2SLIA

Leech intramolecular trans-sialidase complexed with 2,7-anhydro-neu5ac, the reaction product
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
IPEGILMEKNNVDIAEGQGYSLDQEAGAKYVKAMTQGTIILSYKSTSENGIQSLFSVGNSTAGNQDRHFHIYITNSGGIGIELRNTDGVFNYTLDRPASVRALYKGERVFNTVALKADAANKQCRLFANGELLATLDKDAFKFISDITGVDNVTLGGTKRQGKIAYPFGGTIGDIKVYSNALSDEELIQATGVTTYGENIFYAGDVTESNYFRIPSLLTLSTGTVISAADARYGGTHDSKSKINIAFAKSTDGGNTWSEPTLPLKFDDYIAKNIDWPRDSVGKNVQIQGSASYIDPVLLEDKLTKRIFLFADLMPAGIGSSNASVGSGFKEVNGKKYLKLRWHKDAGRAYDYTIREKGVIYNDATNQPTEFRVDGEYNLYQHDTNLTCKQYDYNFSGNNLIESKTDVDVNMNIFYKNSVFKAFPTNYLAMRYSDDEGASWSDLDIVSSFKPEVSKFLVVGPGIGKQISTGENAGRLLVPLYSKSSAELGFMYSDDHGDNWTYVEADNLTGGATAEAQIVEMPDGSLKTYLRTGSNCIAEVTSIDGGETWSDRVPLQGISTTSYGTQLSVINYSQPIDGKPAIILSSPNATNGRKNGKIWIGLVNDTGNTGIDKYSVEWKYSYAVDTPQMGYSYSCLAELPDGQVGLLYEKYDSWSRNELHLKDILKFEKYSISELTGQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The 1.8 A structures of leech intramolecular trans-sialidase complexes: evidence of its enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Macrobdella decora
molecule keywords INTRAMOLECULAR TRANS-SIALIDASE
total genus 184
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature ec 4.2.2.15: Anhydrosialidase.
pdb deposition date 1998-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02973 Sialidase Sialidase, N-terminal domain
A PF13088 BNR_2 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.220.10 Mainly Beta Beta Barrel Intramolecular trans-sialidase; domain 3 Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 2sliA03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2sliA01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 2sliA02
4YW3A 5GALA 1DGLA 4K1KA 4XBLA 2W38A 1MVQA 1CIWA 2B8HA 1LECA 2OVUA 2C5DA 2QWFA 1G9CA 2GNDA 2A3XA 4J9TA 5E8AA 4Y1UA 2YY1A 5IK8A 1WD4A 4MJVA 5CB7A 2BERA 2QWKA 1LHUA 2B7YA 4B7QA 1FYUA 5GZCA 4R9AA 4CTEA 1Z4XA 3TI8A 2VU9A 1MS9A 5M1ZA 1BJIA 1S0DA 1W6PA 5DZEA 1LOBA 2DUQA 1HKDA 3POYA 3BTAA 2R1BA 4M3CB 3V0BB 3NN9A 5JLVA 2DVAA 1FATA 2W08A 2DUPA 2YXSA 3AYAA 2NYYA 2HT7A 3IM0A 4LBQD 1LOAA 1V6MA 3UL2A 4C1WA 5F5QA 4LBJA 4CPMA 5AVAA 3JU9A 1WCQA 1ZM1A 2P2KA 1V3BA 4CPOA 3OY8B 4DGRA 1SNTA 5LK5A 4XXPA 3B00A 4MWUA 2BF6A 4K1JA 1WD3A 3T2TA 2HYKA 1VAVA 1EUUA 1NCCN 1VALA 1DQ0A 1DZQA 5E89A 5HCAA 4B7MA 1WW4A 2VW2A 2GMMA 4GZQA 3ALXA 3VKFC 4FVKA 1W6PB 1AXKA 3ILNA 4FVVA 3TICA 2JE7A 1WBFA 3U4XA 2ZACA 2ZAAA 5GLZA 3A0NA 1A8DA 1EPWA 3H71A 4MWXA 2YA6A 3T1LA 4CRQA 3B9CA 3WCRA 1NMCA 2F27A 3FLTA 3AXEA 3B3QE 5H9PA 2NMOA 5T5OA 3K39A 2QWHA 5DZGA 4XTPA 2F12A 3WV6A 2WSVA 4WA3A 1YRZA 1AXYA 4HANA 3BEQA 1VCUA 6NN9A 1LOEA 3N7KA 1ENRA 3FUOA 5T5PA 1Q8QA 4RA0A 3W59A 2SILA 1ENQA 4XJQA 5B2DA 1YI7A 3T1EA 1AVBA 3ZPYA 3ZSLA 4ISRA 4X6KA 4YM2A 1L7FA 1MS4A 3C2UA 1JYCA 4LBMA 2D6LX 3D6EA 4P14A 1UZZA 4UW6A 1ULGA 5SV8A 1MZ6A 2XG3A 5CNAA 1H9WA 3N36A 3LSDA 3AYEA 5NN9A 2PHXA 2XZKA 4CPZA 1LU1A 3QLQA 4YGEA 2UWCA 2P3KA 3M3OA 3TAYA 4BMBA 3B69A 5L73A 3GVLA 1W6NB 1LJ7A 1J1TA 2SLIA 1FNZA 3ZYPA 1S1AA 1SCSA 2ZMLA 1OFSA 4PBOA 4UF7A 2HTRA 3A71A 3WVJA 1LHVA 4Q8LA 4KS1A 2DU1A 4AWDA 4RL7A 3RG0A 3RMYA 4YZ5A 4GA9A 2VXRA 1LOFC 3RS6A 1V3DA 1N1TA 5T55A 4NCSA 1AXZA 2YV8A 3A4UA 3AP7A 2ZMKA 2F26A 1UAIA 1W20A 4WA5A 2ES3A 4YG0A 1DIMA 2NM1A 2A3WA 1V6LA 3AJZA 1IOAA 4GB1A 2P37A 5DXDA 1RITA 2VW0A 2D3PA 4HZVA 2D3RA 3WNXA 3H0OA 2F10A 1INGA 1CQ9A 1W6OB 2W68A 5JOYA 3OPZA 2W5NA 2NN8A 3WLUA 1SBFA 2CTVA 4GXLA 4K1YA 1NNCA 2F0ZA 2QWDA 2EALA 4FPEA 3MPPG 3UJOA 3APBA 4FPCA 4FPKA 1QF3A 2P34A 1GZCA 3HR9A 4XTMA 4MZEA 4NOTA 5FREA 3RSJA 2F11A 2JD4A 2AEQA 4X49A 1E8VA 3WDYA 3GALA 3USUA 4KBBA 4YFZA 4GZOA 4GEZA 2VSKA 4XOGA 1HQLA 1WLCA 4MWJA 3PJQA 4YG3A 2PELA 1NN2A 1WW5A 1JHNA 1G9DA 1FX5A 1QDCA 3ZSKA 2PHFA 1G7YA 1GANA 2GALA 3FFZA 5IT6A 4FPYA 3GVJA 3M1HA 3RMXA 1UPSA 4K1ZA 4U36A 2A70A 2H0BA 4Q6KA 2F24A 2BZDA 4IQPA 4XDQA 7NN9A 5GLVA 1KQRA 1G9FA 3A72A 2UURA 3N7MA 1JXNA 3SALA 4YGCA 2ZKNA 2JDZA 4FOQA 2CWMA 4XJWA 2D43A 3USUB 1YIFA 2ZGRA 2JKBA 5GLUA 3TI5A 1V0EA 3O9JA 4FPHA 1QKQA 1NMAN 1OKQA 3CKZA 4FOVA 4LBLA 3OGGA 1DFQA 2ZGMA 3AXDA 3MW4A 4JRAA 1B9TA 1SLTA 4GKXA 4QN4A 4XE9A 5E88A 1C4RA 4D69A 2C4AA 4M3CA 2W20A 2R0HA 3CYEA 3SH3A 2HTQA 4K20A 3VKMA 1A3KA 1X50A 1HQWA 1YO8A 4QN3A 2OW4A 2GNBA 5JYYA 3TI3A 2ZGQA 5IK7A 2AR6A 4OZXA 1R1ZA 3POWA 1BZWA 1N1VA 3FLPA 4QNPA 2GMPA 3AP5A 3OY8A 3AZYA 2CMLA 5H9SA 1S0EA 1IVCA 1N47A 3O0VA 2G4IA 1A78A 4WEGA 3V65A 1CONA 2CWSA 1F8BA 4DQAA 1LHNA 1NSCA 1E8UA 3ZXKA 4CPYA 3RRDA 1QNYA 4DPNA 1DYKA 1UKGA 1V2IA 4JF7A 3IKWA 3VV1A 1IVBA 4XYXA 1LTEA 1N3OA 2GN7A 5GJ6A 3SLIA 2E6VA 1S0CA 4FPJA 2P3IA 2A75A 2ZA9A 4R9BA 2DVDA 1GLHA 4XBQA 2AGSA 1VIWB 5HUNA 1W6MA 4GWNA 4Y24A 5IUQA 4LBQB 1USXA 3WG4A 1AJOA 2VH9A 4GZWA 1OQ1A 1GICA 1V0FA 3O9KA 1HLCA 3JUUA 2YA7A 3N35A 3K38A 3HN1A 3KM5A 2AENA 4JC1A 2E7QA 4DS0A 3OYWA 1DQ2A 4WV8A 1IVFA 1IKPA 3AFKA 3IPVB 1ULEA 2WQZC 3O5SA 5KXBA 2PHTA 4FPFA 5EYYA 4XMAA 4F83A 1INHA 2A6VA 4FQ4A 3ZSJA 3SH5A 2A6ZA 3TI6A 2PHRA 5DUXA 1FAYA 2PHWA 4YGDA 2A3YA 4TYSA 3K36A 1WUVA 1AJKA 4DFSA 1QOOA 2D3SA 5JVVA 4K1IA 3INBA 3O0WA 4Y1XA 2AREA 1SBDA 1DQ6A 5KXCA 2D6MA 3WOGA 1YXWA 3CL2A 1W6MB 1LGBA 1LCLA 1ONAA 1SLAA 1URXA 2Z42A 1O4YA 4I00A 2GNTA 3M2MA 4MYEA 1SLCA 1AX1A 4M3CF 1CR7A 1N1SA 3AZZA 1SCRA 3OBRA 1SLLA 2AH2A 2D44A 1MZ5A 1BYHA 3OYWB 1APNA 1FV3A 2ZGLA 1LEDA 3N7JA 2P3JA 2NMNA 1W6NA 1PZ8A 4FPLA 2QWEA 5DUVA 2QWJA 4L8QA 1PZ9A 3VUOA 3B01A 4HZZA 3AK0A 3WUCA 4Y1YA 2DU0A 4P9YA 1WCSA 4Y22B 4CZSA 4SLIA 3NV1A 5GLWA 2AUYA 4KS2A 2YMZA 1V3EA 4U2AA 2C4LA 2A71A 4YW4A 3M3CA 1GYKA 3K37A 2F13A 5GZGA 4Y1ZA 5IK4A 2YZ4A 1UL9A 4AGVA 2E7TA 3O0XA 1LOGA 3W58A 4Q2FA 3NV2A 4BMEA 1S0JA 3AZXA 3MW2A 3WCSA 1MWEA 2ZHKA 2QWAA 3GVKA 1MACA 4FQZA 4GALA 4XXAA 1XQNA 1Z4ZA 4M4NA 4YZ1A 1LOCA 4YZ4A 3W09A 3IN9A 3SNMA 5KXEA 4MWQA 1KJRA 1QOTA 1NCDN 1XOGA 1W6OA 2WKKA 4FZHA 3H72A 1BXHA 4MWWA 1LU2A 1NCBN 1JW6A 1B09A 1WLWA 2FHRA 4Q8KA 2HT5A 4GJTA 3QCWA 1W8OA 3WHUA 1GZWB 1F9KA 3I4IA 4XJRA 1Z78A 4PBPA 3M3EA 4GDJA 2CYFA 1EUTA 1N3QA 2GNMA 1Z0HA 2WSUA 4LBNA 5JOXA 3D5OA 1CPNA 4YZ3A 4ISQA 1GKBA 3MEPA 3SISA 2YA4A 2ARBA 1EURA 1MR5A 1V6KA 1LHOA 3ZXJA 1IS4A 1Z50A 2QWIA 1LGCA 1NLSA 1MVEA 2ZHLA 3DGTA 3AJYA 5GZFA 4XJAA 2D6KA 5H9QA 4XIOA 4ATEA 3L2YA 3PVOA 4FP2A 4YM1A 1S0GA 2DUOA 4XJUA 2XCYA 1CESA 2ZGPA 3WDUA 3T1MA 1W8NA 2QWCA 4FPGA 4YW5A 1KRIA 1V0ZA 1KDMA 3NWKA 5HUGA 1UZYA 2AYHA 3N7LA 4YGBA 5JMCA 2UWBA 3UK9A 3V0AB 1VCJA 2GDFA 2D6NA 3AP9A 2VWDA 1S0FA 2R1DA 4FJ6A 1A4QA 1MS0A 1G9BA 5H9RA 1L7HA 3VKLA 2LALA 4AVSA 2ZHNA 4FPOB 5HUMA 5JDBA 4R9DA 4BOWA 3WZ1A 3TB0A 1IVEA 2SIMA 2XZJA 4HL0A 4ZKTB 1H30A 1KJLA 2WLQA 1INXA 2E51A 1V6OA 2VSMA 4BLJA 3WHTA 4B7NA 5DG2A 3WDVA 2XZIA 3FBYA 2BQPA 4WA4A 1ULCA 2V5YA 4QN6A 4GZTA 4Q1PA 5JOWA 2DTWA 1Z4YA 4LBOA 1Q56A 1IS3A 4K1HA 1N3PA 1JN2P 3AYDA 3CL0A 1KITA 5T5JA 2HTWA 1IVDA 3NV4A 4M00A 3AZVA 1G86A 1U0AA 3GNEA 2SBAA 2UWAA 3AP6A 2EXHA 5BYNA 3ZSMA 2F28A 4XBNA 3AYCA 2A6YA 4FOWA 4PCRA 4TZDA 2ZGTA 4XIKA 2R49A 3N3HA 3PVNA 3Q9OA 1Q8OA 4B7RA 2WJSA 4PF5A 1V6IA 1WLDA 2RKCA 2CY6A 2YDTA 1LOFA 1SO7A 1JOJA 5EYXA 1V6NA 4BBWA 1BQPA 4WVVA 4ASMB 1DQ5A 1JUIA 1F8EA 2DVGA 2JE9A 3ALWA 4NN9A 1LULA 1G9AA 4LBQA 3JU4A 1Q8PA 4CPLA 2WNEA 1E8TA 3R4UA 4ATFA 2EIGA 2V73A 2X9MA 4B7JA 4AYUA 4MZAA 1LODA 2XB6C 2VK7A 1C1FA 3IPVA 4KS3A 2ZBJA 4WVWA 2VUAA 1W1XA 3H6JA 1USRA 1CPMA 1V3CA 1IVGA 4KS4A 3KQRA 1QGLA 3ASIA 3ZYRA 1LENA 5CA6A 1O4ZA 1L7GA 2AEPA 2EAKA 1ULFA 3IMNA 3AZWA 3SANA 1D0HA 2OUJA 4Q1RA 4YM0A 1WBLA 4YM3A 1LESA 3I8TA 3ZXLA 4MJUA 5GZEA 2D6PA 1VAMA 2DVFA 2WT2A 3A0KA 4H52A 1MS1A 2E53A 2W39A 4WZFA 3M3QA 3B7EA 4HZWA 1DILA 2QWGA 1IKQA 1Q8SA 5DZFA 2A6WA 2CL2A 2HTUA 2W52A 2DYCA 2YDPA 3OBTA 1I3HA 2LTNA 1DYPA 1WW6A 4MWVA 3SILA 2ZGNA 2ARXA 4M4UA 4MWLA 2HTYA 3VKOA 1INVA 1N1YA 2WT0A 3TIAA 3D4KA 4M01A 1V6JA 1C1LA 4UW4A 1TEIA 2GN3A 4K3YA 3FLRA 1GNZA 1VLNA 1DIWA 1IS5A 4XHXA 3POSA 2ZB6A 4NC5A 4BM8A 1SLIA 3BOPA 1QU0A 4Y22A 3AP4A 3OJBA 2ZMNA 3ILFA 3WG3A 1SFYA 1AZDA 2EXJA 4Q27A 4KS5A 2TEPA 4MWYA 2VK6A 3NSSA 4I30A 1Z4VA 1CN1A 3H73A 5T52A 1DQ4A 4BQ1A 2RHPA 1DLLA 4ZXKA 3TIBA 4YW1A 1Z4WA 1DHKB 2ZABA 1QOSA 2YA8A 4PQ9A 4AGRA 4M3CE 4AVVA 1INYA 4FP3A 1Q8VA 2ZGOA 3ZXEA 2KM2A 4MWRA 1INWA 2HTVA 5GLTA 3BIWE 2ZHMA 1QDOA 2D6OX 4HIZA 2R0FA 1IS6A 1WW7A 1A14N 1ZA4A 2NZ9A 1GZWA 4Y26A 1S0IA 4GKYA 1NCAN 4GDIA 1AX2A 2DVBA 4LBKA 4UW3A 4AVTA 1NNAA 4XMIA 2ZZJA 1ENSA 1QNWA 4WEFA 3WDWA 5B2CA 2F29A 4MX0A 2FMDA 5CBLA 2F25A 2I2SA 4GZSA 2ZGKA 3PMEA 3SH4A 3MW3A 4YFWA 5T50A 1SBEA 5HCFA 2VW1A 1RIRA 1F5FA 3UJQA 1W21A 1PZ7A 3FUQA 2R16A 2DV9A 1S0BA 5HCBA 3DUIA 4Y20A 2NP0A 2BATA 1MS8A 2WT1A 5IK5A 1F8DA 3BODA 4YG6A 5HX0A 2ZGSA 5T54A 4C1XA 1GNHA 4DRVA 2ENRA 3K3AA 1CJPA 3VKNA 3V0AA 1FV2A 2W5OA 1AF9A 1QMJA 2GMEA 4XILA 5KXDA 4R9CA 3TI4A 2EXKA 5GZDA 4W65A 1V00A 1UX6A 4QN5A 1W6QA 3PVEA 1A4GA 2A5ZA 1RINA 1JBCA 1F31A 1D2SA 5FRAA 4P9WA 5DUUA 1H9PA 4UW5A 1NXD1 1LEMA 5EXOA 4M4VA 1G8WA 4Y20B 1B9VA 1ULDA 3ILRA 2JJ6A 1NNBA 4Z8BA 1W0PA 1NMBN 1AX0A 4CPNA 2YA5A 4X47A 3WDTA 1W0OA 3V64A 4DRRA 4NO4A 1SACA 4X4AA 3HMYA 3LCPA 3R4SA 1NSBA 1B9SA 2OUHA 4M3MA 2ERFA 3RQ0A 4GZPA 2HU4A 5EWSA 5T5LA 3ATGA 1UMZA 1BJQA 4P9XA 3NV3A 4HZXA 2HU0A 4XZPA 3INAA 4ITCA 1GSLA 1GZ9A 4H55A 1W6QB 1YYNA 1C57A 2A6XA 2ZB5A 4Q26A 3ZXFA 4XHBA 1DBNA 2VK5A 4YLZA 2ZGUA 1MS3A 1CVNA 4YW2A 2JECA 2QWBA 2VY0A 3AX4A 1INFA 1JYIA 1I1EA 3WUDA 1LGNA 5F9TA 2EF6A 1GBGA 1F8CA 1GV9A 4FOYA 2PHUA 1SLBA 5CAZA 4H53A 4D8SA 4XJ8A 2C9AA 5JOZA 2HT8A 1FNYA 3O12A 4MC7A 2YROA 4JCKA 1UN1A 1DQ1A 1KDKA 3CNAA 1EUSA 1MS5A 1BKZA 3ZVXA 4YZ2A 1XOEA 2A7AA 3D12A 3WG1A 2DURA 1HDKA 4Y1VA 3WDXA 2VVZA 1Y7BA 2D7FA 5GM0A 1NSDA 4BPZA 2EXIA 3D11A 4XJZA 2CNAA 4XJ9A 3LSEA 4BLIA 5DUWA 2DWRA 4GZXA 4AGGA 2DTYA 2UU8A 2Q5TA 1LHWA 4GWMA 5HUKA 3ENRA 3WG2A 3V0BA 3R05A 4HZYA 4K21A 3SITA 5DG1A 4QN7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YW3A 1Z7S3 1JYTA 5GALA 3GZTB 1DGLA 4DEVA 4K1KA 3O4PA 2YU2A 4QB2A 4XBLA 4Q4Y1 1MVQA 4ARXA 1CIWA 5A7WA 2W38A 2B8HA 2JDMA 3LFIA 2VZUA 4QQ2A 3LEIA 1CX4A 2WWJA 2XLGA 5IFTA 4NROA 1QJEA 2EIDA 4HKWA 1LECA 4RHV1 5LBBA 5BNOC 2OVUA 2C5DA 4PI0A 5A3WA 2QWFA 1W06A 3ACGA 4LIVA 5F3GA 1G9CA 2Y38A 2GNDA 5IJRA 2A3XA 4J9TA 3WX5A 2E31A 3PTYA 5E8AA 1QJX1 5FXWA 1RUC1 1D4M3 4Y1UA 3SC7X 1AR83 2YY1A 3FJSA 3NAPC 3NW4A 1ZRRA 3VD9A 2VC9A 4LJHA 1AYN2 3KD4A 1OSGA 3KHBA 1NQDA 4RGKA 2IVIB 4OFGA 5IK8A 1OH3A 1WD4A 1W05A 5CB7A 2BERA 2EIEA 4MJVA 2VNGA 4D0QA 2OXBA 1XNCA 2B45X 3SKJE 3P5BL 2JDHA 3MV11 1LHUA 2QWKA 4UFMA 2B7YA 1U5XA 1UNBA 3TN91 3ZR6A 1N6FA 1ZVFA 4B7QA 1TQ5A 2HJIA 1FYUA 5F8PA 3UETA 4E27A 5GZCA 3THCA 1Q7FA 1CAUB 2CGNA 4R9AA 4CTEA 1Z4XA 5IHRA 5ABJC 4XQWA 1JZ4A 3TI8A 2WFF3 3KVAA 2W8BA 5A6XA 2WAAA 2VU9A 2B9UA 2EA7A 1MS9A 3LE0A 5FZ3A 3MYXA 2PHDA 5M1ZA 5LEJA 4XDOA 3EJKA 1S0DA 2PHLA 4D7TA 3IIAA 1W6PA 2XOMA 3RZHA 1BJIA 3KLSA 2LROA 1LOBA 4JDMA 5DZEA 3QACA 2DUQA 3RZMA 2ET7A 4X6RB 4OI4A 4ZONA 3B94A 4WM7A 1HKDA 5LRSA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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