2SLIA

Leech intramolecular trans-sialidase complexed with 2,7-anhydro-neu5ac, the reaction product
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
IPEGILMEKNNVDIAEGQGYSLDQEAGAKYVKAMTQGTIILSYKSTSENGIQSLFSVGNSTAGNQDRHFHIYITNSGGIGIELRNTDGVFNYTLDRPASVRALYKGERVFNTVALKADAANKQCRLFANGELLATLDKDAFKFISDITGVDNVTLGGTKRQGKIAYPFGGTIGDIKVYSNALSDEELIQATGVTTYGENIFYAGDVTESNYFRIPSLLTLSTGTVISAADARYGGTHDSKSKINIAFAKSTDGGNTWSEPTLPLKFDDYIAKNIDWPRDSVGKNVQIQGSASYIDPVLLEDKLTKRIFLFADLMPAGIGSSNASVGSGFKEVNGKKYLKLRWHKDAGRAYDYTIREKGVIYNDATNQPTEFRVDGEYNLYQHDTNLTCKQYDYNFSGNNLIESKTDVDVNMNIFYKNSVFKAFPTNYLAMRYSDDEGASWSDLDIVSSFKPEVSKFLVVGPGIGKQISTGENAGRLLVPLYSKSSAELGFMYSDDHGDNWTYVEADNLTGGATAEAQIVEMPDGSLKTYLRTGSNCIAEVTSIDGGETWSDRVPLQGISTTSYGTQLSVINYSQPIDGKPAIILSSPNATNGRKNGKIWIGLVNDTGNTGIDKYSVEWKYSYAVDTPQMGYSYSCLAELPDGQVGLLYEKYDSWSRNELHLKDILKFEKYSISELTGQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The 1.8 A structures of leech intramolecular trans-sialidase complexes: evidence of its enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Macrobdella decora
molecule keywords INTRAMOLECULAR TRANS-SIALIDASE
total genus 184
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature ec 4.2.2.15: Anhydrosialidase.
pdb deposition date 1998-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02973 Sialidase Sialidase, N-terminal domain
A PF13088 BNR_2 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.220.10 Mainly Beta Beta Barrel Intramolecular trans-sialidase; domain 3 Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 2sliA03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2sliA01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 2sliA02
1LEMA 1SNTA 1VAVA 2BF6A 2JKBA 1G86A 3ILNA 3WZ1A 3WV6A 3AXDA 1HQLA 4U2AA 5EXOA 4R9AA 2DYCA 2PHXA 3WDVA 4HZXA 3TI8A 1DLLA 1BKZA 2ARBA 2GMPA 3AZWA 5F5QA 4K21A 4XHXA 5JYYA 2ZGSA 3A72A 2GN7A 3D6EA 2CYFA 4GZPA 1Z4VA 2F29A 4K20A 3VKOA 3AFKA 2V5YA 1R1ZA 3B9CA 2W38A 4KS1A 2D3PA 1YYNA 1V3CA 1XQNA 2HTQA 5DUWA 4FP3A 5JOZA 2CWSA 2WJSA 1LULA 1WCQA 2PHFA 1F8BA 4K1HA 3JUUA 1SO7A 1AX0A 3UJOA 3AZVA 1NSDA 2W5OA 3M3CA 1CN1A 4XJUA 2ES3A 2A71A 2JECA 2SIMA 1MS8A 4FOWA 3WG2A 3UK9A 4XJRA 4PF5A 5T55A 2VWDA 1MVEA 4UW5A 4B7NA 3WDWA 1Y7BA 3RG0A 1LOBA 1GSLA 1SLTA 2E6VA 3TAYA 1YO8A 1ZA4A 4WZFA 2AREA 3N7KA 3MEPA 4AVTA 2HU4A 1Q8OA 3AJZA 2D44A 1CIWA 2B7YA 2UWCA 4FPJA 5E88A 2D3RA 4YW2A 1I3HA 3K39A 3WNXA 4FOYA 4AGRA 2ZHLA 1BQPA 5GLUA 4M3CF 1UMZA 4XJZA 3M2MA 1SLLA 5DZGA 1S0BA 3WG3A 1S0JA 1DQ0A 3USUA 4Y1VA 4YGEA 4WVVA 3WCRA 2WLQA 1BYHA 2A75A 5GLVA 1INXA 2WQZC 3IMNA 2W52A 1NCCN 4FPCA 3WOGA 2A6ZA 1DFQA 2HT5A 2H0BA 3D11A 1N1SA 5GLWA 1SBEA 2HTRA 3D5OA 1DQ4A 2R0FA 3K3AA 2DURA 2F25A 4MWYA 1W6MB 3PJQA 5H9RA 5DG1A 1ULDA 2GNBA 3K36A 1USRA 4XOGA 1W6NB 1CVNA 3FLRA 1IVGA 2AR6A 1V6IA 2P3JA 1MS1A 4YFWA 2FMDA 2VK7A 3ILFA 5GZCA 1V6MA 2SILA 4IQPA 4Y1ZA 1LODA 2CNAA 2E51A 4TYSA 4YZ5A 3AZZA 3POSA 3FBYA 3FLPA 2YDTA 1RIRA 1CPMA 1N47A 4Y22A 4FPEA 2FHRA 1A14N 1QU0A 4K1ZA 2ZAAA 3H73A 4ITCA 3V0AB 2ZB5A 4WV8A 5EWSA 1QNYA 1ONAA 3O0XA 1JYIA 4CPMA 1VCUA 2XB6C 1NNCA 3KQRA 2P2KA 3T1MA 1WD4A 4GKXA 3AP9A 1OKQA 1C1FA 3NV3A 4GZTA 1N1VA 5IK7A 2YA5A 2W68A 1MACA 4HZZA 1RINA 3R4UA 1A3KA 3B00A 4XHBA 2EXKA 4KS2A 2W20A 1B9SA 1F8DA 1W6QA 4XXPA 5IK4A 2AEPA 3W58A 2X9MA 3FFZA 2ZGKA 4CPYA 3K38A 1JXNA 5SV8A 4DQAA 5DXDA 1NLSA 4FPKA 1SLIA 2YDPA 2F28A 1ENSA 4Y20B 1JBCA 3MW2A 3MW3A 1NXD1 2GDFA 2XZIA 1L7GA 2ERFA 1Z4YA 1IVBA 2VK6A 3JU4A 1NNBA 2YA8A 4I30A 1WLWA 1UL9A 3CYEA 5JVVA 3RS6A 5HCFA 3T2TA 3AP5A 4BMBA 2CWMA 2EXJA 2GNMA 2D6NA 3MW4A 2ZGPA 4MWWA 4XMAA 1SBDA 3AP6A 4H52A 4WA3A 3V64A 1N3OA 1UZYA 2QWBA 2A5ZA 4D8SA 1YI7A 2C9AA 1EUUA 2DVAA 4XJAA 4M3CB 1XOEA 1LOFC 2YZ4A 2WNEA 2CTVA 1DZQA 1BXHA 4FQZA 3D4KA 1G9CA 2GALA 1N3QA 1LENA 3FLTA 1Z4XA 4XBQA 1S1AA 1V6KA 1YXWA 3WHTA 3N7LA 2F11A 3RSJA 1URXA 4LBQB 4Q8LA 1W1XA 1E8TA 1MVQA 1G9AA 1W6MA 1AVBA 2JJ6A 3UJQA 5DUXA 4NN9A 4AGVA 1W6NA 3ZYRA 1IS6A 4GDIA 1LCLA 4ISRA 5DUUA 2F0ZA 1YIFA 3ZYPA 4LBJA 1LU2A 4WA4A 5FREA 3GALA 5T54A 3HR9A 2YMZA 1DQ6A 3GVKA 4YZ1A 3ZSLA 3CKZA 4RA0A 2NMOA 5DG2A 5GM0A 2C4AA 2A3YA 1GZCA 3GVJA 4GDJA 3OJBA 1V00A 2VW0A 1IS4A 3V0AA 3SITA 4KS5A 1FYUA 4PBOA 2PHRA 4X49A 1UKGA 1IOAA 3H72A 1WLDA 2ZBJA 1HQWA 4H53A 1S0DA 2D7FA 2D6MA 4YFZA 2WSVA 3SISA 5NN9A 3O9JA 3PMEA 1MR5A 1B9TA 5KXEA 1UAIA 2WKKA 1KJLA 4LBLA 4Y24A 3KM5A 1AF9A 3ZXFA 3B7EA 2VSMA 5HX0A 2WT1A 2ZGRA 1C4RA 4NCSA 3CNAA 4QN3A 1A4GA 4DPNA 1NMCA 2D6LX 1PZ8A 3IPVB 3TIAA 4FOVA 1QDCA 3MPPG 1EUSA 1SACA 5GZGA 2DTWA 3SH3A 2AEQA 1AXKA 4FPGA 2E7TA 1FV3A 4K3YA 1MS9A 1DGLA 4YM2A 1V6OA 4LBNA 5F9TA 3DUIA 1NN2A 1MS4A 4Y20A 4P9YA 1V0EA 4Q26A 1EPWA 5KXBA 3PVNA 2ZMKA 2A6WA 4MJVA 5KXDA 1B9VA 5E8AA 5T5PA 1X50A 1GBGA 1L7FA 4YW3A 3POYA 2Q5TA 4XJWA 1LGCA 2HT7A 1LU1A 1N1YA 3ATGA 2B8HA 4YW5A 2AUYA 3TIBA 4R9BA 4AVVA 1E8VA 1V3EA 3BODA 1WD3A 1QGLA 5HUMA 1JHNA 3TI6A 1LOFA 2ZHMA 2VVZA 1W8OA 4M3CA 3BOPA 1KDMA 2WT0A 5T5JA 1DBNA 1DIMA 2D6KA 1AJKA 3NV4A 1BJQA 1INHA 1D0HA 4Y1XA 4WVWA 1IKQA 1WW7A 4Q8KA 1CR7A 4NOTA 5HUKA 1BJIA 4MZAA 1C1LA 4ATFA 3AP4A 2EXHA 4XIOA 3N36A 2P3IA 2AYHA 3AX4A 4WA5A 1GNZA 3V0BA 4LBMA 4M4VA 5GALA 4LBQA 1AZDA 1DIWA 3WUDA 3BEQA 2GMEA 1HLCA 1KQRA 2BQPA 2VH9A 3UL2A 1N1TA 2R16A 4MJUA 1ENQA 4YW1A 3M3EA 1KITA 1Q8QA 4TZDA 3SNMA 4BPZA 5L73A 3AYAA 3GNEA 3OY8B 2ZZJA 1FNYA 1FATA 4K1KA 4M4NA 1S0FA 3FUOA 2EIGA 4NO4A 2ZGLA 1GZ9A 4PCRA 4K1YA 2ZGMA 2XG3A 2VK5A 3NV2A 2VUAA 3ALXA 1N3PA 2KM2A 4MWVA 1XOGA 1J1TA 5DUVA 1V6JA 4GZXA 1AX1A 1INGA 1ULFA 4GZOA 4CRQA 1W21A 5CNAA 5T5OA 5JOYA 4Q1RA 1JUIA 1LHOA 4UW6A 3ZXKA 1HKDA 1QOSA 1QF3A 4LBQD 3PVEA 4GZQA 1LHWA 4XMIA 1G9DA 2C4LA 2QWHA 1V2IA 3O12A 4M4UA 4M3MA 4MWRA 2P37A 3WDYA 4QN5A 4BOWA 3L2YA 3OYWB 4GXLA 5GZDA 4XE9A 4PBPA 1FV2A 3B69A 1QOOA 5GZFA 3H6JA 4GWNA 3HN1A 2GMMA 3H71A 3M1HA 2NYYA 1INYA 2JDZA 4Y1YA 3APBA 2G4IA 1DHKB 6NN9A 1GZWB 2PHUA 3AYEA 3O0WA 4JC1A 3SILA 4MX0A 1SLCA 2DU1A 1V0FA 4X6KA 4B7JA 1W6PB 4M00A 3O0VA 2VU9A 4L8QA 4J9TA 1H9PA 2GNTA 3OBRA 2UURA 4YM1A 3SANA 3DGTA 3WG1A 1GKBA 1MZ5A 1I1EA 3SH5A 1LEDA 2R0HA 2QWGA 2DU0A 3OPZA 3C2UA 1QDOA 1WLCA 4ASMB 4FPFA 3CL2A 1CJPA 2QWAA 4WEFA 1V0ZA 5DZEA 3N7JA 1DILA 1JYCA 1SCRA 3BTAA 4F83A 4B7MA 7NN9A 1IVEA 3INAA 1AX2A 1NMBN 2CY6A 2PHWA 3SH4A 3ZSMA 3QCWA 3POWA 3D12A 4FJ6A 4CPLA 2A7AA 2ZMLA 1CPNA 4B7QA 2WT2A 2HT8A 1ULGA 4UW4A 3A71A 4RL7A 1HDKA 4FP2A 5CBLA 4AWDA 1SCSA 4GEZA 2VXRA 4BLJA 2OVUA 2QWEA 2DUOA 4KS3A 3NWKA 3N7MA 2QWCA 3WCSA 4QN6A 3ZXLA 4QNPA 1GV9A 1Q8VA 1AJOA 1H9WA 2VSKA 4HZVA 3B3QE 4XJ9A 1E8UA 5CA6A 1G9FA 5JOXA 1KDKA 1VIWB 1MZ6A 2NN8A 1V3BA 2QWDA 2F13A 3VKFC 2ZA9A 4OZXA 2ZGQA 3FUQA 1FX5A 4U36A 1DQ1A 3A0NA 4JCKA 3R4SA 3AYCA 1DQ5A 1IVCA 2A6VA 3OY8A 1JW6A 1A4QA 1OQ1A 5H9QA 4GJTA 3Q9OA 5EYXA 1W20A 4FPLA 3ENRA 1LOCA 1CQ9A 1QMJA 3OGGA 2HTUA 4ISQA 1S0CA 2A6XA 4CZSA 1ULEA 1WW5A 1Q8PA 4D69A 1O4ZA 1FAYA 2DV9A 5T50A 4ATEA 3ZSJA 1RITA 4KS4A 1W0OA 1B09A 1NSCA 4QN4A 1V3DA 3PVOA 4XBLA 2F27A 1LHVA 4CTEA 4YG0A 3VKNA 2V73A 2ZB6A 3INBA 4DFSA 4YZ4A 5JOWA 1LOGA 5HUGA 2CL2A 5B2DA 4MYEA 2A3WA 1GANA 4BBWA 2ZGNA 2R49A 2ZHKA 5GLTA 4GZSA 1CESA 4PQ9A 1H30A 5FRAA 5M1ZA 3RQ0A 4GB1A 2I2SA 3AP7A 3OYWA 1SFYA 4FOQA 4W65A 4P14A 4QN7A 3IKWA 1W6OB 3TI3A 2R1BA 4KBBA 2OUHA 1LOEA 2D43A 5IUQA 5IT6A 2RHPA 1G9BA 3WDUA 2JE7A 3TICA 1GLHA 3IN9A 4JRAA 2DUPA 1GZWA 1LGNA 1UX6A 4ZKTB 5T52A 4R9CA 2VY0A 1LGBA 4XTPA 1D2SA 2WSUA 1QOTA 1UZZA 1W6PA 1WUVA 2YY1A 2JE9A 3VKLA 2DVDA 2UWBA 4HZWA 4B7RA 4MWJA 2UWAA 1NCDN 4BMEA 4ZXKA 1UN1A 1TEIA 4Y26A 3VV1A 3WHUA 3VUOA 4I00A 4MWLA 4YM0A 4YW4A 2XZKA 3B01A 1W6QB 2VW2A 4FZHA 4XZPA 2W5NA 4FVKA 3O5SA 3LSEA 4K1JA 2HTVA 4CPNA 1V6NA 1Z78A 1JN2P 1MS5A 5HCBA 5JMCA 1VCJA 4DS0A 1APNA 5JLVA 2TEPA 4DGRA 1F31A 2W08A 2ENRA 2OW4A 1NNAA 4P9XA 2QWJA 3M3QA 2EF6A 2ZGUA 2EXIA 4XYXA 1IS3A 2ARXA 1USXA 2YA7A 1IVDA 1O4YA 4MWQA 2HTYA 4CPZA 3V65A 1Q8SA 1S0EA 1PZ9A 4HL0A 1SBFA 2QWFA 4SLIA 1GYKA 4H55A 2QWIA 4HANA 4Q1PA 1G8WA 2JD4A 2ZGTA 5AVAA 2DWRA 1OFSA 3A4UA 2YV8A 1IKPA 1C57A 3SLIA 4AYUA 3RRDA 2A70A 1VLNA 3ILRA 2DVGA 2UU8A 4XJQA 3M3OA 4YM3A 3WDTA 4Q2FA 5DZFA 2HU0A 1QNWA 3OBTA 3LSDA 5GJ6A 3AXEA 1W0PA 1LHUA 1U0AA 5LK5A 3GVLA 3QLQA 4MC7A 1ZM1A 2DVBA 4AVSA 2ZHNA 3NN9A 5H9PA 1ENRA 4LBKA 4XJ8A 3WDXA 2VW1A 4X47A 2DTYA 1LTEA 1MWEA 3TI5A 3ASIA 2F12A 1NCAN 5E89A 2ZACA 4XILA 1AXYA 1DYPA 3ZVXA 1WW6A 2AGSA 1Z0HA 1NMAN 2YA6A 2OUJA 3AZYA 1WCSA 3WLUA 2PHTA 1PZ7A 2YA4A 1KRIA 1AXZA 3I4IA 5CAZA 1VALA 2ZMNA 4GA9A 1G7YA 1ULCA 4Q6KA 2NM1A 3W59A 3O9KA 2F24A 1DQ2A 4XXAA 1INVA 4AGGA 1Z4WA 4UF7A 1W6OA 4DRVA 4GZWA 1WW4A 2HYKA 3TB0A 3LCPA 2R1DA 1FNZA 4Y1UA 2D6PA 4XDQA 4MZEA 2D6OX 1YRZA 1SLAA 4CPOA 2NP0A 4C1XA 1V6LA 4M3CE 4XTMA 1SLBA 4P9WA 2P3KA 2BERA 3IPVA 2F10A 1S0IA 4GKYA 3AZXA 4BM8A 5EYYA 1NCBN 4JF7A 3IM0A 5B2CA 1KJRA 1IVFA 4HIZA 1L7HA 5H9SA 2NMNA 2P34A 4UW3A 1F5FA 2AH2A 3BIWE 1NSBA 5CB7A 3RMYA 2NZ9A 2XCYA 1S0GA 1BZWA 1LHNA 2D3SA 3SALA 3ZXEA 5T5LA 4YG6A 3H0OA 2BATA 3AK0A 1A78A 4YGBA 3NV1A 1GNHA 1UPSA 1F8EA 4BLIA 3WVJA 1GICA 3ZXJA 2EAKA 2ZKNA 5IK5A 4YZ2A 1LOAA 2LTNA 4YGDA 2YROA 2W39A 1IS5A 2BZDA 4WEGA 3TI4A 4MWXA 4HZYA 2AENA 3R05A 5KXCA 1Z50A 1LECA 3NSSA 3ZPYA 4MWUA 5HUNA 4XBNA 1LJ7A 4DRRA 4YZ3A 1VAMA 5GLZA 5IK8A 1Z4ZA 5JDBA 1MS3A 4FPOB 4YLZA 1DYKA 4C1WA 3N3HA 5HCAA 2E7QA 2LALA 3K37A 3WUCA 1INFA 2YXSA 2RKCA 1JOJA 4BQ1A 2SLIA 2C5DA 3AJYA 4M01A 2SBAA 3USUB 3AYDA 3HMYA 3N35A 1EUTA 3ALWA 2CMLA 2GNDA 3ZSKA 3W09A 4FVVA 4FPYA 4Z8BA 1EURA 2HTWA 3JU9A 1CONA 2F26A 4R9DA 1F9KA 4X4AA 3V0BB 2ZABA 3U4XA 2PELA 1WBLA 3VKMA 4GWMA 3RMXA 1QKQA 2ZGOA 2QWKA 1Q56A 5BYNA 1A8DA 3T1LA 1W8NA 2A3XA 4GALA 4K1IA 4YG3A 4NC5A 1INWA 1LESA 2XZJA 2GN3A 2EALA 4YGCA 1WBFA 1MS0A 4LBOA 2A6YA 3CL0A 3I8TA 3WG4A 3A0KA 3T1EA 4XIKA 4FQ4A 4FPHA 1F8CA 2E53A 2DUQA 2DVFA 4Y22B 2Z42A 4Q27A 5GZEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5JSOA 3OBZA 3WQ0A 3V56A 1NCRC 1LEMA 3AVRA 2GC0A 3WEZA 4DMIA 1SNTA 1VAVA 2R071 3O7OA 1RHI2 1QJX2 2QQUA 4ASKA 1UMIA 3CMGA 2WNVA 3VD7A 3VNHA 5G04L 1RXFA 2BF6A 2JKBA 1G86A 2G19A 3ILNA 5FYCA 2R042 4R4XA 5FKCA 3WZ1A 2UY8A 3WV6A 3AXDA 4Q4Y3 4XF4A 2RM23 3DR2A 4RQPA 4A41A 1YQ6A 1HQLA 4ZU5A 5F37A 4JV4A 2WLPA 4EV0A 4U2AA 4DXRA 3I3MA 5EXOA 1AYN3 1CZTA 4JGYA 4MGZE 2ZEXA 3AKQA 3SC7X 4Q0PA 4LKEA 4DUWA 1ZBE2 3R4DB 2WFF2 4R9AA 2DYCA 2Y60A 2PHXA 3WDVA 2P17A 3K48A 4HZXA 2QQNA 3HAGA 4QMAA 1PO12 2RMU1 3ZKYA 3OF1A 4QPWA 3TI8A 1DLLA 2NLRA 1MQTA 2JKXA 1BKZA 2ARBA 2GMPA 3AZWA 5F5QA 3G4HA 2X8KA 4JRLA 5D9DA 2VBDA 4K21A 3ZSEA 4XHXA 1CD3G 4BCUA 5JYYA 1PVC3 2ZGSA 3A72A 2QBXA 2BNNA 1ODNA 2GN7A 5FY4A 3D6EA 4YY8A 2WN2A 1XJAA 4AFAA 1O7FA 1TME1 2CYFA 3AMPA 5K9YA 4GZPA 2J1RA 5FYZA 2Y8KA 3E1F1 4S2GA 4HKWA 1Z4VA 2BUKA 1JMUB 1RUD2 4K20A 3VKOA 2F29A 3NQHA 1K5MA 3AFKA 5J48A 5GX5A 1PGW1 2XJSA 4Q4V2 5JCTA 3RJ2X 4AEJA 2V5YA 4AI1A 5C3PA 4KH9A 1XRUA 1R1ZA 3J8F2 5FZOB 3B9CA 3HJRA 5LBBA 5A70A 1OC1A 3WNMA 1X9TA 2W38A 4KS1A 1NOVA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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