2SLIA

Leech intramolecular trans-sialidase complexed with 2,7-anhydro-neu5ac, the reaction product
Total Genus 184

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
IPEGILMEKNNVDIAEGQGYSLDQEAGAKYVKAMTQGTIILSYKSTSENGIQSLFSVGNSTAGNQDRHFHIYITNSGGIGIELRNTDGVFNYTLDRPASVRALYKGERVFNTVALKADAANKQCRLFANGELLATLDKDAFKFISDITGVDNVTLGGTKRQGKIAYPFGGTIGDIKVYSNALSDEELIQATGVTTYGENIFYAGDVTESNYFRIPSLLTLSTGTVISAADARYGGTHDSKSKINIAFAKSTDGGNTWSEPTLPLKFDDYIAKNIDWPRDSVGKNVQIQGSASYIDPVLLEDKLTKRIFLFADLMPAGIGSSNASVGSGFKEVNGKKYLKLRWHKDAGRAYDYTIREKGVIYNDATNQPTEFRVDGEYNLYQHDTNLTCKQYDYNFSGNNLIESKTDVDVNMNIFYKNSVFKAFPTNYLAMRYSDDEGASWSDLDIVSSFKPEVSKFLVVGPGIGKQISTGENAGRLLVPLYSKSSAELGFMYSDDHGDNWTYVEADNLTGGATAEAQIVEMPDGSLKTYLRTGSNCIAEVTSIDGGETWSDRVPLQGISTTSYGTQLSVINYSQPIDGKPAIILSSPNATNGRKNGKIWIGLVNDTGNTGIDKYSVEWKYSYAVDTPQMGYSYSCLAELPDGQVGLLYEKYDSWSRNELHLKDILKFEKYSISELTGQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
source organism Macrobdella decora
publication title The 1.8 A structures of leech intramolecular trans-sialidase complexes: evidence of its enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords INTRAMOLECULAR TRANS-SIALIDASE
total genus 184
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature ec 4.2.2.15: Anhydrosialidase.
pdb deposition date 1998-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02973 Sialidase Sialidase, N-terminal domain
A PF13088 BNR_2 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.220.10 Mainly Beta Beta Barrel Intramolecular trans-sialidase; domain 3 Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 2sliA03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2sliA01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 2sliA02
3B9CA 3NWKA 2NYYA 5DZFA 1Q8PA 2EXKA 4DS0A 3FLRA 4P9WA 4YG3A 2BF6A 5T5LA 3ZSLA 3ALXA 1X50A 4Y22B 4TYSA 4X4AA 1O4ZA 5NN9A 5IUQA 4KS4A 6NN9A 4K1ZA 1WBLA 3AP6A 5GLTA 2A6ZA 1B9TA 3WOGA 1FYUA 4YW1A 2AEQA 5KXDA 5DXDA 3AK0A 5IK7A 2YA7A 2V5YA 3M1HA 2HTRA 4MJUA 4D69A 1Z4XA 3SALA 4NOTA 1NCCN 1W8NA 1CVNA 4GJTA 1MS8A 4XJ8A 1ZM1A 4RL7A 4C1WA 3ZSMA 1Q8SA 2VUAA 1NNAA 3WCRA 4M3CE 1UKGA 1SO7A 1SNTA 1BKZA 3WG2A 3AJYA 1W1XA 4KS5A 1WD3A 2H0BA 1B9SA 1F8CA 3MW4A 2EXHA 3USUA 4YG6A 4Y24A 1YO8A 3OY8A 4YM2A 4FP3A 3MW3A 1ULFA 3QCWA 2BZDA 1C4RA 1NNBA 3CNAA 3N7MA 3K36A 5GM0A 2AEPA 1CPMA 4Y1UA 4FP2A 3WDXA 3FLPA 4YZ1A 5GZGA 5E89A 1YYNA 3ALWA 2PHWA 1DLLA 3CKZA 2F13A 3GALA 2F28A 1NSDA 3VKLA 3QLQA 4FQZA 3UJQA 3BEQA 4Y20A 1MS3A 2P3KA 4AWDA 2DU1A 2HYKA 1S0JA 2VK6A 3I8TA 1DIWA 2F25A 2BQPA 2GN7A 2HU0A 2ZMNA 1USXA 4YZ4A 4NCSA 1GNHA 3W09A 1W6NA 1HQWA 1SBFA 2D6MA 2ZA9A 1W6OB 4WEFA 1WW6A 4XJRA 3WDYA 1KQRA 2DVDA 3AYCA 4MWQA 3LSDA 2ZZJA 1Q8OA 4ZXKA 2GDFA 3MW2A 4WEGA 2AYHA 1KJRA 1QU0A 2Z42A 4YW4A 5FRAA 4YZ3A 2VU9A 1SFYA 1DQ0A 2F27A 1WW4A 2E53A 1MACA 2ZGRA 4HZZA 1G8WA 5E8AA 1DFQA 3V0BA 4FOQA 2SIMA 2AENA 3HR9A 4BBWA 1QF3A 4XHXA 4FPCA 4M3CA 2A3YA 2UU8A 1A78A 1OQ1A 2R0FA 4X6KA 3NSSA 5H9SA 4M3CF 1F8BA 2A7AA 3PMEA 1H30A 2YROA 3IKWA 2W5NA 3O0WA 1W6MA 3D6EA 3BOPA 1W6QA 4HZXA 1GZWB 1QMJA 2YDTA 4WV8A 3ATGA 1JBCA 4DQAA 3O5SA 2GNTA 1SLIA 1XOGA 2GMMA 4XBLA 4Q1PA 1LHNA 4GALA 5F9TA 3TI6A 1A4QA 5GZFA 3ZYRA 2HT5A 4GZTA 3K37A 3AP5A 4AVTA 2E7QA 5KXBA 3B69A 3TAYA 1SLCA 3B3QE 1N3PA 2RHPA 2JE7A 1MWEA 3TI3A 2YV8A 3ZPYA 2WKKA 1MS1A 1Z4ZA 4AGRA 1LULA 4MYEA 1GKBA 2DWRA 1V3BA 4B7JA 1XQNA 1LHOA 3PVEA 2UWBA 2DU0A 2ARXA 1D2SA 1N3QA 2HU4A 2NP0A 2VK7A 1W6PA 1LGCA 1V6KA 3HMYA 1LOCA 4GB1A 1INYA 3AZXA 1IVEA 2D3SA 2PELA 2WT1A 4QNPA 5AVAA 1IVBA 1V6NA 3CL2A 5T5JA 3M3QA 3V0AA 3WVJA 4KS1A 1FNZA 3AXDA 4LBLA 5HCAA 2GMPA 4X47A 3M3EA 2XZIA 1LGNA 2QWBA 2E51A 1KDKA 1IVDA 4M4VA 1WW7A 1NXD1 3ZSJA 3OBTA 4CPMA 4WA5A 1DILA 2ZB6A 4JF7A 2Q5TA 2CWMA 2GNDA 2F24A 3U4XA 4FPGA 3IN9A 4PCRA 2SLIA 4YLZA 1AF9A 1IS5A 4XE9A 4X49A 4B7MA 1IS6A 4XJQA 5GLWA 2AR6A 1IVCA 3H73A 1EPWA 4MZAA 3ENRA 1HDKA 1LJ7A 2JKBA 2WQZC 1DYPA 2DURA 1DIMA 1O4YA 2DTYA 4YGCA 2WNEA 1DZQA 4UW3A 4K1KA 2OUHA 2HTQA 5GLVA 1JHNA 4AVVA 1QDOA 5T55A 1V6IA 1E8TA 4Y22A 4CPOA 1Z50A 4NN9A 1DQ2A 3ILRA 1WLCA 1LCLA 2DUOA 2F11A 4FVVA 1W21A 4FPYA 4M4NA 4YM0A 2TEPA 1USRA 2ZMKA 1L7FA 4FOYA 1C1FA 1MZ6A 5SV8A 2PHFA 1INHA 2XZKA 1J1TA 4YG0A 2BATA 4W65A 4XXAA 1KJLA 2YZ4A 5EWSA 5JYYA 2W52A 2ZBJA 1AJKA 4QN7A 2HTUA 3SISA 1CJPA 1V6LA 4GWMA 4JRAA 2G4IA 5T5OA 1VCUA 3SNMA 1BYHA 4BMEA 3AJZA 2ARBA 1RITA 4L8QA 3TI8A 2C5DA 1SCRA 3D5OA 4KS3A 1QNYA 2ZGUA 2SBAA 4MJVA 4H53A 1SLTA 1YXWA 1URXA 1N1VA 4MZEA 4WVWA 1UPSA 1F31A 2GNBA 4I30A 5KXEA 1KRIA 1GV9A 3BIWE 4MC7A 4Y1VA 2ZHMA 1GBGA 5DG1A 1UZYA 2QWAA 2QWJA 4WA3A 4Y1XA 3LSEA 2F26A 1ULGA 4ASMB 3H71A 1YIFA 4Y1YA 3N35A 2SILA 4FPEA 3BODA 1MR5A 4ISQA 2D6OX 3TI5A 5JVVA 3TICA 3R05A 1DQ1A 2VSMA 4GZQA 3T2TA 2F12A 2YDPA 2A71A 3M3CA 1V6MA 1XOEA 2GMEA 1BXHA 2D44A 2QWKA 2D6LX 1UMZA 2B8HA 1QOOA 4P14A 4CPNA 1U0AA 1W6OA 1C57A 4YZ2A 2R0HA 2XZJA 3H6JA 1GZ9A 1CR7A 1ENQA 1H9WA 1NLSA 1V00A 1VAVA 2ES3A 1RIRA 1UX6A 2WJSA 2CY6A 3ZSKA 3GNEA 3AZZA 2B7YA 2DVGA 2W39A 4GZSA 3WG3A 3HN1A 2ZACA 3AYAA 5KXCA 4XXPA 1NSCA 3L2YA 2D6KA 1S0BA 2YA6A 4FPKA 1GNZA 4DFSA 1LOGA 1FX5A 4Y1ZA 3VUOA 4XZPA 2NM1A 3ZXLA 1CQ9A 2CMLA 4YFZA 1QGLA 1G9CA 2EXIA 5T54A 4OZXA 1DBNA 3N7KA 4MWRA 5T5PA 1S0EA 3Q9OA 3JU4A 3WZ1A 2A6YA 2HTYA 4YM1A 2D6NA 4K1JA 1GZWA 4ITCA 5GZDA 1ENRA 1HKDA 2UWCA 1AX2A 2WSUA 4YFWA 5GALA 5CA6A 2C9AA 3NV4A 4M01A 1JYCA 1VLNA 4LBNA 3ZVXA 3NV3A 2NMOA 3WDUA 3SLIA 4FQ4A 1LU1A 2ZMLA 1KDMA 4K1HA 2VW0A 3I4IA 1NMCA 4R9CA 1A3KA 5JOXA 4XOGA 4YW2A 2YA5A 4CTEA 3POSA 2D3PA 4FOVA 3KM5A 3JU9A 1NN2A 2W38A 3ASIA 3R4UA 1ULCA 2W68A 1L7HA 4MX0A 3FLTA 1Z4VA 2HT8A 3B00A 3MEPA 1INWA 2R49A 3A71A 1IKQA 5JDBA 2EF6A 1CONA 4FPHA 4Q8KA 2W20A 4FOWA 5HUNA 5IK5A 4MWYA 2A6VA 2ZABA 3A0KA 1UN1A 1HLCA 2VW2A 1OFSA 3RMXA 4LBQB 1SACA 2PHUA 3PJQA 1INXA 4NO4A 2ZGQA 4NC5A 1NMAN 5E88A 1GANA 1BQPA 4AYUA 1IOAA 1VAMA 2HT7A 3DUIA 2QWCA 2EXJA 1A4GA 4K21A 4XDQA 2VVZA 4AGVA 1LEMA 5F5QA 2NZ9A 2R16A 2R1DA 3O0XA 1QOSA 3NV1A 1VALA 2D6PA 1LHWA 1FAYA 1JN2P 1V0EA 2C4LA 4BMBA 2UWAA 2YA8A 1SLAA 2FHRA 2OW4A 1F5FA 4M3MA 4PBOA 2D3RA 1GYKA 5HCFA 4XILA 3KQRA 3N7JA 3UJOA 4J9TA 5B2CA 1LOFC 1LTEA 4K1YA 4BPZA 1INFA 3POWA 1SLBA 1SLLA 1A14N 1NCAN 2WSVA 1V3CA 1SBEA 4B7RA 4XBNA 4QN3A 3O0VA 1NCDN 4BQ1A 4M4UA 3D12A 4FJ6A 1QOTA 5BYNA 2ZHLA 2YMZA 1IS3A 2ZGMA 4UW4A 2C4AA 4HZWA 5DZEA 3VV1A 1AX1A 3CYEA 3B01A 3A72A 1V0ZA 2ZGPA 1IVGA 3OYWB 2VY0A 1G86A 2UURA 2P37A 3M2MA 2A6XA 4LBQD 4WVVA 3INBA 2R1BA 4WZFA 4XJZA 3WUDA 4BM8A 4JCKA 3FUQA 1V3EA 3APBA 2GNMA 4YW3A 4UW6A 4FPOB 3RS6A 3CL0A 3K38A 1N1SA 1WW5A 5HUGA 1NNCA 2BERA 2D43A 4Q2FA 2F0ZA 2GN3A 1INGA 1AVBA 2DV9A 1LOEA 1E8UA 2DUPA 3SH3A 4GA9A 2CNAA 3B7EA 2DVAA 3NN9A 4K3YA 5GLUA 1JW6A 4B7NA 2A3XA 4R9AA 3WV6A 1G9AA 3BTAA 1JYIA 2A3WA 4YZ5A 3AZVA 1D0HA 3C2UA 3AYEA 5L73A 2VWDA 1Q8QA 4Q1RA 2V73A 5JOYA 1CIWA 4LBKA 4WA4A 2RKCA 3LCPA 2W5OA 2P3IA 1BZWA 1Z0HA 3ZXEA 1APNA 2QWDA 1W8OA 4MWUA 2CYFA 1S0IA 4LBJA 2P3JA 2WT0A 2QWFA 5LK5A 4CPYA 3N7LA 5DUUA 1ZA4A 1G9BA 1H9PA 4AVSA 1Y7BA 3D4KA 7NN9A 2X9MA 2EAKA 4BLJA 1I1EA 1KITA 3ZXFA 3IPVB 4XMAA 1EUTA 1F9KA 3FFZA 1Z4WA 1LU2A 4GEZA 4CPLA 3WCSA 5DZGA 1R1ZA 4D8SA 3NV2A 1AX0A 3N36A 1IVFA 2F10A 3A4UA 1UZZA 4GKYA 2JE9A 2AGSA 4HZVA 2PHXA 3PVOA 3PVNA 1LEDA 1IKPA 1V3DA 2QWHA 4UF7A 4BLIA 4XJWA 4SLIA 2OUJA 3H72A 4R9DA 4YM3A 1NCBN 3TIAA 3TIBA 5GJ6A 1WD4A 3AFKA 3ZYPA 1PZ7A 1N1YA 2A75A 2QWIA 1MVEA 4I00A 4HZYA 3MPPG 4ATEA 2ZGOA 4P9XA 2NN8A 3V64A 5IK8A 4XIKA 1BJQA 2PHTA 2XB6C 1WCQA 1S0GA 4MWLA 4Q8LA 5T52A 1AJOA 2A5ZA 1TEIA 1ENSA 5CNAA 2EIGA 1WCSA 4GZOA 1BJIA 3GVLA 2NMNA 1W0PA 3VKNA 3W59A 1JXNA 1NMBN 3IMNA 4HL0A 3O9KA 3WNXA 5T50A 4DRVA 5H9RA 4PQ9A 1AXYA 2JD4A 3RG0A 2CL2A 1S0CA 1MS0A 4XHBA 2A70A 2VW1A 1LECA 3T1EA 4GZWA 3FUOA 4YGBA 1VIWB 1DQ5A 5CB7A 5CBLA 1V6JA 3SITA 1EUUA 1SBDA 2ZHKA 4C1XA 3WHTA 1WLWA 2VH9A 1V2IA 1I3HA 2JDZA 4GXLA 3D11A 4LBQA 4Q27A 3OPZA 3WG4A 1ULDA 2EALA 3USUB 1MZ5A 3WDVA 3OY8B 3VKFC 2ZGTA 3M3OA 1EUSA 1Z78A 4KS2A 4LBMA 4FPLA 1IS4A 1MVQA 1GSLA 1LHUA 1N1TA 1S0FA 5EYXA 2I2SA 4F83A 3H0OA 2HTWA 5M1ZA 4HIZA 3O9JA 2F29A 1Q8VA 2ZAAA 2ZB5A 3SH5A 3AYDA 1DQ4A 5H9PA 1GLHA 4XBQA 2ZGSA 4LBOA 5IK4A 1YI7A 2D7FA 4CRQA 4P9YA 1G9DA 1YRZA 4B7QA 3AZWA 1INVA 3K39A 1CN1A 4Y20B 3WDWA 4QN4A 1GZCA 5JLVA 4XJ9A 1LOFA 3SILA 1FV3A 1N3OA 4YGDA 2XCYA 5EYYA 1W6NB 1N47A 3T1LA 1EURA 4H55A 3TI4A 3FBYA 4U36A 2QWEA 2W08A 3POYA 1HQLA 1S1AA 4GWNA 3WDTA 1NSBA 2E6VA 2KM2A 5HCBA 3OBRA 3OYWA 3AXEA 2ZGLA 3RSJA 1FNYA 3UK9A 2AREA 4MWWA 1Q56A 1V6OA 4XTPA 1GICA 1LENA 3WUCA 2XG3A 2DUQA 2PHRA 1CESA 2LALA 5JMCA 4GZXA 3V65A 1LOBA 4XYXA 3V0BB 4QN5A 5B2DA 5HX0A 2E7TA 1DHKB 5CAZA 5FREA 4DRRA 1Z4YA 4HANA 1LODA 2WT2A 4Q6KA 1E8VA 2CTVA 1S0DA 2JECA 4IQPA 4XJUA 1B9VA 1VCJA 4GKXA 3TB0A 1W0OA 4M3CB 5JOZA 1WUVA 1LHVA 3VKMA 1V0FA 3SH4A 2HTVA 4UW5A 3OJBA 2QWGA 4GDIA 1MS5A 1QNWA 4XTMA 3K3AA 1W6MB 4YGEA 1W6QB 4MWVA 2ZGNA 4R9BA 1DYKA 2AH2A 2ERFA 1LESA 4ATFA 1DQ6A 3OGGA 4DPNA 4GDJA 3W58A 3IM0A 1UL9A 4KBBA 1CPNA 4Y26A 1QKQA 1G7YA 4RA0A 4XIOA 4ZKTB 1AXZA 1WBFA 4BOWA 2YXSA 3ZXKA 2JJ6A 3RMYA 2A6WA 5GZCA 1QDCA 2VXRA 4Q26A 3WG1A 3SANA 4MWJA 1FATA 4XJAA 2DVBA 3R4SA 4XMIA 4GZPA 3RRDA 2ZKNA 3WHUA 3T1MA 2DVFA 1FV2A 1SCSA 4FZHA 1JUIA 2AUYA 3GVKA 3WLUA 3AP9A 5GZEA 5DUVA 2CWSA 1B09A 1PZ8A 3VKOA 1G9FA 1W6PB 4FVKA 2YY1A 5DG2A 1A8DA 3ZXJA 3GVJA 2GALA 3IPVA 1LOAA 1AXKA 2ZHNA 1AZDA 4ISRA 1WLDA 3V0AB 5EXOA 3JUUA 5HUKA 5DUWA 3AX4A 3ILNA 1OKQA 3N3HA 1ULEA 3AP7A 1W20A 1JOJA 2OVUA 1ONAA 1MS4A 1RINA 2LTNA 4U2AA 4CPZA 2P2KA 5IT6A 4TZDA 2DYCA 4QN6A 1C1LA 4JC1A 4M00A 5JOWA 3UL2A 3RQ0A 5GLZA 1DGLA 4CZSA 4YW5A 2ENRA 3INAA 1UAIA 4PBPA 3AP4A 3DGTA 4DGRA 3AZYA 4PF5A 1L7GA 2DTWA 4FPFA 5DUXA 2P34A 1LGBA 1F8DA 4H52A 3A0NA 2ZGKA 4MWXA 2VSKA 1F8EA 5HUMA 4FPJA 5H9QA 4K1IA 3O12A 4Z8BA 2WLQA 1PZ9A 1MS9A 2FMDA 2VK5A 2YA4A 4AGGA 4K20A 3ILFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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