4YW5A

Crystal structure of streptococcus pneumoniae nanc, complex with oseltamivir carboxylate
Total Genus 202
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
202
sequence length
659
structure length
659
Chain Sequence
ETPVLEKNNVTLTGGGENVTKELKDKFTSGDFTVVIKYNQSSEKGLQALFGISNSKPGQQNSYVDVFLRDNGELGMEARDTSSNKNNLVSRPASVWGKYKQEAVTNTVAVVADSVKKTYSLYANGTKVVEKKVDNFLNIKDIKGIDYYMLGGVKRAGKTAFGFNGTLENIKFFNSALDEETVKKMTTNAVTGHLIYTANDTTGSNYFRIPVLYTFSNGRVFSSIDARYGGTHDFLNKINIATSYSDDNGKTWTKPKLTLAFDDFAPVPLEWPREVGGRDLQISGGATYIDSVIVEKKNKQVLMFADVMPAGVSFREATRKDSGYKQIDGNYYLKLRKQGDTDYNYTIRENGTVYDDRTNRPTEFSVDKNFGIKQNGNYLTVEQYSVSFENNKKTEYRNGTKVHMNIFYKDALFKVVPTNYIAYISSNDHGESWSAPTLLPPIMGLNRNAPYLGPGRGIIESSTGRILIPSYTGKESAFIYSDDNGASWKVKVVPLPSSWSAEAQFVELSPGVIQAYMRTNNGKIAYLTSKDAGTTWSAPEYLKFVSNPSYGTQLSIINYSQLIDGKKAVILSTPNSTNGRKHGQIWIGLINDDNTIDWRYHHDVDYSNYGYSYSTLTELPNHEIGLMFEKFDSWSRNELHMKNVVPYITFKIEDLKKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Neuraminidase C
publication title Streptococcus pneumoniae NanC: STRUCTURAL INSIGHTS INTO THE SPECIFICITY AND MECHANISM OF A SIALIDASE THAT PRODUCES A SIALIDASE INHIBITOR.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 202
structure length 659
sequence length 659
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2015-03-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02012 BNR BNR/Asp-box repeat
A PF02973 Sialidase Sialidase, N-terminal domain
A PF13088 BNR_2 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.220.10 Mainly Beta Beta Barrel Intramolecular trans-sialidase; domain 3 Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 4yw5A03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4yw5A01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 4yw5A02
5H9QA 1E8UA 2GN7A 5HX0A 4AYUA 1LOAA 1F8EA 4CPZA 2HTVA 2CY6A 4C1WA 1DIWA 2EXHA 2A6WA 1O4ZA 4XBQA 4BM8A 3WG1A 4HZYA 1S0JA 2WT0A 1LEDA 3B69A 1LODA 3M1HA 5H9RA 3ZXJA 1W8OA 2PELA 2C9AA 3K36A 3AP6A 4DS0A 1BZWA 1LHVA 4FPYA 3I4IA 4FVVA 5GALA 4MWJA 1GZ9A 1Q8PA 1SLTA 1LECA 1JBCA 2GNMA 1QOSA 3OYWA 4JF7A 3AJYA 4Q27A 3ALWA 3WDXA 4KS5A 4YZ3A 2UU8A 3SH4A 4WZFA 4XTPA 2XZJA 1JHNA 4FOYA 2ZGSA 3D5OA 3RG0A 1AVBA 3M2MA 3WCSA 3M3QA 4GZXA 5FRAA 1SCSA 1ULFA 3O9KA 2JE9A 5IK7A 1IVEA 1W8NA 5KXCA 3CYEA 1LU2A 3A71A 2CWSA 3TI8A 2ZHLA 1BJIA 1WD4A 5DUVA 4UF7A 1S0BA 4GZQA 2QWBA 1N3QA 4Q2FA 1V6KA 2R16A 1QMJA 4SLIA 1W6PA 4MWRA 4XMIA 4YG0A 4K20A 2ZMKA 1NNBA 3ZSMA 3B7EA 4GKXA 3OY8B 5DZGA 2A3WA 3AYDA 4GB1A 2FHRA 4U36A 2X9MA 3AFKA 3N7JA 2F26A 1GYKA 3RSJA 1QNWA 2UWAA 4P9YA 4FJ6A 5T55A 4XHXA 3T1EA 4Q1PA 4GDJA 4XE9A 2CL2A 4YW2A 1AX1A 3N7LA 3GVKA 1IVGA 1AZDA 3BEQA 1LENA 3MW2A 3AXEA 3KM5A 1F8BA 3I8TA 2A3XA 4XJAA 5T54A 4FZHA 3MW4A 3IM0A 2WSVA 1A8DA 4QNPA 4ISRA 3USUA 1V3CA 3TAYA 2PHXA 3H73A 4CPNA 2DURA 3WUDA 1N1SA 3A0NA 1ZA4A 4K1IA 4BLIA 3NV2A 2W5NA 5DUUA 3OYWB 1LULA 1NNCA 1LOBA 1ULCA 2Z42A 1NLSA 1NCAN 5T5OA 1WBLA 2VK6A 2JKBA 2WT1A 2DV9A 5HUKA 2R1BA 2GMMA 1GANA 4Y1VA 1A3KA 4ZXKA 1V6LA 2JECA 1IKQA 4QN3A 2CNAA 4YG6A 1MACA 1F9KA 5T50A 4FOQA 2ZMLA 2SLIA 4AGGA 4B7MA 2DYCA 3N3HA 2HT7A 4NC5A 1A4GA 4ATEA 1W6PB 4K1KA 2YA8A 2A71A 1APNA 4J9TA 1ULGA 3AYCA 1LHOA 3V65A 2A6ZA 1OKQA 2QWIA 1G86A 4XJWA 3NV3A 2R49A 5F9TA 2DVFA 1CN1A 3WV6A 3FFZA 1AXYA 4CPMA 5DZEA 1KRIA 3ZXEA 4UW6A 3W09A 2YA4A 1SBDA 1LGCA 4LBOA 3R4UA 1GSLA 2VY0A 4XIOA 3RMYA 4W65A 1HQWA 2XZIA 3WDVA 2W52A 3AZZA 4K1HA 1MR5A 1WW6A 3ZVXA 4DRVA 2E7QA 3BOPA 3FLTA 4GWNA 7NN9A 3O5SA 3USUB 1NMCA 3AJZA 1G7YA 2DVAA 1PZ9A 3AYAA 1V2IA 4PBPA 4GZPA 1L7FA 4Q8KA 2WNEA 1V00A 2DTWA 2ZA9A 2BQPA 3ZYPA 4D69A 1NCDN 5CAZA 1GKBA 5DG2A 4AWDA 1MS8A 3QLQA 1VCJA 2QWCA 1W6MA 4LBQD 1Y7BA 4ZKTB 4M00A 1KJRA 4YZ1A 1Z0HA 3WOGA 2JDZA 1XQNA 1NSDA 1D2SA 1MS1A 2R0FA 4LBLA 1H9PA 3ZXFA 3RRDA 1DQ5A 1DILA 2ZGOA 2W5OA 2YMZA 3TIAA 3K38A 3R4SA 1YYNA 4WV8A 1Z4WA 1NNAA 4TYSA 2ES3A 2QWAA 3V64A 2HU4A 1C57A 2G4IA 1GNZA 3HN1A 3FUOA 3CL2A 1BYHA 1G9FA 4ISQA 1N1VA 1S0IA 1G9DA 4BBWA 2WJSA 3W59A 1UN1A 3SISA 5IK4A 5DUXA 1FYUA 3AXDA 2DVDA 4YM1A 2A70A 3WZ1A 1YRZA 1MZ6A 3PJQA 1AX2A 5T5LA 3WDTA 1IS3A 2ZGTA 2F28A 2CYFA 2H0BA 2YA7A 4GZTA 1INGA 3TICA 2D44A 5GJ6A 3CKZA 1CONA 5GZEA 4R9DA 2C5DA 4CPYA 2DTYA 2VSMA 1ENQA 3SH5A 2NMOA 3AZXA 3NV4A 1IS5A 4FPLA 3OBTA 1JXNA 4Q6KA 3AZVA 1SBEA 4TZDA 5JOXA 1CIWA 2LTNA 3JU4A 4XXPA 1JN2P 2A75A 4X49A 2NP0A 3WNXA 1Z4VA 1QF3A 3TI3A 3AZYA 5GLUA 2UWBA 4M3CA 5JVVA 4DQAA 1W6MB 3BTAA 2ZACA 2VU9A 1NMAN 4FPCA 1AXKA 1USXA 2ZGUA 3A0KA 2CTVA 4GJTA 1NCBN 3IMNA 1QGLA 4LBNA 4QN6A 4FPHA 5GZDA 1NSBA 5GZGA 3CL0A 4YZ5A 4NOTA 5F5QA 1NMBN 5E8AA 3H72A 4HIZA 2D6KA 2C4LA 1LOEA 3BODA 1INHA 2VH9A 5CNAA 5IUQA 1V6JA 4CRQA 5EXOA 4M4UA 4FQ4A 1IVCA 4QN7A 2GALA 5AVAA 2WT2A 1ENSA 3H6JA 2XZKA 2AENA 1GZWA 3CNAA 4XHBA 4BLJA 5JLVA 5KXDA 1LOFC 3D11A 2BZDA 2PHRA 3NV1A 4PQ9A 2DUQA 2JJ6A 2A5ZA 3UJOA 1DQ0A 1Q8OA 3AP4A 1HDKA 4DRRA 3V0AA 2EXIA 1VIWB 4PF5A 4FPJA 3HMYA 1W6QA 1Z50A 3U4XA 2A7AA 3KQRA 4XJRA 2DU1A 4X47A 3TI6A 2AR6A 3N7MA 1CR7A 1LCLA 3ZSLA 4FP2A 4PBOA 3ZSKA 2HTYA 4YZ4A 3APBA 3JUUA 1A78A 1QDOA 1LJ7A 4HZXA 5JOZA 1L7HA 4ASMB 3WCRA 1R1ZA 2A6YA 1U0AA 3ZXKA 4Z8BA 2SBAA 4BMEA 1JUIA 1IS4A 1L7GA 1DIMA 2QWDA 4WA5A 2ZGLA 3D4KA 4YLZA 1BQPA 2PHWA 4M3CB 5KXEA 4CPOA 3ZXLA 1AJOA 4BOWA 1LOFA 1N3PA 4AVTA 2QWHA 4WEFA 2AEPA 2WQZC 4PCRA 4BMBA 3GVLA 4CTEA 1A14N 4XIKA 2W39A 3T1MA 4YM0A 1UX6A 4I30A 3NN9A 4LBKA 4WVVA 2EIGA 5KXBA 5E88A 4M4VA 1JOJA 3QCWA 5DXDA 2KM2A 1HQLA 3VUOA 2F29A 2ZKNA 4XOGA 1DHKB 1LU1A 1DQ6A 4M3CE 2DU0A 1V0EA 2HYKA 2GDFA 4UW5A 1GZWB 3LCPA 3NWKA 5LK5A 4R9CA 4GKYA 1F8CA 1AJKA 4Y1YA 2D3PA 4I00A 2YDPA 4YW4A 4P14A 4AGVA 3TI4A 4OZXA 4MWQA 1WLWA 1TEIA 3DUIA 3V0AB 1AXZA 3O9JA 4XTMA 5IK5A 2ZAAA 4HANA 1PZ7A 1W6QB 1INWA 1S0FA 3M3OA 1VALA 2CMLA 4XJZA 2D6LX 1SLLA 2NYYA 2F24A 4UW4A 4Y20A 2DUPA 4X4AA 3VKLA 1YO8A 3WVJA 1RIRA 2Q5TA 4X6KA 1Q56A 4P9XA 3FUQA 4LBMA 4HZZA 1V3EA 4M3MA 2HT8A 1LTEA 1BJQA 2F12A 4YGEA 4WA4A 2W68A 1SLCA 1VLNA 5IT6A 1LESA 1IKPA 3UJQA 3Q9OA 2ZB5A 2F13A 1JYIA 2D6OX 4LBJA 1FATA 2ZGNA 4YW1A 3C2UA 2YA6A 4GWMA 4HZVA 1KDKA 4Y1XA 5HUNA 4B7JA 1ULDA 3ZYRA 4H55A 3OPZA 1MZ5A 1QOTA 2ZHNA 1DYKA 3GNEA 4P9WA 2DVGA 3SANA 2EXKA 2ZABA 2OW4A 4Y24A 2P37A 2UWCA 4Y26A 2F0ZA 5T5PA 5CA6A 5IK8A 3MW3A 1NCCN 2D6PA 4MWUA 1HKDA 3GVJA 5JDBA 4UW3A 2VWDA 1Z4ZA 3IKWA 1ONAA 3TIBA 1INVA 3RMXA 1FX5A 1EUTA 3B9CA 1CQ9A 4C1XA 2WKKA 1F31A 5GLZA 2ARBA 4GA9A 2F11A 3HR9A 2AREA 2WLQA 1WCQA 3ENRA 1YIFA 4MWYA 3OJBA 4KS1A 3V0BA 1I1EA 1DFQA 5CBLA 2D6MA 1G9BA 2GNBA 2R0HA 1C1FA 1N1TA 2V73A 3WG4A 3PVEA 4Y20B 5JOWA 1LOGA 2D3RA 1ZM1A 5T5JA 3BIWE 2W38A 3SALA 1QOOA 5GLVA 1KJLA 3TI5A 1DBNA 5E89A 1SNTA 1UKGA 1B9VA 4YM2A 2D43A 4K21A 5EWSA 2P34A 3LSEA 5GZCA 1ULEA 1MS0A 3FLPA 3VKMA 4XJ9A 2ENRA 1Z4XA 2FMDA 1UAIA 5EYYA 5CB7A 1QKQA 4GDIA 4IQPA 2E53A 1Q8QA 1KITA 4KS2A 2QWEA 3RQ0A 3N35A 3AYEA 1LHWA 3AP9A 2VW2A 4KBBA 2GNDA 1W6OA 1MS3A 5HCFA 4R9AA 4YGDA 3SNMA 3OGGA 1S0DA 2DUOA 1WUVA 1Q8VA 1FV2A 4Y22A 1NSCA 2P3JA 1C1LA 3D12A 4YG3A 3B00A 1WD3A 4Y1ZA 4MC7A 4XJ8A 4GZOA 1LGNA 1N1YA 2QWFA 3T1LA 4YW5A 1SO7A 2BERA 4FPEA 2E7TA 4WA3A 3ILNA 3POWA 1B9SA 2F10A 4JC1A 3VKOA 3M3CA 1W21A 1G8WA 3LSDA 2NZ9A 4XYXA 4FOWA 4M01A 1LEMA 4AVSA 2GMPA 3ILRA 2NM1A 1CVNA 1V6OA 4XBNA 1WW4A 1GV9A 2OUJA 2W08A 4XJUA 4RL7A 1SLBA 1INYA 1F8DA 2JD4A 3V0BB 3WDWA 4XMAA 2E51A 4MWVA 1I3HA 1DQ1A 2EF6A 2ZGRA 1UL9A 2ZGMA 4FPOB 2VW1A 2CWMA 3GALA 4WVWA 1MS4A 3WG2A 4FVKA 1V6NA 5DZFA 2QWJA 5FREA 3INBA 3B3QE 2RHPA 3ALXA 3IPVA 4K3YA 1N3OA 4HL0A 2BF6A 3PVNA 1QU0A 2VVZA 2QWGA 1E8VA 4XZPA 2EALA 2HTRA 1YI7A 2OVUA 4AGRA 1PZ8A 3M3EA 2AGSA 5NN9A 1INFA 4GXLA 4K1ZA 2XCYA 4K1JA 1W6OB 4GZSA 4DFSA 1YXWA 1B09A 1G9AA 1FNYA 2YZ4A 4KS3A 2ZMNA 4MWLA 1DYPA 4Y22B 3D6EA 1WLCA 4BQ1A 5T52A 1V0FA 1BKZA 1GLHA 1V6MA 2YXSA 3WDUA 3A72A 3O0WA 3UK9A 1CPNA 2HTQA 2F27A 1IVDA 1WW5A 1CJPA 3AP5A 2D6NA 3ILFA 1S0CA 3VKFC 1FNZA 1IVBA 3O12A 3WHTA 1SCRA 1WBFA 4YFWA 2OUHA 4B7RA 4K1YA 1Q8SA 1W1XA 4AVVA 2GNTA 4NCSA 1EPWA 5B2CA 2R1DA 4Q26A 2V5YA 1W20A 1RITA 2PHUA 3PVOA 2GN3A 1UZZA 4QN5A 1XOEA 3IN9A 5JMCA 5GLWA 3RS6A 4F83A 1AX0A 3WHUA 5HUGA 1VCUA 1IVFA 1MS9A 4DGRA 2TEPA 3K37A 2EXJA 5HCBA 4WEGA 2PHTA 1GBGA 1GZCA 4KS4A 4M4NA 3JU9A 5HCAA 3IPVB 1V6IA 2C4AA 1ENRA 1FAYA 2PHFA 4YGCA 3SILA 2JE7A 5JYYA 3FBYA 3WUCA 5BYNA 1LOCA 4Q8LA 3AX4A 4MWWA 1F5FA 2GMEA 3ZPYA 3PMEA 3H0OA 5H9PA 3W58A 1FV3A 4LBQA 4XDQA 2YDTA 1QDCA 4GALA 1DGLA 5GLTA 2QWKA 3AK0A 1B9TA 2F25A 4MX0A 2D3SA 2XB6C 3K39A 2VW0A 3MEPA 5GZFA 1Z4YA 1LGBA 1OQ1A 1JYCA 1SBFA 2LALA 3K3AA 4B7NA 3T2TA 2W20A 2ZGKA 2UURA 4FOVA 4FPKA 4GZWA 1S0EA 2SIMA 2ZHMA 4YZ2A 4XILA 1GICA 1UZYA 4MZAA 1USRA 1XOGA 5GM0A 1NXD1 1V0ZA 1D0HA 5JOYA 1LHNA 2ZGPA 4XBLA 2VK7A 2AUYA 2B8HA 3AP7A 2D7FA 2SILA 4ATFA 2ZZJA 2AYHA 4JRAA 4JCKA 4YW3A 2EAKA 5M1ZA 1H9WA 4FPGA 2NN8A 3R05A 4HZWA 1BXHA 3AZWA 1EURA 1V3DA 5H9SA 1QNYA 3TB0A 3O0XA 4M3CF 2P3IA 1DQ4A 1EUUA 4MJUA 4XJQA 4YGBA 1W6NA 1GNHA 4CPLA 2I2SA 1UMZA 4H53A 1JW6A 2DWRA 4MJVA 1G9CA 4CZSA 1WLDA 3WG3A 1O4YA 1CESA 2VK5A 3B01A 1MWEA 1NN2A 2WSUA 1E8TA 3MPPG 3POSA 4XXAA 1Z78A 4FP3A 4LBQB 5EYXA 2HTUA 5L73A 5DG1A 4FPFA 3L2YA 1S0GA 4H52A 3ASIA 1C4RA 1LHUA 1W0OA 4NO4A 1DLLA 2ZHKA 2E6VA 4B7QA 1V3BA 3N7KA 5SV8A 2NMNA 3OBRA 2XG3A 1OFSA 3SLIA 1RINA 2ARXA 2ERFA 2A3YA 3UL2A 4U2AA 3FLRA 3WDYA 3SH3A 2A6XA 3DGTA 4L8QA 3A4UA 4ITCA 2ZB6A 1J1TA 1DQ2A 2P3KA 2HU0A 5HUMA 1SACA 1SFYA 2ZGQA 1SLIA 5B2DA 3POYA 4Q1RA 1S1AA 2YROA 1INXA 4BPZA 4RA0A 3INAA 1A4QA 4D8SA 1WW7A 2YA5A 1URXA 3H71A 2VUAA 2HTWA 2AH2A 2P2KA 2ZBJA 1IS6A 1MVQA 4YFZA 4DPNA 1AF9A 1X50A 3WLUA 4MWXA 1W6NB 3VV1A 6NN9A 2DVBA 2VSKA 4Y1UA 2VXRA 1MVEA 3NSSA 1N47A 1EUSA 1UPSA 1WCSA 4MYEA 1KQRA 3ZSJA 1SLAA 1HLCA 1VAVA 1MS5A 2HT5A 1IOAA 4MZEA 2BATA 3SITA 2RKCA 3ATGA 1KDMA 2YV8A 2A6VA 4R9BA 4YM3A 1DZQA 2YY1A 3OY8A 4GEZA 4NN9A 1VAMA 2B7YA 4FQZA 1H30A 3VKNA 4QN4A 1CPMA 3N36A 2AEQA 1W0PA 3O0VA 5DUWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IAXA 5FZ9A 4URTA 1L7LA 5H9QA 4AI2A 2PXJA 1E8UA 3J7HA 2GN7A 4D7SA 5BNOB 2NPIA 5HX0A 3K4DA 4CDUB 2UY9A 3SQOA 1H8TA 2RR11 3BU7A 4AYUA 1LOAA 1F8EA 3VBHB 1ZA7A 4CPZA 2ORZA 2HTVA 2CY6A 4QDQA 4XF3A 1GWLA 1PO21 4BK5A 1DIWA 2LM3A 2PLV2 3HWJA 2CV6A 2LS6A 4BISA 5FQ0A 2EXHA 3GM8A 1KD7A 4LHSA 3VBSB 2A6WA 5IYYA 1O4ZA 1R081 2BRTA 2BP6A 4XBQA 3WG1A 4RS5C 4BM8A 4P5YA 5CKNA 3I3MA 4HZYA 3W9AA 1ZYBA 2BTVC 5BNNA 1S0JA 4XF0A 2WT0A 1LEDA 3U07A 1O3RA 2FDHA 1OFNA 3B69A 3J8F3 1LODA 3M1HA 1W05A 4KGQA 4UOJA 4CDQB 3GHMA 4P9JA 2HWE2 3CJIA 3KV6A 5JSOA 3FFQA 1N7DA 1JHJA 1UXXX 1GP4A 2K46A 3E5UA 4BA6A 5IVEA 5H9RA 3FHQA 3ZXJA 1B35A 1W8OA 4GAZA 2IXCA 1OOPC 2PELA 2C9AA 1KS4A 5FZIA 3K36A 4IDZA 1H2KA 3LWCA 4QKBA 1PNFA 2Q1FA 3AP6A 3OBAA 2ILMA 1J83A 4QX8A 1ZZ8A 4DS0A 1BZWA 3DKWA 1PMHX 2AC1A 1LHVA 5I0UA 4FPYA 3I4IA 4FVVA 5GALA 4D94A 1IPKA 2ZEWA 4MWJA 1GZ9A 1Q8PA 1RVF1 1ZBA2 1SLTA 1HN1A 1LECA 1JBCA 2ADEA 3F95A 3MF9A 4UBGA 4AZZA 2I74A 3W5NA 4ZS3A 4P08A 2GNMA 3T2QA 2JG8B 1W8HA 1PMIA 1QOSA 1BVVA 1WMDA 3IDAA 3OYWA 4FAGA 5CADA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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