4SLIA

Leech intramolecular trans-sialidase complexed with 2-propenyl-neu5ac, an inactive substrate analogue
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
IPEGILMEKNNVDIAEGQGYSLDQEAGAKYVKAMTQGTIILSYKSTSENGIQSLFSVGNSTAGNQDRHFHIYITNSGGIGIELRNTDGVFNYTLDRPASVRALYKGERVFNTVALKADAANKQCRLFANGELLATLDKDAFKFISDITGVDNVTLGGTKRQGKIAYPFGGTIGDIKVYSNALSDEELIQATGVTTYGENIFYAGDVTESNYFRIPSLLTLSTGTVISAADARYGGTHDSKSKINIAFAKSTDGGNTWSEPTLPLKFDDYIAKNIDWPRDSVGKNVQIQGSASYIDPVLLEDKLTKRIFLFADLMPAGIGSSNASVGSGFKEVNGKKYLKLRWHKDAGRAYDYTIREKGVIYNDATNQPTEFRVDGEYNLYQHDTNLTCKQYDYNFSGNNLIESKTDVDVNMNIFYKNSVFKAFPTNYLAMRYSDDEGASWSDLDIVSSFKPEVSKFLVVGPGIGKQISTGENAGRLLVPLYSKSSAELGFMYSDDHGDNWTYVEADNLTGGATAEAQIVEMPDGSLKTYLRTGSNCIAEVTSIDGGETWSDRVPLQGISTTSYGTQLSVINYSQPIDGKPAIILSSPNATNGRKNGKIWIGLVNDTGNTGIDKYSVEWKYSYAVDTPQMGYSYSCLAELPDGQVGLLYEKYDSWSRNELHLKDILKFEKYSISELTGQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The 1.8 A structures of leech intramolecular trans-sialidase complexes: evidence of its enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule tags Enzyme
source organism Macrobdella decora
molecule keywords INTRAMOLECULAR TRANS-SIALIDASE
total genus 186
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature ec 4.2.2.15: Anhydrosialidase.
pdb deposition date 1998-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02973 Sialidase Sialidase, N-terminal domain
A PF13088 BNR_2 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.220.10 Mainly Beta Beta Barrel Intramolecular trans-sialidase; domain 3 Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 4sliA03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4sliA01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 4sliA02
4GDIA 1SBFA 1DILA 1WCQA 2NP0A 4FPYA 3WG4A 1DGLA 1S0FA 2P3JA 1SBDA 1U0AA 3ZSJA 5T5OA 1QNWA 3IM0A 4H52A 4XZPA 4YM2A 4LBQA 2NMOA 4GWMA 1GBGA 1V3DA 2BERA 4GKYA 1V00A 2NZ9A 3B7EA 1Q8PA 4K1HA 3OJBA 3POWA 4MX0A 1MS9A 2YA6A 2ZA9A 1YI7A 5SV8A 2HTUA 3TI3A 1V6JA 1W6PB 1APNA 2BATA 3MPPG 4MZEA 1ONAA 1LOFA 1EUUA 4MWVA 5CA6A 3SANA 4YM1A 2LALA 4WEFA 3FUOA 3AP6A 1PZ7A 2ARXA 1WD4A 4X49A 2AENA 1W6PA 2CNAA 3RSJA 2XCYA 5IK4A 2W68A 2R16A 4XYXA 5E88A 5GALA 3V64A 1IVEA 1DFQA 2VWDA 3FUQA 4Z8BA 5T50A 1F8DA 3AP5A 1DYPA 5GZFA 2ZHNA 4WA3A 4M4UA 4LBMA 4YLZA 1ULCA 1RITA 4YW2A 4UW4A 3TI5A 2WKKA 1GV9A 4PCRA 4M3CF 4YZ5A 2F13A 4YG6A 1QDCA 4MWUA 4P14A 1AXZA 2W08A 3WDVA 2DV9A 1S0JA 5DUWA 2GMEA 1MS4A 2PHRA 4FPLA 1N1TA 4BLIA 3W59A 4K3YA 3D4KA 1DLLA 2WT0A 2A7AA 3NV3A 4Q26A 1W20A 2VVZA 3VV1A 1IKPA 1WW5A 1S0GA 3USUB 2AREA 1INVA 3W09A 2DVFA 2BQPA 1LHWA 2B7YA 4BBWA 1LOCA 1DYKA 2QWJA 5JDBA 1DQ0A 3CYEA 5EWSA 5DZEA 1Y7BA 3WHUA 2D6MA 3WG3A 1C57A 5HUNA 3USUA 1SACA 2ZGOA 2CL2A 4XIKA 3PVEA 5CBLA 4XJWA 1W6NA 4H53A 4MJUA 1VCJA 2EF6A 4K1IA 2GNDA 2W52A 2ZGMA 4GZPA 2QWAA 3PMEA 3SH4A 2AH2A 4UW6A 4FOVA 5EYXA 1UAIA 4Y1UA 2ZGUA 2YV8A 3TAYA 1CESA 4XBQA 1SNTA 1V6KA 3ALXA 1B9SA 3ZSLA 1NMAN 1S0DA 1NCDN 2BF6A 3ILRA 4QN5A 4HIZA 4XBNA 4MWXA 2NYYA 1LENA 2OUHA 1NXD1 2A6VA 4RL7A 4HZYA 1D2SA 3R4UA 2D6PA 2WT1A 2SILA 2WLQA 3D11A 4LBLA 3WVJA 1D0HA 2D6KA 2GALA 2YA5A 4GB1A 1QDOA 2ZGPA 1XOGA 4XMAA 3AFKA 3M3OA 3SH5A 3MW3A 1QOSA 4C1XA 2YA4A 2PHXA 5EXOA 4JF7A 2SIMA 1F5FA 2ZHLA 4LBJA 1IVFA 3UJOA 3RS6A 4CZSA 4RA0A 4DQAA 4FPCA 4Y1ZA 5DZGA 2OW4A 1WW7A 3KM5A 4XHXA 4PBPA 1S0BA 2QWIA 2OUJA 3NSSA 2R1BA 3WG1A 1EUSA 2JKBA 1A4GA 3VKOA 5HCBA 1MVQA 4DPNA 2ZGKA 1Z4XA 4Q8KA 1NNCA 3A71A 1E8VA 3WUDA 1IVCA 4R9BA 1N1YA 1YYNA 3VKNA 2HT7A 1UZZA 5DZFA 4B7RA 1Z4VA 3TICA 2EXJA 1SCRA 3O12A 3JU4A 3SLIA 1NSDA 2ZGTA 4DRVA 4ATEA 3VKFC 2EALA 2D3SA 4AGVA 3MW4A 2F26A 4FPOB 1VALA 1LODA 4FPFA 2CWMA 3A72A 1SFYA 4FPKA 2XZJA 2JD4A 1MACA 3N7MA 1LHUA 1WCSA 1QNYA 1JW6A 1MS0A 3WOGA 4Y26A 1FV3A 2QWHA 1JYCA 1HLCA 4IQPA 3OYWB 2WJSA 3BODA 3BOPA 4FOWA 1WD3A 4ISQA 3RQ0A 1G7YA 1V0EA 5LK5A 2VH9A 2A70A 1S0CA 3WCRA 1QMJA 2HT5A 3OY8B 1GZWB 3OYWA 1SO7A 3HR9A 5IK8A 1S1AA 2ZGQA 4KS1A 3FFZA 3FBYA 5DXDA 4GZQA 1G9AA 1LHNA 3W58A 2P3KA 4HL0A 4XMIA 3BIWE 2V73A 5NN9A 4LBOA 4JC1A 4CPNA 1B9VA 1JBCA 4WVVA 3DUIA 1QOOA 5IUQA 2GN3A 1GZWA 2D43A 4YZ4A 1KJLA 3BEQA 1DBNA 1PZ9A 1JUIA 3SALA 4PBOA 4WV8A 1CIWA 2ARBA 4ISRA 2EIGA 4GZTA 4Y20B 1DQ1A 1FAYA 4LBQB 2C4LA 5GLTA 2A3WA 2XG3A 4XJ8A 2FHRA 4XHBA 5HUKA 1N3PA 3M1HA 5T5LA 4XIOA 1NMBN 4WEGA 5BYNA 4WVWA 4KBBA 4FPHA 3WUCA 4GA9A 1LHOA 4CPYA 1DQ4A 1DQ6A 5H9QA 4Y20A 1Z4ZA 3WDXA 2V5YA 1IS3A 2D3PA 2GMMA 3APBA 1IVBA 5KXBA 3U4XA 1KJRA 3NWKA 1CJPA 3AZYA 2HTWA 3AJZA 2CMLA 4U36A 1SCSA 4AVVA 4Y22A 1L7FA 5DG1A 4B7JA 5KXDA 3NV4A 2ZHMA 4D69A 1MZ6A 2P37A 4U2AA 1V3CA 2A6WA 3B00A 5GZEA 1NCBN 1ENRA 4ZKTB 3AP7A 1B9TA 3SNMA 2SBAA 1AX2A 1Q8QA 3O0VA 2Q5TA 3PVNA 1SBEA 3WNXA 1GICA 1A8DA 1ULEA 4NC5A 5GLWA 2CYFA 1XQNA 3WDTA 1H9WA 2GNBA 2TEPA 4XJRA 5E89A 3IN9A 4AGGA 4I00A 1YXWA 1NN2A 3I4IA 1FNZA 4Q8LA 1LULA 4FZHA 2DU1A 2ZGNA 1AZDA 2W39A 1FV2A 3RMYA 2F11A 1Z4YA 1QKQA 2CY6A 2HTVA 5B2CA 1CPMA 3GVJA 4B7QA 2F28A 2AGSA 5H9RA 2YROA 1HDKA 1UPSA 2D6NA 3WV6A 2P34A 2ZACA 3T1EA 2W38A 1QOTA 2VXRA 3AYCA 3IKWA 5GJ6A 4FVKA 1ULFA 2DVDA 1AJKA 1LGBA 3T1MA 1OFSA 1CVNA 1KDKA 4Y24A 3PVOA 2AEQA 4D8SA 3RG0A 1H30A 4CPOA 1A3KA 2PHFA 4HZXA 4FPEA 1GZCA 4X4AA 4PQ9A 2D7FA 1LOBA 1JOJA 1A14N 2JJ6A 4KS2A 2D6OX 1EPWA 1F9KA 4X6KA 4Q1PA 4P9XA 3WCSA 4R9AA 2QWGA 1KITA 2A6YA 4GKXA 4CPZA 4K1YA 5JMCA 2VK6A 1HKDA 3LCPA 5JVVA 5JOXA 4WZFA 2UURA 2A3YA 7NN9A 1W6NB 5CAZA 2XB6C 5T52A 2YA7A 4MJVA 4J9TA 3GVKA 2QWFA 2A6ZA 4L8QA 2W20A 4M01A 1V3EA 2ERFA 3I8TA 2HU4A 1DQ5A 1MR5A 4OZXA 1WBFA 1IVGA 2X9MA 1E8UA 3AJYA 1X50A 2F25A 1N1SA 4GZWA 3MW2A 4HZZA 1Z50A 2JE7A 4Y1XA 2HT8A 2F10A 1W21A 3LSEA 1IOAA 1G86A 1EUTA 1OKQA 4BMBA 3GALA 2DTYA 4Q2FA 3GNEA 1URXA 4HANA 3M3CA 2F0ZA 1N47A 3M3EA 1JXNA 4W65A 3AYDA 1G9FA 2A75A 4FP2A 1FNYA 4GALA 4KS4A 1Z4WA 4ITCA 1LU1A 4DGRA 2AYHA 1W6QB 1MS3A 4XBLA 3WG2A 1TEIA 5F9TA 4JCKA 2VU9A 1IS6A 1GNZA 4GJTA 1O4ZA 3CL2A 3NV2A 3SITA 3WDWA 2EXKA 2ZMKA 2JECA 3N3HA 4F83A 1EURA 4XOGA 1WW4A 4FPGA 3JU9A 1W6QA 2UWAA 4MZAA 3ENRA 3ZXJA 5DUVA 2G4IA 3OBTA 2R1DA 4NN9A 3WDUA 4YFWA 5DG2A 4MWYA 1WLWA 2WT2A 4LBNA 1LJ7A 2Z42A 2UU8A 4LBQD 2DUOA 1ULDA 2GNTA 3FLRA 4FOQA 2JE9A 1AX1A 1V3BA 1VAMA 3AYEA 1WLCA 1Q8OA 2H0BA 2ZAAA 1JYIA 3POYA 3RMXA 2DVBA 2QWCA 2ENRA 4YFZA 1V6IA 5FREA 3ATGA 2ZMNA 3M3QA 2VK7A 4YZ1A 3ZSMA 2ZB5A 1E8TA 1W6MB 2CWSA 4MWWA 3INBA 5HUGA 3GVLA 5JLVA 5HUMA 4XJAA 5H9PA 1V6NA 4JRAA 1JN2P 1Q8VA 1V6LA 5DUXA 3B3QE 4YW3A 1FATA 4XTMA 1F8BA 2QWKA 1SLLA 3AK0A 1ZA4A 1GZ9A 1W6MA 3IPVB 1LEMA 1H9PA 2DYCA 4YM3A 3ZXKA 1DQ2A 4H55A 3D12A 1Q56A 3AYAA 1I1EA 4FJ6A 5JOWA 3D6EA 2ZKNA 4P9YA 3K36A 2WSVA 3N36A 3H6JA 3K38A 4UW5A 1LGCA 2XZKA 1GANA 3IPVA 1RINA 4LBKA 3POSA 4M3CE 1AXKA 1INFA 1UKGA 1NMCA 2EAKA 4TYSA 5GLZA 2ZZJA 5KXEA 1LTEA 1V6OA 5H9SA 5T5PA 1QGLA 4YG3A 5E8AA 2LTNA 5T54A 1UL9A 4AGRA 1NNBA 2F24A 5EYYA 2D3RA 3OGGA 1LCLA 2C5DA 3ASIA 3FLPA 3ZVXA 1VIWB 1LOAA 4M3CB 1DIMA 1NSBA 3D5OA 2A5ZA 1BJIA 3TI6A 3LSDA 1QF3A 4UF7A 1INWA 3M2MA 1N3OA 1W8OA 1N1VA 4HZVA 1MS5A 1USXA 5HCFA 3VKMA 1NLSA 4FOYA 4XE9A 1BXHA 1Z78A 2BZDA 4BMEA 4M3CA 1IKQA 1WLDA 2EXHA 2RHPA 5HCAA 1C1FA 4FQ4A 1CONA 3DGTA 3ZXEA 1GNHA 3CL0A 2AUYA 2I2SA 4YM0A 1ZM1A 4YW5A 5JOZA 3ZYRA 3FLTA 3UL2A 2KM2A 2VW2A 1DHKB 2DVGA 4XXPA 1CQ9A 4Y22B 4Q27A 3V0BB 2F29A 4M3MA 2ZGLA 2XZIA 1USRA 1FX5A 3CNAA 3HN1A 1G9CA 2D44A 3WDYA 2AEPA 2ZB6A 1UMZA 1KQRA 1QU0A 1RIRA 1DIWA 1UZYA 3A4UA 3IMNA 4ASMB 4MWRA 4SLIA 3V0BA 2R0HA 2NMNA 4XJUA 1KRIA 1YRZA 1BYHA 2F27A 3WHTA 1CR7A 1CPNA 5DUUA 2E7QA 2C9AA 3ZXLA 2HTQA 4Q1RA 4Q6KA 4AVTA 5GZDA 1AF9A 3H72A 5M1ZA 1LU2A 5GLVA 5JYYA 1G8WA 2HTYA 2ZHKA 1INXA 4YGCA 3JUUA 3C2UA 4B7NA 2UWCA 3N7LA 1OQ1A 2VW0A 1INHA 5B2DA 1LESA 3L2YA 2ZMLA 3ZSKA 1W6OB 2QWBA 3O9KA 3TI4A 3B69A 1O4YA 1ENQA 2PHUA 1MWEA 2RKCA 5F5QA 3RRDA 4BOWA 4GZXA 2A71A 5GZGA 1NCCN 3INAA 1L7GA 1YO8A 1CN1A 3O0WA 3O5SA 1W6OA 4YZ2A 4FVVA 3AZVA 1BQPA 1IS4A 4CPMA 1SLIA 3R4SA 3BTAA 2DTWA 1GLHA 3ZXFA 2E53A 4YGDA 1YIFA 4Y1YA 5JOYA 3T2TA 3MEPA 3AZWA 3NV1A 4K1ZA 1WUVA 4K20A 3QCWA 2W5OA 1UN1A 4QN4A 3O9JA 1BJQA 4GZOA 1MZ5A 2NM1A 1F8CA 1HQLA 1I3HA 3CKZA 1ULGA 4YZ3A 2B8HA 1NNAA 4XJQA 4FQZA 3AP9A 4YG0A 3HMYA 4Y1VA 4YW4A 2JDZA 2R0FA 1AXYA 1BKZA 2YXSA 4YW1A 4MC7A 2YZ4A 1KDMA 4K1KA 1W0PA 1SLCA 1G9BA 4X47A 2E51A 5T5JA 1NCAN 2ZABA 5GM0A 2QWEA 3AP4A 4QNPA 1Z0HA 2D6LX 4B7MA 3ILFA 1AJOA 1IS5A 5KXCA 2R49A 3N35A 3AXDA 5AVAA 4XTPA 1XOEA 1SLTA 2DUQA 2GMPA 5GLUA 3SISA 4MYEA 2YMZA 4CRQA 3H0OA 4GWNA 1LOGA 4MWJA 4QN3A 5HX0A 2ZBJA 3VKLA 5IK7A 3SILA 1GYKA 3TI8A 3ALWA 3K39A 1L7HA 4GDJA 4XILA 1UX6A 6NN9A 3Q9OA 3PJQA 4YGBA 2YA8A 1AVBA 3VUOA 4M00A 2DURA 4XJZA 2HYKA 2ZGRA 1SLBA 4ZXKA 4DFSA 4K21A 3R05A 5L73A 1MVEA 1B09A 1JHNA 1C1LA 1W0OA 2GN7A 4M4VA 3QLQA 2NN8A 3A0KA 2WNEA 3SH3A 3N7KA 4XJ9A 1WBLA 4GZSA 4KS5A 1AX0A 4AWDA 2C4AA 2ES3A 1F8EA 1LHVA 1V0FA 1GKBA 1INGA 3ZYPA 3UJQA 1FYUA 1S0IA 1MS1A 4CPLA 2YDPA 4UW3A 2P3IA 1C4RA 2GNMA 4R9DA 4GXLA 2VSKA 3K37A 2VSMA 3O0XA 3V65A 2HU0A 1F31A 4BQ1A 1BZWA 3N7JA 3OBRA 2F12A 1IVDA 4AVSA 2W5NA 5IK5A 2QWDA 1LEDA 1VLNA 1SLAA 1G9DA 3H73A 2CTVA 4BLJA 1LGNA 1R1ZA 1W8NA 2OVUA 1PZ8A 2PELA 3OPZA 4C1WA 2PHTA 2A3XA 2ZGSA 2E7TA 5CB7A 1S0EA 2UWBA 1GSLA 5GZCA 4HZWA 1V6MA 2YY1A 1MS8A 4ATFA 2VW1A 3ZPYA 4K1JA 2GDFA 3WZ1A 1INYA 1A78A 3ILNA 3TIBA 3H71A 4I30A 2P2KA 1VAVA 3TIAA 1DZQA 3A0NA 2A6XA 1N3QA 4QN6A 1A4QA 2VUAA 4PF5A 2YDTA 4R9CA 2WSUA 1LOEA 4YGEA 4DRRA 3K3AA 4XDQA 1Q8SA 3WLUA 4WA4A 4BPZA 4NCSA 5T55A 3AXEA 3AZZA 1NSCA 3KQRA 2WQZC 1V2IA 3B01A 4DS0A 1LECA 1LOFC 1V0ZA 4KS3A 2EXIA 2VY0A 2DVAA 3V0AB 2AR6A 5CNAA 3NN9A 4BM8A 4WA5A 3TB0A 4CTEA 3AZXA 2DWRA 4FPJA 4NO4A 2DUPA 1W1XA 3B9CA 2E6VA 2HTRA 2VK5A 1VCUA 2DU0A 2SLIA 1J1TA 2PHWA 4GEZA 1WW6A 2FMDA 1ENSA 5FRAA 4MWLA 3V0AA 3OY8A 4XXAA 4TZDA 5IT6A 4FP3A 4QN7A 4AYUA 3T1LA 3UK9A 4P9WA 1HQWA 4M4NA 4MWQA 4NOTA 3AX4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QQJA 2RS51 5J48A 2VJXA 1NXMA 4LITA 4GDIA 1SBFA 1WCQA 1DILA 3P6BA 2XJVA 1R1A3 3SQOA 4CUCA 1F2NA 2NP0A 4HSLA 2ZX4A 3P1IA 2JIJA 3RNSA 4CCJA 4FPYA 2CDOA 4MV2A 3S7IA 3O1SA 3WG4A 5IHRA 3JD71 1DGLA 1S0FA 3Q6PA 1UD1A 2RR11 1SG3A 2P3JA 1SBDA 1U0AA 3ZSJA 5T5OA 1QNWA 1BBT2 3IM0A 2BEOA 3BPZA 1AR62 5L9RA 1Q43A 2C0ZA 4H52A 2QZ3A 1LNSA 4XZPA 4YM2A 4LBQA 2NMOA 2VG9A 4J6GA 4GWMA 3ZFEC 2WWUA 1YFYA 2VZPA 3VL9A 1GBGA 5ACA1 4CDUC 4UAPA 2B46X 2VAUA 1K5MB 1PO21 2MPFA 2ZX3A 3R0RA 1NG0A 5F3GA 3VHNA 3BTYA 1V3DA 4AI1A 1XJAA 2XR4A 4HK9A 2BERA 4GKYA 1V00A 2NZ9A 3AKQA 3ME2A 1VBC1 2R063 3B7EA 5J7MA 4LOTA 1Q8PA 4NHKA 4Q4Y3 4K7JA 4LIUA 1F8VA 4K1HA 2YPDA 3OJBA 3DKQA 4GAZA 5FZHA 4N9HA 1XNCA 2QKDA 3POWA 2JE8A 5FYSA 2HWF3 2XQXA 3S30A 2BYVE 1MS9A 1FOD2 1KD7A 4NN0A 4L7CA 2XWBB 2YA6A 4DXSA 4K6BA 4GH4B 4XW3A 4ZPIA 1SMVA 1TG7A 4NROA 1ZBE3 2ZA9A 5BNNB 5EX7A 1RUC2 5H47A 3KLSA 2WINB 4WM7B 3H1YA 1YI7A 5SV8A 4I0AA 5LY2A 5A7SA 2HTUA 5FXXA 3TI3A 3ELNA 1POV0 2JKXA 1V6JA 2RM22 3AMHA 3AC0A 2OX0A 4TTGA 1QQP1 1W6PB 5FZNA 4UT5A 1K5MA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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