The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
66
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structure length |
66
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Chain Sequence |
MGLKWTDSREIGEALYDAYPDLDPKTVRFTDMHQWICDLEDFDDDPQASNEKILEAILLVWLDEAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Iron binding protein
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| source organism |
Escherichia coli
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| publication title |
YfhJ, a molecular adaptor in iron-sulfur cluster formation or a frataxin-like protein?
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PROTEIN ISCX
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| total genus |
18
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| structure length |
66
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| sequence length |
66
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-08-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF04384 | Fe-S_assembly | Iron-sulphur cluster assembly |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | IscX-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2BZT A; 1UJ8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3BDD A; 2XV4 S; 1KYZ A; 4L5E A; 1SFK A; 1TWA J; 2ZJ2 A; 3CJR B; 2PN6 A; 1MBJ A; 4KUM A; 1U0J A; 3I53 A; 2DOD A; 2YU9 J; 3ECH A; 3FDY A; 1HKT A; 2QEX I; 1YQA A; 4F3Q A; 3GTK J; 5EF6 A; 2R7Q A; 2LRD A; 1PUF A; 5DUK A; 3HRT A; 1WZ2 A; 3VWB A; 3K0L A; 1A6Q A; 1N77 A; 5ERI A; 2JPC A; 3CUQ C; 3DKY A; 3GW2 A; 3P9I A; 5E1W A; 2XVC A; 3BOQ A; 4NC6 A; 4AID A; 4A0X A; 5D8K B; 4C30 A; 2CV0 A; 4FX0 A; 1SC7 A; 2M5W A; 1P9Q C; 2O9L A; 1AU7 A; 2EBI A; 1Y8R B; 2EIL H; 1EH8 A; 1LJ9 A; 4YIR X; 2R7W A; 1S9H A; 2BY0 A; 1O57 A; 2K3P A; 4XLN F; 1HOM A; 1ETW A; 4AVP A; 1BBY A; 4XID A; 4RMN A; 4XK4 A; 2FQ3 A; 4XN3 A; 2VPR A; 3HSR A; 1V5G A; 3HHG A; 4XR6 A; 1OMI A; 2L2O A; 4ETS A; 4IRH A; 2MH9 A; 2HTJ A; 1GXP A; 3FXJ A; 4D5F A; 3TW6 A; 2EFN A; 2WA0 A; 1P4W A; 4I02 A; 3RZD J; 3ZMT A; 5D6F A; 2GOX B; 2MLK A; 4C3I J; 3L2R A; 1P2F A; 1Z67 A; 2IA2 A; 3BLY A; 3HL2 A; 3LQR A; 4RGS A; 4Y15 A; 3ZQC A; 1L3L A; 3HB9 A; 4KMF A; 2VC1 A; 2WV0 A; 3ESW B; 2JRT A; 5FLX Z; 4UV8 A; 2LDU A; 4IVN A; 3GZ6 A; 4M73 A; 3BG5 A; 3LWF A; 4FQG A; 1E2X A; 1QPM A; 2DA3 A; 3HPH A; 4OWR B; 5JVT A; 3CCU I; 2HQR A; 3S32 A; 2X51 A; 3VEP A; 5GPA A; 3RSN A; 1IO2 A; 2IGO A; 2D5V A; 2XRO A; 4NHJ A; 3S16 J; 3U2R A; 3OYL A; 1JXS A; 5HNF A; 3C2G A; 3HOT A; 4JP0 A; 1FTT A; 4EGY A; 1HA8 A; 3IC7 A; 2Z9O A; 1WGX A; 3WTV C; 1Z0X A; 2HZD A; 3EUA A; 2Z16 A; 3BQZ A; 3BG6 A; 1R6R A; 4QIW N; 4QSH A; 1T08 B; 2EK5 A; 3RTR A; 3KET A; 2JA8 J; 1R1V A; 1JTX A; 1T8I A; 3E97 A; 2E1O A; 1IDZ A; 3QU3 A; 2ELK A; 4EJO A; 2ZFW A; 2BHZ A; 2KJB A; 2PFB A; 2L9V A; 2HPM A; 3VYT B; 1HW2 A; 4ZZD A; 4ZZL A; 1OCO H; 2OC6 A; 3S3O A; 1B72 A; 2F5D A; 4FX4 A; 2HQ5 A; 3SYT A; 2XPV A; 1U8B A; 5ILS A; 2OJE D; 3BG3 A; 1BW6 A; 3RPQ A; 4ZDO A; 3OYJ A; 1X4P A; 2ZBK A; 3RDI A; 4KIF A; 4MQ9 F; 1GDT A; 3F22 A; 3J80 K; 4LMY A; 2Y69 H; 1LFB A; 3Q9V A; 3RCO A; 4MEY F; 4I2O A; 4II2 A; 2LF7 A; 2XAG A; 2Y75 A; 1ZRD A; 1XCV A; 4BY7 J; 1Y8Q B; 1MNM C; 4RAZ A; 4AIJ A; 2L9R A; 3EUH A; 2RV8 A; 4IL6 C; 3H9Q A; 2EFP A; 1IN8 A; 1H9G A; 3WE2 A; 2V6E A; 4M6X A; 2ZC2 A; 2VKV A; 4E7J A; 3FK6 A; 3I59 A; 2X48 A; 3PJR A; 4HOB A; 3E6C C; 3EYI A; 1RET A; 3J7A O; 1QQI A; 4J01 A; 3I4P A; 1TBX A; 1ETV A; 5HLI A; 3WU1 B; 4CH7 A; 4U7D A; 1FLI A; 2LKS A; 1GV5 A; 2FF4 A; 1R5I D; 1IRZ A; 3GCM A; 5IYC J; 2XAJ A; 3HOY J; 3ERM A; 3JAM K; 1YO5 C; 3ZXS A; 1A04 A; 4BDY A; 5F0C A; 1FC3 A; 3ZN1 A; 3IH2 A; 4CYC B; 5DYM A; 1PDN C; 1R4M B; 2KP6 A; 1MKM A; 3CP2 A; 4IHX A; 1WHU A; 5EEH A; 3N05 A; 5B5E C; 3IL2 A; 2BGC A; 2FNP A; 3Q9S A; 1PUF B; 3DLA A; 1G3S A; 4BJ6 C; 4OAZ A; 4NUB A; 2R7O A; 4BKX A; 1S29 A; 4F52 A; 2YS9 A; 3FWE A; 4KA4 A; 3PSF A; 5KCM A; 1OPC A; 1R23 A; 3C1D A; 2G0E A; 3JSO A; 1R71 A; 3BR6 A; 4JBA A; 2ACJ A; 1YIO A; 3D1N I; 5LRS A; 5L3E A; 4MNU A; 1OYW A; 4XRM A; 2XF7 A; 2COB A; 2IVM A; 1MGT A; 2Y2Z A; 1MNE A; 4QWQ A; 3U21 A; 2X6W A; 4O5V A; 5J4V A; 1LQ1 A; 2D45 A; 4JYK A; 1D5Y A; 3CCM I; 3V8L A; 1LEA A; 1LE8 B; 2ZSH B; 2AQF A; 4E70 A; 4KIG A; 2JT1 A; 1RZ4 A; 2PQ8 A; 1XSD A; 3M4O J; 2R7T A; 1LDJ A; 1TNT A; 2A6H F; 4U0V A; 4L9N A; 1HQC A; 2L5Q A; 2CQN A; 2K9L A; 2BY3 A; 2F5E A; 2F4O B; 5LFA A; 1HDD C; 1P4X A; 2ADU A; 2L9N A; 2RGV A; 4BDZ A; 1SEU A; 3ML6 A; 5K5R A; 3HPG A; 2CFO A; 3T1B A; 2W57 A; 3I71 A; 3WGH A; 3H0D A; 2NVY J; 1DGR M; 3ONQ A; 4BHC A; 1ZH5 A; 3UKG A; 2V7F A; 2DFI A; 1Y1V J; 2YR2 A; 3CMM A; 2EFW A; 1Y39 A; 5L3F A; 1OCZ H; 3CJT B; 4F55 A; 2DXI A; 3GUD A; 3ABU A; 2K4B A; 3DEU A; 2DA2 A; 5CVR A; 4D1Q A; 1HC8 A; 2H09 A; 4BXU A; 1R4N B; 2Z33 A; 5M5X J; 1FBU A; 4LD5 A; 3L2V A; 3H0G J; 3TMO A; 4BE0 A; 1GT0 C; 4RGX A; 2UXX A; 1LDD A; 3KCC A; 2LBF B; 4ANJ A; 4IRG A; 1W36 C; 4CCK A; 4XL9 A; 5CJ9 A; 1R1T A; 5BOX A; 2D1H A; 1Y0N A; 4JX4 A; 1JE8 A; 3RZO J; 2EZH A; 3O3K A; 4Y3O A; 5KAI C; 3MKW B; 1WRJ A; 4Q47 A; 3VOE A; 4L9T A; 4BQA A; 3BR0 A; 1YX3 A; 5GTI C; 3TOB A; 1EH7 A; 2NRA C; 5JHU A; 5EZH A; 2FE3 A; 2ID6 A; 1TNS A; 3CLO A; 2JJ7 A; 2A6T A; 2GAU A; 2DFE A; 4X0G A; 2X1D A; 4IHT A; 5HLG A; 4U88 A; 5EGO B; 1JT6 A; 2ETH A; 1MZB A; 3M8J A; 1ZR2 A; 3M1E A; 3M7G A; 4RLF A; 2GBY A; 2R5Y A; 1ZGJ A; 1V54 H; 3BWG A; 4I01 A; 4AYB A; 2EH3 A; 3R6S A; 3TO9 A; 1J9I A; 2DA1 A; 5H6R A; 1F43 A; 2VQH A; 3BPX A; 3DBH B; 4IOC F; 3WGG A; 3REO A; 3ZMD A; 3CDL A; 2DJN A; 2DOA A; 4RS8 A; 2TRT A; 1FP1 D; 2HOE A; 1MJ9 A; 3B73 A; 2COM A; 4IX7 A; 1IC8 A; 1BI3 A; 5F64 A; 2VN2 A; 3FIW A; 1JHF A; 4YII A; 2HYJ A; 2M45 A; 4OIO F; 1J2X A; 1S3J A; 1UG2 A; 4A69 C; 1UST A; 2JN6 A; 4FET A; 3EET A; 1JGS A; 2HXO A; 4A3F J; 1RNL A; 3EUH C; 2QVO A; 1X3Z B; 2O5R A; 3D5L A; 2VBW A; 3QP6 A; 1ZEL A; 2ID3 A; 5K5O A; 5ICF A; 2N8G A; 5EEG A; 4NNJ A; 4D0P A; 2IRF G; 3JSP A; 2JTV A; 2M4G A; 3DTK A; 4IXA A; 3ZQF A; 1GHC A; 2CSO A; 4G8X A; 2M7B A; 1K78 A; 3PL8 A; 4JQF A; 3HKZ A; 4M6V A; 5E3L A; 1VQ9 I; 4GDF A; 2EV5 A; 1VZ0 A; 3L2W A; 4J19 A; 2KRH A; 2H8R A; 1SD6 A; 2VKD A; 4ZYH A; 1V4R A; 2R7Z J; 3S1Q J; 1U8R A; 5LHG A; 1ZG5 A; 5B66 C; 4FTH A; 4M9Z A; 3CCR I; 3WTT C; 2PJR B; 3B02 A; 3M3Y J; 4ENJ A; 3G6E I; 3BTI A; 4BE1 A; 4YIF A; 3K4M A; 4R8H A; 4UB8 C; 1CGP A; 3G3Z A; 4BBR J; 1XC5 A; 2AHQ A; 3JCU C; 3SJM A; 1U2W A; 2L9S A; 3ZQQ A; 2A07 F; 1WVR A; 4AYB N; 4HLY A; 3O8H A; 4P96 A; 4AD9 A; 2A5Y B; 4BQQ A; 2OTJ I; 2M0M A; 1QZE A; 2K02 A; 1FBQ A; 4B3A A; 4NQW A; 1FYM A; 4ZTJ A; 1RRJ A; 3A0B C; 4Y33 A; 1TC3 C; 1TWH J; 5CVJ A; 4UB6 C; 4YEJ A; 2DQR A; 1TT5 B; 3JTH A; 1BI2 A; 4HQM A; 5EG0 B; 4CCL A; 4Z2Y A; 1Z3Y A; 1T2K A; 2KZV A; 1DUX C; 2E5Z A; 5H2F C; 4RB3 C; 4LLL A; 5CQG A; 2QBY A; 3DEE A; 2R5Z A; 1YFH A; 1MJA A; 4LK0 F; 3R4K A; 2KPM A; 3BR3 A; 3K6G A; 2HOT A; 2E1M B; 3O2P E; 5IP6 A; 4HX8 A; 2X85 A; 4A6E A; 5GAE J; 2FMY A; 3A2K A; 1MBF A; 3M8E A; 3BJO A; 3DTE A; 3TP0 A; 1R49 A; 2CH0 A; 3OS0 A; 3CJN A; 2IPQ X; 3HKZ N; 2EFQ A; 2KIM A; 1ETQ A; 4XIC A; 2E19 A; 1SAN A; 2W24 A; 5HDG A; 3HUG B; 3L1P A; 2ZJQ F; 2GM4 A; 2X6O A; 3H36 A; 3GYH X; 1D8J A; 4MQV A; 4BAC A; 2K5C A; 4V2G A; 3HXL A; 4CO8 A; 3S3M A; 2HPI A; 2EB7 A; 4BH9 A; 2V4J C; 2X9D A; 2BVM A; 3PUB A; 3BPV A; 1FX7 A; 4BQO A; 3OYE A; 4WXD A; 3IKT A; 1R00 A; 5EYR A; 1U5T A; 1WH7 A; 3RYP A; 4PDK A; 4I0A A; 5HS8 A; 5KAF C; 1MBG A; 1W5S A; 1LUJ B; 5E8I A; 1FT9 A; 2WY8 Q; 1MMD A; 3J80 Z; 2DK8 A; 2VOO A; 2BVL A; 2LY1 A; 2OQR A; 4G7O F; 2M0C A; 5D5V B; 2G7U A; 2X4H A; 2V1N A; 2VJI A; 1U78 A; 2ZCW A; 4HEA 2; 1CF7 B; 1B59 A; 1E17 A; 4Y4R A; 3KFW X; 2VON A; 3S1N J; 1NTC A; 3KEY A; 1YTY A; 2E34 A; 3P9K A; 2ZFU A; 1IF1 A; 1YW9 A; 2M7A A; 4N4N B; 2NS7 A; 2IGK A; 4AIK A; 4EJT A; 1T95 A; 3CES A; 3KEQ A; 1Y56 A; 4FT8 A; 4CA0 A; 1JKQ C; 3HSF A; 1H88 C; 1IV8 A; 3NAU A; 1YIJ I; 2L4M A; 4NBQ A; 3RPU D; 5K7F A; 1FPQ A; 1V5F A; 1HXD A; 2NAZ A; 1N78 A; 2VIX A; 2K85 A; 4ENN A; 2BY1 A; 2CUJ A; 2MFZ A; 1YJW I; 4KYW A; 2IW5 A; 3JAM Z; 4BHP A; 4RAF A; 3CCL I; 5FD5 A; 4W1U A; 4Y7N J; 1UMQ A; 5ILV A; 5J4Y A; 1ZGA A; 4CHU A; 1MND A; 3A03 A; 4PSW A; 3BY6 A; 1XDS A; 1USS A; 1XGN A; 1DGW Y; 3GTO J; 3GZN B; 3SZP A; 2RRE A; 3NWT A; 1I1S A; 3CF2 A; 2R7D A; 3FX3 A; 2X0L A; 4HNT A; 3W6K B; 3DEW A; 3BZ6 A; 1VQP I; 1J75 A; 4OIR F; 5JHF A; 1ZHF A; 4I76 A; 3ROU A; 4FHT A; 4M6Y A; 1FYK A; 2MG4 A; 2X1C A; 4C2M J; 4WCG A; 4XKW A; 3Q5F A; 3CCE I; 1QRY A; 3A01 B; 2OQG A; 2V26 A; 3ABL H; 2K86 A; 4MFE A; 2A3S A; 1H0M A; 1GVD A; 1FY7 A; 5KK1 A; 5DTD A; 5LLQ A; 4HAM A; 2Y48 A; 5FO5 A; 5IP9 J; 3OS1 A; 1VQM I; 2W82 A; 1G3T A; 2HYG D; 1X3U A; 2B0L A; 2CUF A; 3HIF A; 2OZU A; 3WTX C; 4XMY A; 2VBY A; 1OQY A; 3KLN A; 3KP6 A; 3U1D A; 4GYI A; 2QSH X; 2DO7 A; 1J7K A; 3MKL A; 4HPQ A; 3FM3 A; 3NQO A; 2MSY A; 3BZC A; 5L3D A; 2ZJP F; 3I0T A; 3DKW A; 3MEX A; 3ZQH A; 5DM6 F; 4PGH A; 4B3X A; 2M87 A; 2PX9 A; 2ME6 A; 1MH4 A; 3ZPL A; 1FMW A; 2CV1 A; 4PJM A; 4PGG A; 1X19 A; 1U6G A; 4AIH A; 3G73 A; 1FWZ A; 2BW3 B; 3DP7 A; 4I98 B; 3ASN H; 2LYC A; 1K83 J; 2ZNZ A; 2KRC A; 2RQQ A; 3B6C A; 2JSC A; 4GO1 A; 1KU2 A; 4DJA A; 1R9T J; 1AWC A; 2E2I J; 1FTZ A; 2TCT A; 5J3L A; 1QHG A; 4KN4 X; 4A3B J; 1RKW A; 1TQM A; 2BXZ A; 1W1W E; 5L3C A; 2PMZ A; 3HTS B; 2Z1D A; 1CQT A; 2HTS A; 2K40 A; 2JQ7 A; 3I55 I; 3HSE A; 2QUF A; 4BBS J; 2NS8 A; 2D2W A; 3L00 A; 3RKY A; 3TQN A; 3OL3 A; 1DP3 A; 2A6E F; 3S3N A; 3VSK A; 4UVB A; 1Z77 A; 3GX4 X; 1SD5 A; 1X1C A; 2XAH A; 3K69 A; 4WX9 A; 1FSH A; 4BJT A; 3KYC B; 4PUS A; 4ZYD A; 3VOD A; 4CYC A; 3BJA A; 4DZP A; 2VT2 A; 4M74 A; 3KP2 A; 3AL0 B; 4PCQ A; 5D4S A; 4QLC U; 1RUN A; 2JSP A; 1XB4 A; 2XF5 A; 2VQG A; 2EQR A; 3T0Y A; 1I39 A; 1U5T C; 3CLQ A; 2HOA A; 2P6T A; 2ESH A; 4ASN A; 1D1C A; 5KNL A; 3OYM A; 4E7Z A; 1U5T B; 3RIR A; 4A2U A; 1I5Z A; 2VJ5 A; 3CDH A; 4A3M J; 3CME I; 3VFZ A; 4KIT B; 3EDP A; 2WB1 A; 4L9V A; 2BXY A; 2NVT J; 4PJ0 C; 5IOZ A; 3C2B A; 2HKX A; 2I8D A; 4CIC A; 5IYB J; 1QU3 A; 1YW8 A; 2UUZ A; 3K4B A; 4GYG A; 2KZG A; 4E7I A; 1QZZ A; 5J1R A; 2QZ8 A; 2W7N A; 4A3I J; 3OOU A; 1BI0 A; 3GF2 A; 2KLO A; 3WTZ A; 3ZQL A; 2GXA A; 1B9N A; 4ABZ A; 1PVE A; 3TOA A; 4XLH A; 1ENH A; 1TZL A; 3BTL A; 5H20 A; 4CCN A; 3DFG A; 2AQE A; 3U9G A; 4YRV A; 5TRD A; 1D3Y A; 2KFD A; 3DPU A; 4B4C A; 1X3W B; 4MTD A; 5DUI A; 3IRQ A; 1LE8 A; 2PMZ N; 1OKR A; 2M3A A; 4WK8 F; 5K7Z A; 4U0Y A; 1YS7 A; 2E60 A; 1BI1 A; 4G7H F; 2DT6 A; 4Q4Z F; 3AG1 H; 4GCV A; 5E3M A; 3H1C A; 2MA3 A; 1W5C C; 2RN7 A; 1I6H J; 4H0E A; 1WJE A; 2FD5 A; 3PSI A; 4N0B A; 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