3B69A

T cruzi trans-sialidase complex with benzoylated nana derivative
Total Genus 182
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
182
sequence length
635
structure length
626
Chain Sequence
ASLAPGSSRVELFKRQSSKVPFEKDGKVTERVVHSFRLPALVNVDGVMVAIADARYETSFDNSLIDTVAKYSVDDGETWETQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYVLVGSYNSSRSYWTSHGDARDWDILLAVGEVTKSTAGGKITASIKWGSPVSLKEFFPAEMEGMHTNQFLGGAGVAIVASNGNLVYPVQVTNKKKQVFSKIFYSEDEGKTWKFGKGRSAFGCSEPVALEWEGKLIINTRVDYRRRLVYESSDMGNTWLEAVGTLSRVWGPSPKSNQPGSQSSFTAVTIEGMRVMLFTHPLNFKGRWLRDRLNLWLTDNQRIYNVGQVSIGDENSAYSSVLYKDDKLYCLHEINSNEVYSLVFARLVGELRIIKSVLQSWKNWDSHLSSICTPAGCGPAVTTVGLVGFLSHSATKTEWEDAYRCVNASTANAERVPNGLKFAGVGGGALWPVSQQGQNQRYHFANHAFTLVASVTIHEVPKGASPLLGASLDSSGGKKLLGLSYDKRHQWQPIYGSTPVTPTGSWEMGKRYHVVLTMANKIGSVYIDGEPLEGSGQTVVPDERTPDISHFYVGGYKRSGMPTDSRVTVNNVLLYNRQLNAEEIRTLFLSQDLIGTEAHM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Trans-sialidase
publication title A new generation of specific Trypanosoma cruzi trans-sialidase inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 182
structure length 626
sequence length 635
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2007-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3b69A02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 3b69A01
4F83A 4GXLA 4HIZA 1UAIA 1LOFC 1URXA 1C4RA 2VW2A 4FPOB 5DUVA 4PBOA 1SLBA 2XZJA 4Y1YA 4B7RA 2HU0A 2XG3A 2CY6A 2DVBA 2ZACA 1F9KA 4B7MA 1ULFA 1MR5A 3QLQA 2PHXA 4XXAA 2ZGPA 1LU2A 2HT5A 1MVEA 2X9MA 1C57A 2GNBA 5DUUA 1Y7BA 4CZSA 4MWJA 1BJIA 1VALA 4MX0A 1L7GA 1V00A 1GZWB 2DURA 3JUUA 1SLIA 4LBLA 2YDPA 4XTPA 1KITA 3WHTA 1ULGA 3OYWB 2EAKA 1AZDA 3LSDA 3FLTA 1MS1A 3CKZA 1NMCA 3AYDA 4KS1A 4FOYA 2CNAA 4AGVA 3V64A 3SILA 4NC5A 3O5SA 2E7TA 2A70A 1KQRA 2ZB6A 3D6EA 1OFSA 2ZGUA 2DUOA 1GBGA 2GNMA 1INHA 4Q27A 1SBEA 4AVTA 3AZXA 3ZXJA 2CYFA 1CQ9A 4TZDA 2QWCA 1W20A 1LTEA 2QWBA 3K39A 4K1HA 3CNAA 4Q26A 4NCSA 1V3BA 3IN9A 2NYYA 4AVSA 1NSBA 4QN5A 2EALA 4KS2A 3M3QA 4XYXA 4KS4A 1H9WA 3IMNA 3INAA 1JUIA 2HU4A 4JC1A 1ENSA 3N36A 1J1TA 1LU1A 2OUJA 5FRAA 3B69A 1SLTA 4CPZA 5SV8A 4XXPA 2W5OA 4MZAA 2JE7A 3KM5A 1MZ5A 1HDKA 2VVZA 1QGLA 4K1ZA 2OVUA 3O9KA 5H9RA 2Z42A 1W6OA 1ULCA 4U2AA 1W6NA 2UWCA 3N7LA 3T1EA 4M3MA 4Z8BA 2V5YA 2VXRA 1PZ8A 4Y22A 1V0ZA 4M4UA 4Y1XA 4OZXA 1VLNA 3ILRA 1WLCA 2W68A 3QCWA 3W59A 4BLJA 4YW4A 1DIWA 1A14N 2ZB5A 3GVLA 1C1FA 1UZZA 1F8BA 4B7JA 4FJ6A 3A72A 1LENA 3IM0A 1WW7A 2F25A 1W6PA 3A0KA 1G86A 1WLWA 3ZXKA 1FNYA 3MEPA 4FVKA 2B7YA 4Y24A 4KBBA 1S0EA 2P3KA 2SIMA 2A7AA 4YFZA 5JOZA 4FPCA 3AXDA 2DVGA 5JVVA 4UW6A 2A3WA 4XJRA 1R1ZA 1LGBA 2H0BA 5IK7A 1O4YA 1Q8SA 4YZ2A 5IK4A 4YGEA 4MWWA 2JECA 1A4GA 4J9TA 1D2SA 4DRVA 3PJQA 4HZWA 3AYEA 2JKBA 3RMYA 2ZGQA 3ZYPA 1AVBA 2W39A 5HCBA 4ZKTB 3PVNA 4WEFA 2F11A 2ZGSA 1GZCA 2HTQA 1CVNA 2ZHKA 3AZVA 2XZKA 1IKQA 3WZ1A 4R9DA 3VKMA 3NSSA 4AVVA 2A6WA 3FUQA 3SLIA 3RQ0A 4BBWA 4HL0A 2DUPA 1EUSA 3A71A 1AJKA 1LESA 1MVQA 2NP0A 2R16A 4YFWA 3JU9A 3ZYRA 4NN9A 5H9SA 1AX0A 3TI6A 1AF9A 5EYYA 4MJUA 4FVVA 2HTWA 1ULEA 3TI3A 2AREA 4DGRA 1DQ2A 4XJUA 3OGGA 5DUXA 1HKDA 4YW1A 1W8NA 3AP6A 3WUCA 5DG1A 1Q8VA 1B9VA 3FBYA 3OPZA 4UW3A 1VCUA 1BJQA 4KS5A 3SH5A 3KQRA 3ZSJA 4XJAA 4R9CA 2D6LX 3INBA 4XOGA 6NN9A 2XZIA 1DQ6A 5JYYA 1A78A 4RA0A 2VSMA 4D69A 4YW3A 4DQAA 1V6NA 1SCSA 1B9SA 3WUDA 5DXDA 4FOQA 4RL7A 2R0FA 1YIFA 1INWA 2A3YA 3WDXA 4CPNA 2ZMKA 1W6OB 2A6ZA 5BYNA 4BM8A 4QN7A 2WT2A 1G9DA 2RKCA 5H9QA 1W6NB 5M1ZA 4AYUA 2P3JA 1N3QA 4Y22B 2A3XA 3WDYA 4I30A 1HQLA 3N35A 4JCKA 2PHRA 3SH3A 4ATEA 3NV4A 4XDQA 4GWNA 3N7MA 2PHFA 2VU9A 4YM1A 1V2IA 1VAMA 2HYKA 2PHTA 1JW6A 1W6PB 4YG3A 2ZKNA 1N3PA 1JOJA 4WA3A 3BTAA 3OBTA 1W0PA 1SACA 2G4IA 5E88A 3BIWE 3AP4A 1NSDA 1VAVA 2NN8A 1FATA 1INXA 5H9PA 4FPGA 4AGGA 2E51A 4YW2A 1FAYA 3SNMA 2DWRA 2ZBJA 3U4XA 2GN7A 1F8DA 1S0JA 1W1XA 3ZSKA 3POSA 2ZGOA 4BOWA 4MJVA 4X4AA 1LHUA 1I1EA 4XTMA 1XOGA 1N1YA 1DQ1A 5GZEA 5JDBA 2W52A 3OY8A 1YXWA 2WT1A 1UX6A 1YI7A 4AGRA 1LHNA 2WLQA 5DUWA 4Y26A 3SANA 2D6OX 1G9FA 1BZWA 1SBDA 1LOBA 4HANA 4B7QA 2ERFA 3VV1A 1MS4A 3CYEA 3TB0A 2EXJA 4D8SA 3DUIA 3AJZA 2ZHMA 4FQ4A 4W65A 1S1AA 4LBOA 1DHKB 2C5DA 5CNAA 4DFSA 1LOGA 1JYIA 1JHNA 4GZTA 5E89A 2Q5TA 4BLIA 2ZA9A 5GM0A 4YG6A 1E8VA 4JRAA 1DGLA 1WW5A 1LOFA 2ARBA 2EF6A 4K20A 1IVBA 1W6MA 2D6MA 1Z50A 3RSJA 3RMXA 3ZVXA 3N7KA 4ISQA 3RG0A 4B7NA 1I3HA 2DVFA 1FNZA 4K1IA 1Z0HA 4GZWA 2OW4A 5GLVA 2BATA 2AUYA 4YW5A 1WBFA 3T2TA 1QOSA 1APNA 1CR7A 4XJWA 3H6JA 2VW0A 4H52A 2A6YA 3VKLA 4YGCA 4HZVA 4WZFA 2XB6C 1INGA 4L8QA 1WBLA 4YM3A 4LBQA 4CRQA 4UW4A 3N7JA 3UJQA 3M1HA 1UN1A 1Q8OA 3WG2A 2E7QA 1LHVA 4M01A 3LSEA 1SLLA 2PELA 2EXIA 2C4LA 2BZDA 2YV8A 2AR6A 1RIRA 5GALA 2EXKA 1CIWA 2R0HA 2D3SA 5JMCA 3V0BA 1NMAN 2FMDA 2JE9A 2AENA 5HX0A 3HN1A 1DZQA 1RITA 1QMJA 5IT6A 1MZ6A 2R1DA 1LHOA 3L2YA 4KS3A 1S0DA 3BOPA 3CL0A 5KXCA 1SCRA 1SFYA 2AGSA 3O0WA 3ENRA 5HUNA 3SALA 2QWFA 4Q1RA 4LBMA 1Q8QA 2WSVA 4FOVA 1N1SA 3AZZA 1BXHA 4QNPA 3WDVA 4FPKA 4PF5A 1IVCA 2JDZA 1QNWA 2R1BA 1GZ9A 1NNBA 1E8UA 5KXEA 1SO7A 2QWJA 2KM2A 3AK0A 3AP7A 1EURA 3WDUA 1AXZA 3ATGA 4BMEA 5HUGA 2BQPA 3OY8B 3SITA 1Z78A 1MS0A 2YMZA 4XJQA 4YZ5A 3M3OA 1YRZA 2VWDA 3V0AA 2WJSA 1LOAA 4Y1UA 3ZXEA 4XJ8A 4K3YA 1WW6A 4FP3A 2F0ZA 2W08A 2A5ZA 1LGNA 1QOOA 2EXHA 3AXEA 1NCBN 1PZ7A 4WEGA 4GZXA 4HZZA 1LEMA 2B8HA 1LEDA 4XMAA 2A71A 3SH4A 3GNEA 1RINA 3NN9A 1MWEA 4YGDA 1Q8PA 3H0OA 3ILFA 2ZMLA 4XBLA 2UU8A 3T1LA 4ISRA 4M4VA 1NXD1 3K37A 3ZPYA 1WCQA 3WDTA 1Z4YA 1USXA 1W6MB 5GLWA 1QKQA 2UURA 1NNCA 3AP5A 3TIAA 3WG4A 1AXKA 2E6VA 2WNEA 2A75A 2PHUA 2DVAA 4WVVA 3VKFC 5IK8A 4WV8A 1IVEA 3CL2A 1ONAA 2QWAA 2BF6A 4MWQA 2DUQA 5T55A 1GYKA 4LBKA 2ENRA 1EUUA 4MWXA 2D43A 1MS5A 2BERA 3PMEA 1UPSA 3O9JA 5IK5A 1LOCA 1MACA 2F10A 4XHBA 2ZGMA 2EIGA 2F13A 2GN3A 4M3CF 1W6QA 4LBQB 2QWEA 5GZFA 2HTUA 1F5FA 4CPLA 2YA5A 4XJ9A 3AZWA 2QWDA 4XBNA 4PQ9A 2YROA 1Q56A 2RHPA 1B9TA 3ASIA 2P3IA 5JOYA 3IPVB 4M00A 1G8WA 2F28A 4CPYA 4GZOA 3V0BB 3ZXLA 3POYA 4XZPA 5CAZA 4FPLA 4XMIA 2UWBA 3O12A 2VW1A 2PHWA 3TI8A 1SLAA 5EYXA 1OKQA 4X47A 3R05A 1N47A 4GWMA 1V3EA 1U0AA 1Z4WA 5DZFA 4Q1PA 4GKXA 2P34A 4CTEA 4XIOA 2GNDA 3GVKA 1PZ9A 3POWA 1GSLA 1V6KA 4YLZA 1V6LA 4YZ4A 3SISA 4Q2FA 3WG1A 2LTNA 1WCSA 2A6VA 1AX1A 4Q6KA 4WVWA 1H9PA 4LBQD 5HCAA 3K38A 4QN4A 1EPWA 1ENRA 2E53A 3W58A 3TAYA 3OBRA 4BPZA 1UZYA 2F26A 1INVA 4ASMB 3W09A 2WKKA 1CESA 1LECA 3AYAA 4MWVA 2YZ4A 1S0BA 5IUQA 5CB7A 3V0AB 3IKWA 4FPYA 1VIWB 3VKNA 2CTVA 2JJ6A 1FYUA 1XQNA 3MW3A 4M4NA 2QWIA 1USRA 4P14A 1OQ1A 1AJOA 2ZGRA 5KXDA 2C9AA 3C2UA 1H30A 2HTRA 2W38A 3AFKA 3LCPA 2QWHA 1MS8A 1NLSA 1YO8A 3BODA 1DQ5A 4LBJA 3NWKA 4I00A 4R9AA 1D0HA 1L7HA 4MC7A 3OJBA 2ES3A 5CBLA 1V3CA 1HLCA 2DU1A 2WSUA 1MS3A 1F31A 3I4IA 2NM1A 2JD4A 3FUOA 3RRDA 3FLPA 2D3PA 5GLTA 5GZGA 4YM2A 1JN2P 1V3DA 1INFA 5T50A 4ZXKA 2GNTA 4GZPA 1LOEA 1JBCA 1QF3A 5NN9A 3K3AA 3AX4A 4YZ1A 2CWMA 2W5NA 3ZSLA 1FV2A 3TI4A 3RS6A 1V0FA 1L7FA 1LCLA 3R4SA 1GNHA 1Z4XA 2AEPA 5AVAA 4YGBA 1KJRA 1G9AA 4K21A 2ZGTA 1F8CA 4MWLA 1EUTA 3UJOA 1DILA 2D44A 1ULDA 1ZA4A 4X6KA 5JOWA 1W6QB 4PBPA 2D6KA 3ALXA 1GKBA 4UF7A 1DQ4A 1IS5A 1JYCA 4C1WA 3WHUA 1HQWA 3Q9OA 2P37A 5EWSA 1F8EA 3HR9A 1A3KA 5T54A 2YA7A 1IVDA 4MWYA 2VH9A 4XE9A 1NSCA 4Y20A 3A0NA 4M3CA 2HT8A 2DYCA 1C1LA 3M3CA 4K1JA 1TEIA 2YA4A 1KJLA 4YZ3A 4BMBA 4C1XA 1B09A 2HTYA 1SLCA 1WD4A 2QWKA 2VSKA 4FP2A 2YDTA 2ZMNA 1V6IA 4SLIA 4MYEA 1NCCN 4GEZA 2CWSA 1LULA 1CN1A 2ZABA 2ARXA 3WCRA 3MW2A 4NO4A 3IPVA 1A4QA 1DIMA 1NNAA 1DBNA 2DVDA 3O0XA 4MZEA 2DTYA 4Q8LA 3BEQA 4XJZA 4MWRA 3M3EA 1W8OA 4GA9A 3K36A 3DGTA 1WUVA 1ZM1A 1WD3A 4Y1VA 1CPNA 1S0GA 4JF7A 4K1YA 2A6XA 5T5OA 3VUOA 3AZYA 1G7YA 3WDWA 1N3OA 3B3QE 4PCRA 1N1TA 1V6JA 4P9WA 3WG3A 2GMMA 2W20A 3H73A 2NZ9A 1A8DA 1LJ7A 1V6OA 2F24A 1BQPA 4HZXA 5GLZA 1WLDA 1Z4VA 2GMEA 4XBQA 4H53A 4GDJA 3USUA 2F12A 1DYKA 1GV9A 4YM0A 1VCJA 1QDCA 2VK5A 1LGCA 1JXNA 4WA5A 4Q8KA 1GNZA 3D12A 1W0OA 2AYHA 4HZYA 1SNTA 5T5JA 3B00A 1G9CA 3B01A 2AEQA 3AYCA 3H71A 4GJTA 1LHWA 3WV6A 5B2CA 4Y1ZA 5GJ6A 2GDFA 3ILNA 2UWAA 2ZGNA 1FV3A 2SBAA 1GICA 2ZZJA 2CMLA 1CJPA 3T1MA 2D6NA 3FLRA 2C4AA 2VUAA 3MPPG 4NOTA 4P9XA 3NV3A 4FPFA 5HUMA 1IS3A 5L73A 2QWGA 1BYHA 2VK7A 3MW4A 4UW5A 2NMNA 4FPEA 4FPJA 1AX2A 2CL2A 1QOTA 4FZHA 3WLUA 4MWUA 3WNXA 1QNYA 2YY1A 5F9TA 1CPMA 4X49A 4K1KA 2P2KA 1GZWA 2VY0A 3WOGA 4P9YA 1O4ZA 1V6MA 1Z4ZA 1UL9A 3VKOA 5HUKA 3TIBA 1DYPA 3WVJA 1IVGA 4LBNA 3R4UA 2YA8A 4XIKA 4GB1A 1DFQA 3OYWA 1V0EA 2R49A 5T52A 7NN9A 4GZSA 4QN3A 2V73A 1KRIA 4CPOA 2NMOA 5GZCA 5DG2A 1W21A 4YG0A 4H55A 4XILA 5DZGA 2AH2A 1MS9A 4FQZA 4Y20B 3D4KA 4M3CB 1WW4A 4ITCA 1YYNA 2XCYA 2ZHLA 3GVJA 3H72A 1UKGA 3I8TA 3O0VA 3ZSMA 2ZGLA 2HT7A 3HMYA 5T5PA 4DS0A 3D5OA 2TEPA 3PVOA 2WT0A 4GZQA 1QU0A 3NV2A 1DLLA 1NMBN 4DPNA 4U36A 1XOEA 1NCDN 1X50A 2D7FA 3JU4A 3ZXFA 4CPMA 5CA6A 1KDKA 4AWDA 5GZDA 1GLHA 5JOXA 5F5QA 3AJYA 2F27A 4FOWA 3N3HA 2SILA 1BKZA 3FFZA 4GALA 2F29A 1E8TA 2DTWA 1QDOA 2HTVA 5FREA 2GMPA 1NCAN 2VK6A 4ATFA 2YXSA 3D11A 5E8AA 2WQZC 3UK9A 3A4UA 2OUHA 3GALA 1INYA 3B7EA 1UMZA 5DZEA 4TYSA 5GLUA 4GKYA 4BQ1A 1CONA 1KDMA 1IS6A 3B9CA 3AP9A 5B2DA 3ALWA 3UL2A 2ZGKA 4WA4A 3TICA 2LALA 4XHXA 4GDIA 3USUB 2DU0A 2SLIA 3PVEA 1IKPA 2ZAAA 2D6PA 1FX5A 1LODA 3TI5A 5KXBA 1N1VA 2DV9A 3M2MA 4IQPA 3NV1A 4M3CE 1G9BA 1IS4A 5EXOA 1S0FA 2ZHNA 1IVFA 1DQ0A 1NN2A 2I2SA 4DRRA 4R9BA 1IOAA 5LK5A 1S0CA 4QN6A 3V65A 1AXYA 5HCFA 2FHRA 2GALA 4FPHA 2YA6A 2D3RA 3APBA 5JLVA 1ENQA 1GANA 3WCSA 5T5LA 1S0IA 1SBFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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