2SLIA

Leech intramolecular trans-sialidase complexed with 2,7-anhydro-neu5ac, the reaction product
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
IPEGILMEKNNVDIAEGQGYSLDQEAGAKYVKAMTQGTIILSYKSTSENGIQSLFSVGNSTAGNQDRHFHIYITNSGGIGIELRNTDGVFNYTLDRPASVRALYKGERVFNTVALKADAANKQCRLFANGELLATLDKDAFKFISDITGVDNVTLGGTKRQGKIAYPFGGTIGDIKVYSNALSDEELIQATGVTTYGENIFYAGDVTESNYFRIPSLLTLSTGTVISAADARYGGTHDSKSKINIAFAKSTDGGNTWSEPTLPLKFDDYIAKNIDWPRDSVGKNVQIQGSASYIDPVLLEDKLTKRIFLFADLMPAGIGSSNASVGSGFKEVNGKKYLKLRWHKDAGRAYDYTIREKGVIYNDATNQPTEFRVDGEYNLYQHDTNLTCKQYDYNFSGNNLIESKTDVDVNMNIFYKNSVFKAFPTNYLAMRYSDDEGASWSDLDIVSSFKPEVSKFLVVGPGIGKQISTGENAGRLLVPLYSKSSAELGFMYSDDHGDNWTYVEADNLTGGATAEAQIVEMPDGSLKTYLRTGSNCIAEVTSIDGGETWSDRVPLQGISTTSYGTQLSVINYSQPIDGKPAIILSSPNATNGRKNGKIWIGLVNDTGNTGIDKYSVEWKYSYAVDTPQMGYSYSCLAELPDGQVGLLYEKYDSWSRNELHLKDILKFEKYSISELTGQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The 1.8 A structures of leech intramolecular trans-sialidase complexes: evidence of its enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords INTRAMOLECULAR TRANS-SIALIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Macrobdella decora
total genus 184
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature ec 4.2.2.15: Anhydrosialidase.
pdb deposition date 1998-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02973 Sialidase Sialidase, N-terminal domain
A PF13088 BNR_2 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.220.10 Mainly Beta Beta Barrel Intramolecular trans-sialidase; domain 3 Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 2sliA03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2sliA01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 2sliA02
1DQ1A 2E53A 2YA8A 2D6MA 3ZYPA 3PMEA 4Y1ZA 2DUPA 2D3PA 5JVVA 1LJ7A 1AF9A 4R9CA 3POYA 1DQ2A 3AYDA 4TYSA 1H9WA 4Y1XA 3I8TA 1BJIA 3A72A 3B9CA 1V3EA 2D44A 4LBOA 1JW6A 5EYXA 1NCAN 1WW6A 4YM1A 4WA4A 2D7FA 1B9VA 3SNMA 3OBRA 1FV2A 2CTVA 2RHPA 1EUUA 1QU0A 1W6NB 2FHRA 3POWA 3O9KA 2ZHMA 3CL2A 4YZ5A 5DXDA 3D6EA 4U2AA 1WD4A 1AXYA 5HUGA 4GZSA 3IMNA 1KJRA 1V00A 2A7AA 1SLBA 3RQ0A 5GZEA 3O5SA 5CA6A 1W6OA 4Y1VA 1UMZA 3POSA 5DUWA 2XCYA 3OY8B 2ZB6A 3D11A 2VK6A 1IOAA 4XBQA 5CBLA 1FV3A 1F8CA 1USRA 4K1ZA 4Y24A 4WEGA 1N1YA 5EYYA 1ENQA 2DVAA 3M3QA 3KM5A 5GZGA 3HMYA 4XHBA 5CB7A 3R4UA 4YGBA 2AGSA 2WQZC 5JOYA 4XXPA 2A71A 1W6PA 2VK5A 2GN3A 2XZKA 1IKQA 1CPMA 3H6JA 6NN9A 3R05A 5JOXA 4M3CF 1WBLA 3WNXA 2DTYA 1S0CA 1APNA 1N3QA 2JE7A 4MWUA 2BQPA 4K3YA 1GICA 2WSUA 4WZFA 3SH3A 2HTUA 1W0PA 4FOYA 1V6KA 2V73A 4GB1A 3WV6A 2C5DA 4KS4A 1NMBN 3FBYA 5H9SA 3W59A 2JE9A 1SACA 1MS1A 2DTWA 3SH5A 3SLIA 1QF3A 5IT6A 4D8SA 3NN9A 1GKBA 1IS5A 1N3PA 2OVUA 3D12A 3I4IA 1SCRA 1W0OA 1GV9A 3DGTA 2NP0A 1C1FA 4FPEA 1GLHA 1NN2A 2QWFA 3B3QE 2ZGNA 1SBEA 3N3HA 1GNZA 4QN5A 2DV9A 3WG1A 4QN4A 5IK5A 4CPZA 2PHUA 1NCBN 1BZWA 2YMZA 1WLDA 3INAA 2EXIA 3AYEA 1ULDA 2WT1A 3PVNA 4QNPA 2P34A 3WVJA 4YM3A 4FVKA 3RSJA 4YW2A 2VSMA 1JYCA 3ILFA 4DQAA 3BTAA 1G9BA 3O0VA 4YZ2A 4FPHA 4HZXA 4KS2A 2ZGQA 5GLZA 3SALA 3O9JA 4FOQA 5DUVA 3NWKA 1NLSA 3M3CA 4YG6A 2F25A 2CY6A 3ZXFA 2XZIA 2DU1A 1MS4A 1LGBA 1BYHA 4CPNA 4Q8KA 3ILNA 4YZ4A 1JXNA 1JN2P 4WA5A 1QDCA 1W6MA 4HZYA 4Q6KA 5IK4A 3UL2A 3RS6A 1LU1A 5GZFA 2GMPA 2A75A 3OYWA 1G9CA 2ZMNA 4P9WA 4BQ1A 2YDPA 2W5NA 1HLCA 2ZGSA 1E8VA 4C1XA 3JUUA 3NV2A 4YFZA 1IVDA 4MWVA 1SLAA 3B01A 1LU2A 3PJQA 4GWMA 4ISQA 2WT2A 3GVKA 5JOZA 1V6NA 2VK7A 4H53A 2HTWA 1Z50A 1C1LA 1UL9A 2RKCA 1E8UA 1WLWA 3N35A 2EXJA 3AZVA 4XXAA 4JC1A 5HCAA 1W21A 1G8WA 4FPLA 4PF5A 5GLTA 1X50A 1NSCA 1QOOA 3IPVA 1W6OB 2JD4A 4WA3A 2QWKA 5AVAA 2F11A 1LHOA 1KRIA 1S0GA 4RA0A 2GN7A 1RITA 3K37A 4K20A 4DRVA 2CNAA 2VXRA 2F28A 3VKLA 4BBWA 2VW2A 1FNZA 2CWSA 4L8QA 2EXHA 4HANA 4CRQA 1PZ7A 2WSVA 2AH2A 1ULGA 4HL0A 2QWDA 1INVA 3M3OA 4Y22A 1RIRA 3V65A 4BPZA 3ATGA 1L7GA 1A3KA 3DUIA 1MACA 1O4YA 1W6PB 5IK8A 3Q9OA 1VLNA 3RMYA 2CMLA 1V0FA 2WLQA 4YFWA 4MZAA 1LOBA 2F0ZA 2LALA 1BJQA 3TI8A 3ZPYA 5CAZA 1V3CA 1LHVA 1DYPA 2FMDA 5DUXA 4XMIA 1IKPA 1ENSA 2DWRA 1AVBA 2NN8A 3N36A 5T5JA 2A5ZA 3BIWE 1LOEA 3V0AA 4K1IA 3T2TA 4DS0A 1J1TA 2SBAA 4PBPA 4FOVA 3R4SA 1BKZA 4XBNA 4YGDA 1UKGA 2ZB5A 4Z8BA 1LHWA 5E89A 3INBA 1MS9A 5CNAA 4K1JA 2ZGUA 4XDQA 4XYXA 1Z4ZA 1AXZA 4RL7A 4FPFA 1C4RA 1L7HA 5T5OA 1INGA 2AEQA 3A4UA 2I2SA 2BF6A 5FREA 2ZHKA 1INFA 3N7LA 4YW4A 2P3KA 1F8BA 4LBMA 4X6KA 1VCUA 4GA9A 3BODA 1CPNA 4YG0A 1Q8VA 2HYKA 1AJOA 4GDJA 3O0XA 1HQLA 2GMMA 1QOSA 4KS5A 1MS3A 2WT0A 5HX0A 1NCDN 1HDKA 4YZ3A 1JHNA 1DGLA 3WDXA 1NNBA 4LBQD 3W58A 4P14A 1F8DA 2DURA 4ATFA 4WV8A 4GZTA 5E88A 2D6PA 2R1BA 3VKFC 5E8AA 1YI7A 4NOTA 1CQ9A 4CPLA 2R0FA 4ISRA 4Q2FA 2VWDA 1W6MB 4PCRA 4GZPA 2F12A 4CZSA 4MZEA 3ZXEA 3OYWB 1GZ9A 2A3YA 1CESA 3OPZA 3MW4A 3ZVXA 4Q27A 3TI4A 1SBDA 3WG2A 3AYAA 1D0HA 1QMJA 3D5OA 5LK5A 3V0BA 1B9TA 1LHNA 1WBFA 3KQRA 1IS6A 4I30A 4X47A 1DQ4A 2F10A 1U0AA 3TI5A 4CTEA 4QN7A 4Q8LA 1WW7A 3CKZA 1QDOA 1WLCA 1AJKA 3M1HA 1UN1A 2F26A 2QWEA 1V6JA 4WVVA 3NSSA 3SISA 1QNWA 1O4ZA 3IPVB 2AREA 4C1WA 1JOJA 2YA4A 3B69A 4B7MA 4AWDA 3T1LA 5H9RA 2NMOA 2VW0A 1W1XA 3OBTA 4X4AA 3O0WA 4KBBA 1NXD1 2UWBA 5GALA 1NNCA 1Y7BA 1LCLA 1DLLA 1F9KA 5GLWA 2GNBA 3USUB 1INWA 2HU0A 7NN9A 2ZMKA 1GYKA 2NYYA 1AX2A 4Y22B 4MWJA 2C9AA 3TI3A 2ZGPA 5DG1A 2E6VA 1S0BA 1LGNA 2EAKA 4BM8A 1B9SA 1Z78A 1UZYA 2R0HA 1QKQA 2GDFA 2BERA 1F8EA 4Q26A 2ES3A 3LSDA 1QOTA 4YW3A 1I3HA 1INXA 4YZ1A 1VIWB 4MWWA 3ZXLA 3ALWA 2JKBA 3ZSLA 1XOGA 5T52A 4FVVA 3A0NA 1DIMA 1W6QA 3V0AB 1E8TA 4NN9A 3GVJA 1LEMA 2ZA9A 2X9MA 4FJ6A 3UJOA 3CL0A 4GALA 4KS1A 4JF7A 4DPNA 4MWQA 3N7JA 2F27A 3A71A 1WW4A 4MYEA 2EF6A 4P9XA 4XTMA 1A8DA 2ZGTA 2V5YA 3NV4A 2C4AA 3TIAA 4YGEA 1AZDA 2R49A 2EIGA 1G86A 1PZ8A 4Q1RA 2ARXA 4R9AA 1ULEA 2B7YA 4FQZA 4WEFA 1GBGA 5IK7A 3TAYA 2YA7A 3FFZA 4XJQA 2VU9A 4K21A 4BMEA 1R1ZA 5T55A 1URXA 1SLTA 4GJTA 3PVEA 4JCKA 4J9TA 3AXEA 1CONA 4JRAA 2D6OX 2QWJA 2H0BA 1YO8A 3AJYA 4YG3A 2AYHA 2GMEA 1NCCN 4M3CE 1NSDA 1LOCA 3WOGA 1CVNA 1DYKA 2Q5TA 3N7KA 1YIFA 2WJSA 1HKDA 4FOWA 5EWSA 2ZGMA 4MJUA 2HT5A 1KDMA 1JBCA 2YA6A 3QCWA 1ENRA 2D3SA 5GZDA 3ZXJA 5KXDA 1CIWA 1XQNA 4XJRA 1NMAN 1OKQA 3M3EA 1IVGA 5DUUA 2W39A 4MC7A 2KM2A 1MR5A 2ZKNA 4HZWA 5JYYA 3TIBA 2F24A 1HQWA 1OFSA 4FPGA 4M3CA 3V0BB 3VKOA 4NCSA 3WDYA 3MW2A 1MVQA 3WG4A 2W68A 5JOWA 2NM1A 1PZ9A 1UAIA 2ZACA 5KXEA 2W52A 3UJQA 4MWXA 1WD3A 1MS0A 4NC5A 1KITA 4H52A 2XB6C 5SV8A 1S0EA 4PBOA 4XHXA 3K38A 3USUA 2P3JA 1SNTA 1V3DA 4FPKA 4MWYA 1IVEA 1SLIA 2A6VA 3FLRA 2HTYA 1DQ0A 1N1SA 2HTRA 2YV8A 1QNYA 1ULFA 1W20A 4LBQB 4MWLA 2PHWA 5JLVA 4AVSA 1S0JA 3ZSKA 1LOFA 1A14N 1IS3A 1FYUA 1VAMA 2E7TA 4GEZA 1OQ1A 2SIMA 1EUSA 5JMCA 4GWNA 2CYFA 2DVDA 3WHUA 1BQPA 4ITCA 1FATA 2NMNA 1EURA 1DFQA 1A4GA 4MWRA 4B7NA 3VKMA 2JDZA 2ZMLA 5DG2A 4BMBA 1JYIA 1GNHA 2G4IA 1S0DA 4ATEA 2YZ4A 1SFYA 3WDTA 2AUYA 1V0EA 5GLVA 3CYEA 3WLUA 3AP4A 1V0ZA 1GZCA 1D2SA 2SILA 1N3OA 4XE9A 4XIOA 2VW1A 2ERFA 1W6QB 4GXLA 2C4LA 2HTQA 2D6NA 2XG3A 4M01A 1UZZA 2EALA 4XILA 3VKNA 4WVWA 3NV3A 5T54A 4HZZA 5HUMA 3H0OA 4M4UA 1L7FA 2UURA 3AP9A 2GNTA 2P37A 4P9YA 1SBFA 2JJ6A 2LTNA 3SILA 3WCRA 1LODA 4FPCA 1DHKB 2W08A 4LBKA 4XJAA 1N1VA 1A4QA 2A6YA 4DGRA 1JUIA 4XOGA 4GDIA 1AXKA 3SH4A 2ZAAA 1N1TA 2D3RA 5DZFA 1ZA4A 1SCSA 2ZGKA 4B7RA 4M3MA 2VUAA 1LECA 4Y1UA 1MWEA 1FNYA 3K3AA 3HN1A 1V6LA 2R16A 4QN6A 3WHTA 5GZCA 5KXCA 2GALA 3AZYA 3ILRA 4F83A 3MPPG 1QGLA 3ZSJA 1LHUA 1EUTA 3JU4A 1MS5A 4AYUA 5HCBA 5KXBA 4FP2A 3ASIA 3VUOA 1I1EA 3RG0A 1F31A 2HT7A 1YRZA 1IVFA 2ZHLA 1AX0A 1B09A 5T5LA 4B7JA 1XOEA 1MS8A 3RRDA 4BLIA 3TI6A 4Y26A 4K1YA 3B7EA 5H9QA 4GKYA 1Z4WA 4LBNA 1F5FA 4MJVA 4Y20A 1ULCA 3H72A 4M3CB 1LOAA 3ENRA 4IQPA 3RMXA 3TICA 3M2MA 4XJUA 1FX5A 5GM0A 4FP3A 1WW5A 1CN1A 3WG3A 1ZM1A 4LBQA 3T1MA 1KQRA 4R9DA 2YDTA 1WUVA 1Q56A 1Z0HA 3WDWA 3WUDA 2QWIA 1G9AA 1SO7A 3T1EA 5B2CA 1DQ6A 1RINA 5DZEA 2E51A 1Z4XA 4TZDA 4XJ8A 2D6LX 1VAVA 4Y1YA 1G9DA 3K39A 3WZ1A 2A6XA 3IKWA 2WNEA 3AZWA 3BEQA 4M00A 2DUOA 4FPJA 1V3BA 4YM2A 2UU8A 2YXSA 1LULA 2VH9A 1H9PA 3H71A 2QWBA 2YROA 4UF7A 1W8OA 5NN9A 3ZYRA 3L2YA 4ZKTB 3AK0A 3D4KA 2PHFA 1GSLA 4DFSA 1LENA 3LSEA 4B7QA 1H30A 2HU4A 1FAYA 5F5QA 4GKXA 4M4VA 2BATA 2D43A 1DILA 2OUJA 1V2IA 4K1HA 1IVCA 3AP5A 4FPOB 3GNEA 4SLIA 5F9TA 1WCQA 1Z4YA 3LCPA 2DUQA 4KS3A 2ZHNA 3HR9A 4M4NA 2DVGA 1DBNA 4AVVA 1SLCA 1VALA 2A3XA 3U4XA 3VV1A 1YYNA 4MX0A 4I00A 3IN9A 4OZXA 3A0KA 1NSBA 2W20A 2QWAA 3UK9A 2PHTA 5M1ZA 4K1KA 4UW3A 4Q1PA 4GZOA 2VSKA 1A78A 4BLJA 3H73A 2UWCA 3APBA 5DZGA 1EPWA 4NO4A 2JECA 4YGCA 2ZBJA 1CR7A 1GZWA 3FUOA 4HZVA 2WKKA 1V6IA 1UPSA 3WCSA 5GJ6A 1AX1A 4AVTA 2B8HA 2QWCA 4H55A 4PQ9A 1INHA 2OUHA 4DRRA 3WDUA 4W65A 1CJPA 2P2KA 2W38A 4XJZA 5T5PA 4UW5A 2DU0A 2A6WA 1DZQA 3FUQA 5HUNA 4AGGA 3SANA 2P3IA 4XMAA 3WDVA 1LTEA 5EXOA 3AZXA 4YM0A 1IS4A 4GZWA 1LOFC 1W6NA 2ZGOA 3O12A 2ARBA 4FQ4A 1INYA 2DVBA 2GNMA 1KJLA 4ZXKA 4GZQA 3AP7A 3AXDA 1N47A 1Q8QA 2GNDA 1NNAA 2QWGA 4YW1A 2AEPA 4CPYA 2UWAA 4AGRA 2HTVA 2HT8A 2YY1A 2Z42A 5IUQA 4XIKA 3OY8A 2AR6A 1MVEA 3CNAA 1MZ5A 2BZDA 2A3WA 5L73A 4X49A 2VY0A 1LOGA 4FPYA 3W09A 3QLQA 4Y20B 2AENA 1TEIA 3C2UA 3BOPA 4XZPA 2ENRA 3B00A 4LBLA 3AZZA 5FRAA 4XJ9A 1YXWA 2PHXA 2F29A 2SLIA 1VCJA 4YLZA 5T50A 2OW4A 4D69A 1KDKA 3N7MA 3K36A 3SITA 4BOWA 3ZSMA 4HIZA 3GVLA 5JDBA 1Q8OA 1USXA 2CWMA 2XZJA 2CL2A 1S0FA 2ZGRA 2D6KA 1NMCA 1W8NA 4CPOA 2A70A 4GZXA 4UW4A 5GLUA 1MZ6A 2DYCA 3PVOA 2ZZJA 2VVZA 2R1DA 3TB0A 1V6OA 4LBJA 4QN3A 5HUKA 2W5OA 1LESA 3NV1A 5H9PA 3AX4A 4AGVA 4FZHA 2PELA 3ALXA 1SLLA 1DIWA 3ZXKA 3WUCA 1LGCA 2TEPA 5HCFA 4R9BA 4XTPA 1DQ5A 1C57A 2NZ9A 3OJBA 4YW5A 3MEPA 3FLPA 3AP6A 3AJZA 1V6MA 1S1AA 2QWHA 5BYNA 4ASMB 1S0IA 2ZGLA 3AFKA 3V64A 3FLTA 1ONAA 2A6ZA 2DVFA 3AYCA 2E7QA 5B2DA 4UW6A 1GZWB 1Q8SA 2F13A 1GANA 3GALA 1IVBA 4CPMA 1LEDA 4U36A 1WCSA 2EXKA 1BXHA 3MW3A 1Q8PA 2YA5A 2ZABA 4XJWA 1Z4VA 1G9FA 3JU9A 1G7YA 3IM0A 3OGGA 2PHRA 1UX6A 4XBLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DQ1A 4MH0E 2E53A 2BVBA 4OZOA 4QGNA 3PMSA 4AI2A 4EJRA 1NCQC 2YA8A 5FJKA 2D6MA 1UY0A 3HT2A 1B35B 3ZYPA 2GHSA 4OI4A 3SOVA 1CX1A 4Q29A 3PMEA 2ZKLA 4H52A 4Y1ZA 2DUPA 2Q1ZB 2D3PA 2QTWB 2WNUB 3LAGA 3MIEA 3UKVA 3BTXA 5JVVA 1UYYA 3POFA 5A6XA 2XUEA 1LJ7A 2EAAA 4DXTA 1AF9A 1VBA3 4GULA 1DCSA 3D82A 4R9CA 4WZCA 2FZ2A 1XYNA 4X6QB 3POYA 1DQ2A 1AR83 1UCXA 3AYDA 2FQPA 1ZNPA 4TYSA 1H9WA 4Y1XA 3I8TA 1D4M1 1T2XA 4FAGA 1BJIA 2RS32 3A72A 3HIFA 5FP4A 3B9CA 4H14A 1RHI2 3PDQA 3ZR5A 4QD2A 5FZDA 4ZU7A 2RMU3 3M8LA 1MPXA 4MLOA 2JDMA 3SOBB 4ASCA 5F8PA 1WA4A 3B9IA 4XQ4A 1CAUB 2D44A 4JDOA 4LBOA 2VVEA 5FPAA 3WF1A 4ASLA 2B45X 1JW6A 3ABZA 2AEZA 4N53B 5EYXA 5FZFA 5FQ0A 5BNOB 1NCAN 1BHGA 1WW6A 1T6BX 2WZEA 1DZTA 2XLFA 3VNHA 4IN4A 2YC0A 4YM1A 5A80A 4ARXA 1HV1A 2D7FA 4S2FA 4X6RB 5F3CA 3SNMA 2HYXA 1B9VA 1AR92 3OBRA 1FV2A 4URTA 3WNMA 2CTVA 5K0UA 2ZEWA 4OUMA 1HJGA 3UKNA 2RHPA 1EUUA 1GOFA 1QU0A 1W6NB 2FHRA 3POWA 2JEMA 2VVFA 4QB2A 3R6SA 3RJ2X 3VBRC 3O9KA 3IMMA 3BTZA 4D7SA 2ZHMA 4XW3A 4I09A 3CL2A 1HB2A 4YZ5A 2P6HA 3FMGA 3CU7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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