3SLIA

Leech intramolecular trans-sialidase complexed with 2,7-anhydro-neu5ac prepared by soaking with 3'-sialyllactose
Total Genus 182

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
182
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
IPEGILMEKNNVDIAEGQGYSLDQEAGAKYVKAMTQGTIILSYKSTSENGIQSLFSVGNSTAGNQDRHFHIYITNSGGIGIELRNTDGVFNYTLDRPASVRALYKGERVFNTVALKADAANKQCRLFANGELLATLDKDAFKFISDITGVDNVTLGGTKRQGKIAYPFGGTIGDIKVYSNALSDEELIQATGVTTYGENIFYAGDVTESNYFRIPSLLTLSTGTVISAADARYGGTHDSKSKINIAFAKSTDGGNTWSEPTLPLKFDDYIAKNIDWPRDSVGKNVQIQGSASYIDPVLLEDKLTKRIFLFADLMPAGIGSSNASVGSGFKEVNGKKYLKLRWHKDAGRAYDYTIREKGVIYNDATNQPTEFRVDGEYNLYQHDTNLTCKQYDYNFSGNNLIESKTDVDVNMNIFYKNSVFKAFPTNYLAMRYSDDEGASWSDLDIVSSFKPEVSKFLVVGPGIGKQISTGENAGRLLVPLYSKSSAELGFMYSDDHGDNWTYVEADNLTGGATAEAQIVEMPDGSLKTYLRTGSNCIAEVTSIDGGETWSDRVPLQGISTTSYGTQLSVINYSQPIDGKPAIILSSPNATNGRKNGKIWIGLVNDTGNTGIDKYSVEWKYSYAVDTPQMGYSYSCLAELPDGQVGLLYEKYDSWSRNELHLKDILKFEKYSISELTGQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
source organism Macrobdella decora
publication title The 1.8 A structures of leech intramolecular trans-sialidase complexes: evidence of its enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords INTRAMOLECULAR TRANS-SIALIDASE
total genus 182
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature ec 4.2.2.15: Anhydrosialidase.
pdb deposition date 1998-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02973 Sialidase Sialidase, N-terminal domain
A PF13088 BNR_2 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.220.10 Mainly Beta Beta Barrel Intramolecular trans-sialidase; domain 3 Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 3sliA03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3sliA01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 3sliA02
5E88A 5DZGA 3VKLA 3O9JA 6NN9A 3K36A 3M1HA 1CQ9A 5AVAA 4XJZA 3WUDA 3W59A 5FRAA 1A4GA 4R9DA 4XBNA 1WLWA 3ZXJA 3V65A 4J9TA 1L7FA 2CTVA 3BIWE 1V6KA 1S0CA 1XOGA 1A4QA 1V6NA 4JRAA 1C1FA 4F83A 2D6NA 5T5LA 1W20A 1V0FA 2I2SA 3DUIA 1ZA4A 2EF6A 3TI6A 1HDKA 2DURA 2UU8A 5GM0A 1GYKA 3ZSKA 1PZ9A 2CWMA 1Z50A 4AWDA 4YW2A 4FPFA 5IK8A 2D43A 4YGEA 1LOFC 1S0IA 3OYWB 3C2UA 3MW3A 5T5PA 3TICA 1KDMA 1LOGA 4HZWA 1GNZA 1S0JA 2TEPA 2Z42A 2VK7A 3ASIA 1SNTA 3ZYRA 1IS5A 1GZCA 3TIBA 2VSKA 3N7LA 4X4AA 1AXZA 1WW4A 4TZDA 1NNAA 4XJQA 2YA5A 2W39A 4HIZA 1WCSA 1DIWA 1IKPA 5E89A 1Z4XA 3L2YA 2GNMA 3VKOA 5T5JA 2YDTA 3RMXA 4FQZA 4QN3A 2XG3A 4BPZA 1WW6A 5IK4A 1D2SA 2A3YA 1HQWA 2XZJA 5JMCA 1C57A 1NSDA 2ZA9A 4DPNA 3AYCA 1Z0HA 1LESA 2F28A 5DUUA 3SH5A 1MS5A 1EURA 4WEGA 3ZSJA 2E6VA 4UW4A 3TI3A 1QNWA 1G9DA 1IVEA 2CMLA 2DV9A 3V0BA 3K38A 1AX1A 1LOCA 2G4IA 1EUTA 2A70A 1NMAN 2ZACA 1DIMA 4PBOA 1DBNA 1OQ1A 1AX2A 3WG1A 1FX5A 3POSA 2F12A 4D8SA 2ZHKA 3USUA 4Y22A 4CPLA 2SIMA 1LECA 4Q2FA 1KRIA 1SLCA 2ZABA 1UAIA 4YW4A 3D11A 3WDVA 4YG6A 3QLQA 5H9RA 5T50A 1GV9A 1SO7A 3TI5A 4UW3A 1CPNA 2P2KA 2HT8A 3V64A 2F11A 4K1KA 2A3WA 1MWEA 4LBOA 4ZXKA 1FV2A 2XB6C 1ENQA 1INVA 4WA3A 2D3RA 1Q56A 1JYIA 4K21A 5HX0A 3AYEA 1V3EA 2OUHA 3VUOA 1V3DA 4M00A 4QNPA 2R1BA 2W5NA 2VY0A 3M2MA 1LULA 5HUMA 2F0ZA 2CWSA 4YG3A 4MWWA 1UZYA 4W65A 4FPJA 4BM8A 2HTQA 2EXIA 4MWUA 5B2CA 2LALA 1KJLA 5GALA 4YGDA 3H71A 2VK5A 2UWBA 1AX0A 5CNAA 1J1TA 2YDPA 5CA6A 5DUVA 3W09A 1IVGA 2UWCA 3V0AB 5JOZA 4M3CF 1MACA 2ES3A 4RL7A 4MZAA 1LEDA 1DQ6A 5B2DA 4ISRA 2PHXA 2W5OA 4OZXA 3JUUA 1NSBA 4FPGA 3B9CA 4XJWA 2PHTA 2R0FA 1X50A 1BZWA 2GNBA 1W6NB 3SH3A 3WG2A 4GZPA 2QWBA 1MVEA 1SCSA 5T52A 3ZSLA 1SLIA 5BYNA 3GNEA 4ATEA 2ZMKA 4MWQA 4XXAA 2OW4A 5JVVA 2RHPA 1G86A 1U0AA 1JHNA 2WJSA 1QOTA 1Z4VA 3ALWA 2DTYA 5E8AA 2C5DA 4AVVA 1WD3A 4XJRA 4LBQD 5HUKA 2GNTA 4JC1A 1HQLA 1LHVA 4KS2A 3AK0A 1LEMA 1DYPA 1INWA 2UWAA 3B69A 1AJKA 4Q6KA 5IK5A 4XOGA 2E7QA 1BJIA 4GALA 2ARBA 2OUJA 3ALXA 2EXHA 2ZHLA 4Z8BA 4GZXA 2NMNA 2RKCA 2ZGUA 2YXSA 3ZVXA 1Y7BA 3WZ1A 3MPPG 4LBQB 2PHFA 5JYYA 2VVZA 1VLNA 1NCBN 2D3PA 4B7NA 4M3CB 2NYYA 4BBWA 1KITA 3PVNA 1V6JA 4GKYA 4BQ1A 5JOXA 4HZVA 4LBNA 1MVQA 4L8QA 2YA4A 2ENRA 3D4KA 5CB7A 2WLQA 2DVAA 1LTEA 2WSVA 2QWKA 2A6YA 2D3SA 5KXDA 4MX0A 1ULCA 1I3HA 1O4YA 2B8HA 4FPLA 4MJVA 1W6PB 5DG2A 2YA8A 1VAMA 4H55A 4XJ8A 1G8WA 1QKQA 4R9AA 4K1JA 3PJQA 3OYWA 4Y20B 2JJ6A 2YMZA 4BOWA 2ZGNA 4D69A 2D6PA 3HN1A 3WDTA 4XMAA 3M3EA 4K20A 4GJTA 4YLZA 4JCKA 1EUUA 3N3HA 4FPEA 4ATFA 3O0VA 2XZIA 4XILA 1CVNA 1ZM1A 1N1YA 1OKQA 2Q5TA 3FUQA 1BKZA 2GMPA 1SBDA 1QU0A 2OVUA 1VIWB 2CYFA 4GZSA 4HL0A 2ARXA 1GZWB 2VWDA 3OY8B 1JW6A 2AYHA 1INGA 1N3PA 2AH2A 3A71A 3B00A 3SISA 1H9WA 2P37A 1IVBA 1TEIA 1V6OA 1UL9A 1B9VA 1CPMA 4B7MA 3ILRA 3MW2A 1MS8A 4YZ2A 2HT7A 4MYEA 4Y1XA 2AEPA 1INXA 1W0OA 1Q8VA 4MWXA 4Y26A 4FVKA 2R49A 3R05A 1NSCA 2ZHNA 1W6QB 5IUQA 1SACA 1JUIA 1DHKB 3B3QE 1Q8SA 4M4UA 3K39A 2VK6A 1LU1A 3FLRA 1S0BA 4Y1VA 5T55A 1LGCA 2BQPA 1A78A 5GLZA 4MWJA 3AYAA 1KJRA 4GB1A 1ENSA 5EXOA 4MWLA 2EXKA 4ASMB 4DQAA 4YFZA 1R1ZA 3CYEA 1JYCA 1E8UA 1F8CA 1H9PA 2GMMA 1QOSA 3AJZA 3DGTA 2ZKNA 4NN9A 4K1YA 2ZGQA 4CZSA 3H73A 2HTVA 4MWVA 3B7EA 1Q8PA 2CL2A 2BF6A 2GN3A 1INFA 4BLIA 1V0ZA 3WVJA 1EPWA 3TIAA 4JF7A 2FHRA 1DQ2A 1WW5A 2QWAA 4Y24A 1URXA 2WT0A 2BZDA 4FQ4A 1AZDA 4Y1ZA 4CRQA 3N7JA 3NSSA 5JLVA 2NN8A 2VH9A 1B09A 1O4ZA 3R4UA 3WHTA 2PHRA 2QWJA 2ZHMA 2DVBA 1VCUA 3D12A 4GWMA 4H53A 1GBGA 3QCWA 3V0AA 3ZYPA 1LCLA 1KDKA 3SITA 4YGBA 2KM2A 4FOVA 1IS4A 1F5FA 1PZ8A 3AP5A 3O5SA 3TI8A 3U4XA 4WEFA 1B9SA 1S0FA 1W6NA 2GNDA 4B7JA 5SV8A 3I8TA 4LBKA 4XMIA 2GDFA 2P34A 1A14N 1VALA 2BATA 5NN9A 1W8NA 5GZGA 4WZFA 1B9TA 1MS3A 1AF9A 1JN2P 1NCAN 2SBAA 2QWFA 3T1LA 2YA6A 4CPNA 4CPMA 4MJUA 3A4UA 1LHOA 2DWRA 3IPVB 2QWGA 1SFYA 1FAYA 4YW1A 1AXKA 3WG3A 2EIGA 3GVJA 1QDOA 3AZYA 5H9QA 3M3OA 1FNYA 4LBMA 1BJQA 2HYKA 3D6EA 3SALA 4X49A 3T1EA 1WW7A 2P3JA 5T54A 3D5OA 2DU0A 4IQPA 4XXPA 1Z4ZA 4YM1A 1V3BA 5F5QA 3KM5A 4FVVA 4LBQA 5DUXA 1NNCA 3FLTA 4FPOB 5GLWA 5CAZA 2QWHA 1PZ7A 3IKWA 2D6MA 4M3CA 1IVDA 5JDBA 5HCBA 4XBQA 1IS3A 1WUVA 3WCSA 3AZZA 2E51A 2YY1A 1LENA 4R9BA 1F8DA 1UMZA 3BTAA 1SLLA 1DQ1A 3JU4A 1W0PA 4CPOA 4YM3A 4BMEA 2F13A 4FZHA 4UW6A 3M3CA 2DTWA 3Q9OA 4NO4A 1W6PA 1VAVA 4P9YA 2PELA 1MS0A 3LCPA 1USRA 1F8BA 3SANA 7NN9A 4U36A 4FPHA 2HU4A 3K3AA 4XDQA 4QN7A 1JXNA 1APNA 4Y20A 1DFQA 3RQ0A 2ZGOA 4C1WA 3NV4A 4DRRA 2SLIA 2DU1A 1DLLA 4M4NA 1N1SA 3ILFA 1WLCA 1QNYA 1XOEA 5M1ZA 5GJ6A 4FOWA 2DUOA 4SLIA 4GDIA 3M3QA 1G9CA 5HUNA 4WV8A 3TAYA 4B7RA 1GICA 4XTPA 2WT1A 2F24A 1LU2A 1GZWA 2LTNA 2D44A 1DILA 3BODA 2ZZJA 3OY8A 2DYCA 4GEZA 2C9AA 4GZWA 1N1TA 4WA5A 1YYNA 2WKKA 3UJOA 1G9FA 1NXD1 2P3KA 5EWSA 2DVGA 3K37A 4Q26A 3HR9A 3AP6A 3AFKA 1CN1A 3MW4A 4DRVA 4X6KA 1YRZA 3AZXA 3APBA 4M3MA 2B7YA 1ULEA 1MS1A 4YZ5A 4ITCA 3WUCA 2W20A 1F8EA 4U2AA 3FBYA 1WD4A 5IT6A 1GZ9A 1FATA 3SH4A 3BOPA 2VW1A 2HU0A 1QOOA 1WBFA 3ILNA 2R1DA 1QDCA 1W6QA 2HT5A 2AGSA 3H72A 2JDZA 3WDUA 1INYA 3OPZA 4KS1A 2CNAA 1LHUA 1XQNA 4KS5A 1AVBA 1C1LA 4Q1RA 4Q8KA 1OFSA 5JOYA 2A6XA 4XIOA 3KQRA 2GN7A 2F10A 2VU9A 5F9TA 4QN4A 1GANA 1LHNA 1ULDA 3RG0A 1UKGA 4FOYA 4QN5A 5DG1A 4AGVA 1FYUA 1NCDN 2VXRA 1GKBA 2A71A 2NP0A 1VCJA 1LOFA 4YGCA 1Z4WA 3PMEA 3POWA 4I30A 2C4AA 4Q27A 3CL0A 2R0HA 4WA4A 3AP4A 2R16A 3AXDA 2GMEA 4AVSA 4ZKTB 1MZ5A 2AEQA 2DUPA 2W52A 1N3QA 1LOEA 5GLTA 5CBLA 1MS4A 4FPKA 1HLCA 4KS3A 1UZZA 5IK7A 3NWKA 3UJQA 4AGGA 4HZYA 2A6ZA 2A7AA 3MEPA 3WDYA 1W6OB 2W08A 3O0WA 1ULGA 4I00A 5JOWA 1SCRA 1EUSA 2CY6A 3ENRA 2C4LA 4K3YA 4PCRA 2DVFA 2ZGTA 1IS6A 3IM0A 1ULFA 4XYXA 4WVWA 2HTRA 2D6LX 1E8VA 3SILA 2V5YA 4H52A 3WV6A 2QWIA 2A6WA 3OJBA 1LOBA 1NMCA 4GZOA 4AGRA 4KBBA 1MZ6A 4K1ZA 5HCAA 1G9AA 2EALA 1I1EA 1FNZA 1SLTA 3IPVA 1YXWA 3SLIA 2AR6A 4HZZA 2UURA 2JKBA 3ZXEA 4GZTA 3WOGA 3WLUA 2F29A 3N36A 5EYYA 3OBRA 3INBA 3N35A 4QN6A 1USXA 3HMYA 1W6MB 4XHBA 1V2IA 4AVTA 3N7KA 1CIWA 3ZXFA 1NLSA 1NMBN 2JECA 4XHXA 3JU9A 1GSLA 1N1VA 4DFSA 1SLBA 3RS6A 4MC7A 4CPZA 1AXYA 3PVOA 5HCFA 3ZXKA 5FREA 2A3XA 2F26A 3FUOA 3POYA 1UX6A 2JE9A 4TYSA 3SNMA 5DZEA 4RA0A 3WDWA 3NV3A 1RIRA 2HTUA 4CPYA 4FPYA 5L73A 3ZSMA 1S0DA 1FV3A 3T1MA 5KXCA 2VW0A 2YV8A 4XJ9A 1ENRA 2VUAA 1GNHA 3NV2A 1QMJA 2WT2A 1DGLA 1Z78A 2W68A 4PBPA 1CONA 3AJYA 3NV1A 3O12A 4P9WA 3CL2A 2NMOA 3AZVA 1GLHA 4ISQA 4M3CE 2VSMA 1NNBA 2HTWA 2DVDA 2F27A 4DGRA 1V3CA 1V6LA 3INAA 1DQ4A 1YI7A 4YM0A 1AJOA 1NN2A 3ZXLA 4YM2A 1UPSA 1Q8OA 2D6KA 1DQ0A 3GVKA 4LBJA 1MR5A 3VKNA 1IVFA 1LGNA 2DUQA 5GLVA 3LSEA 3I4IA 3WCRA 3VKFC 2GALA 1WLDA 1W8OA 4GA9A 4YZ4A 5DXDA 2XCYA 4Q1PA 1V6MA 3PVEA 4FPCA 3GALA 3RMYA 1INHA 1LJ7A 4FP3A 1YO8A 3WNXA 3ZPYA 5GZFA 4YFWA 2YROA 4GZQA 3VKMA 4YG0A 4R9CA 4MWRA 2P3IA 2VW2A 4K1IA 2XZKA 1CJPA 3LSDA 1LODA 2ZBJA 4NCSA 4YW3A 3TI4A 4M01A 4XJAA 1KQRA 3B01A 3R4SA 5EYXA 1H30A 3FLPA 1CESA 1F9KA 2HTYA 1A3KA 3ATGA 2D6OX 3CKZA 3VV1A 3N7MA 2ZB5A 2PHUA 3RSJA 1NCCN 2A75A 3H0OA 1QGLA 5KXEA 4M4VA 4XTMA 4P14A 4GKXA 4LBLA 3V0BB 3A72A 4UW5A 3UK9A 3WHUA 2AUYA 3AZWA 4GWNA 3A0KA 1DZQA 4XE9A 1A8DA 2ERFA 2AREA 2JD4A 1V0EA 1BXHA 2X9MA 4GDJA 2JE7A 4FOQA 1F31A 4B7QA 3AYDA 3USUB 4Y22B 2SILA 2QWCA 4XIKA 1L7GA 1RINA 2EXJA 4AYUA 2ZMLA 2WQZC 1MS9A 2YZ4A 1V6IA 3H6JA 1WBLA 1L7HA 4MZEA 2ZMNA 3BEQA 2AENA 5HUGA 4NC5A 4K1HA 1JOJA 1SLAA 3AP7A 1RITA 2A5ZA 4WVVA 3RRDA 1Q8QA 2PHWA 2F25A 3OBTA 1S0GA 1C4RA 2D7FA 1W6OA 3AXEA 2H0BA 4Y1YA 2E7TA 5GLUA 4BMBA 4FP2A 1BQPA 1IOAA 1LHWA 2ZGPA 3TB0A 3UL2A 1E8TA 1YIFA 1CR7A 1UN1A 1IKQA 1N47A 4X47A 5DZFA 4NOTA 4Y1UA 4C1XA 2ZGLA 2ZGRA 4KS4A 1DYKA 5GZEA 4HZXA 5GZDA 1ONAA 3GVLA 4HANA 1IVCA 3NN9A 2ZB6A 4PF5A 1SBEA 4YZ1A 3W58A 2ZGKA 3FFZA 5KXBA 5DUWA 4XZPA 3O0XA 1SBFA 4GXLA 2WNEA 5H9PA 5H9SA 1LOAA 1HKDA 4DS0A 1W6MA 2NZ9A 1DQ5A 1Z4YA 3IMNA 1LGBA 3A0NA 4UF7A 2NM1A 1N3OA 2A6VA 4MWYA 2ZGMA 4PQ9A 2ZAAA 1JBCA 1W1XA 2V73A 3CNAA 3T2TA 2EAKA 1S0EA 4CTEA 1G9BA 2FMDA 4XJUA 4BLJA 1QF3A 1S1AA 2ZGSA 5GZCA 3AX4A 3O9KA 4YZ3A 3IN9A 2W38A 4XBLA 1G7YA 2E53A 3WG4A 1W21A 2QWEA 4P9XA 5T5OA 4Q8LA 1WCQA 3WDXA 4FJ6A 2QWDA 1V00A 2YA7A 1BYHA 3AP9A 5LK5A 1D0HA 2BERA 2WSUA 4YW5A 3OGGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5GX3A 3K51A 2ETEA 5DZGA 5E88A 4AI3A 1PO21 3VKLA 5C3RA 3O9JA 4DG6A 4UFHA 3RZZA 6NN9A 4MADA 3K36A 1D0GA 3M1HA 1CQ9A 2AC1A 5FJHA 1W3VA 1ZRFA 3JBG1 2WZ8A 4LULA 4RQPB 3TNPB 1OFZA 2VOXA 5AVAA 3VBFC 4NIHA 3BIEA 3A9GA 5LA2A 4XJZA 3WUDA 3W59A 5FRAA 4L2NA 4TLFA 1A4GA 4Q0PA 2WFF1 4R9DA 1H2MA 4XBNA 1WLWA 2ZX3A 5FMBA 1PM7A 4OLLA 2QUOA 5FZ6A 1WA4A 3KVBA 3ZXJA 1OD5A 1S2KA 4M0NA 1UY3A 3V65A 2WLPA 4J9TA 1ACCA 1L7FA 3S8VA 2CTVA 1NUKA 5CU1A 3BIWE 5LA9A 1R1A1 5IAXA 1UOJA 4QKNA 1V6KA 1S0CA 1XOGA 4CXXA 1JUHA 2DCYA 3E6BA 5GX4A 1A4QA 5I0DA 1V6NA 4X6QB 4JRAA 4KMQA 1C1FA 3AVSA 4GN7A 1TG7A 1RUC3 4CPBD 4F83A 4MGTA 3D3AA 4IW3A 3AMNA 4Z92B 2QE3A 4FFGA 3HWJA 2Q1FA 2W87A 2D6NA 1WCUA 5T5LA 4JTNA 1VE0A 1HIXA 1PM4A 1YJKA 3BB6A 1V0FA 1W20A 4V1PA 2DF7A 5ACA2 1U6DX 1V04A 2I2SA 3B7MA 3DUIA 4IEPA 3RYPA 5C9AB 1ZA4A 5AC91 2EF6A 3NJVA 4G3YC 4R8HA 5LRSA 3TI6A 1HDKA 2DCZA 2DURA 1YLLA 1SG3A 2UU8A 1QHDA 2HWF3 4FTEA 3UV9A 4D7SA 5A7WB 5C7GA 2RDQA 4C1YB 2A73B 5GM0A 5BUVA 1GYKA 3ZSKA 1GNYA 1O3RA 1CRZA 2RDRA 1PZ9A 2VZOA 3GBFA 2BVVA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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