2SLIA

Leech intramolecular trans-sialidase complexed with 2,7-anhydro-neu5ac, the reaction product
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
IPEGILMEKNNVDIAEGQGYSLDQEAGAKYVKAMTQGTIILSYKSTSENGIQSLFSVGNSTAGNQDRHFHIYITNSGGIGIELRNTDGVFNYTLDRPASVRALYKGERVFNTVALKADAANKQCRLFANGELLATLDKDAFKFISDITGVDNVTLGGTKRQGKIAYPFGGTIGDIKVYSNALSDEELIQATGVTTYGENIFYAGDVTESNYFRIPSLLTLSTGTVISAADARYGGTHDSKSKINIAFAKSTDGGNTWSEPTLPLKFDDYIAKNIDWPRDSVGKNVQIQGSASYIDPVLLEDKLTKRIFLFADLMPAGIGSSNASVGSGFKEVNGKKYLKLRWHKDAGRAYDYTIREKGVIYNDATNQPTEFRVDGEYNLYQHDTNLTCKQYDYNFSGNNLIESKTDVDVNMNIFYKNSVFKAFPTNYLAMRYSDDEGASWSDLDIVSSFKPEVSKFLVVGPGIGKQISTGENAGRLLVPLYSKSSAELGFMYSDDHGDNWTYVEADNLTGGATAEAQIVEMPDGSLKTYLRTGSNCIAEVTSIDGGETWSDRVPLQGISTTSYGTQLSVINYSQPIDGKPAIILSSPNATNGRKNGKIWIGLVNDTGNTGIDKYSVEWKYSYAVDTPQMGYSYSCLAELPDGQVGLLYEKYDSWSRNELHLKDILKFEKYSISELTGQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The 1.8 A structures of leech intramolecular trans-sialidase complexes: evidence of its enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords INTRAMOLECULAR TRANS-SIALIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Macrobdella decora
total genus 184
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature ec 4.2.2.15: Anhydrosialidase.
pdb deposition date 1998-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02973 Sialidase Sialidase, N-terminal domain
A PF13088 BNR_2 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.220.10 Mainly Beta Beta Barrel Intramolecular trans-sialidase; domain 3 Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 2sliA03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2sliA01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 2sliA02
1L7HA 1QOSA 4DGRA 4YG3A 4CPMA 3UJQA 2NP0A 4XHBA 4CPYA 1Q8QA 4BPZA 4KS4A 2GMPA 1QOTA 1GZWB 2JECA 2PHXA 1YO8A 3BODA 5F9TA 2V73A 3NSSA 5T55A 4MWYA 4Y22B 2F27A 4BBWA 2GNBA 3AJZA 2QWGA 4XBQA 3W58A 4OZXA 4GZOA 2E6VA 1WW7A 2JKBA 3A72A 3K39A 1UZYA 2LALA 1CJPA 1FV3A 1G9BA 4WEGA 4MWRA 5T5LA 4Y1UA 3PMEA 1RINA 4HL0A 1MS0A 3LSEA 3NWKA 3GVKA 4ISQA 1EPWA 4YG0A 3WG4A 4LBLA 4FPFA 5DG1A 4BMBA 1FYUA 1MZ5A 3AZVA 4CZSA 2YA6A 3APBA 2D6PA 5JDBA 4YW2A 4YZ5A 2B7YA 2ES3A 4GKYA 1W6QB 3T2TA 1V6MA 3ZSJA 4KS3A 3U4XA 3OYWA 2YDPA 4X4AA 5GZDA 4DRRA 1LOFC 1VCUA 4FJ6A 3KQRA 1NCCN 3SANA 4D69A 1PZ8A 3D5OA 2VW0A 4QN5A 1LOCA 1WW5A 4BOWA 1JW6A 1I1EA 2A7AA 1QDCA 4HZWA 1MACA 3ZSKA 3WG1A 1E8TA 3D12A 1OFSA 4MYEA 1AXKA 1UX6A 1W6PB 2ZHMA 4D8SA 2D44A 4FPYA 3RG0A 1S0CA 4YLZA 2CWMA 5T52A 3N36A 1LULA 5B2DA 4WA3A 4YZ3A 1WD4A 2F26A 1SLAA 1W8NA 3A4UA 1BYHA 2PHTA 4U36A 4YW1A 3UL2A 3ZYRA 4C1XA 4XYXA 4AGGA 1F9KA 1CN1A 3WV6A 2HTRA 1OKQA 2OVUA 4JRAA 2GMEA 3FFZA 2E53A 1LU2A 3V0AA 2ZZJA 1WBLA 4HZXA 1GZWA 2YZ4A 3DGTA 4C1WA 6NN9A 2SLIA 1C4RA 2BERA 1LJ7A 3AYAA 1Q8VA 1GZ9A 2EXIA 5SV8A 4YM2A 4XIKA 2GNTA 2VWDA 1MS1A 3AP4A 1IVGA 3R4SA 2ZB6A 2ZGLA 3WDXA 2XZJA 4TZDA 2A5ZA 3K36A 4B7QA 1DIWA 5GLWA 1CPMA 2ZHLA 1LESA 4PBOA 2W68A 1QU0A 1S0JA 2QWIA 4GEZA 1V00A 1CR7A 4FP3A 2JD4A 3FLPA 1SBFA 4XBLA 1INYA 4MWJA 4PBPA 2SBAA 1IS4A 2RKCA 4M3CB 3H6JA 2YY1A 4YGDA 1F31A 1LHWA 3LSDA 1USRA 5B2CA 1QKQA 1W6QA 1NSBA 4ATEA 1INGA 4IQPA 2UU8A 1LHVA 3H71A 1EUSA 3TAYA 1LECA 4FPGA 5LK5A 2QWEA 3FUOA 2C9AA 1UKGA 4P9YA 1JOJA 1LENA 5HCAA 3AP9A 3JU4A 2QWJA 5AVAA 2VU9A 4I00A 5EYYA 2HTVA 4YFZA 1W6PA 5GLUA 1GZCA 1MS9A 1LEMA 4GB1A 5DG2A 3M1HA 1DQ6A 3ZSLA 5H9SA 3M3QA 2YA7A 3SITA 4R9AA 3UK9A 3T1LA 2JE7A 5IUQA 4XJWA 3O9KA 2F10A 5DZGA 2TEPA 5H9QA 2ZGRA 4LBOA 1N1SA 2HTUA 4PF5A 2E7TA 4PQ9A 1V0ZA 5CAZA 3PJQA 2QWFA 1JYCA 1F8CA 4FP2A 4GKXA 2JE9A 2AUYA 5E8AA 2AGSA 4XE9A 1ULFA 1GICA 3I4IA 1ENSA 4HZZA 1UMZA 3ALWA 4LBQB 4Y24A 1SFYA 1NMBN 3MEPA 1JHNA 1O4ZA 1F8BA 2ZB5A 1LOAA 5EXOA 2CMLA 4FVVA 2VW2A 2DU0A 4QN3A 2F29A 2D6MA 4MZAA 4FOQA 3AYEA 4XJAA 1NLSA 1LU1A 4ZKTB 1N47A 1MS4A 5M1ZA 2ZKNA 1DBNA 1N1TA 1BZWA 2D43A 5KXBA 4XJZA 2W08A 3B00A 3N7KA 3B3QE 1TEIA 4P14A 3ZPYA 1W20A 2R0FA 2HTYA 1RIRA 3BOPA 2DYCA 4Q8LA 5GM0A 2WSUA 1IKQA 2WQZC 2A3WA 1QF3A 4P9XA 3N35A 5JYYA 4DFSA 2NMNA 1INFA 4GWMA 2D3RA 4UW6A 3WNXA 4KS5A 2F13A 4MX0A 1H30A 2NYYA 3OY8A 5NN9A 1G86A 4UW3A 1Q8OA 3PVEA 2BQPA 4M3CA 1V3EA 1CONA 1INWA 1R1ZA 1W0PA 1LODA 1NMAN 3TI8A 4GZXA 2ZGQA 3V0BB 3N7LA 1FV2A 4CTEA 1DILA 2A3XA 2Q5TA 1H9PA 3ENRA 1XOEA 1CQ9A 2QWCA 1IOAA 1YXWA 1B09A 3AZXA 1DZQA 4KBBA 3OBTA 4Q6KA 3WUDA 1FX5A 3V0AB 2P3KA 5GJ6A 1XOGA 4MWWA 1GNZA 2R0HA 4FPOB 2EIGA 4JCKA 4WEFA 2ZHNA 2NM1A 2DUOA 2ZGNA 3ZSMA 3TI6A 4XMIA 1A14N 3N7MA 4WA4A 4XHXA 1IS6A 2PHUA 2A75A 3WOGA 4XOGA 3NV2A 3POYA 4B7JA 1N3QA 2F28A 3MPPG 1E8UA 2ZMKA 3HMYA 3B01A 3W09A 4Z8BA 2QWDA 3V65A 4X6KA 4BLJA 1WLWA 1NNAA 1V0EA 2D6OX 3M2MA 1C57A 1V3CA 3GVJA 2D3PA 4K3YA 2CL2A 1W8OA 1Q8SA 4XJRA 3AXDA 5BYNA 1LOBA 1NSCA 3K38A 4CPLA 1JUIA 2AR6A 3HN1A 5GZGA 4MWUA 1S0BA 5JLVA 1DHKB 3BIWE 4LBQA 4K1JA 1SCRA 2A6VA 4SLIA 4Y1VA 1YYNA 2B8HA 3I8TA 3H72A 2HU0A 1A8DA 2RHPA 4Q26A 4YG6A 4FQZA 4FPKA 2OW4A 2HYKA 2PHWA 4R9DA 3R4UA 5T54A 2CNAA 2ZGTA 1W1XA 1SLCA 4HZVA 2R1BA 4HZYA 4YFWA 2A3YA 1GANA 3NV1A 3MW3A 1G7YA 5DUUA 1MR5A 2JDZA 2VVZA 4FOYA 3CYEA 5DZEA 5HCBA 1UPSA 1VAVA 4CPNA 2A6YA 1VLNA 4XTPA 5DZFA 1INXA 4XBNA 1JN2P 2F25A 2D6KA 1LHOA 1E8VA 3K37A 4CPOA 4YGCA 3BEQA 3JU9A 3ZXLA 1WW6A 2ZABA 1NNBA 4M4UA 1MS8A 1URXA 3AXEA 1KDKA 4XZPA 5IK8A 3WDYA 1WLDA 4GZWA 3IMNA 2I2SA 2E7QA 1KDMA 1B9SA 1SNTA 1LGBA 3V0BA 4JC1A 1AX1A 1DQ4A 3M3OA 3OBRA 3FUQA 1KRIA 1U0AA 2YA5A 2KM2A 1BKZA 4GALA 2HT5A 5H9RA 4XJ8A 4ATFA 1LTEA 1JXNA 4DPNA 1N3PA 4GZSA 3WDUA 5FRAA 2C4AA 4MJUA 4LBNA 1XQNA 1BXHA 3GVLA 2DUQA 1YI7A 2DVDA 3WUCA 1ZA4A 2WKKA 2A71A 1QOOA 1N3OA 1Z4WA 1DGLA 2EXJA 4HANA 4GZPA 5IK4A 1I3HA 1JBCA 3QLQA 2VK7A 1S0IA 1KQRA 1GBGA 1V2IA 5KXDA 3O0XA 1BQPA 4DQAA 4QNPA 2OUHA 1Z4VA 1D0HA 2XZIA 4QN4A 5HUMA 4FPEA 1Z78A 4RA0A 2CY6A 4FVKA 4K1YA 2YA8A 3WG3A 5T5OA 1Y7BA 1SO7A 2VH9A 1AX0A 4GZTA 1ULGA 1Z4ZA 3WDVA 3AX4A 2C4LA 2C5DA 2DURA 2QWKA 1QMJA 2XB6C 3HR9A 3AZWA 2GNMA 3WHUA 3Q9OA 3OY8B 1A4GA 1W6OB 2ZGSA 5CB7A 1NXD1 2SIMA 2D6LX 4M4NA 2ZBJA 2GNDA 1DFQA 4MWQA 4ITCA 3VKNA 1GNHA 1D2SA 2P3IA 4Y26A 2EXHA 1MVQA 2P34A 1SBEA 5JOZA 1HKDA 4Q1PA 4NC5A 4XDQA 1QDOA 4X49A 1LOGA 3UJOA 2NN8A 3T1EA 1DQ2A 3AYCA 5EWSA 1V6OA 3V64A 1AF9A 4LBJA 1NN2A 5KXCA 3C2UA 5CNAA 1ZM1A 4FQ4A 3KM5A 2HU4A 2HTWA 4FOWA 5E88A 7NN9A 3AFKA 1HDKA 1FNZA 4Q8KA 5HUGA 4AWDA 2W39A 3M3CA 2A70A 3SH5A 1SLLA 4H52A 4M3CF 1FAYA 2P37A 3VKLA 2F11A 4YW3A 4MC7A 1L7FA 4WZFA 4CPZA 2R1DA 2AYHA 1IVFA 1KITA 1INHA 3INBA 2DWRA 3B7EA 1EUTA 3POSA 4ASMB 2F12A 1GKBA 5GLVA 1A3KA 1MZ6A 1F5FA 3WDWA 1LEDA 3CKZA 2D7FA 1V6JA 1PZ7A 2PHFA 2ARBA 5E89A 4B7NA 1AX2A 3RMXA 2ZMLA 2EAKA 2YDTA 3A0NA 4MWVA 2R49A 3CNAA 3AP5A 1SCSA 4TYSA 1W6NB 3O0WA 3NV4A 2W5OA 3RMYA 1G9AA 2DU1A 4YM3A 2H0BA 5JOXA 1WD3A 3TB0A 4QN6A 2ZGMA 1S0DA 2QWBA 3VV1A 5GZCA 2E51A 2DUPA 3AK0A 1CVNA 5JMCA 1DIMA 1W6MB 3ILFA 4Y1ZA 1GYKA 4MJVA 1AJKA 4K1KA 3T1MA 1V3BA 1UZZA 1LHNA 4J9TA 4WA5A 1IVCA 2YV8A 4YZ4A 4WVVA 3N3HA 2HTQA 1W6OA 3CL0A 2DTYA 5T5PA 3INAA 2VSMA 1EUUA 4M01A 3WG2A 3H73A 1RITA 3DUIA 3WVJA 4GWNA 2D6NA 1SLIA 2AH2A 5EYXA 4B7MA 1UN1A 2VSKA 4M3CE 1ENRA 2AREA 2PELA 3IN9A 4BQ1A 2QWAA 5DUVA 4FPLA 1ONAA 5DXDA 4GZQA 4GJTA 2W5NA 4MWLA 5CBLA 2WT2A 2ZMNA 3JUUA 5F5QA 4LBKA 4H53A 3A0KA 3ZYPA 2ZGKA 3FLTA 3R05A 1C1LA 1QGLA 1AJOA 4KS1A 1ULDA 2GMMA 3O9JA 4MZEA 4CRQA 2WNEA 5IK7A 3POWA 4NCSA 5KXEA 2DVBA 1O4YA 4YM0A 4B7RA 4MWXA 2UWCA 2ARXA 2JJ6A 3RRDA 3ZXKA 5JOYA 3VKOA 1VIWB 3IPVA 4R9BA 1CIWA 4YW4A 1H9WA 2LTNA 4Q1RA 4QN7A 1GV9A 3SALA 1UL9A 2NMOA 3D11A 4YGEA 2PHRA 2YMZA 1B9VA 1C1FA 4YW5A 4K1IA 3OGGA 3WCSA 1WCSA 4Q27A 1W6NA 3TI3A 5HUKA 4AVVA 1LGNA 2ZGUA 3RSJA 1V6KA 2BZDA 3TIBA 2CTVA 2VUAA 3ILRA 4H55A 2BF6A 4AGVA 1S1AA 4Y20B 1SLTA 3N7JA 5IK5A 1AVBA 1USXA 3NN9A 2F0ZA 1W6MA 2A6WA 3OJBA 2UURA 1CPNA 1B9TA 4XJ9A 1VCJA 2AENA 1HQWA 3NV3A 2ERFA 3B69A 3D6EA 5JVVA 2P3JA 3AJYA 3ILNA 4PCRA 3GNEA 2ZHKA 3SLIA 4RL7A 4R9CA 3VKMA 2GDFA 1DYKA 2DVAA 1UAIA 2HT7A 1NMCA 2V5YA 3SILA 3WLUA 1Q56A 1QNYA 2VK5A 3TIAA 3WHTA 4U2AA 1GLHA 1V0FA 1IKPA 3ASIA 1IS3A 2XZKA 3FBYA 4K20A 2ZACA 4M4VA 5CA6A 1GSLA 3RQ0A 4AVSA 2W52A 2VXRA 4JF7A 5IT6A 4ISRA 3CL2A 3AZZA 1PZ9A 3SH4A 5GZFA 4K1HA 3FLRA 1N1VA 1A78A 1NSDA 4FPHA 1ULEA 3W59A 2D3SA 4LBMA 3WCRA 2OUJA 2ZGPA 3LCPA 1NCBN 1CESA 5GLTA 1DLLA 4GXLA 5T5JA 3QCWA 4Y1YA 1L7GA 4GA9A 3AZYA 3L2YA 2R16A 1F8DA 3PVNA 5H9PA 3ZXFA 4FPJA 4M00A 3AP6A 4Y22A 4YM1A 4WV8A 4BMEA 2X9MA 1N1YA 4GDJA 1J1TA 2UWAA 5DUXA 2ZGOA 2F24A 1WUVA 2VK6A 2VW1A 4X47A 1Z4XA 1MS3A 3OPZA 4XTMA 1HLCA 1WCQA 1V6IA 1S0GA 3WDTA 2UWBA 4DRVA 1LHUA 3VKFC 5T50A 4K21A 1YIFA 1ENQA 3IKWA 1F8EA 2SILA 3O5SA 1SBDA 2WJSA 4KS2A 2GN7A 4LBQD 1HQLA 4FOVA 2ZAAA 2W20A 4W65A 3B9CA 1Q8PA 4M3MA 1LGCA 3USUB 1MS5A 1QNWA 1Z0HA 1AZDA 4Y20A 1Z4YA 4XILA 3TI5A 2EF6A 3BTAA 3GALA 4UW4A 1NNCA 1G8WA 1KJLA 2VY0A 2DTWA 1V3DA 2YXSA 2WT0A 3SISA 2FMDA 1G9DA 2P2KA 4P9WA 4YZ1A 3ZXJA 3IM0A 2AEPA 2A6XA 1ULCA 4AVTA 1OQ1A 4YZ2A 1W0OA 1FATA 1YRZA 3A71A 2EALA 5JOWA 3ATGA 5GZEA 3TI4A 4WVWA 5FREA 1Z50A 1DQ0A 2NZ9A 4K1ZA 3SH3A 1V6NA 2CWSA 1FNYA 1A4QA 3VUOA 1MWEA 2QWHA 3O0VA 1DQ1A 1INVA 1IS5A 1S0FA 4NOTA 3IPVB 5HUNA 4I30A 2ENRA 4NO4A 2GALA 3WZ1A 1KJRA 3D4KA 1AXYA 1BJQA 2EXKA 2YROA 4UF7A 4NN9A 2Z42A 1EURA 1SACA 1SLBA 4XXPA 5DUWA 5GALA 3ALXA 1DQ5A 2AEQA 3RS6A 4DS0A 1LOEA 1NCAN 1X50A 2FHRA 4XXAA 4BLIA 4L8QA 4BM8A 4XIOA 1WLCA 1G9CA 5HX0A 3O12A 1WBFA 2XCYA 2WLQA 3OYWB 4FZHA 2CYFA 4XJQA 4HIZA 3AP7A 2W38A 4YGBA 4XJUA 5L73A 3AYDA 3M3EA 4FPCA 1WW4A 2BATA 1BJIA 2YA4A 5GLZA 1S0EA 1JYIA 1DYPA 1AXZA 2DVGA 1G9FA 1V6LA 1APNA 4GDIA 3SNMA 3H0OA 4F83A 4XMAA 1MVEA 3PVOA 1NCDN 4AGRA 3ZVXA 2DVFA 4Y1XA 1IVEA 2GN3A 2HT8A 3USUA 2WT1A 2DV9A 4ZXKA 1VAMA 1LCLA 3TICA 2XG3A 3MW4A 4UW5A 1LOFA 3ZXEA 1IVDA 1VALA 2G4IA 2A6ZA 2ZA9A 1IVBA 4Q2FA 3K3AA 3MW2A 5HCFA 4AYUA 1W21A 2WSVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Z5WA 2BOJA 1L7HA 1GP6A 1QOSA 4V1PA 4DGRA 4YG3A 4META 4ZZ5A 5C7GA 4CPMA 4R4ZA 5IW0A 5JXGA 3UJQA 1QJY1 2RM23 2NP0A 2QQIA 4AI2A 5K0UC 4XHBA 4CPYA 1Q8QA 2QQLA 4N9HA 3S7IA 1RVF3 5A7QA 2UY8A 4BPZA 3VDBA 4KS4A 1JZ8A 2GMPA 1R083 3VDCA 2R30A 3TEWA 1AR73 1GZWB 1QOTA 2HU4A 2WAOA 4GWJA 4UFHA 1YWKA 3HNMA 4Z2WA 5C3RA 4BIOA 4QKBA 2JECA 4PDWB 2ZZKA 2PHXA 1YO8A 4E9KA 3BODA 4XVHA 3KV5A 5F9TA 2V73A 3TEXA 1W2AX 3TWIA 5I0TA 1YQ5A 3J7MA 2YPJA 4B7EA 5CKMA 2H2UA 1PNGA 1RUF3 1YUDA 2PFWA 1QEXA 3NSSA 2QQJA 1PK6B 4A6SA 1H6LA 5T55A 5FZDA 1NCRA 4MWYA 3RWKX 4XF3A 1CGPA 4Y22B 3A23A 4PT6A 1V9U2 4AH4A 2F27A 4BBWA 2GNBA 2FD8A 3RI9A 3AJZA 2QWGA 2PTMA 1XYOA 5FZOA 4XBQA 5FYZA 3FWEA 3W58A 2GC3A 4NUBA 4KMQA 3WW3A 4CEWA 1UY4A 1W9TA 5BPXA 4OZXA 5BNOA 5I8YA 5L9VA 2ZEYA 5LASA 4IV1C 5A7SA 2E32A 4GZOA 2E6VA 1WW7A 5FMOL 2IXLA 2JKBA 4WM8A 3DYOA 3ZIXA 4C0BA 4DUWA 3A72A 3IIIA 3K39A 1UZYA 4LO5B 4QKFA 2TBVA 4YYOA 1S4CA 4AI8A 5FZLA 4ZY9A 1TNFA 3HLIA 2RJLA 4YRDA 2LALA 4GN7A 1CJPA 2FLUX 1FV3A 4E27A 2C4XA 5FZ8A 5DAPA 3W20A 1G9BA 1GP4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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