4YZ3A

Crystal structure of streptococcus pneumoniae nanc, in complex with oseltamivir.
Total Genus 194
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
194
sequence length
657
structure length
654
Chain Sequence
TPVLEKNNVTLTGGGENVTKELKDKFTSGDFTVVIKYNQSSEKGLQALFGISNSKPGQQNSYVDVFLRDNGELGMEARDTSSNKNNLVSRPASVWGKYKQEAVTNTVAVVADSVKKTYSLYANGTKVVEKKVDNFLNIKDIKGIDYYMLGGVKRAGKTAFGFNGTLENIKFFNSALDEETVKKMTTNAVTGHLIYTANDTTGSNYFRIPVLYTFSNGRVFSSIDARYGGTHDFLNKINIATSYSDDNGKTWTKPKLTLAFDDFAPVPLEWPREVGGRDLQISGGATYIDSVIVEKKNKQVLMFADVMPAGVSFREATRKDSGYKQIDGNYYLKLRKQGDTDYNYTIRENGTVYDDRTNRPTEFSVDKNFGIKQNGNYLTVEQYSVSFKKTEYRNGTKVHMNIFYKDALFKVVPTNYIAYISSNDHGESWSAPTLLPPIMGLNRNAPYLGPGRGIIESSTGRILIPSYTGKESAFIYSDDNGASWKVKVVPLPSSWSAEAQFVELSPGVIQAYMRTNNGKIAYLTSKDAGTTWSAPEYLKFVSNPSYGTQLSIINYSQLIDGKKAVILSTPNSTNGRKHGQIWIGLINDDNTIDWRYHHDVDYSNYGYSYSTLTELPNHEIGLMFEKFDSWSRNELHMKNVVPYITFKIEDLKKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
source organism Streptococcus pneumoniae serotype 4
publication title Crystal Structure of Streptococcus pneumoniae NanC.
rcsb
molecule keywords Neuraminidase
total genus 194
structure length 654
sequence length 657
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2015-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02012 BNR BNR/Asp-box repeat
A PF02973 Sialidase Sialidase, N-terminal domain
A PF13088 BNR_2 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.220.10 Mainly Beta Beta Barrel Intramolecular trans-sialidase; domain 3 Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 4yz3A03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4yz3A01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 4yz3A02
1QU0A 1VAVA 2D6LX 4XZPA 3ZXEA 1DIWA 1JYCA 5DUVA 3AYEA 1QDOA 2D6PA 1GBGA 5E8AA 5BYNA 4LBMA 1V00A 2A6VA 2PHWA 1SNTA 3WHTA 4Z8BA 1IS5A 3OYWB 4YM2A 3TI6A 2ZGOA 1INVA 3USUA 1AX1A 4K1JA 4XBLA 3GVLA 1ZA4A 3WDWA 1QMJA 5DG1A 2AREA 4B7QA 3T1EA 1Z4XA 4Q2FA 4X47A 1S0EA 4YGBA 4NN9A 3N7KA 2ZMNA 3O12A 3RG0A 2HTUA 1AX2A 5FREA 4P9XA 1JW6A 4FPCA 4PQ9A 5HCFA 1A3KA 5GZEA 3B01A 1YIFA 3ATGA 1NMAN 4WV8A 1INHA 2DU0A 3AK0A 4RA0A 4FPEA 4XILA 1LHVA 1GLHA 1N1VA 1F9KA 3B69A 4ZKTB 2DTWA 2XZIA 2ZAAA 3UL2A 4NC5A 1Q8QA 1QKQA 2A3WA 3UK9A 3I8TA 1DQ1A 1VAMA 2W08A 2A6WA 4M4VA 4Q8LA 4UW4A 4YW4A 1DQ4A 3AZXA 4BMEA 1NCDN 1CIWA 3W58A 1NSCA 2GALA 3H71A 4U2AA 1LHOA 2Q5TA 3AJZA 1YYNA 2W38A 2HTRA 2EXHA 3ZSMA 1KRIA 2DWRA 1WBFA 2LALA 1IOAA 4YM3A 4FQ4A 3SLIA 2NZ9A 2AH2A 1DQ6A 1RITA 5T55A 3A4UA 5EYYA 3Q9OA 4Y1ZA 1SLBA 4K1YA 3HN1A 2F29A 4XJUA 3WDYA 4WZFA 5HCBA 3MEPA 2W5OA 2ZB5A 3NWKA 3FUOA 1Z4VA 1WW4A 2NN8A 4D8SA 3A0KA 4MJUA 2R1DA 2D44A 1UX6A 1W6NA 2YDTA 1V6JA 4FPJA 3HMYA 2D7FA 2AEPA 2P2KA 4FPGA 4LBOA 3DGTA 2GMPA 3GNEA 4M4NA 3V0AA 1NNBA 4MWYA 3NSSA 2F26A 4GZWA 1MS9A 4K1ZA 1W6QB 4PF5A 3PVNA 2QWHA 1SLCA 5LK5A 1WW5A 1BKZA 1GZWB 4R9BA 1SLLA 3AYDA 1LULA 1A78A 2CTVA 2JE9A 4K20A 5HUNA 4Y1UA 2ZGKA 4CPYA 1VLNA 2DTYA 2P3KA 3KM5A 2GNDA 1QNWA 1JHNA 2VW2A 1OFSA 4AYUA 4Q26A 2R0HA 3H72A 3VKNA 3LSEA 3FBYA 1W6PA 2QWIA 4GWNA 3AZWA 1LHWA 3C2UA 3H73A 4HANA 5HX0A 3IKWA 1SBEA 4GWMA 3D12A 1WD4A 3RMXA 3DUIA 4QN3A 4U36A 3O9KA 1S0BA 3O0WA 1ULDA 5DUXA 1I1EA 4WEGA 1N47A 5GLUA 1UZYA 1XQNA 1SLAA 2ES3A 1V2IA 3AP7A 3POSA 2XZJA 1V6OA 4XIKA 2Z42A 1B9VA 4Q8KA 1USXA 4M3CB 4Y22B 3TIBA 2AYHA 3ENRA 1N3QA 2XG3A 4BOWA 2V5YA 4FZHA 1F5FA 1IS4A 4X49A 2BQPA 4FPLA 1JXNA 1IKQA 1U0AA 3B7EA 3WHUA 1PZ8A 3WVJA 2FMDA 3T1LA 3JU4A 3AP4A 2BF6A 4XXPA 1JOJA 1NMCA 4BM8A 2PELA 1GNZA 1LGBA 3N3HA 3V0BB 4GALA 2AEQA 2E7TA 1Q8OA 2X9MA 3TIAA 2ZHNA 1WD3A 1HQWA 4ITCA 2VW0A 5F9TA 2VK7A 2NP0A 3APBA 2EAKA 1NNCA 1O4YA 2EALA 1MWEA 4MWLA 3CNAA 3RRDA 2C5DA 3AZYA 1UMZA 2CWSA 1LU1A 1W0PA 1EUSA 4MZAA 1IVBA 1SCRA 1AJKA 4GKXA 5IK7A 4KBBA 2VU9A 1NCAN 4K1HA 5T5OA 4AGGA 3ILNA 6NN9A 2WT0A 2PHRA 3ALXA 1QOTA 3WG1A 1WLWA 4LBQA 7NN9A 3OGGA 2ARXA 2W68A 1LOEA 1QGLA 3FLRA 5GZFA 4XHBA 2EF6A 1WLCA 1CPMA 1LTEA 1E8VA 3SITA 1L7GA 3TI4A 4LBKA 1LEDA 4XIOA 4Y24A 4JF7A 3IPVA 1IVFA 2ZB6A 2SIMA 1N3PA 5KXBA 3W09A 1GZ9A 1UN1A 4M00A 4WVVA 4GEZA 2ZGRA 5EWSA 3WDVA 2ZMKA 2B7YA 5E88A 1VIWB 2A70A 5L73A 4M3CF 1ULGA 1GANA 1A8DA 5NN9A 4MJVA 3POWA 3D6EA 5IUQA 2YY1A 3R4SA 3USUB 1MS5A 1LJ7A 4B7RA 1F31A 1YO8A 3N36A 4LBJA 3ILRA 2ZACA 2YMZA 4CPLA 4GA9A 2UWCA 4AGVA 5GM0A 1FV2A 1V6NA 2VVZA 3ZXJA 3AZZA 3MW3A 1ULFA 5H9RA 4XOGA 1B9SA 4GZTA 3WZ1A 2ENRA 4FP3A 3UJOA 1SBDA 5T5JA 2A75A 1DQ5A 1Z4WA 3WLUA 1W6MB 1INYA 4R9DA 3U4XA 3D5OA 1LOFA 2GMMA 4YZ1A 4K3YA 3SH4A 3SNMA 1QOSA 2P34A 2AGSA 4KS3A 4C1WA 1ONAA 2ZHMA 1QDCA 4Q1PA 1C57A 1HKDA 1CPNA 1B9TA 3WDTA 2E7QA 2R1BA 3OY8A 2ZGUA 4ASMB 1NSDA 3A0NA 4TZDA 5EYXA 4Q27A 1AXZA 3GVKA 4XMIA 3IMNA 4HZZA 2F28A 1DQ2A 5JVVA 1MACA 1W8OA 2DVGA 2A7AA 4Y1XA 5GLWA 4B7JA 1DQ0A 3N7MA 4MZEA 3WG3A 1GYKA 4FPHA 1GZCA 4MWRA 4GKYA 3K36A 1S0JA 2VY0A 3GVJA 1L7FA 3K3AA 3IM0A 4YZ4A 3ZSJA 1F8DA 4XDQA 2UWAA 4GZOA 2YA6A 4MWWA 4Q1RA 3PVOA 1V3BA 4BPZA 4NOTA 1PZ9A 2WSVA 4W65A 2GMEA 5KXEA 3N7LA 4M3MA 3AP5A 4NCSA 3UJQA 1G9BA 3AX4A 4CZSA 4OZXA 1CR7A 4GZQA 3I4IA 3M3OA 1Y7BA 1DZQA 2HTWA 3K38A 1DILA 4Y26A 4HZXA 2RHPA 5EXOA 1Z78A 4SLIA 3AZVA 4HIZA 4AVSA 3JU9A 4PCRA 2ZGPA 4KS2A 1R1ZA 1KDMA 3IN9A 3R4UA 4XJQA 5B2DA 3VUOA 1MS3A 4HZVA 2JJ6A 2DUOA 1HQLA 2WT2A 3WDUA 4XBNA 1APNA 2ERFA 2PHXA 4YM0A 2YROA 3WCRA 2A3YA 1F8CA 3FFZA 4CPZA 1E8TA 1RIRA 4B7MA 4FPKA 4FVVA 1NSBA 2R49A 2YV8A 2BZDA 3M2MA 4YW2A 4DQAA 2VK6A 1LU2A 3ASIA 1WCQA 1ULEA 2E6VA 5IK8A 1W6OA 2A6XA 4YZ3A 2ARBA 3SH5A 2GN7A 1LOCA 1UKGA 2D3SA 3FLPA 3ZXFA 3NV1A 3AXEA 3H6JA 3SISA 4XBQA 1BYHA 3D11A 1CN1A 3L2YA 4AWDA 1IVEA 3AXDA 5GALA 1IVDA 4DRRA 3BOPA 2G4IA 4XJRA 3TI5A 3O9JA 3WG4A 2W5NA 2ZKNA 1BXHA 5IT6A 1DHKB 1NCBN 2QWAA 4XJ9A 1G8WA 4WA3A 1AJOA 1LGNA 3V65A 3AJYA 4HL0A 5M1ZA 1YI7A 2YA4A 2F12A 3NV3A 4FQZA 4RL7A 1LODA 4FOVA 3ZSKA 2AUYA 4LBLA 3CKZA 2I2SA 2YXSA 5HUGA 4YFWA 1GKBA 3VKOA 3WCSA 4YZ5A 4Y20B 4UF7A 1JYIA 1MZ6A 3ILFA 1INFA 4AVTA 1YRZA 3ZYPA 3BEQA 4DGRA 5CA6A 1LEMA 1F8BA 3PMEA 4XJ8A 3SALA 4WEFA 4B7NA 1VCUA 1IS3A 2AENA 5KXDA 2DU1A 3K37A 3INAA 5T54A 2F24A 1C4RA 1A14N 3N35A 1W8NA 4Q6KA 5HUMA 4CPMA 4P9YA 4LBQB 2OW4A 1AXKA 1A4GA 4I00A 2HYKA 4X6KA 3VKLA 4YG6A 2JE7A 3BTAA 4QN4A 1ENSA 3ZSLA 3NV4A 2A6YA 3OBTA 1G86A 4GDIA 4QN5A 1GZWA 3PJQA 1USRA 2V73A 3LCPA 4R9AA 1DIMA 1WUVA 2R16A 4BBWA 2VH9A 4XE9A 2CNAA 2P3JA 1VALA 1V6LA 4JCKA 4YW1A 4GXLA 3V64A 4DPNA 1EUUA 1LESA 1SCSA 1FNZA 1INWA 1WW7A 2YA5A 1V3DA 3CL2A 2HTYA 4YGEA 2EXJA 2WNEA 1FNYA 1V6MA 4LBNA 3T1MA 2TEPA 1UAIA 3VV1A 3M3EA 2HT8A 3JUUA 4XYXA 2ZA9A 1Z4YA 3ZXKA 2W52A 2R0FA 1KDKA 4XHXA 1KQRA 1W1XA 3M3QA 1MS0A 1SO7A 3BODA 5DG2A 1MR5A 3FLTA 1JUIA 2WJSA 2GN3A 4FOQA 1SLTA 3AYCA 4FPYA 5SV8A 2F27A 5T5PA 1LOAA 3AP6A 2OUHA 4Y22A 1S0IA 3QLQA 1W0OA 1ENQA 4QNPA 1G9FA 2DV9A 2P3IA 4AGRA 2ZMLA 5JDBA 1FATA 1DFQA 3WG2A 5E89A 2EIGA 4KS1A 4JC1A 1IVGA 4R9CA 3BIWE 2VXRA 1S0CA 1G9CA 4XJAA 1GICA 2GDFA 1EURA 3VKMA 4D69A 3OPZA 3RSJA 1KITA 2XZKA 1Z50A 2WLQA 3SH3A 1LGCA 4IQPA 1Q8PA 4YW5A 1V0ZA 4MWJA 4ATFA 4UW6A 1ULCA 3TB0A 1HDKA 2JD4A 1LOGA 2QWBA 2GNBA 4YZ2A 3NV2A 4FVKA 4XJZA 1AZDA 5JMCA 1V6KA 4Y1YA 2HT7A 4H55A 2XB6C 5FRAA 2D6NA 2AR6A 1WCSA 4UW5A 3RS6A 4YFZA 2NMOA 4MWVA 2E51A 4PBPA 1LOBA 1GSLA 4I30A 5JOYA 4FPOB 1CONA 1CQ9A 3AP9A 5H9SA 4QN7A 4CPOA 1V3EA 2YDPA 4LBQD 2YA8A 5KXCA 1WLDA 1I3HA 1H9WA 4QN6A 1C1LA 4ISRA 2UWBA 4J9TA 1UZZA 4MWXA 3B9CA 4DS0A 4TYSA 1E8UA 2WQZC 2D43A 2ZGMA 4XTMA 1S1AA 1W6OB 1X50A 4XJWA 5JOWA 2ZGTA 2RKCA 1W6MA 5GLZA 1LENA 2ZZJA 4K21A 1Q8SA 1V3CA 2F25A 1W6NB 2D3PA 4ATEA 4BQ1A 5IK4A 2C4AA 4FOWA 4FP2A 5F5QA 4YW3A 2DUPA 5T52A 2QWCA 3V0AB 1W21A 2W39A 5JYYA 1CJPA 1JBCA 3CYEA 4HZWA 3TICA 3FUQA 5H9QA 1MVQA 4WVWA 1DLLA 1MZ5A 4L8QA 2HT5A 5CBLA 2YA7A 3PVEA 3OYWA 2P37A 1AVBA 2A5ZA 3O0VA 1INGA 3POYA 4FPFA 4JRAA 5GZGA 4FOYA 2DVAA 4ISQA 3MW2A 5IK5A 4MC7A 1C1FA 2ZGLA 5GLVA 3WNXA 1MS8A 1G9DA 1CESA 4NO4A 2CY6A 3R05A 5DXDA 1AXYA 1W6PB 2KM2A 3K39A 2HU4A 1Q56A 1PZ7A 1KJRA 2QWEA 4MWQA 1VCJA 2F11A 3MPPG 1NLSA 3B3QE 1TEIA 2W20A 4M4UA 1Z0HA 1XOEA 1XOGA 5B2CA 1LECA 2VUAA 1DGLA 2XCYA 4GZSA 2A71A 2DYCA 2FHRA 4X4AA 1KJLA 3M1HA 1S0DA 2WSUA 5JOZA 1CVNA 1WBLA 1EPWA 3TAYA 1FYUA 3HR9A 1NNAA 1EUTA 1NMBN 1N3OA 2CWMA 4YM1A 3A71A 3WOGA 2BERA 2NM1A 1YXWA 3WUDA 2PHTA 5JLVA 4GJTA 1OKQA 1W20A 1BZWA 3WV6A 1V6IA 4HZYA 2JECA 2VW1A 2OUJA 4F83A 1Q8VA 2EXKA 3INBA 1WW6A 2CL2A 4KS4A 1D0HA 1BJQA 4P9WA 1DYKA 4CRQA 5HUKA 3KQRA 4CTEA 2F0ZA 4YG0A 2HU0A 5GLTA 5DUUA 4BLIA 4MX0A 4YG3A 4KS5A 2ZABA 4GZXA 4YGDA 1RINA 1AF9A 3VKFC 4ZXKA 4C1XA 2ZGNA 4FJ6A 3N7JA 1LHUA 2GNMA 4GZPA 5DZGA 1IS6A 2OVUA 2VWDA 3A72A 2NMNA 1FAYA 1GNHA 1SBFA 2C9AA 2SLIA 2B8HA 1F8EA 1W6QA 1J1TA 1ENRA 1IVCA 3O0XA 4Y1VA 2ZGSA 2VSKA 4K1KA 1N1TA 4AVVA 1LCLA 4WA4A 2QWGA 2QWKA 4H52A 1D2SA 1N1SA 1FX5A 2UU8A 4WA5A 3ALWA 4GDJA 2C4LA 3IPVB 2BATA 1A4QA 1H30A 1URXA 2DVBA 2SBAA 2CYFA 2ZHLA 4MWUA 5CNAA 4Y20A 2HTVA 1GV9A 1JN2P 3WDXA 2E53A 5H9PA 2PHUA 5GZDA 1OQ1A 4CPNA 3D4KA 2QWDA 2JDZA 2F13A 1SLIA 1MS1A 2WT1A 3SILA 1G9AA 1Z4ZA 4DFSA 4XMAA 4BLJA 3ZXLA 5HCAA 2PHFA 4BMBA 2DURA 1LOFC 1B09A 3ZPYA 3ZVXA 4YGCA 2SILA 2ZBJA 2CMLA 3T2TA 1N1YA 2F10A 4GB1A 1MVEA 2D6KA 4MYEA 5DZEA 4M3CA 4P14A 1SACA 4M3CE 3WUCA 1UL9A 2QWJA 1BQPA 4YLZA 2WKKA 2ZGQA 3M3CA 2YZ4A 2HTQA 5CAZA 3TI8A 3NN9A 1DBNA 1S0GA 3TI3A 5CB7A 5DUWA 2D3RA 1QOOA 2H0BA 2ZHKA 3OY8B 5GJ6A 2VK5A 1LHNA 3RQ0A 1HLCA 1AX0A 1ZM1A 3V0BA 1NXD1 3AYAA 2NYYA 2QWFA 3MW4A 4XTPA 5DZFA 1L7HA 1IKPA 1QF3A 3CL0A 1INXA 1H9PA 2LTNA 2VSMA 1V0EA 4XXAA 2UURA 1UPSA 1SFYA 2DUQA 1G7YA 1QNYA 1NCCN 2A6ZA 3ZYRA 3GALA 2JKBA 5JOXA 5T50A 3LSDA 5AVAA 2DVFA 5GZCA 4M01A 3O5SA 1MS4A 2A3XA 3W59A 1O4ZA 2D6MA 3H0OA 4H53A 1NN2A 5T5LA 3OBRA 4K1IA 4UW3A 4PBOA 2EXIA 1BJIA 1V0FA 2DVDA 3QCWA 2GNTA 1S0FA 1DYPA 2D6OX 3OJBA 1FV3A 3AFKA 3B00A 3SANA 4DRVA 3RMYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1OF3A 2AEZA 1QU0A 2B46X 3POBA 4GMP1 4IV3C 4QKFA 1S2BA 3S30A 2JE8A 1PNGA 4C90A 1VAVA 5FP8A 2DCKA 3VDBA 4OQ8A 1RUD1 2D6LX 1H0BA 1PX4A 4XZPA 3ZXEA 1AR92 1VBC3 5FO7B 1TNRA 2GC1A 2RDQA 5DDJ2 2WS91 4M0HA 4LA2A 1PJXA 2W9XA 1DIWA 1OD5A 2PQQA 4R4ZA 3DCQA 5JIUA 2IXKA 4TSVA 1NE4A 3O1SA 2PHDA 3VD7A 1JYCA 5DUVA 3RPQA 2W94A 3AYEA 1JZ4A 1QDOA 2D6PA 4IV3B 1RUJ3 1GBGA 5E8AA 5BYNA 4E2SA 4LBMA 1X7NA 1RUC1 1V00A 4XURA 2A6VA 5F5IA 2Q8DA 4MV2A 4A6SA 2PHWA 1SNTA 3VBRC 4UOJA 5C6CA 3WHTA 2WFPA 4Z8BA 2WZR3 1IS5A 4OFGA 5FZHA 4AHZA 3KF3A 3OYWB 4Y4YA 1JHJA 2GSYA 3OOXA 3FHIB 3WQBA 2QQJA 4YM2A 4CEYC 3TI6A 3S57A 5JR2A 4C0BA 1A34A 4IEZA 3ELNA 5JXGA 1IQAA 2ZGOA 3S5AA 5FMCA 1INVA 5AC93 2YYOA 4DIQA 4AEMA 4IEXA 1H2NA 3USUA 4A41A 5L7OC 2GC3A 3C7HA 1AX1A 4KBZA 2W95A 2R042 2Y60A 4TLGA 2C9KA 3RYPA 3VHOA 4K1JA 5D8AC 4XBLA 2D93A 2UY9A 4D52A 4JX0A 4HFSA 1RJ7A 3S7EA 3VBRB 3GVLA 4GMP0 3SOBB 1ZA4A 1TME3 2IAXA 2ZEWA 1AR73 3WDWA 2BEOA 2D97A 1QMJA 2F4LA 5DG1A 5FYCA 3O7OA 1IGOA 2VXJA 1NKGA 4RR3A 4CEYB 4D6SA 4YW7A 2AREA 4MSVA 1KFUL 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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