The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
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sequence length |
46
|
structure length |
46
|
Chain Sequence |
GKSPEEMYIQQKVRVLLMLRKMGSNLTASEEEFLRTYAGVVNSQLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Mechanism of phosphorylation-dependent binding of APC to beta-catenin and its role in beta-catenin degradation
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Beta-catenin
|
| molecule tags |
Cell adhesion/cell cycle
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
17
|
| structure length |
46
|
| sequence length |
46
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-04-07 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Beta-catenin-interacting ICAT |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1M1E B; 1T08 B; 1LUJ B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1ONV A; 2DFH A; 4XKB A; 4BAY A; 1XDU A; 2CG4 A; 3E0J B; 4E6K G; 1R58 A; 1FP1 D; 1PP7 U; 1T6S A; 4FAS D; 5C3E J; 4DGW B; 5GTH C; 3A2K A; 2R4G A; 1X2M A; 4BQN A; 4M3E A; 4BHB A; 3VWB A; 3O2P E; 4JYK A; 2IPQ X; 5F04 A; 5J1Y A; 4UXN A; 4DNC A; 2B9S A; 2DI3 A; 2WC2 A; 3M3Y J; 1N78 A; 3H9G A; 1IC8 A; 2PEX A; 4IF4 A; 2DDA A; 2XB0 X; 1ZHF A; 4LOC A; 2OCC H; 3OV8 A; 3RPQ A; 5E3L A; 3CCM I; 2RN7 A; 3K69 A; 4CSW A; 2A3S A; 2Y0S A; 1P4A A; 4KYW A; 3IP4 B; 3GFM A; 1KGS A; 2DA7 A; 3M1C A; 1Y8R B; 1ZLK A; 4IL6 C; 3D5L A; 1FWZ A; 3FHZ A; 2X1E A; 3G4S I; 1KYW A; 2BHZ A; 4XLP F; 1FBQ A; 2JRM A; 1GT0 C; 4A5N A; 4MIM A; 1TQI A; 3CDL A; 1QHH D; 2HPM A; 4Y52 J; 1V3F A; 5D6E A; 2L4M A; 3E6M A; 4XK4 A; 1X1P A; 2CO5 A; 1FY7 A; 2EZI A; 2G7H A; 2H09 A; 5D8K B; 4E7S A; 4LG3 A; 1W1W E; 3H5A A; 2VAS A; 2FOW A; 4LK1 F; 4XSZ F; 4LG0 B; 3C18 A; 1XSX A; 2XPV A; 3CES A; 3QPS A; 4HV6 A; 2W7N A; 2ID3 A; 4A69 C; 3I0T A; 3S1M J; 3CMA I; 3E6D A; 4L5I A; 3KLN A; 5BPI A; 4GDF A; 4I0A A; 4B1R A; 4X6A J; 2A5W A; 2XSJ C; 3D1N I; 2CJJ A; 2P4W A; 2ZFU A; 2CQN A; 3Q3S A; 1OKR A; 5B1A H; 5BPD A; 1RR8 C; 3MD2 A; 2ICW G; 4CYC A; 1JUP A; 3TGN A; 4YEJ A; 1OCO H; 4EJO A; 4HST A; 4E7I A; 3VYS B; 1F4K A; 3TDZ C; 2VL8 A; 1CGP A; 3T1B A; 2Q0O A; 2ESN A; 3QP6 A; 1YO5 C; 1PDN C; 4FCY A; 3C1D A; 2CSO A; 2P5K A; 3VYR B; 4M71 A; 5GAG J; 2G0E A; 1SEU A; 4QLC U; 5GAD J; 2L7M P; 5IT9 Z; 5LBQ A; 3FXL A; 4A0X A; 3U2R A; 2ZB9 A; 5LFA A; 5JLW A; 1DQU A; 1XSV A; 2M87 A; 1R49 A; 1P6R A; 1DDN A; 1VQ7 I; 2JVH A; 2X4H A; 2XDV A; 3ZN0 A; 3CCQ I; 1VQN I; 4DOZ A; 3CTA A; 3C3W A; 4KIF A; 2HU9 A; 2ISY A; 2LG4 A; 3CJQ B; 3EQL F; 4HQM A; 2HDD A; 5DUI A; 2AHQ A; 2GZW A; 1OJL A; 1QO0 D; 3IRQ A; 2VJJ A; 2PG4 A; 3QYB A; 1ETW A; 1BC7 C; 2P0W A; 3GYH X; 1HW2 A; 1WWX A; 4BU2 A; 2R5Z B; 2KRC A; 3QYF A; 4NHJ A; 5J8C A; 4IPA A; 2LNB A; 4BDY A; 2KRF A; 3GTK J; 4B3A A; 3TO9 A; 2ESH A; 5JVG F; 2YX4 A; 2OJE D; 5EEG A; 2BZT A; 2VPL A; 5IYC J; 3V8K A; 5F1J A; 1E3O C; 4JP0 A; 1I3A A; 2HWV A; 4G9Y A; 2JUC A; 2PBI A; 5IPA A; 3ZR8 X; 5LD2 C; 3H3Z A; 1IN5 A; 1TT5 B; 1ZR2 A; 1FJL A; 2JK3 A; 3VSK A; 1DPR A; 2XAQ A; 3OS1 A; 4I02 A; 5J6X A; 3F21 A; 4A12 A; 2BBY A; 3CO6 C; 2VT3 A; 3HG9 A; 1MDM A; 3DP7 A; 3VYT B; 5B66 C; 1WJC A; 3ZMT A; 3DXJ F; 2MD5 A; 3JAM Z; 2HQ5 A; 3JRF A; 3A4C A; 4OMY A; 2OA4 A; 5HS8 A; 2WAQ A; 1W0T A; 5E8G A; 4PFO A; 3BR3 A; 3K70 D; 5DV5 A; 5CPR B; 1UFM A; 1XGS A; 2FML A; 1MJB A; 3KYC B; 5JFR A; 2A05 A; 4XLE A; 3WGI A; 2OQG A; 1HKQ A; 2ZJQ F; 3RQ4 A; 2R7O A; 2BY0 A; 1MMD A; 1WH7 A; 4UVC A; 2Y31 A; 3F22 A; 1F1Z A; 4PJJ A; 2HZD A; 1J5Y A; 2UUZ A; 3L00 A; 4C3H J; 3OR2 C; 5FRM A; 2ZXI A; 1Y1W J; 1DGR M; 1IN7 A; 3J81 K; 3ZQQ A; 4RAF A; 3NEU A; 3QU3 A; 4DJA A; 3F8M A; 3R4K A; 3SFZ A; 5D4S A; 5K5Q A; 4HRI A; 2CRG A; 1MBK A; 4KN4 X; 3MCZ A; 1I39 A; 2LKX A; 1S9H A; 5E20 A; 5F64 A; 5FKK A; 1TL8 A; 1K79 A; 2DA2 A; 3HPG A; 2O6G E; 4S0H B; 4KUM A; 4RAY A; 3BR5 A; 3GTQ J; 3OWT A; 4PGG A; 1R1V A; 5TJJ A; 2MSY A; 1MND A; 4BQQ A; 1R5H A; 4FE7 A; 1YRN A; 1S7O A; 1LDJ A; 3IUO A; 3AG3 H; 2E1N A; 3SHF A; 4QTR A; 2MFZ A; 4P1W A; 2XPU A; 3DEU A; 3S16 J; 5DD8 A; 1LB2 A; 4BHP A; 1LFU P; 1X1A A; 5LRS A; 3OYN A; 3WHC A; 2DMT A; 2TDX A; 3IWZ A; 1ON2 A; 2ZFW A; 1MMS A; 2DTR A; 1G3W A; 5C44 J; 2XSD C; 1U8R A; 2LVS A; 3E5U A; 4AWX B; 1WVR A; 1N77 A; 3DPU A; 3M8E A; 2QKL B; 4G94 A; 1R4M B; 4MTD A; 2CUJ A; 2HXI A; 1SMT A; 1LDD A; 3I59 B; 2OQR A; 2HR3 A; 1B1B A; 4LLG F; 1DP3 A; 1YJ9 I; 2R7S A; 2IS1 A; 2KMU A; 4XRS A; 4KIS A; 3HSE A; 3QOP A; 4BL0 B; 3H5N A; 3BC8 A; 1XB4 A; 1UMQ A; 3HSR A; 4N0B A; 4JK1 X; 3FXK A; 1GHC A; 2ME6 A; 3U9G A; 3FHN A; 4CCL A; 5DCM B; 3L2R A; 2WBM A; 2PMZ N; 1YW9 A; 4HNU A; 4F91 B; 2OZ6 A; 2XAU A; 3NQO A; 3G71 I; 3ZOB A; 2EB7 A; 4LG0 A; 1FNN A; 4D1Q A; 2Y48 A; 3VPR A; 3PO2 J; 1E2X A; 2EV5 A; 2XRO A; 1G8X A; 2MC3 A; 3GTP J; 3OYJ A; 1TTY A; 3SYT A; 2LRD A; 3KFW X; 5KAI C; 4BE2 A; 9ANT A; 4D7M A; 3RIR A; 3FK6 A; 4XKV A; 1YIT I; 3BT9 A; 4XN0 A; 1ODD A; 5H6R A; 3OYK A; 1OQY A; 1HLV A; 4AU7 A; 3IWF A; 2KKO A; 3D5S C; 4FX0 A; 4CGZ A; 1I3Q J; 3A02 A; 2VKE A; 5FLV A; 2TCT A; 3V42 A; 2Y30 A; 1TNS A; 1F36 A; 1FP2 A; 2CUF A; 3PJR A; 1Z77 A; 2NAZ A; 1ULY A; 3W6K B; 4B43 A; 1OCR H; 5ICE A; 4DBR A; 3S8P A; 3B6C A; 5IOY A; 2GOX B; 3VFZ A; 3H3U A; 4CA0 A; 1O3R A; 1NK2 P; 4XIC A; 1HST A; 3KYL A; 1RZ4 A; 2OF7 A; 2L2O A; 3MKW B; 4UVB A; 5J8F A; 4DBQ A; 3CP2 A; 1V5E A; 2IS4 A; 3SDG A; 3HOV J; 2K5C A; 3LSI A; 5K1Y A; 4UUV A; 2R7X A; 2DQR A; 4FT8 A; 4OIO F; 1QZY A; 2VON A; 3SQN A; 2VQG A; 5GPC A; 1YJW I; 3CF5 F; 1D8K A; 3SEZ A; 5HDN A; 2QSH X; 4UNO A; 1O7L A; 1MNE A; 4EQQ A; 4E7K A; 5AON A; 4LB5 A; 3OIQ A; 1YQA A; 2UV1 A; 1ETY A; 3MVP A; 3ERE D; 1YS7 A; 3E5X A; 2R5Z A; 3ZQI A; 3ZP5 A; 2VLA A; 2H8R A; 2JA7 J; 1D5V A; 3BDD A; 1H9T A; 1FPQ A; 5CKT A; 5J1R A; 1MKM A; 2L7K A; 2V1X A; 5FLX Z; 3W6J B; 1Z05 A; 2QUF A; 2VE9 A; 1X4O A; 2MA3 A; 5LGN A; 4HQE A; 5CVU A; 3TKY A; 4G12 A; 1XGO A; 2E35 A; 2L54 A; 1BOA A; 2HOT A; 4HLY A; 3H36 A; 2E2H J; 3JRE A; 3K9T A; 2JMW A; 4PK4 A; 2EWN A; 4G7H F; 4KDP A; 3DU6 A; 2TRT A; 2VJ4 A; 2ELK A; 2CQX A; 4HF0 A; 1IF1 A; 4XQF A; 2E19 A; 2WWY A; 1X4P A; 5B3S H; 3OYC A; 3B6A A; 2Y75 A; 4A3C J; 4HX7 A; 2CW7 A; 3BJO A; 4RGS A; 1MMN A; 4PZJ A; 2AXT C; 3OYB A; 5K7F A; 5A2Q Z; 3HZJ A; 5BNG A; 3E1S A; 1U5T C; 4AM3 A; 3DKY A; 2JUG A; 3TMO A; 2H27 A; 3FXO A; 4PJM A; 5F1R A; 2IRF G; 4L5J A; 2LBF B; 3TO6 A; 2V1U A; 2NS7 A; 1FIP A; 3IC7 A; 1HBX G; 4II2 A; 3RDI A; 2OUM A; 3KEQ A; 4A3L J; 3J80 K; 2DA3 A; 4ZDL A; 2R93 J; 4A3J J; 2A69 F; 2W48 A; 2XAH A; 1V54 H; 1KU7 A; 5D5U B; 3KYD B; 3RKW A; 2XAJ A; 1WJE A; 3MKY B; 1W36 C; 4B47 A; 2FUG 2; 1BI3 A; 2B7E A; 5FRO A; 3BQZ A; 3I71 A; 4YG2 F; 1LQ1 A; 3CJT B; 1JJ8 C; 4HPQ A; 4D0P A; 4WK8 F; 3CCJ I; 2IGN A; 3VYU B; 4G7Z F; 4Z2Y A; 4LK0 F; 4M3D A; 5IT3 A; 2B0L A; 4KIB A; 2CW8 A; 4GCV A; 2ZSI B; 1R71 A; 1ZRE A; 1LEB A; 3PM1 A; 4AC0 A; 1FSH A; 3KP7 A; 3M8J A; 3OMY A; 1XSD A; 2D1H A; 2VBY A; 1IRF A; 2RRE A; 1ZAR A; 3OYG A; 1SAN A; 2Y2Z A; 3A03 A; 5FFZ A; 1JXS A; 1AHD P; 1RUO A; 2FRH A; 3CJN A; 4Y15 A; 2K9N A; 4E7Z A; 1X1D A; 6PAX A; 2E7X A; 3P9C A; 3GUD A; 3CF2 A; 4LLL A; 1K6O A; 3KP5 A; 2E34 A; 4PJ0 C; 4D5F A; 2L5Q A; 2D2W A; 1JHH A; 2M7B A; 3EUH A; 4ENJ A; 5CLS A; 2HGC A; 4A3F J; 2X51 A; 4CYD A; 4LIT A; 1SFX A; 4RLQ A; 2M2E A; 3ZMZ A; 4IRH A; 4YII A; 5DCM A; 1STZ A; 4NNJ A; 1RC9 A; 2J5P A; 3AL0 B; 3DTI A; 1BI2 A; 1ETV A; 2ELH A; 2PJR A; 1TC3 C; 4MQ9 F; 4WCG A; 3K10 A; 3FKI J; 4RAG A; 2CV2 A; 4CYC B; 2OD5 A; 4F55 A; 5DM7 F; 1Z9C A; 1K4S A; 3TP3 A; 1JKP C; 3GF2 A; 4BQA A; 2O5R A; 2XAS A; 1A6I A; 5KAF C; 3TL4 X; 5HLG A; 5E3M A; 2HYG D; 3PIO F; 1KA8 A; 3ML6 A; 2X6Y A; 2M30 A; 2YUS A; 4QWQ A; 1TWC J; 3DV8 A; 2E60 A; 1J7K A; 4PSX A; 1J2X A; 2PQ8 A; 1SFK A; 1I1S A; 2VB6 A; 2V6C A; 3E97 A; 4JX4 A; 2L7Z A; 3ZQ7 A; 4IHT A; 3LOC A; 4RGU A; 2XPW A; 1J59 A; 1WJD A; 3KP4 A; 5EEA A; 2DAO A; 1ETX A; 1A31 A; 3RKQ A; 3K1P A; 3SZT A; 3HBL A; 2KIQ A; 3I5U A; 2FQ4 A; 4A3B J; 1K78 A; 2YX7 A; 3CCU I; 1K6Y A; 2XF5 A; 2EA2 A; 4D9J A; 3BJ6 A; 2HTS A; 4M6Y A; 4DIQ A; 4EGZ A; 4IKF A; 4OU0 A; 4QIW N; 2DMQ A; 1MH4 A; 2L7F P; 3F9K A; 3RPU D; 2NNY A; 3HIF A; 4AUX A; 3NRV A; 1WJ5 A; 3N97 A; 2VBW A; 2P81 A; 3K2Z A; 5GAH J; 1IN4 A; 1BN5 A; 1XG1 A; 3VB2 A; 1ZK8 A; 2I10 A; 4AYB N; 2R7U A; 2MBF A; 1YLF A; 5K7Z A; 2QCO A; 1ZG1 A; 2F5C A; 2IA1 A; 3WTY C; 5GPA A; 2VKH A; 3FIS A; 4EM0 B; 2IS2 A; 2KHM A; 4YIR X; 2Q8K A; 2V26 A; 2H1K A; 1NTC A; 2VXZ A; 4MFD A; 4UV8 A; 1FSE A; 1W7P D; 3BTI A; 4N4N B; 3HRT A; 5IP7 J; 1VFC A; 4N9H A; 2BW3 A; 2O8X A; 1S3J A; 4MEY F; 1W5T A; 2QQB A; 1JTY A; 3GEZ A; 3GZ5 A; 3GZN B; 2O9L A; 3NAU A; 4EM2 A; 4JX6 A; 3PIP F; 2A68 F; 2L9V A; 2FX0 A; 2XF6 A; 2VPR A; 2DYS H; 4BXF A; 2FU4 A; 2ZC2 A; 3ABL H; 2R5Y A; 4FHT A; 1U6G A; 4ZDO A; 3EYY A; 2I8D A; 4DYQ A; 5L3D A; 3JW4 A; 3OYL A; 3CUQ C; 3H0G J; 2KIM A; 1BW5 A; 3BCB A; 4EJV A; 3IL2 A; 1WJA A; 2NRA C; 1RKT A; 3IHU A; 2EZL A; 4NQW A; 3ZQF A; 3MKL A; 1ETK A; 4ITV A; 4XOT A; 5IT9 K; 4ZYG A; 4RBO A; 2CV0 A; 1IV6 A; 3FXJ A; 2VC1 A; 3ZMD A; 4KJZ A; 5ED4 A; 5B5E C; 2D5V A; 3CDH A; 2JA5 J; 2STW A; 1FLI A; 2L0K A; 3DQV C; 4AVZ A; 5BQT A; 1AOY A; 2W00 A; 1P7J A; 2RC4 A; 4BXX J; 4FQG A; 5KK1 A; 2O0Y A; 4MO7 A; 4A3G J; 1WI9 A; 4RLF A; 2ECB A; 3HOT A; 1ITY A; 4J19 A; 1YRN B; 2R7F A; 1XCV A; 4EAT A; 1BJA A; 2WA0 A; 4A3D J; 1BR4 A; 3Q9S A; 5C4J J; 1MJA A; 1XGM A; 1E0E A; 1VF9 A; 1Q1H A; 1TZL A; 4YFN F; 3HC7 A; 1VQK I; 2ID6 A; 2W57 A; 2QQA A; 2XKO A; 3QP5 A; 4RS8 A; 1YE9 A; 4B09 A; 4E70 A; 1KQ8 A; 2P6T A; 1QGP A; 2JA6 J; 2VJI A; 2VUM J; 4MFE A; 1SD4 A; 1IXS B; 1FIA A; 3OSG A; 2GQQ A; 5EJC A; 3WGG A; 2OTL I; 3VOE A; 3ZRG A; 1R5I D; 4RM2 A; 1G4D A; 4L5E A; 3ZMV A; 2MC4 A; 3NWS A; 2FEZ A; 2BXY A; 1NHA A; 2DMP A; 2GOM A; 1OCP A; 1FBU A; 2VQH A; 4M73 A; 4UVA A; 1BL0 A; 2HXO A; 1J75 A; 4Q47 A; 4BY1 J; 4L9N A; 3L2Q A; 3F8C A; 2DU9 A; 5ICG A; 1AKH B; 3S2H J; 3OYI A; 2DFE A; 1B59 A; 3R61 A; 5EDN A; 1BI1 A; 5E1X A; 1V5G A; 2NOG A; 1CQT A; 4RM3 A; 3JAM K; 4BDZ A; 2GM4 A; 1TP4 A; 3LA3 A; 3WU2 C; 2ZBK A; 3WU1 B; 3ONQ A; 3WE3 A; 1GXQ A; 2B63 J; 2K02 A; 2HPI A; 3PFY A; 4C2U A; 4OAZ A; 1WI3 A; 4KA4 A; 4ON0 A; 2IS6 A; 1ZLJ A; 3O6B B; 1LDK B; 3BZC A; 2MG4 A; 3CC2 I; 5CYV A; 2V7F A; 5KCM A; 2IA0 A; 1ZGJ A; 3ZCO A; 5FFX A; 1MSE C; 3MZH A; 1G6N A; 1R1T A; 5E3O A; 4UB8 C; 1X1B A; 4BJ6 C; 4LD5 A; 5K5R A; 2NVX J; 5HS9 A; 2DPD A; 4A6E A; 1OPC A; 2DN0 A; 2FNP A; 3FM5 A; 1UCR A; 2W82 A; 3IH2 A; 2Z33 A; 1G3T A; 1G59 A; 1VQL I; 1EF4 A; 4AIK A; 2MW8 A; 1LPQ A; 4Q5S F; 2NOJ B; 2KL4 A; 3DBH B; 4CIC A; 2L3D A; 2E36 A; 3FMS A; 5LHG A; 3IAM 2; 3LQR A; 1VQM I; 4OIN F; 1R7J A; 3OYM A; 1VQ4 I; 2IW5 A; 3TDU C; 2JWT A; 5LHH A; 1DU6 A; 4AVP A; 2HVQ A; 2DJN A; 1U8B A; 2H6C A; 1X2N A; 3BG5 A; 3RKX A; 1WJB A; 2QLZ A; 3GLX A; 5EG0 B; 1E17 A; 3BG9 A; 2EFQ A; 4CZZ A; 2KJC A; 2K3P A; 2H94 A; 3DFG A; 4R1H A; 3LL7 A; 3K0L A; 3DCF A; 1LEA A; 5FD6 A; 1Z0X A; 1FTT A; 3G2B A; 1ZN2 A; 2JN6 A; 4HAM A; 1UHW A; 3H5R A; 3W6V A; 3EET A; 4N4O B; 1YX5 A; 1NG6 A; 2DFI A; 3F23 A; 2PI0 A; 4BQO A; 3C2G A; 2K7L A; 3WTS C; 2OCE A; 4ZZL A; 3ECO A; 1BC8 C; 1ON1 A; 5L3E A; 2CU7 A; 4C30 A; 3SFI A; 4UUS B; 3AKZ A; 2A6E F; 3MAJ A; 2Z16 A; 4M3F A; 2WV0 A; 3ZQL A; 3FKJ A; 4IXA A; 4PJN A; 1D0Y A; 3V4G A; 3BWG A; 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