1FLI | Genus

Total Genus 15

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	15
sequence length	98
structure length	98
Chain Sequence	PGSGQIQLWQFLLELLSDSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Solution structure of the ets domain of Fli-1 when bound to DNA. pubmed doi rcsb
molecule keywords	FLI-1
molecule tags	Transcription/dna
source organism	Homo sapiens
total genus	15
structure length	98
sequence length	98
ec nomenclature
pdb deposition date	1994-09-15

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00178	Ets	Ets-domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.10.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Arc Repressor Mutant, subunit A	Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain	1fliA00

4G6DA 1XD7A 4CO8A 3KLNA 1B59A 2VE8A 1MD0A 4KDPA 2QWWA 1CF7B 5EEGA 2FBHA 3WTTC 4ZZLA 4I2OA 3NRVA 2HTSA 4ESJA 2MC3A 3HRMA 3KE2A 3ZP5A 3IL2A 5F6FA 4U88A 2VC0A 4L0ZB 3N97A 1BIAA 3N4MA 4LLGF 3WTUC 3HRUA 1PDNC 4ESFA 5FO5A 2GA2A 3RKXA 3HSEA 4CGZA 2YU3A 1MZBA 1TQPA 3MFKA 1AWCA 4M72A 4UHTA 5DUKA 5LGUA 2RQPA 2R7FA 1WKMA 1PUEE 2LNBA 2GWRA 3FM5A 2FU4A 4U7BA 1XCBA 4L18B 5CYVA 1FZPB 1LB2A 2RNJA 1T2KA 2BYVE 3EDPA 3ABUA 2QQAA 3K1NA 4HZFA 4I01A 4AIHA 4G7HF 2RC4A 4BNCA 2FOKA 3MAJA 2OZUA 4ENJA 2DFIA 2M45A 3TDUC 4R8HA 1XDSA 1KQ9A 5ICCA 3LQQA 3KCCA 3E97A 2A61A 1MJBA 5ILUA 2VOPA 3QP5A 2VN2A 3F8BA 3I4PA 3SQNA 2P5VA 2XV4S 4RB3C 1ZH5A 3GWZA 3C3WA 1U5TC 1FNNA 3GX4X 1BM9A 5FGMA 1I1GA 2XRNA 1I27A 2W85A 4HAMA 2A68F 1R1TA 2V1XA 1FYMA 3MZYA 5CVUA 1SD5A 2UXXA 3Q9VA 3TO6A 4AVPA 3SZTA 3GVAA 1XSVA 1G3YA 2VT2A 1EH6A 4EJWA 1UFMA 1LVAA 1R1UA 2FNPA 4U0VA 3HYIA 4Q4ZF 2IPQX 1QBJA 1XN7A 2YPRA 2J5PA 2W84A 2HKOA 4RGSA 3LFKA 4UVBA 3R6SA 4EGZA 4JQFA 1UB9A 4IVNA 4GYGA 3SZPA 2RVCA 4PGGA 4UV8A 1TTYA 1ONVA 2STTA 4BH9A 2PMHA 2M8EA 1FBUA 1IAWA 2RN7A 1E2XA 4L9TA 4MGRA 2EWNA 4NB5A 2P4WA 1FOKA 4R79A 2OQGA 3KFWX 2A69F 4HX8A 2A6HF 1Z1DA 3DP7A 3KEOA 1Y0UA 3PQKA 1WRJA 4EMSA 1RI7A 3G3ZA 5HS8A 2NS0A 4KIBA 1IXCA 1YLFA 2K4BA 3BROA 5CVIA 3F6VA 2HYFA 5K5OA 3JAMZ 1XDUA 3P7NA 3K1MA 3VFZA 4PGHA 4S04A 3K69A 4PDKA 3HRSA 2ZFWA 2ZXJA 3F23A 2MH9A 2KIFA 5HDKA 2Z3YA 2ISYA 1SFEA 5IT9K 3IWZA 4RB0A 2Z99A 2L4AA 4RGXA 1LDKB 3GO5A 4A0ZA 3GUDA 4ASNA 3TOAA 2NYXA 1SAXA 1QGPA 4A6DA 2XROA 3FXUA 5HVQC 1SD7A 4HA8A 5LEKA 2IRFG 5D6EA 4S05A 4A12A 3I54A 1YG2A 1QZYA 2ZKZA 1HW2A 5HLGA 3WGGA 1ZRFA 5LHIA 3C7JA 2XASA 5D4RA 2Y0MA 1ZG3A 3QU3A 4RAZA 1RNLA 2HOEA 3ROUA 2FRHA 4U0WA 2YX7A 3M8FA 1XCVA 1ZHFA 2M5WA 2CYYA 5H6QA 3V7RA 2BBYA 3KZZA 3J7AO 3DF8A 5L3GA 2L4MA 2OZ6A 4A5NA 3GFJA 4LLLA 2GAUA 1YW8A 4H0EA 4RGUA 4ESBA 5DCMB 1T0FA 2ADUA 2CO5A 2FA5A 2IW5A 5E1XA 3DXJF 4HV5A 5DD8A 1YFHA 4HLXA 1ZG1A 1HBXG 2AS5F 3RPUA 3IHUA 3FZVA 3QP6A 1JHHA 2WV0A 2KIMA 2DPUA 5J8CA 1TNSA 2ZMEA 3ZMZA 4P9FA 3W6JB 4XBFA 1D5VA 1HXDA 1B9MA 5D8KB 3TOBA 2VBZA 2HDCA 5TRDA 5LBQA 1LJ9A 3KZYA 3HOTA 5HLIA 2FMYA 4XLNF 1IN4A 2PFBA 1HKTA 2COMA 4BHPA 1T98A 5FFZA 3BPXA 3CTAA 3O2PE 1MDMB 2QZ8A 5IT3A 5EEHA 1P4WA 5HS7A 1USTA 5LLQA 4I0AA 4WXDA 4OINF 5ILSA 4RB2C 2F5EA 1HW1A 2BEOA 5E20A 3KP3A 2CSOA 4U0YA 3V4GA 3GF2A 1ON1A 3FMQA 5JR3A 2EFPA 1WQ2A 1TQIA 3TQNA 2HZTA 2OAZA 4JBAA 3V8JA 5CJ9A 3FMSA 1KYZA 1J75A 2IA0A 2IA2A 5DD4A 1R36A 5BQTA 3KP7A 3VODA 2PLYA 4DQ2A 1IXSB 3Q9SA 3FHZA 3H92A 2CG4A 2XKOA 2VODA 1TQMA 3IKVA 4MTEA 2DQRA 3ZMUA 1BI3A 3E5XA 1DDNA 3J80Z 4N9IA 1LNWA 1G6NA 4HF2A 1O3QA 1TW3A 4AD9A 1K79A 1HKSA 2CGPA 3GEZA 2L02A 1SD4A 4L5IA 4Q5SF 1HQCA 4KIGA 1BC8C 3GXOA 3QAHA 4GO1A 2Q0OA 2R3SA 1T39A 3FM3A 5DEQA 1DUXC 1FC3A 5AIQA 2QUFA 2PN6A 2LF8A 3ZMTA 1STZA 1YS6A 1YQAA 4A6EA 2O3FA 4OIOF 2EA4A 1MDMA 1EH8A 5JHUA 2FBIA 4ZYDA 3ERED 4HQMA 2ETHA 1FLIA 2JRTA 3P9KA 2Y75A 2JT1A 1PP8F 3KP4A 2E1CA 3GFMA 5E8GA 2DT5A 4CZZA 2DPDA 4BHCA 1QQIA 5K1YA 1QZZA 2P6TA 2DQLA 3F72A 4AWXB 1J59A 1W7PB 3I71A 2PQ8A 2FXAA 1WI9A 1ZRCA 1ZGJA 3FXQA 1LDDA 1G3WA 1ZG5A 2O0YA 4ZYEA 2BGCA 4EVIA 1O3RA 2OD5A 1FP1D 3HUGA 1GVJA 4U7DA 3CLOA 4G6QA 4CICA 4MTDA 4KT5C 5KK1A 4P96A 4IRGA 5J6XA 1KA8A 4KN7X 1HSTA 1ZN2A 2HFHA 4MEXF 3RTRA 4G8XA 1XGMA 4BHBA 2Y48A 1Z6TA 1BN5A 2NAZA 3JTHA 4GXOA 2TDXA 3MQ0A 2GIVA 5BPDA 2P7CB 2M87A 1O57A 5E18F 2A5YB 2Z5UA 2HTJA 2YX4A 3IRQA 1ODDA 3S2WA 1EH7A 4LB6B 1P92A 2YR2A 3EYIA 5DCFA 3K0LA 2F2EA 5K5QA 3BZ6A 3RPQA 5ICGA 1J2XA 1IN6A 2DI3A 2G7HA 4L9VA 3WU0A 4IPAA 1Z9CA 2EJRA 1W7PD 3FMRA 3O6BB 1AOYA 3E6DA 2XUBA 1V3FA 5BMZA 4BQAA 1U2WA 4ZZDA 5LGNA 4IJAA 2CW0F 2VOOA 3U9GA 2H27A 1H9TA 2V1DA 5D8LB 1SFUA 5DUIA 2EV0A 4RB1A 3J81Z 1R00A 1R23A 3EETA 1B1BA 3RKWA 2ZO4A 2M30A 1L0OC 1RUNA 3QPTA 2QBYB 1IZ1A 4EQQA 2PJPA 2VE9A 2NNYA 5L3DA 2Q8KA 1DP7P 3L09A 2GXBA 3DQVC 1W7PA 3WE2A 1OMIA 3HSRA 2UZKA 4OMYA 1R58A 2W57A 2OQRA 2P5LC 3F21A 3ZMVA 4B8XA 2VBWA 1MGTA 4O5VA 4PCQA 4HQEA 1ZLKA 3KP2A 2IT0A 3VB2A 4K2EA 1FP2A 3HHGA 3ZPLA 4ENNA 4YFXF 2UXNA 1S8NA 4I09A 1V4RA 5FD5A 4M9SA 4YIFA 1QO0D 4CDGA 1KYWA 3F6OA 3COAC 2HR3A 4UNOA 2ZJ2A 3ELKA 2ZMEB 5D5XB 1Z6RA 3V8KA 3T5XA 4IHTA 3ABTA 4FT8A 1ZLJA 1BI0A 2OBPA 4M9XA 4TV7A 4YFKF 1SMTA 3IC7A 4LD5A 5JI6A 3I59B 3J80K 2K02A 3L00A 5E1WA 3F22A 2ESHA 4BAYA 1R7JA 1REPC 3HIFA 5ILVA 2F5DA 1GHCA 2QLZA 3G73A 4A5MA 3E3VA 3RYPA 4A0XA 4RAYA 3D5LA 1IRGA 2KRFA 4MNUA 3OOPA 4HF1A 1JGSA 5JVTA 3ISPA 1YYVA 1L3LA 4UUVA 1KQ8A 2WWYA 2EV6A 3M1EA 3M7GA 2XIGA 3F3XA 4KN4X 3CJNA 2EFNA 4ENKA 1KU7A 2QBYA 1K78B 1J0RA 4EV0A 3LA3A 3BJOA 5F1RA 6PAXA 4LFUA 2H09A 1Z7UA 2KIUA 2E1NA 2Z33A 1Z05A 5CVRA 2NNNA 1B4AA 2V6CA 1ULYA 2ACJA 3R0AA 1TBXA 4CHUA 2LKPA 1LEBA 1FPQA 4KMFA 1MKMA 5ICFA 4O6JA 4Y13A 2ZNZA 1Q1HA 3CUQB 4MHGA 2KJCA 2FNAA 3I5UA 4I7HA 3ZN0A 3L2CA 3I58A 4EJUA 2ESNA 3VEPA 4B09A 4G7OF 3R4KA 4L5JA 4OMZA 4OIQF 5FB2A 2H6BA 4XSXF 3R0JA 1P6RA 1I1SA 3TO7A 2XHKA 1J7KA 4UVAA 5LRSA 3FF5A 3EYYA 5FD6A 1W5SA 4WXHA 5D5WB 1WWXA 3I59A 2G9WA 3DPLC 2A6EF 1T38A 3GLXA 3W6KB 4G9YA 3R60A 2NRAC 1S7AA 3V7CA 3IKTA 4WCGA 4G7ZF 3C1DA 4NHJA 3WTVC 5HOOA 5LGTA 4IF4A 4EM1A 4MQ9F 4M6XA 3GZ5A 3F8CA 2EV5A 5TJJA 2QQ9A 3HSFA 2XKPA 3NEUA 1DPUA 2O6GE 1NHAA 4XLPF 4M73A 1FX7A 2K86A 4FX0A 3WTZA 2ELHA 3RDIA 3GZ6A 3JTGA 4P9UA 2H94A 2QENA 3T1BA 1BIBA 3J81K 1K78A 1XMKA 1J5YA 1OPCA 3BJ6A 3KEQA 3GYHX 2DO7A 1WSUA 1U78A 5E1ZB 3WGHA 2PEXA 4LK1F 5CVJA 3TKYA 3P9CA 3LSTA 1ZGAA 3TGNA 3L9FA 4YG2F 3K2ZA 2X0LA 2D1VA 4ETSA 3CUQA 2M1BA 4OIRF 3ML6A 1UHMA 5ERIA 1G3TA 3HRTA 1I5ZA 5CVVA 1OYIA 4RGRA 1B6AA 4BYYA 1IN5A 3WODF 4NQWA 1MJAA 2F5FA 2HQRA 4WX9A 1HKQA 2QYOA 4F7ZA 3KP5A 4UVCA 4KICA 3LA2A 4HX7A 1F1ZA 3V8LA 1B9NA 4HLYA 2DW4A 1KU3A 3JSPA 2GA1A 3LA7A 3ULQB 1D8JA 5D5VB 3CO6C 1FYLA 3R61A 4GYIA 4UXNA 3T8RA 2IA1A 1OKRA 3LWFA 4HX4A 5HDNA 4EJTA 3F8FA 1XSXA 3C18A 1FBQA 4R1HA 3D0SA 2EFWA 5D6FA 1O3SA 1FT9A 4EM2A 3WU1B 3ZQ7A 3M9AA 5L3CA 2DK8A 1KQ0A 2FE3A 1F5TA 2IVMA 1XGOA 4KNYA 3I0TA 4IRIA 4N0BA 3RI4A 4YFNF 3RIRA 2STWA 4JK1X 3ZN1A 2XAQA 2GXGA 2FMLA 3MWMA 2CQKA 2F5CA 2J5OA 2RKHA 1G3SA 5FLXZ 3E6MA 3I64A 1G4DA 4G94A 1O3TA 4KMUX 3E6CC 2Q2EA 3HTUA 1XGSA 3KP6A 3WTWC 2MH2A 3HTSB 4LMYA 2XGXA 3H3UA 3BY6A 2GQQA 1YS7A 2EFOA 4OOIA 1S6LA 2PMUA 1EV7A 2FBKA 5D4SA 2FEZA 1TNTA 1IF1A 2V79A 1JE8A 3RYRA 3QU6A 4EM0B 1IUYA 3H3ZA 4CXFA 2XAGA 2Z9OA 2XAJA 3QPHA 2HEOA 2IJLA 4QWQA 1U3EM 4A2UA 4IXAA 4E70A 1YTYA 2PG4A 3HOSA 2VBYA 3EUHA 3I53A 3K9TA 2LDUA 3KLOA 2XVCA 3B02A 4HYEA 2HYGD 1LEAA 1XMAA 1BOAA 1E17A 1R5GA 2FF4A 1GXPA 3CDHA 5L3FA 1X3UA 2OA4A 1KU2A 2HS5A 3WE3A 4L9JA 3WTYC 3ECOA 1F4KA 5BOXA 2WTEA 3E5QA 1FYKA 5HLHA 4LG0B 2K4JA 1F9NA 1XSDA 2XAFA 1CF7A 4IRHA 3IRRA 1O7FA 5L3BA 1FY7A 3TO9A 4Y15A 2MLKA 1S7OA 5AONA 4DNCA 4ZYGA 3LAPA 1IXRC 5BS6A 2EFQA 4O3MA 4KFCA 3BP8A 1HSJA 3RKYA 4Q48A 5LRRA 4L0YB 2KKOA 4Z2YA 2L54A 3SXYA 1ZREA 1U5TB 2W25A 1SFXA 4HBLA 2HWVA 3U2RA 2HQNA 2K27A 4LB5A 4I98B 1C0WA 3WGIA 1JXSA 5A2QZ 4UV9A 2OU2A 2LSOA 3MEXA 2DBBA 5DDGA 3GW2A 3HHHA 2EA2A 3REOA 1I6XA 4EJOA 3KETA 2H6CA 2RGVA 4HDVA 4QLCU 2CWEA 4RS8A 5F64A 3WTSC 1SMYF 4OIPF 5D5UB 3JSOA 3IWFA 4EJVA 1R5HA 3CUOA 3FWEA 3PQJA 3BDDA 2P8TA 3EQLF 2O61A 3OV8A 1ZAOA 2ZCWA 5E17F 4ZH4F 2RV8A 4Y17A 5ICEA 2MD5A 1IW7F 5AIPA 4WXCA 2VXZA 2D2WA 3E5UA 3F8MA 4M9ZA 4P55A 1ZARA 1OYWA 5LEJA 1TLHB 3AAFA 3O3KA 4HW0A 2DAOA 1YW9A 4ENMA 1KGSA 2QVOA 1IN8A 2PBIA 2DTRA 4KA4A 4XSZF 5LHGA 2ZNYA 1W4MA 5CLSA 1XB4A 3JW4A 2P7VB 4GGGA 4LG0A 1PP7U 2EK5A 1YO5C 1RUOA 2KJBA 5KVRA 2K7LA 3V7SA 4Q47A 2WC2A 2UWMA 4WK8F 2L01A 3CUQC 2A07F 1RIOH 1O7LA 1ZRDA 4OU0A 2GZWA 1CGPA 4LJZF 2DU9A 4HOBA 4AIJA 3DEUA 1BBYA 3BPVA 3B73A 4M74A 1U5TA 4XRFA 2BV6A 2ZBKA 4EGYA 1U6GA 4MQVA 1XGNA 3PFIA 4M71A 5K5RA 4HF0A 3NQOA 2DK5A 4LK0F 4LGWA 3LQRA 1P4AA 2FSWA 4A0YA 5H20A 1KU9A 2P5KA 5FLXK 1OR7A 3P9IA 1GXQA 4PZJA 3GFLA 1UCRA 3T0YA 2PI0A 4CYDA 3LAJA 1H0MA 3FXRA 3TDZC 3K1PA 5FFXA 1BI1A 1W5TA 2A3SA 1D8KA 1BI2A 3DV8A 5E8IA 3ZMSA 1VTNC 2JSCA 3CO7C 5H6RA 4AIKA 2RDPA 2XAHA 2E7WA 3DPTA 3SHFA 3T8TA 2EB7A 2G7UA 1YW7A 5BPIA 1T6SA 2V9VA 5DYMA 2VC1A 1U8RA 1P4XA 4GCVA 1JHFA 3QRFF 1K6OA 2R7DA 2IP2A 3RJPA 1RZ4A 4FHTA 2MLGA 2V1UA 2P6SA 3Q5FA 5HS9A 3DFGA 4P5OA 4KIFA 2HKXA 1FSEA 3WG9A 1YIOA 1FSHA 2VT3A 2MBFA 2JPCA 1IRFA 5ED4A 3F8NA 2VBXA 3MCZA 1BC7C 4KYWA 1LDJA 4N9HA 2YSRA 2BE5F 3ECHA 2JTVA 4WWCA 3WTXC 2MA3A 3SFZA 4I0BA 1IN7A 1HW5A 1ZYRF 1ON2A 2HGCA 1DPRA 3BJAA 4ON0A 3BWGA 4I02A 1UHWA 2L3DA 4IHSA 1QPMA 1SD6A 4BXUA 2CFXA 1P2FA 2B0LA 1K7AA 2JPBA 2FQ3A 2VONA 1R22A 1TW2A 4D0PA 5L3EA 3L7WA 4KUMA 2W24A 2ISZA 1J9IA 4WF2A 4MEYF 2O03A 3QOPA 2X4HA 3DKWA 4YIIA 5A2QK 3MZHA 3VOEA 2O8XA 2D45A 1USSA 5DV5A 5J8FA 3FX3A 1QNTA 4L9NA 5LHHA 1FBSA 2C6YA 4FX4A 5JFRA 1A04A 2JZYA 2D1HA 2AXLA 5DCMA 1D3YA 3BOQA 2DLLA 5HDGA 3M8EA 3ZMDA 3U1DA 1S29A 2E7XA 2QQBA 4M6YA 1S3JA 4HV6A 2QM3A 4ZYHA 1BJAA 5IT9Z 1H9GA 1R1VA 3E6BA 4HDUA 1MJ9A 1LQ1A 1OYYA 1FWZA 1Z91A 4LLNA 3GFIA 2LF7A 3JAMK
chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4G6D A;  1XD7 A;  4CO8 A;  3KLN A;  1B59 A;  2VE8 A;  1MD0 A;  4KDP A;  2QWW A;  1CF7 B;  5EEG A;  2FBH A;  3WTT C;  4ZZL A;  4I2O A;  3NRV A;  2HTS A;  4ESJ A;  2MC3 A;  3HRM A;  3KE2 A;  3ZP5 A;  3IL2 A;  5F6F A;  4U88 A;  2VC0 A;  4L0Z B;  3N97 A;  1BIA A;  3N4M A;  4LLG F;  3WTU C;  3HRU A;  1PDN C;  4ESF A;  5FO5 A;  2GA2 A;  3RKX A;  3HSE A;  4CGZ A;  2YU3 A;  1MZB A;  1TQP A;  3MFK A;  1AWC A;  4M72 A;  4UHT A;  5DUK A;  5LGU A;  2RQP A;  2R7F A;  1WKM A;  1PUE E;  2LNB A;  2GWR A;  3FM5 A;  2FU4 A;  4U7B A;  1XCB A;  4L18 B;  5CYV A;  1FZP B;  1LB2 A;  2RNJ A;  1T2K A;  2BYV E;  3EDP A;  3ABU A;  2QQA A;  3K1N A;  4HZF A;  4I01 A;  4AIH A;  4G7H F;  2RC4 A;  4BNC A;  2FOK A;  3MAJ A;  2OZU A;  4ENJ A;  2DFI A;  2M45 A;  3TDU C;  4R8H A;  1XDS A;  1KQ9 A;  5ICC A;  3LQQ A;  3KCC A;  3E97 A;  2A61 A;  1MJB A;  5ILU A;  2VOP A;  3QP5 A;  2VN2 A;  3F8B A;  3I4P A;  3SQN A;  2P5V A;  2XV4 S;  4RB3 C;  1ZH5 A;  3GWZ A;  3C3W A;  1U5T C;  1FNN A;  3GX4 X;  1BM9 A;  5FGM A;  1I1G A;  2XRN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1FLIA

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