2FHRA

Trypanosoma rangeli sialidase in complex with 2,3- difluorosialic acid (covalent intermediate)
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
632
structure length
625
Chain Sequence
SLAPGSSRVELFKRKNSTVPFEESNGTIRERVVHSFRIPTIVNVDGVMVAIADARYETSFDNSFIETAVKYSVDDGATWNTQIAIKNSRASSVSRVMDATVIVKGNKLYILVGSFNKTRNSWTQHRDGSDWEPLLVVGEVTKSAANGKTTATISWGKPVSLKPLFPAEFDGILTKEFIGGVGAAIVASNGNLVYPVQIADMGGRVFTKIMYSEDDGNTWKFAEGRSKFGCSEPAVLEWEGKLIINNRVDGNRRLVYESSDMGKTWVEALGTLSHVWTNSPTSNQQDCQSSFVAVTIEGKRVMLFTHPLNLKGRWMRDRLHLWMTDNQRIFDVGQISIGDENSGYSSVLYKDDKLYSLHEINTNDVYSLVFVRLIGELQLMKSVVRTWKEEDNHLASICTPVKGGCGAAVPTAGLVGFLSHSANGSVWEDVYRCVDANVANAERVPNGLKFNGVGGGAVWPVARQGQTRRYQFANYRFTLVATVTIDELPKGTSPLLGAGLEGPGDAKLLGLSYDKNRQWRPLYGAAPASPTGSWELHKKYHVVLTMADRQGSVYVDGQPLAGSGNTVVRGATLPDISHFYIGGPRSKGAPTDSRVTVTNVVLYNRRLNSSEIRTLFLSQDMIGTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Trypanosoma rangeli
publication title Structural and Kinetic Analysis of Two Covalent Sialosyl-Enzyme Intermediates on Trypanosoma rangeli Sialidase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords sialidase
total genus 181
structure length 625
sequence length 632
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2005-12-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2fhrA02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 2fhrA01
3TI3A 2WSUA 4PCRA 4WA4A 1N3QA 4CRQA 2A6XA 4FQZA 1NLSA 2E51A 1MACA 3AP5A 3GALA 2BATA 2C9AA 4XTPA 4I00A 3N7MA 2HTVA 1AF9A 1HQWA 4YGDA 1N1YA 3KM5A 4CPOA 5HCFA 2QWBA 1LECA 1GV9A 2YA6A 4HZVA 4XE9A 4Q8KA 2A75A 3U4XA 2EALA 3ZPYA 3RMYA 3N36A 3WG2A 2AEPA 1PZ9A 1WW5A 1DZQA 5EYXA 2LTNA 2EXJA 3SLIA 1DGLA 1GZWB 2A7AA 1INWA 3NSSA 1C1FA 1DQ4A 4MZEA 2QWAA 1MZ5A 4F83A 2D3RA 3D12A 4LBOA 2TEPA 3FLRA 1LGNA 1QOSA 1XOEA 1GSLA 2D7FA 2R16A 4XZPA 3INBA 1DQ5A 3LSDA 5IUQA 1SO7A 4K1JA 4FPFA 3ILFA 4QNPA 2W52A 1ULDA 2Q5TA 3D6EA 2SLIA 3N7KA 2F28A 1G9CA 4AVSA 5JLVA 1F8CA 1CR7A 3CL2A 4XXPA 1LESA 5H9PA 3SH3A 4LBQA 1KJLA 1IVEA 3AXDA 1Q8PA 4CPZA 2PHFA 1LU1A 2A3YA 4Y24A 2P3KA 3PJQA 4XBQA 3SNMA 3WG3A 3R4SA 2VU9A 1IVBA 2HT7A 3BOPA 4MJVA 1NCCN 1SLIA 2AENA 4BBWA 1IS4A 3A0KA 5JOWA 4HIZA 2XB6C 1AJOA 1CQ9A 3FUQA 1INXA 4YGBA 3IMNA 4YM3A 5L73A 1DILA 3H72A 2HT5A 2CL2A 3ZXLA 4YG0A 5LK5A 1NMAN 1FNZA 4FPOB 1UZYA 2JECA 1W8NA 4Q27A 4DS0A 2A71A 2GMPA 4Y22A 2YDPA 1HQLA 2VK5A 1E8UA 2CYFA 4YW4A 1N47A 2QWHA 2Z42A 4MWVA 1H30A 4YZ1A 3M1HA 5H9QA 5CBLA 4PBOA 3OJBA 3WDYA 1YYNA 2DURA 1FNYA 3FUOA 1GZ9A 1D2SA 2VK6A 2NMOA 1NSBA 1EUSA 1QGLA 2DU0A 4R9DA 5H9RA 1FX5A 2XZKA 5IK5A 3WDVA 1LHWA 1C57A 2D6OX 3W59A 4M4UA 3AZVA 4XMIA 4WVVA 2C5DA 1A8DA 4BLIA 2D3SA 1GZWA 4Y20B 1LENA 1MWEA 2JE9A 4LBQD 3AJZA 5EYYA 4Y1ZA 4WA5A 3ZXKA 2D6PA 2YROA 2H0BA 1LOCA 5JYYA 3TIBA 1G9FA 2ZHKA 3OBTA 4XDQA 4DRVA 3OY8B 1LGBA 1WCSA 1QU0A 1SBDA 3A72A 4YG3A 3GVKA 2NYYA 5F9TA 4GA9A 4PF5A 4K1IA 3WUDA 2DYCA 3OYWB 1MS5A 1KRIA 3A71A 1S0EA 2GMEA 1DQ2A 4GDIA 2A3XA 1DYKA 2OW4A 2FMDA 3W09A 1VAVA 4B7JA 5T50A 4K1ZA 5T5LA 2ZGLA 1S0GA 1LEMA 1CN1A 1LHVA 5CA6A 4B7NA 2GMMA 4Q2FA 4M3MA 1UN1A 4MZAA 2HTWA 4LBJA 4XJWA 6NN9A 1I3HA 1F8BA 1V3DA 3TI5A 2E7TA 5EXOA 1Y7BA 1VLNA 2PHRA 1UL9A 1A14N 4YW1A 1UKGA 2F25A 2ZB6A 1RINA 3AZWA 2HTQA 1GLHA 5T5PA 3B3QE 3WNXA 3MW2A 5DXDA 3N3HA 4GZPA 1HLCA 2P2KA 3CYEA 1WBLA 5DUUA 1IS3A 2D3PA 4ATFA 1W6QA 1Z78A 5BYNA 4YZ3A 3M2MA 2F13A 1MS4A 2AREA 2BERA 4QN4A 5IK8A 2OUJA 2DVBA 1LOFA 3UJQA 1R1ZA 1QDCA 1W20A 2WLQA 3JUUA 1OFSA 4WVWA 5GJ6A 4M4NA 2AH2A 4XJ8A 1Z4YA 3POWA 5DZFA 1JW6A 5M1ZA 3RS6A 1N1SA 5DZGA 2EF6A 4K3YA 5JMCA 2D6MA 4XJRA 3ZYPA 4XJUA 3RQ0A 4DFSA 1MVQA 2E53A 1BJQA 4GEZA 3DUIA 4FJ6A 3B00A 2XZIA 2CWSA 3GVJA 1J1TA 3SILA 2P3IA 3VKLA 2ZMKA 3T1MA 4Q1RA 3KQRA 4LBLA 1IOAA 5IT6A 3O0XA 1B9SA 2SIMA 3HMYA 1DIWA 1LOAA 5CNAA 4ISRA 4XHBA 3I8TA 1EUUA 4GZSA 4XJ9A 3H0OA 1SLCA 2AGSA 4XJAA 3Q9OA 2VUAA 4WV8A 3OY8A 4P9WA 2WKKA 2CNAA 3I4IA 2B8HA 5CAZA 2OUHA 4GKYA 2ZBJA 4XOGA 1JHNA 2D6KA 3OYWA 2WT2A 1F31A 4GZWA 4FP3A 1AJKA 4WZFA 4FPKA 2VSMA 2C4LA 1JUIA 1FATA 1OKQA 2HTYA 1MS0A 1KDMA 4MWUA 1LU2A 3NV2A 4XMAA 3BEQA 4MJUA 1S0BA 1C4RA 4NCSA 3TB0A 3N35A 2EXHA 2YY1A 1WBFA 2ZAAA 3NV3A 1G8WA 4L8QA 2A6YA 3A4UA 3SITA 2UURA 4Q1PA 1IS5A 7NN9A 2W5OA 1CESA 3VKNA 1A78A 1LGCA 1YXWA 3M3OA 2NP0A 4MWRA 2ZZJA 1XOGA 4H53A 3TIAA 4KS4A 3K36A 1MVEA 1DQ1A 2PHXA 3V0BB 3POYA 1V6IA 2AYHA 1IVDA 4R9BA 2UWBA 1Q8QA 3AP6A 3MEPA 1QMJA 1WLDA 2YDTA 3L2YA 4AGGA 4YW3A 1UPSA 2V73A 1IKPA 1N3OA 3WG1A 2KM2A 3SALA 4BM8A 4IQPA 1V0ZA 1WUVA 4GWNA 5GLWA 2D6LX 4M3CE 1W6NB 5T5JA 4HZZA 1Z4VA 3AYCA 4LBMA 4YZ4A 4X47A 4YM2A 1QDOA 4CZSA 3AYAA 1AVBA 2VW1A 5T54A 3UK9A 3D5OA 1CIWA 1W21A 3VKFC 4J9TA 3ASIA 4AGVA 3SISA 1CONA 5DUWA 1MR5A 2F27A 5KXBA 1B09A 2GN7A 4MWWA 1DYPA 4K21A 1Z4XA 4YM1A 1LJ7A 1V6JA 2VW2A 3TI4A 5GALA 4GZQA 2PELA 5JDBA 4FPGA 3K38A 2JD4A 4BOWA 1Z4WA 2F29A 1WLWA 1QNWA 1A4QA 4GALA 1B9TA 3WDXA 1SBFA 3WHUA 4MWJA 2A5ZA 2FHRA 1USRA 4TZDA 2VW0A 1ENRA 4Y1YA 5HUKA 4GDJA 4D8SA 3ATGA 4MWLA 1W0OA 1FV2A 5KXEA 1AX2A 4C1WA 3SH5A 4KS1A 2ZGPA 3T2TA 5HUNA 4CPLA 3ZXEA 2JDZA 1IS6A 4ASMB 5JOXA 2QWFA 2BQPA 3TI8A 2SILA 1INGA 2DWRA 2YMZA 1ULFA 4X6KA 1WW4A 1V00A 2EXIA 1BJIA 3ZSKA 4OZXA 1QF3A 5E89A 4NO4A 4XBNA 4YZ2A 3NV1A 5T55A 2XZJA 4H52A 2AEQA 1F5FA 1WW7A 3PVEA 3PMEA 3M3QA 3AK0A 3PVOA 1LOBA 1SNTA 2UWCA 1IVCA 5JOYA 3CL0A 3ENRA 4XIOA 1S0JA 5DUXA 1BKZA 1CJPA 2R0FA 2VH9A 3ZSLA 4UW3A 1HDKA 4ISQA 4YLZA 2CWMA 1KJRA 1NNAA 1O4ZA 1NXD1 2ZGMA 4W65A 4P9XA 1W8OA 3K39A 1CVNA 3B7EA 1W6PB 1V3EA 2YA8A 1GNZA 3M3CA 3R4UA 4BQ1A 3WDUA 1UX6A 4M01A 2CMLA 4AWDA 5KXCA 3USUB 4C1XA 4M3CB 3HR9A 1NCBN 3M3EA 2ZGQA 2VWDA 3OGGA 2ZMLA 1H9PA 2NM1A 3T1EA 4I30A 1N3PA 5FRAA 1WLCA 1ZA4A 4K1YA 4M00A 3AZYA 1SLAA 5FREA 1V2IA 2DVDA 4MX0A 5GLTA 4K20A 1HKDA 5B2DA 5GZDA 2GNBA 4FOQA 2XCYA 1JYCA 2YV8A 4LBKA 2ZGOA 2A70A 4K1KA 2EAKA 2ZB5A 2JE7A 4YW2A 5IK7A 1N1VA 1SACA 2RHPA 4WEGA 3K37A 2D44A 3ILRA 1V3CA 2C4AA 2ES3A 3H71A 1LTEA 1GYKA 4FPLA 2ZGSA 5DG1A 4Z8BA 1KQRA 4AGRA 1JOJA 4RA0A 3O12A 4FZHA 1Z4ZA 1DIMA 1QOOA 4KBBA 2PHUA 1VALA 1GZCA 1Z50A 4ATEA 4M3CF 4U36A 1Q8OA 2R49A 1D0HA 1F9KA 1W6OB 3H6JA 3NV4A 2AR6A 3POSA 2DVGA 4BPZA 1INYA 1V6NA 2ENRA 5HCBA 2ZKNA 2DVFA 1ONAA 2ZA9A 3UJOA 3TICA 3NN9A 2QWJA 1SCRA 5AVAA 1Z0HA 1IKQA 1LODA 1Q8SA 1LEDA 3AZZA 4GZOA 2P37A 1LOGA 1UZZA 4Y20A 4DGRA 4PQ9A 4Q26A 2DTYA 3VUOA 1SBEA 2ARXA 5EWSA 1NCDN 3O0WA 1DBNA 2YA4A 4YGCA 1FYUA 2SBAA 2WJSA 1V3BA 1W1XA 1URXA 5E8AA 1NN2A 2W20A 2QWGA 1S0IA 3TAYA 1ULCA 4JC1A 1NMCA 2ZACA 1Q8VA 1FAYA 3SH4A 5GLUA 3WCSA 4P9YA 2QWEA 3USUA 4M3CA 1BZWA 4XBLA 3WOGA 2X9MA 3N7JA 2JKBA 3O5SA 2QWKA 2ZHMA 2WT1A 3IPVB 3O9JA 1JN2P 2RKCA 4QN6A 3ZYRA 5F5QA 2GNDA 3GNEA 4FPYA 4NN9A 2W38A 4GWMA 1SLTA 1S0DA 1I1EA 4RL7A 3AP4A 3D11A 1UAIA 4BMEA 1DQ0A 1LOFC 4R9AA 1RIRA 4NOTA 1AXZA 3RMXA 4BMBA 3B9CA 1YO8A 4FVKA 4AVTA 5CB7A 1V6MA 4UF7A 3HN1A 1ULGA 4FOWA 4M4VA 2BF6A 4MWXA 4U2AA 4CPMA 2YA5A 2VK7A 1JBCA 2HU0A 2DU1A 3R05A 2DUPA 3O9KA 1EPWA 1QOTA 4BLJA 2WSVA 1MS1A 4CPNA 2YZ4A 5JVVA 4FP2A 1Q56A 1VAMA 1W0PA 4JF7A 2JJ6A 4JRAA 2D43A 3OBRA 3QLQA 3AP7A 4Y1VA 2V5YA 1W6OA 4X49A 5B2CA 1S0FA 3GVLA 1BQPA 1ENSA 4QN3A 2E6VA 2F0ZA 3FBYA 4CTEA 1USXA 2CY6A 4DRRA 3JU9A 4XIKA 3WUCA 4UW6A 4P14A 2DV9A 1YRZA 3ZXFA 2NN8A 1PZ7A 5HUGA 1VCJA 1YI7A 2BZDA 5IK4A 3AZXA 4XJQA 1LCLA 1X50A 1G86A 3V0AB 5H9SA 3AYDA 4MWYA 2F11A 2ZGUA 1NCAN 1CPNA 3MW4A 1L7GA 2NZ9A 3WG4A 4JCKA 4AYUA 4ITCA 3AXEA 3FLTA 2HT8A 2DVAA 2WT0A 3O0VA 2P3JA 5E88A 3VKMA 1JYIA 4D69A 5HX0A 3SANA 3IPVA 1F8DA 4YZ5A 4H55A 5GZGA 1AXYA 2XG3A 3WLUA 3ILNA 2ZGKA 3MW3A 3INAA 1GICA 3ALXA 4XXAA 4CPYA 1AX0A 3NWKA 2A6VA 3B69A 1FV3A 4LBNA 4FOYA 4Y26A 1YIFA 1V0EA 2GNTA 3CKZA 1TEIA 1WD3A 1WD4A 1APNA 3WCRA 1BYHA 3WZ1A 4HANA 1O4YA 1W6QB 3V0BA 5GZFA 4YW5A 2ZGTA 1JXNA 4WA3A 1VCUA 1MS8A 1V6LA 4UW4A 2B7YA 3B01A 5GZCA 4YFWA 1G9DA 1ZM1A 2P34A 1NNCA 3ZSJA 2QWDA 4NC5A 5HCAA 1DFQA 2F26A 4Q6KA 1WW6A 4ZKTB 4B7RA 1RITA 5KXDA 1BXHA 1ULEA 5GLZA 2ZGNA 4GB1A 3LCPA 4B7MA 2W39A 3WDTA 3ZVXA 4AVVA 1B9VA 2ARBA 2WNEA 1L7FA 1GANA 4XYXA 1NSDA 2W68A 4MC7A 1AXKA 1W6NA 5GZEA 3RRDA 1GKBA 4KS2A 1PZ8A 5NN9A 1G9AA 2PHWA 3UL2A 3H73A 1VIWB 5T52A 2I2SA 2QWCA 1MZ6A 4WEFA 4K1HA 3APBA 3MPPG 2VY0A 4GZXA 3V0AA 2VXRA 4GKXA 1NSCA 2ZABA 1LULA 3BIWE 2ZHLA 2GALA 2A3WA 5GLVA 2GN3A 3ZXJA 2DTWA 3T1LA 4YG6A 3ZSMA 1KITA 4Q8LA 4SLIA 1V6OA 3V64A 3QCWA 3JU4A 3D4KA 4KS3A 3VKOA 1INVA 3IM0A 2PHTA 2QWIA 4FPHA 3V65A 2AUYA 2OVUA 1NMBN 3W58A 3OPZA 5JOZA 1SFYA 2F12A 1EUTA 3A0NA 4MYEA 3FFZA 2D6NA 4FPCA 4GZTA 1E8TA 2YA7A 4KS5A 1W6MB 3IKWA 4Y1XA 1EURA 1WCQA 1S1AA 3TI6A 1L7HA 2DUQA 2W5NA 2R1BA 4GXLA 1XQNA 4HZXA 1NNBA 2GDFA 1CPMA 3AP9A 2ERFA 3AX4A 4HZWA 3WHTA 2EIGA 4ZXKA 5DG2A 4XILA 2LALA 3C2UA 3FLPA 2EXKA 4YGEA 2R1DA 4UW5A 5DUVA 1A4GA 4HZYA 3AFKA 1C1LA 2UWAA 3WVJA 3K3AA 1LOEA 2E7QA 4YFZA 1V0FA 2A6ZA 3WDWA 2ZMNA 2ZGRA 2R0HA 3AYEA 3LSEA 1AZDA 1SCSA 1MS3A 2YXSA 3RSJA 1N1TA 4FVVA 1SLLA 4DPNA 3VV1A 2F24A 3N7LA 4X4AA 4R9CA 4YM0A 1DLLA 2HTRA 4DQAA 3DGTA 1W6PA 1INFA 5GM0A 4FPJA 1IVFA 3ALWA 1LHUA 2WQZC 2HU4A 4Y1UA 4XTMA 1AX1A 4XJZA 1F8EA 1H9WA 1IVGA 3AJYA 4MWQA 4LBQB 2A6WA 4FQ4A 3CNAA 1DHKB 3PVNA 2HYKA 4QN5A 2CTVA 2NMNA 3BODA 2GNMA 1OQ1A 2ZHNA 2HTUA 3BTAA 4QN7A 1UMZA 4XHXA 2DUOA 1INHA 4FOVA 5HUMA 1KDKA 4GJTA 1V6KA 1E8VA 2F10A 2VVZA 3WV6A 1QKQA 1QNYA 2VSKA 2G4IA 4HL0A 3RG0A 2W08A 1LHOA 4PBPA 1ENQA 4B7QA 5SV8A 1G9BA 1LHNA 5DZEA 1GNHA 1S0CA 1A3KA 4TYSA 5T5OA 3IN9A 4Y22B 1U0AA 1W6MA 1G7YA 1GBGA 2UU8A 1SLBA 4FPEA 1DQ6A 1MS9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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4CUCA 1C5HA 1PVC1 2EXJA 3K2OA 3SLIA 1DGLA 2IASA 1GZWB 4KNCA 2A7AA 1INWA 3NSSA 1C1FA 1DQ4A 2RS53 1RUJ1 3BYWA 4ONUA 4S2DA 4WM8C 3ZMNA 4MZEA 1GP5A 2QWAA 4CEYC 1J1LA 1UX7A 1MZ5A 4OUMA 4F83A 3EXUA 2FMYA 1AYN1 5ANNA 5KBFA 2D3RA 2JDAA 4QD2A 2GSYA 1C8NA 5D1IA 3D12A 4LBOA 3U37A 2TEPA 4E8DA 5L36A 2UYBA 1LGNA 2VQ0A 1CZVA 3FLRA 4LPLA 1QOSA 1XOEA 1MEC1 1GSLA 2D7FA 2R16A 4XZPA 3VHPA 2W92A 1X36A 1DQ5A 2MHFA 3LSDA 5IUQA 3H3ZA 4E9KA 3INBA 2WINB 4D7SA 4MHUA 5CKQA 5BY5A 5C8CC 1SO7A 4K1JA 3POGA 3GF6A 4FPFA 5LZ6A 3U11A 5F8PA 3ILFA 4QNPA 3UGGA 4EWDA 4P08A 1RUC1 1UMIA 2DBIA 2W52A 3RVHA 5JXHA 3RZHA 5GTQA 4IFJA 1UXXX 4MZUA 1ULDA 2MNGA 2Q5TA 2VR4A 1AL22 3D6EA 1QXJA 2SLIA 3N7KA 3TOJA 1SUUA 5FPZA 2RMU1 4JGZB 2F28A 4L99A 1QJZA 1G9CA 2V4VA 4GH4B 3MI8A 4CDXB 4AVSA 5JLVA 3ACFA 3WQ0A 3WP4A 4LKFA 1AYM3 2DCYA 4QQOA 5SV5A 1F8CA 2JDMA 2XJSA 2YC2A 1CR7A 2D5HA 3H1WA 4NAOA 2QZ2A 4I02A 3ZFGC 1JYVA 1R1A1 3CL2A 2W91A 2XJPA 1C28A 1ZRFA 1KFUL 1W0NA 5DPNA 4XXPA 1LESA 3I49A 2VMDA 2WS92 3PLQA 5H9PA 2X09A 2W1WA 3SH3A 4LBQA 4QKBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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