4SLIA

Leech intramolecular trans-sialidase complexed with 2-propenyl-neu5ac, an inactive substrate analogue
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
IPEGILMEKNNVDIAEGQGYSLDQEAGAKYVKAMTQGTIILSYKSTSENGIQSLFSVGNSTAGNQDRHFHIYITNSGGIGIELRNTDGVFNYTLDRPASVRALYKGERVFNTVALKADAANKQCRLFANGELLATLDKDAFKFISDITGVDNVTLGGTKRQGKIAYPFGGTIGDIKVYSNALSDEELIQATGVTTYGENIFYAGDVTESNYFRIPSLLTLSTGTVISAADARYGGTHDSKSKINIAFAKSTDGGNTWSEPTLPLKFDDYIAKNIDWPRDSVGKNVQIQGSASYIDPVLLEDKLTKRIFLFADLMPAGIGSSNASVGSGFKEVNGKKYLKLRWHKDAGRAYDYTIREKGVIYNDATNQPTEFRVDGEYNLYQHDTNLTCKQYDYNFSGNNLIESKTDVDVNMNIFYKNSVFKAFPTNYLAMRYSDDEGASWSDLDIVSSFKPEVSKFLVVGPGIGKQISTGENAGRLLVPLYSKSSAELGFMYSDDHGDNWTYVEADNLTGGATAEAQIVEMPDGSLKTYLRTGSNCIAEVTSIDGGETWSDRVPLQGISTTSYGTQLSVINYSQPIDGKPAIILSSPNATNGRKNGKIWIGLVNDTGNTGIDKYSVEWKYSYAVDTPQMGYSYSCLAELPDGQVGLLYEKYDSWSRNELHLKDILKFEKYSISELTGQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The 1.8 A structures of leech intramolecular trans-sialidase complexes: evidence of its enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords INTRAMOLECULAR TRANS-SIALIDASE
molecule tags Enzyme
source organism Macrobdella decora
total genus 186
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature ec 4.2.2.15: Anhydrosialidase.
pdb deposition date 1998-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02973 Sialidase Sialidase, N-terminal domain
A PF13088 BNR_2 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.220.10 Mainly Beta Beta Barrel Intramolecular trans-sialidase; domain 3 Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 4sliA03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4sliA01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 4sliA02
1CVNA 1W6PB 4B7JA 4XZPA 2P3JA 2C5DA 3AP4A 5DG1A 1WLWA 1AXZA 2C4AA 2NN8A 4M3CE 2G4IA 4WA5A 1ULDA 2ZGPA 4LBOA 2P34A 4XTMA 2WSVA 1W20A 1MZ5A 1Q8QA 2DVFA 1UN1A 2ZGRA 4GWNA 2C9AA 3AP6A 4HIZA 1INFA 1JW6A 1CONA 1QOOA 4QN4A 1SACA 4CPNA 2RHPA 4PBOA 1Q8VA 1GYKA 1S1AA 2UWBA 1NN2A 3K36A 4X47A 4BMBA 5JOWA 1EUTA 2A3WA 2YMZA 1HKDA 2GMMA 1HQLA 1X50A 4YGBA 5JMCA 1INHA 2F0ZA 3ZSKA 4HZVA 3H72A 1LOBA 3WG1A 4F83A 2ARBA 2A6XA 4FP2A 3TI4A 4FOQA 1FNYA 3TI3A 3W59A 1AXKA 5HCBA 4FQZA 2OW4A 1S0JA 4MZAA 4FQ4A 3TIBA 2D6MA 3SH4A 1FYUA 2BF6A 3SALA 2D44A 4Y1YA 1W0OA 1YRZA 1NNBA 4R9BA 4FZHA 3FUQA 4XMIA 3WDTA 4YZ1A 2GN3A 2D6OX 2ZBJA 2E53A 4R9AA 1USXA 2EALA 1Z78A 1QOSA 4WEFA 1UAIA 2W5NA 2YA5A 1ULEA 4GZOA 1MS8A 1GLHA 2A7AA 4XJQA 1V6NA 2YZ4A 1V0ZA 1VAVA 3AJZA 4U36A 1BJQA 4JC1A 4LBJA 1EUUA 4XE9A 2ZHKA 2EIGA 3VV1A 1LGBA 2CL2A 1NSBA 1DQ6A 2NP0A 3L2YA 3NV4A 3LCPA 4FOWA 1NNCA 4IQPA 1Z50A 2SBAA 3N36A 2JE7A 1VIWB 2QWIA 3BEQA 5F5QA 4FPHA 5HCAA 1HQWA 1N3PA 5T5LA 1G9BA 3WOGA 1QNYA 5B2DA 4WZFA 1KJLA 1IVDA 1UZZA 1N1YA 2PELA 1G8WA 1L7FA 3WLUA 4GXLA 2PHFA 3USUB 3JUUA 3OPZA 3CYEA 1FX5A 1WBLA 1ENRA 4FPEA 1GBGA 2EAKA 3UL2A 3U4XA 3GVLA 2V5YA 2AUYA 2P37A 3OY8A 1NNAA 1MWEA 1DLLA 2F24A 1D2SA 4K1IA 2JECA 3N7MA 1RINA 5GM0A 1BJIA 4QN5A 3WHUA 4XOGA 4ITCA 4WA4A 4Y1ZA 4GALA 5GZGA 1INYA 1LHWA 4YG3A 3V0BB 1MR5A 4MC7A 4Y20A 1SLLA 3V0BA 3RG0A 4M4VA 4CPLA 1SBEA 5H9SA 1QF3A 1A14N 4L8QA 2YA4A 1I3HA 3CKZA 3M3EA 2ZZJA 3H71A 4K1YA 1SBFA 1UMZA 3WHTA 1H9PA 5EWSA 4FVKA 4Y22B 1MS1A 3K39A 4KS5A 1INVA 1Z4VA 1LULA 1S0BA 4HZYA 1H30A 4GWMA 5IK8A 4XIOA 2GNTA 2DTWA 5FRAA 1QU0A 4FPFA 2ZGMA 1A8DA 5B2CA 2QWFA 2UWCA 4M4UA 1CPNA 1KJRA 1WUVA 2ZABA 1MS3A 3TI8A 5T5OA 5DZFA 4YLZA 5T54A 4MYEA 1ENQA 2LALA 3ATGA 2R0FA 5GLTA 3OGGA 1A3KA 3A0KA 1N1VA 4Q6KA 2CNAA 2D43A 1NCDN 3TI6A 2DU0A 3AFKA 4HZWA 1NMCA 3AZWA 3TB0A 3O12A 4KBBA 2W38A 4MJVA 3SLIA 2ZA9A 3TICA 2HTRA 2DVDA 3K38A 1LEDA 1MACA 5IK7A 1UKGA 2WSUA 1L7GA 1AZDA 1GNHA 1LJ7A 1BKZA 2R49A 3AZYA 4AVTA 5HUKA 4YM0A 4BBWA 3M3CA 2UU8A 4XJRA 4ATFA 1DBNA 1G9FA 1SLTA 4YW2A 3AJYA 5GLUA 1GKBA 4FPJA 3N7LA 2QWJA 3M3QA 1O4ZA 2VK7A 4BM8A 1Z4ZA 4FJ6A 2H0BA 2HYKA 5CB7A 2ZGOA 1ONAA 4UW5A 1V3EA 3FLTA 1V3BA 2ZGUA 5LK5A 2NM1A 3WNXA 2GDFA 3SH3A 3IM0A 2F13A 1V0EA 3MEPA 2YY1A 1LHNA 1F8CA 1LEMA 3BODA 4K20A 1W8NA 1AX1A 1UPSA 1W6OB 2E7TA 1LCLA 4Q1PA 2WT0A 1W6OA 1Z4XA 4YW4A 1G9AA 2A6ZA 4BQ1A 3UJOA 1W8OA 1LOAA 1BQPA 5FREA 5KXDA 4GZXA 1XOGA 4XJWA 1Q8PA 4X6KA 4M3CA 1NMBN 5HUGA 3ASIA 2D3PA 3TAYA 4XDQA 4NC5A 3DUIA 3POYA 1JBCA 2PHXA 1F31A 1XOEA 4YM3A 3VKLA 3PMEA 3ALWA 1JHNA 2JKBA 1FAYA 4KS1A 3JU4A 2QWDA 1Q8OA 4MWLA 1JYIA 3NV2A 3VKNA 1GNZA 3LSEA 4H52A 1W6NB 5H9RA 3D12A 2LTNA 1W6NA 3VKMA 5AVAA 2B8HA 3WUCA 5GZEA 3SANA 1YYNA 1NCAN 1AF9A 4NOTA 2SLIA 3WUDA 2QWCA 1L7HA 5DUVA 2A6YA 5CA6A 2YDPA 2A6WA 4HZXA 2DURA 2DVGA 4R9CA 4J9TA 3JU9A 4Y1UA 2VUAA 4FVVA 3AZVA 5DZEA 2AEQA 2HU0A 5HCFA 2CYFA 4UW4A 4P9WA 2W39A 3B00A 4Q2FA 4HZZA 3A71A 1DQ0A 4ZXKA 1QDCA 3WG4A 4LBQA 1V6JA 1F8BA 1DQ1A 1V3DA 4XXPA 5DZGA 4Q8LA 4X4AA 2EF6A 4XJ9A 2F12A 3H6JA 3LSDA 1S0IA 4KS2A 4TZDA 1G9DA 4PBPA 2B7YA 4CZSA 3N7KA 4YG6A 2WLQA 2GNDA 3R4SA 1OKQA 4K1JA 4AYUA 5F9TA 3D5OA 4GDIA 3NV3A 4JF7A 1VLNA 2VSMA 1LU1A 1WD4A 2XZJA 3H73A 2ZHMA 2F26A 4B7RA 1E8VA 1FNZA 3IN9A 1CR7A 1MVEA 2R1BA 4CPOA 1RITA 1A4QA 3AP5A 5E8AA 4I00A 1JOJA 3O0VA 4P9YA 1Z4YA 1WCSA 1LOGA 1MS4A 3ZXJA 1LECA 2OUHA 5DUWA 1SBDA 2P3KA 3WDVA 4D69A 2A75A 1JN2P 1EPWA 4UW3A 4OZXA 3SISA 4Q26A 5T50A 1IVEA 1GZ9A 2HT5A 3AZXA 3O9KA 4XJZA 4DS0A 4K1KA 2SIMA 2VW1A 3RRDA 2JE9A 2QWEA 3B01A 5T5PA 1PZ7A 2AEPA 1LHVA 1C1LA 1WCQA 1DFQA 1DQ5A 2QWAA 3ALXA 3QLQA 3ZPYA 2ZHNA 7NN9A 4X49A 2ZMLA 2WNEA 1DILA 1N1TA 3OY8B 5JVVA 4XBNA 1CPMA 2VWDA 5EYYA 3AYCA 2HTUA 1V00A 1Q8SA 4BLJA 1QKQA 2VSKA 2A5ZA 1NCBN 2D6PA 1V6OA 1OQ1A 1Z4WA 1XQNA 2CWSA 1I1EA 1G7YA 3GVJA 1G9CA 1MS5A 1WW7A 2X9MA 2E7QA 4MWRA 4Y20B 4GZWA 1WBFA 3WG3A 4Y26A 1VCUA 4K1HA 2A6VA 4XIKA 1IS4A 1PZ8A 4JRAA 1KQRA 3SNMA 3NSSA 3K3AA 4MWXA 5KXCA 3A72A 4GZTA 3T1EA 1ENSA 1LHUA 1FV2A 4XILA 4AWDA 1KRIA 2VU9A 4GB1A 4C1WA 3RMXA 2VW2A 4K1ZA 4XHBA 4GKXA 1NXD1 1CQ9A 1URXA 1WW6A 1DYKA 3W58A 5GALA 1TEIA 3V65A 1IS6A 1S0DA 4SLIA 3SH5A 4WA3A 1DZQA 2E6VA 1AX2A 4M4NA 3PJQA 1GZWA 1SNTA 1S0GA 4XTPA 2AYHA 1LOFC 3K37A 2W68A 1N3OA 2F25A 1S0EA 4NN9A 3AYAA 3ILNA 1VALA 3ZSLA 4FPKA 4GZSA 2CTVA 1W6QB 3AXDA 4QN3A 2PHWA 1W6QA 2XB6C 1SLIA 4ASMB 5T55A 2NMOA 1YIFA 5DG2A 3N35A 4LBMA 1HDKA 3VKOA 1UX6A 2F10A 2AGSA 2ERFA 2AH2A 3MPPG 1QGLA 2Q5TA 1B9TA 1H9WA 2XZIA 1KITA 2D6NA 4KS3A 3IKWA 4B7NA 1N1SA 3AK0A 1SO7A 2QWHA 4CTEA 3ZVXA 2UWAA 3MW2A 3WCRA 3OBRA 1W1XA 3B7EA 4FPYA 3MW3A 2PHRA 4MWUA 3I4IA 5IT6A 4YZ3A 1YI7A 2R16A 1V2IA 2A3YA 5EXOA 4Q8KA 4Q1RA 2DYCA 1JUIA 2PHUA 4GEZA 4YGEA 3FLRA 4FPCA 3VUOA 4YW1A 3RSJA 4CRQA 1IVBA 2I2SA 2QWBA 2TEPA 2DTYA 1INXA 1UL9A 3GNEA 3ZXKA 1B9SA 3OYWA 3M3OA 4MZEA 2VH9A 2A3XA 2DUPA 4D8SA 4MJUA 4WV8A 3POSA 2EXHA 1IKQA 2F11A 4DQAA 3O5SA 3TIAA 3UK9A 4LBNA 1IVCA 1DIMA 2QWKA 2OUJA 5GLWA 1MS9A 4M3CB 4GZPA 1O4YA 5T5JA 4R9DA 5EYXA 5H9PA 2ZGLA 2Z42A 1V6MA 1V3CA 1AVBA 4ISQA 3BIWE 4I30A 4YFZA 3NV1A 5L73A 5BYNA 2HTVA 1EUSA 2GMEA 3C2UA 5H9QA 5JYYA 3WDWA 2YROA 2E51A 1B9VA 2HT7A 2W52A 1NSCA 1J1TA 4MX0A 2R1DA 4AGGA 1AJOA 1E8TA 2BQPA 2ZMKA 5GJ6A 3HR9A 2CWMA 2NMNA 1SCSA 3WDXA 1S0CA 1MVQA 3ZXLA 2AENA 4B7QA 2WT2A 2ZMNA 3V0AA 1IS3A 3RQ0A 4YZ4A 3ENRA 3DGTA 1N47A 4H55A 3ZXFA 1W6PA 4DRRA 1ULCA 4FPGA 5IK4A 4PF5A 2VVZA 1V6KA 1SLCA 2EXKA 2BZDA 2NYYA 4PQ9A 3O0XA 3GALA 3FFZA 1ULGA 2DUQA 1U0AA 1INWA 4XJ8A 2DVAA 2ZB6A 4M3MA 1PZ9A 5DUXA 5CBLA 4CPZA 4LBQB 5GLVA 3H0OA 2V73A 4YW5A 2ZACA 2FMDA 2VK6A 4Y1XA 4XJAA 3MW4A 4MWWA 4PCRA 1A4GA 4C1XA 1C57A 2KM2A 4YFWA 3WDYA 4AGRA 2BERA 1Z0HA 4M00A 4DGRA 2D7FA 2NZ9A 1LOCA 2XG3A 3O0WA 2QWGA 2ZGTA 2WQZC 2HU4A 3W09A 5DUUA 1C4RA 4FPLA 1CESA 3B3QE 1IS5A 4Q27A 2YA6A 1LESA 1ZM1A 2DUOA 4YGCA 1D0HA 3OBTA 2WT1A 1JXNA 4NO4A 4AVVA 5JDBA 4XMAA 1VCJA 4M01A 3WDUA 1C1FA 1QOTA 2F27A 1JYCA 2YXSA 3M1HA 1DHKB 3WG2A 4YGDA 3PVEA 3T1LA 4M3CF 3AP7A 2DU1A 2GALA 4FPOB 4MWQA 5KXEA 1QNWA 4RL7A 3BOPA 1YO8A 2YA8A 4QN6A 4LBKA 3HN1A 1B09A 1F8DA 3A0NA 4GZQA 4B7MA 1SCRA 3M2MA 2W5OA 1WW4A 2GMPA 4P9XA 4HANA 2SILA 2XZKA 3ZXEA 3R4UA 3AYDA 2ARXA 3FBYA 3ILRA 4ISRA 4AGVA 5CAZA 4AVSA 1GV9A 1VAMA 4KS4A 2P3IA 3ZYRA 4GKYA 1BYHA 4UF7A 4YZ5A 4QN7A 1DQ2A 1DQ4A 4FOYA 2GN7A 4YM1A 3V64A 2WKKA 4LBQD 3FLPA 2BATA 3KM5A 4ATEA 1F9KA 4XXAA 5CNAA 1DIWA 2W08A 3Q9OA 3B9CA 1LHOA 4DRVA 2CMLA 1V6LA 1ULFA 3AP9A 2FHRA 4DFSA 3POWA 3N3HA 5HUMA 1LGCA 5NN9A 4JCKA 2PHTA 4MWYA 5KXBA 1OFSA 2JDZA 2GNMA 1LGNA 3T1MA 3USUA 1W21A 1FV3A 1F8EA 3FUOA 4MWJA 2XCYA 1A78A 1WLDA 1NMAN 1AJKA 3AXEA 4BOWA 3APBA 1AXYA 4UW6A 2VY0A 1EURA 1UZYA 1HLCA 5GZCA 5T52A 4P14A 3VKFC 1INGA 1WD3A 3ZSJA 4ZKTB 3KQRA 2YA7A 3A4UA 4GJTA 1SLAA 2RKCA 3BTAA 5SV8A 2YDTA 2ZGNA 4CPMA 5JLVA 4WEGA 5IUQA 1V6IA 1NSDA 4GDJA 1IKPA 1GZWB 4CPYA 5JOYA 1RIRA 3CL0A 3AX4A 3D11A 4Y24A 2ZGQA 4BMEA 3WCSA 4YM2A 3HMYA 3B69A 4XYXA 4Y22A 2F28A 2ZKNA 5HUNA 3CNAA 4RA0A 2HT8A 4W65A 4XBQA 1CJPA 4FP3A 2VXRA 5JOZA 3CL2A 1SLBA 4WVWA 5E89A 2AREA 2HTYA 1LOFA 3INAA 1GZCA 1WW5A 3PVOA 1W0PA 3UJQA 2P2KA 3O9JA 1FATA 5IK5A 4K3YA 2DVBA 1Q56A 1ZA4A 1LTEA 2ENRA 3R05A 2DWRA 2UURA 4MWVA 4Y1VA 1CIWA 4BPZA 3SITA 1BXHA 1AX0A 3ILFA 3NWKA 4FOVA 5M1ZA 1NCCN 2A71A 1GICA 2ZGKA 3IPVB 1DYPA 4QNPA 1IOAA 3SILA 5JOXA 2ZB5A 1W6MB 3IPVA 3PVNA 5DXDA 1LOEA 3D6EA 1NLSA 1SFYA 1W6MA 1USRA 5GLZA 1LENA 1KDMA 1QMJA 1E8UA 3N7JA 1N3QA 2HTQA 3T2TA 3INBA 1BZWA 4NCSA 4YG0A 2CY6A 3AYEA 3RS6A 3I8TA 3AZZA 3D4KA 1KDKA 3OYWB 2VW0A 4XHXA 3ZSMA 2D6KA 4GA9A 2AR6A 4LBLA 4TYSA 1YXWA 2OVUA 4K21A 2W20A 5HX0A 1S0FA 2JJ6A 2EXIA 3ZYPA 3GVKA 2D6LX 3IMNA 3WZ1A 3WV6A 5E88A 6NN9A 4XJUA 1MS0A 5GZDA 5GZFA 3QCWA 2R0HA 2ZAAA 4BLIA 2GNBA 1V0FA 2ZGSA 4YW3A 2JD4A 3OJBA 1QDOA 2DV9A 2WJSA 1CN1A 2D3SA 4HL0A 1GSLA 1LU2A 4XBLA 3RMYA 4H53A 1R1ZA 3TI5A 2ZHLA 4U2AA 2F29A 2A70A 2YV8A 4WVVA 1IVGA 2HTWA 4Z8BA 1Y7BA 1APNA 2EXJA 4YZ2A 1WLCA 3NN9A 4DPNA 1IVFA 1LODA 2ES3A 1DGLA 2VK5A 1G86A 2D3RA 3V0AB 1MZ6A 1GANA 1F5FA 3WVJA 2C4LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HNMA 3VBHA 4CPBA 1CVNA 1W6PB 2QE8A 4UT5A 2E33A 4WVMA 1W90A 3THDA 4B7JA 3N9MA 3WW4A 1R093 4XZPA 2P3JA 4QDRA 4BQ5A 1H8TC 2RS13 1WMEA 2VQTA 3ZMOA 2C5DA 3AP4A 1XE8A 1VBC2 1R1A3 5DG1A 1WLWA 1ZNPA 1AXZA 4OHVA 2C4AA 3JD72 2NN8A 3NJZA 2JKXA 2ZXQA 2ZX2A 4M3CE 2G4IA 4WA5A 1ULDA 4CEYB 2ZGPA 4LBOA 3KVBA 2P34A 5D8AC 4XTMA 2WSVA 5D8AB 5JXHA 1W20A 1FOD1 2ORZA 1MZ5A 1Q8QA 2DVFA 4PT6A 1C9UA 1UN1A 1NQJA 2ZGRA 4GWNA 1IUCA 1X7NA 1S18A 4CEYA 2C9AA 3AP6A 4HIZA 3UESA 4B1LA 5A6YA 1RUD2 1INFA 1RMU3 1US2A 1QXJA 3NRUA 1XNAA 5LEKA 2VAQA 3SEEA 4JKLA 1RWIA 4W6YA 2ZX3A 1EY2A 4QXHA 4DZGA 2VXJA 5ISLA 2KD7A 1JW6A 1CONA 1XBFA 1I5PA 4N1BA 2LROA 5FP7A 2ZW9A 1QOOA 1KD7A 4QN4A 2Y6GA 1AYM2 5E6HA 2ZX1A 1EAH3 1SACA 2JB8A 4P02B 4CPNA 3LDRA 4IDZA 1HW5A 1NQDA 3K75B 1K32A 4ZGCA 2BUKA 2RHPA 1OD5A 4YRDA 3JXSA 4QX2A 4PBOA 4A2UA 1Q8VA 2PQSA 2ZZQA 1GYKA 4AI0A 3HAGA 5CZKA 3LOIA 5F32A 5LBCA 1S1AA 2UWBA 3LWCA 1O4TA 1NN2A 4IEUA 4COVA 3K36A 1U6DX 4CCLA 2XKPA 4KU7A 5F3EA 5I8TA 3LDKA 3O1SA 3VN4A 4X47A 1DDLA 3U0ZA 2X10A 4BMBA 2ZEYA 4LLOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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