The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
45
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sequence length |
152
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structure length |
139
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Chain Sequence |
SSTLTPMHLRKAKLMFFWVRYPSSAVLKMYFPDIKFNKNNTAQLVKWFSNFREFYYIQMEKYARQAVTESELYRVLNLHYNRNNHIEVPQNFRFVVESTLREFFRAIQGGKDTEQSWKKSIYKIISRMDDPVPEYFKSP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Protein prospero
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| publication title |
Structure of the DNA Binding Region of Prospero Reveals a Novel Homeo-Prospero Domain
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Drosophila melanogaster
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| molecule tags |
Transcription
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| total genus |
45
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| structure length |
139
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-08-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Homeo-prospero domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LMD A; 1MIJ A; 1XPX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1MJ9 A; 1D3Y A; 2RDP A; 3RYR A; 1MGT A; 2W1O A; 4M9X A; 1VQO I; 4AVZ A; 5M3F J; 1VQ4 I; 1GDT A; 1SAX A; 1WQ2 A; 2HI3 A; 1ONV A; 1A04 A; 5F08 A; 3OYC A; 4G6T B; 3JRG A; 2FX0 A; 3CJT B; 5KAI C; 1Z77 A; 1SD7 A; 1VQP I; 3IUO A; 3H1C A; 5FB2 A; 2L0K A; 2RVC A; 1RKT A; 3QRF F; 3DP7 A; 2NVU B; 4Y3O A; 3ZCO A; 1LQ1 A; 4XKC A; 2HYG D; 1R58 A; 4C2M J; 2DYR H; 3GX4 X; 2K86 A; 1WJB A; 1E3P A; 4MIM A; 5E1Z B; 1IZ1 A; 1FIP A; 2QBY B; 1G3T A; 2X6O A; 1O3T A; 1VQK I; 2PLY A; 2ZME B; 4CGZ A; 1OLT A; 3GUD A; 2LMD A; 2BHY A; 1A6Q A; 3IWZ A; 2JZY A; 5D6F A; 1H89 C; 1LDK B; 3ZQG A; 4E7J A; 3LA3 A; 3WGI A; 1SVL A; 3HZJ A; 1RR7 A; 1IRG A; 2O0Y A; 4BE0 A; 1G8X A; 2DMN A; 2Y31 A; 4MFE A; 2KIM A; 2HNH A; 3COA C; 5FGM A; 5IP7 J; 4XRS A; 3ZMU A; 2VKH A; 4A3B J; 3F72 A; 3GZ5 A; 1IXC A; 2K4J A; 5A2Q K; 3SZT A; 2A61 A; 3ROU A; 3DPT A; 4OMZ A; 1DUX C; 4F7Z A; 3IKV A; 4MTE A; 3T1B A; 4B48 A; 5HLT A; 1ERD A; 3RTR A; 3AKZ A; 3OYD A; 1ETV A; 5CVU A; 1B59 A; 5IT9 K; 2HVQ A; 4U88 A; 2AXT C; 4JX6 A; 3S1Q J; 3BJO A; 3NWT A; 4RGU A; 4UV8 A; 2M30 A; 1X3W B; 2FQ3 A; 4DQ2 A; 4HST A; 3F21 A; 3L9F A; 3TOA A; 4P9U A; 2M34 A; 4M6Y A; 1R5G A; 2EFP A; 4WF2 A; 3ABL H; 2E35 A; 3BZC A; 4CYC A; 4OIO F; 1T98 A; 3HSR A; 2IS2 A; 1FT9 A; 2JQ7 A; 3Q9S A; 1JGS A; 1YS7 A; 1RUN A; 2K4B A; 2QQ9 A; 4AWX B; 5KVR A; 2KQR A; 4AC0 A; 4DIQ A; 4PJJ A; 5K7Z A; 4BJT A; 5D5U B; 1ZAO A; 2XRN A; 3FXR A; 4LJZ F; 3BG3 A; 3PM1 A; 4I09 A; 5F0H A; 2M0C A; 1ZRE A; 2OBP A; 2Z5U A; 1UZC A; 2DFE A; 5FKO A; 2DMP A; 3L1P A; 3MCZ A; 2HZD A; 1T08 B; 1USS A; 2HQ5 A; 2M3A A; 2Y0M A; 3DTK A; 3ZMS A; 1DP7 P; 5ILV A; 5L3E A; 2GOX B; 4LLG F; 3G71 I; 3H5N A; 5H6Q A; 4CIC A; 3BJ6 A; 2W57 A; 3O6B B; 4F3Q A; 5LGU A; 3WTV C; 5KAF C; 4Y13 A; 1C0W A; 2HYJ A; 1VND A; 4QPQ A; 3MKZ A; 3CC4 I; 2FNP A; 4RA2 A; 4ZZD A; 2KIF A; 2MBF A; 2NYX A; 3DKW A; 3DPL C; 5DEQ A; 1E3H A; 1Y56 A; 3DTI A; 4OIP F; 2EZL A; 3VWB A; 2CQN A; 1RET A; 4RDU A; 1FTT A; 4M6V A; 3KYD B; 3U21 A; 3GTO J; 1AKH A; 3W2W A; 5FD5 A; 2M5W A; 3ESW B; 4GYI A; 3Q3S A; 4LIT A; 4XRM A; 5J40 A; 1MMD A; 1YJN I; 1MH4 A; 2X1E A; 4NUB A; 2FNA A; 3DTE A; 1JHH A; 5ICC A; 4S04 A; 4G7Z F; 3N05 A; 4DNC A; 3CCR I; 3L00 A; 3I9V 2; 3AL0 B; 4XN3 A; 3KCC A; 4YRV A; 4CZC A; 1R4N B; 4R8H A; 2XF5 A; 1OYI A; 2LF7 A; 4OAY A; 4RM3 A; 1R7J A; 1Z0X A; 2MH9 A; 2WAF A; 3IH4 A; 1ZQ3 P; 2E1N A; 4M74 A; 1CF7 B; 4KMF A; 3GXO A; 3ZQQ A; 2EFW A; 4DYC A; 3MZ8 A; 1KGS A; 3PO3 J; 3VFZ A; 1TLH B; 3RSN A; 4UHT A; 5F0C A; 2HTS A; 5DTD A; 5HNH A; 1RES A; 1OR7 A; 3IWF A; 5IYB J; 2BOL A; 2KT0 A; 5C4J J; 3ERE D; 2AO9 A; 2K5C A; 5M3M J; 1I50 J; 5FFX A; 1OCP A; 1WI3 A; 2XB5 A; 1J7K A; 3ZR8 X; 3CCE I; 3ISP A; 1YJW I; 4EM0 B; 3H9Q A; 2DMT A; 4JX5 A; 3RDI A; 3HBL A; 3GYH X; 5DCM B; 3PNT A; 3SFI A; 2I5U A; 3JRB A; 5DUK A; 5LBQ A; 3S1R J; 1T8I A; 5JVG F; 2L4M A; 3NAU A; 3BDD A; 3D0S A; 1R5I D; 1TWG J; 4LMY A; 2NVY J; 4U87 A; 2R7Z J; 4RGS A; 5C4X J; 1WHU A; 2V1N A; 4C2U A; 2JK3 A; 4XSZ F; 2WAQ A; 3JRC A; 2STT A; 3CTA A; 3O2P E; 2RQQ A; 4CCJ A; 1H0M A; 1LFP A; 1GUU A; 3F6O A; 1S7A A; 3FX3 A; 1E17 A; 2IS1 A; 3MZH A; 3LSM A; 4NC7 A; 1QPM A; 2LR8 A; 3X2Q H; 3F22 A; 4U7D A; 4KNY A; 1HW1 A; 5L3D A; 3H3V K; 1JUP A; 3QPL A; 4A0Z A; 1X2M A; 3JRI A; 3KP4 A; 4X1E A; 2Z9O A; 2DJI A; 1FX7 A; 2FRH A; 1L0O C; 1P4X A; 2W4S A; 5J47 A; 4YFX F; 2E2J J; 9ANT A; 3JSP A; 4ZTF A; 1GVD A; 3E0J B; 2JN6 A; 3K4K A; 2HQR A; 2KJB A; 2PMZ A; 1YW9 A; 3WTU C; 2ACJ A; 1WJA A; 3UNG C; 1D1A A; 3GLL A; 1U0J A; 3VOD A; 4BEH A; 3HRS A; 4KIC A; 2PJR B; 2VBZ A; 3U1D A; 3GFL A; 2E36 A; 2M9H A; 1B72 B; 3CLO A; 1X4P A; 1Y0N A; 4AU7 A; 2YPR A; 2HDW A; 3D5L A; 2EK5 A; 1YJ9 I; 4PFP A; 3UR3 C; 3AG2 H; 2WBM A; 5LLQ A; 2DFF A; 2XGX A; 3HRU A; 5EEH A; 2HQN A; 4YEL A; 2BBY A; 3ECH A; 1EKE A; 3SEZ A; 2VQG A; 1F4K A; 2GM4 A; 2DJN A; 5EG0 B; 2WWY A; 4RMN A; 3FXM A; 2NS0 A; 1HKQ A; 5GTI C; 1KU7 A; 5D8L B; 2DOE A; 1QVT A; 3OL4 A; 1BIB A; 3BRO A; 3W3C A; 4XQF A; 5L3B A; 3I58 A; 3K4B A; 3OYK A; 4FET A; 2RV8 A; 4RAF A; 3HGY A; 1I27 A; 3IH2 A; 1OPC A; 2KHM A; 1VI0 A; 5GAD J; 5GPC A; 3S3O A; 1MBH A; 2JTV A; 1XX5 A; 3AAF A; 3RYP A; 1YOV B; 1W7P D; 1Z9C A; 4ZZL A; 2NS8 A; 3OIO A; 4LB5 A; 2BZT A; 3QYB A; 2QA4 I; 5B1A H; 5DM6 F; 1FTZ A; 1YRN A; 2DAO A; 3H0G J; 3HOZ J; 3MZY A; 2IT0 A; 4A5M A; 2BY2 A; 1QHG A; 1X2N A; 2FU4 A; 2F5C A; 4ZYH A; 5IT3 A; 1FBU A; 4FE4 A; 4J00 A; 1V5G A; 2IBD A; 1U5T B; 3BT9 A; 3KZZ A; 5GAE J; 4L9J A; 3LOC A; 4NQW B; 5JFR A; 1PUE E; 4MGR A; 1ZG5 A; 2R5Z A; 1T2K A; 2IEK A; 4CZZ A; 1V5F A; 3G1L A; 3OYI A; 4A6E A; 4BDY A; 1UEL B; 3MMY B; 1MZB A; 2QYO A; 4XLF A; 1PJR A; 3BG7 A; 1WKM A; 1U9N A; 4HLY A; 5IY5 H; 1FWZ A; 2ZJQ F; 2XAH A; 4CDG A; 3LST A; 4IZZ A; 2Q2E A; 5GTH C; 4QLC U; 4IHV A; 3GTQ J; 1B4A A; 4UB8 C; 2ECB A; 3L7W A; 4UVA A; 3IKT A; 3GBG A; 3QPS A; 1XC5 A; 3TW7 A; 3T8R A; 1P7I A; 5IP9 J; 1Z6R A; 4B44 A; 2H6C A; 4PJM A; 1QHH D; 1KU3 A; 3LL7 A; 4PGH A; 3WU0 A; 2ZC2 A; 3ECO A; 5EGO A; 1XMX A; 3G1M A; 2KLO A; 1R00 A; 2OQG A; 4S0H B; 3P7N A; 1GT0 C; 2P81 A; 1G3S A; 3I5U A; 2W25 A; 3OYA A; 2JA2 A; 3HOX J; 2X4H A; 4BJ6 C; 2X1C A; 2R92 J; 4XNF A; 4BHP A; 5HLH A; 2JVH A; 1W0T A; 3J7A O; 2VKV A; 3N4M A; 5E3L A; 1HA8 A; 2V6E A; 5CVV A; 2RAE A; 4IHX A; 2E71 A; 2HVS A; 1FIA A; 2XSD C; 2BVM A; 2LF8 A; 3E3V A; 2GXB A; 1DPR A; 2MLG A; 2BY3 A; 1K78 A; 4C9Y A; 3BTJ A; 3WHC A; 2OTJ I; 4PCQ A; 3H0D A; 2OD5 A; 4HAM A; 1Y8Q B; 2VOD A; 1ORK A; 3CO7 C; 1P92 A; 4N9H A; 2Z3Y A; 3PIP F; 4CCN A; 2CV0 A; 4I7H A; 2OAZ A; 4QSH A; 4BH9 A; 4II3 A; 4Y17 A; 4XKV A; 3HM5 A; 3CC7 I; 3GEZ A; 3H5R A; 5L3C A; 4U0Y A; 3E5U A; 4BS9 A; 2LD5 A; 2KIU A; 4F93 B; 1D8K A; 1XMA A; 4UY8 I; 1F43 A; 1K78 B; 4HYE A; 1SD5 A; 4LB6 B; 2QEX I; 3C7J A; 3GTM J; 4XID A; 2D2W A; 3A0B C; 3FXQ A; 5ERI A; 2WTE A; 2QQA A; 4TV7 A; 1HXD A; 2VJ5 A; 2UXX A; 4HV5 A; 4JYK A; 1LB2 A; 4BHC A; 3W6J B; 2W48 A; 4BUP A; 3S2D J; 2EIK H; 3RKW A; 2QF7 A; 4C2T A; 1TNS A; 2BGC A; 2AHQ A; 4ZTJ A; 2D5V A; 2QLZ A; 1FMV A; 1YX5 A; 5GAH J; 2NNN A; 1X1D A; 1ON1 A; 5FRO A; 4F92 B; 3FZV A; 3EET A; 3HIF A; 1PYV A; 3ABM H; 3DLA A; 1TZL A; 3OOP A; 2G7U A; 1BW6 A; 3PSF A; 4KJZ A; 3CMM A; 3ZN0 A; 4HG2 A; 2R7T A; 3ASN H; 1IDZ A; 1R5H A; 2VQH A; 2YR2 A; 3K4M A; 2ZO4 A; 2GA2 A; 3VOE A; 3OMY A; 3GWZ A; 2R7Q A; 3OYG A; 2CW7 A; 5BPD A; 1R71 A; 4BAC A; 4FX0 A; 2NXN B; 4BQN A; 5TJJ A; 3FXK A; 4LG0 A; 3OSG A; 3W6K B; 2XAS A; 2XIG A; 2M7A A; 4YII A; 1APL C; 3MWM A; 2O3F A; 4BGD A; 3RPU D; 1RC9 A; 4PGG A; 5CVR A; 5CJ9 A; 2J5O A; 3PFY A; 4BAY A; 3VSL A; 3HTS B; 1K83 J; 4HDU A; 2QEN A; 4ZYD A; 4L5I A; 3DQV C; 4KA4 A; 2ID3 A; 2LDU A; 4HZF A; 4A3F J; 1NH3 A; 4JOM A; 5E8I A; 1Y39 A; 1B9M A; 3HPG A; 2D1H A; 1OIS A; 1JXS A; 1ETY A; 2Y9Y A; 3T5X A; 3HOU J; 2VBX A; 2LG4 A; 2VJI A; 2LKP A; 3CMY A; 4XKB A; 2LBF B; 1KQ0 A; 1VQ8 I; 2VBY A; 4AVP A; 4MEY F; 1P4W A; 3PUB A; 3JTG A; 4UXN A; 2QZ8 A; 4II2 A; 3JAM Z; 1U8R A; 5C3E J; 2NVT J; 2EIJ H; 1I3Q J; 3HB9 A; 1RKW A; 2DOF A; 2LKS A; 4NB5 A; 2YU9 J; 3KLN A; 3HOT A; 1TT5 B; 2YUS A; 2WAQ N; 2DFH A; 2XV4 S; 3G3Z A; 5D5V B; 3I4N J; 3S32 A; 5FRN A; 2ICW G; 5D4R A; 5FKL A; 2VKD A; 1MDM A; 2IXS A; 4XN0 A; 1GHC A; 1DPU A; 3NWS A; 1LJ9 A; 1XDS A; 2ZJ2 A; 2EV5 A; 3LSR A; 2L02 A; 4IRI A; 5E3N A; 1TP4 A; 2P6S A; 2C6Y A; 2KDO A; 2K9L A; 4FT8 A; 3IC7 A; 2FML A; 2JRT A; 2DT7 B; 1SFO J; 1QNT A; 3E5X A; 1R23 A; 2XRO A; 3P9K A; 4RLF A; 4P9F A; 2NVQ J; 2WB1 A; 1ZR4 A; 2HEO A; 1UHW A; 3AG4 H; 4XLA A; 2Z1D A; 1RIO H; 1QZE A; 1FNN A; 2RGV A; 4HNT A; 2HDD A; 2WC2 A; 4A0X A; 5HS9 A; 2PG4 A; 2PMZ N; 2A68 F; 5FRM A; 2AQE A; 2E60 A; 2Y2Z A; 3F8F A; 4B1R A; 2DT6 A; 1TWF J; 3K0L A; 2VLA A; 3ZQC A; 1IN8 A; 2V1X A; 2YSR A; 2CG4 A; 1LE8 B; 4BL0 B; 2WV1 A; 4ETS A; 1UFM A; 3IV5 A; 1OCT C; 2CO5 A; 3R61 A; 4WXH A; 2PMU A; 3K2A A; 2VT2 A; 3M8E A; 2H94 A; 2QSH X; 1AA7 A; 2IS6 A; 4JQF A; 4I0A A; 3BP8 A; 1IC8 A; 3PO2 J; 1BM9 A; 4KIS A; 2ZCW A; 3DCF A; 4OAZ A; 3HG9 A; 2KRF A; 3KZI C; 1R36 A; 4IQ4 A; 1T0F C; 3LFU A; 1MBF A; 3GO5 A; 2M8G X; 1TQI A; 2L9S A; 2OZ6 A; 4EQQ A; 4LFU A; 1IO2 A; 4AUX A; 3ZMT A; 4G6D A; 3Q5F A; 3SZP A; 3J7Z I; 4XIC A; 4IKF A; 1O7F A; 2P5L C; 3I64 A; 4OIQ F; 3QQA A; 3GTG J; 1Z6T A; 1V4R A; 2DFI A; 2GIZ A; 2HPM A; 4EGZ A; 3S14 J; 2VC1 A; 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1D5Y A; 4HW0 A; 1FEX A; 3LA2 A; 2COB A; 1ZGW A; 1SD6 A; 2FBK A; 4NNJ A; 4HQE A; 1IV6 A; 1W4M A; 3Q9V A; 1VF9 A; 1O3R A; 1P4A A; 1YYV A; 1AHD P; 1HW2 A; 1UJ8 A; 4M6X A; 2DA2 A; 1IAW A; 4DYR A; 3FM5 A; 2A69 F; 2XGD A; 3S2H J; 3K6G A; 4DGW B; 2L2O A; 1B1B A; 2BXY A; 3J80 Z; 2E2H J; 4E7I A; 1TL8 A; 2B7E A; 2HPI A; 2GIV A; 2BHZ A; 4RAZ A; 1KYZ A; 2MAB A; 1GVJ A; 2M2E A; 4CCO A; 3GTK J; 2HFH A; 5J8C A; 3KP3 A; 3A02 A; 5E18 F; 2DT5 A; 2ESH A; 4MHG A; 3ASO H; 3HYI A; 5JI6 A; 3BR5 A; 4G9Y A; 3V4G A; 2G9W A; 3CP8 A; 1QA6 A; 1WVR A; 3KE2 A; 4U0V A; 1KON A; 3SFZ A; 4XON A; 2DDB A; 1QZY A; 4N0B A; 4IRG A; 1IN5 A; 2QUF A; 1OCR H; 2ZNZ A; 3PQJ A; 2V1U A; 1I6H J; 4IHS A; 5DV5 A; 2DPD A; 1S7O A; 4RAG A; 4EV0 A; 1CF7 A; 3BCB A; 2Y48 A; 1X3U A; 3IRQ A; 1OKR A; 4UV9 A; 4HF1 A; 4LG3 A; 1ZH5 A; 4I2O A; 1H88 C; 1A6I A; 4I99 C; 4EJT A; 1Z05 A; 1KQ8 A; 5J4Y A; 1MBE A; 2HOA A; 5CLS A; 1NG7 A; 2VE8 A; 1U6G A; 2H1L A; 4L18 B; 3RZO J; 1Q1V A; 3ZQI A; 2FA5 A; 1UST A; 2KP6 A; 1S29 A; 1WCM J; 2RRE A; 1F9N A; 4ESB A; 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