3B69A

T cruzi trans-sialidase complex with benzoylated nana derivative
Total Genus 182

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
182
sequence length
635
structure length
626
Chain Sequence
ASLAPGSSRVELFKRQSSKVPFEKDGKVTERVVHSFRLPALVNVDGVMVAIADARYETSFDNSLIDTVAKYSVDDGETWETQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYVLVGSYNSSRSYWTSHGDARDWDILLAVGEVTKSTAGGKITASIKWGSPVSLKEFFPAEMEGMHTNQFLGGAGVAIVASNGNLVYPVQVTNKKKQVFSKIFYSEDEGKTWKFGKGRSAFGCSEPVALEWEGKLIINTRVDYRRRLVYESSDMGNTWLEAVGTLSRVWGPSPKSNQPGSQSSFTAVTIEGMRVMLFTHPLNFKGRWLRDRLNLWLTDNQRIYNVGQVSIGDENSAYSSVLYKDDKLYCLHEINSNEVYSLVFARLVGELRIIKSVLQSWKNWDSHLSSICTPAGCGPAVTTVGLVGFLSHSATKTEWEDAYRCVNASTANAERVPNGLKFAGVGGGALWPVSQQGQNQRYHFANHAFTLVASVTIHEVPKGASPLLGASLDSSGGKKLLGLSYDKRHQWQPIYGSTPVTPTGSWEMGKRYHVVLTMANKIGSVYIDGEPLEGSGQTVVPDERTPDISHFYVGGYKRSGMPTDSRVTVNNVLLYNRQLNAEEIRTLFLSQDLIGTEAHM
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
source organism Trypanosoma cruzi
publication title A new generation of specific Trypanosoma cruzi trans-sialidase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Trans-sialidase
total genus 182
structure length 626
sequence length 635
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2007-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3b69A02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 3b69A01
1NSDA 4FPJA 1IVFA 1G9BA 2NMNA 4XJZA 1V6KA 3SLIA 1KJRA 2ZKNA 1S0EA 2VUAA 3ASIA 3D4KA 1VAMA 1LULA 2PHXA 2C5DA 4XZPA 1N1YA 1QKQA 3LSDA 3IPVB 1R1ZA 2GALA 1NCAN 1Y7BA 1CPMA 1V6OA 1IVDA 5NN9A 1O4YA 3DUIA 1Z4XA 2YY1A 3ENRA 1SLLA 1N1SA 2YXSA 4GZQA 1LHOA 4DFSA 3H73A 4WA4A 1A3KA 1W6MA 2BQPA 3WCRA 2WT0A 4GZWA 5HCAA 1WLCA 3ALWA 4ITCA 2W52A 3N3HA 2P2KA 4Q26A 2HT8A 3TI3A 2C9AA 4XBLA 1NXD1 1WD3A 2A7AA 3JUUA 1MS8A 1UZYA 1U0AA 1LOFC 5GALA 2DVGA 2CNAA 3I8TA 2HYKA 3ILRA 4FPFA 3ZXLA 1QF3A 4GB1A 3TI4A 1WBFA 1S0FA 2AR6A 2C4LA 2VVZA 2W20A 4MWJA 4Y24A 1GLHA 1LGCA 1SNTA 1Z4WA 1V0ZA 3OYWB 3GALA 4QNPA 1JUIA 1LGBA 2OUHA 1LHUA 4FPCA 1MACA 3RS6A 1GV9A 1DZQA 1USXA 4YG6A 4XOGA 2YA4A 5DUXA 4GKYA 4XXPA 4AVVA 1G9AA 5GZEA 3WDUA 3NV2A 4DRRA 3OJBA 2YZ4A 4C1WA 5IK8A 4HZWA 1ULGA 4NN9A 2QWFA 4WEGA 1I3HA 2JDZA 2YA5A 1AJOA 3M1HA 2D3RA 2D43A 2PHFA 1DQ0A 3WDVA 4NO4A 2VK7A 1IKQA 2UWAA 4P9XA 4ZXKA 2GMPA 1ULFA 3ZXFA 2HTVA 2D6OX 2YA6A 1FYUA 1UMZA 3MW3A 3V0BB 1WLWA 1ENRA 2I2SA 1XOGA 1Z4YA 4YM2A 6NN9A 5JOWA 4MZEA 2F27A 4TYSA 3D6EA 1V6JA 4CZSA 5T5PA 3O12A 1B9TA 4LBJA 3ZYPA 1QOSA 1WUVA 3RMXA 3UK9A 1EURA 1W0OA 1SLTA 1XOEA 4Y22B 5DXDA 3V0AA 2JECA 4MJUA 4LBKA 3ZXEA 2HT5A 4MC7A 3FLTA 4Y1ZA 1AF9A 4XTPA 4XJUA 3NWKA 2F12A 2VSKA 3NSSA 1LECA 2DV9A 4FQ4A 2CMLA 3A0KA 4K1KA 1EPWA 4Q27A 5EYXA 4DGRA 2LALA 2PHTA 3AJYA 4FPEA 1DQ5A 2YMZA 1AX2A 1DBNA 3O0WA 1IKPA 5GLUA 1INYA 4HANA 1KITA 1LTEA 4Q8KA 1W6MB 5SV8A 1LHNA 2E53A 2QWBA 4RA0A 1BZWA 4WA5A 2CL2A 5LK5A 1UPSA 4FPYA 1Q8QA 2SLIA 1IVGA 3AYDA 2ZGRA 1Q8SA 4FPKA 4MYEA 4Y1XA 4GDIA 5DG1A 1S0IA 5H9PA 1IS6A 2TEPA 1MS4A 3I4IA 3LSEA 4XIOA 1CESA 2GNTA 4LBQA 3TI8A 1MWEA 3SITA 1S0GA 2AH2A 4YZ3A 1KDKA 4YG3A 4MWRA 4K1IA 4PF5A 2DURA 1EUSA 2XG3A 5CA6A 3IPVA 4M00A 4Q1PA 4HZXA 2HT7A 3WOGA 3H71A 1AZDA 1LOBA 4B7NA 2UURA 2QWJA 3CKZA 3TIAA 2XZJA 1D2SA 1NCBN 3T2TA 2QWEA 3WLUA 5T5JA 4FPGA 1FV2A 1GANA 3K38A 3KQRA 3ZSKA 1JBCA 4XMAA 1WD4A 1QNYA 4KS1A 1N47A 2ZAAA 3D11A 3FFZA 2DVFA 1V0FA 1INVA 4XYXA 4GWMA 4YFZA 1IVBA 1HQLA 1B09A 4XJWA 2WNEA 3T1MA 2ZB6A 3C2UA 3WVJA 4P9WA 3VKOA 1C1FA 5T55A 2HU0A 1NN2A 5E8AA 1ONAA 4BPZA 1MZ5A 3OYWA 3WDWA 1HLCA 4YW3A 4FPHA 1ULEA 2AGSA 1OKQA 5IUQA 2NZ9A 1J1TA 4Y26A 1W0PA 2A75A 2GMMA 1NCDN 4YM3A 2JKBA 5H9SA 2YDTA 5GZDA 5T5LA 2LTNA 3POSA 1X50A 1CONA 3V0AB 2WQZC 4MWQA 1PZ9A 1VCUA 1F9KA 2HTRA 3POYA 1KJLA 2EF6A 3Q9OA 3GNEA 2PHUA 2GDFA 4K1HA 3LCPA 1V3CA 2KM2A 3RSJA 4XJ8A 2R16A 2F11A 1INGA 2WSVA 4YW4A 3O9JA 4FP2A 4UW5A 2JE9A 4GZOA 2A3WA 2SIMA 1VCJA 4YGBA 2GNMA 1H9PA 2EXIA 3SALA 3MPPG 1GZWA 5GZFA 4MWVA 5BYNA 1WCQA 3NV3A 4WVWA 1VALA 3WG4A 3V0BA 2ZA9A 3M3EA 1TEIA 3UJQA 2CWSA 2P3JA 1SBFA 4R9BA 4K1JA 2ZGNA 4MZAA 3AYAA 3WUDA 2A6YA 1VIWB 4LBQB 4F83A 1VAVA 4PQ9A 1Z78A 5GLZA 1E8TA 2X9MA 3AZXA 4JRAA 5F9TA 4Y22A 1LHVA 1CVNA 1BYHA 4KBBA 2D7FA 2GNBA 4AVTA 3RG0A 3IKWA 2YDPA 1CQ9A 3W09A 2A6ZA 3GVJA 4FJ6A 1BJQA 2D3SA 1NNAA 3HN1A 3OGGA 2PHRA 1Z0HA 1IVCA 1A4QA 3WDXA 1SBEA 3N7LA 4GZXA 4XBNA 1QNWA 1LEDA 2B7YA 1INHA 1AXKA 1RIRA 5T50A 2EAKA 1APNA 4GWNA 1IS5A 1S0DA 2R1DA 2D6NA 3A72A 1Q8OA 4HIZA 1CN1A 4WVVA 3AZVA 2R1BA 5CNAA 5JDBA 2CWMA 4ATFA 2OW4A 4YW1A 2D44A 2DVBA 2PHWA 4GJTA 3N7MA 4D69A 4H52A 2ZBJA 4FPOB 1JHNA 2ZMLA 1NMCA 5EYYA 5JMCA 2VY0A 3MW2A 4M4UA 2YROA 1CIWA 1Q56A 4K3YA 1Z4ZA 1C57A 1AVBA 2QWDA 3FUQA 5JLVA 1SLIA 1DQ6A 4P14A 4MWYA 4YZ5A 2AYHA 4XJQA 4FVKA 2NP0A 3PJQA 3USUA 1Q8VA 4UW6A 1V2IA 3K39A 1GNZA 2W08A 7NN9A 4YGCA 3B69A 4AGGA 2A71A 1UL9A 4LBQD 2GNDA 3M2MA 2AEQA 3IM0A 1V6LA 5GLWA 4YGEA 1SLAA 5T5OA 3R4SA 4ATEA 3NV1A 3ZVXA 1JYCA 1FNZA 2R49A 2DU1A 1ZM1A 1HDKA 1Q8PA 1AJKA 4X49A 2SILA 1DHKB 1GBGA 3ZXJA 3PMEA 2F24A 1S0JA 2EXHA 2WKKA 1W6NB 2D6KA 2GMEA 4XHBA 1GZWB 2OVUA 1V6NA 2HTYA 2CTVA 2DWRA 4I30A 1I1EA 3OPZA 3O9KA 2ZGMA 4ISQA 5B2CA 4Y20B 4YFWA 4YW5A 2RKCA 3N7JA 4GDJA 1WCSA 5KXBA 1FNYA 5KXDA 4FOQA 2YA8A 2ARXA 2JE7A 1AX0A 1UKGA 5JOYA 2AENA 5IK5A 3RMYA 2BF6A 4CPYA 3W58A 4BLJA 1MS3A 1LENA 1KRIA 4M3CE 3A4UA 1FX5A 1V3EA 3M3OA 2XZIA 2F28A 1A4GA 5HUMA 3AP5A 2ZHNA 2VXRA 5H9QA 4R9DA 1INXA 3POWA 3T1LA 2ZGUA 4WZFA 2UWBA 3PVNA 1KQRA 2F29A 1DQ4A 3WHUA 2ZHMA 1LJ7A 4YM0A 4GZPA 1Z4VA 4YG0A 2ZABA 2VSMA 1OQ1A 1GNHA 4R9CA 4FOWA 1DIMA 2ZGTA 1LOEA 3V65A 4PBOA 2VK6A 2QWGA 3R05A 4Q1RA 1GICA 3V64A 2E7TA 1FV3A 2ZMNA 4YLZA 4XE9A 3SISA 3NV4A 3WG1A 1UX6A 2BATA 3CL2A 3USUB 1FATA 4FOVA 4GZSA 1W6QB 1S0CA 5JOXA 4Y1UA 4KS5A 2ZGPA 1JN2P 3B01A 2XB6C 3AZWA 3SH5A 4BMEA 4XXAA 1LGNA 4WV8A 5HUKA 5IK7A 4K1ZA 1S1AA 3TICA 1MS0A 4CPMA 4YM1A 2AREA 1F8CA 4HZYA 1HQWA 1QDOA 1GSLA 3AFKA 1H30A 1URXA 4KS3A 3SANA 3VKNA 5E88A 5E89A 3AYCA 4AWDA 1E8UA 4DQAA 1YRZA 3CYEA 4AGRA 1N3OA 2EIGA 1L7HA 5GLTA 4OZXA 3QCWA 3APBA 1DYPA 3A71A 4X47A 3AP9A 1CR7A 3W59A 2QWAA 1SFYA 2YA7A 4PBPA 4M4VA 1INWA 4CPOA 1MZ6A 2R0HA 3K3AA 2GN7A 1W21A 3M3QA 3OY8A 2F26A 2ZGLA 5F5QA 2UU8A 2QWKA 1W8OA 1W8NA 4DS0A 1BQPA 4GA9A 2DUPA 4XILA 4WEFA 2JJ6A 3WDTA 1RINA 2HTUA 4GEZA 5CAZA 1EUTA 3WG2A 3INAA 1G7YA 4XHXA 4MWWA 1NCCN 2A70A 3VKMA 2W68A 2A6WA 5L73A 3SH3A 4HZVA 2VW1A 3TI5A 2VW2A 4BOWA 5DZFA 1W6NA 2R0FA 4XJ9A 4W65A 4AGVA 1QMJA 4MX0A 2BERA 3WZ1A 1V6MA 1A14N 2EXKA 1PZ8A 2NM1A 1W6OB 2ZHLA 3NN9A 3CL0A 1QOTA 3INBA 4BBWA 4Y20A 3QLQA 1W20A 1O4ZA 1JW6A 2WT2A 5EXOA 2P37A 1GYKA 2XCYA 2A6XA 1D0HA 2Z42A 5FRAA 2ZHKA 3VKFC 4X6KA 4MJVA 3ATGA 1G9CA 5GM0A 2QWIA 5GZCA 3FUOA 3VV1A 2DUQA 1V3BA 3ZSMA 4YZ1A 3ILFA 2UWCA 1YI7A 4M3CA 1LOGA 1E8VA 2W38A 3B00A 1A78A 1LODA 1SCSA 3BTAA 3AP4A 1SCRA 4K20A 4AYUA 3WV6A 3ZPYA 1ZA4A 4KS2A 4UW3A 1F8EA 3BOPA 1V0EA 2DTYA 1YYNA 4B7RA 2AEPA 2DYCA 2ERFA 3VKLA 4DPNA 3CNAA 2EXJA 1G9DA 2F10A 3WNXA 1WW4A 4BMBA 1OFSA 2C4AA 1SO7A 3D12A 2NMOA 3AXDA 1H9WA 3KM5A 2W5OA 4GALA 2NYYA 1F8DA 4C1XA 3JU4A 5IK4A 3ALXA 2WSUA 4FZHA 1DQ2A 1PZ7A 2SBAA 4CPLA 5GZGA 1MVQA 3A0NA 1INFA 3B9CA 1JXNA 1SLCA 4X4AA 4ISRA 4D8SA 4Q8LA 3WCSA 3IN9A 4K21A 4MWXA 1N3PA 1W6QA 3OY8B 3UL2A 3BIWE 4JF7A 4CPNA 2V5YA 4QN3A 3ZSJA 5CBLA 2E51A 2FMDA 1MVEA 3AZYA 1NNBA 1NSCA 1WBLA 1SLBA 2A6VA 1JOJA 4NOTA 4BLIA 3N7KA 3FLPA 1UZZA 4B7QA 2VU9A 1USRA 3B7EA 5DUWA 4BM8A 5B2DA 2YV8A 2ENRA 4XTMA 3HMYA 4ASMB 3K36A 3AZZA 2ZB5A 1F31A 3BODA 1L7FA 4XMIA 4NCSA 2Q5TA 3H0OA 3TB0A 2ES3A 4GZTA 1L7GA 2ARBA 2CYFA 1LCLA 4CRQA 4LBNA 2A3XA 3H6JA 3GVKA 1ULCA 2GN3A 2P34A 3MW4A 1NLSA 1QU0A 4K1YA 1BJIA 2E6VA 2QWHA 2F0ZA 3D5OA 2WLQA 3RRDA 5GJ6A 1QOOA 2A3YA 2ZMKA 2VH9A 1LOCA 5DUUA 5AVAA 1G8WA 3U4XA 4Y1VA 5HX0A 3ZXKA 1F8BA 3AP6A 1UN1A 1DQ1A 4Q2FA 1CPNA 4CTEA 2DU0A 2AUYA 1YIFA 1N3QA 1Z50A 5KXCA 4M01A 1V3DA 4L8QA 4RL7A 4YZ2A 2W39A 2W5NA 1NNCA 1QDCA 3AXEA 1HKDA 4JC1A 5DZEA 4M3CB 1DIWA 1W6PA 1YO8A 2WJSA 1XQNA 4FQZA 3RQ0A 2EALA 1DILA 1ULDA 2G4IA 2ZGQA 4U36A 4JCKA 4QN7A 3M3CA 1V6IA 3T1EA 1AXZA 1MS1A 1IOAA 1IS3A 1C4RA 3AK0A 3B3QE 3L2YA 1GZ9A 4ZKTB 2DVAA 1SACA 4GKXA 4FOYA 1G86A 4XDQA 1W6OA 2HTQA 1IVEA 4I00A 1BKZA 5DG2A 3ZSLA 4LBOA 2P3KA 4XBQA 4H55A 3TAYA 1ENSA 4XJAA 3ZYRA 1NMBN 4QN5A 1AXYA 1WW7A 1N1VA 4J9TA 4Y1YA 3SILA 4Z8BA 4B7JA 5HUGA 4H53A 5CB7A 2A5ZA 4M3CF 1ENQA 3TIBA 3R4UA 4R9AA 2OUJA 3TI6A 4UW4A 5HCFA 1NSBA 2F13A 2D6LX 2FHRA 1IS4A 2D6MA 3O0XA 2QWCA 2DUOA 1DGLA 4YGDA 4XJRA 1DFQA 1G9FA 1UAIA 3H72A 1JYIA 3FLRA 4YW2A 1FAYA 1N1TA 2WT1A 3WDYA 5DUVA 3SH4A 4WA3A 5GLVA 4KS4A 3O0VA 3AJZA 3WG3A 3K37A 2VK5A 1LOFA 4MWUA 3VUOA 1LHWA 2E7QA 5H9RA 1RITA 2V73A 1W1XA 1GZCA 3N36A 1LEMA 4MWLA 4LBLA 3DGTA 1LU1A 2H0BA 4FVVA 1A8DA 1DLLA 3AX4A 4Q6KA 4M4NA 4PCRA 3UJOA 4XIKA 1SBDA 4AVSA 4QN6A 1QGLA 4CPZA 3O5SA 5KXEA 3WHTA 4FP3A 1B9VA 2D3PA 1V00A 1LOAA 5FREA 1CJPA 4HL0A 2ZACA 1B9SA 2XZKA 4QN4A 2ZZJA 1NMAN 1LU2A 2JD4A 5DZGA 2VWDA 3BEQA 3GVLA 3WUCA 3HR9A 3AP7A 1MS9A 3PVOA 2CY6A 1EUUA 2DVDA 4B7MA 1F5FA 2HU4A 4NC5A 1MR5A 2ZGSA 3SNMA 4TZDA 3JU9A 3MEPA 2BZDA 4YZ4A 4HZZA 4GXLA 4P9YA 3N35A 2B8HA 1VLNA 5IT6A 1W6PB 3ILNA 4UF7A 3AYEA 4DRVA 5M1ZA 5HUNA 4BQ1A 2F25A 4FPLA 3FBYA 3OBRA 1AX1A 2PELA 1GKBA 2NN8A 2HTWA 2D6PA 5EWSA 3OBTA 1BXHA 2RHPA 5JOZA 4LBMA 5JYYA 3IMNA 4U2AA 1DYKA 4M3MA 4IQPA 1WLDA 1WW6A 5T54A 1YXWA 1S0BA 1KDMA 2ZGKA 3PVEA 1MS5A 2ZGOA 5T52A 2P3IA 4SLIA 1C1LA 2VW0A 5JVVA 5HCBA 1LESA 1WW5A 2DTWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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