3PJQA

Trypanosoma cruzi trans-sialidase-like inactive isoform (including the natural mutation tyr342his) in complex with lactose
Total Genus 171
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
171
sequence length
635
structure length
626
Chain Sequence
ASLAPGSSRVELFKRQSSKVPFEKDGKVTERVVHSFRLPALVNVDGVMVAIADARYETSFDNSLIDTVAKYSVDDGETWETQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYVLVGSYNSSRSYWTSHGDARDWDILLAVGEVTKSTAGGKITASIKWGSPVSLKEFFPAEMEGMHTNQFLGGAGVAIVASNGNLVYPVQVTNKKKQVFSKIFYSEDEGKTWKFGKGRSAFGCSEPVALEWEGKLIINTRVDYRRRLVYESSDMGNTWLEAVGTLSRVWGPSPKSNQPGSQSSFTAVTIEGMRVMLFTHPLNFKGRWLRDRLNLWLTDNQRIYNVGQVSIGDENSAHSSVLYKDDKLYCLHEINSNEVYSLVFARLVGELRIIKSVLQSWKNWDSHLSSICTPAGCGPAVTTVGLVGFLSHSATKTEWEDAYRCVNASTANAERVPNGLKFAGVGGGALWPVSQQGQNQRYHFANHAFTLVASVTIHEVPKGASPLLGASLDSSGGKKLLGLSYDKRHQWQPIYGSTPVTPTGSWEMGKRYHVVLTMANKIGSVYIDGEPLEGSGQTVVPDERTPDISHFYVGGYKRSGMPTDSRVTVNNVLLYNRQLNAEEIRTLFLSQDLIGTEAHM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of an enzymatically inactive trans-sialidase-like lectin from Trypanosoma cruzi: the carbohydrate binding mechanism involves residual sialidase activity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Trypanosoma cruzi
molecule keywords Trans-sialidase
total genus 171
structure length 626
sequence length 635
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2010-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3pjqA02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 3pjqA01
4K1HA 5JOXA 4M3CB 4ITCA 2D6LX 2A3YA 2YY1A 3ALWA 5DZGA 1DILA 1HQLA 4Y1YA 1Z50A 4GZQA 3OYWA 3VKFC 4YGEA 2CYFA 1N1SA 4FPLA 1EUTA 3AYCA 3WG4A 3WUCA 5T54A 4Y1UA 4Q27A 4YLZA 2R1DA 3MEPA 4UW5A 2AGSA 2A75A 4J9TA 3AYAA 2YA7A 4YM2A 3T1EA 2XZJA 4MWYA 2P3KA 1W6QB 1FNZA 1WD3A 3M1HA 3POSA 3SANA 4K1IA 1IKQA 2YMZA 4KBBA 1V3EA 1F8DA 3INAA 3SLIA 1N3PA 3M3OA 2P3JA 2I2SA 1D2SA 3RSJA 1W8NA 4GZXA 4FVVA 3DGTA 1EUSA 2DTYA 4CZSA 1W8OA 1DFQA 2LALA 4MZEA 1AVBA 2F25A 1W6NA 4FPHA 5GZCA 1LJ7A 2F24A 3D5OA 4FPGA 4RL7A 3ZXFA 1Z4WA 3WG1A 1APNA 1LOFA 4Q1PA 4Z8BA 4X4AA 2GDFA 1WLDA 3MPPG 3N7MA 4LBQA 1ULDA 1INYA 3R4UA 1IS6A 2A6VA 4P9XA 4RA0A 1KDKA 1UL9A 4PBPA 2OUJA 1LGBA 3M3CA 2JKBA 2F12A 1INWA 1INVA 3N36A 1AX0A 1FV2A 1OFSA 1DZQA 2ARBA 2JECA 2VUAA 1SBEA 2YXSA 1V0EA 2E7QA 2A6YA 3AP6A 2H0BA 4QNPA 2W39A 2PHFA 3WHUA 3ILFA 5GZEA 1YRZA 1QKQA 2PHRA 4XJQA 4I30A 4Y20B 3SH4A 3O9KA 4U2AA 4MWJA 3I8TA 2DUPA 1X50A 3RS6A 4X6KA 3M3EA 1XOGA 2C9AA 4GXLA 2C4LA 1DQ0A 2ERFA 1CIWA 4DRRA 1V3BA 3NV1A 4WA3A 1V6OA 4MX0A 5FRAA 2D3RA 4XJZA 1QOTA 1GZWA 3AZWA 2A71A 3WCRA 4KS1A 2ZAAA 4BMEA 1V6MA 1GZCA 1KRIA 2YA6A 1Q8VA 1F8BA 1C1LA 1GNHA 5HCFA 4GJTA 3N7LA 1SLTA 5DUVA 2DVGA 5EWSA 1LGNA 4X47A 4H55A 1EUUA 1NCCN 4LBJA 2YDPA 2W5OA 5JOWA 4XJRA 2VK7A 1CPMA 1SNTA 1YYNA 1I3HA 2DU0A 1S0DA 1ONAA 1S0FA 1LHNA 4Q8KA 3CYEA 1JHNA 5KXDA 4LBLA 4QN4A 2VW1A 2EF6A 1PZ8A 1GICA 1VAVA 1DIMA 4GDJA 1NNBA 4X49A 2YA4A 3WG3A 1VALA 2FHRA 3V65A 5GLWA 2E6VA 3K39A 1OKQA 1GANA 2UWBA 3ILRA 3TAYA 1LU2A 2EAKA 4XIKA 4F83A 2AH2A 4NO4A 3GVLA 1LOFC 1NCDN 4B7RA 3MW4A 1OQ1A 3M3QA 3WDWA 4YG6A 2QWFA 3FFZA 1LULA 2HTQA 2ZGNA 4FPKA 2DWRA 1GYKA 4M3MA 5LK5A 1MS1A 4MWXA 1LCLA 4Y1ZA 4HL0A 5IK8A 5T5JA 4XTPA 1ULGA 1G9FA 3TI3A 4XTMA 2ZACA 2GNDA 3A71A 2BQPA 3JU9A 2ZGQA 2DUOA 5FREA 2DVAA 5T5LA 2DTWA 3AJZA 1N1TA 2NM1A 4FOWA 1WBLA 1NLSA 3HMYA 1INFA 3N7KA 3BEQA 5IK7A 1N1VA 1SLAA 4YZ1A 5H9RA 2VK6A 2R0FA 4WVWA 1DYKA 1UMZA 3N7JA 5T5PA 3AX4A 1JW6A 1YXWA 1V6NA 3D11A 1NXD1 4Q8LA 2XZKA 1ZA4A 3O0WA 4WEGA 1A4QA 3OJBA 2QWKA 5CA6A 4YM0A 4Y24A 2QWJA 3K37A 4UF7A 7NN9A 1VAMA 1SLLA 5JMCA 1NCAN 4XE9A 2ZMLA 1I1EA 3H71A 4M3CF 4MJVA 1LESA 2QWCA 2A6WA 1YIFA 3NV3A 1Y7BA 3ZSMA 4HZVA 4XJUA 1SBDA 5M1ZA 4NCSA 1W20A 3VKNA 3AJYA 1F31A 3MW2A 5CB7A 4QN6A 2HT7A 3POWA 1F5FA 1L7FA 1USRA 3IM0A 5H9SA 3OY8A 5HCAA 2WNEA 2PELA 4Y22B 2WJSA 3TI5A 4MC7A 3ZPYA 4JF7A 1DLLA 4BM8A 1IS3A 2WT0A 2D3SA 1G9DA 4AYUA 2VU9A 1Z4ZA 4MWWA 1KJRA 4M00A 3V0BB 4YG3A 1TEIA 1BZWA 3ZXEA 3U4XA 5GLVA 2W52A 2SLIA 2ZGOA 3USUB 3AFKA 5DUWA 1HQWA 1LHWA 1AXZA 5NN9A 3AP5A 2JDZA 5E88A 4GDIA 2VVZA 4DPNA 2VSKA 1LODA 2CTVA 2DV9A 1A78A 1IS5A 2QWDA 3RRDA 2DVDA 4BPZA 5JOYA 3BTAA 1ZM1A 4XMAA 1A14N 5EXOA 2YZ4A 1CONA 1LHUA 4FP3A 3WOGA 2WQZC 2GMPA 4NC5A 4ZXKA 2CL2A 4R9CA 3NWKA 3O12A 1JYIA 1NCBN 1IVDA 3SH3A 1WW7A 1V3CA 4XBQA 4Y1XA 4FJ6A 1IOAA 1UKGA 1MZ6A 1AJKA 1DQ1A 4CPNA 4YM1A 3H0OA 4CTEA 2VK5A 1V0FA 1QF3A 1N3QA 3RG0A 1NSDA 1AF9A 3WV6A 3VKMA 3BIWE 3IPVA 4B7QA 2EXIA 1NNCA 3WDYA 3WG2A 4AVSA 5F9TA 4QN7A 4IQPA 1DQ2A 1LU1A 1DBNA 4YM3A 4XJ9A 4AWDA 4GWMA 1ULCA 2GMMA 2QWEA 1PZ7A 1B9VA 1CN1A 3B9CA 4FPJA 1Z4XA 1J1TA 4NOTA 1JUIA 1E8TA 3INBA 1V3DA 2QWGA 2ZGLA 4YZ3A 1ENQA 3ZVXA 4BLJA 1E8UA 3ZSLA 1V0ZA 3FLRA 1WLCA 1IVEA 1V00A 4GKYA 3TIAA 1QNWA 2E53A 3WHTA 4M3CA 3UL2A 1EPWA 3PMEA 3SH5A 4ISQA 2AREA 2VW0A 2R16A 4K1YA 2JE9A 4K21A 2NMOA 4AVVA 2SILA 4XHBA 2D6OX 2ZA9A 4YW2A 2ZKNA 5BYNA 4GZOA 1WW5A 3GVKA 1AXKA 4PCRA 3W09A 2BF6A 4FPYA 4DRVA 4Q6KA 4K3YA 4HZXA 1D0HA 4MWUA 1L7GA 2D7FA 2W68A 1WCQA 1W6QA 3B3QE 1W6OB 5AVAA 3ZXLA 2ZHMA 1LECA 2DYCA 1CJPA 1BJIA 2BERA 4UW6A 3AZZA 4K1ZA 4GZSA 1FYUA 2E7TA 1RITA 1H9PA 1ENSA 1L7HA 4Q1RA 3SNMA 4D69A 3IN9A 2AEQA 2F29A 2OVUA 2A7AA 2ZHKA 1DGLA 1GBGA 1V2IA 1V6JA 1F9KA 1IS4A 1F8EA 3R4SA 1VCJA 4AGRA 1GSLA 1QU0A 2D6KA 3TICA 1NSCA 1SO7A 4GZTA 2NP0A 1MS9A 2OUHA 2KM2A 4FVKA 1QMJA 4P9YA 2ZGTA 1S1AA 4WV8A 1SLIA 2RKCA 4XZPA 2F28A 1LOBA 5CNAA 3W58A 3T2TA 2HYKA 2QWIA 3FUOA 4GA9A 1CESA 4DS0A 3LCPA 1Q8PA 3N3HA 4XILA 2RHPA 3ILNA 4M3CE 2D6PA 1WD4A 2W38A 4TYSA 1INXA 1G86A 3BOPA 4QN3A 4CPLA 4WVVA 1W6PB 1JBCA 2R1BA 1SCSA 1IVBA 1UPSA 1QGLA 2UWCA 4Y20A 2EXHA 1YI7A 3RMYA 1BQPA 1B9SA 3D4KA 1G7YA 2WSVA 1LGCA 1DQ6A 1GNZA 4UW3A 3V64A 4ATEA 1FX5A 4FOVA 5GALA 2PHWA 3T1LA 1LTEA 4XDQA 4GKXA 1MS3A 5F5QA 1CVNA 3H73A 6NN9A 4XJWA 2WKKA 1JOJA 3MW3A 1N3OA 1RIRA 2P3IA 2D44A 4M4VA 4I00A 4B7MA 1LOCA 4LBMA 2NZ9A 4FOQA 2F10A 5EYXA 1E8VA 4FZHA 2C5DA 2FMDA 5B2DA 1SFYA 3A0KA 2XG3A 2SIMA 3AYDA 1ULEA 2OW4A 1GKBA 4CPZA 3JU4A 2A6ZA 4DFSA 4FP2A 1CPNA 1QDOA 5SV8A 2CY6A 1V6IA 4WA5A 3FUQA 1N1YA 3N35A 2AYHA 2UURA 3WVJA 3K38A 4K20A 1O4ZA 2JD4A 1DQ5A 4XYXA 3B7EA 4WZFA 4YW1A 1IVCA 1KJLA 5B2CA 1G9CA 4XOGA 1BYHA 4XJAA 2HTUA 2W5NA 1AJOA 3VV1A 1Q56A 4Y26A 1MS5A 5T5OA 3W59A 2YDTA 1C1FA 2JJ6A 3WDTA 5DUUA 3UK9A 3HN1A 3SALA 3OYWB 2ENRA 3FLPA 4M4NA 1G9AA 2ZGMA 3JUUA 1S0BA 1VCUA 1NMAN 1UZYA 2YV8A 2PHTA 1UN1A 2XZIA 5DZFA 1AX1A 3SILA 1H30A 1ENRA 4GB1A 2VWDA 3K36A 5JYYA 2GNMA 4ATFA 4KS5A 4B7NA 2WT2A 3C2UA 5HUMA 1LHOA 3PVOA 5T50A 3ATGA 2ZB5A 2ES3A 1W0PA 1URXA 4M4UA 1FNYA 1A4GA 3WNXA 3PVEA 1Z78A 4H53A 2ZGPA 2Z42A 1KQRA 2ZABA 1DHKB 1F8CA 4MWVA 1VIWB 1W6NB 4MYEA 4C1WA 3AZXA 3UJOA 1Q8SA 4FPEA 2V73A 3OBTA 3TI6A 1S0JA 1FAYA 3B01A 2DU1A 4PBOA 4YZ5A 2F27A 4XHXA 2P34A 3APBA 1LEDA 4WA4A 2E51A 3RMXA 2NN8A 2R0HA 1INHA 2ZMNA 3B00A 3AK0A 3H6JA 4ASMB 3IKWA 3NV2A 3R05A 4K1JA 2ZGRA 3TI8A 1MS4A 2F13A 3ENRA 1W6MB 3ASIA 2YA5A 4LBQD 4XMIA 4YFWA 4KS3A 3QCWA 4Y22A 4LBOA 3PJQA 2P2KA 5CBLA 1NN2A 2PHXA 5E8AA 4GEZA 4K1KA 3VUOA 4HIZA 2UWAA 2ZGUA 3DUIA 2EXJA 3V0BA 3TI4A 2NMNA 2W08A 3V0AB 5KXCA 2QWAA 4YGCA 2ARXA 3USUA 4JCKA 4MWQA 1AZDA 1MS8A 4ISRA 2D43A 2WSUA 5GJ6A 2AUYA 2HU4A 4XBNA 2ZZJA 3OPZA 2D3PA 3H72A 1GZWB 1Z4VA 1SACA 5IK5A 1MVEA 1S0CA 4Y1VA 3AYEA 5H9QA 3ZYRA 5GLTA 3O9JA 5L73A 5HUKA 4XIOA 2DURA 1IKPA 2GNTA 2VSMA 1SLCA 4ZKTB 4XBLA 2AR6A 3WDXA 1FATA 4BBWA 1MZ5A 2F11A 1W0OA 2HTVA 2Q5TA 4D8SA 2DVFA 2A70A 4BMBA 2C4AA 3O0VA 5DZEA 2XCYA 1W6MA 2QWBA 2XB6C 2CMLA 3OBRA 5JVVA 3LSEA 4HANA 3RQ0A 1N47A 2TEPA 3WZ1A 1RINA 4XXPA 2V5YA 2HTWA 1A8DA 3TIBA 4SLIA 1LOAA 1LEMA 3AP9A 3ZXJA 1PZ9A 1UZZA 5E89A 3V0AA 1BXHA 3ZSKA 1QOOA 5JLVA 4Q2FA 3VKLA 1CR7A 3QLQA 2D6NA 2A3WA 1S0IA 2YROA 1SBFA 4GALA 3GNEA 2ZMKA 2CWSA 2ZBJA 2GN7A 1USXA 3AZVA 4HZYA 1YO8A 2VH9A 5T55A 3M2MA 3SISA 2BZDA 4FQZA 4BLIA 2A3XA 3LSDA 4HZWA 3L2YA 2UU8A 1GZ9A 2CNAA 1S0EA 1XOEA 1GV9A 4R9AA 4YW4A 5JDBA 1BKZA 3AP4A 2ZGKA 3D6EA 4YGBA 5GM0A 4DQAA 4FPOB 2EALA 1VLNA 4AVTA 2EIGA 1KITA 5IT6A 2W20A 2HT8A 2AEPA 4MZAA 3D12A 1W1XA 5DG1A 4FPCA 1C57A 4GWNA 2YA8A 4YFZA 2DVBA 1R1ZA 1B9TA 1CQ9A 2GN3A 4FPFA 1QOSA 3CL0A 1MACA 3BODA 3A4UA 4JRAA 1B09A 3VKOA 1W6OA 5T52A 1KDMA 1WBFA 3WCSA 3O5SA 3GVJA 3TB0A 4WEFA 4BQ1A 2VXRA 4M01A 5HX0A 1Z4YA 1G8WA 1QDCA 1WW4A 2SBAA 1LHVA 2NYYA 2CWMA 3K3AA 3NSSA 1SCRA 4GZWA 1GLHA 5CAZA 1DYPA 1SLBA 2ZHNA 4QN5A 2GMEA 4GZPA 2QWHA 1WLWA 3POYA 3SITA 4FQ4A 3CL2A 4YZ4A 2WT1A 3A72A 3AP7A 2D6MA 4P9WA 5DUXA 3WDUA 5GLUA 3OY8B 2GALA 3HR9A 4LBNA 4XXAA 3O0XA 3UJQA 3ALXA 1JXNA 1A3KA 3Q9OA 4YG0A 2HTYA 2ZHLA 1NSBA 3PVNA 1AXYA 5HUNA 1EURA 2F0ZA 1NNAA 1S0GA 1MWEA 3CKZA 3WUDA 2AENA 2DUQA 4Q26A 4R9DA 4BOWA 5KXBA 1H9WA 3IMNA 1IVFA 2G4IA 5DXDA 4YW3A 1Q8OA 2ZGSA 4MWLA 1BJQA 1MS0A 3WDVA 2HTRA 4CRQA 2JE7A 3AZYA 2R49A 3AXEA 4H52A 4MJUA 1W6PA 1G9BA 2WLQA 4W65A 5KXEA 1WUVA 1UX6A 2PHUA 4KS2A 3FLTA 4U36A 5GZFA 2ZB6A 4P14A 1HKDA 3CNAA 4CPOA 5IK4A 5GZDA 1W21A 4AGVA 1C4RA 4TZDA 1WCSA 4L8QA 2EXKA 4YGDA 2BATA 4FOYA 3NN9A 5EYYA 4C1XA 3ZYPA 2B8HA 1NMBN 3A0NA 1ULFA 2A6XA 3OGGA 4KS4A 4CPMA 4LBKA 1UAIA 3T1MA 3NV4A 4HZZA 1JN2P 1HLCA 4OZXA 1U0AA 3KQRA 4YW5A 1MR5A 1NMCA 2LTNA 2HT5A 2GNBA 4MWRA 3IPVB 2X9MA 4AGGA 3WLUA 3I4IA 5JOZA 3AXDA 1Z0HA 4DGRA 1HDKA 5HUGA 3GALA 1AX2A 4XJ8A 4PF5A 4PQ9A 4YZ2A 4R9BA 2VW2A 2B7YA 2VY0A 1O4YA 2A5ZA 4NN9A 1DQ4A 1QNYA 1XQNA 1DIWA 1LOGA 3KM5A 1MVQA 5IUQA 5H9PA 2P37A 3ZSJA 5GZGA 1LENA 2F26A 4JC1A 1V6KA 3B69A 1INGA 4UW4A 5DG2A 3ZXKA 4B7JA 1Q8QA 1WW6A 1JYCA 4CPYA 3FBYA 2HU0A 5HCBA 1LOEA 1FV3A 5GLZA 1IVGA 1V6LA 4LBQB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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