2SLIA

Leech intramolecular trans-sialidase complexed with 2,7-anhydro-neu5ac, the reaction product
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
IPEGILMEKNNVDIAEGQGYSLDQEAGAKYVKAMTQGTIILSYKSTSENGIQSLFSVGNSTAGNQDRHFHIYITNSGGIGIELRNTDGVFNYTLDRPASVRALYKGERVFNTVALKADAANKQCRLFANGELLATLDKDAFKFISDITGVDNVTLGGTKRQGKIAYPFGGTIGDIKVYSNALSDEELIQATGVTTYGENIFYAGDVTESNYFRIPSLLTLSTGTVISAADARYGGTHDSKSKINIAFAKSTDGGNTWSEPTLPLKFDDYIAKNIDWPRDSVGKNVQIQGSASYIDPVLLEDKLTKRIFLFADLMPAGIGSSNASVGSGFKEVNGKKYLKLRWHKDAGRAYDYTIREKGVIYNDATNQPTEFRVDGEYNLYQHDTNLTCKQYDYNFSGNNLIESKTDVDVNMNIFYKNSVFKAFPTNYLAMRYSDDEGASWSDLDIVSSFKPEVSKFLVVGPGIGKQISTGENAGRLLVPLYSKSSAELGFMYSDDHGDNWTYVEADNLTGGATAEAQIVEMPDGSLKTYLRTGSNCIAEVTSIDGGETWSDRVPLQGISTTSYGTQLSVINYSQPIDGKPAIILSSPNATNGRKNGKIWIGLVNDTGNTGIDKYSVEWKYSYAVDTPQMGYSYSCLAELPDGQVGLLYEKYDSWSRNELHLKDILKFEKYSISELTGQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The 1.8 A structures of leech intramolecular trans-sialidase complexes: evidence of its enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords INTRAMOLECULAR TRANS-SIALIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Macrobdella decora
total genus 184
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature ec 4.2.2.15: Anhydrosialidase.
pdb deposition date 1998-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02973 Sialidase Sialidase, N-terminal domain
A PF13088 BNR_2 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.220.10 Mainly Beta Beta Barrel Intramolecular trans-sialidase; domain 3 Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 2sliA03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2sliA01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 2sliA02
4I00A 3BTAA 4ZXKA 2W38A 1HQLA 2A6WA 1WD4A 1USXA 1ULGA 3UK9A 1MS4A 2HTVA 1SLAA 2DVAA 3APBA 5GLZA 1GYKA 4Q1PA 1V6LA 3N7KA 1AZDA 2QWKA 4XXAA 5EYXA 2YA4A 2E53A 1WUVA 3VKFC 1YYNA 4YW1A 4P9YA 2AUYA 3TI5A 4CPZA 3VKNA 4WEFA 3N36A 4PCRA 5HCFA 1L7HA 2ZGPA 3WHUA 1JHNA 4MWXA 1FNZA 4UW3A 4GZPA 2D43A 5GZEA 3PVEA 3IM0A 4LBQB 1LEDA 3AJYA 2OUJA 2UWAA 4LBQA 2VU9A 4YG0A 4R9CA 1A4GA 4NN9A 4KS2A 3TI4A 5HX0A 3I8TA 3AYEA 1ULFA 3TB0A 4WVVA 2WLQA 4Q26A 3W59A 5EXOA 4B7JA 1X50A 2DVGA 3WDUA 3CL2A 3VV1A 1N1VA 3LSEA 2GN7A 2ZMKA 5LK5A 3GVKA 2EXKA 4GWMA 1AX0A 4FPGA 4NC5A 2BATA 4MJUA 1HLCA 4YG6A 4BOWA 3FUOA 5GZCA 1XOGA 1D0HA 2A70A 4CTEA 4LBLA 4CPMA 4XJAA 3KM5A 2VH9A 2GNBA 1A78A 1PZ7A 2A6XA 1GLHA 2A6ZA 3WV6A 5DUUA 2ES3A 4FQ4A 5BYNA 3O0VA 3AZWA 7NN9A 2QWFA 3WZ1A 3TIBA 5KXEA 4KS4A 4FVVA 4DQAA 1GSLA 4UW5A 2P3JA 2X9MA 1PZ8A 3RRDA 1U0AA 1W21A 3W09A 3WHTA 2NYYA 5IT6A 5DUWA 1O4ZA 1S0CA 4R9BA 4GEZA 3M3CA 3O5SA 3SH4A 4FPLA 1C1LA 3D12A 5GLWA 4XJ8A 4JC1A 1AVBA 2YA6A 1SLLA 3OBRA 3WDYA 4XBNA 1F8CA 1MWEA 1V6MA 4GKYA 5HUGA 2QWDA 4WA5A 3H0OA 1UZZA 4BQ1A 2ZACA 4C1XA 1A14N 5DUVA 5DG2A 1JYCA 4NCSA 1DQ2A 4QN7A 1JYIA 1IVDA 3N7LA 5FRAA 4KS5A 2A6YA 3SISA 1ZA4A 5IK7A 2CL2A 5JOZA 4WA3A 4YZ4A 5T5PA 1V6NA 2V5YA 1UZYA 3UJQA 1Q8VA 5HUMA 2E7QA 3ZPYA 1LJ7A 3AYAA 2HTWA 4PQ9A 3AX4A 5FREA 5HUKA 1TEIA 1WBLA 1VLNA 1OKQA 2GNDA 4GZSA 1LGCA 2VK6A 4ASMB 2ZGRA 3T1LA 5HCBA 2VW2A 2WSUA 1GV9A 3V64A 1LU1A 4AGVA 1SBFA 2W08A 1LOFC 2DTYA 2AEPA 1DIWA 3OY8B 1GANA 2DYCA 1C1FA 1S0EA 3ZYRA 1DQ4A 2VY0A 2YDPA 3OY8A 2F28A 4CPYA 2ZGNA 3V0AB 2LTNA 1SLIA 2JKBA 1OQ1A 2EALA 3V0AA 4FVKA 2GN3A 4IQPA 5IK8A 2SBAA 2AREA 2UWBA 4P14A 4YGDA 3AYCA 4MWRA 3RMXA 3ZXJA 4FPEA 2PELA 3USUB 3MW4A 1LOBA 3USUA 1V00A 3O0WA 3AZZA 4XBLA 2GMEA 2GMPA 3CNAA 4KS3A 4Q27A 1N3OA 1E8TA 2ZGSA 2QWCA 3FLPA 2AENA 3GNEA 1LHNA 2EIGA 2JE7A 1ULCA 1GZWB 4ISRA 1CPMA 2WQZC 2DVFA 2DVBA 2ZA9A 1KJLA 4HZVA 1GZWA 2YA5A 2SIMA 1QDOA 3C2UA 4XJWA 1AXZA 5EWSA 2ZAAA 3JUUA 4W65A 3H71A 2C4LA 4K1JA 3D4KA 2Z42A 4BLJA 3POYA 4Y1VA 1XQNA 4M3CF 2P3KA 3AP5A 1H9WA 1LENA 3SALA 3I4IA 2A3WA 1Q8OA 3WNXA 1V0ZA 5GJ6A 3TIAA 4B7NA 2D3SA 2F26A 4H53A 3CYEA 1G8WA 1LOEA 4YZ3A 3ILRA 4KS1A 3IN9A 4XJUA 3R4SA 4X4AA 2D3PA 5CAZA 5JMCA 4GDJA 4XIOA 1BKZA 3BODA 4XJ9A 4UF7A 2P34A 4D69A 4XE9A 2RKCA 4FPKA 1N3QA 1G9BA 1IS3A 1IS5A 4XIKA 4K1ZA 1NMAN 3SILA 5T55A 4M4VA 4LBQD 4TYSA 1YO8A 1NCAN 4K1HA 2QWJA 5SV8A 4FOQA 1LULA 1AJOA 1N1YA 1Z4WA 1KDMA 2CWSA 1N1SA 4MWJA 3OYWB 3ZYPA 3ASIA 4XMAA 5IK5A 5JOWA 2XB6C 3OYWA 1MS8A 2HTYA 1EUTA 4MYEA 1APNA 1ONAA 2ERFA 2HT5A 2F11A 3H6JA 1EPWA 1IS4A 3WDTA 2QWGA 3V65A 2VW0A 3NV1A 1WBFA 4M4NA 1CQ9A 4H55A 5AVAA 1F8BA 3NV4A 2HU4A 2B8HA 4XJRA 4HIZA 2R16A 2OVUA 5JVVA 1ENSA 1WLWA 1IKPA 2CYFA 4AVSA 1IVBA 1LOAA 2HTUA 1NSBA 3OPZA 1NCCN 1SNTA 2F12A 3RQ0A 4I30A 1UPSA 3ALXA 3Q9OA 1AXYA 3A0NA 2D6MA 1WD3A 1LOCA 1XOEA 1BYHA 4GZQA 4GALA 2ZGQA 2NMNA 3AP9A 4K1YA 1V3CA 1V3BA 2SILA 2ZZJA 3FLRA 3HN1A 3NV3A 1SLBA 1NCDN 1INGA 3TI3A 2D6PA 1WW7A 2WT1A 4YZ5A 4B7RA 4CPNA 5B2DA 2H0BA 1QOOA 4JRAA 2ZMLA 3WVJA 3VKLA 2W5NA 2WT2A 1QU0A 1S0DA 2C4AA 1MVQA 2UURA 2UWCA 4GXLA 4ATFA 4MWYA 2VSKA 1VALA 2TEPA 3H73A 4M00A 4M3MA 1JN2P 2E6VA 2W39A 3RS6A 1YIFA 1V0FA 2A6VA 4BBWA 2DUPA 3FLTA 1Z4ZA 2ENRA 3AXEA 3FFZA 4HZXA 1N47A 1LCLA 5DZFA 4YFZA 4DGRA 3SH3A 4YFWA 5CNAA 2KM2A 5IUQA 4XHBA 3L2YA 1DGLA 3A71A 3K3AA 1F31A 5DZEA 1IS6A 3FUQA 4YZ1A 4FP2A 3N7JA 3WG2A 4GKXA 1V6KA 3CKZA 4FPYA 4BPZA 5CA6A 5NN9A 1UAIA 1Y7BA 2PHUA 4CPOA 2JJ6A 5CB7A 2SLIA 1V6JA 2ZHLA 1WW5A 1LHWA 2ZGTA 2EXJA 1FNYA 1DQ0A 1IVCA 4MJVA 3ZXEA 4XTMA 2AGSA 1LESA 1SLCA 4GZWA 1AX1A 4MX0A 1GBGA 1IVFA 2ZBJA 3T1MA 4WEGA 3WDWA 4WV8A 5KXBA 2P2KA 4K3YA 2CNAA 1BZWA 1EUUA 5T50A 4YLZA 1S0FA 1EUSA 4MWVA 1BQPA 4Y22B 5HUNA 4R9DA 5EYYA 4YM1A 3V0BB 1V6OA 3D5OA 4Y22A 2ZKNA 4HZZA 3INBA 3V0BA 2YV8A 4XZPA 2EXIA 2HT7A 4YM3A 4AYUA 4Q8KA 3A72A 1E8VA 1N3PA 4LBJA 4GZTA 4YW3A 3TICA 5H9QA 4YM0A 4HZWA 4FJ6A 5F5QA 2ZHNA 2RHPA 1G7YA 2ZGUA 2NZ9A 3WG3A 3ENRA 2DU0A 4R9AA 4QN6A 1UX6A 1V3EA 5GZFA 2F29A 1IKQA 3WUDA 3ZXLA 1MVEA 2GNTA 4HANA 1UL9A 1LU2A 2HTQA 1Q56A 4MC7A 2DTWA 1ENRA 3ZVXA 3HR9A 2F0ZA 1KJRA 1VCUA 2VSMA 1D2SA 3JU9A 2ARXA 3DUIA 1QGLA 1NCBN 4OZXA 1DLLA 3LSDA 4BMBA 2P3IA 4K1KA 1WW6A 3WCRA 3GVJA 4MZEA 4Q1RA 4XDQA 4NO4A 4FPJA 3AZYA 1MACA 3ZSJA 1Q8QA 3ZXKA 2W68A 1INXA 4Q6KA 1JXNA 1FYUA 3O9JA 4K21A 2DUOA 1UMZA 2NM1A 1MS5A 2QWHA 3TI8A 4FPOB 1W6MA 4DRVA 3BOPA 2D6NA 3M3EA 1DQ5A 2NMOA 1URXA 3ILNA 1W0OA 1NNCA 3B69A 2D44A 4F83A 3ILFA 2NP0A 1WLDA 1SBDA 1MS9A 2DV9A 5H9PA 1Z4VA 1QNYA 3AP4A 3ZSMA 1Z4YA 1SCRA 1NNAA 1YI7A 2UU8A 1FX5A 2D3RA 1S0BA 1SBEA 1W6QB 4MZAA 1CONA 3AYDA 1NLSA 1INVA 2R1DA 2F27A 5DZGA 4XYXA 1W6QA 1UKGA 4PF5A 1Z4XA 4XTPA 2HTRA 2HYKA 3FBYA 4WZFA 3QCWA 1QOTA 2F13A 4XHXA 1JUIA 2R0FA 1I3HA 1N1TA 1CN1A 3B01A 5T5OA 2YA8A 4CRQA 4ITCA 4BMEA 2B7YA 3SLIA 1QF3A 2DVDA 3AFKA 3SNMA 4Z8BA 4B7QA 2D6OX 5IK4A 3AK0A 2W52A 2R49A 1A4QA 1INHA 3IMNA 2AYHA 1LHVA 3AXDA 3BEQA 3PJQA 2D6LX 2ZGKA 3MEPA 1IVGA 2CY6A 4QN4A 1G9DA 2A3YA 1MS1A 1PZ9A 2ZGMA 2PHRA 3N3HA 3NSSA 2FMDA 1MS0A 4GB1A 2QWEA 2A7AA 2PHFA 2BERA 1LOGA 1AF9A 4NOTA 4Y20B 4C1WA 1R1ZA 5KXDA 4Y1UA 1F8EA 4Y20A 1GZ9A 3INAA 1F9KA 3GALA 1Z50A 3NWKA 5H9SA 2OUHA 4M3CE 4SLIA 1SCSA 3AJZA 3POSA 1INYA 1YXWA 1CR7A 2XZJA 4DPNA 3VKOA 2YROA 6NN9A 1S0JA 1KDKA 2YY1A 4GZOA 4K20A 4GA9A 3RMYA 2CMLA 4ATEA 3K37A 1QKQA 3UJOA 5JOXA 1DIMA 1B9TA 1GKBA 2HU0A 4YW4A 2R1BA 4LBKA 3VUOA 4PBOA 4M3CB 5JDBA 4PBPA 1OFSA 4HL0A 2D6KA 4Q8LA 3KQRA 5KXCA 4AVVA 5GZGA 4M3CA 1B9SA 4AWDA 1NSDA 1F5FA 4AVTA 1DQ1A 4U2AA 2V73A 5GLTA 1G9CA 4YZ2A 4MWQA 1LOFA 5B2CA 1IOAA 3D11A 1S1AA 1DILA 4FQZA 2W20A 1VAMA 1NMBN 1KRIA 4YW5A 1V6IA 1KITA 2VK7A 3PMEA 1V3DA 2VUAA 2GMMA 1W20A 2GNMA 1W6PB 1NMCA 1ULDA 2JE9A 1AX2A 1W6PA 2Q5TA 1W0PA 1LGBA 4LBNA 1DYPA 1JW6A 3MW3A 1G9AA 2YDTA 1V2IA 4QN3A 2OW4A 2NN8A 2CWMA 1SLTA 4CZSA 3R05A 2XZIA 4FOYA 2F24A 1INFA 4QN5A 4LBMA 5E89A 2E7TA 3B3QE 1FV2A 3T1EA 3WG1A 4MWUA 3QLQA 2VWDA 3ATGA 1H30A 4DS0A 1C57A 4XBQA 5CBLA 1BJQA 3BIWE 1L7FA 1FATA 3UL2A 1NNBA 1H9PA 4YG3A 4X6KA 3OBTA 4MWWA 3ZSKA 1E8UA 1LTEA 4Q2FA 2BQPA 1S0GA 3PVNA 1W1XA 1CESA 1C4RA 4XJZA 3AZXA 1DFQA 4K1IA 4U36A 2VVZA 4RL7A 2BF6A 3AP6A 3IPVB 3HMYA 5E8AA 1AJKA 4ZKTB 5F9TA 4D8SA 1QNWA 3IPVA 2VXRA 3WCSA 1B9VA 1BXHA 4YW2A 1HKDA 3OJBA 2ZGLA 2DURA 4FPCA 1Z0HA 3POWA 1W6OB 2ZB6A 2C9AA 4Y1XA 4XMIA 2ZMNA 4H52A 1W6OA 4QNPA 3NV2A 1I1EA 1J1TA 1FAYA 2VW1A 2A75A 4MWLA 1A8DA 5DG1A 3WG4A 1YRZA 1VIWB 3N7MA 4CPLA 3M3OA 3CL0A 1RITA 2G4IA 1SFYA 1INWA 4WVWA 3GVLA 4YGCA 3K39A 5L73A 1NXD1 1W8OA 4DRRA 1WW4A 4Y26A 1IVEA 4P9XA 5T5LA 1HQWA 4Y1ZA 2A71A 4M01A 4FOVA 3AZVA 3SH5A 5GLVA 1UN1A 1G9FA 1GICA 5HCAA 2QWBA 2W5OA 1VAVA 1LGNA 1SO7A 1EURA 1DYKA 4XXPA 2YMZA 1RIRA 1CIWA 4FOWA 3WLUA 4Y24A 4AGGA 5M1ZA 2EF6A 3K36A 2QWAA 5E88A 2DU1A 1VCJA 2A3XA 1JBCA 1F8DA 2EAKA 1QMJA 3WOGA 3RSJA 1AXKA 2E51A 2YA7A 5GM0A 3MPPG 2WJSA 4BM8A 2R0HA 4M4UA 1WCQA 2HT8A 1RINA 1JOJA 2CTVA 5GLUA 4L8QA 2A5ZA 5H9RA 1DHKB 3TAYA 3MW2A 4Y1YA 1Z78A 4RA0A 1FV3A 2WKKA 4FZHA 3SITA 3O12A 1W6MB 4XOGA 3T2TA 1USRA 2PHTA 3M2MA 2LALA 3B9CA 1CPNA 5T5JA 3N35A 2GALA 4GZXA 1ULEA 1MZ6A 2C5DA 4YGBA 3ZSLA 1HDKA 5JOYA 5JLVA 4JCKA 1A3KA 3B00A 3D6EA 1W6NB 1S0IA 4YGEA 2PHXA 2FHRA 1W6NA 5DXDA 2PHWA 4JF7A 2WNEA 2P37A 2ZHKA 1Q8SA 2ARBA 2ZB5A 1L7GA 3WUCA 3W58A 2ZHMA 3U4XA 1GNZA 2VK5A 2AR6A 1NN2A 3SANA 3JU4A 3B7EA 1CVNA 3M1HA 2ZABA 4UW6A 3AP7A 4FPHA 3M3QA 1SACA 5T54A 4UW4A 2XG3A 1LHUA 1MZ5A 2QWIA 1GNHA 3R4UA 1WCSA 3A0KA 4GDIA 3H72A 4FP3A 4X49A 4BLIA 1LECA 3IKWA 1QOSA 3O0XA 2WT0A 5DUXA 3DGTA 1BJIA 4GJTA 5GALA 4HZYA 1GZCA 1ENQA 2YZ4A 1LHOA 4YM2A 1LEMA 4XJQA 4AGRA 2YXSA 2GDFA 4XILA 2ZGOA 1MR5A 1ZM1A 3ZXFA 2I2SA 1WLCA 4B7MA 1LODA 3K38A 2XZKA 3LCPA 1Q8PA 3WDVA 4LBOA 2AH2A 1KQRA 4ISQA 3NN9A 2D7FA 3WDXA 2JDZA 2JD4A 4KBBA 2DWRA 4TZDA 1G86A 3RG0A 3VKMA 3OGGA 1MS3A 1DZQA 3TI6A 3A4UA 4WA4A 1DBNA 5T52A 3PVOA 5GZDA 1V0EA 4GWNA 4FPFA 1CJPA 4X47A 2EXHA 2XCYA 1NSCA 1B09A 1DQ6A 3O9KA 2WSVA 2F25A 4J9TA 2AEQA 2DUQA 5JYYA 1W8NA 4DFSA 4P9WA 1O4YA 2BZDA 3ALWA 2JECA 1QDCA 2F10A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4I00A 3WQ0A 3BTAA 2MPFA 3KGLA 4QGMA 4ZXKA 1AUYA 5JAXA 2RS31 2JIJA 4V1PA 1IPSA 4G4FA 1HQLA 4C0BA 1QJY3 2A6WA 2W38A 2FD8A 4RQPC 4DUVA 1AR63 1HXS2 4UFHA 1RUE2 5FZDA 1WD4A 2WWUA 1JZ2A 1USXA 5F1RA 1ULGA 4NPMA 3UK9A 5I0DA 1MS4A 2HTVA 4XEZA 5A1FA 3WW2A 5LEJA 4R4XA 2ZS6B 4BZ4A 3OBZA 1COV1 1SLAA 2DVAA 2OIIA 3APBA 5GLZA 4CU7A 1GYKA 4Q1PA 4LO7A 5LW9A 1ZZ6A 1HQNA 4LIVA 1GWMA 5C3QA 1V6LA 2H6CA 2HWF1 1NOVA 2IVIB 1AZDA 1CX4A 1GP6A 1VRH3 3N7KA 4KG0A 2QWKA 4XXAA 5EYXA 2YA4A 4HW6A 2BFUS 2W87A 2E53A 5FYBA 2RVAA 2JDPA 2IZWA 4KBZA 1HN1A 1IUBA 4GQ7A 1HX6A 5F5IA 3SOBB 2J1EA 2BNOA 1WUVA 3VKFC 1YYNA 5BNNC 2VR4A 1PIV1 5F6KA 4YW1A 3SRGA 4P9YA 2AUYA 3IDCB 5J96B 3VKNA 3TI5A 2KA3A 4MV2A 1H2KA 5FZHA 4CPZA 4WEFA 1TQ5A 4MGQA 4D6RA 3CZUA 2JDAA 1C3HA 3N36A 3S57A 1W2NA 4AHXA 1RWLA 4L7DA 1LB2A 4BDVB 1EV13 4PCRA 1YFWA 3UKNA 5IYYA 1NQJA 1ASJ1 1OMIA 2B39A 3D0SA 5HCFA 2R073 3LI4A 1GNYA 5C9AC 1JYXA 1C5IA 2XJPA 5CFDC 1L7HA 2A1XA 2WS91 2JDKA 1VAKA 4I0AA 2ZGPA 1KGYA 5C8WA 4IE7A 2VZ1A 4XQDA 4P02B 4WM7B 3WHUA 1GU3A 1ZBA2 1AYM2 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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