3SLIA

Leech intramolecular trans-sialidase complexed with 2,7-anhydro-neu5ac prepared by soaking with 3'-sialyllactose
Total Genus 182
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
182
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
IPEGILMEKNNVDIAEGQGYSLDQEAGAKYVKAMTQGTIILSYKSTSENGIQSLFSVGNSTAGNQDRHFHIYITNSGGIGIELRNTDGVFNYTLDRPASVRALYKGERVFNTVALKADAANKQCRLFANGELLATLDKDAFKFISDITGVDNVTLGGTKRQGKIAYPFGGTIGDIKVYSNALSDEELIQATGVTTYGENIFYAGDVTESNYFRIPSLLTLSTGTVISAADARYGGTHDSKSKINIAFAKSTDGGNTWSEPTLPLKFDDYIAKNIDWPRDSVGKNVQIQGSASYIDPVLLEDKLTKRIFLFADLMPAGIGSSNASVGSGFKEVNGKKYLKLRWHKDAGRAYDYTIREKGVIYNDATNQPTEFRVDGEYNLYQHDTNLTCKQYDYNFSGNNLIESKTDVDVNMNIFYKNSVFKAFPTNYLAMRYSDDEGASWSDLDIVSSFKPEVSKFLVVGPGIGKQISTGENAGRLLVPLYSKSSAELGFMYSDDHGDNWTYVEADNLTGGATAEAQIVEMPDGSLKTYLRTGSNCIAEVTSIDGGETWSDRVPLQGISTTSYGTQLSVINYSQPIDGKPAIILSSPNATNGRKNGKIWIGLVNDTGNTGIDKYSVEWKYSYAVDTPQMGYSYSCLAELPDGQVGLLYEKYDSWSRNELHLKDILKFEKYSISELTGQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The 1.8 A structures of leech intramolecular trans-sialidase complexes: evidence of its enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords INTRAMOLECULAR TRANS-SIALIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Macrobdella decora
total genus 182
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature ec 4.2.2.15: Anhydrosialidase.
pdb deposition date 1998-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02973 Sialidase Sialidase, N-terminal domain
A PF13088 BNR_2 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.220.10 Mainly Beta Beta Barrel Intramolecular trans-sialidase; domain 3 Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 3sliA03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3sliA01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 3sliA02
3AJZA 2WJSA 2A3YA 4U36A 4Q1PA 1JW6A 4GKYA 3NWKA 3T1EA 3IM0A 2VW0A 1RINA 1Z4YA 5E89A 2X9MA 5NN9A 4YW2A 1C1LA 3RRDA 4B7RA 1AVBA 1DYPA 3APBA 4UW6A 3H71A 1VCUA 4MZEA 2QWEA 1NMCA 4LBLA 4Y1ZA 1ENSA 4Q1RA 2NN8A 3BTAA 2GNDA 4I30A 5GLZA 4R9BA 1S0DA 1Q8PA 1L7FA 2JDZA 1LOCA 3ZSKA 2ZHLA 2UWAA 4ZXKA 2GMPA 1LOAA 2W39A 2ZB5A 1LTEA 2ZHKA 3ZXJA 2AEPA 1DQ1A 4Q2FA 6NN9A 3BOPA 1MS1A 3WCSA 1SBEA 1LOBA 2NMOA 2ENRA 5KXEA 3TI3A 4F83A 4K1IA 5T5JA 1N1SA 5GZCA 1FYUA 2UURA 4WVWA 2VSKA 4GXLA 2DVFA 4FQ4A 4BMEA 2P2KA 2ZMKA 1INWA 2ZMLA 5GLUA 2EF6A 1KDMA 4K1KA 4GJTA 1G9BA 1V6NA 1WBLA 1ULCA 4HZVA 3AZZA 4WA5A 4YM0A 1F8DA 3GNEA 4GDJA 1QOOA 2TEPA 2FMDA 3INAA 3N7JA 2W5NA 1DQ4A 3K37A 4M3MA 3AP9A 1W1XA 3R4SA 1LULA 1Q8QA 1NSDA 4FJ6A 4MWWA 1N47A 3M3QA 1IKQA 4OZXA 2DWRA 2P37A 1BQPA 4BM8A 2YA4A 2E51A 1EURA 1LOFC 1O4YA 1D0HA 4FVVA 4IQPA 2HTWA 1WLCA 5BYNA 1LENA 1W6OA 4PQ9A 3OYWB 2JJ6A 3TIAA 1URXA 2W52A 1APNA 1GBGA 3T1MA 1QOSA 3V0AB 3WUDA 4Y1YA 4FQZA 3LSEA 1N3OA 3ZXKA 1DQ6A 2FHRA 1GANA 1C57A 3TB0A 1CPNA 3USUB 4BOWA 2SIMA 1V0EA 5CNAA 2GALA 2VUAA 1AXYA 4XJZA 2QWHA 1KQRA 3WVJA 4I00A 2BQPA 5GLTA 1GICA 5CB7A 1G8WA 5GZGA 2E7TA 3MEPA 2YA5A 1W6QA 3GVKA 1QDCA 1QU0A 4YW5A 1LHNA 1NSBA 2JECA 1BZWA 3WOGA 1S0CA 1N3PA 2VVZA 4MWVA 1QNWA 3WG4A 4BQ1A 2Q5TA 2OUJA 3ATGA 4FOWA 1A8DA 3AYAA 1LODA 2ZB6A 4C1WA 2OUHA 4ISRA 1SNTA 4X49A 2KM2A 3ILFA 3ALWA 3CL2A 2A6VA 4CPYA 2E53A 1W6MB 4LBJA 3WNXA 1GZWA 1JHNA 2A7AA 1LESA 4Q27A 1CPMA 1BKZA 1SLIA 5T5OA 5T50A 2D6NA 2GNBA 4ATFA 2LTNA 4Y1VA 2A3WA 1RITA 2EALA 2W08A 1G7YA 1IVDA 3SLIA 4RL7A 3SITA 1UAIA 2PHXA 1W6NA 2ARXA 3CNAA 1F31A 2XB6C 3ZSMA 1ULGA 4XOGA 1SCRA 3A0NA 1A4GA 1NXD1 2VH9A 1NCBN 4M3CE 1ULFA 4Q26A 4XXPA 4JC1A 1WW5A 1RIRA 4HIZA 4FPLA 2DUPA 1MS0A 2UWBA 4K3YA 3N7LA 4AWDA 5JVVA 4GDIA 4FPKA 4B7QA 2RHPA 4XILA 1NN2A 5HX0A 3O5SA 1UN1A 4P9XA 2DVDA 5DUVA 4AGRA 1AJOA 4CPOA 2P3IA 1F5FA 4MZAA 1WBFA 2UU8A 1W21A 1Z78A 3NN9A 3AYEA 4WEGA 1V6KA 2CTVA 4FPGA 2R1DA 1NCDN 2VWDA 4JF7A 1S1AA 1ENRA 5T54A 3N7MA 4M3CA 2JE7A 2WKKA 5JMCA 4P14A 3WLUA 3B9CA 3PMEA 3VKFC 1SLTA 2SLIA 4Y20B 1NCCN 3WUCA 5DUWA 4KS3A 5DUXA 3H73A 5H9PA 3AZYA 1W8OA 3PVOA 3C2UA 1UZYA 2A6WA 1XQNA 1E8VA 5M1ZA 5T55A 4H55A 2BATA 3VKMA 4FP2A 1IKPA 3GALA 1DBNA 5LK5A 4LBQA 3WZ1A 1W6PA 1IVFA 2DU0A 1V3CA 4MWXA 3I4IA 4FZHA 3WDWA 3M2MA 3SANA 4CRQA 2BZDA 4XTPA 1IS5A 2ZHNA 4YW1A 3RQ0A 4Y20A 2QWAA 2ZGTA 1Y7BA 2DVAA 4XDQA 2OVUA 2C5DA 1YO8A 1ENQA 1TEIA 3T1LA 4UW4A 4YFWA 3QCWA 4ZKTB 4DRVA 2ZAAA 1NSCA 5HCBA 1PZ8A 4BLIA 4YZ4A 2WT0A 3ZXEA 1S0JA 3FLPA 2BF6A 2XCYA 1UL9A 4DGRA 3D11A 2AEQA 3VKLA 1INYA 4XMIA 3ASIA 3D5OA 3GVLA 4XZPA 2E7QA 3H0OA 1Q8OA 2HTRA 1YYNA 2DTYA 2E6VA 3R05A 2V5YA 3HR9A 1GKBA 2B8HA 2YA8A 4XHXA 3M1HA 1CONA 4YZ5A 1J1TA 2H0BA 1LU1A 1VAMA 4RA0A 4ASMB 2PHUA 4YG0A 2W38A 1AX1A 5JDBA 2YROA 2HT5A 2UWCA 2AH2A 3POWA 1LHVA 1HQWA 1DLLA 1CR7A 1UX6A 4H52A 2QWKA 4H53A 3TAYA 3ZSJA 3ZPYA 2A71A 3NV2A 2HYKA 2CMLA 3TI6A 1N1TA 1INHA 2F0ZA 1WCSA 1W20A 4D69A 1NNCA 2F28A 5HUKA 1FNYA 2EAKA 5H9QA 1G9DA 5L73A 4NN9A 1BJIA 3M3EA 1H30A 2ZMNA 1ONAA 5DZFA 2DUQA 1SLAA 5JOWA 4PBOA 1SBDA 4Y26A 4LBKA 2VY0A 2OW4A 3Q9OA 4MWRA 5HUMA 1FV2A 1DYKA 4YFZA 2GMEA 2ZGRA 2GDFA 3ZXFA 1D2SA 4CPZA 1MACA 1INXA 1FATA 1XOGA 3ZVXA 2D6KA 2YA7A 1NCAN 4YM1A 5IT6A 2AYHA 4KS2A 2QWJA 5IK8A 2SILA 3D4KA 4FPHA 4YZ1A 4NC5A 3PVNA 1W6OB 4JRAA 1S0EA 3K39A 1LGBA 1IVBA 2A3XA 1V3BA 5F5QA 4SLIA 7NN9A 1LECA 1AX2A 1EPWA 3H6JA 2F29A 1F8BA 3IPVB 4LBMA 1GLHA 2A5ZA 2WSUA 1MR5A 2HTYA 4AYUA 4KS4A 2G4IA 4U2AA 1BJQA 4XJQA 4X4AA 3IKWA 4K1ZA 1QKQA 5CBLA 1VAVA 3ILRA 2VK7A 4GZWA 5SV8A 2CL2A 5CA6A 1F8EA 4ATEA 4LBQD 1W6QB 4J9TA 4M4UA 4MWLA 4DS0A 3IPVA 3AX4A 5JLVA 1CESA 1H9WA 2R49A 1DILA 1ULEA 3FUOA 2AUYA 3OY8A 3B01A 3O0VA 4GALA 4FPOB 4YG3A 3ILNA 4X6KA 5F9TA 3A71A 5T5PA 3WDYA 1GZWB 2CNAA 3SNMA 3D12A 2WT2A 4GZSA 3B3QE 2XZJA 1JN2P 4Q6KA 4MYEA 3AP7A 5KXDA 4FOQA 1N1YA 3AP4A 3B00A 3LSDA 5JYYA 4BLJA 1CN1A 4FP3A 3FBYA 4KBBA 1SFYA 3ZYRA 1V00A 1GNHA 4NO4A 4YGEA 4FPEA 1DIWA 3VV1A 1G9CA 1W6NB 2DYCA 1Z4VA 1QGLA 2WNEA 2SBAA 4XE9A 2HT8A 3VUOA 4FOVA 1AXZA 4QN4A 2CYFA 4B7JA 1V6OA 2I2SA 1IOAA 4P9YA 5GJ6A 2ZGSA 1S0IA 1YI7A 2W20A 2CWMA 4B7MA 4Y22B 1A14N 1UPSA 4MWYA 4QN6A 1V0FA 4XJ9A 3A4UA 3WHUA 3SH5A 2P34A 1F8CA 2QWBA 4MC7A 4CTEA 4Y1XA 3AP5A 1AF9A 1I3HA 2EIGA 4K1YA 5DXDA 1JYCA 1OKQA 1NNAA 4QN5A 1SCSA 1GV9A 4AGVA 3ZSLA 1HKDA 3SH4A 2YZ4A 4WVVA 4Y22A 1NMBN 2YV8A 3T2TA 1IVEA 1NLSA 1CIWA 3UL2A 4M3CB 2R16A 1LEMA 5DZGA 1Q8SA 2A6XA 3BEQA 1DHKB 3WDUA 2JKBA 4K1HA 1R1ZA 4XYXA 1XOEA 4XHBA 3R4UA 1DIMA 4DFSA 1WLWA 2XG3A 2HTUA 5EYYA 2QWGA 4YZ2A 3A72A 2ZGMA 4XIKA 4LBQB 1W6PB 2VK5A 5T5LA 4BPZA 2GN7A 4W65A 1H9PA 5KXBA 2D6LX 5JOXA 4HL0A 3ZXLA 1L7GA 5B2CA 1FNZA 2YA6A 2A6YA 3UJOA 4GA9A 2R0FA 4MJUA 1LOEA 3RG0A 3RS6A 5GM0A 2CY6A 1AXKA 5AVAA 2V73A 4XBNA 1WW7A 2LALA 2ZGKA 3NSSA 2ZBJA 3SILA 2D6PA 1AZDA 4Z8BA 1JOJA 2HU4A 1WW6A 4MWQA 3K36A 1LU2A 2A75A 1HDKA 2P3KA 4GWNA 3AZXA 1G9FA 4PBPA 1G86A 2XZIA 3FLTA 4YGBA 1DQ2A 2F11A 3TIBA 1S0FA 1MS9A 3CL0A 1V3EA 3AXEA 1Q8VA 2YDTA 1Z4XA 4B7NA 2B7YA 3N36A 2F25A 4NCSA 5EWSA 1N1VA 3DGTA 1KRIA 5DUUA 4YW4A 5DG2A 1MS8A 4YZ3A 1GSLA 1KJRA 3O0XA 5H9SA 1O4ZA 3IN9A 1A3KA 1W0OA 2AGSA 4R9DA 1IS3A 4WV8A 4KS1A 2VK6A 2F26A 3CYEA 4YW3A 1QOTA 2D7FA 1FAYA 2W5OA 3SALA 4P9WA 4GZOA 2DTWA 3WG1A 3HN1A 3CKZA 1YIFA 4XBQA 5GALA 2Z42A 2QWIA 1Z4ZA 4LBNA 2NZ9A 4HZYA 3OJBA 3O12A 2HTVA 4CZSA 5E8AA 1E8UA 3NV4A 2YY1A 2GNMA 2PHFA 3GVJA 1C1FA 4WZFA 3AZWA 4GZTA 3V0BB 2EXHA 4K21A 3SISA 3WDTA 1NMAN 5HCFA 2NMNA 4L8QA 4MWJA 2NM1A 1Z0HA 1V2IA 3D6EA 1WCQA 4XMAA 3V65A 5JOZA 3N7KA 3WHTA 5IK7A 4K1JA 4XJAA 3AYDA 1CJPA 1LHUA 4Q8KA 1LHOA 1QNYA 3V0BA 3WG2A 3KQRA 5GLWA 4XJWA 2VSMA 2C4LA 2HTQA 1QMJA 2AREA 5GZDA 2NP0A 3SH3A 5EXOA 4XJRA 1IS6A 2PHRA 1OFSA 4GB1A 1QF3A 1LCLA 2A70A 4CPLA 4BBWA 3RMXA 5HUGA 5DG1A 3WCRA 3AJYA 4DRRA 2D6OX 1YRZA 2NYYA 4R9CA 2F10A 1S0BA 4XIOA 2D3PA 2F12A 1DZQA 5E88A 1I1EA 3AP6A 3OY8B 2HU0A 1USRA 2DVGA 1Z50A 1F9KA 1HLCA 1V6MA 4AGGA 4M3CF 5CAZA 3OGGA 2F24A 4HANA 2D6MA 3TI8A 3VKNA 3POYA 3QLQA 3HMYA 4FOYA 4DPNA 4DQAA 2C9AA 4TYSA 4MJVA 5EYXA 1CVNA 4AVVA 3W09A 1DQ5A 1IS4A 1DGLA 3M3CA 3B7EA 1IVCA 2EXKA 3I8TA 2RKCA 2ZGUA 4WA4A 1USXA 2R0HA 1JUIA 4UW3A 1MWEA 1WW4A 1MVQA 4HZZA 5FREA 2ZA9A 1GZ9A 4M4NA 5IK5A 2VU9A 5IUQA 4ISQA 1JYIA 1IVGA 1CQ9A 1BYHA 5IK4A 3OYWA 1W0PA 5GZEA 4TZDA 1B9VA 2JE9A 4QN7A 1N3QA 1Z4WA 1INGA 1LOGA 2ZHMA 4Y24A 3V0AA 4FVKA 5B2DA 3AXDA 3UK9A 4FPJA 1B09A 3O0WA 4YLZA 1PZ7A 1G9AA 2D3RA 3JUUA 3USUA 4XTMA 1V6IA 2ERFA 1MS4A 2ZGQA 2WT1A 2ZACA 3W59A 4XJ8A 1VALA 2ARBA 4UW5A 4MX0A 4FPCA 2PHTA 1MZ6A 5GLVA 2D44A 4QN3A 4PCRA 1L7HA 1MS3A 1UMZA 3L2YA 1DFQA 4MWUA 3N3HA 3TI4A 2R1BA 3O9JA 4FPYA 3BIWE 3K3AA 4YG6A 2YXSA 3JU4A 4HZXA 1KITA 3LCPA 4K20A 3A0KA 4GZPA 1SBFA 4UF7A 1WLDA 1DQ0A 2GNTA 4XBLA 1C4RA 1KJLA 3MW2A 4YM2A 2VW2A 1SLLA 2WLQA 2BERA 4JCKA 4NOTA 1W6MA 2WSVA 4GEZA 5JOYA 1U0AA 3DUIA 3POSA 2ZKNA 2ZGPA 3ZYPA 1B9TA 5H9RA 3VKOA 1WD3A 2D3SA 5FRAA 1X50A 5HUNA 3AFKA 1YXWA 3OBRA 5GZFA 4GZXA 4M00A 1PZ9A 1Q56A 2ZGLA 3BODA 1MVEA 3K38A 3FLRA 4AVSA 2VW1A 4C1XA 5T52A 3RMYA 4GWMA 4CPNA 2ES3A 1V3DA 4XXAA 3OBTA 1EUTA 3N35A 1UZZA 4Y1UA 4GZQA 3INBA 2ZGOA 3NV1A 1JXNA 1EUUA 1FX5A 4ITCA 3NV3A 3WG3A 1A4QA 1E8TA 1ZA4A 4D8SA 2F13A 1QDOA 1INFA 2EXIA 1S0GA 1HQLA 2ZZJA 3AYCA 4YGCA 4KS5A 2C4AA 3W58A 4Q8LA 4YGDA 1AJKA 1WD4A 2W68A 4PF5A 2F27A 2QWFA 1V6JA 2CWSA 3PJQA 4M01A 2P3JA 3KM5A 3ENRA 4BMBA 1JBCA 1LEDA 2QWCA 2YDPA 3FUQA 4GKXA 3IMNA 1SACA 2GN3A 3AZVA 4LBOA 4AVTA 4WA3A 2WQZC 1ZM1A 1V6LA 3AK0A 1LHWA 3B69A 3PVEA 2D43A 3FFZA 1SLBA 3V64A 1VLNA 3WV6A 2AR6A 3JU9A 2PELA 4HZWA 1A78A 1GNZA 4XJUA 2DUOA 3WDXA 2XZKA 3TI5A 1B9SA 1MS5A 2DU1A 3MW4A 1LGNA 1BXHA 1LJ7A 1INVA 5DZEA 1VCJA 4CPMA 2DVBA 3ALXA 4X47A 2EXJA 4WEFA 5HCAA 1FV3A 3O9KA 2QWDA 4FPFA 1OQ1A 1UKGA 2JD4A 4M4VA 4R9AA 1V0ZA 3M3OA 1W8NA 3UJQA 2DV9A 2ZGNA 3OPZA 2ZABA 1NNBA 1GYKA 2HT7A 3U4XA 1VIWB 2DURA 2GMMA 3WDVA 2AENA 1LOFA 1ULDA 4QNPA 1WUVA 1SO7A 1AX0A 1GZCA 1LGCA 1KDKA 1SLCA 3MW3A 2VXRA 3TICA 3RSJA 4YM3A 2PHWA 2YMZA 3MPPG 2A6ZA 1EUSA 3H72A 5KXCA 1MZ5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FKBA 4XFGA 2X10A 1GR3A 2GAUA 2F6BA 5FXZA 4DOUA 3AJZA 4K6BA 3S7EA 2WJSA 2A3YA 4U36A 3Q6PA 4Q1PA 1JZ3A 1JW6A 4GKYA 3NWKA 2GU9A 4JDMA 3T1EA 1H1IA 3IM0A 4ZU4A 2VW0A 1RINA 3PUQA 1O91A 5FZEA 1W2UA 4NRPA 5JAXA 1Z4YA 5E89A 2X9MA 5FAXA 1PHMA 3OUHA 1XXNA 3AC0A 3HLHA 5NN9A 4YW2A 2OKXA 3Q6TA 1C1LA 2HH9A 4QKFA 3RRDA 1HB4A 1UZWA 5I0SA 4B7RA 4JKMA 4M0NA 1AVBA 1DYPA 1Y9MA 3APBA 3MBWA 2QBXA 2RJKA 4UW6A 3H71A 2O1QA 1FT9A 1VCUA 4MZEA 2QWEA 1NMCA 4LHLA 4QMAA 4YRDA 3QH7A 4IFLX 1ULOA 4HSJA 1NCQB 4COWA 1K5MB 3DEMA 3EBRA 3VDDC 3NAPC 5IVYA 1AL22 2Y6GA 3E6DA 1OOPA 3MZHA 1C9UA 3DR2A 2B46X 4LBLA 2VNVA 3VBOC 4Y1ZA 4DXTA 1ZRFA 1QH7A 3R6SA 3WDZA 4COUA 4AW7A 2FCVA 1ENSA 3AL5A 2BNMA 2NN8A 4Q1RA 5J1XA 3VBRA 3BTAA 4PJYA 2GNDA 1ZYBA 1ENXA 3ZYJB 4E4HA 4MGIE 1GWLA 1KXGA 4I30A 5GLZA 2FCTA 3I2IA 4OI0A 2WO2A 4R9BA 5DPNA 2VQUA 5C9AA 4QPGA 4QB2A 5LB6A 5A3NA 2JE8A 2HYXA 1VRBA 3JCIA 5EP9A 1S0DA 1OFZA 3EJKA 2YDPA 3NJZA 1A34A 1QJEA 4L97A 4AHAA 1Q8PA 1L7FA 5AC91 3LZZA 2JDMA 2JDZA 1TME1 1T2XA 5HBAA 3BN6A 1LOCA 4LR4A 5FYVA 3ZMOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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