3B69A

T cruzi trans-sialidase complex with benzoylated nana derivative
Total Genus 182
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
182
sequence length
635
structure length
626
Chain Sequence
ASLAPGSSRVELFKRQSSKVPFEKDGKVTERVVHSFRLPALVNVDGVMVAIADARYETSFDNSLIDTVAKYSVDDGETWETQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYVLVGSYNSSRSYWTSHGDARDWDILLAVGEVTKSTAGGKITASIKWGSPVSLKEFFPAEMEGMHTNQFLGGAGVAIVASNGNLVYPVQVTNKKKQVFSKIFYSEDEGKTWKFGKGRSAFGCSEPVALEWEGKLIINTRVDYRRRLVYESSDMGNTWLEAVGTLSRVWGPSPKSNQPGSQSSFTAVTIEGMRVMLFTHPLNFKGRWLRDRLNLWLTDNQRIYNVGQVSIGDENSAYSSVLYKDDKLYCLHEINSNEVYSLVFARLVGELRIIKSVLQSWKNWDSHLSSICTPAGCGPAVTTVGLVGFLSHSATKTEWEDAYRCVNASTANAERVPNGLKFAGVGGGALWPVSQQGQNQRYHFANHAFTLVASVTIHEVPKGASPLLGASLDSSGGKKLLGLSYDKRHQWQPIYGSTPVTPTGSWEMGKRYHVVLTMANKIGSVYIDGEPLEGSGQTVVPDERTPDISHFYVGGYKRSGMPTDSRVTVNNVLLYNRQLNAEEIRTLFLSQDLIGTEAHM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title A new generation of specific Trypanosoma cruzi trans-sialidase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Trypanosoma cruzi
molecule keywords Trans-sialidase
total genus 182
structure length 626
sequence length 635
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2007-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3b69A02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 3b69A01
4M3CF 3AP9A 1W6NB 2NMNA 4XJAA 4LBQD 1W8OA 3AP7A 1FNZA 1YXWA 4M3CB 4K20A 3GNEA 2QWEA 1KDKA 5DXDA 2UWAA 1Z4ZA 2VWDA 3UL2A 2V73A 1QKQA 4LBMA 3APBA 1USRA 4X6KA 1MS4A 4DQAA 4GZQA 2X9MA 1SLIA 1S0GA 3AFKA 1UKGA 4YW5A 3V65A 5DG1A 4Y1UA 2QWGA 1S0CA 3FLRA 3D6EA 4MWWA 4MWLA 2PHUA 1LGCA 2HYKA 4XOGA 2WNEA 1UZZA 2HTYA 4WVVA 3W58A 3WG2A 3T1EA 3IPVB 4YFWA 1N3PA 3TIBA 1NN2A 1G86A 2BQPA 5IK7A 3ZXLA 1QOOA 2QWHA 2ZMNA 4FPJA 1Q56A 3SLIA 3OY8A 2QWCA 3SITA 1LENA 1WBFA 1JW6A 3SH5A 1CQ9A 5JOXA 2SILA 1W6OB 2D43A 2WSVA 1LHWA 1W0PA 4Q6KA 2A70A 5EYXA 1G9BA 2NZ9A 4ZXKA 3OJBA 4XILA 2JECA 2DV9A 4XMIA 4ISQA 4Y1VA 2BERA 4Y24A 2A6ZA 1EUSA 1QNYA 1G8WA 1LOGA 1A3KA 4KS4A 2CL2A 4XBQA 3OYWB 2CNAA 2F27A 2W08A 3AP4A 1DIWA 4Y20A 4DS0A 5DUWA 2CTVA 3AYCA 2EIGA 2UWCA 3M3QA 1MS5A 1BJQA 1J1TA 2GMEA 5GZCA 1APNA 1ZM1A 4GZXA 2AENA 4AGGA 1B9TA 2Z42A 4ZKTB 1XOGA 4CPLA 4Y22B 5GZFA 3D11A 2YA5A 5HUMA 4GZSA 1PZ9A 2BZDA 4Y26A 2YDTA 4YZ2A 4H55A 2QWIA 1Z50A 1WUVA 3AYDA 1DYKA 3O5SA 2VU9A 4BMBA 5JVVA 4KBBA 5JOZA 2F28A 1LHOA 4Z8BA 3QCWA 4FQ4A 3NV4A 2NP0A 2OVUA 2E53A 4FPGA 3FFZA 3MW3A 4YW4A 3IPVA 5T54A 4XTPA 4MC7A 2R0FA 1WW4A 1KDMA 4MWYA 2WLQA 4QNPA 1IKPA 1QF3A 1WCSA 4K1ZA 1W6OA 2R0HA 3ATGA 3ZXEA 4YG0A 2AEPA 1OQ1A 2F11A 2CYFA 4BQ1A 3ZSJA 1B9VA 3HMYA 4J9TA 5E89A 3W59A 2QWKA 4YGBA 4XIKA 4QN5A 3UJQA 3A0KA 1A4GA 1IVDA 4BLJA 3GVKA 1QGLA 4CPZA 1SBFA 4NCSA 4WEGA 1EUTA 3AJYA 2WKKA 4DFSA 3H0OA 4X49A 2A7AA 3LCPA 3WG3A 2ZHMA 5NN9A 3TI3A 4Y22A 2ARXA 1DGLA 5T50A 1LHVA 2EXJA 1GICA 4U36A 1Q8OA 3WDTA 1V6JA 2A5ZA 1FAYA 4XJUA 1RINA 2ZGKA 3A0NA 3FLTA 1QMJA 4P9WA 4K1YA 2XZJA 2E51A 1N1YA 4UW5A 2GMPA 5HCBA 4XMAA 3B00A 2PHWA 4PBPA 1LCLA 4WA3A 3NV3A 1F9KA 4TYSA 4FOVA 1BKZA 5GLVA 3USUA 1L7GA 4Q8KA 1H9WA 2EXHA 4XE9A 4DRRA 1DZQA 3ILNA 3N7LA 4YM1A 1Q8VA 3U4XA 2A6YA 5GJ6A 3B69A 3NV1A 4MWRA 3WLUA 3TAYA 1LGNA 2DU1A 3Q9OA 1V0FA 1DHKB 2ZBJA 2UURA 1A8DA 2ZKNA 3ENRA 4IQPA 2GNTA 1C57A 3O12A 4H52A 4MX0A 1CONA 1W21A 1GLHA 1GZWB 1N47A 1CESA 4CZSA 1Y7BA 1CN1A 4YZ4A 4B7JA 1UAIA 3QLQA 1SLBA 3AK0A 1AX0A 2W38A 1NCCN 3K38A 1GBGA 3ZXKA 4Q26A 1SO7A 1LECA 5GZEA 1ENSA 3MPPG 3UJOA 1UL9A 2PHXA 5IK5A 5E8AA 5H9PA 2XZIA 3RSJA 1MS1A 1V3BA 1GSLA 4CRQA 4K1HA 1INGA 5EWSA 3BEQA 4XBLA 3WHTA 1S0IA 3TB0A 2F12A 1IVEA 3VV1A 3AYAA 4HZVA 4XHXA 5HX0A 1DQ0A 3R05A 2ENRA 3B3QE 2P3IA 1LU2A 1G9CA 1UMZA 2BF6A 3AXDA 4LBNA 1AX2A 4FPEA 1TEIA 4CPOA 1Z0HA 1W8NA 4D8SA 4AVSA 2SBAA 4LBJA 4QN4A 2NM1A 4GZWA 5DUXA 4R9AA 4WEFA 5M1ZA 1WW6A 1V6IA 3D5OA 1KRIA 1GKBA 4K1IA 3KM5A 4CPMA 3WUCA 2ZB6A 3ASIA 1GNZA 5DZEA 5T5OA 1N3OA 2PHFA 1WBLA 5DUUA 3AP6A 2QWDA 1F5FA 3MEPA 4FPKA 5T5JA 3FLPA 4XYXA 2GN7A 2JE7A 1JYIA 1V6KA 4LBLA 1FYUA 1E8TA 2QWAA 4C1XA 3TIAA 1WD3A 4KS1A 1SACA 2ZGPA 4HIZA 2VH9A 2DTYA 1IVFA 2HTRA 1V6OA 3ZXFA 1LEMA 1Q8QA 3B7EA 4B7NA 2C4LA 2W68A 2C4AA 1IOAA 1GANA 4XJQA 2EF6A 5JMCA 2A6XA 1W6MB 5E88A 4AVTA 3JU9A 3WOGA 4WV8A 3O0WA 1AF9A 3CKZA 2HU0A 3AZWA 1JBCA 3IMNA 1ULCA 1V3EA 2VSKA 1LTEA 3NV2A 3A71A 4FQZA 1W1XA 1GZ9A 2A3YA 2D6NA 4XZPA 2OUJA 1EUUA 2WT0A 1NMBN 2E7TA 1A78A 4XJWA 3ALXA 3V64A 3R4UA 4HZYA 1PZ7A 4B7MA 2D6LX 2BATA 5GLTA 3ZSLA 2A71A 2VUAA 4FPOB 1GZCA 4YM3A 3BODA 1FV3A 2YA6A 1V6LA 4AGVA 4OZXA 2DYCA 1O4ZA 4ATEA 1VLNA 1XOEA 2YXSA 4MYEA 5CAZA 2D6MA 2D3PA 4BMEA 1S1AA 3W09A 3DUIA 2EALA 3WG1A 1L7HA 3ZVXA 2TEPA 2VXRA 3WDWA 2PHRA 4GZOA 2DUPA 2XG3A 1AXYA 1S0DA 4M3CE 4GDJA 4P14A 4SLIA 1WW7A 4FJ6A 1MS3A 1S0BA 2NN8A 3SILA 1KJLA 1LOFA 4UW6A 1KITA 4FOWA 5T52A 4XBNA 2E7QA 1EURA 1OFSA 1LHNA 5L73A 2W20A 1AJOA 1QU0A 2VY0A 1W6MA 1NMAN 4UW3A 5KXEA 3K37A 2ZGLA 3IM0A 1NMCA 3O9KA 1FX5A 2A6WA 3NSSA 4DGRA 3USUB 2W5NA 1NNAA 2ZA9A 1V6MA 1NSDA 3LSEA 3T2TA 2AGSA 3AZYA 1IS6A 4I00A 3SH4A 4H53A 5IK4A 4YGDA 5KXBA 4K3YA 2ZGUA 3ZSKA 2EXIA 4YG6A 5JYYA 3WVJA 2F13A 4GZTA 1B09A 2VW1A 5BYNA 4XTMA 4XJ9A 5DUVA 2G4IA 1BQPA 1MS8A 5HCFA 4YM2A 2B7YA 1UPSA 4RL7A 3WUDA 1V6NA 2AR6A 4WA4A 3OPZA 1LOAA 4DRVA 4L8QA 3N36A 1FATA 1ULDA 4MZAA 3M3CA 2D6OX 1QNWA 5HUKA 1YYNA 2ZHNA 3SANA 3ZXJA 3WHUA 4B7RA 2ZGMA 4XDQA 4MWVA 4XXPA 1AJKA 4JCKA 1QOSA 1WD4A 3DGTA 4GWMA 1DQ6A 1F8BA 3ALWA 2SLIA 5FREA 3POYA 2WJSA 3O0XA 2OW4A 3AZXA 3BIWE 3CNAA 3INAA 2B8HA 4BM8A 2EXKA 4WVWA 2ZHLA 5EXOA 1DILA 4XJ8A 1Z4XA 3WCSA 1AXKA 4GKXA 3RMYA 4AWDA 4GWNA 1SBDA 1GV9A 4U2AA 4BPZA 3A72A 5JLVA 3B9CA 1VCUA 5JOYA 2HTUA 2YV8A 5H9RA 3K36A 4MJUA 4HZZA 3TI4A 3WDXA 2WSUA 4YZ1A 1V3DA 3IN9A 1A4QA 2LTNA 4MJVA 5CBLA 2QWJA 3MW4A 1SCSA 3M1HA 4GDIA 4QN7A 3OGGA 3V0BB 5F9TA 3VUOA 3CL0A 3AYEA 5FRAA 1VAMA 1BZWA 3D12A 1VAVA 1E8UA 2V5YA 4HZXA 2KM2A 5DZFA 1NCDN 4YGCA 2I2SA 1HQLA 1CPMA 4GXLA 2AUYA 3LSDA 1JXNA 4ATFA 3ZSMA 4Q27A 1CVNA 4CPNA 4CTEA 2GNDA 1CPNA 1AXZA 3K39A 5B2CA 1YO8A 1C1FA 1FV2A 4GZPA 1SFYA 4Q2FA 2F26A 3RS6A 3POSA 2GMMA 4XHBA 4YZ5A 5CB7A 3AZZA 1AVBA 5GM0A 3VKMA 4K1KA 4M4NA 2VW2A 1NSBA 1VALA 5T55A 2F25A 2P37A 2R1BA 4M3MA 1H9PA 1INFA 1SCRA 3ZYRA 1NCBN 3SH3A 3V0AA 4Q8LA 5LK5A 4FVKA 2GDFA 1HKDA 1Z4YA 4FP2A 2JE9A 2F0ZA 2ZGRA 1DQ2A 4F83A 3VKNA 1HQWA 5AVAA 4K1JA 1INXA 2WT1A 3A4UA 1LESA 2XB6C 1R1ZA 1BYHA 3ILFA 4NN9A 1X50A 3KQRA 4QN6A 3V0BA 1JYCA 1RIRA 2JDZA 1LJ7A 3AZVA 1FNYA 1G9FA 1H30A 2P2KA 5JOWA 1SLCA 2YA4A 4AGRA 4PF5A 1G9AA 1IS5A 1V2IA 3O0VA 1G7YA 4R9BA 2GN3A 3BTAA 2P3KA 4TZDA 1W20A 5DZGA 2EAKA 5EYYA 5T5LA 4XJRA 3K3AA 2A75A 1IS4A 2ZGNA 2DVFA 1S0JA 1HDKA 1A14N 2UWBA 4JF7A 1GYKA 4Q1RA 2A3XA 2ZAAA 2DVDA 1DLLA 2P34A 2DUQA 6NN9A 3WV6A 3INBA 4ISRA 1WLDA 2YY1A 3HN1A 1IVBA 4AYUA 1VCJA 3WDVA 2QWBA 3JUUA 2C5DA 1N1TA 5GZGA 1IKQA 4M4VA 2GALA 2HTWA 5T5PA 1AZDA 2R49A 4D69A 1WLWA 3BOPA 5KXDA 2QWFA 2HT5A 4B7QA 3PVNA 4WZFA 1MVQA 4YW2A 4FZHA 1YIFA 2E6VA 4YW3A 1ENQA 5IT6A 2ARBA 3ILRA 1LOBA 2DVAA 3WCRA 1S0EA 1D0HA 4Q1PA 4ASMB 1MR5A 2D7FA 4CPYA 1LOCA 2LALA 1B9SA 2VK7A 3H6JA 2SIMA 5JDBA 4R9DA 4KS5A 1INVA 1F8EA 4UF7A 2YA8A 1LODA 4BBWA 1N1VA 2D3RA 1SNTA 5GZDA 1BJIA 5H9QA 5GALA 1XQNA 2ZGSA 4LBQB 2ZMKA 4RA0A 3T1MA 1USXA 3L2YA 2XZKA 1WCQA 4JRAA 1MWEA 2PELA 3FUQA 1IS3A 3GALA 5H9SA 5KXCA 5HUNA 2HT8A 1V0EA 2YMZA 4M4UA 1Z4VA 2DUOA 1W6NA 3AXEA 4P9YA 5IUQA 1NCAN 3WZ1A 2F24A 4M3CA 2F10A 2VVZA 4NC5A 4NOTA 3NN9A 4Y1XA 2ZACA 4FPYA 2ZMLA 3N35A 1QDOA 1LEDA 5IK8A 2HTVA 2CY6A 1W6QB 3UK9A 3VKLA 3N7KA 4BOWA 3M3OA 3H71A 1IVCA 3TI5A 3RG0A 3I8TA 4I30A 4GJTA 1D2SA 2P3JA 1JN2P 1QOTA 4XIOA 2AREA 4MWUA 3RQ0A 4HL0A 3R4SA 4MWXA 3WNXA 4YZ3A 1L7FA 1EPWA 4KS3A 2D6KA 5DG2A 1NNCA 3FBYA 5SV8A 2R1DA 4ITCA 5CA6A 1DIMA 3TI8A 2D6PA 2GNMA 3OBRA 4GB1A 2DU0A 3N3HA 4W65A 2DURA 1INYA 1KJRA 1U0AA 3GVLA 1SLTA 1LHUA 1UZYA 1MZ5A 2RHPA 4BLIA 2PHTA 2W5OA 3CYEA 1NNBA 1I3HA 2VK6A 1LGBA 1LULA 1KQRA 2ZGOA 1CIWA 5HCAA 3HR9A 4C1WA 4YFZA 2DWRA 1DQ1A 2JKBA 4LBQA 4FVVA 1I1EA 1NLSA 1W0OA 2JD4A 1LOEA 3RMXA 2AH2A 4K21A 4YW1A 1CJPA 4FOQA 4MZEA 3OYWA 4AVVA 4FPHA 1DFQA 5CNAA 1ONAA 1UN1A 3SALA 4KS2A 2WT2A 2HTQA 2FHRA 1NSCA 1ULGA 3N7JA 2ZB5A 1YI7A 2A3WA 1VIWB 4FPLA 4PQ9A 1ULFA 1WLCA 3ZPYA 3V0AB 2JJ6A 3AX4A 1LU1A 2F29A 1W6PB 5GLWA 2Q5TA 1IVGA 2VSMA 1INHA 1W6QA 3PMEA 2D3SA 1Z4WA 1Q8PA 1DBNA 1SLAA 4FPCA 4WA5A 4PBOA 3O9JA 3I4IA 1ULEA 1SBEA 3CL2A 3MW2A 1DQ5A 2DTWA 5F5QA 5GLUA 2CWSA 4LBKA 1DYPA 4PCRA 2NYYA 2VK5A 2CMLA 4YM0A 1BXHA 1INWA 2YDPA 4YGEA 2GNBA 2YZ4A 1E8VA 1JUIA 1ZA4A 3T1LA 4X4AA 4X47A 3M3EA 1S0FA 4JC1A 2UU8A 1MZ6A 1Z78A 4HANA 1CR7A 4P9XA 1MVEA 1C4RA 3IKWA 4Y1ZA 4GA9A 1MACA 4FPFA 4UW4A 4R9CA 4DPNA 2WQZC 3C2UA 1OKQA 3AJZA 2R16A 1V00A 1C1LA 1URXA 2FMDA 2D44A 3VKOA 1MS0A 1V0ZA 2W39A 4YG3A 1DQ4A 3GVJA 1UX6A 2CWMA 3D4KA 3SNMA 4LBOA 2ZABA 2AEQA 5HUGA 3RRDA 5GLZA 2ERFA 2C9AA 4XXAA 3AP5A 1V3CA 2YROA 7NN9A 3H72A 2ZGTA 3M2MA 4FP3A 1W6PA 3FUOA 1SLLA 3WDYA 4Y1YA 2VW0A 3PJQA 4XJZA 1HLCA 3SISA 3JU4A 3OBTA 2ES3A 2HU4A 3TI6A 3WDUA 1F8CA 2ZHKA 3H73A 2DVGA 1AX1A 1MS9A 1N1SA 4GALA 4QN3A 1RITA 4GKYA 4MWJA 2DVBA 3NWKA 1F31A 1WW5A 3POWA 2W52A 3B01A 1JOJA 2H0BA 3OY8B 2RKCA 2NMOA 1ENRA 2A6VA 4HZWA 1JHNA 2ZGQA 3ZYPA 4FOYA 4NO4A 1O4YA 3TICA 3PVOA 3VKFC 2YA7A 3WG4A 2HT7A 1Q8SA 5B2DA 3N7MA 4M00A 1GNHA 1N3QA 1G9DA 2OUHA 2XCYA 1LOFC 1F8DA 4MWQA 2AYHA 1QDCA 1GZWA 1YRZA 1PZ8A 4GEZA 3PVEA 4Y20B 2ZZJA 4YLZA 4M01A 1NXD1
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1TME 2;  1DF0 A;  4M3C F;  3AP9 A;  1W6N B;  2HWC 3;  1PGL 1;  2Q4S A;  2NMN A;  4XJA A;  4C90 A;  4LBQ D;  3VDD A;  1W8O A;  3AP7 A;  1C28 A;  1FNZ A;  3AMH A;  3VBR C;  3OGJ A;  2ZCW A;  1YXW A;  4M3C B;  4K20 A;  5C9A C;  1HRI 2;  4OFG A;  3GNE A;  5BNN B;  2X5I C;  3LOB A;  1QXJ A;  2RM2 2;  1I5Z A;  3BCW A;  2QWE A;  2VNO A;  1VRH 1;  2HEW F;  1ZRF A;  1KDK A;  2DCK A;  5DXD A;  5K9Y A;  2UWA A;  1Z4Z A;  3ZSE A;  3CF6 E;  1C8N A;  2WS9 2;  3IIA A;  2VWD A;  3UL2 A;  1NCR B;  3GZA A;  2BYV E;  1KS5 A;  2V73 A;  4Q4Y 3;  3WQ7 A;  1D4M 1;  1QKQ A;  4HLT A;  4LBM A;  4N53 B;  3APB A;  1USR A;  2Y38 A;  4FAH A;  1TNR A;  1CGP A;  1D2Q A;  4X6K A;  2RMU 1;  4KG8 A;  4HSJ A;  2JG9 A;  4Q0P A;  1MS4 A;  4DQA A;  4GZQ A;  2X9M A;  1SLI A;  1MEC 2;  1PIV 3;  3FE5 A;  1AUY A;  1JH5 A;  1S0G A;  3AFK A;  1UKG A;  4YW5 A;  1UF2 C;  2QJV A;  3V65 A;  5DG1 A;  1FOD 3;  2B39 A;  1K5M B;  4AQ2 A;  4Y1U A;  3THT A;  2QWG A;  1S0C A;  2H6B A;  2DCJ A;  3FLR A;  3D6E A;  4HBN A;  4MWW A;  5CFD B;  4MWL A; 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