6NA 4QN4A 2EXIA 2BQPA 1UMZA 4FPKA 1JUIA 2R1DA 2DU1A 3AYEA 2ZGRA 2A7AA 1X50A 2FHRA 4B7RA 1D2SA 4UW3A 1NLSA 2NMNA 1KJRA 4H52A 3WDTA 2D7FA 1PZ7A 4FVKA 3ILRA 1LU2A 3NV2A 3H73A 4PCRA 2WQZC 2ZMNA 5BYNA 1S0BA 3JU9A 1LOAA 2W08A 4BLIA 4BQ1A 5EYYA 3V0AB 4JCKA 1XOGA 1AX2A 4MZAA 1CIWA 4QN6A 1GNHA 4BPZA 1CONA 1DHKB 3MPPG 3A72A 1CQ9A 4I30A 4MWWA 1LTEA 1WLCA 3N3HA 4FOYA 1Q8VA 3RMXA 2DTWA 6NN9A 2EIGA 2G4IA 3ATGA 1JW6A 1F31A 3AZXA 4FQZA 2OUHA 4R9CA 1CN1A 4XMIA 4Y1YA 2SIMA 1GZWA 2EXKA 2WLQA 3B00A 1W6NB 1V3DA 2W5OA 3TI6A 4CTEA 1LEDA 2QWEA 3U4XA 3R05A 1Q8OA 4GZTA 1YO8A 2B8HA 2ZAAA 5GZDA 3VKFC 1AXYA 1UX6A 1DIWA 1SBEA 2BATA 1N47A 5H9PA 3D11A 5H9RA 2HT8A 3SNMA 4D8SA 2A3YA 1UZZA 3PJQA 2ZHMA 2ZGPA 3ZXEA 4GZOA 2F12A 4K1IA 1SACA 1FV2A 3OJBA 4YZ2A 4PBOA 2SLIA 3AP7A 4XYXA 4GALA 3O5SA 3ZSJA 1V3CA 1V6KA 1W20A 1YYNA 3AZZA 2DVDA 1N1YA 1G9AA 3D6EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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