2AH2A

Trypanosoma cruzi trans-sialidase in complex with 2,3-difluorosialic acid (covalent intermediate)
Total Genus 188
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
188
sequence length
633
structure length
624
Chain Sequence
LAPGSSRVELFKRQSSKVPFEKDGKVTERVVHSFRLPALVNVDGVMVAIADARYETSFDNSLIDTVAKYSVDDGETWETQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYVLVGSYNSSRSYWTSHGDARDWDILLAVGEVTKSTAGGKITASIKWGSPVSLKEFFPAEMEGMHTNQFLGGAGVAIVASNGNLVYPVQVTNKKKQVFSKIFYSEDEGKTWKFGKGRSAFGCSEPVALEWEGKLIINTRVDYRRRLVYESSDMGNTWLEAVGTLSRVWGPSPKSNQPGSQSSFTAVTIEGMRVMLFTHPLNFKGRWLRDRLNLWLTDNQRIYNVGQVSIGDENSAYSSVLYKDDKLYCLHEINSNEVYSLVFARLVGELRIIKSVLQSWKNWDSHLSSICTPAGCGPAVTTVGLVGFLSHSATKTEWEDAYRCVNASTANAERVPNGLKFAGVGGGALWPVSQQGQNQRYHFANHAFTLVASVTIHEVPKGASPLLGASLDSSGGKKLLGLSYDKRHQWQPIYGSTPVTPTGSWEMGKRYHVVLTMANKIGSVYIDGEPLEGSGQTVVPDERTPDISHFYVGGYKRSGMPTDSRVTVNNVLLYNRQLNAEEIRTLFLSQDLIGTEAHM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
source organism Trypanosoma cruzi
publication title Structural Insights into the Catalytic Mechanism of Trypanosoma cruzi trans-Sialidase
pubmed doi rcsb
molecule keywords trans-sialidase
total genus 188
structure length 624
sequence length 633
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2005-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2ah2A02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 2ah2A01
1G9DA 4XYXA 2EAKA 1NSDA 4W65A 3LCPA 4WV8A 4AYUA 5CA6A 2QWJA 4R9BA 2NMNA 4UW3A 1W6MA 3T2TA 3PJQA 2VK6A 1MS1A 5KXBA 4JC1A 3D6EA 4FVVA 3RQ0A 2ZZJA 4YW3A 4UW4A 5H9PA 3O9KA 4CPMA 1GANA 1Y7BA 4M3CA 4DFSA 3IPVB 2A70A 5DUVA 4BLJA 3ZXEA 4XTPA 3I8TA 1OFSA 2ZGOA 1QDOA 5HCFA 2YROA 5GLVA 4BBWA 1F31A 4AVVA 1A78A 1F8CA 3L2YA 3T1LA 3ILRA 1V3EA 2ZB5A 2VK7A 2CWSA 2ZHLA 3PVNA 1LHOA 2ZGTA 3ZSKA 3NV3A 2HYKA 3BODA 3QCWA 4GZSA 3IKWA 1ULGA 4KS3A 1XOEA 1N47A 2PHWA 1SLCA 5HUKA 1SLLA 1FV2A 4HANA 2PHFA 2DU0A 4HL0A 1GZWB 1VAVA 2CL2A 1SFYA 3O0WA 1HDKA 1C4RA 3O0XA 5H9QA 3GVJA 1ONAA 2A71A 3HR9A 1IVBA 4Q1RA 5GJ6A 4FZHA 3U4XA 1BQPA 2DVGA 4MJUA 4FPJA 5EWSA 2R1BA 3AP6A 2E51A 1NNCA 2F26A 2B8HA 2VXRA 5HUNA 2XB6C 3W59A 3WDYA 3ENRA 3V0AB 1ENRA 4MYEA 1LGBA 2ZGPA 2JECA 1LECA 4ZXKA 2VUAA 4MJVA 4J9TA 2AREA 2WT1A 1C57A 5E89A 4TZDA 3Q9OA 3ZYRA 2F12A 3AX4A 3O9JA 1LHNA 4MWUA 4M4VA 4MWJA 4I30A 4LBQB 1IVEA 1IOAA 2EXHA 4K3YA 3KM5A 1ULFA 1NNBA 4NC5A 4Y22A 4DQAA 3AK0A 3ZSMA 4XE9A 3UJOA 2HTQA 4Y20B 1EURA 4B7QA 4XZPA 2DVAA 4XJRA 3BTAA 2DTWA 1W6QB 4Y1XA 4Q26A 1E8UA 2ZGQA 3ZVXA 4ATEA 3TB0A 1EUSA 2F28A 2UWCA 1GNHA 1CR7A 4GZPA 2HTRA 1PZ9A 3W09A 2QWEA 5EYYA 2CYFA 2F10A 3FLPA 1GNZA 4HZYA 1QNYA 3OPZA 4WA3A 3WDWA 2AUYA 2ZGNA 1QDCA 1G86A 4M3CF 4NCSA 2ZHNA 1S0IA 4AGRA 2ZGRA 4WEGA 1V6LA 2ZBJA 4CZSA 1W1XA 5HCBA 3INBA 3PMEA 3CL0A 4D69A 3AZYA 2F13A 4XJUA 3B00A 4FPEA 4NO4A 3POSA 2G4IA 3ILFA 3ILNA 5DZFA 3WUCA 2JDZA 2A3YA 3T1EA 4PCRA 1S0JA 4NN9A 1LESA 3R4SA 2DVDA 4YGBA 1QGLA 1SBFA 2EALA 3N7LA 3WNXA 4ZKTB 3ASIA 4IQPA 1NSBA 2HTVA 5GLWA 4Z8BA 1N3PA 4FVKA 4MWXA 3AFKA 2E7TA 1JYIA 4D8SA 4K20A 3O12A 4WA4A 2W08A 1S0FA 1KJLA 5BYNA 1A3KA 3M3QA 1G9CA 1Z50A 2VW2A 3ZXFA 3AZWA 4YG0A 4LBLA 2PHXA 5EYXA 2YV8A 5JYYA 4K1IA 1W6NA 1SCRA 2JJ6A 3AXDA 4FPKA 2WLQA 4AWDA 2GNDA 1JBCA 2JD4A 5DG2A 3AYDA 4BMEA 3AYAA 4B7NA 4RL7A 1WW7A 3MPPG 1V0EA 2UWAA 4Q8LA 4K1YA 4QN6A 4BMBA 2UWBA 1NMBN 4YGDA 4CPZA 4Q8KA 1W8NA 1INHA 3O5SA 3HN1A 1MZ5A 4FPOB 1L7HA 3WVJA 3WHUA 4Q1PA 1H9PA 2VY0A 1ZM1A 1F5FA 3C2UA 4YZ1A 5IK7A 1F8EA 4YM1A 1Z0HA 4YM2A 3ZXKA 3JUUA 5DUUA 4XDQA 1MVQA 3TI5A 2CWMA 3WOGA 3V0BA 1Q8SA 2AGSA 2VK5A 4X4AA 3AYEA 4YW2A 1UX6A 5T54A 1IVGA 2YA6A 4AGVA 2GMMA 2Q5TA 1ULCA 5JOYA 2V73A 4FOQA 1J1TA 1D0HA 3AP7A 4X47A 4P9YA 4KS2A 2D6PA 1USXA 2EIGA 3VKMA 1HKDA 4YZ2A 4XBLA 2QWHA 2DTYA 2A6XA 1B9VA 3N35A 2F27A 1DQ5A 2FMDA 4K1KA 2QWKA 4DRRA 4PQ9A 4YFWA 1MACA 4BOWA 2XG3A 5HUMA 5T5LA 3SNMA 1AX0A 4FPHA 5H9SA 4M01A 3D11A 3ZSLA 3M3CA 3ZPYA 2ERFA 3AZXA 4ISRA 2NMOA 1KDKA 3VUOA 4R9DA 1UZYA 2V5YA 3TI3A 2DUPA 2D6OX 3SANA 1JUIA 1SBEA 2D6KA 2D6NA 3M1HA 4LBNA 1NMCA 2PELA 1FX5A 1NMAN 1LGNA 2D6MA 1ENQA 4UW6A 4FP2A 4FPCA 5JVVA 4Y24A 1W6OA 3AZZA 2XZJA 3K39A 5CAZA 1H30A 1GV9A 1RINA 1FAYA 2P34A 3OJBA 3AP5A 3FUOA 4HZWA 1GZCA 3TIAA 2XCYA 2W39A 1W21A 2W20A 2DUQA 1UZZA 1DQ6A 2E6VA 4GJTA 2ZMNA 4XJQA 4FPLA 3SH4A 4GZQA 4QNPA 2A7AA 2CY6A 2NZ9A 2P2KA 1G9BA 4YZ5A 5GM0A 4KS4A 2HTYA 1DIMA 4PBOA 1V3BA 3K36A 1LOGA 2DVFA 2ZABA 2WSUA 4YGEA 4PF5A 2YMZA 4BLIA 3H71A 4GA9A 4L8QA 1UPSA 4H53A 4Y22B 3O0VA 3WHTA 2WT2A 3NN9A 2ES3A 2OUJA 4B7JA 3VV1A 1QKQA 1N1TA 2P3KA 4U2AA 1SNTA 3WLUA 5FREA 1INYA 3NV4A 4I00A 4SLIA 5B2CA 1LJ7A 3OY8B 4Y1VA 2W5OA 2A5ZA 4X49A 1WD4A 2D7FA 2BQPA 3TI6A 3ATGA 2WKKA 3N7JA 3VKFC 2ARBA 3GVKA 1A4QA 1YRZA 1IVFA 2BZDA 2DVBA 4WVWA 3V64A 1LEDA 1DQ4A 2PHUA 1X50A 3UK9A 3GVLA 5GZEA 4X6KA 4YM0A 1YI7A 1Q8PA 2JE9A 2F11A 3USUB 1FNYA 1UMZA 1V00A 3VKNA 2QWGA 3WV6A 1WLWA 2W68A 1AF9A 4MX0A 2DURA 1UL9A 1VIWB 5T52A 2YDTA 3WCRA 1RITA 1I1EA 3FUQA 3IPVA 4QN5A 2OW4A 4M3CE 4K21A 1QMJA 5B2DA 1DQ2A 2F29A 5F5QA 2ENRA 1NLSA 5DZGA 1L7GA 4WVVA 2NP0A 3D5OA 4XOGA 1MR5A 3K37A 6NN9A 1I3HA 4XIKA 1WUVA 1VALA 4XILA 1JXNA 3OYWA 3B7EA 1LULA 1UAIA 1A8DA 1NCCN 4MWQA 3APBA 1INVA 2GMEA 2R0HA 3RMXA 3VKLA 2XZKA 5IK8A 1NCBN 1W6PA 3I4IA 1NCDN 3POYA 4CPYA 4DGRA 2X9MA 4K1ZA 2BERA 2VVZA 5IT6A 4UF7A 1LOAA 1CPNA 4ATFA 1KDMA 5FRAA 1GZWA 4FPFA 4HZXA 3DGTA 4WA5A 4KS1A 1MVEA 1Z4YA 1W6NB 1B9TA 1NN2A 3A4UA 4MZAA 4GXLA 5F9TA 2RKCA 4LBJA 5JMCA 5DUXA 1USRA 1V0ZA 2EXKA 4Y26A 1UN1A 5GLZA 1Z4VA 2W5NA 1ENSA 2AEPA 3AJZA 1W8OA 1BZWA 1S0GA 1A14N 1LOBA 4ISQA 2C4AA 4YM3A 2SLIA 3TI8A 1FYUA 4Q6KA 4M00A 4CPLA 3RSJA 4HIZA 5E88A 2UU8A 1IKQA 1F8BA 5T5JA 3WDTA 1U0AA 1OKQA 1Q8OA 2QWIA 2W52A 5EXOA 3LSDA 4MWLA 2I2SA 4Y20A 3DUIA 3FLTA 5HCAA 2ZA9A 5AVAA 3ALXA 4FQZA 4LBOA 3SITA 1W6QA 2DU1A 1Q8VA 1QOSA 2NN8A 4FP3A 3ZXLA 4MWRA 4P9XA 3POWA 1HQLA 2UURA 3BIWE 2E53A 2CMLA 1WCQA 1QNWA 4JCKA 1INGA 1MS3A 1DILA 1CONA 1CVNA 1SLBA 3CNAA 5JLVA 3VKOA 2OVUA 5IK4A 1NNAA 4YZ4A 1DYKA 1YYNA 2VW1A 2YA7A 2A6VA 3ALWA 4C1XA 1G9AA 4XHXA 2DV9A 3SH5A 2R0FA 3M3EA 1QF3A 1YXWA 2JE7A 3K38A 3TI4A 1NXD1 1XOGA 2NYYA 1KRIA 3SISA 2ZKNA 1AX1A 1MS8A 2QWFA 3V65A 1E8VA 3PVEA 2R1DA 1IVDA 2H0BA 4R9CA 4GZTA 3A71A 1SLAA 2D44A 4YW4A 4B7MA 4PBPA 3OBTA 1AXYA 2SBAA 1O4YA 2A6ZA 2QWCA 1DLLA 1B9SA 4Q2FA 3IM0A 4KBBA 1DIWA 1MZ6A 4Y1UA 3NV1A 2VH9A 4MWVA 1HQWA 1DQ0A 1INXA 1XQNA 1W6MB 1DZQA 1O4ZA 4MWWA 2QWBA 4XJ8A 1F9KA 3OGGA 1LOCA 3AYCA 4RA0A 1V6IA 3K3AA 3RRDA 4YW1A 3AZVA 3CKZA 1G9FA 4M3CB 1LENA 1AJOA 4LBMA 3AP9A 1N1SA 1AZDA 1MS0A 2D43A 3RS6A 2ZGUA 2TEPA 4YG3A 4FOWA 1N1YA 4GDJA 2YXSA 5GZCA 5IUQA 4GB1A 4MC7A 5DZEA 4GWNA 3WG1A 1JYCA 3MW3A 1MS4A 3JU4A 1AXZA 2GALA 3H6JA 1WLDA 3M2MA 2A75A 4U36A 3WUDA 1DQ1A 3N7KA 2HTUA 4DRVA 2C5DA 1CQ9A 1D2SA 3GALA 1GBGA 5IK5A 1WCSA 1GKBA 1TEIA 1BKZA 3D12A 1CN1A 1LEMA 4XMAA 2Z42A 1RIRA 2AEQA 5DXDA 1CESA 2AH2A 3BEQA 3WG2A 4GZOA 4XTMA 1AX2A 3UL2A 1YO8A 1LHVA 4AGGA 1Z4XA 1GZ9A 1VCJA 5GLUA 1DYPA 4JF7A 3MW2A 4M3MA 2EF6A 2WT0A 1EUTA 1BJIA 3SALA 4QN4A 2LTNA 3R4UA 3JU9A 4FOYA 2D3PA 1MS9A 2P3IA 4K1JA 3WZ1A 3B01A 1QOTA 2F0ZA 1E8TA 2ZHKA 3QLQA 1KJRA 1INFA 1DBNA 2VW0A 2LALA 3SH3A 4GZXA 2YDPA 5HX0A 2R16A 1SACA 3OBRA 3AJYA 1AJKA 2ZHMA 4XBQA 3INAA 1LHWA 1SLIA 2KM2A 2WSVA 1DFQA 1Q56A 5M1ZA 1NSCA 4Q27A 2YA8A 3OYWB 2RHPA 3WDUA 3RG0A 1G7YA 2GMPA 1S1AA 2HT5A 1W6PB 1V6KA 2D3SA 3BOPA 1GSLA 1V6OA 1MWEA 3SLIA 1INWA 2F24A 4XJ9A 1C1LA 1LGCA 2ZGMA 4M4UA 5JOXA 4XIOA 4ASMB 1V3CA 5DG1A 7NN9A 4GKYA 1GYKA 2HT7A 2ZAAA 1FATA 2CTVA 2BATA 2GN3A 3SILA 3MW4A 2AYHA 4H55A 4K1HA 3CYEA 1LHUA 3AP4A 4XJWA 1Z4WA 2SIMA 3LSEA 1JHNA 5CNAA 5HUGA 2HTWA 4WEFA 2DUOA 3KQRA 3ZXJA 1NCAN 4GALA 4CRQA 2A3XA 1IVCA 2GDFA 5T5PA 5JOZA 3D4KA 3WDXA 5T50A 5CB7A 2VSKA 5GZDA 2QWAA 2E7QA 4KS5A 4WZFA 2A6WA 4XXAA 2YA5A 2YZ4A 3B3QE 1W0PA 5GLTA 4AVTA 2B7YA 4GKXA 1JN2P 3RMYA 3CL2A 3M3OA 1BYHA 2FHRA 3OY8A 1QOOA 2OUHA 2EXJA 2VU9A 1PZ7A 1IKPA 1ZA4A 1SLTA 4JRAA 3H0OA 1WW6A 1W0OA 1LU2A 1W20A 2NM1A 3B9CA 3PVOA 4CPOA 4C1WA 4XMIA 1V6JA 2YA4A 1LTEA 1AVBA 4GEZA 2F25A 1IS3A 3USUA 2R49A 3W58A 1BJQA 2PHRA 4OZXA 1VLNA 1CPMA 3V0AA 1AXKA 1FNZA 2ZGKA 4BM8A 1OQ1A 1S0EA 3WDVA 1LOFC 3HMYA 3N7MA 2A6YA 2ARXA 2AENA 1WBLA 1LU1A 2YY1A 3A0NA 3NV2A 2GNBA 4GZWA 5T55A 2ZMKA 4LBQA 1N1VA 4FJ6A 1EUUA 3FLRA 1JOJA 1EPWA 2PHTA 3V0BB 4XBNA 5KXCA 1URXA 5GALA 5H9RA 1PZ8A 4F83A 2HU0A 3TICA 3GNEA 5E8AA 4R9AA 4YW5A 3IN9A 1KITA 1L7FA 4NOTA 2W38A 1DHKB 1S0DA 1S0BA 1N3QA 4YLZA 3UJQA 1SCSA 1ULDA 1IS4A 3MEPA 2HT8A 2WJSA 4FPGA 1N3OA 4YZ3A 2ZGLA 1QU0A 2AR6A 4H52A 4B7RA 4GWMA 2GNMA 4Y1ZA 4FQ4A 1WLCA 5NN9A 4DPNA 3TIBA 2QWDA 2A3WA 4TYSA 1GLHA 4XXPA 5L73A 1IS6A 1LODA 2WQZC 3TAYA 1LOFA 4QN3A 1FV3A 3N3HA 4P14A 4FOVA 3WG3A 4M4NA 4YG6A 2P37A 1CIWA 2D6LX 2BF6A 1B09A 5JOWA 4YFZA 2XZIA 4QN7A 2GN7A 3AXEA 5SV8A 3NWKA 2C9AA 3FBYA 1F8DA 4AVSA 4BQ1A 1Z4ZA 4BPZA 1Q8QA 1W6OB 1A4GA 4DS0A 4Y1YA 5GZFA 2P3JA 5CBLA 2ZGSA 1LOEA 1G8WA 1SO7A 1V3DA 3B69A 4YGCA 2VSMA 4FPYA 3A0KA 1Z78A 1LCLA 3N36A 3H72A 1VCUA 1DGLA 1WD3A 2CNAA 5GZGA 1WW5A 5KXDA 2JKBA 1UKGA 1S0CA 1GICA 1MS5A 4CPNA 1V6NA 2D3RA 3WG4A 1BXHA 2GNTA 4UW5A 4MZEA 1JW6A 4XJAA 2VWDA 3NSSA 4ITCA 1WBFA 1YIFA 2WNEA 4GDIA 3ZYPA 1VAMA 2ZMLA 3IMNA 5JDBA 1V6MA 4LBQD 2ZACA 1V0FA 3R05A 3T1MA 3A72A 4LBKA 1ULEA 1HLCA 2HU4A 3H73A 2SILA 3ZSJA 5KXEA 4XHBA 1IS5A 2EXIA 4CTEA 1KQRA 2ZB6A 3WCSA 4HZVA 4P9WA 5T5OA 1SBDA 2DWRA 1R1ZA 3FFZA 1H9WA 5DUWA 4MWYA 2C4LA 1C1FA 5LK5A 1V2IA 1CJPA 4HZZA 4XJZA 1WW4A 1APNA 2DYCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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