2AH2A

Trypanosoma cruzi trans-sialidase in complex with 2,3-difluorosialic acid (covalent intermediate)
Total Genus 188
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
188
sequence length
633
structure length
624
Chain Sequence
LAPGSSRVELFKRQSSKVPFEKDGKVTERVVHSFRLPALVNVDGVMVAIADARYETSFDNSLIDTVAKYSVDDGETWETQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYVLVGSYNSSRSYWTSHGDARDWDILLAVGEVTKSTAGGKITASIKWGSPVSLKEFFPAEMEGMHTNQFLGGAGVAIVASNGNLVYPVQVTNKKKQVFSKIFYSEDEGKTWKFGKGRSAFGCSEPVALEWEGKLIINTRVDYRRRLVYESSDMGNTWLEAVGTLSRVWGPSPKSNQPGSQSSFTAVTIEGMRVMLFTHPLNFKGRWLRDRLNLWLTDNQRIYNVGQVSIGDENSAYSSVLYKDDKLYCLHEINSNEVYSLVFARLVGELRIIKSVLQSWKNWDSHLSSICTPAGCGPAVTTVGLVGFLSHSATKTEWEDAYRCVNASTANAERVPNGLKFAGVGGGALWPVSQQGQNQRYHFANHAFTLVASVTIHEVPKGASPLLGASLDSSGGKKLLGLSYDKRHQWQPIYGSTPVTPTGSWEMGKRYHVVLTMANKIGSVYIDGEPLEGSGQTVVPDERTPDISHFYVGGYKRSGMPTDSRVTVNNVLLYNRQLNAEEIRTLFLSQDLIGTEAHM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural Insights into the Catalytic Mechanism of Trypanosoma cruzi trans-Sialidase
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Trypanosoma cruzi
molecule keywords trans-sialidase
total genus 188
structure length 624
sequence length 633
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2005-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2ah2A02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 2ah2A01
4KBBA 1QDCA 5T5LA 1USXA 1IVEA 2YDTA 3OPZA 3USUA 5CBLA 4F83A 1C1FA 1W6MB 1LGNA 4LBLA 1WLCA 4RA0A 3ALWA 2HT7A 2C5DA 4HZYA 5JLVA 1QGLA 5T54A 3POSA 3V65A 3AP9A 4XJ9A 4FPFA 4M3CA 4GEZA 3TI8A 1KJRA 4BOWA 2F0ZA 3LCPA 3O9KA 2JE7A 3AXEA 1GZWA 2PHXA 2WT0A 1V3EA 1WD3A 1LHUA 1IVDA 1WUVA 2R0HA 4LBQA 1V0EA 1QMJA 3B3QE 3O0XA 4FPCA 4BQ1A 1W6OB 3TI6A 1W20A 2HYKA 4YZ4A 4I30A 2ZB6A 2YROA 2ENRA 1AJKA 2WLQA 2D3PA 3B01A 1VALA 1IS5A 4YG3A 2NMNA 4OZXA 1S1AA 2WT2A 3PJQA 1RINA 3CYEA 1LTEA 2PHUA 1MACA 2QWJA 1MS8A 3QLQA 3VKMA 1LOFC 3U4XA 3UK9A 3WDYA 1KDMA 3AZVA 2F24A 4XJZA 2HTRA 1BJIA 1FX5A 5GLVA 1EUUA 1V3CA 1APNA 1SLBA 4GXLA 1SBDA 1GZCA 3TI5A 1HDKA 1IVGA 4NO4A 1GV9A 2D6PA 3T2TA 2W08A 1F8BA 3W09A 2DURA 4WV8A 2ZMKA 4L8QA 1UN1A 4DRRA 2DU1A 1QOSA 2ZGQA 3INBA 4JC1A 2ZGNA 4H52A 2ZA9A 4UW3A 3RG0A 4CPZA 3WCSA 1W6PA 2BERA 4QN5A 3ENRA 1G9DA 1DQ2A 2YA4A 2BF6A 3N35A 5M1ZA 3WNXA 3ZYPA 4K1IA 1DYKA 3VKOA 1NMAN 1C4RA 1LCLA 2ZGSA 3VV1A 2G4IA 1AF9A 2D44A 3A72A 4GZQA 4B7RA 2Q5TA 4XJ8A 4C1WA 2ZACA 4GJTA 3JU9A 3WDVA 3M3OA 1V3BA 1LECA 2W52A 1LOBA 1IVFA 2ZB5A 3TAYA 3Q9OA 1NCBN 2QWKA 2P3JA 1LJ7A 4PF5A 5IT6A 4WVVA 4Y24A 4P14A 1W21A 1LEMA 2PHFA 1Z4ZA 5KXBA 1DBNA 3PVEA 1AXKA 5B2DA 1UAIA 4FPKA 2BATA 5CNAA 4C1XA 3GVLA 2PHTA 3V0BA 2E7TA 3T1MA 4BM8A 2QWFA 3V0AA 4Q8KA 1MVEA 3CKZA 4MWUA 1FYUA 1CIWA 5JOXA 1J1TA 3PMEA 5HUNA 4MYEA 2ZHMA 2CMLA 1SLIA 2YA8A 1BQPA 2AEQA 4ZKTB 3B9CA 2XZIA 3R4SA 3H0OA 1G9BA 3D5OA 4ATEA 1H9WA 2PELA 3WG4A 3FFZA 1DIWA 1GNHA 4MWJA 1E8UA 2WSUA 3W59A 3ALXA 1BZWA 2A6YA 4TZDA 2A71A 5AVAA 1MR5A 1MS4A 4WA3A 5EWSA 3H6JA 2VXRA 3FLRA 2XCYA 1SLLA 3MW2A 3FUOA 1I1EA 1FNYA 2DVBA 4HZXA 2DYCA 2DVAA 4XIOA 3AJZA 1NMBN 2SLIA 1INWA 4NC5A 1LU2A 1H9PA 1LOGA 5CAZA 3T1EA 3PVOA 2LALA 2QWDA 3HN1A 4Q6KA 1S0JA 3IN9A 4WEGA 1W6MA 4PCRA 4AGRA 2YA7A 5T5PA 4Y26A 4FP2A 3WDXA 4FVVA 4KS2A 2H0BA 1NNAA 2DUPA 1XOEA 1DQ4A 1USRA 1O4YA 3LSDA 2D6NA 2VUAA 2F13A 3O9JA 2FHRA 2R1BA 3WG3A 4WA5A 1Z78A 1NCAN 1V6JA 2BQPA 1SBFA 3N36A 1AVBA 2P34A 4RL7A 1SCSA 2NZ9A 1WW7A 2HTQA 5E89A 1W6QB 4GZTA 1JHNA 2D6OX 3A0NA 2DVFA 1XQNA 1W6OA 4XBQA 2F10A 4AYUA 4AVTA 5IK8A 5KXDA 1GYKA 2EXIA 2XZKA 4GB1A 1SLCA 2DVDA 3WDWA 4KS5A 1ENSA 4CPNA 1ONAA 1Y7BA 3HR9A 1HQWA 4YZ3A 4CZSA 4XILA 2VW0A 4WVWA 4MWVA 1SLAA 1B9SA 1SLTA 1NMCA 3ILRA 1MZ6A 1NNBA 4GDIA 5DG1A 3WG1A 1CN1A 2VVZA 3GVKA 1WD4A 4YG0A 6NN9A 3TB0A 3D4KA 2V73A 2GMEA 4X6KA 2ZGRA 1VLNA 1ULDA 4CPMA 2ARXA 2C9AA 2EAKA 2AENA 1BYHA 1JXNA 1V6NA 1S0GA 3CL0A 1VAVA 4FPGA 2W38A 4YW3A 3ILNA 2X9MA 1MVQA 2YZ4A 4BMBA 4P9WA 4XJQA 2WT1A 1W0PA 1C57A 5DUUA 3O0WA 2NYYA 3D11A 2AEPA 2AGSA 2LTNA 3V64A 4P9XA 3OGGA 4JRAA 2JDZA 3ASIA 5SV8A 5KXCA 1LOEA 3VUOA 1DQ1A 1AJOA 2ZMLA 4TYSA 2WJSA 3SILA 2F26A 3M3QA 1MS9A 3SALA 3AJYA 4ISRA 5H9QA 1R1ZA 2YDPA 4Q26A 4BBWA 1MS1A 2RKCA 4XDQA 1V0FA 4XYXA 3WDTA 1ZM1A 1INXA 4FPHA 2HTVA 1CONA 4FP3A 3MPPG 1NNCA 1UL9A 1FNZA 3R05A 4BLIA 2ZHNA 1Z4YA 2F29A 4YM1A 2CNAA 1UZYA 3AP6A 1WLWA 4KS4A 2AREA 2P2KA 4R9DA 4CPOA 4MWLA 4JCKA 4B7NA 3AZXA 4XTPA 1VAMA 1Q8SA 1L7FA 5FRAA 5CB7A 1BXHA 4LBMA 4Q1PA 3SH5A 1OQ1A 3ATGA 4K1ZA 1V6KA 2A6VA 1N1VA 2ZMNA 2QWBA 5GZCA 4Q27A 4X49A 1KJLA 1KITA 1AX0A 4LBJA 1OKQA 3D6EA 3ZYRA 3OJBA 1W0OA 3ZXEA 1RIRA 2ZGOA 2QWAA 4PBPA 4HIZA 4MX0A 2R0FA 1AX2A 1NCCN 3RSJA 1IOAA 2P3IA 2VY0A 4WEFA 3PVNA 3VKFC 1KRIA 2HTWA 4FOVA 3VKLA 1LENA 2OVUA 5T52A 3ZPYA 5JOWA 1WCQA 2YY1A 2E6VA 5JOYA 1QOOA 4BMEA 5DXDA 4PBOA 1LESA 3R4UA 2ZGUA 1MS5A 4FZHA 3NV4A 5E8AA 5DZGA 2ZABA 3WVJA 1SCRA 1W8OA 1BKZA 1PZ8A 5DZFA 3APBA 4XJWA 1LOFA 1H30A 2CY6A 3FLPA 2CWMA 1EPWA 3WHUA 1JN2P 1QOTA 3H71A 4K1KA 3B7EA 4GWNA 4Y20B 3WV6A 1QU0A 2W39A 1MZ5A 2ERFA 2DUQA 5F9TA 2PHRA 2VSMA 4M3CE 1ENQA 2V5YA 3M3CA 5EYXA 4YW2A 5GLTA 1B9TA 5HX0A 3OY8A 3TICA 3INAA 5JYYA 3K38A 5JVVA 1ULGA 2BZDA 1W6QA 1A4QA 2A3YA 2Z42A 1V6LA 3OBRA 1HLCA 1LU1A 1PZ9A 4YW5A 1LHVA 4GKXA 3ZSJA 1CPMA 1JOJA 1B09A 1JYIA 1WLDA 1MWEA 4BLJA 1G8WA 1Q56A 4YGBA 4GZOA 4I00A 4K1JA 2SILA 4JF7A 1F8CA 1KDKA 2UU8A 2YV8A 5GLWA 1I3HA 1BJQA 3AX4A 4D8SA 4YFWA 1INVA 1Q8OA 4H55A 2NN8A 1Z50A 4CTEA 1WCSA 4MJVA 3FUQA 5GZEA 2ZAAA 4XTMA 4UW4A 4K20A 3B69A 2HU0A 4U2AA 1GICA 1W1XA 1JUIA 1NSCA 2A75A 3B00A 1LULA 1C1LA 2E51A 2HTYA 3UL2A 1F31A 1W8NA 2QWIA 4X47A 4CPYA 1YXWA 2CTVA 2NP0A 1OFSA 2GNBA 1GBGA 2UWCA 4XXAA 4KS1A 1ULFA 2GDFA 1F8EA 1SBEA 4FPLA 5DG2A 2VWDA 1FATA 2UURA 2HT5A 4YG6A 4GZSA 2JKBA 2ZGKA 4HZVA 4QN6A 5GLZA 3SANA 2EXKA 2GN3A 3NN9A 5CA6A 3RRDA 1D2SA 3VKNA 5HUGA 2PHWA 2A7AA 3ZXJA 1GANA 1A14N 2D6MA 1Z0HA 3RMXA 2AUYA 3RMYA 3C2UA 5F5QA 3SITA 3ZXFA 5NN9A 1DFQA 3AZYA 1S0EA 4Z8BA 3RQ0A 4QN3A 4HANA 1ENRA 4YZ2A 3SISA 4PQ9A 1NCDN 1DZQA 4MWQA 3TIBA 2ZBJA 3ZSLA 1YO8A 2YMZA 1DQ6A 2XZJA 3NV3A 1VIWB 1SACA 2CL2A 1ULEA 2GNMA 2AR6A 1IKQA 4B7MA 3V0AB 4XXPA 2QWHA 2DV9A 4Y1ZA 3ILFA 1AXYA 1NN2A 3POYA 4R9AA 3CNAA 2AH2A 4YM2A 4GDJA 3BODA 2D3RA 3AP5A 5HCFA 4QN4A 4ITCA 5HCAA 5IK4A 4XBLA 2GNDA 4Y22B 3AP4A 5T5OA 1WW6A 4Q1RA 4XBNA 3TI3A 2YA5A 2OUHA 4FVKA 1MS0A 3WLUA 2W20A 3GALA 3AP7A 1O4ZA 1N1TA 2DUOA 3AYAA 4XHXA 1LHNA 4Q2FA 4K21A 5T5JA 3K3AA 1RITA 1G9AA 3AXDA 3WUDA 3N7MA 3ZSKA 2SBAA 2VW2A 2NM1A 4MC7A 5FREA 2A6ZA 2F25A 4B7JA 2R1DA 2RHPA 4FOWA 1IS4A 2WKKA 1WW4A 2WSVA 1SO7A 2QWCA 1N1YA 4XZPA 2C4LA 1LOCA 4LBOA 2ZZJA 4K3YA 1VCUA 2DU0A 1DYPA 3ZVXA 5GZGA 2P3KA 1A3KA 1CJPA 4MJUA 2W68A 2A70A 1CPNA 4XIKA 4Y20A 3ZXKA 2F27A 1V0ZA 3T1LA 3AYDA 4YM0A 1LHWA 1QKQA 4J9TA 1IVCA 1INGA 3WDUA 3MEPA 4YGCA 2DWRA 3WHTA 1D0HA 2OW4A 5GALA 5E88A 2EF6A 2I2SA 2W5NA 5DZEA 1V2IA 4XMAA 1E8VA 5GLUA 4LBQD 1LGCA 3NSSA 2JD4A 5T55A 5H9SA 1V6MA 2OUJA 4D69A 1G9CA 4QN7A 2ZKNA 4FPJA 3NV1A 4FQZA 1UMZA 1S0BA 2E53A 4AVSA 3N7LA 1GSLA 2JJ6A 5DUVA 4DGRA 1KQRA 1JW6A 2A3WA 4U36A 2GMPA 3W58A 1JYCA 4M4UA 1W6NB 3IKWA 1UX6A 4FPYA 4R9BA 3IPVB 2QWEA 3CL2A 1V6OA 3H72A 3IMNA 2TEPA 1S0CA 1F5FA 4HZZA 5BYNA 2GMMA 3OYWB 1E8TA 2NMOA 4GZPA 4DPNA 1LODA 5EXOA 5DUXA 2EIGA 1UKGA 2ZHLA 5JOZA 1XOGA 2A3XA 1NSBA 1TEIA 3BOPA 2YXSA 1LOAA 3SLIA 3POWA 4YW1A 4Y1UA 4MZEA 1QNWA 3KM5A 2ZHKA 1HQLA 3SNMA 2DVGA 1Z4WA 3AYCA 4YM3A 4XJAA 5HUKA 1Q8VA 1A8DA 1Z4VA 2B8HA 3O0VA 5HUMA 3A71A 4QNPA 1FV2A 1HKDA 1ULCA 1GNZA 3USUB 3BEQA 4CPLA 1IKPA 4UW6A 5IK7A 4HZWA 2EXJA 2F12A 2D7FA 2F11A 4LBNA 1G7YA 4UF7A 3GVJA 2D6KA 4M3CB 4NN9A 2FMDA 2C4AA 2WQZC 2CWSA 1DHKB 3I4IA 1N3QA 1SNTA 1NXD1 1N47A 3WCRA 2XB6C 5GZDA 1Z4XA 1V00A 5JDBA 1GZWB 4M4VA 3BIWE 5T50A 2HTUA 1AXZA 4DQAA 1FV3A 3DUIA 4LBQB 3N7JA 3KQRA 2GNTA 3M1HA 5GJ6A 3DGTA 5LK5A 4XOGA 4FPOB 3N7KA 5HCBA 1DLLA 1LGBA 1G9FA 1WBFA 4FPEA 2D6LX 1B9VA 3SH4A 1X50A 4XE9A 1YI7A 2F28A 1A78A 4Y1VA 1URXA 2VSKA 2P37A 3K37A 1CR7A 4DRVA 1GKBA 4B7QA 3UJOA 1JBCA 4Q8LA 3I8TA 1CVNA 3OBTA 5KXEA 4Y1XA 4MWWA 4MWXA 1DILA 5IK5A 3WOGA 1PZ7A 2QWGA 3AZWA 1LHOA 2ZGTA 2VK6A 4Y22A 4KS3A 2UWBA 5L73A 3NWKA 1DGLA 4MWYA 3TIAA 2ZGPA 4GZXA 3A4UA 2YA6A 1N3PA 4XJUA 3AK0A 1DQ0A 4AGVA 2VU9A 1UPSA 5IUQA 2ES3A 2DTWA 3A0KA 1AX1A 5GM0A 4M01A 4ATFA 2JECA 3HMYA 1DQ5A 2DTYA 2GN7A 2SIMA 4BPZA 1CQ9A 1L7HA 4M3CF 3QCWA 5H9PA 1ZA4A 3WUCA 4MZAA 2A6XA 3NV2A 4GA9A 2JE9A 4UW5A 1CESA 4FJ6A 4GZWA 1N3OA 1W6PB 3AFKA 3UJQA 2VW1A 2HT8A 4ZXKA 3JUUA 3WZ1A 1EUTA 3WG2A 2E7QA 2VK7A 4YW4A 4YLZA 4Y1YA 4AVVA 1EUSA 4FQ4A 4XHBA 1S0DA 2AYHA 4P9YA 1INYA 1QF3A 2D43A 4DS0A 1VCJA 3LSEA 2XG3A 2WNEA 1YRZA 3TI4A 1S0IA 4AWDA 3RS6A 4XJRA 3N3HA 1V3DA 3M3EA 3SH3A 4ISQA 3AZZA 2KM2A 3K36A 1F9KA 4K1YA 3FLTA 2GALA 5B2CA 4YGEA 2R49A 1QDOA 4M00A 3D12A 1GZ9A 3O12A 1EURA 4YZ1A 4LBKA 3OY8B 2B7YA 4M4NA 3IM0A 4SLIA 1FAYA 5DUWA 5EYYA 1G86A 2VK5A 4GWMA 2ZGMA 3V0BB 1F8DA 3GNEA 3H73A 1NSDA 1WW5A 1QNYA 4CRQA 2ARBA 3AYEA 2ZGLA 4WZFA 2UWAA 7NN9A 4DFSA 1INHA 4FOYA 1A4GA 4GKYA 2HU4A 1W6NA 2A6WA 1IVBA 2EXHA 2VH9A 3IPVA 1V6IA 2A5ZA 1MS3A 1IS3A 4WA4A 2CYFA 3FBYA 1U0AA 4M3MA 4FOQA 3MW4A 3ZSMA 3BTAA 2D3SA 1YYNA 3OYWA 4MWRA 4HL0A 1WBLA 1LEDA 1UZZA 4YZ5A 1Q8QA 1SFYA 1YIFA 1N1SA 3MW3A 4X4AA 1AZDA 4YFZA 3ZXLA 4AGGA 5H9RA 1Q8PA 4H53A 3JU4A 5GZFA 4NCSA 1IS6A 1S0FA 4YGDA 2EALA 3O5SA 4R9CA 4K1HA 1INFA 1NLSA 1GLHA 1L7GA 3M2MA 2W5OA 3K39A 4W65A 3L2YA 4NOTA 4GALA 2R16A 4IQPA 1DIMA 4ASMB 4XMIA 5JMCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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