4SLIA

Leech intramolecular trans-sialidase complexed with 2-propenyl-neu5ac, an inactive substrate analogue
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
IPEGILMEKNNVDIAEGQGYSLDQEAGAKYVKAMTQGTIILSYKSTSENGIQSLFSVGNSTAGNQDRHFHIYITNSGGIGIELRNTDGVFNYTLDRPASVRALYKGERVFNTVALKADAANKQCRLFANGELLATLDKDAFKFISDITGVDNVTLGGTKRQGKIAYPFGGTIGDIKVYSNALSDEELIQATGVTTYGENIFYAGDVTESNYFRIPSLLTLSTGTVISAADARYGGTHDSKSKINIAFAKSTDGGNTWSEPTLPLKFDDYIAKNIDWPRDSVGKNVQIQGSASYIDPVLLEDKLTKRIFLFADLMPAGIGSSNASVGSGFKEVNGKKYLKLRWHKDAGRAYDYTIREKGVIYNDATNQPTEFRVDGEYNLYQHDTNLTCKQYDYNFSGNNLIESKTDVDVNMNIFYKNSVFKAFPTNYLAMRYSDDEGASWSDLDIVSSFKPEVSKFLVVGPGIGKQISTGENAGRLLVPLYSKSSAELGFMYSDDHGDNWTYVEADNLTGGATAEAQIVEMPDGSLKTYLRTGSNCIAEVTSIDGGETWSDRVPLQGISTTSYGTQLSVINYSQPIDGKPAIILSSPNATNGRKNGKIWIGLVNDTGNTGIDKYSVEWKYSYAVDTPQMGYSYSCLAELPDGQVGLLYEKYDSWSRNELHLKDILKFEKYSISELTGQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The 1.8 A structures of leech intramolecular trans-sialidase complexes: evidence of its enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule tags Enzyme
source organism Macrobdella decora
molecule keywords INTRAMOLECULAR TRANS-SIALIDASE
total genus 186
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature ec 4.2.2.15: Anhydrosialidase.
pdb deposition date 1998-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02973 Sialidase Sialidase, N-terminal domain
A PF13088 BNR_2 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.220.10 Mainly Beta Beta Barrel Intramolecular trans-sialidase; domain 3 Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 4sliA03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4sliA01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 4sliA02
2F12A 3VKLA 4XIKA 2QWCA 3MW2A 2PHFA 3B69A 3M3OA 1LGCA 3M3CA 2NMOA 4MWQA 4C1XA 4F83A 4FPCA 4Y1YA 3BEQA 4YG6A 5JOZA 3R05A 1FYUA 4XJUA 2QWJA 1FNYA 5KXEA 1VAVA 2VU9A 4UW4A 2AENA 2HTYA 4P9WA 5E8AA 1YXWA 1UKGA 4QN7A 1MZ5A 3D12A 3SH5A 1YIFA 1SBDA 1WUVA 4XJ8A 4NN9A 2HT5A 4BMEA 2DU1A 3OGGA 2BATA 4XE9A 3D4KA 4YGDA 3ZXJA 5DG1A 4FPHA 4BQ1A 1IOAA 2XZJA 1G9AA 3NV4A 5GJ6A 1O4YA 4AYUA 1U0AA 5GLUA 4XJQA 2WT1A 1PZ7A 5B2DA 3K37A 3ZXKA 3K38A 2ZGOA 1RIRA 3U4XA 3WLUA 1G9FA 3PMEA 4MWUA 2NP0A 1PZ9A 1DHKB 1TEIA 1URXA 1VAMA 4FVVA 1Z78A 4MWXA 2A3YA 4YZ1A 2QWIA 2YMZA 2WT2A 2D43A 4B7RA 2FHRA 4XXPA 1ULGA 5LK5A 1GZWB 3VUOA 2A6WA 2CY6A 4ITCA 3IM0A 4BLIA 2VW1A 3B7EA 2CMLA 5GLTA 1SLCA 1WLWA 2QWBA 1MS0A 3V65A 4GZWA 1FX5A 2ENRA 3RMXA 5KXBA 2WQZC 1V6MA 1LJ7A 1CONA 1LECA 3WG1A 4MX0A 4IQPA 3TAYA 4Q1RA 1QOOA 2E6VA 1A78A 3WDYA 3TB0A 3CKZA 2QWAA 3POYA 4FOYA 3FUOA 4NC5A 4XHBA 5HX0A 4BMBA 1OFSA 4NOTA 1KJLA 5DUXA 3VKNA 1MS4A 4K20A 1DYKA 1GSLA 3LSEA 1Q56A 2ZACA 1EUTA 5CB7A 1BYHA 1KRIA 4C1WA 2HTRA 3N7MA 4K1YA 4YZ5A 1S0JA 1ZA4A 1JOJA 1GKBA 2R49A 2F13A 1AJKA 1W0OA 1EUSA 1MR5A 2OVUA 5T52A 2XG3A 3H6JA 3B9CA 5GZCA 3K3AA 2ZMKA 3CL0A 4YW2A 4XMIA 1F9KA 4GZSA 4XYXA 2VW2A 1X50A 4B7MA 1DILA 1ULFA 2VW0A 2D6PA 2VH9A 2AH2A 5GZEA 5JOWA 5JLVA 3I8TA 2C9AA 2PHTA 3V0AA 3RS6A 1GBGA 1CJPA 1NNCA 1MACA 1B09A 1SCSA 1NNAA 1FATA 4Q27A 3N36A 1DQ6A 1BJQA 4K1ZA 5EWSA 3WZ1A 4HZYA 2F0ZA 6NN9A 1LOAA 2JDZA 1V3EA 2ZHNA 2LALA 3OY8A 2R0FA 2RHPA 2D6MA 3A0NA 3W59A 4MWYA 1LESA 1IS4A 1S1AA 1UAIA 2WSUA 1S0BA 2YROA 1WBLA 1W6OA 4MJVA 4I00A 5DZFA 3O5SA 1W21A 2YA5A 3NWKA 1INGA 1WCQA 2X9MA 1LENA 1SBEA 1LHNA 2D6KA 2E7QA 1S0FA 3H73A 4AGGA 5T5OA 1WW7A 2AEPA 1N1YA 4BOWA 2A71A 1LEMA 4NO4A 1CQ9A 2F25A 3AJZA 1QOTA 2ZMNA 5JOYA 1G86A 1SBFA 4DRRA 3PVEA 1A4GA 3R4SA 4FPYA 2YA6A 2WT0A 4Q26A 4ASMB 1V6OA 4YZ2A 4YM3A 1INXA 4GZQA 3B01A 2DWRA 4YW5A 4LBQD 3VV1A 3AZWA 1NSDA 4GZOA 1CIWA 4X47A 4K1IA 1V6NA 3C2UA 1YYNA 4R9CA 1G9BA 3A72A 3TI3A 5H9PA 1V0ZA 1VCUA 1UL9A 2F27A 4GWMA 2HU0A 7NN9A 1S0IA 2CWMA 1S0GA 1SLIA 4GZPA 3PVNA 1CESA 1QU0A 4XBNA 4GWNA 2UWBA 3WDVA 1MVQA 3MW4A 1MS1A 2DUOA 3FLTA 3LSDA 2H0BA 3VKOA 3IN9A 1MS8A 1LHUA 3IKWA 3KQRA 4GJTA 4M00A 5GLWA 5F5QA 3WDXA 3POWA 3UJOA 1L7FA 3Q9OA 1LOFA 3V0AB 1F8EA 1LGNA 2HTVA 3FLPA 3A4UA 4Y26A 3AYAA 2FMDA 2UWAA 1B9VA 1APNA 4FVKA 1ULCA 4GXLA 3TI8A 1JYCA 4FP3A 4FOVA 2C5DA 1CVNA 5H9QA 1FNZA 3AYDA 3WOGA 4BPZA 3AYCA 3TIBA 4PBPA 3ASIA 1W20A 1EUUA 4AVVA 2AR6A 3ALWA 3OY8B 2HTUA 3JU9A 2QWGA 2JECA 3ZSMA 4DGRA 3AK0A 2W5OA 4XBLA 3WDUA 2AUYA 2G4IA 2ZBJA 2ZGNA 3M3QA 3AX4A 2D6NA 1W6OB 1W6MA 4XJZA 2A7AA 4YM0A 4AVTA 1Z50A 1JXNA 1GANA 2OUHA 2ZGMA 1USXA 4MJUA 1H30A 2XZIA 1QDCA 1LHOA 3KM5A 2VK6A 4YGBA 4KS5A 2JE9A 1GYKA 4GZXA 3HN1A 3AXEA 3ZXFA 5IK4A 1NCAN 3NV2A 1CN1A 2F10A 2BQPA 2GNDA 3CNAA 2VSMA 2JD4A 4Q6KA 2YXSA 2DU0A 1Z4ZA 4MWLA 2ZHLA 5DUWA 1FV3A 4Y24A 3ILNA 3POSA 2BF6A 3B3QE 1I1EA 1IKQA 1ENRA 4GB1A 1JHNA 1AXKA 2DUPA 1E8VA 1DBNA 5KXCA 3O0WA 5GLZA 4XHXA 2R1DA 4AVSA 4GZTA 1F8CA 2VY0A 4M3MA 2W39A 2HTQA 5AVAA 2ZB6A 4Y22A 1BQPA 2ZZJA 5JYYA 5T50A 3AP4A 1OKQA 3AZXA 1GZCA 4K21A 3N7KA 4GDJA 1DZQA 1SO7A 4XIOA 1QGLA 1AX1A 1N47A 4PF5A 4K1HA 5FREA 1WW4A 1ULEA 1WD4A 2EIGA 2WNEA 3H0OA 5GZDA 3M2MA 1IVGA 3WV6A 2D3RA 2I2SA 3RMYA 2P3JA 1Z4XA 4MZEA 1LOBA 2A6VA 1IVCA 2ZHKA 4CZSA 2LTNA 2BZDA 5HCBA 1NMCA 4R9DA 4U2AA 3WHUA 1Y7BA 2VSKA 3ILRA 1W6MB 2ARXA 2DVBA 5JOXA 1LOFC 1S0CA 3SANA 1UZYA 1A14N 4XJAA 2R0HA 2UURA 5BYNA 1CPMA 1DYPA 5NN9A 1SLAA 2DVFA 1FAYA 1SNTA 1H9PA 3BODA 4FP2A 4Q1PA 4YFZA 2HT7A 1FV2A 4XJWA 2W08A 4FQZA 2F11A 4YZ3A 2V73A 2UWCA 1E8TA 3SALA 1QMJA 4P9XA 5KXDA 1UN1A 2RKCA 1ZM1A 4CPNA 4P14A 3AYEA 1L7HA 4Y20A 2A6XA 3MPPG 4XILA 2HYKA 4LBJA 3M3EA 1E8UA 4K3YA 1OQ1A 2GNTA 1LGBA 1V6JA 1LU2A 1CPNA 1DQ2A 3R4UA 4DRVA 3A0KA 1A3KA 1XQNA 1IVBA 4AGVA 1LHWA 1NMBN 2DYCA 4WEGA 4J9TA 1J1TA 2ZAAA 1GLHA 5HUKA 5HUNA 3B00A 4FPEA 2P2KA 4DQAA 3D6EA 2ZGRA 4YW1A 4M3CA 4Z8BA 1V3DA 1INHA 4HL0A 4Y22B 1USRA 4MYEA 5DUVA 4X4AA 4ATEA 2CNAA 4M01A 4AGRA 1GZ9A 2QWHA 5GALA 5T5PA 4TYSA 4U36A 3SITA 3O0VA 4YFWA 1W8NA 3BOPA 4D69A 1N3OA 2EXHA 1LHVA 1NMAN 1WLCA 1KDMA 3GVKA 1QF3A 2WLQA 4GEZA 1G9DA 4WZFA 1NNBA 4X6KA 1EPWA 5FRAA 2QWDA 2HU4A 4XDQA 4YM1A 4PBOA 3TICA 3WCSA 1IKPA 1QNYA 1AJOA 1MS5A 1LODA 1HQLA 2ZA9A 4XZPA 1JUIA 1GNHA 3JUUA 4HZVA 4LBQA 4XOGA 4CPOA 2EAKA 1G8WA 4D8SA 3ZSJA 3K39A 3W09A 1AX2A 2F28A 1AF9A 1JYIA 4FPLA 4GKXA 4HZZA 3O9KA 1MZ6A 3BTAA 4QN6A 1HLCA 1C1LA 2YZ4A 4LBKA 2E51A 1JBCA 3M1HA 4M4UA 1W1XA 5DG2A 4Y20B 1V3BA 1W6NA 2YDPA 2W52A 1KDKA 3WDWA 1BXHA 2JE7A 1A8DA 1MWEA 4R9BA 2F24A 1HKDA 2OUJA 2ZMLA 3UJQA 3N35A 4LBOA 1NSCA 2D44A 3K36A 1R1ZA 3PJQA 4MC7A 2P3KA 1L7GA 1SCRA 1BJIA 1G7YA 2D3PA 2C4AA 4XBQA 1Q8VA 4MWWA 2W20A 4XMAA 4I30A 2D3SA 1XOEA 2XCYA 4HZWA 5IK7A 4YW4A 4B7QA 1C1FA 2GDFA 2YA7A 4CPYA 2ZABA 4FPKA 3L2YA 4M3CB 4YG3A 4M4VA 3INBA 5CA6A 4NCSA 5EYXA 5HUMA 4K1KA 2EALA 3AZZA 4Y1VA 2WSVA 5F9TA 3HR9A 1H9WA 3ZYRA 1BKZA 1GV9A 1IS3A 3O0XA 3FUQA 1MVEA 3GVLA 3OBRA 4UW3A 1LULA 1KITA 1W6PA 2CYFA 2PHRA 3NV1A 4WV8A 2A5ZA 1D2SA 1VALA 1V0EA 4KS3A 5DUUA 5E89A 3T1MA 4YGCA 2ZGKA 3AFKA 1SACA 4WEFA 3IPVA 5M1ZA 3WVJA 5T5JA 2GMPA 1LCLA 2A3WA 3TIAA 4FZHA 3SILA 3TI6A 2SLIA 2F29A 2HT8A 1V6IA 2R1BA 1F5FA 3AP9A 4LBQB 2PHWA 4GA9A 3ZVXA 1LEDA 2ZGTA 4X49A 1AXYA 1KJRA 5GZGA 5CAZA 5L73A 3D5OA 4QN5A 4LBNA 2NYYA 3HMYA 2EF6A 4TZDA 4H53A 5IUQA 2W68A 2ZB5A 1NCDN 3ALXA 4CPMA 2A70A 3OPZA 4FPGA 1A4QA 5T54A 1MS9A 1W6NB 5HUGA 2F26A 2AGSA 2TEPA 3IMNA 2CWSA 4FPFA 5IK5A 3MW3A 3VKMA 3FBYA 2DVDA 4XTMA 2NM1A 1AVBA 2EXJA 1NXD1 3N7LA 2YA4A 1W6QA 2W38A 1DIWA 2GALA 4Q8KA 2GNBA 2KM2A 4Y1UA 1INVA 4KS4A 2SBAA 1WBFA 4RA0A 1QKQA 3CYEA 4ZXKA 4FPJA 4ATFA 2WJSA 1WLDA 2ZGPA 5DZEA 1LTEA 1N1TA 1V2IA 5CBLA 4XJRA 1UMZA 2GN7A 3WUDA 1Z4YA 1Z4VA 3WUCA 2YV8A 4PQ9A 3T1LA 1F31A 4KS2A 4M3CF 4GALA 3TI5A 2QWKA 4KS1A 1RINA 1SLTA 2GNMA 1INFA 3ILFA 1WD3A 1F8BA 2DUQA 2ZGQA 1W6PB 1LOEA 1SLLA 1G9CA 4KBBA 2QWEA 1IVDA 1NSBA 2A3XA 4CPLA 1DQ1A 4L8QA 4QN3A 1Q8PA 2AEQA 3V64A 1C57A 4Q8LA 3IPVB 5EYYA 5GLVA 2PELA 5JMCA 1N3PA 3A71A 3RQ0A 2YY1A 4BLJA 4HANA 2GMMA 4CTEA 4FQ4A 2B8HA 4YG0A 1GICA 2D6LX 2ZHMA 1INWA 1DQ4A 4JCKA 2CTVA 2P37A 3DGTA 3LCPA 2DURA 4XJ9A 4BBWA 4P9YA 1UPSA 3ATGA 3NN9A 3RG0A 4YLZA 1INYA 3V0BA 4ISRA 2JKBA 1AZDA 2AREA 1YO8A 1B9TA 1VCJA 1F8DA 3WG4A 3GVJA 3SLIA 3ZSKA 3FFZA 4YGEA 4LBMA 1W6QB 5DXDA 2YDTA 4FOWA 5T5LA 2C4LA 4YZ4A 3UK9A 3CL2A 3GNEA 1Q8SA 1NLSA 4GKYA 3AP7A 3AZYA 2GMEA 4M3CE 4WA4A 2GN3A 4RL7A 4UW6A 4HZXA 4JF7A 4DFSA 2YA8A 3OBTA 4K1JA 3APBA 1WCSA 4XXAA 3DUIA 4WVWA 2ERFA 3T2TA 3BIWE 1ENQA 1HDKA 1D0HA 3MEPA 1W8OA 4XTPA 4YW3A 2D7FA 2VVZA 4OZXA 4JRAA 1N3QA 2ES3A 4ISQA 5CNAA 2PHUA 1CR7A 4YM2A 3OYWA 5T55A 4GDIA 1ENSA 3NV3A 1B9SA 1Q8QA 4DPNA 3VKFC 1SFYA 4W65A 2Z42A 1IVEA 2VK5A 1JN2P 5JVVA 4FOQA 2NZ9A 1NCCN 1V3CA 4MWVA 5HCAA 3SISA 3QLQA 1AX0A 1AXZA 4H55A 1KQRA 2BERA 2DTYA 4HIZA 3ZPYA 1QOSA 4FJ6A 5H9SA 5DZGA 2NN8A 1DQ5A 3I4IA 2OW4A 2Q5TA 3USUA 3N3HA 1N1VA 4DS0A 5JDBA 4Q2FA 3SH4A 4JC1A 3AXDA 2A75A 3V0BB 5E88A 1LOGA 1ONAA 2UU8A 1IVFA 2A6YA 2SIMA 2DVGA 4M4NA 1YI7A 1RITA 1I3HA 3WG3A 3PVOA 5HCFA 2NMNA 4MZAA 3ZSLA 4MWRA 1N1SA 2VUAA 4WVVA 3ZXLA 2DVAA 4QN4A 3WNXA 1VIWB 4H52A 3W58A 1QNWA 3NSSA 1IS5A 1JW6A 1UX6A 4FPOB 2DV9A 1DGLA 3RRDA 1HQWA 2PHXA 1WW5A 2CL2A 1V00A 1NCBN 3T1EA 2W5NA 3RSJA 4QNPA 1IS6A 2QWFA 2E7TA 1Z4WA 2VWDA 1V0FA 4UW5A 5EXOA 1S0DA 1O4ZA 4PCRA 2EXIA 2WKKA 2ZKNA 3JU4A 1BZWA 2XB6C 1S0EA 3OJBA 2E53A 1VLNA 1PZ8A 2D6OX 3ENRA 3WDTA 1DQ0A 1DLLA 3D11A 2P3IA 5IK8A 3H72A 3O9JA 4Y1XA 2HTWA 2A6ZA 3UL2A 4SLIA 4AWDA 1UZZA 1WW6A 3AZVA 3OYWB 1MS3A 4B7JA 3SNMA 1NN2A 2V5YA 4CPZA 1Z0HA 2ZGSA 2P34A 1V6KA 2SILA 3QCWA 4B7NA 3AJYA 2R16A 2VXRA 1QDOA 2DTWA 4ZKTB 4Y1ZA 1V6LA 4BM8A 3O12A 3ZXEA 3H71A 2XZKA 1ULDA 1W0PA 3WHTA 3FLRA 1GNZA 5GM0A 4MWJA 1GZWA 1LU1A 5B2CA 1SLBA 3USUB 4LBLA 2ZGUA 5H9RA 1XOGA 3AP5A 3N7JA 3SH3A 1LOCA 2JJ6A 4WA3A 1DIMA 1YRZA 2EXKA 2ARBA 1Q8OA 4R9AA 1C4RA 4WA5A 2ZGLA 3AP6A 3INAA 3WCRA 2AYHA 1DFQA 3GALA 3WG2A 2VK7A 5GZFA 5IT6A 4UF7A 3ZYPA 3TI4A 5SV8A 4CRQA 1EURA 2B7YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1CAVA 1MEC2 5FP7A 2F12A 2IASA 4DUVA 3VKLA 4XIKA 1VBC2 2QWCA 4RFRB 3MW2A 4BQ3A 1YFUA 2W47A 2HWC3 4ZS3A 3ZIWA 1H6LA 2WABA 5EZWA 2PHFA 1JZ8A 3MYXA 5LRRA 3B69A 5FWJA 3M3OA 1LGCA 3PTYA 2C9KA 3M3CA 1AL0G 3MDPA 3NRUA 5BNNC 4FTBA 2HBTA 2NMOA 1AR62 1YHFA 5KBFA 4MWQA 4C1XA 4I0BA 1JI6A 3MF6A 4QDQA 4F83A 1PO21 5FOBB 3PIJA 5E16A 4FPCA 4IERA 2Q1ZB 4JGZB 4Y1YA 2GZWA 4XUNA 4CDXA 3BEQA 2HWC2 3HN3A 5BNOB 5CFCC 1H4HA 1XOYA 3DPRB 5EFUA 4D7YA 4YG6A 4FXKB 3KMHA 1UOBA 2WQ8A 5FMCA 5JOZA 3R05A 1FYUA 5DMYA 1N6FA 4YVSA 5FMDA 3HIFA 3THPA 4Z1VA 4HLTA 4XJUA 2QDRA 3ALQA 3ACFA 3AM2A 2QWJA 4XDPA 4XFCA 1FNYA 2AEYA 5KXEA 1VAVA 5FZOB 5CISA 2XHKA 4KGQA 3GDBA 2VU9A 4UW4A 1N6EA 2AENA 4YYOA 1LAJA 4DXRA 5ABJA 1POOA 2HTYA 1H2LA 3ZXAC 1FOD1 4P9WA 5E8AA 1YXWA 1RUE1 3WDZA 1SPPB 1UKGA 3M4FA 4QN7A 1MZ5A 3J7MA 4G3YC 1H8TB 2XHNA 4NVPA 5GZGA 1CAWB 5GX4A 3D12A 5ERLA 5TSWA 2RMU2 2WRAA 3T0BA 1BHGA 1VBE1 1VMHA 3SH5A 2G19A 1HN0A 1UCXA 1YIFA 3FBMA 2ZW9A 1SBDA 3G4EA 4CU9A 1WUVA 4XJ8A 1COV1 4NN9A 1AUYA 4NMIA 4O7XA 2HT5A 4BMEA 2DU1A 3OGGA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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