4SLIA

Leech intramolecular trans-sialidase complexed with 2-propenyl-neu5ac, an inactive substrate analogue
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
IPEGILMEKNNVDIAEGQGYSLDQEAGAKYVKAMTQGTIILSYKSTSENGIQSLFSVGNSTAGNQDRHFHIYITNSGGIGIELRNTDGVFNYTLDRPASVRALYKGERVFNTVALKADAANKQCRLFANGELLATLDKDAFKFISDITGVDNVTLGGTKRQGKIAYPFGGTIGDIKVYSNALSDEELIQATGVTTYGENIFYAGDVTESNYFRIPSLLTLSTGTVISAADARYGGTHDSKSKINIAFAKSTDGGNTWSEPTLPLKFDDYIAKNIDWPRDSVGKNVQIQGSASYIDPVLLEDKLTKRIFLFADLMPAGIGSSNASVGSGFKEVNGKKYLKLRWHKDAGRAYDYTIREKGVIYNDATNQPTEFRVDGEYNLYQHDTNLTCKQYDYNFSGNNLIESKTDVDVNMNIFYKNSVFKAFPTNYLAMRYSDDEGASWSDLDIVSSFKPEVSKFLVVGPGIGKQISTGENAGRLLVPLYSKSSAELGFMYSDDHGDNWTYVEADNLTGGATAEAQIVEMPDGSLKTYLRTGSNCIAEVTSIDGGETWSDRVPLQGISTTSYGTQLSVINYSQPIDGKPAIILSSPNATNGRKNGKIWIGLVNDTGNTGIDKYSVEWKYSYAVDTPQMGYSYSCLAELPDGQVGLLYEKYDSWSRNELHLKDILKFEKYSISELTGQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The 1.8 A structures of leech intramolecular trans-sialidase complexes: evidence of its enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords INTRAMOLECULAR TRANS-SIALIDASE
molecule tags Enzyme
source organism Macrobdella decora
total genus 186
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature ec 4.2.2.15: Anhydrosialidase.
pdb deposition date 1998-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02973 Sialidase Sialidase, N-terminal domain
A PF13088 BNR_2 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.220.10 Mainly Beta Beta Barrel Intramolecular trans-sialidase; domain 3 Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 4sliA03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4sliA01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 4sliA02
3O9JA 2F26A 4I00A 4WA4A 3AK0A 4I30A 2YA8A 4XIKA 1MZ5A 4UW3A 2YMZA 2QWHA 2AR6A 3T1MA 4GZQA 4KS3A 2ZMKA 2WSUA 2W68A 3RS6A 4CPNA 1KDKA 1LEMA 4GZPA 3PVEA 4PBPA 4KS2A 1V0FA 3L2YA 2TEPA 1X50A 5GJ6A 3ILRA 1BJIA 4M3CA 1W6OB 1ENQA 2FHRA 1RINA 1F8BA 1NNAA 3WG4A 4HZYA 4J9TA 3FFZA 2ARBA 2GMEA 1G9AA 2QWKA 4XILA 2F27A 2F24A 4YZ3A 4YW3A 1Z78A 3A0KA 2XZJA 2WSVA 3VUOA 1GZ9A 1XQNA 4HL0A 1RITA 1SACA 1AJKA 1GV9A 1S0FA 3BEQA 2CYFA 2W08A 4FQZA 4U36A 3AYDA 2A3YA 4XDQA 2BF6A 2ZGNA 2XCYA 5GLZA 1INWA 3OY8A 1QOOA 4FPLA 2EAKA 1AX2A 1ZA4A 1JYCA 2R49A 2OUHA 3SH3A 1V3BA 4YG3A 1QNYA 1DGLA 3K37A 2ZAAA 2UU8A 1CIWA 4CRQA 1H9PA 1IVFA 4HIZA 2EXJA 2R0FA 2AH2A 4Q1PA 4MWXA 4YGBA 2QWDA 2DVBA 2E53A 3RMXA 2HYKA 2CNAA 2ZMNA 1WLDA 1W6OA 4YZ4A 4MWRA 4M4VA 1NSCA 1S1AA 2JD4A 1LGCA 3KQRA 5CB7A 5B2DA 2UWBA 3SH5A 3WHUA 2ZGMA 4LBLA 3FUQA 5JDBA 1FAYA 3JU9A 4M3MA 3SITA 1V3EA 1A8DA 3W09A 4FPCA 3ZSJA 4D69A 1W0PA 5GZCA 3AJZA 3T2TA 2CY6A 4Y24A 1GNZA 5HX0A 3B00A 1FV2A 2R1BA 1OKQA 5IK4A 3WG2A 1F8EA 3BODA 4DS0A 4XJZA 2YROA 1CN1A 2A6VA 4XXPA 1SBDA 2WLQA 1Y7BA 4TZDA 3ILNA 4XOGA 4WEGA 4YFWA 4YGCA 1Z0HA 3W58A 3MEPA 1NSBA 4CPOA 3LSEA 2WQZC 3CL0A 5JMCA 2D43A 1MS1A 1HLCA 4B7RA 4MWLA 3OYWB 4GXLA 3V0BB 4CPMA 2SBAA 1PZ9A 1FYUA 4YGEA 1BZWA 4GA9A 2VVZA 3RSJA 1BXHA 2NMOA 3AP4A 1SFYA 2KM2A 4X6KA 1NNBA 4B7QA 1B9SA 4ATFA 1EUTA 2ZA9A 1INXA 1IOAA 5JOWA 2HT5A 1AXKA 1HQWA 4WZFA 1WW5A 3WUCA 1SBFA 1UZZA 4P9XA 5GLTA 4YM3A 3AP9A 3ZPYA 3T1LA 3N35A 3ZVXA 4YG0A 3WUDA 1V00A 1LOGA 4Q6KA 1ENRA 2W38A 2E51A 1LJ7A 4HZWA 1FATA 1U0AA 1Q8PA 3A72A 3KM5A 1V6IA 2HTWA 4DQAA 4YZ1A 4QN4A 1EPWA 3WCRA 1F5FA 4BOWA 3N7MA 4Q2FA 3B01A 1DYKA 2NYYA 2WKKA 2D6MA 4K1YA 5FREA 4FP3A 3M3CA 1LCLA 2YDPA 1UAIA 3HMYA 4XMIA 1FNZA 2JE7A 3OPZA 1S0JA 3GALA 3OYWA 3V0BA 3ENRA 3H0OA 3WDYA 3NSSA 2EXHA 1RIRA 4MYEA 2VK6A 4BBWA 1LU2A 4AVVA 4HZZA 4MC7A 1ULCA 4L8QA 2CWSA 1F9KA 1GYKA 1J1TA 4XTPA 2ZHMA 3WG3A 3A4UA 2ZZJA 4YG6A 1WD3A 3M3OA 2A6ZA 1LOBA 1B9VA 2VK5A 1JUIA 3A0NA 1LOFA 4Z8BA 1NMBN 1V6LA 1QDOA 1GICA 1VLNA 3Q9OA 2AYHA 3ZSKA 4FOYA 1GSLA 1QGLA 1S0GA 3GNEA 1DIMA 5NN9A 3D6EA 3ZXFA 4B7JA 2ZGSA 3ALXA 1H30A 3O5SA 2YA5A 1NNCA 1IVDA 1C1FA 1N3PA 5BYNA 2WT0A 2JJ6A 1IVBA 2NZ9A 3B3QE 3PVNA 1IS3A 2OUJA 2D6OX 5L73A 1UN1A 2GALA 2R0HA 2A7AA 3QCWA 2R16A 4LBNA 1SLTA 3FLTA 1CPNA 1INFA 1W21A 4GZXA 2ZGLA 3ZSLA 1AZDA 3VKLA 3H71A 2A6WA 1MS0A 2DWRA 3VKFC 1XOGA 1LESA 2PHFA 2ZACA 4KS1A 3AZYA 2C9AA 2A6YA 3SISA 5HUNA 5T52A 2DVAA 3IN9A 2HU0A 1B09A 4XJWA 4FPKA 3RMYA 2QWCA 4YW1A 3FLPA 3H72A 3BOPA 1PZ7A 3AZZA 3AJYA 2VW1A 4WA5A 1W6NB 4GKYA 4RL7A 1KITA 2RHPA 1VIWB 2HT8A 1S0IA 3O0VA 4K1ZA 3M3QA 3LCPA 2F28A 4Y22A 3U4XA 2HTUA 2DUQA 5F9TA 4CTEA 1GBGA 1IKQA 3SNMA 4YM1A 3K38A 4H53A 2ARXA 3UK9A 1ULDA 3B69A 3MW2A 3O12A 4M4UA 2P3JA 3T1EA 3TB0A 4GEZA 4CZSA 1DILA 3TI8A 1DIWA 3JU4A 2W5OA 2VWDA 1CESA 4GZTA 3BIWE 4FVVA 3LSDA 1YYNA 2EALA 2DTWA 1A78A 2DUOA 2GNMA 3PVOA 2DYCA 3C2UA 4P9YA 5IT6A 3POYA 1W1XA 5T5OA 2F29A 2VH9A 1LULA 2C5DA 5M1ZA 4Y20B 1LHVA 1PZ8A 1DQ0A 1USRA 3R05A 3ASIA 4DGRA 3VV1A 1Z4YA 5AVAA 1LOEA 1UKGA 2BZDA 3PJQA 1N1VA 1JN2P 4XMAA 4FPYA 5DUUA 4FPJA 4MWVA 1HQLA 5DXDA 4FPFA 1A4GA 4AGGA 2NN8A 4GZOA 2ZKNA 1W6NA 1ZM1A 5CA6A 4SLIA 3WZ1A 2I2SA 5B2CA 4JC1A 1AXYA 5GLWA 2H0BA 3SLIA 3ZYPA 3TI5A 3AP5A 1INVA 1V2IA 1APNA 5LK5A 1IS4A 1A14N 4YZ2A 4GDJA 4CPZA 5GLVA 4YM0A 4MX0A 1N1TA 4GJTA 4QN6A 1MS8A 5JOZA 4FOWA 2C4LA 1V6MA 1S0CA 4NN9A 1E8VA 1AX0A 4BPZA 1LHWA 1KQRA 2G4IA 1A4QA 4NOTA 4F83A 3SALA 1AJOA 4QNPA 4Q8KA 5T55A 1LODA 2ZB6A 1WBFA 2ZGOA 1ULFA 4R9BA 1IKPA 1N3QA 4BLJA 3RQ0A 1KDMA 5IK7A 4MJVA 4M4NA 2ZGKA 1IVCA 2HTVA 3NV2A 2DV9A 4GWNA 5EYXA 4GB1A 3I4IA 4Y20A 2ZB5A 2EF6A 1Z50A 1NMCA 1CQ9A 3NWKA 5KXCA 1MVQA 1G9FA 2ZHNA 4XHXA 3BTAA 4X47A 4Q1RA 2UWAA 2D6NA 4GKXA 2PHRA 1F31A 1WUVA 1ULEA 1NXD1 1V0EA 3WDWA 4W65A 2JECA 4QN3A 2DTYA 3USUB 3SANA 3DUIA 1JOJA 3NN9A 1R1ZA 3O0WA 1W8NA 4C1WA 2YV8A 5H9PA 1MS3A 4U2AA 4YGDA 2HTRA 5JOYA 1GANA 1C1LA 2A5ZA 1DQ6A 4XBLA 2SIMA 2CWMA 2XG3A 4K1HA 1MR5A 2GN3A 5GLUA 4BMBA 1UZYA 2F0ZA 4M00A 1HDKA 4XJ9A 1BJQA 1IVEA 4XZPA 2VW2A 2JE9A 1MS5A 1NCCN 1W6MB 2EXKA 4GALA 1NCDN 5KXEA 2F13A 1JBCA 1OQ1A 4P9WA 4Y1XA 2VY0A 3R4SA 1SCSA 4BMEA 3B7EA 4WEFA 1Q8VA 3GVJA 4K1KA 5T5LA 1Q8SA 4MWWA 3SILA 4B7NA 4K21A 1G86A 4MWUA 4WVWA 5EXOA 2DUPA 2GNDA 4YFZA 2F10A 1UX6A 2W39A 1CVNA 1QKQA 3AZVA 2EIGA 2ZMLA 5HCBA 3USUA 4LBJA 3APBA 1QF3A 1LOAA 1ENSA 4MWQA 5GM0A 1NMAN 5GZDA 2A3WA 2GDFA 1DQ4A 3WVJA 2F12A 2YXSA 3TICA 4K3YA 1BKZA 2YDTA 3A71A 4NCSA 2P34A 3B9CA 4FP2A 1QDCA 2AENA 1XOEA 1UL9A 1YI7A 4DFSA 4ASMB 1MS4A 1WCQA 4H52A 1Z4VA 4PQ9A 4R9DA 1W6MA 3RRDA 2ZHKA 3WNXA 1F8CA 3NV1A 3CNAA 2NM1A 2BERA 4BLIA 1GLHA 4MWJA 2QWEA 5HUKA 1EUUA 5H9RA 1V6JA 4UF7A 5T5PA 4CPLA 4QN7A 5SV8A 3WDVA 4IQPA 5FRAA 1V3DA 1AVBA 2YZ4A 4R9CA 4KS4A 1LU1A 1G9DA 1L7GA 1FNYA 2CL2A 4GZWA 2YA4A 2B7YA 4Q26A 3INAA 4LBQD 1UPSA 3HR9A 5IUQA 1QU0A 1Q8OA 2QWAA 4WA3A 1F8DA 4MJUA 3NV4A 3MW3A 2ES3A 1DLLA 4UW6A 5JYYA 3AX4A 3RG0A 4XHBA 4ITCA 3CKZA 1SLLA 1MACA 4WVVA 3W59A 1E8TA 5GZGA 4KS5A 3AFKA 1USXA 1JXNA 2AREA 3AYEA 5E88A 2SILA 5EWSA 4FPEA 4PBOA 2NP0A 3IPVB 1IS6A 3VKOA 2A71A 4JRAA 1L7FA 1MWEA 2DU1A 1FX5A 1DQ2A 3OGGA 2XZIA 1URXA 3V0AB 1CJPA 3R4UA 2ZGUA 2D3RA 3QLQA 4AYUA 2CMLA 1N47A 1SBEA 2PELA 1JHNA 3PMEA 1QOTA 4M3CF 4MWYA 3FLRA 4MZAA 4AVTA 1MZ6A 1EURA 3K39A 3H6JA 4ATEA 2ZGPA 4XJQA 3WDUA 3FBYA 2VXRA 3N7KA 5DZEA 4K1IA 4AWDA 2D3PA 2ZGTA 1D0HA 1E8UA 3TIAA 4TYSA 5E8AA 3OBTA 2DVGA 3NV3A 2D6KA 5H9QA 4Y1VA 2GNBA 1AXZA 4YLZA 4YM2A 4MZEA 1VCUA 3ZYRA 4Q8LA 4YW2A 1WW6A 1S0BA 5T54A 2F25A 1S0EA 3UL2A 1WD4A 3V64A 1YRZA 3VKMA 1Q8QA 2QWIA 3WLUA 1INGA 3M1HA 1OFSA 4AVSA 3D5OA 2YA6A 1DYPA 1G8WA 3OJBA 1KRIA 4RA0A 2GNTA 3WV6A 1V0ZA 4XBQA 3IPVA 5DZFA 2D44A 1TEIA 2JKBA 5HUGA 2A75A 3AYAA 1G9CA 1DQ5A 1VALA 4YW4A 5CAZA 1IS5A 4UW5A 5JLVA 1SLIA 4X49A 4XJAA 3V0AA 2Q5TA 4XYXA 2P2KA 2RKCA 1FV3A 3ILFA 2WT2A 2XB6C 1DBNA 3WDTA 1LHOA 2FMDA 4GZSA 1LHUA 4LBMA 2UWCA 1L7HA 1WBLA 3N36A 1B9TA 4AGVA 2ENRA 1SLCA 5IK5A 4D8SA 3AZWA 3WDXA 4XBNA 1W6QB 2SLIA 3GVLA 2LALA 4XIOA 4ISQA 4Y1ZA 1N1SA 2D6PA 4XJUA 1Z4XA 3WOGA 1CR7A 1A3KA 4FVKA 4M01A 4JF7A 3WG1A 4FPOB 1C4RA 4LBOA 3AXEA 1YO8A 3AZXA 5EYYA 1JW6A 2VW0A 1Z4WA 3MW4A 3N7JA 2QWFA 1SLBA 4XXAA 2XZKA 2AGSA 4X4AA 1LEDA 3POSA 2PHWA 4YZ5A 2OW4A 4QN5A 2ZGRA 3M2MA 4FQ4A 1KJLA 2WJSA 5T50A 2ZHLA 2AEPA 4PF5A 2W20A 1QNWA 3D11A 4DPNA 4ISRA 3ATGA 5GALA 4HZXA 4ZKTB 2D6LX 3AXDA 4WV8A 4XJ8A 1VCJA 1V6OA 1BQPA 5HCAA 3CYEA 2VUAA 1DFQA 1W6QA 1LHNA 2DVFA 1SNTA 5DUWA 1WCSA 2B8HA 2BATA 2GMMA 2HT7A 1NCAN 1GNHA 1GZWB 3OBRA 5HUMA 5GZEA 1I1EA 4FPHA 1V6NA 2NMNA 2V5YA 2DVDA 4B7MA 1AX1A 2VU9A 2QWGA 1UMZA 1O4YA 5T5JA 3VKNA 1LTEA 2R1DA 4Y1YA 1G7YA 1JYIA 4BQ1A 4OZXA 4Y26A 1LOFC 3AP7A 1O4ZA 4Q27A 5KXDA 1SO7A 2D7FA 4ZXKA 3ALWA 1WW4A 1YXWA 3ZXEA 3TIBA 2AUYA 4LBKA 1ONAA 1CPMA 1GKBA 1SCRA 2E7QA 3POWA 2WNEA 2YA7A 5JVVA 2PHUA 4K1JA 1W8OA 4LBQB 5GZFA 5CBLA 6NN9A 1WLCA 3IMNA 4FPGA 3IM0A 4FJ6A 2ERFA 3UJQA 2C4AA 4XJRA 1H9WA 1BYHA 4PCRA 4FOVA 2EXIA 5DG2A 3WCSA 1KJRA 5DG1A 2A70A 1W6PB 2HTQA 1GZWA 1ULGA 3TI4A 1W20A 2AEQA 4K20A 2W5NA 2DU0A 3WHTA 2PHTA 1LGBA 1LOCA 3TAYA 2BQPA 2P3IA 4KBBA 1WW7A 1DHKB 3GVKA 1QOSA 3DGTA 3SH4A 2VSMA 2YY1A 2P37A 4C1XA 7NN9A 5JOXA 1V6KA 1MS9A 1INHA 2ZBJA 1C57A 3FUOA 3O9KA 2QWJA 1I3HA 2E6VA 3M3EA 4GDIA 1Z4ZA 2LTNA 5DUVA 3I8TA 1CONA 1VAMA 2QWBA 4DRVA 2ZGQA 2Z42A 1NLSA 1AF9A 4FOQA 3TI3A 1S0DA 1LECA 4LBQA 2VSKA 2PHXA 5DZGA 1G9BA 2VK7A 2CTVA 1NCBN 1W0OA 3IKWA 3AYCA 3INBA 5E89A 3UJOA 1LGNA 3V65A 1Q56A 4BM8A 1W6PA 4Y22B 2JDZA 3D4KA 1GZCA 5HCFA 4Y1UA 3N7LA 2X9MA 2E7TA 1VAVA 1EUSA 4YW5A 5KXBA 4HZVA 2WT1A 4XTMA 5F5QA 1SLAA 3HN1A 3ZSMA 4XE9A 3ZXJA 4NC5A 4CPYA 2HTYA 1MVEA 2A3XA 2GN7A 3TI6A 4M3CE 4H55A 1N3OA 3N3HA 5CNAA 2A6XA 4M3CB 2V73A 3ZXLA 2DURA 2P3KA 2F11A 2UURA 3D12A 5H9SA 4FZHA 3MPPG 1HKDA 4R9AA 1NSDA 3O0XA 1IVGA 3ZXKA 1V3CA 1DQ1A 1QMJA 4GWMA 1N1YA 3H73A 3AP6A 2GMPA 3CL2A 2D3SA 1NN2A 4UW4A 4DRRA 4HANA 3K36A 1WLWA 3K3AA 4P14A 4AGRA 2HU4A 4NO4A 1D2SA 2OVUA 5IK8A 1DZQA 2W52A 1YIFA 4JCKA 1LENA 2ZABA 3JUUA 1INYA 3OY8B 5DUXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O9JA 4MUVA 5BNNA 1T6BX 4NUBA 2F26A 1PMJX 1V04A 1S55A 2J22A 2VTXA 4I00A 4WA4A 4Y3OA 3BU7A 1QJEA 3AK0A 4QX8A 4I30A 3I3MA 1H2LA 2YA8A 5FYYA 4XIKA 1MZ5A 4UW3A 2YMZA 3B94A 5IVYA 2QWHA 1OLME 2AR6A 3T1MA 5CYYA 4N90A 2CAVA 3UT0A 1FMD2 1POV1 1JYTA 1RWLA 4GZQA 1WLTA 4KS3A 1IQAA 2ZMKA 5FIXA 1ZRDA 3VDBA 2I74A 1W2AX 2W68A 2WSUA 3Q8AA 1PVXA 4D52B 1PK6B 5FYHA 3F95A 3RS6A 4CU6A 4CPNA 2PLV2 1KDKA 2QQJA 4IXLA 2PAKA 2QQNA 1XNBA 3NAPB 1LEMA 5A7PA 3O1TA 5JZGA 4GZPA 4JGZC 3PVEA 2WLPA 3C7GA 4PIYA 5A32B 1FPN2 2VZQA 4N43A 1PGL2 4GH4B 1E5HA 4PBPA 3HBKA 4KS2A 1WCDJ 2GVWA 1V0FA 3L2YA 3N9MA 1RYYA 3OSDA 4QXCA 2Q30A 2TEPA 1X50A 5GJ6A 3ZYIB 3ILRA 2EIEA 2HWD1 4BISA 1BJIA 4M3CA 1PMIA 1RUE1 1W6OB 1HJFA 4RYDA 1ENQA 4CCMA 4I2OA 4GJZA 3WP5A 3I2HA 2FHRA 1RINA 2HWE2 2K9ZA 2PTMA 3SCGA 4AFBA 1MQTB 5BNOB 4HVRA 3LDRA 4QQPA 3BTXA 1F8BA 2WNVC 3I2DA 4AF9A 1NNAA 4UAPA 4XW3A 4P02B 3WG4A 4Q1UA 4RFRB 5A33B 1EYBA 4HZYA 4J9TA 3FFZA 2ARBA 2B42B 2BGCA 4UFJA 4AHWA 5A6XA 2GMEA 1G9AA 5KC6A 2QWKA 4XILA 1XNTA 1OOPB 2WZ8A 3T0BA 4S2HA 4AFMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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