4SLIA

Leech intramolecular trans-sialidase complexed with 2-propenyl-neu5ac, an inactive substrate analogue
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
IPEGILMEKNNVDIAEGQGYSLDQEAGAKYVKAMTQGTIILSYKSTSENGIQSLFSVGNSTAGNQDRHFHIYITNSGGIGIELRNTDGVFNYTLDRPASVRALYKGERVFNTVALKADAANKQCRLFANGELLATLDKDAFKFISDITGVDNVTLGGTKRQGKIAYPFGGTIGDIKVYSNALSDEELIQATGVTTYGENIFYAGDVTESNYFRIPSLLTLSTGTVISAADARYGGTHDSKSKINIAFAKSTDGGNTWSEPTLPLKFDDYIAKNIDWPRDSVGKNVQIQGSASYIDPVLLEDKLTKRIFLFADLMPAGIGSSNASVGSGFKEVNGKKYLKLRWHKDAGRAYDYTIREKGVIYNDATNQPTEFRVDGEYNLYQHDTNLTCKQYDYNFSGNNLIESKTDVDVNMNIFYKNSVFKAFPTNYLAMRYSDDEGASWSDLDIVSSFKPEVSKFLVVGPGIGKQISTGENAGRLLVPLYSKSSAELGFMYSDDHGDNWTYVEADNLTGGATAEAQIVEMPDGSLKTYLRTGSNCIAEVTSIDGGETWSDRVPLQGISTTSYGTQLSVINYSQPIDGKPAIILSSPNATNGRKNGKIWIGLVNDTGNTGIDKYSVEWKYSYAVDTPQMGYSYSCLAELPDGQVGLLYEKYDSWSRNELHLKDILKFEKYSISELTGQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The 1.8 A structures of leech intramolecular trans-sialidase complexes: evidence of its enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords INTRAMOLECULAR TRANS-SIALIDASE
molecule tags Enzyme
source organism Macrobdella decora
total genus 186
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature ec 4.2.2.15: Anhydrosialidase.
pdb deposition date 1998-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02973 Sialidase Sialidase, N-terminal domain
A PF13088 BNR_2 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.220.10 Mainly Beta Beta Barrel Intramolecular trans-sialidase; domain 3 Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 4sliA03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4sliA01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 4sliA02
1INGA 2QWAA 1BJIA 1DQ6A 3MW2A 4MWRA 1INXA 3FLTA 4DS0A 2F12A 4LBQB 2EIGA 1ENQA 2P3JA 2JD4A 2NZ9A 3WG2A 1F8CA 2GDFA 4CPMA 5HUKA 5HCFA 3WDYA 5DZGA 1DGLA 1EPWA 3ENRA 1HLCA 4JRAA 2PHTA 1WBLA 1QKQA 2PHWA 5GALA 3TI4A 3B7EA 3O0VA 3OYWA 1SNTA 3L2YA 3PJQA 2A5ZA 1UZZA 3N7MA 4FVKA 2A71A 1A78A 1SLBA 1S0BA 3OYWB 4LBKA 1G9AA 2ZGRA 1KITA 5GLTA 4TYSA 4WEGA 4YZ4A 2VY0A 1Z4ZA 2ZZJA 1AZDA 4H55A 2EXKA 4FVVA 2QWEA 2LTNA 2A6WA 4CRQA 3A72A 3H73A 2GNMA 1INYA 1WD4A 1IKPA 4RL7A 3UL2A 4LBJA 4Q1PA 4GALA 2NN8A 2WLQA 4AVTA 4KBBA 4GDJA 1NSDA 5E88A 3D5OA 1N3PA 5T50A 2DVGA 4XILA 2ZGTA 1UKGA 4AYUA 2A70A 2AEPA 1QOSA 3QLQA 4KS4A 1HQWA 3SISA 3RG0A 3WDXA 5IT6A 4YW5A 4DRVA 3M2MA 1C4RA 4WEFA 2JJ6A 1SLLA 3SLIA 1KQRA 5T54A 4B7JA 2AREA 4P9WA 3APBA 2JECA 2D6OX 4WVWA 2DYCA 3AP5A 4FOQA 3TIBA 1AJKA 3M1HA 4R9AA 1Z78A 1V6KA 1GNHA 1LOBA 4XMIA 4I30A 2EALA 4HANA 1W6NA 5JVVA 2QWIA 4HL0A 2A6VA 4YM0A 2R1BA 2VSMA 1LU1A 3T1LA 3INAA 1D0HA 3POSA 4M3CE 1CQ9A 5KXDA 5L73A 3INBA 4XJAA 4M4UA 4CPOA 1W1XA 5DUVA 5EYYA 3FFZA 1GZCA 4LBMA 2ZB5A 3K39A 2A3YA 2AH2A 4XIKA 1V2IA 3O9KA 1AJOA 4BPZA 1INWA 3WDVA 3QCWA 1EURA 4X47A 4GJTA 3LSEA 2DWRA 3ZYRA 1LENA 3IKWA 3IMNA 2D6KA 5GM0A 2YY1A 1HQLA 2EXHA 2LALA 4ASMB 5CAZA 1KDMA 1W8OA 2SLIA 2JDZA 1F5FA 4K1IA 1ULEA 3ZXEA 2JKBA 3WZ1A 1NN2A 4WA5A 5IUQA 4YW3A 4BM8A 2HTYA 3N35A 3ZXFA 1JHNA 3VKFC 2ZMKA 4ISQA 4PCRA 2D3RA 4AVVA 3WDWA 1N1TA 3AZXA 4YFZA 1AX2A 3FBYA 2QWDA 5DG2A 1LGNA 1QDOA 2SIMA 1URXA 3AXEA 4BBWA 1L7FA 3N7LA 1LU2A 2BATA 1RINA 3D4KA 3FLPA 4M3CA 3A0KA 1LECA 1JOJA 3WDUA 5CBLA 1N3OA 3UJOA 3CKZA 4XBLA 1LOCA 3RQ0A 3IPVA 3SITA 3GALA 1WLWA 1SBDA 1QMJA 4FPEA 3NWKA 5LK5A 3B01A 1NLSA 3VKMA 2WSUA 1JXNA 3LSDA 1LEDA 1CVNA 3SH4A 2JE9A 3T2TA 2ZGLA 1WLDA 3ZVXA 3D6EA 3ALWA 1MS8A 2B7YA 3RMXA 3Q9OA 1ENSA 1QOTA 2JE7A 2E7QA 2B8HA 4FPHA 2DVDA 2P37A 5HCBA 3AFKA 3ZXLA 4BLJA 1ONAA 1W0OA 1DHKB 2HTRA 3BEQA 2VVZA 4YGCA 3BIWE 4FP3A 1ULFA 2ERFA 1LOFC 3T1MA 3VV1A 1IKQA 3WCRA 1IVCA 1VCUA 2R0FA 1USXA 3IN9A 4SLIA 4ATFA 1SO7A 4GXLA 4GZXA 1BJQA 5GJ6A 3MEPA 4GZTA 3U4XA 2GNDA 1G9DA 5SV8A 2C5DA 3HMYA 4AGRA 1L7HA 4M01A 2V73A 2R16A 1CPMA 2NP0A 1U0AA 7NN9A 2XZJA 1RIRA 4XXPA 4DFSA 4CZSA 1YXWA 2A3WA 1YO8A 3B00A 5T5JA 2VK5A 4FPCA 1O4ZA 1JBCA 4H52A 3M3QA 1B9SA 5HUGA 1W6QA 3O5SA 3IM0A 1IS5A 2VXRA 2QWHA 4U2AA 3M3EA 2YA7A 1W6QB 2D3SA 2F0ZA 4Y20A 3VKNA 1V00A 4FPJA 1S0CA 4R9BA 4Q1RA 3AZVA 2GMEA 1Q56A 3M3OA 3OBTA 4Y24A 4UW5A 3WDTA 1DLLA 2EXIA 1V3CA 4CPNA 5CA6A 4YLZA 2ZHNA 1NNCA 2WKKA 1V0ZA 2UWCA 1LOFA 4Q26A 4WVVA 4B7NA 5IK7A 4MJUA 1LTEA 1Z4VA 1FNYA 2A6XA 1UMZA 1Z0HA 1USRA 1A14N 2UU8A 5EYXA 1LHOA 2ZMNA 2C4LA 4MWXA 1B09A 2A3XA 2DUPA 1QGLA 4QN3A 1Z50A 3FUQA 3V65A 2BERA 1V0FA 1S0FA 1MS0A 1SLIA 1SACA 1W6PA 5JOWA 1AXZA 3SH5A 4NC5A 5T55A 1B9TA 5FRAA 1CJPA 4Q8KA 2D3PA 1DQ4A 2GNTA 5GZGA 3ALXA 4MX0A 2FMDA 2OUJA 1YIFA 4YM2A 4DRRA 4BMEA 3N7KA 5IK8A 3ZXKA 1F31A 1QNYA 2YMZA 3ASIA 3OGGA 3ZXJA 4LBQD 2D6PA 1N1SA 5GZEA 3SILA 2ZGUA 5GZCA 1LOEA 4B7RA 5GZDA 1CESA 2A75A 4BMBA 1AX1A 2SBAA 2D6LX 4M00A 1EUSA 1Q8VA 1NCAN 1S0GA 1CONA 2AR6A 2D44A 4J9TA 1PZ8A 5EXOA 3OBRA 2HYKA 3NV3A 2ZGQA 1AVBA 2ZHMA 3VKOA 4YW4A 4P9XA 2WT2A 4M4VA 1Z4WA 1LHNA 4XTPA 5DUXA 1W21A 4PQ9A 4Y22A 2QWJA 1VALA 1HKDA 1CIWA 3ILFA 2YDTA 2VSKA 2F27A 1MZ5A 5CB7A 1MWEA 2R1DA 3JU4A 1GICA 5KXCA 2QWKA 4FP2A 5DUWA 5H9SA 2ZKNA 1DQ0A 3UJQA 3FUOA 1EUTA 4AWDA 4OZXA 2F24A 4LBLA 3B3QE 4WA3A 1WLCA 3JU9A 2RHPA 2PHFA 1MS1A 3WV6A 2CY6A 4YGEA 1HDKA 3BTAA 2DVFA 3A71A 1WUVA 3TICA 2VH9A 4XBNA 1MS9A 4XJ9A 2NMOA 2GNBA 1N1VA 2AYHA 4KS1A 2BZDA 1G7YA 2AGSA 2D6MA 2KM2A 1ULCA 1V6NA 4YZ5A 1F9KA 4R9CA 1DIWA 1V6LA 4XIOA 1W6OA 1DFQA 2XG3A 4YGDA 1F8DA 3D11A 3AP7A 1JYCA 1DZQA 3WHUA 4UW3A 1GYKA 2Z42A 1UAIA 1AF9A 1D2SA 3ILRA 3GVKA 1KDKA 5FREA 5JMCA 5H9RA 3GVJA 1N47A 1W6NB 1ZA4A 1E8VA 4FPFA 2HT7A 4M3CF 5GLZA 3AZZA 3A0NA 2DU1A 5HCAA 2W52A 3BOPA 3CL2A 1WW6A 2CL2A 1C57A 2CMLA 5T5PA 4MJVA 2YA5A 3CNAA 4XJ8A 4CPLA 5GLUA 4Q27A 1TEIA 2VK7A 3CYEA 3POWA 4U36A 2F28A 2XZIA 1S0DA 1XOEA 2RKCA 3WLUA 3SALA 4FPOB 1A8DA 2UWBA 4PBOA 1Q8QA 1IS4A 4FOWA 3TI3A 4XJQA 1VCJA 1NCDN 1RITA 1INFA 3M3CA 3AP9A 4YGBA 1DQ2A 1FATA 1GSLA 3WUDA 4AGVA 2WNEA 4QNPA 3R4SA 2I2SA 4GDIA 2GMPA 5T52A 4M3CB 4YM3A 4K1JA 1QNWA 3ZSMA 2YA8A 2W39A 3GVLA 1XQNA 4PF5A 1MZ6A 3AYDA 4HZZA 3N36A 4H53A 1Z4YA 1UN1A 1QF3A 1NCCN 1WW5A 2A6YA 3IPVB 2ARXA 2ZB6A 3PVEA 4FJ6A 2OUHA 1FV2A 2HTWA 1IVFA 2QWGA 1SLAA 3I4IA 3OJBA 4XJUA 4GZQA 2G4IA 2X9MA 1N1YA 3ZSLA 4XBQA 4XOGA 1INVA 1LHVA 4K20A 3O9JA 1YI7A 4MZAA 1SFYA 3TI5A 1V3BA 4IQPA 3OY8A 2EF6A 2TEPA 3O0WA 3K38A 4HZXA 4XJWA 3NN9A 5GZFA 4K1HA 2AENA 4MC7A 1WCSA 3POYA 4NO4A 1F8BA 5AVAA 2R49A 3H71A 1LODA 5DG1A 1I1EA 1V3DA 1QDCA 1SCSA 4X4AA 2CWMA 4YZ1A 4UF7A 2HTUA 3SH3A 4MYEA 2F13A 4GZSA 3NSSA 4BQ1A 1B9VA 4WV8A 2NYYA 2DTYA 3H72A 1A4GA 1OQ1A 3V0BA 2YA4A 4MZEA 4R9DA 1LEMA 3AP6A 3BODA 1KJRA 4CTEA 1MS3A 4XMAA 4LBOA 1JN2P 3V0BB 4P9YA 1X50A 1MR5A 1JW6A 2VWDA 4DQAA 3ZPYA 5IK4A 2GALA 2VK6A 2ZABA 3T1EA 3UK9A 1INHA 1NNAA 2W68A 3NV2A 4MWVA 4LBNA 1IVBA 1CR7A 3VUOA 1GBGA 3HN1A 2VW1A 5E89A 4D69A 4Y20B 3H6JA 2CWSA 5M1ZA 4MWWA 4FQZA 2F29A 4RA0A 2E51A 3B69A 5DUUA 2HU4A 2EAKA 1WCQA 3AK0A 1LGCA 4Q8LA 1DIMA 4MWUA 1GZ9A 4ZXKA 1SLCA 1VAMA 3SANA 2ZGPA 4GWMA 3USUA 4YW1A 1MACA 3AJZA 4GZOA 3TIAA 1NCBN 2DVAA 1ULDA 1OFSA 1W8NA 5JYYA 3N3HA 4FOYA 2PELA 3AJYA 3ZSKA 2YZ4A 2E6VA 2CTVA 1NSBA 2P3KA 4KS2A 4LBQA 4K1KA 1VAVA 2D43A 1W6PB 1QU0A 2HT5A 4MWJA 1WBFA 1S0IA 1BXHA 1LOGA 1G9CA 3O0XA 1AXKA 2XCYA 4JC1A 2FHRA 2PHRA 1Q8OA 3B9CA 4PBPA 3R05A 2QWFA 1FX5A 1V3EA 4WA4A 2GMMA 1LHWA 4KS5A 4WZFA 2ZAAA 2ZGSA 3MPPG 3GNEA 3WG4A 5DZEA 2VU9A 2A6ZA 2GN7A 1BYHA 4Z8BA 4NCSA 4Y1VA 3ZSJA 2F25A 3PMEA 1DQ1A 6NN9A 4ITCA 1FYUA 4NN9A 1GZWA 2R0HA 3AP4A 5DZFA 1C1LA 3TB0A 5BYNA 1AX0A 5B2CA 5HX0A 3C2UA 3W58A 3AYAA 1GZWB 5F5QA 4XYXA 2ZBJA 1APNA 5KXEA 1SCRA 1DYKA 1H9PA 1SLTA 5NN9A 4YZ3A 3WHTA 2CYFA 3ILNA 3NV1A 1FAYA 1R1ZA 1G86A 2XB6C 5GLVA 2WQZC 3PVNA 4Y22B 1NMBN 1GKBA 5JOXA 5F9TA 4BOWA 4HZYA 3TAYA 1BZWA 4DPNA 4XHBA 3LCPA 1QOOA 3ATGA 2PHUA 1DYPA 1YRZA 5JDBA 4HZVA 4YG3A 1S1AA 4C1XA 4AVSA 4FPKA 4YW2A 2VW2A 4Y1XA 2HTVA 2DUOA 1S0EA 5GLWA 1LESA 3DGTA 3V0AA 3FLRA 2W5OA 3H0OA 2YDPA 2QWBA 2W20A 3V64A 2ZGMA 3V0AB 1W6OB 3A4UA 3AXDA 3PVOA 2WT0A 4HIZA 5IK5A 4M3MA 5T5OA 4AGGA 1WW7A 3K3AA 4GEZA 1CN1A 3RMYA 1JYIA 1IVGA 1G9FA 5HUMA 4ATEA 2NMNA 4CPYA 4W65A 2DUQA 2P34A 2QWCA 5HUNA 2V5YA 4XDQA 1G9BA 3D12A 1UPSA 2ZGKA 4TZDA 2BF6A 3KQRA 4NOTA 1NXD1 1WD3A 4UW6A 2ES3A 2E7TA 4QN7A 4F83A 4YG0A 4UW4A 4GB1A 4GWNA 5CNAA 4FOVA 3TI8A 3K37A 2DV9A 5EWSA 1WW4A 4D8SA 1H9WA 1V6JA 4I00A 3MW3A 2XZKA 2OW4A 1S0JA 4ISRA 1F8EA 5JOYA 4FZHA 2PHXA 3WCSA 2ZMLA 4CPZA 1LJ7A 2ZACA 4Y1ZA 1ZM1A 4QN4A 2HU0A 2YROA 2DU0A 4FQ4A 1Z4XA 3ZYPA 4MWLA 2C9AA 3MW4A 4FPYA 4C1WA 4XJZA 1NSCA 4Y1YA 1IVEA 3W09A 4X49A 4GZPA 4K3YA 1IS3A 1UZYA 1OKQA 4Y26A 3RSJA 4MWQA 1W6MA 1XOGA 3DUIA 1PZ7A 4GZWA 4FPLA 5JOZA 3R4UA 5E8AA 2DVBA 1W20A 2WJSA 2WT1A 1W6MB 3I8TA 3CL0A 3O12A 1NMCA 1N3QA 2E53A 3SNMA 2ZA9A 3W59A 4P14A 3WG3A 2HT8A 3WUCA 1UX6A 4ZKTB 4L8QA 4B7MA 5KXBA 4XHXA 2ZHKA 2BQPA 2DTWA 1E8UA 1BKZA 2D7FA 2YA6A 3AYCA 1LOAA 1DQ5A 3JUUA 4BLIA 4GA9A 1V6IA 5JLVA 2W38A 1J1TA 2GN3A 2F10A 2HTQA 1V0EA 1W0PA 4MWYA 2ENRA 2F11A 3OY8B 4GKYA 1BQPA 3NV4A 4YFWA 1DILA 4JF7A 3KM5A 1L7GA 1CPNA 5B2DA 3AX4A 1MS5A 4DGRA 1JUIA 1A4QA 3AYEA 1KJLA 4XZPA 1FV3A 4X6KA 1VIWB 2YXSA 1FNZA 1IS6A 3OPZA 4JCKA 3AZYA 1KRIA 2Q5TA 2AEQA 1GV9A 1UL9A 4HZWA 1V6OA 3AZWA 5T5LA 1ULGA 4QN5A 4YM1A 3WNXA 1LCLA 1ENRA 4K21A 3K36A 2AUYA 4XXAA 2ZHLA 2YV8A 2OVUA 1I3HA 4GKXA 1MVEA 1IVDA 2VUAA 2SILA 1NNBA 1AXYA 3RS6A 1IOAA 2DURA 2P3IA 1V6MA 4XJRA 3WOGA 3VKLA 1Q8SA 1Y7BA 3TI6A 4FPGA 4XTMA 2C4AA 2UWAA 2ARBA 1MS4A 4Q6KA 1DBNA 1GLHA 4K1ZA 1A3KA 1YYNA 2F26A 1VLNA 4YG6A 3WG1A 2P2KA 2UURA 1MVQA 3RRDA 1NMAN 2W08A 5H9PA 1LULA 1SBFA 1E8TA 4K1YA 3WVJA 3N7JA 2VW0A 2WSVA 1LGBA 1GANA 4M4NA 3HR9A 2ZGOA 1H30A 1C1FA 4B7QA 3USUB 2D6NA 1PZ9A 1GNZA 4Y1UA 1LHUA 2A7AA 2NM1A 2H0BA 1SBEA 5DXDA 1G8WA 2W5NA 4QN6A 1EUUA 1Q8PA 4KS3A 2CNAA 4Q2FA 1O4YA 5H9QA 4XE9A 4YZ2A 2ZGNA 2EXJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1K5MC 3OUHA 1IQDC 1INGA 2QWAA 3RFRA 1BJIA 4XFHA 1NZCA 2XDVA 1DQ6A 2PN5A 2W1SA 3MW2A 4IEOA 3FLTA 4H3WA 4ZXEA 4LBQB 4CUGA 2EIGA 1ENQA 4KL1A 5B4XA 4IETA 4CEYB 4QXHA 4YSFA 2P3JA 2VAQA 2JD4A 1UY0A 2NZ9A 3WG2A 3LEKA 4QKNA 1F8CA 3KCCA 1OQEA 2GDFA 4N43A 3AL6A 5FTTC 4CPMA 5HUKA 2XBO2 3MICA 3ETPA 3HEIA 3HIFA 2GVWA 4IQKA 2B9VA 5HCFA 3WDYA 5CFCC 1OPOA 1EY2A 4N90A 5DZGA 1WMFA 2ET7A 3K2OA 3KT4A 4BXFA 1DGLA 3I3QA 4META 1EPWA 3TC9A 1FPN2 3ENRA 5BNQA 4QX7A 1HLCA 4JRAA 4XF3A 1ASJ3 3NKGA 1SHWB 4LITA 1R091 3SRGA 2BYVE 3WF1A 3LA3A 3OCPA 3O1VA 2NQYA 2VXJA 2D40A 2Y6KA 4CPBA 2PHTA 1O8PA 1PVC3 1WBLA 1S2EA 4UFLA 1ST8A 4CP1A 5I91A 1QKQA 2PHWA 2I45A 5ACA3 5GALA 4MHRA 1XRUA 2MEV1 1WCUA 3AMNA 3TI4A 2HWB2 3B7EA 4HK9A 4IV1A 1BVVA 1ZZ8A 2OS2A 3O0VA 3VD9A 2FCVA 1OF4A 4AK3A 4AQ6A 3OYWA 1SNTA 3L2YA 2P1BA 4I3PA 3PJQA 4H7LA 1O4TA 1OKOA 3C7GA 4Q1UA 2A5ZA 4XW3A 2QVSB 1SEFA 1UZZA 2WS93 3HNBM 3KCYA 3N7MA 3W20A 4FVKA 2A71A 3WNNA 1DU3D 1DZRA 3MF6A 1JZ5A 1WZXA 5I93A 5LY1A 3JD72 4OQ9A 1A78A 4FTEA 2IAUA 1ZZCA 3OD4A 2GH2A 1POV3 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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