3SLIA

Leech intramolecular trans-sialidase complexed with 2,7-anhydro-neu5ac prepared by soaking with 3'-sialyllactose
Total Genus 182
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
182
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
IPEGILMEKNNVDIAEGQGYSLDQEAGAKYVKAMTQGTIILSYKSTSENGIQSLFSVGNSTAGNQDRHFHIYITNSGGIGIELRNTDGVFNYTLDRPASVRALYKGERVFNTVALKADAANKQCRLFANGELLATLDKDAFKFISDITGVDNVTLGGTKRQGKIAYPFGGTIGDIKVYSNALSDEELIQATGVTTYGENIFYAGDVTESNYFRIPSLLTLSTGTVISAADARYGGTHDSKSKINIAFAKSTDGGNTWSEPTLPLKFDDYIAKNIDWPRDSVGKNVQIQGSASYIDPVLLEDKLTKRIFLFADLMPAGIGSSNASVGSGFKEVNGKKYLKLRWHKDAGRAYDYTIREKGVIYNDATNQPTEFRVDGEYNLYQHDTNLTCKQYDYNFSGNNLIESKTDVDVNMNIFYKNSVFKAFPTNYLAMRYSDDEGASWSDLDIVSSFKPEVSKFLVVGPGIGKQISTGENAGRLLVPLYSKSSAELGFMYSDDHGDNWTYVEADNLTGGATAEAQIVEMPDGSLKTYLRTGSNCIAEVTSIDGGETWSDRVPLQGISTTSYGTQLSVINYSQPIDGKPAIILSSPNATNGRKNGKIWIGLVNDTGNTGIDKYSVEWKYSYAVDTPQMGYSYSCLAELPDGQVGLLYEKYDSWSRNELHLKDILKFEKYSISELTGQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The 1.8 A structures of leech intramolecular trans-sialidase complexes: evidence of its enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Macrobdella decora
molecule keywords INTRAMOLECULAR TRANS-SIALIDASE
total genus 182
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature ec 4.2.2.15: Anhydrosialidase.
pdb deposition date 1998-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02973 Sialidase Sialidase, N-terminal domain
A PF13088 BNR_2 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.220.10 Mainly Beta Beta Barrel Intramolecular trans-sialidase; domain 3 Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 3sliA03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3sliA01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 3sliA02
1GSLA 2A71A 2YZ4A 3POWA 1VIWB 1F8DA 4GZTA 4XBNA 3N3HA 3A4UA 5L73A 2ZB6A 4MZAA 4MX0A 5GLUA 1AXKA 2W52A 1LGBA 1UX6A 2OUJA 1NSBA 4HANA 1I1EA 3SNMA 2BQPA 4K1JA 2WJSA 3K36A 2R1DA 1V3EA 5T5PA 3NV3A 4Q8LA 1ULGA 2ES3A 4GZQA 2BZDA 2A6ZA 1LCLA 5DZFA 4FJ6A 4BOWA 1LTEA 1QMJA 3UJOA 4ZXKA 1U0AA 2WT1A 4XYXA 3VKFC 1Z4ZA 3APBA 1SLLA 1Y7BA 1QKQA 2LALA 2GMMA 4K1ZA 4FP3A 4P9YA 2CWMA 1G9DA 1Q8QA 5GM0A 4UW6A 4H52A 5SV8A 4Q26A 2ZGLA 3NV1A 4XOGA 4Y1UA 1WW7A 2SLIA 1NNBA 4GDJA 2WLQA 3VUOA 4MWWA 2P2KA 4XJQA 4M3CB 5B2CA 3OPZA 5KXBA 5IK5A 1DQ2A 2ZGMA 1DYKA 4GKXA 1MWEA 2DVDA 4DQAA 4UW5A 3AZZA 2HYKA 5IK4A 3ILFA 1KITA 4U36A 1PZ7A 3NN9A 1ENQA 1HQLA 4LBQD 1KJLA 2DUQA 3W09A 1LHOA 5FREA 2VK6A 5LK5A 4AGVA 1L7FA 2VW0A 4MJVA 4FOQA 3PJQA 4FPYA 3I8TA 1LULA 5IK7A 1S0EA 4WA5A 5HUGA 4RA0A 1MS1A 3DGTA 4ATEA 3SLIA 2P3KA 2HT7A 3WDVA 2ZGTA 5HX0A 1JUIA 2E7TA 2ARBA 2W68A 1OKQA 3R4SA 1BJQA 2C9AA 1GKBA 2DYCA 2NN8A 2H0BA 1Z78A 2JD4A 4BMBA 1E8TA 5H9RA 5JLVA 3IN9A 3RQ0A 5F5QA 1GV9A 1QNYA 4BM8A 2HTWA 1ENSA 2QWEA 5HUKA 1MS9A 3HR9A 5DUVA 3L2YA 1TEIA 5GLTA 3UJQA 4YLZA 1WLWA 1F9KA 2DTYA 1GYKA 3FUQA 2ZGOA 3BEQA 5E89A 3LSEA 2GN3A 4K1IA 1YIFA 2ERFA 2ZAAA 3O0WA 3VV1A 1NSDA 4AGGA 1AVBA 1WCQA 4NOTA 4K1YA 4NO4A 4XJRA 2ENRA 3BOPA 1AXYA 1SO7A 4GZWA 3AX4A 3AZWA 3O0VA 1NNAA 5JOXA 1MS8A 3MW3A 3M3QA 2F0ZA 1NMCA 4FZHA 4AVSA 1Z50A 4D69A 4Y20A 3TICA 1NMBN 2NP0A 5GJ6A 2AENA 1Z4XA 4XHXA 4FOVA 2RKCA 4SLIA 3ATGA 3B3QE 1SACA 1NCAN 3SH5A 1WBLA 3B9CA 5T55A 1AX2A 2D6KA 1HQWA 3RMYA 2ZMLA 2HTYA 3OBTA 2AH2A 4Y1XA 3T1LA 5T52A 3AZXA 3WHTA 2P3JA 4YW5A 1IS3A 5E8AA 1JN2P 1UMZA 4MWUA 3AZYA 3AYEA 4YGDA 2DV9A 1EPWA 1W0OA 2GNDA 5EXOA 3BTAA 4AVTA 3R05A 2YDTA 3SANA 2A3XA 1YI7A 3WG4A 1CESA 3TI3A 3N36A 2A3WA 3V65A 4WEFA 1V6NA 4CTEA 1W6NB 4Q2FA 1C4RA 2XZJA 2PHWA 2ZZJA 4FPJA 3V0AA 3AP6A 2R1BA 3SILA 4M3CA 1A3KA 2R49A 2HU0A 1QDOA 4B7RA 4PBPA 3TI6A 3IPVB 2YA6A 2D6PA 1BQPA 2EXIA 1CVNA 4BBWA 2YA8A 3ZXEA 1WBFA 1IVDA 2ZHMA 5FRAA 5JMCA 3GNEA 2E53A 4CRQA 4I30A 4ISQA 4R9BA 1S0JA 1G9FA 5KXDA 4WA3A 4GA9A 2GALA 5CAZA 3WDYA 4C1XA 4DPNA 4YM1A 2B8HA 1IOAA 1GICA 1MS5A 3MW2A 3B01A 1V6IA 3MEPA 2CYFA 1LODA 4Y1ZA 4Q1RA 2YXSA 1AX0A 1F5FA 1INVA 1WUVA 2YY1A 2NM1A 2CTVA 3RSJA 5T50A 1DBNA 1GZCA 4M3CE 1DYPA 3ZYPA 4HZYA 2UWAA 4JRAA 1NCBN 3SH4A 4KS1A 1KDKA 1SLBA 4DRVA 1OFSA 1O4YA 2CL2A 5NN9A 1A8DA 2A5ZA 6NN9A 5JYYA 1A14N 1NSCA 4YG3A 1V6JA 1UL9A 4M01A 1Z0HA 1DQ6A 2GNMA 1LGCA 2D44A 2ZHNA 3ZPYA 2ZHKA 1CPNA 2VSKA 1NCCN 4FPOB 3A0KA 4XJZA 4JCKA 4F83A 2A6XA 1F8CA 4YM3A 3ZXKA 5IT6A 1QNWA 2EF6A 4BLJA 1N1YA 2UWBA 4AGRA 2CWSA 4YGEA 1SBFA 4ATFA 3OGGA 3V64A 2ZBJA 3ZSJA 3K39A 4Q27A 1W6PB 4Y1YA 1YXWA 4NCSA 4X47A 1LGNA 1UPSA 1AF9A 2VW1A 1YRZA 1CR7A 1BJIA 4K1KA 4XZPA 1V00A 4B7NA 3TI5A 5B2DA 2ZA9A 3WUDA 3PMEA 2GMEA 3WG2A 4FVKA 1LOBA 1C1LA 4HL0A 3B7EA 2HTQA 1LECA 4FPLA 2DVFA 1O4ZA 1QU0A 2G4IA 4FOYA 3VKNA 4XILA 3T2TA 3UL2A 3O9JA 3PVEA 4FPGA 4XE9A 2E6VA 1IVGA 2C4AA 5IK8A 2DU1A 3CL0A 4B7MA 2QWFA 1VAMA 2ZMKA 4AWDA 4WEGA 2CY6A 1F8EA 3MPPG 2V5YA 4YFZA 1USXA 2XG3A 1SLAA 2YA4A 1W6NA 1UZZA 1BZWA 4P9WA 2XB6C 1A4QA 2NMOA 4M3MA 5EYYA 1RIRA 5JDBA 2GMPA 3H71A 3VKLA 2QWJA 1CIWA 5GZDA 3IPVA 1G9BA 1G7YA 3V0AB 1RINA 2A7AA 1SNTA 1X50A 3WNXA 3H6JA 1VAVA 3O5SA 3M2MA 1IS6A 2NZ9A 1PZ8A 5GZGA 2D6MA 1WCSA 4GZSA 3N35A 2C4LA 3NV2A 1CN1A 2GNBA 3WV6A 3HMYA 3AP5A 1W8NA 2OW4A 2SIMA 1HDKA 2E7QA 1ULCA 3VKOA 1WLCA 5T54A 1SLCA 1H9WA 2P34A 2EALA 1CONA 4PCRA 3AYCA 1H9PA 3CNAA 2QWHA 5GLVA 4B7JA 4XTPA 3M3EA 2A6WA 1Q8PA 1Q8OA 2F27A 1SLTA 3TIAA 3ZXFA 4CPMA 1LHNA 1FV3A 3TI8A 4L8QA 3O9KA 4YG6A 5AVAA 2XCYA 4WA4A 1Q8VA 1MZ6A 3IMNA 4DS0A 5T5LA 2UU8A 2VWDA 2DWRA 3AXEA 5DUWA 2F13A 3PVNA 4R9AA 3OJBA 1Q8SA 1V0FA 2JJ6A 1IVBA 4UW4A 1LOAA 1LENA 1WD4A 3T1MA 2ZHLA 1D0HA 5HUMA 2JE9A 3SALA 4FOWA 3GVLA 1JBCA 2DVAA 3TAYA 2D7FA 2D6NA 1ULFA 1CPMA 3IKWA 3GVKA 1MS0A 4X49A 1SCSA 2ZMNA 1LU2A 1KJRA 2YMZA 4M3CF 2SILA 4FPHA 4FPKA 4MZEA 1DZQA 1HLCA 1ONAA 3WHUA 4U2AA 1JOJA 3AYDA 2HT5A 2WKKA 5H9SA 4H53A 4YM0A 1N1TA 2F11A 4GZOA 1LOFC 1FAYA 4GWMA 5KXCA 1W6OB 4WZFA 3SISA 5HUNA 1W6PA 1INGA 2F29A 5CNAA 1DILA 1V3DA 1N3QA 4ZKTB 1XOGA 2W5OA 4HZVA 3WDTA 2BATA 2JKBA 3LCPA 3WG3A 2AGSA 1V6KA 1JYIA 2E51A 4MC7A 2DURA 3RS6A 3ZXLA 4LBJA 4JF7A 1KRIA 2ZKNA 5DUUA 2ZACA 2F25A 3WDWA 2RHPA 5T5OA 2W38A 4QNPA 1EURA 3CKZA 5CA6A 4XHBA 2ZABA 3H0OA 5JOWA 2QWIA 2D3RA 4BQ1A 1INXA 3OYWA 2VU9A 2AR6A 4GDIA 4FPEA 2EXHA 4Q1PA 1N1VA 3GVJA 1USRA 5DG2A 3AFKA 3TB0A 1LHWA 2Z42A 1FV2A 4YZ1A 3WVJA 2VW2A 2F10A 2JECA 2ZGRA 3WZ1A 1SBDA 2YROA 2A6VA 1ULEA 4WVWA 3JU9A 2PHTA 5F9TA 4Y22B 3FUOA 3A71A 4MWLA 2YDPA 4DFSA 3AK0A 2FHRA 2I2SA 1MVEA 3D12A 4GJTA 2ZB5A 4XIOA 1C1FA 4GXLA 2YV8A 1MACA 1APNA 2P3IA 3INBA 2WQZC 2VUAA 5T5JA 1B9VA 1V6MA 1Z4VA 1VALA 4ISRA 4KBBA 1LESA 1S0CA 1A78A 2VK5A 1WW6A 4KS4A 3FLPA 4XBLA 1Z4YA 3ALXA 3RRDA 4YFWA 3WCRA 3K38A 1G86A 4LBLA 4YZ3A 4XJAA 2F26A 4J9TA 4Q8KA 3H73A 3D6EA 3D4KA 4WVVA 3M1HA 3SH3A 1DIMA 4FPCA 2QWDA 5GZFA 1MZ5A 5H9QA 5HCAA 4MWVA 3NSSA 3KQRA 1IS4A 3V0BA 4YW3A 3W59A 3ZYRA 3FBYA 2D3PA 2DTWA 3C2UA 2V73A 2ZGSA 1W6MB 5M1ZA 2UWCA 1MS3A 4CPOA 3NV4A 3M3CA 4K20A 5JOYA 4PBOA 4YM2A 2C5DA 1PZ9A 4CPYA 1WW5A 2PHFA 1ZA4A 1F8BA 1QF3A 2WSUA 4QN4A 2A3YA 3LSDA 3OBRA 2HTUA 2HU4A 3ZSMA 4DRRA 1WW4A 2EXKA 3RG0A 3IM0A 3AZVA 4CPLA 1DQ0A 1W20A 2SBAA 4I00A 2VK7A 2XZKA 2PHRA 3N7JA 4XMAA 3AXDA 3AJYA 1B9TA 4KS5A 2PHUA 3ILRA 3T1EA 4LBMA 1W6OA 4TZDA 1ZM1A 4KS2A 3JUUA 1AJKA 2GNTA 2HTVA 5BYNA 3R4UA 4NC5A 1SFYA 2JE7A 4CPZA 1VCUA 2R16A 2D3SA 4YG0A 1MVQA 1V3CA 2R0FA 3CYEA 3WDXA 3Q9OA 4Y1VA 2AUYA 1GZWB 2F24A 1DLLA 4YW2A 5DZGA 4GEZA 4UF7A 4MWXA 1N47A 4AVVA 4PF5A 3AYAA 3N7KA 2DUOA 4MYEA 4TYSA 4MWRA 4X4AA 4LBKA 4K21A 1SBEA 1J1TA 3TIBA 2QWCA 1XOEA 1V6OA 3OYWB 2YA5A 2R0HA 1GANA 1L7HA 2W08A 5GZCA 5JOZA 1DIWA 1FNZA 4GB1A 2DU0A 1W1XA 1G9CA 4Y22A 2B7YA 1W6QA 1IKPA 1UZYA 2X9MA 3FFZA 1QGLA 4WV8A 1YO8A 4MWJA 4HZXA 4GKYA 2VVZA 4OZXA 5DZEA 1AZDA 1IVEA 1D2SA 3I4IA 4R9DA 2OVUA 1JYCA 1QOTA 1V0EA 3D5OA 3VKMA 1WLDA 3TI4A 4MWQA 4P14A 2KM2A 3KM5A 4CZSA 2GN7A 1A4GA 1AJOA 3OY8B 3QLQA 2P37A 2VY0A 4XDQA 3WLUA 1W8OA 4XMIA 1W21A 1E8VA 1S0DA 4BLIA 1IVFA 1FNYA 4LBQB 1XQNA 4FQZA 4UW3A 4FPFA 1E8UA 3SITA 1S0FA 3BIWE 3U4XA 1FX5A 1LU1A 1CJPA 1L7GA 4QN5A 4M4NA 1S0GA 5H9PA 3USUB 4Q6KA 4P9XA 1W0PA 1LJ7A 2AREA 1BYHA 2WNEA 2A75A 1NNCA 1DQ5A 3INAA 2ZGNA 4ASMB 2PHXA 2BF6A 3MW4A 5DUXA 4HIZA 4DGRA 1INFA 3K3AA 5DXDA 1W6MA 3PVOA 3V0BB 1IS5A 3ZSKA 4XXAA 4K1HA 2D6LX 2PELA 1LEMA 1LOGA 1JXNA 4FQ4A 4ITCA 3O0XA 4XJ8A 3B00A 1LOFA 3ZSLA 4QN7A 4XIKA 1LHUA 1LOEA 7NN9A 1INHA 5IUQA 2VSMA 3ILNA 4XJ9A 1GNHA 1QOOA 4M4UA 4QN3A 4B7QA 2EAKA 2EXJA 5E88A 5JVVA 4YZ5A 4Y24A 2UURA 1SCRA 2ZGUA 4YZ4A 1IKQA 2GDFA 3ENRA 2VXRA 2DVGA 1AX1A 1B09A 2A6YA 3WOGA 1WD3A 3BODA 1S1AA 4K3YA 1GZ9A 3WG1A 2WT0A 4BMEA 4BPZA 4GALA 4XBQA 2OUHA 4HZWA 1GZWA 3GALA 4LBOA 4KS3A 1B9SA 1FYUA 3RMXA 5EYXA 3AP9A 3B69A 1ULDA 3ASIA 4M4VA 3H72A 1S0BA 3JU4A 4Y26A 2WT2A 2ZGQA 1BKZA 3M3OA 4H55A 3FLTA 1DFQA 4YGBA 1URXA 1Q56A 1BXHA 2D43A 4M00A 4RL7A 3DUIA 1UN1A 3WDUA 2QWKA 4CPNA 2NMNA 3N7MA 1DQ1A 1EUUA 3O12A 2TEPA 3WCSA 2ZGPA 1YYNA 1F31A 2VH9A 2FMDA 2AEPA 1OQ1A 3A72A 1NLSA 1DGLA 1VCJA 1W6QB 1N1SA 3UK9A 5GZEA 2F12A 1RITA 1HKDA 1SLIA 5CB7A 4JC1A 2CMLA 1V0ZA 4YZ2A 1IVCA 4HZZA 2W20A 1V3BA 3OY8A 1VLNA 4XTMA 5GLWA 2AEQA 1H30A 2NYYA 4NN9A 2EIGA 1NN2A 1QDCA 3POYA 2YA7A 2LTNA 2QWGA 1MR5A 4GWNA 4LBQA 3N7LA 1S0IA 1JW6A 3ZXJA 4QN6A 5GLZA 3POSA 4XJWA 2W5NA 3USUA 2DVBA 4GZXA 1DHKB 1ENRA 1FATA 3W58A 1C57A 2AYHA 1MS4A 3AP7A 5KXEA 1LHVA 5GALA 1INYA 4C1WA 4YW1A 1GBGA 1GLHA 1Z4WA 2HTRA 2Q5TA 1R1ZA 4AYUA 2BERA 1EUSA 5HCFA 4GZPA 4IQPA 2ZGKA 4X6KA 1QOSA 3NWKA 1UAIA 2QWBA 3AP4A 2A70A 4W65A 2DUPA 2WSVA 3FLRA 2D6OX 1GNZA 2QWAA 1I3HA 1N3PA 1AXZA 3D11A 4XJUA 2HT8A 5HCBA 1CQ9A 3ALWA 3A0NA 4FP2A 4FVVA 4YGCA 1G9AA 1NXD1 3HN1A 4R9CA 1V6LA 4YW4A 2F28A 3QCWA 2JDZA 3CL2A 4Z8BA 5EWSA 1LEDA 1UKGA 1EUTA 2CNAA 4XXPA 1G8WA 4MWYA 2W39A 1DQ4A 1NCDN 1INWA 3K37A 1NMAN 4D8SA 1KDMA 2XZIA 5CBLA 1LOCA 5DG1A 1V2IA 3AJZA 2ARXA 3WUCA 1KQRA 1N3OA 4PQ9A 1JHNA 4Y20B 4MJUA 4LBNA 3ZVXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GSLA 1NLRA 4J9TA 2A71A 2DG1A 2YZ4A 3POWA 2R063 5L7OB 1VIWB 5CKNA 3N9OA 1O3TA 3GGLA 2IVJA 4K7JA 3VB9A 1F8DA 4GZTA 3U37A 5FZJA 4XBNA 3CJIC 3N3HA 1OLQA 5FY4A 3OEBA 3WD5A 1C8NA 2W46A 1ZZ8A 4V2WA 3A4UA 4XABA 4FTSA 4NPMA 1JH5A 3PNAA 4JMLA 4RR3A 5L73A 2ISMA 2G19A 2ZB6A 4MZAA 2W1QA 4LHSA 3KYAA 4MX0A 3ZN6B 4OI1A 3M4FA 5LBEA 1YHFA 1AYM2 1ZBE1 3OGJA 2NLRA 5GLUA 5KHGA 1ASJ3 1AXKA 1TNRA 2VCMA 4S2GA 5EPAA 4LJHA 2W52A 1LGBA 1UX6A 1YIPA 2OUJA 2XBO3 3ZYBA 4HANA 4A6SA 1NSBA 1FXZA 2Z5WA 2ZJCA 1VBC2 3FHAA 4YVSA 5FXWA 3SNMA 1I1EA 4OUMA 3KZ4C 1JUHA 1ZYBA 2BQPA 1RWLA 3KGLA 4K1JA 2WJSA 1VPHA 2XWBB 4CU8A 5IYYA 3K36A 1TG7A 3UV9A 4Y33A 1ZRRA 2R1DA 4UXAA 3JBG1 5F5AA 4B29A 1V3EA 4IFLX 3GZTB 4QU1A 4PLOA 5T5PA 2I07B 4XFAA 1RUE1 5FNQA 1FI2A 3NV3A 2KR2A 4YVWB 4D6RA 3O7OA 2RDQA 4CCLA 1AYN2 4XUNA 3RZKA 1E5IA 3N9MA 4R52A 1J3QA 4Q8LA 1ULGA 2VE1A 3PHMA 1NCQA 2ES3A 3GBWA 3OCPA 1C3HA 4GZQA 1JYNA 3I2DA 1PHMA 3TEWA 4RHV2 1SDDB 2QQKA 2VNVA 3J7LA 4Z2WA 2V4VA 2WAOA 5GX1A 4CUBA 3KT1A 4AOCA 1PIV1 2FP9A 2BZDA 2H2NA 4BQYA 1WCUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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