3SLIA

Leech intramolecular trans-sialidase complexed with 2,7-anhydro-neu5ac prepared by soaking with 3'-sialyllactose
Total Genus 182
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
182
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
IPEGILMEKNNVDIAEGQGYSLDQEAGAKYVKAMTQGTIILSYKSTSENGIQSLFSVGNSTAGNQDRHFHIYITNSGGIGIELRNTDGVFNYTLDRPASVRALYKGERVFNTVALKADAANKQCRLFANGELLATLDKDAFKFISDITGVDNVTLGGTKRQGKIAYPFGGTIGDIKVYSNALSDEELIQATGVTTYGENIFYAGDVTESNYFRIPSLLTLSTGTVISAADARYGGTHDSKSKINIAFAKSTDGGNTWSEPTLPLKFDDYIAKNIDWPRDSVGKNVQIQGSASYIDPVLLEDKLTKRIFLFADLMPAGIGSSNASVGSGFKEVNGKKYLKLRWHKDAGRAYDYTIREKGVIYNDATNQPTEFRVDGEYNLYQHDTNLTCKQYDYNFSGNNLIESKTDVDVNMNIFYKNSVFKAFPTNYLAMRYSDDEGASWSDLDIVSSFKPEVSKFLVVGPGIGKQISTGENAGRLLVPLYSKSSAELGFMYSDDHGDNWTYVEADNLTGGATAEAQIVEMPDGSLKTYLRTGSNCIAEVTSIDGGETWSDRVPLQGISTTSYGTQLSVINYSQPIDGKPAIILSSPNATNGRKNGKIWIGLVNDTGNTGIDKYSVEWKYSYAVDTPQMGYSYSCLAELPDGQVGLLYEKYDSWSRNELHLKDILKFEKYSISELTGQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The 1.8 A structures of leech intramolecular trans-sialidase complexes: evidence of its enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords INTRAMOLECULAR TRANS-SIALIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Macrobdella decora
total genus 182
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature ec 4.2.2.15: Anhydrosialidase.
pdb deposition date 1998-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02973 Sialidase Sialidase, N-terminal domain
A PF13088 BNR_2 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.220.10 Mainly Beta Beta Barrel Intramolecular trans-sialidase; domain 3 Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 3sliA03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3sliA01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 3sliA02
4Z8BA 2CYFA 3PVNA 1WD3A 4XJRA 2V73A 4K20A 1SCRA 3AJYA 3A4UA 3T1MA 2HTQA 2AUYA 1QOTA 1W20A 1UPSA 2GN7A 3D6EA 5JVVA 4CZSA 5SV8A 4M4UA 4MJUA 3O0WA 1V6MA 2ZMKA 1V0ZA 3I4IA 3N35A 4JC1A 1VALA 4U2AA 2ERFA 1A4QA 1HKDA 1KITA 1QKQA 1NSDA 2ZGQA 1LOFA 2PELA 4FQZA 4M01A 4UW4A 1LHNA 2P37A 1D0HA 5H9QA 2WT2A 1W6QB 1BYHA 3SILA 2A6VA 2WSUA 3BODA 4YM2A 4SLIA 3ZXFA 5T50A 4MWXA 1SLCA 3W59A 3LSEA 3IN9A 2DVFA 1CN1A 1JOJA 1GV9A 1J1TA 1MS3A 5JOYA 1S0BA 2QWKA 1N1TA 2PHTA 3U4XA 2VK6A 3JU9A 2GNBA 3AP4A 3WCSA 1EUSA 2W20A 1FNZA 5H9SA 1A78A 2D44A 3WUDA 3FUQA 4XZPA 4AVTA 3NN9A 4WEFA 4ISRA 1C57A 3MW2A 4LBNA 4R9DA 1ENSA 1QMJA 1GKBA 3WV6A 3RMYA 3TI8A 1NNCA 4M4NA 3N7JA 5DUWA 4P9WA 1WD4A 2X9MA 2A6WA 1NCDN 1DGLA 1RINA 4YZ1A 3WG2A 3QLQA 4XJQA 3TAYA 2WQZC 2PHXA 1V6KA 1CONA 4HZVA 1A14N 4NO4A 4FPFA 4J9TA 5DZFA 2GMMA 3POYA 3ZSMA 2R1BA 2EXHA 2P3IA 2GN3A 4BLIA 1Z4WA 1CPNA 3BOPA 5GLUA 2AYHA 4MZAA 4JCKA 4HZXA 4LBKA 3B69A 5LK5A 3SLIA 4D69A 5KXBA 2YDTA 1S0JA 3DUIA 1VIWB 5FREA 2GMPA 3WDXA 3AP6A 1DYPA 2NM1A 3GVKA 3HMYA 4HZWA 1LHUA 3UJOA 2G4IA 5GZEA 1FYUA 5EYXA 3TI6A 4MWRA 2RHPA 2AGSA 4FOQA 4Y1XA 1XOEA 2EALA 2LTNA 5GLWA 4YG3A 4BMBA 1GZWA 2A7AA 4M00A 2XCYA 3AYDA 2EIGA 2YA7A 3ZSJA 4XIKA 1IVDA 2NN8A 1LGBA 2ZGMA 3ALXA 2XZKA 1UX6A 1Z4VA 2YY1A 4X49A 3WCRA 4B7NA 2ZGOA 1G9AA 1LESA 2AR6A 1N1YA 4YW5A 2FMDA 2VK5A 3ZXEA 1IS4A 4P9XA 1IS6A 1AJKA 3VKNA 2KM2A 5JLVA 1GYKA 3ZSLA 1JUIA 4D8SA 1N1VA 3OBRA 1SBFA 1DILA 3CL2A 1A3KA 3IPVB 5DUVA 1Z4YA 4NCSA 2JKBA 5IT6A 4LBJA 1DYKA 2W38A 1UKGA 2HYKA 4XE9A 2OVUA 2NMNA 2CY6A 2ENRA 1EUUA 3OYWA 4ISQA 1BJIA 2XZJA 4XBLA 4GZPA 4YW1A 4YZ4A 2D6LX 2JECA 3R4UA 5EXOA 1LENA 5F5QA 1MS0A 3INAA 3MW4A 1S0IA 1DIMA 3IKWA 3B7EA 1SLAA 4Y1ZA 1QF3A 3D4KA 4WVVA 3UK9A 3NV4A 2D6PA 1W8NA 1LCLA 3IMNA 3SISA 2HTWA 1Z78A 1SLTA 2DURA 1WUVA 1INVA 1DQ6A 4GWMA 2NYYA 3AP9A 1DQ4A 4K21A 4GZOA 5GZDA 2YA5A 2Q5TA 1MWEA 4HL0A 4YGDA 2BATA 2HU0A 3AYCA 4GZQA 5E89A 5CB7A 1V6OA 1S0CA 4GZTA 2HT8A 3SNMA 4QN6A 2F29A 5JDBA 4F83A 1WW4A 1SFYA 5IK4A 3MW3A 2F27A 3HR9A 5IUQA 5HX0A 1KDMA 2YDPA 3ZXJA 3NV1A 1YIFA 1LODA 2HTYA 5JYYA 2HT5A 4DGRA 1WW5A 3TI4A 2PHWA 3ZXKA 2QWAA 3OGGA 1LOAA 5EYYA 2QWGA 4ZKTB 1NMAN 3NV2A 3PVOA 1JYCA 1AXZA 4KS1A 1CJPA 4XMIA 3MPPG 4QNPA 3PMEA 2EXJA 2GNTA 2VVZA 3RSJA 1G7YA 2EXIA 1N47A 3B9CA 2YROA 1GZCA 4GKYA 2VWDA 2JJ6A 4PQ9A 3RS6A 1N3PA 2E53A 4FZHA 4P9YA 4FPJA 3AP7A 2A71A 4Y1UA 5DUUA 1IS5A 1MZ6A 1INHA 1AZDA 2YMZA 2YA4A 2P3KA 1WLCA 4K1YA 2W5NA 2CWMA 1YRZA 4XIOA 1N3QA 3WNXA 1PZ9A 1WLWA 2H0BA 4FP3A 3V0AA 1WCSA 2R16A 1BQPA 4DRRA 3ZYPA 2F0ZA 3M3CA 1QGLA 2F28A 3GALA 5GZFA 5HUNA 2XB6C 4YM3A 4FPCA 2OW4A 1LECA 4R9AA 5T5JA 1A4GA 3FLRA 3QCWA 3VKLA 1LOFC 1EURA 1IS3A 1AVBA 4DFSA 4M3CF 2BQPA 2ZMNA 4XJ9A 4BBWA 2VW0A 4K1KA 1XOGA 3K37A 1V6NA 2DVGA 4Q8LA 4Y22A 2W52A 2F10A 2WT0A 2CMLA 1C1FA 2BF6A 3AJZA 4PCRA 2QWBA 4DPNA 2R49A 1FATA 2EAKA 4QN4A 1SO7A 3CL0A 1H9WA 1YXWA 5CBLA 3B3QE 1LGNA 5GJ6A 1B9VA 1L7HA 1HLCA 2E6VA 5HCFA 3N7LA 4C1XA 1W6OB 3K39A 3OY8A 1W0PA 1LHOA 5KXEA 2YA8A 1JW6A 3AYEA 1AXYA 2R0FA 1W0OA 3VV1A 4YG6A 4UF7A 4H55A 1GANA 4MWLA 4MWJA 4GA9A 3H71A 3WZ1A 3IM0A 3KQRA 1SBEA 4FPKA 4FPHA 1DHKB 2C4LA 4WEGA 1YYNA 1VCJA 3OJBA 5KXCA 3K3AA 3N36A 4GEZA 1VAVA 2UWCA 2VK7A 2V5YA 2D7FA 2PHUA 3AK0A 4JF7A 1TEIA 1JBCA 2ZACA 1V0EA 2WNEA 1GICA 2VU9A 3I8TA 2D6NA 1HDKA 1SACA 4QN5A 3ZXLA 3TI5A 1NLSA 4Y1VA 1D2SA 1G8WA 5CNAA 2A3WA 4TYSA 2ZZJA 4R9BA 2C4AA 1RIRA 4AWDA 3R05A 1NCCN 4PF5A 1W6OA 1G9CA 1GZWB 3RMXA 3GVJA 1OFSA 1LTEA 2CNAA 1MR5A 2E51A 1V3DA 1L7GA 2ZABA 2I2SA 4FP2A 3OPZA 5HUGA 2WJSA 3BIWE 2SIMA 1NXD1 3ASIA 4MWYA 2A70A 4FOYA 1W1XA 1EPWA 3FLPA 5T54A 2DVBA 3H72A 3V0BA 2ZGLA 2F25A 3BEQA 3H73A 2JD4A 4XJZA 4K1JA 2JE9A 1APNA 5B2CA 3GVLA 1UL9A 1NNAA 2DUOA 2VW2A 1MS5A 1ONAA 4FOWA 4UW5A 4MWVA 1LHVA 3OYWB 5E88A 1INXA 2D3SA 3ATGA 1V6JA 2R0HA 2A75A 3FFZA 5GALA 2AEQA 2ZGPA 5DZEA 2WLQA 4GB1A 1LULA 3USUA 4X4AA 1G9FA 4MZEA 4MWWA 1SLIA 3V64A 1WBLA 5JOXA 3WHTA 3FLTA 4PBPA 1WLDA 4XXAA 2C9AA 5IK5A 3O9JA 4YFZA 3PJQA 5GZGA 1RITA 1C1LA 3WDTA 5DG2A 3C2UA 2QWCA 2EXKA 2DU0A 3K36A 1DQ5A 2Z42A 1Z50A 1ENRA 4FVVA 4HZYA 4YM1A 3MEPA 1FX5A 3L2YA 4M3MA 3T2TA 4KS2A 5JMCA 1GLHA 2ZGSA 2QWDA 3ILRA 1IKQA 1V0FA 3FUOA 4FOVA 2HU4A 4YM0A 2EF6A 3O9KA 4GXLA 5AVAA 1WCQA 1INFA 2ZB6A 4RA0A 1ULGA 4YFWA 4H53A 4M3CB 4LBMA 3AP5A 1WW6A 3RG0A 2DV9A 2ZGRA 4XJWA 4P14A 4R9CA 2NP0A 4K1HA 3WG3A 1IVGA 1IOAA 4Q2FA 4HZZA 5HUKA 2TEPA 4B7MA 2UWAA 3ILFA 1S0GA 5M1ZA 1Q8QA 5B2DA 2DUQA 4AVVA 3D5OA 1ULFA 5GLZA 1PZ7A 1FV3A 3WDVA 4LBLA 2HTUA 3M3EA 4XYXA 4B7JA 2YZ4A 1LEDA 1YI7A 2NMOA 2WSVA 1N3OA 4XDQA 3TB0A 3LSDA 2ZHNA 2A6YA 1GNZA 2DVAA 5HCBA 3AYAA 5GZCA 1Q8PA 2A5ZA 2A3XA 5T52A 1IVEA 4ATEA 4L8QA 1ENQA 1BXHA 1CVNA 2W39A 4KS3A 2A6ZA 3V0AB 4ITCA 1KDKA 1VAMA 4M3CA 1KQRA 3O12A 1Q8VA 1E8UA 2ES3A 3PVEA 4KS4A 2BERA 2ARXA 1KJLA 1F8EA 2AENA 3WG4A 1V3BA 4K1IA 1G9BA 3SH3A 2W08A 5H9PA 1E8TA 2QWEA 1OQ1A 4XJAA 4Y22B 2DTYA 1AX0A 1AXKA 5GLTA 1DQ2A 3NWKA 4KBBA 1W6MA 1URXA 2FHRA 1YO8A 3VUOA 1MS4A 4YZ2A 4Y1YA 1USXA 3D12A 4MWQA 3WOGA 3B00A 2HTVA 2ZBJA 4QN7A 1QOOA 3KM5A 4XHBA 4M3CE 2OUJA 6NN9A 4OZXA 5BYNA 4YZ3A 5IK7A 3OY8B 3O0XA 1V2IA 2ZKNA 4WA3A 2ZGTA 2QWIA 1Z4ZA 3WG1A 4WVWA 3JU4A 1LJ7A 1VLNA 1V6IA 1E8VA 4NN9A 2P3JA 5JOZA 5HCAA 4I00A 2LALA 3DGTA 3AZYA 4CPOA 7NN9A 1U0AA 4DRVA 4GKXA 2E7TA 4YG0A 1DQ0A 4BMEA 4Q1RA 4GZSA 4XHXA 2ZGNA 1R1ZA 3VKOA 2WT1A 4BOWA 3AZWA 4YGBA 3TIAA 1LOGA 1F8DA 2ARBA 5DG1A 2DU1A 3WLUA 1L7FA 1INWA 1MS9A 4ASMB 3A71A 4FPLA 3UL2A 2QWHA 2YV8A 3A0NA 3AXDA 2ZMLA 4FPOB 1QU0A 1O4ZA 1G86A 4GDIA 4LBQB 1KRIA 4YLZA 5T5OA 1Q56A 1X50A 4CPYA 2GMEA 1INGA 4H52A 4AVSA 2D3PA 2A3YA 1I1EA 4MWUA 4AGVA 2F24A 2JE7A 2VW1A 4U36A 2W5OA 4XOGA 1QNWA 3AX4A 4UW3A 1CQ9A 2D3RA 4X47A 4YW4A 1VCUA 2WKKA 3POSA 1LEMA 2CTVA 3AZVA 3OBTA 1MS8A 1IVCA 3SITA 2VXRA 2F26A 3N7MA 4LBOA 3V0BB 1DQ1A 4CTEA 5NN9A 1UAIA 1LHWA 1A8DA 1G9DA 1W6PB 2ZHKA 4B7RA 2HT7A 1S1AA 2XZIA 1B09A 2ZGKA 1S0EA 1CPMA 1SLBA 5GLVA 4XTMA 4FJ6A 5T5LA 1PZ8A 2W68A 1CESA 5E8AA 3ZPYA 4LBQA 1INYA 1GZ9A 4BPZA 2NZ9A 4M4VA 2D6KA 2B7YA 4HIZA 4NC5A 2DVDA 2XG3A 4BM8A 2HTRA 1IKPA 3USUB 1N1SA 2ZHLA 4XBQA 3LCPA 1BKZA 2AH2A 1GBGA 4AGGA 4FPGA 1LOCA 3M2MA 1H30A 1UZZA 2P2KA 1W6QA 3WUCA 3WHUA 1V3EA 2CWSA 1OKQA 3NSSA 4Q6KA 1NMCA 3V65A 4RL7A 2GNDA 1S0FA 4CRQA 4C1WA 2F12A 2D6OX 1LU2A 3M1HA 3APBA 5F9TA 1HQWA 4X6KA 4I30A 3ILNA 1F5FA 2P34A 1W6PA 3INBA 1JXNA 3CKZA 1DBNA 2ZA9A 4KS5A 2UU8A 4XJUA 4W65A 1QOSA 4GWNA 4TZDA 1Z4XA 4YGCA 1V3CA 3TICA 3AFKA 4JRAA 1B9TA 2D6MA 1W21A 4GZXA 3HN1A 2D43A 4DS0A 2SBAA 2VH9A 3K38A 2F13A 3R4SA 4CPLA 1HQLA 1QNYA 2BZDA 3CYEA 1NCAN 1KJRA 3CNAA 4Q1PA 3FBYA 2VY0A 4WA5A 1WW7A 3WDUA 1DLLA 4WV8A 2F11A 1UMZA 1AF9A 1AJOA 1NSCA 2A6XA 1NMBN 3SANA 3T1EA 5EWSA 4FQ4A 3ZVXA 3BTAA 5GM0A 1ULDA 2B8HA 2PHFA 3NV3A 1NCBN 4MC7A 4BQ1A 4YZ5A 4ATFA 1C4RA 1CR7A 4PBOA 3O5SA 4CPMA 2C5DA 1Y7BA 4CPNA 3T1LA 1O4YA 1MVQA 1S0DA 3WVJA 1ULEA 1BZWA 3RRDA 4FVKA 1ULCA 3JUUA 1DIWA 1LOEA 4LBQD 1WBFA 1W8OA 5CA6A 1Q8SA 3N7KA 1B9SA 2GNMA 3M3QA 1LGCA 1DZQA 2SLIA 4IQPA 4XXPA 4XTPA 4K1ZA 4Q27A 1ZA4A 5L73A 1GSLA 3TIBA 2QWJA 1Z0HA 5IK8A 1V00A 3A0KA 5DXDA 3TI3A 5T5PA 4MYEA 2QWFA 1F8CA 4XILA 2GDFA 1MZ5A 5H9RA 2VSKA 1JHNA 4UW6A 3VKMA 5HUMA 1H9PA 2PHRA 1LOBA 4HANA 4XJ8A 1NSBA 1ZM1A 4YGEA 1DFQA 3SH4A 1W6NB 1W6MB 4Y20B 1SLLA 4GDJA 4YW3A 4GALA 3RQ0A 4Q8KA 2DWRA 2DYCA 4ZXKA 1XQNA 4FPEA 3O0VA 4Y26A 2E7QA 1FV2A 2JDZA 5FRAA 2ZB5A 4AGRA 4XBNA 1NN2A 1GNHA 1IVFA 3IPVA 4CPZA 5KXDA 3N3HA 5T55A 3B01A 1MVEA 1EUTA 1Q8OA 1BJQA 2DUPA 4MJVA 1USRA 3ZSKA 3W58A 3POWA 1SNTA 3SALA 1F8BA 3AXEA 4WZFA 4B7QA 4YW2A 3Q9OA 3GNEA 2YA6A 2AEPA 4NOTA 4DQAA 1AX1A 1SCSA 2RKCA 1MS1A 3WDWA 2CL2A 3D11A 2OUHA 3W09A 1CIWA 3H6JA 4Y24A 4BLJA 4K3YA 1F9KA 3AZZA 1LU1A 3WDYA 3SH5A 4XMAA 3ALWA 4Q26A 2AREA 2GALA 2SILA 1FNYA 1AX2A 1W6NA 2VSMA 1QDOA 2DTWA 2R1DA 4Y20A 5DZGA 1QDCA 2YXSA 1IVBA 2UWBA 5CAZA 4AYUA 1V6LA 2ZAAA 3ENRA 3A72A 3M3OA 1NNBA 3UJQA 5JOWA 5DUXA 2VUAA 4GZWA 4FPYA 3ZYRA 1UZYA 1I3HA 3VKFC 4QN3A 2ZHMA 3H0OA 3AZXA 1FAYA 4WA4A 1JN2P 2UURA 2ZGUA 1F31A 4MX0A 4GJTA 1JYIA 1UN1A 1MACA 1SBDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2WO1A 3IB3A 5JWPA 3SREA 1HJFA 1T6BX 2IXKA 5F39A 2Q8EA 2VMGA 2CYFA 4Z8BA 4FFIA 3PVNA 4XFHA 4XFAA 4QQPA 5JR2A 1REFA 3PIGA 2QQKA 5I0TA 4BQ5A 3VZMA 4BQWA 1WD3A 4XJRA 4QX8A 2O8OA 2V73A 4K20A 1AYN2 1QQP2 1SCRA 3ZFFA 1C5KA 5HI0A 1TG7A 2CGNA 2XWJB 1WA6X 3DEMA 3IWZA 4LJHA 4E9KA 5A1FA 3O1SA 1RUE1 2H2NA 3UYJA 3POFA 1H4GA 4UOJA 1OOPB 3AJYA 4HVOA 2K0GA 3A4UA 4XQWA 3T1MA 1PO13 3EJKA 4P00B 5C3RA 1PVC2 5FPLA 4KMQA 4A44A 4GZ9A 2HTQA 2JDYA 4IDZA 1XBFA 1ZI0A 1XE8A 1QJY2 1QOTA 2AUYA 3OUJA 1W20A 1UPSA 2IVJA 3Q6PA 5DDJ2 3TOJA 2GN7A 1ND2C 3D0JA 2PYTA 3OG2A 5LA2A 2CU5A 3E97A 1CRUA 3D6EA 5FK8A 4B7KA 5JVVA 4EN8B 3RZJA 4AEDC 3BOWA 4ZZ5A 1HIXA 2BNOA 4CZSA 5SV8A 2ZKLA 1DZRA 3U0ZA 2JIGA 4M4UA 2R30A 1WMXA 2VQTA 1W9TA 4QU2A 1PGW1 3VDCA 4MJUA 3O0WA 1V6MA 2ZMKA 4N90A 4RD7A 4XEZA 4Q4V3 1FPN2 4LE4A 1V0ZA 3LIGA 1KGYA 3I4IA 4KG0A 2VMCA 1GZTA 1CAWB 1R093 3IDAA 3N35A 3VB9A 4JC1A 1YJKA 2VAUA 3LA7A 5FZBA 3KCCA 4AQ2A 1VALA 4E2QA 1KFXL 2FQPA 4Y33A 4U2AA 5LBCA 5FYSA 2WNVA 1OA3A 1VE0A 1NE4A 3MIBA 2ERFA 2WZPP 5FPXA 5L9VA 1ZVFA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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