3PJQA

Trypanosoma cruzi trans-sialidase-like inactive isoform (including the natural mutation tyr342his) in complex with lactose
Total Genus 171
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
171
sequence length
635
structure length
626
Chain Sequence
ASLAPGSSRVELFKRQSSKVPFEKDGKVTERVVHSFRLPALVNVDGVMVAIADARYETSFDNSLIDTVAKYSVDDGETWETQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYVLVGSYNSSRSYWTSHGDARDWDILLAVGEVTKSTAGGKITASIKWGSPVSLKEFFPAEMEGMHTNQFLGGAGVAIVASNGNLVYPVQVTNKKKQVFSKIFYSEDEGKTWKFGKGRSAFGCSEPVALEWEGKLIINTRVDYRRRLVYESSDMGNTWLEAVGTLSRVWGPSPKSNQPGSQSSFTAVTIEGMRVMLFTHPLNFKGRWLRDRLNLWLTDNQRIYNVGQVSIGDENSAHSSVLYKDDKLYCLHEINSNEVYSLVFARLVGELRIIKSVLQSWKNWDSHLSSICTPAGCGPAVTTVGLVGFLSHSATKTEWEDAYRCVNASTANAERVPNGLKFAGVGGGALWPVSQQGQNQRYHFANHAFTLVASVTIHEVPKGASPLLGASLDSSGGKKLLGLSYDKRHQWQPIYGSTPVTPTGSWEMGKRYHVVLTMANKIGSVYIDGEPLEGSGQTVVPDERTPDISHFYVGGYKRSGMPTDSRVTVNNVLLYNRQLNAEEIRTLFLSQDLIGTEAHM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords Trans-sialidase
publication title Crystal structure of an enzymatically inactive trans-sialidase-like lectin from Trypanosoma cruzi: the carbohydrate binding mechanism involves residual sialidase activity.
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 171
structure length 626
sequence length 635
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2010-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3pjqA02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 3pjqA01
4YM3A 3ZVXA 1MS9A 1LOFA 2AH2A 3USUB 1F8BA 1SFYA 5HCAA 5T52A 1CJPA 4M3CB 4BMEA 1TEIA 4B7MA 2DVFA 3GALA 4WA5A 5JDBA 2A75A 1SO7A 2JDZA 2DUPA 2W5OA 4CPMA 4WZFA 1WUVA 3KQRA 1MS0A 4XOGA 3OGGA 1PZ7A 4WVVA 5AVAA 4GJTA 1BXHA 1S0BA 1IVBA 4LBKA 4XJAA 2GMPA 5JOYA 1IS5A 4FPCA 2WQZC 4FVKA 1WW5A 4XJUA 1SLAA 2HTQA 1XOGA 2C4LA 4BM8A 5BYNA 5IK8A 4CPZA 1Z78A 1NMAN 2W5NA 3M3QA 1W6OA 1NN2A 1HDKA 4Y1ZA 2EIGA 2YY1A 1UAIA 3RMYA 2ZGUA 1L7HA 4MWVA 3MPPG 5E8AA 2AREA 1V3EA 2QWCA 1G9AA 2XCYA 2E51A 1GZCA 3WG3A 1V3CA 2A3YA 2WLQA 2ZGQA 3W58A 1INVA 1ULEA 1N1VA 1SLTA 2PHXA 1MS1A 2D43A 3AYDA 5B2DA 1JXNA 5HX0A 4MX0A 1CVNA 2ZGSA 2VK6A 4OZXA 1AXZA 1EUSA 2GN7A 3MEPA 2E7QA 1F31A 4GWNA 3WCRA 1KRIA 2WSUA 3D11A 4AGRA 1UZZA 3AZZA 1RIRA 2OUJA 2OUHA 4AGGA 4YW3A 2YA4A 4MZAA 3IN9A 4YG0A 1S0GA 2VW2A 1MZ6A 2I2SA 3AX4A 2ZAAA 2ZGRA 4DQAA 2QWHA 1INGA 5GM0A 1NCBN 4TZDA 4XHXA 1NCDN 2A5ZA 4IQPA 2QWGA 1L7FA 4K1KA 1LHWA 4DRRA 1EURA 2EXIA 4P9XA 1JYIA 2EXJA 1INHA 1V0FA 3ZXJA 2QWKA 1EUTA 2PHFA 1WBLA 2D6KA 1SCRA 3ALXA 4HZZA 2D3SA 3ZXFA 2HTVA 4K1IA 1LHUA 3W59A 3WLUA 3UK9A 4FPHA 2QWFA 4ATEA 4HZYA 4U36A 1USRA 4X6KA 2W38A 3WUCA 4BPZA 1QOOA 4Y22B 4XHBA 2YMZA 3USUA 1W6NA 3V0BB 4HIZA 5B2CA 4FPKA 4M3CA 1LOFC 1HQWA 3RMXA 2ZB5A 3RRDA 2EF6A 4UW5A 2ZACA 2VY0A 1LU2A 2AUYA 1YIFA 3HMYA 1S0CA 3QLQA 2ZA9A 4CPNA 4GZXA 2ZGNA 1E8UA 3H6JA 2A6YA 4MWXA 3AZVA 1IKPA 1NMCA 1IVFA 3OPZA 2CNAA 4K1YA 2PELA 3AXDA 3O0XA 4MWLA 2XB6C 6NN9A 1GNZA 2Q5TA 5DZFA 1SBFA 1VCJA 4Q26A 1KDMA 4PCRA 3D4KA 4GZPA 4Q8KA 3VUOA 2ZKNA 4YGCA 2HTWA 3IM0A 5GLWA 4LBJA 3NSSA 5H9PA 2DUQA 3ILRA 3ZSJA 2UWAA 4XILA 3BODA 1V6OA 1N3QA 1UZYA 3B7EA 4QN4A 1Q8PA 3AP4A 1JUIA 3K38A 4M3CE 1GZWB 1GZ9A 1RINA 5JLVA 2F28A 4GALA 1DBNA 5KXBA 1AJOA 1NNCA 1YI7A 1LJ7A 4UW4A 3GNEA 2JE9A 3TAYA 3B69A 1INXA 2NMNA 3AFKA 3A4UA 5JYYA 5M1ZA 4DS0A 2GMEA 3V0AB 1SLBA 1DIWA 5HCBA 4YZ3A 4GDJA 1AJKA 3POYA 3T2TA 4CRQA 3TI6A 2A3WA 2QWDA 3SLIA 3K37A 2DVGA 1ULFA 1V6JA 1N1SA 2F12A 4KBBA 3OBRA 1GBGA 4QNPA 2F25A 2V73A 4YW2A 1AX1A 2ZBJA 4PBOA 4YG3A 5JOZA 2TEPA 2NP0A 1FX5A 1DFQA 4NC5A 4QN5A 1S0DA 5IK5A 3A72A 4LBLA 5T5OA 3RQ0A 3K36A 3WG2A 1S0JA 4LBQA 3WDWA 1B09A 3GVJA 1LHNA 2VK5A 4MWUA 1V6KA 2JKBA 2DVAA 3OY8B 2DURA 4D8SA 2SLIA 3AZXA 3K3AA 1AXYA 3K39A 4LBOA 2D3RA 1LOGA 2YA7A 2UURA 2DU1A 1DQ4A 4WEFA 1W1XA 4XJQA 4Y22A 1YO8A 3V0BA 1NLSA 3SNMA 5EYXA 2CWSA 1WW6A 4AVTA 1DQ5A 5CA6A 2DV9A 5DXDA 2PHUA 2RHPA 3UJQA 2F11A 4BOWA 3Q9OA 1UKGA 3NV3A 5T5LA 3ZXLA 5JOXA 3CNAA 3HR9A 4HZXA 2D44A 1KITA 3V64A 1AZDA 2FMDA 1JHNA 4X47A 2D6NA 5NN9A 3IMNA 1USXA 2DYCA 2NN8A 3OJBA 3RS6A 2HT5A 2QWAA 1VIWB 1LOCA 3A0NA 2GNDA 4NOTA 5FRAA 2BZDA 2DUOA 1CN1A 3ENRA 4ISRA 4XXPA 4Q1PA 5KXCA 2AR6A 2W08A 1VLNA 1W6PA 1DHKB 2ZB6A 2GDFA 3ZSMA 3ZSKA 1LU1A 4CPLA 5DUVA 1N1TA 1GZWA 1SLCA 3AYCA 3VKNA 4JC1A 1KJRA 2V5YA 1WD3A 2R0FA 4YLZA 2DTYA 1Z50A 3R4UA 1C4RA 2FHRA 2QWJA 2YA5A 3CL2A 1GNHA 4LBQD 1IS4A 1WCQA 3M1HA 4FPLA 2JD4A 3AP7A 1BJQA 1VCUA 4BLJA 2HT8A 2DVDA 5GLUA 3BOPA 1NNBA 2CY6A 2E53A 3N7MA 3RG0A 2P2KA 1NXD1 3B00A 1UL9A 3JU4A 3TICA 2R16A 3VKOA 3MW2A 4P9YA 1GICA 4Q6KA 2JJ6A 1LESA 3FLPA 3ALWA 4B7JA 1O4YA 4UW6A 4AVVA 2GMMA 3JUUA 3VKLA 3SH3A 2ZMKA 1Y7BA 1FNYA 2A6WA 1MR5A 1FYUA 1MS3A 1KQRA 2CYFA 1NMBN 4XTMA 1G9CA 4DFSA 1QDOA 2VWDA 2W39A 3N7LA 3OY8A 2BF6A 3FBYA 1CONA 4GEZA 3QCWA 3RSJA 2VW0A 3AK0A 3ILNA 4XBQA 4FOWA 1B9TA 2A70A 1AF9A 4BBWA 1F8CA 3VKFC 1DLLA 2A71A 2D6LX 1W8NA 4RA0A 1LENA 1S0EA 2OW4A 3M2MA 4B7NA 3AJZA 3I4IA 3A71A 1ULCA 5GZEA 4AWDA 4SLIA 4MWYA 1W20A 3D6EA 3N7JA 3SISA 2ENRA 1JW6A 2SILA 4FQ4A 5HCFA 1LGCA 3V65A 1W6QB 3DUIA 2NZ9A 2XG3A 4YW5A 3H72A 4M3MA 2W20A 3ZXEA 4GA9A 1KDKA 4PBPA 4CTEA 2CMLA 3CYEA 1MVQA 5GLZA 3IPVB 4TYSA 1DYPA 2ZHKA 5DG2A 3TI8A 1RITA 4M4NA 5T50A 3T1EA 3R4SA 3WZ1A 4AVSA 3INBA 2LALA 3AP9A 1QNWA 3WVJA 2GN3A 2JECA 2ZMNA 2GNTA 5HUMA 1Z4YA 2F27A 1E8TA 3WDXA 3ILFA 1Z4VA 2WSVA 5CB7A 2EAKA 4GZWA 1V6IA 1ULGA 3DGTA 2R1BA 2A3XA 4GXLA 2W68A 1IVGA 3WHUA 3OYWB 4K1JA 3N3HA 3H0OA 2GNBA 3NN9A 3I8TA 4QN6A 4K1HA 2WT0A 4NCSA 1AX2A 1W6MB 1UMZA 4GZTA 3IKWA 3UJOA 1QOTA 3T1LA 1O4ZA 1VALA 4Z8BA 4BQ1A 4FPEA 3CKZA 1VAMA 4HL0A 1S1AA 2HT7A 4XJWA 5DZGA 1G9DA 4XJRA 2DWRA 5HUKA 4Q27A 1I3HA 2H0BA 3VKMA 4FPJA 4XJ9A 1NCAN 3LSDA 1LODA 2P3KA 2KM2A 1XQNA 3SILA 5IUQA 1NSBA 2ZMLA 4UW3A 2BERA 2VVZA 3WOGA 2YZ4A 5H9SA 3WDYA 2HYKA 2VW1A 1WW7A 1JYCA 4H55A 4BLIA 1MVEA 1HKDA 2R49A 4WVWA 1SBEA 1NCCN 4WA3A 4XJ8A 4L8QA 1QOSA 1QMJA 7NN9A 1JN2P 5F5QA 1Q8VA 1DGLA 3HN1A 4CPOA 4R9BA 5H9QA 4MJUA 4Y26A 1ZA4A 1C1FA 3N35A 1ULDA 1F9KA 1IOAA 4ZKTB 3AYEA 2XZIA 3TI3A 2C9AA 2YV8A 1A14N 2WT2A 1LEMA 2R1DA 1N1YA 1APNA 3U4XA 4GDIA 4GKXA 4K21A 5GJ6A 1NSCA 1W6QA 2P37A 2P34A 2D3PA 2QWEA 4MYEA 4Y24A 5DUXA 2ZHNA 1URXA 3WDUA 3GVLA 1IVDA 3SH4A 1IVEA 5GZCA 1SLLA 1D2SA 2LTNA 1QGLA 3C2UA 2ZHMA 1UX6A 1LECA 2NM1A 4XE9A 3VV1A 1V3DA 5EWSA 1A3KA 4YFWA 4XYXA 4K20A 2A6ZA 3TIAA 1OKQA 1AVBA 1FV2A 2C5DA 1W8OA 2VK7A 5CAZA 3NWKA 2QWIA 1AXKA 4PQ9A 2R0HA 4ATFA 2AEQA 1Q8QA 3O5SA 3OBTA 2YA8A 4FOQA 1WLWA 3WCSA 2EXHA 1NNAA 2CL2A 1SNTA 4R9CA 1F8EA 1BYHA 2D6MA 4FP3A 3SITA 1IKQA 4AGVA 1INYA 3O0WA 3BTAA 1UPSA 1A4QA 2YXSA 1SACA 1W6MA 3B3QE 4RL7A 1MWEA 5SV8A 4K3YA 1V6NA 4B7QA 2ZGTA 1PZ8A 2DVBA 3TB0A 2UWBA 2ZGLA 4I30A 5DUUA 4MWWA 4XDQA 1BJIA 4LBMA 1MZ5A 3NV4A 1GANA 5GALA 2CWMA 1W6NB 4HANA 2E7TA 4M4VA 4YGEA 5GLVA 1WCSA 4XBNA 2VSKA 4UF7A 4M4UA 1KJLA 2B8HA 2F29A 2ARBA 3L2YA 1INFA 3UL2A 2QWBA 5GZGA 1DQ2A 3T1MA 4XIKA 1I1EA 3ZSLA 3V0AA 1A78A 5T54A 1LHVA 4MJVA 4WA4A 1G86A 3M3CA 2VU9A 3LSEA 1J1TA 4YW1A 1LHOA 1MS4A 3B9CA 4CZSA 4H52A 1E8VA 5IK4A 2UU8A 1FAYA 1V0ZA 1CPNA 1FNZA 5GZFA 5GZDA 4XMIA 3W09A 4XZPA 4XJZA 1BZWA 1S0IA 4XTPA 1W0PA 2WNEA 1LCLA 1DIMA 3SANA 1ENRA 1LTEA 4X4AA 1AX0A 2W52A 1ZM1A 3POSA 2ZGPA 4JF7A 3WNXA 2SIMA 1FATA 1GLHA 2ZGKA 2HU4A 4W65A 2ZZJA 2C4AA 4XBLA 2AYHA 2WT1A 5E89A 3NV2A 3ZXKA 1GSLA 1BKZA 4KS2A 3WUDA 1WW4A 1CPMA 4MWRA 1IVCA 3WV6A 1FV3A 4YZ1A 2Z42A 1H9WA 2E6VA 1V2IA 1F5FA 3NV1A 3PVNA 3D5OA 1LOBA 4GKYA 3N36A 4DPNA 1VAVA 4PF5A 5HUGA 5IT6A 4YM1A 3LCPA 1G8WA 4B7RA 2D6PA 4YGDA 2SBAA 4Q1RA 1A4GA 4MWJA 5JVVA 4FPGA 4M3CF 1QU0A 4FZHA 2YDPA 4YGBA 4R9DA 5CBLA 1Q8SA 4JCKA 4FQZA 5KXEA 3BIWE 4Y1UA 2HU0A 3PVEA 1Z4ZA 4X49A 3WG1A 4ASMB 2CTVA 4LBQB 3APBA 3WDTA 4CPYA 1ENQA 4YFZA 4H53A 4QN3A 5DG1A 1OQ1A 2NMOA 1W0OA 3GVKA 4FPOB 3ZPYA 1CESA 4YZ2A 4FOYA 4GZOA 4M00A 3AZYA 3INAA 5HUNA 4XMAA 5F9TA 4D69A 3FLTA 5EXOA 1G9BA 4I00A 3O9JA 3AP5A 2VUAA 1Q56A 2PHRA 4XXAA 2YROA 2YDTA 4FP2A 1DQ0A 1QDCA 5KXDA 1LOAA 1LEDA 4GB1A 4Q2FA 3PVOA 1GV9A 2F0ZA 4Y1VA 1B9VA 4YM0A 4GZQA 3FUOA 2EXKA 1QF3A 1MS5A 2X9MA 4Y20B 1OFSA 4F83A 1N47A 3ZYRA 3AXEA 2ARXA 1QNYA 4WEGA 1C57A 5GLTA 3AZWA 2ZGOA 4AYUA 1H30A 2VH9A 1W21A 3WHTA 3AJYA 1DILA 2RKCA 1DQ1A 1CQ9A 3TI5A 2VSMA 1YYNA 4KS1A 2P3IA 1IS3A 1B9SA 4KS3A 1YRZA 2ZGMA 4Y1YA 1S0FA 3PMEA 1HLCA 1F8DA 1DZQA 2NYYA 2XZJA 1Z4WA 4C1WA 1W6PB 2GNMA 4JRAA 4FJ6A 5EYYA 1EUUA 3FUQA 2ZABA 1C1LA 2GALA 3O12A 5T55A 5DZEA 2A6XA 2XZKA 5DUWA 1D0HA 1DQ6A 3TIBA 4P9WA 3SH5A 4ISQA 3H73A 4NO4A 5T5JA 1V3BA 4HZWA 2DTWA 2EALA 2F24A 3SALA 2HTRA 1LULA 4R9AA 2F26A 3KM5A 4J9TA 2WJSA 3MW3A 2HTUA 1BQPA 3ATGA 1Z4XA 5T5PA 5IK7A 1JBCA 4FVVA 2DU0A 4ITCA 2P3JA 4DRVA 3CL0A 1W6OB 3ASIA 1V6MA 3JU9A 1V0EA 3D12A 2B7YA 2ERFA 2WKKA 4U2AA 4Q8LA 1Q8OA 2AENA 1CR7A 1EPWA 4P14A 3M3EA 3O9KA 1IS6A 4YZ5A 3FFZA 4YM2A 4C1XA 1NSDA 2OVUA 4QN7A 1LOEA 1G9FA 5E88A 4MC7A 1YXWA 1GYKA 1MACA 5H9RA 3H71A 2F10A 2UWCA 1LGNA 1X50A 2F13A 1N3PA 4YG6A 3N7KA 1UN1A 3POWA 4XIOA 3M3OA 1LGBA 3AP6A 2HTYA 4LBNA 3BEQA 1SCSA 1HQLA 3IPVA 1U0AA 2BATA 4MWQA 4FPFA 2VXRA 5JOWA 2JE7A 4FPYA 2AGSA 3FLRA 5L73A 2PHTA 3B01A 2A7AA 1SBDA 4M01A 1G7YA 1GKBA 4MZEA 4KS4A 2D7FA 3AYAA 1V6LA 1QKQA 4FOVA 1L7GA 1MS8A 2D6OX 4YZ4A 4GWMA 2ZHLA 3PJQA 1WBFA 4NN9A 1A8DA 2YA6A 3O0VA 4Y1XA 4YW4A 3OYWA 1V00A 3TI4A 3ZYPA 4Y20A 2A6VA 4ZXKA 1ENSA 1WLCA 1DYKA 4BMBA 1R1ZA 1ONAA 1JOJA 4GZSA 4HZVA 1INWA 5CNAA 1Z0HA 5LK5A 2AEPA 3R05A 1N3OA 1H9PA 2PHWA 4K1ZA 4KS5A 3MW4A 5JMCA 1XOEA 1WLDA 2BQPA 1WD4A 4WV8A 3WDVA 4DGRA 2G4IA 3WG4A 1SLIA 2ES3A 5FREA 3A0KA 1CIWA 1PZ9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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