2A75A

Trypanosoma rangeli sialidase in complex with 2,3- difluorosialic acid (covalent intermediate)
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
634
structure length
632
Chain Sequence
MASLAPGSSRVELFKRKNSTVPFEESNGTIRERVVHSFRIPTIVNVDGVMVAIADARYETSFDNSFIETAVKYSVDDGATWNTQIAIKNSRASSVSRVMDATVIVKGNKLYILVGSFNKTRNSWTQHRDGSDWEPLLVVGEVTKSAANGKTTATISWGKPVSLKPLFPAEFDGILTKEFIGGVGAAIVASNGNLVYPVQIADMGGRVFTKIMYSEDDGNTWKFAEGRSKFGCSEPAVLEWEGKLIINNRVDGNRRLVYESSDMGKTWVEALGTLSHVWTNSPTSNQQDCQSSFVAVTIEGKRVMLFTHPLNLKGRWMRDRLHLWMTDNQRIFDVGQISIGDENSGYSSVLYKDDKLYSLHEINTNDVYSLVFVRLIGELQLMKSVVRTWKEEDNHLASICTPVVPATPKGGCGAAVPTAGLVGFLSHSANGSVWEDVYRCVDANVANAERVPNGLKFNGVGGGAVWPVARQGQTRRYQFANYRFTLVATVTIDELPKGTSPLLGAGLEGPGDAKLLGLSYDKNRQWRPLYGAAPASPTGSWELHKKYHVVLTMADRQGSVYVDGQPLAGSGNTVVRGATLPDISHFYIGGPRSKGAPTDSRVTVTNVVLYNRRLNSSEIRTLFLSQDMIGTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural and Kinetic Analysis of Two Covalent Sialosyl-Enzyme Intermediates on Trypanosoma rangeli Sialidase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Trypanosoma rangeli
molecule keywords sialidase
total genus 181
structure length 632
sequence length 634
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2005-07-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2a75A02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 2a75A01
2D3RA 1INGA 5CB7A 4YW3A 2GMMA 1E8VA 1WD3A 4FPLA 4KS2A 1QOSA 2E53A 2EXKA 1UL9A 1CONA 5BYNA 1CPMA 5CNAA 1CN1A 7NN9A 4NCSA 2TEPA 3TAYA 4XTPA 2NN8A 1SFYA 1GZCA 4M4NA 2AEPA 2GMEA 1YO8A 4LBQD 4DQAA 2AR6A 3NV3A 4LBJA 5IK4A 2DU0A 5DG2A 4CTEA 1MS1A 2YY1A 4AVVA 2WLQA 3ZXFA 1ZM1A 1HKDA 5IK5A 4GXLA 2QWEA 4HL0A 4YZ4A 4XIOA 1NN2A 1AXYA 3WCSA 4WA4A 4AYUA 2P3KA 1DLLA 3BTAA 3FUQA 3SALA 3SLIA 2G4IA 2ZHNA 3M3OA 3ZXJA 3PVOA 2PHUA 2ZHKA 4Q6KA 1V0ZA 3AZXA 1Q8VA 1ENRA 1CJPA 1ZA4A 3WUCA 1JBCA 2UWAA 3GVJA 2OVUA 2HT8A 4MWVA 1S0EA 3UJOA 3AYCA 3RG0A 3HMYA 1MS9A 1PZ8A 4MWRA 3WVJA 3PJQA 2YA7A 3SILA 3Q9OA 1BQPA 1QF3A 4KS1A 4B7JA 5H9SA 3NV1A 2D3SA 4XHXA 2C5DA 1S0DA 1V00A 5IUQA 3RSJA 1J1TA 5E88A 4FPGA 2CNAA 1MS8A 2ZMNA 2CL2A 4MWJA 4MJUA 4LBQB 2WQZC 2ZGUA 4BOWA 2QWKA 3RQ0A 1W0OA 4J9TA 3AXDA 1INHA 4XBNA 5DUUA 1F5FA 2QWCA 4FJ6A 2A71A 4K20A 1BKZA 4YFWA 4CPYA 2HT5A 3UL2A 1DGLA 5GZFA 2C4LA 4FVKA 1F8BA 1JOJA 1DQ5A 5LK5A 2PHFA 3IKWA 5M1ZA 2W5NA 1AJKA 1GNZA 2R1BA 4WVWA 3AP9A 1S0FA 1NCBN 3ZYPA 1Z78A 1LHUA 1MZ6A 1W6QB 3C2UA 1NNAA 1G9FA 2B7YA 3WDTA 4F83A 2W38A 3MEPA 3NN9A 4FPYA 3D11A 1WLDA 3SITA 5GZGA 1WBFA 4K1HA 3H0OA 1GANA 3W59A 2HTUA 5JOWA 1Z4YA 3VKLA 5JVVA 1VCJA 2WT0A 5E8AA 3WDYA 4GZTA 1YXWA 1C4RA 1LJ7A 4YW4A 2DVFA 3FBYA 3WV6A 4FOQA 3WG3A 2CWMA 1MR5A 2W68A 2XZKA 4XJAA 2GNTA 2A6WA 1LU1A 3ILRA 5IK8A 4I30A 1QDOA 2HTRA 3H6JA 4M4VA 4M00A 1BJQA 2A3YA 1NCAN 4H53A 4M3CF 1EURA 4XXAA 4LBMA 1NSCA 3I8TA 4YW5A 3WHUA 4BMBA 5HUMA 4MYEA 2Q5TA 5DUWA 5KXEA 3WDUA 3N7JA 4QN3A 3OJBA 4GA9A 3D6EA 2ZB6A 3A4UA 1G9DA 4XXPA 4AWDA 3OYWB 1NMCA 2HTYA 4XJWA 1Q56A 2VXRA 1JUIA 4RL7A 1SBDA 4X47A 3AJZA 2WKKA 1F9KA 2QWIA 2SILA 5NN9A 1WW4A 4XBLA 1SO7A 1NCDN 2CTVA 1LOFA 2ZGTA 1W20A 3K3AA 2D6PA 3AP6A 4Q8LA 2EXIA 4MWXA 3SANA 4HZVA 1CQ9A 4R9BA 5AVAA 1TEIA 3WG4A 2ZMKA 1E8UA 5DZEA 1W8OA 4M3MA 2JE9A 1GYKA 1WBLA 3AZWA 3VKFC 2JD4A 4K21A 1L7FA 1LCLA 2LTNA 3DUIA 1C1FA 1Q8SA 4XMAA 1NMAN 1NCCN 1WCQA 3SH5A 2VW2A 3N3HA 1SBEA 5T55A 3T1MA 3INAA 3FLTA 3AX4A 4Q1RA 1UMZA 1Z4WA 2Z42A 2WSUA 3B00A 5HUNA 3A0NA 4PBOA 2YV8A 4PQ9A 2D6LX 3ZSMA 3ZPYA 3V0BB 4XTMA 4DGRA 4WEGA 1ENSA 5DZGA 1DHKB 1QKQA 3H73A 1F8EA 3PVNA 3AYEA 3O0VA 2WT1A 3AZVA 4YG0A 5CA6A 4YM2A 5F9TA 4B7RA 1X50A 3SNMA 4K1YA 4I00A 4QN7A 1GZWA 1PZ9A 2EIGA 3D12A 3OBRA 1Z50A 4GWMA 2AUYA 1L7HA 1V6LA 2NZ9A 2ZB5A 4Y24A 4JRAA 3ALXA 2ZAAA 4H55A 4XOGA 1N1YA 1NSBA 5HCAA 3ZXLA 5GLUA 1N3QA 1LOGA 4LBQA 4BLJA 3IM0A 4M3CE 3WG2A 1S0CA 1WLCA 1F31A 1KJLA 1QMJA 1VCUA 2ZA9A 1WW7A 2UU8A 4NOTA 4C1XA 1SACA 3ZYRA 3WNXA 1LEDA 5H9RA 2CWSA 2F0ZA 3INBA 1LGBA 3KQRA 4YZ3A 5JLVA 3OY8A 1HLCA 3JU9A 1W6PA 4BM8A 4HANA 2NM1A 2ERFA 2SBAA 2W52A 1A8DA 3HN1A 1DILA 4GB1A 2ZMLA 2C9AA 3WZ1A 2VU9A 4R9AA 5JDBA 3W58A 1LHNA 5GLWA 4BQ1A 5T5JA 3JUUA 2P34A 5HX0A 1UAIA 1LENA 1EUUA 1ULDA 2YDPA 4U2AA 3M3EA 3WUDA 4MC7A 2XB6C 1FX5A 3K37A 3GNEA 2AYHA 4XILA 1IVBA 1G9BA 1CPNA 4B7NA 1F8DA 1V6MA 1KITA 3LSDA 3VKOA 4R9DA 2R1DA 2ZGRA 3ATGA 1KRIA 3JU4A 2EF6A 2VK7A 1OFSA 1OQ1A 3AP5A 1YYNA 4K1KA 2GDFA 2AH2A 3VV1A 4DRVA 5JOXA 4WZFA 2DVBA 2JE7A 3D5OA 1Q8QA 1A4GA 2OUJA 2ZGNA 2ES3A 3UJQA 2ZHLA 3POYA 3IPVB 4GJTA 2JECA 4LBNA 4Z8BA 4AVTA 3ZXEA 4UW3A 4FZHA 2UWCA 4CZSA 1B9TA 3IMNA 2D7FA 4Q27A 1LGNA 2P3JA 3ZXKA 3OYWA 4UW4A 1V6IA 1LOFC 1D2SA 4DPNA 2PHTA 1ONAA 4LBKA 4MWUA 2JJ6A 2ZABA 1V3EA 4FP2A 1DQ4A 1GICA 1GZWB 1WUVA 4L8QA 3ILFA 3GVKA 3O5SA 4GDJA 4QN6A 3MPPG 1V0EA 4GWNA 4Y1YA 5DUXA 1VAMA 4KBBA 3B7EA 3BIWE 1RIRA 2DUOA 5KXBA 2GALA 2YROA 4CPZA 2A7AA 2LALA 5KXCA 4NC5A 4B7QA 2DTWA 1MWEA 1OKQA 4Y1VA 5IK7A 1NLSA 2DU1A 5GZDA 1EPWA 4FPKA 2YA4A 4K1JA 3AJYA 3CL0A 4M3CB 2GN3A 2ARBA 2HU4A 1V6OA 1DBNA 2I2SA 5EYXA 2QWAA 3WDWA 2WT2A 3OY8B 2DVDA 1W6PB 1V6KA 3V0BA 3SH4A 4CPLA 1RINA 3WDXA 2YA8A 3ZSLA 1AX0A 2VW1A 2DVAA 2F29A 4FOVA 5DG1A 1KDKA 1H9WA 4RA0A 1ULEA 2C4AA 1QNWA 4XE9A 3V0AA 3OBTA 1Q8PA 2XZIA 1SLCA 3AZYA 3U4XA 3I4IA 3R4SA 4XJRA 3CL2A 4GZQA 4YLZA 3N7KA 4M01A 1Q8OA 2D6KA 4FP3A 3AYAA 3TI8A 2A6VA 4YFZA 4XYXA 1A3KA 3ASIA 2JDZA 4ATFA 1V6JA 2E51A 5E89A 3W09A 4X6KA 5DUVA 5HCBA 4BBWA 2HTVA 4XJZA 4AGGA 5T54A 2D3PA 2W08A 2RHPA 4WV8A 3WLUA 2A70A 3POSA 4FPFA 4AGRA 4YW1A 1LESA 4B7MA 2JKBA 1Z4XA 4QN4A 1GLHA 1IVDA 2F11A 2P2KA 4GKXA 4YGDA 2GNMA 4Q2FA 3ILNA 2DTYA 1G9AA 4Y1ZA 1JHNA 1QOOA 4DS0A 4WA3A 1UKGA 1N3OA 1INXA 4HZYA 3V64A 1DIMA 2A5ZA 1KDMA 4P9XA 2GN7A 3BEQA 3BOPA 2PHXA 4W65A 2E7TA 4JC1A 1IOAA 1FATA 5EYYA 4UW6A 2BQPA 2DYCA 1S0IA 3H71A 4KS4A 3TIBA 2VSKA 2YA6A 4GKYA 3O0XA 3AP7A 4P9YA 2ZGLA 4ZKTB 2PELA 1LGCA 1AXKA 1JW6A 1IS3A 3B3QE 1PZ7A 4FPEA 1LEMA 2VY0A 1G9CA 2A75A 5T50A 4GZWA 3RRDA 3T2TA 6NN9A 1LOAA 1AJOA 5L73A 1NXD1 3IPVA 4M4UA 2AREA 3FLPA 3N7MA 4YW2A 1INYA 2F10A 1SLTA 1INWA 1YRZA 4LBLA 1W6MB 1AVBA 2E7QA 4FQZA 1A14N 2ZKNA 1D0HA 1JYCA 3HR9A 3WCRA 3V65A 3V0AB 4CPMA 4SLIA 1B09A 4H52A 3POWA 4ISRA 1DYKA 2ENRA 1FV3A 1CVNA 1G8WA 3FUOA 5JOZA 2P37A 1S1AA 5KXDA 1N1SA 1BZWA 1GKBA 1MVEA 2UURA 3AP4A 4YM1A 4MX0A 3TB0A 1N47A 1V0FA 4Y26A 3N7LA 4YGBA 1ULCA 1VALA 3UK9A 1I1EA 1W6OB 1DZQA 2HYKA 1O4ZA 5GZEA 1EUTA 5DXDA 2BERA 1MS3A 1ULGA 4FPOB 2YMZA 5GM0A 2VWDA 1IS5A 1CR7A 4P9WA 5SV8A 2HTQA 4KS5A 2XZJA 2ZGQA 1SLLA 1FNYA 2QWDA 4XJUA 2DURA 1BXHA 4YZ2A 1S0GA 3M2MA 3AZZA 2R49A 1LOEA 3FLRA 1N3PA 3MW2A 2F27A 2DUQA 4JCKA 2VUAA 1ENQA 1B9VA 4YM0A 4XJ8A 4M3CA 2ARXA 2A3XA 2EALA 4K1ZA 4GALA 5CBLA 4GEZA 5HUKA 2D43A 2YZ4A 4FOWA 4YGCA 1CESA 1VLNA 3A0KA 1MACA 2SLIA 4CPNA 1JXNA 2D6MA 4GZOA 1H30A 1LU2A 2A6YA 1SCRA 1V3DA 1DQ6A 1IKQA 2VW0A 3CKZA 2EXHA 4FPCA 4X4AA 4XIKA 4DRRA 4GZXA 5FREA 1S0JA 1WCSA 4HZZA 1UX6A 1MS0A 2ZACA 1UN1A 1NMBN 4PBPA 5GLZA 5T5OA 2AENA 2R0FA 2H0BA 4Y20A 4Y1XA 4GDIA 1A4QA 3M1HA 5IT6A 2DVGA 3VKMA 4MWYA 2CYFA 3T1EA 2P3IA 2AGSA 3K38A 1HQLA 4MJVA 2ZGSA 3USUA 2PHWA 2NP0A 1LULA 4YG6A 3RMXA 3B9CA 5F5QA 1AXZA 2F12A 1Y7BA 4MWWA 2QWBA 2DWRA 4BMEA 4TYSA 3R4UA 2WSVA 1G7YA 4XZPA 2A3WA 1SLIA 1KQRA 3O9JA 3LSEA 2XG3A 1IVCA 3RS6A 2GNBA 1UZYA 2UWBA 2ZGPA 1DQ2A 3KM5A 2V5YA 4YZ1A 1C57A 3WHTA 1F8CA 4P14A 4YM3A 3WG1A 3A71A 2YA5A 4GZPA 3IN9A 1LECA 2E6VA 1QGLA 4PCRA 1Z0HA 1YI7A 3TI5A 1LODA 2X9MA 1R1ZA 1LHVA 1WW5A 3VKNA 3AXEA 4FQ4A 1U0AA 1JN2P 1FNZA 5GALA 1DQ1A 3TIAA 1NNBA 4YGEA 3NSSA 1H9PA 1GV9A 4AVSA 5B2DA 1GSLA 4PF5A 3MW4A 4BPZA 1UZZA 3M3QA 4XJ9A 3H72A 1QNYA 1QU0A 1IS6A 1Z4ZA 4QNPA 1W6NA 1UPSA 2D44A 1XQNA 1N1VA 4Q8KA 2AEQA 5T52A 2BF6A 4GZSA 2QWGA 2DUPA 5EWSA 1APNA 2WJSA 2ZGMA 1W6MA 3N36A 4DFSA 2EXJA 4OZXA 4D69A 2QWJA 2GMPA 3D4KA 2F26A 4LBOA 1LTEA 3TI3A 3NWKA 2W5OA 1SLAA 5GJ6A 1EUSA 2F28A 3APBA 4Y22B 2QWHA 3GVLA 4ISQA 4NO4A 5T5LA 2D6OX 1V6NA 1IVFA 3ZSKA 3AK0A 2HTWA 4JF7A 5JMCA 5CAZA 1W0PA 4FPHA 2F25A 4CRQA 1AX1A 5JYYA 4Y20B 1ULFA 1DFQA 4Q1PA 3TI6A 1W6OA 4YZ5A 4D8SA 4FVVA 5H9QA 1LOCA 2B8HA 2A6ZA 1FYUA 3PMEA 3ZSJA 3USUB 2R16A 1C1LA 2VSMA 1VAVA 3WOGA 4HIZA 2NYYA 4BLIA 3K39A 1DQ0A 3NV2A 3ZVXA 4XJQA 1N1TA 1XOGA 1S0BA 3TI4A 1MVQA 3L2YA 3ALWA 3VUOA 2KM2A 1GZ9A 1IKPA 3B69A 2NMOA 1SNTA 2DV9A 3BODA 1MS4A 1SCSA 3QLQA 4TZDA 4NN9A 5GZCA 4XMIA 1USXA 1FAYA 4CPOA 5H9PA 1QOTA 1YIFA 3R05A 1IVEA 2D6NA 2A6XA 1LHOA 1A78A 4QN5A 2YXSA 3WDVA 1QDCA 3LCPA 4WVVA 1G86A 4K3YA 1Z4VA 3CNAA 1LHWA 2VK6A 3O12A 4KS3A 1GBGA 2YDTA 1FV2A 3SH3A 5HUGA 3RMYA 1USRA 3M3CA 4ITCA 4FPJA 2XCYA 3B01A 4ZXKA 4WA5A 4FOYA 1V3CA 4YG3A 2WNEA 1W6NB 4UW5A 4XDQA 1INFA 4XBQA 3OGGA 4Y1UA 2QWFA 2W20A 2W39A 1V2IA 2ZGOA 1O4YA 2GNDA 5FRAA 1NSDA 1SBFA 4R9CA 2EAKA 2OUHA 3AYDA 3N35A 1URXA 1V3BA 2ZZJA 4MWQA 5B2CA 2VK5A 5DZFA 3ENRA 2F24A 3NV4A 1E8TA 5JOYA 1HDKA 3PVEA 5GLTA 5T5PA 1W8NA 4XHBA 4ATEA 4UF7A 2VH9A 1AX2A 2ZBJA 1BYHA 3QCWA 1XOEA 1I3HA 3SISA 1AF9A 1VIWB 1MZ5A 2BZDA 3OPZA 2ZGKA 5GLVA 1L7GA 1WLWA 4IQPA 5EXOA 2FHRA 1IVGA 3A72A 1DIWA 2SIMA 2BATA 4AGVA 4MZEA 2HT7A 4ASMB 1LOBA 1GNHA 4MWLA 1CIWA 2FMDA 1HQWA 4MZAA 3DGTA 2V73A 1WD4A 4Q26A 1MS5A 4K1IA 1BJIA 3T1LA 4HZWA 1WW6A 4X49A 3O9KA 1JYIA 5HCFA 2VVZA 1SLBA 3MW3A 2ZHMA 2CY6A 2R0HA 2RKCA 1IS4A 1W21A 3GALA 4U36A 1INVA 4Y22A 1AZDA 3K36A 4HZXA 3FFZA 1W1XA 1B9SA 2OW4A 3TICA 2HU0A 1W6QA 1KJRA 3AFKA 2F13A 4C1WA 2CMLA 1RITA 3CYEA 1DYPA 4WEFA 2NMNA 2PHRA 3O0WA 1NNCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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