The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
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sequence length |
46
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structure length |
46
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Chain Sequence |
GKSPEEMYIQQKVRVLLMLRKMGSNLTASEEEFLRTYAGVVNSQLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Cell adhesion/cell cycle
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| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Mechanism of phosphorylation-dependent binding of APC to beta-catenin and its role in beta-catenin degradation
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Beta-catenin
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| total genus |
17
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| structure length |
46
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| sequence length |
46
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-04-07 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Beta-catenin-interacting ICAT |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1M1E B; 1LUJ B; 1T08 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1SMT A; 3DEU A; 3M8F A; 3K2A A; 5DCM B; 3GLX A; 3MKZ A; 1DGR M; 3MZ8 A; 1ZTR A; 4NQW A; 3S8P A; 4KT6 A; 4IZZ A; 2Y0S A; 3IHU A; 3SZT A; 2NS0 A; 3NEU A; 1K79 A; 1FPQ A; 1B59 A; 4DJA A; 3WGH A; 4D5C A; 1LFP A; 4LGW A; 2K9M A; 3KP7 A; 1D1A A; 1LUJ B; 3TDU C; 4AYB N; 2W25 A; 2FOW A; 3JW4 A; 1YW7 A; 4IXA A; 5ILV A; 5D5V B; 1V3F A; 3WTW C; 1E2X A; 1ETK A; 1GDT A; 4HST A; 1KQ8 A; 3JRC A; 3A0B C; 4HZF A; 3Q9V A; 2CV0 A; 1T33 A; 2CU7 A; 1OIS A; 2K3F A; 2ISZ A; 3HSF A; 4ENM A; 3BR5 A; 3OSF A; 2LYC A; 1ON1 A; 5ICC A; 4UB8 C; 1MJB A; 4XK4 A; 5IT3 A; 3D1N I; 1QPI A; 3I9V 2; 2ZO4 A; 5IP7 J; 3MAJ A; 2YS9 A; 2A69 F; 3H92 A; 4R8H A; 3PFY A; 5B66 C; 2XAU A; 3HPG A; 3PSF A; 3G4S I; 4HF2 A; 2X48 A; 3FZV A; 4E7Z A; 4G7O F; 1GLN A; 3TW7 A; 1HLV A; 2Y0M A; 4I76 A; 3HIF A; 1X1B A; 4OWR B; 2A6E F; 3VYT B; 2KIU A; 3DFG A; 3RKX A; 1J0R A; 5IYC J; 1MNE A; 2L9N A; 1Y56 A; 3OYL A; 2F4O B; 4QLC U; 2FBH A; 1FYL A; 5K5R A; 3S15 J; 4ZZL A; 2P5V A; 4YFX F; 4YEL A; 2VE8 A; 3S1N J; 2O7O A; 1XSV A; 2QQA A; 5C3E J; 2XRL A; 1MBH A; 1XMK A; 2XGX A; 3ABT A; 5F1J A; 5HDK A; 1FP1 D; 3S3M A; 1ETX A; 2IPQ X; 5L3B A; 4EJU A; 2F6C A; 3LA7 A; 2Q8K A; 4S05 A; 1Y1W J; 3BOQ A; 4A3C J; 4XSX F; 1I3Q J; 3TMO A; 4IHY A; 2DJI A; 4QWQ A; 4KIF A; 1WPK A; 3LA3 A; 4BEH A; 1J09 A; 3I56 I; 2HPM A; 1A35 A; 2IT0 A; 1IUF A; 1QNT A; 5LGU A; 3J81 Z; 3EUA A; 4ON0 A; 5LRR A; 3GTL J; 3KYL A; 4N4O B; 1Z3Y A; 1BJA A; 3ZQQ A; 3FWE A; 5C4J J; 5IT9 K; 1SD4 A; 1WH5 A; 1LJ9 A; 3K4J A; 2HOS A; 2BVL A; 1FOK A; 4HA8 A; 3O8G A; 2ECC A; 5M3M J; 5J1Y A; 1H88 C; 2JA6 J; 3HEF A; 1MSE C; 1R4N B; 3HOU J; 5A2Q K; 2DJN A; 4R79 A; 4LB5 A; 4EM2 A; 2CUE A; 3AKZ A; 4A5M A; 2NRA C; 3CCL I; 3SZG A; 3FMR A; 2CFO A; 2V1N A; 3E3V A; 3RKW A; 3HXL A; 1WZ2 A; 1MMG A; 4F92 B; 3GBG A; 3C2G A; 4XRF A; 2WAE A; 1W0U A; 2X1C A; 2Y48 A; 2DCE A; 1BR2 A; 2P5L C; 3KFW X; 2I10 A; 2NVY J; 4LG0 A; 4NHJ A; 3RQI A; 4RGX A; 2DQL A; 4IOC F; 5BS6 A; 5GTH C; 1LDD A; 4CYC B; 2UV1 A; 5E79 C; 4C30 A; 3ONQ A; 4BKX A; 4BGD A; 5DCM A; 3DBL B; 1Z0X A; 3V8L A; 1QZE A; 3KIO A; 4RGU A; 2IS2 A; 3AG2 H; 2ZSH B; 4LLG F; 5E1X A; 2ZJP F; 3HSR A; 3JCU C; 4ASN A; 3DV8 A; 4N0B A; 2FE3 A; 3DPT A; 3MD2 A; 3HOW J; 3V7S A; 4IHW A; 3R61 A; 4U0V A; 1S7A A; 3ABK H; 3BPX A; 4KMU X; 2EV0 A; 4HX7 A; 2HNH A; 2QLZ A; 1FWZ A; 2W48 A; 1RNL A; 3DF8 A; 4S0H B; 2P4W A; 1WJE A; 3TOB A; 3H9J A; 2GIZ A; 2OZU A; 2GXB A; 4KJZ A; 2DN0 A; 1MBE A; 2COM A; 2NNN A; 4J01 A; 2FNP A; 2IP2 A; 1VQ9 I; 2HDC A; 1X3W B; 1ETV A; 1R22 A; 1C0W A; 5DD8 A; 3GX4 X; 5IPA A; 5EGO B; 3BTC A; 2DK8 A; 3ECH A; 5FJ8 J; 3O6B B; 4I0B A; 4MLO A; 4UUT A; 4UUV A; 2OTL I; 3J7A O; 1RET A; 1LNW A; 1Z67 A; 3AAF A; 2EV5 A; 2L9R A; 1BC7 C; 2J5O A; 4ABZ A; 3SJM A; 1R49 A; 2MC3 A; 4IOA F; 5FD6 A; 4YIR X; 3MEX A; 4XN3 A; 4XOT A; 4C3J J; 1IXS B; 3E0J B; 5LHH A; 3DBR B; 5DM7 F; 3OL3 A; 1HKS A; 3OMY A; 1DP7 P; 1BBY A; 3GW2 A; 5FKO A; 5F1R A; 4NNJ A; 2E1C A; 2L7K A; 3H5N A; 2CQN A; 4PFP A; 5DM6 F; 3CF5 F; 2KFD A; 1JGS A; 3GME A; 1IV6 A; 3U1D A; 3PNT A; 2QKM B; 3I53 A; 3M7G A; 3HM5 A; 2A68 F; 2KMU A; 4PJL A; 3CMY A; 1S6L A; 1X1P A; 5CVV A; 2PFB A; 5TRD A; 3NAU A; 4IX7 A; 1SEU A; 3ZMS A; 4BQO A; 3OIQ A; 3PUB A; 2L02 A; 3KZY A; 5B3S H; 3PL8 A; 4RB3 C; 2HDD A; 3OYM A; 1ZG3 A; 2V26 A; 5HLG A; 1YE9 A; 2L7F P; 2PMZ N; 5EZG A; 4A3E J; 1TWF J; 3CD6 I; 2MH2 A; 3TP0 A; 1LVK A; 2JQ7 A; 5IYD J; 4II3 A; 5EDN A; 3CCJ I; 4U0W A; 1E17 A; 2M3A A; 3Q0U A; 5HS8 A; 4BHC A; 4OMZ A; 4C3H J; 1QU3 A; 4ZDO A; 4QIW N; 1KON A; 2R7X A; 2EFN A; 2D45 A; 4ETS A; 1NH3 A; 5KAI C; 3CQZ J; 3KCC A; 2EIL H; 1X58 A; 4HSR A; 4PSX A; 4A0Y A; 3L1P A; 3LFK A; 4Z6Y A; 1PP8 F; 2XRO A; 3RYR A; 3VDX A; 1KU2 A; 2PJP A; 2DMU A; 1T6S A; 4FHT A; 2W24 A; 2GOX B; 4XOP A; 1WJF A; 4G9Y A; 3RYP A; 2IS1 A; 1Z6R A; 5FLX Z; 1G3T A; 3C7J A; 3TP3 A; 2G7U A; 2R5Z B; 2DA4 A; 2EK5 A; 3J80 Z; 2K7L A; 2UXN A; 4RA2 A; 2DPD A; 2F2E A; 2YSR A; 3PUF A; 4KMF A; 2WV0 A; 1TZL A; 2X6W A; 3GFL A; 4XBF A; 2IGK A; 1GHC A; 2FML A; 1XSD A; 4IRI A; 2K4J A; 4PGG A; 2IXS A; 2P5K A; 5K7Z A; 2CW0 F; 4ZDL A; 3SHF A; 3JR9 A; 1ZRE A; 1AA7 A; 3JTG A; 1SFU A; 3IH2 A; 3F8B A; 4A3D J; 5F0F A; 2F5D A; 4F93 B; 1FSH A; 2V79 A; 2BEO A; 3WGI A; 4E4H A; 1W7P B; 4LB6 B; 1YW9 A; 2FQ3 A; 1WHU A; 2HZT A; 5D6F A; 4A3J J; 1OYW A; 1W0T A; 2CQX A; 4EEF G; 2MA3 A; 2RGV A; 3EET A; 3BDD A; 1DP3 A; 4ENN A; 3V7R A; 2W57 A; 1OQY A; 6PAX A; 1R36 A; 1MDM B; 3WTV C; 5JVG F; 2FRH A; 1JTY A; 1OR7 C; 4F55 A; 4WXC A; 3D5S C; 3CZ6 A; 3V8K A; 1VQP I; 2O0Y A; 2WWY A; 5EGO A; 3FXO A; 1QBJ A; 5EZH A; 4JBA A; 2BBY A; 2VIX A; 2JMW A; 5K5Q A; 1VQO I; 4GDF A; 1M1E B; 2HQN A; 1IN4 A; 4IQ4 A; 5E8G A; 2DO7 A; 4CZC A; 1KQ9 A; 1UB9 A; 2PG4 A; 3IH3 A; 3HSE A; 4HW0 A; 4I98 B; 3RPU D; 5J8C A; 4M9X A; 2QA4 I; 3T1B A; 2HKX A; 4QPQ A; 1JUP A; 4XM3 A; 5DV5 A; 5GTI C; 2E5N A; 1VQL I; 4L9T A; 2ZME C; 4Y4R A; 2EIN H; 2YPR A; 1MZB A; 3AL0 B; 2DK5 A; 2VB6 A; 2L4M A; 5ED4 A; 3ZCO A; 2IAI A; 1RES A; 1WJA A; 1QQI A; 1R7J A; 3CCV I; 3J7Z I; 2R7U A; 2HOA A; 3C18 A; 5ILS A; 3C1D A; 2PMU A; 2VOP A; 2CH0 A; 4RM3 A; 1U3E M; 3OYJ A; 3ZR8 X; 1ZGW A; 1XB4 A; 3SXY A; 4BDZ A; 1ZRD A; 5K5O A; 2E36 A; 3SFZ A; 2VBZ A; 2FU4 A; 3CUQ C; 1OCO H; 4F91 B; 2HYF A; 1U0J A; 3W6V A; 4AU7 A; 1FMV A; 3KLN A; 2MG4 A; 2V9V A; 2WAF A; 4CH7 A; 3HOT A; 3A0H C; 2LBF B; 1JKP C; 1KU7 A; 1K78 A; 3KZZ A; 2LVS A; 1V5F A; 2XAG A; 2ZC2 A; 3G1M A; 2Z2S B; 4E7K A; 1NG6 A; 3WE3 A; 5CLS A; 3T0Y A; 1EF4 A; 2R5Y B; 2VC0 A; 1IN8 A; 3ZQL A; 2OC6 A; 1W1W E; 4X6A J; 1W5S A; 4XLA A; 1JKO C; 2H6C A; 2IEK A; 3H0G J; 4RGS A; 2CMP A; 1F43 A; 1E3H A; 1HXD A; 1UHW A; 2X1D A; 2FQ4 A; 2R5Z A; 2QSF X; 3W2A A; 4CXF A; 5K1Y A; 3LFU A; 1WKM A; 2XGD A; 3LOC A; 4CA0 A; 3BZK A; 4DZJ A; 2Z3Y A; 1LFB A; 3E6D A; 3BR1 A; 2YX4 A; 4B09 A; 5A2Q Z; 3O3K A; 3OYN A; 1LEB A; 2OF7 A; 4YEJ A; 2HI3 A; 4UUS A; 1R71 A; 1ZHF A; 1HKT A; 3CC7 I; 1NK3 P; 1RI7 A; 2RDP A; 2E7W A; 4RLF A; 2KL4 A; 1HDD C; 3RPQ A; 2FMY A; 3TO7 A; 1ZR4 A; 4HV5 A; 2ETH A; 1OCT C; 3HC7 A; 3V8J A; 1DPR A; 1F4K A; 2Y31 A; 4KFC A; 2V1X A; 4I09 A; 2A5Y B; 1HBX G; 1W7P A; 1LEA A; 5E3M A; 1LPQ A; 3BG7 A; 3I3L A; 3CO7 C; 4HQM A; 2E35 A; 3HOS A; 1P4W A; 3L2C A; 2R7D A; 4G12 A; 1WSU A; 3HHH A; 2IVM A; 4FE7 A; 3WU1 B; 2E1M B; 2HKO A; 4A6E A; 3IH4 A; 2EFW A; 2X0L A; 4MIM A; 1H8A C; 2QBY B; 1R1U A; 3FMS A; 3DPU A; 2QUF A; 1R00 A; 4HQE A; 5D4S A; 1HDP A; 2VQL A; 2HQR A; 2L9V A; 1MBK A; 4AIJ A; 1FBU A; 3WTY C; 4XMY A; 3CUQ B; 5EEA A; 1R23 A; 3K4M A; 4I7H A; 3NWT A; 4RAZ A; 3ISP A; 4JX6 A; 4FX4 A; 2EJR A; 3A01 A; 2EFQ A; 2XGC A; 2NOJ B; 2HZD A; 1Y6I A; 3BR6 A; 3PSI A; 4CIC A; 3S3N A; 1MND A; 1BN5 A; 2P7V B; 2VN2 A; 5FKN A; 4BY7 J; 2GLO A; 4G6D A; 4XLH A; 3PO3 J; 3BQY A; 1TQI A; 2ME6 A; 3QU3 A; 2HGC A; 4OU0 A; 1D3Y A; 5DEQ A; 2P0W A; 2L3D A; 4DYQ A; 2EPF A; 2R7Z J; 1AOY A; 4D1Q A; 3P9C A; 1G4D A; 3RSN A; 2VON A; 2M30 A; 3OOP A; 2HR3 A; 2QQ9 A; 2QCO A; 3E5Q A; 2DTR A; 2TRT A; 1ON2 A; 5E20 A; 3M4O J; 1DUX C; 2QWW A; 4B8X A; 2DYR H; 3N4M A; 2KP6 A; 3E6B A; 3LSM A; 3G73 A; 2DT6 A; 2HYJ A; 5EF6 A; 1SVM A; 5HOO A; 1K83 J; 1QRY A; 1ONV A; 2HTJ A; 4G8X A; 2Y9Z A; 4JOM A; 4A2U A; 2ISY A; 4P9U A; 2KIM A; 1PUF A; 4PGH A; 4AM3 A; 5HVQ C; 2JA5 J; 3HPH A; 1W36 D; 4GFB A; 1XC5 A; 4BU2 A; 5M5W J; 2VQG A; 2CW8 A; 2CYY A; 2KT0 A; 3E5X A; 3IRQ A; 1BC8 C; 4L9N A; 4CHU A; 2VLA A; 1HKQ A; 1X1C A; 1HC8 A; 4BAC A; 5J40 A; 2BY2 A; 4NDL A; 4HBL A; 4KNY A; 4ZC3 A; 1OR7 A; 5FLM J; 1IO2 A; 5LFA A; 4DIQ A; 3Q3S A; 3KE2 A; 3FK7 A; 1MJA A; 2I5U A; 2IA2 A; 4PDK A; 4U88 A; 2K5C A; 4OIQ F; 1XGM A; 5FLX K; 3NQO A; 1VQM I; 4KIB A; 2DPU A; 3M8J A; 4BYY A; 2V1D A; 3VYU B; 2OU2 A; 1I6H J; 3J80 K; 1FEX A; 4KT5 C; 3ZMZ A; 2X51 A; 4QTR A; 5HNF A; 2DDA A; 3D0S A; 3PIO F; 1NK2 P; 4BXF A; 5DS9 A; 2BY1 A; 3CCE I; 3BLY A; 1G6N A; 4M72 A; 2VQC A; 4NBQ A; 3FM5 A; 4XSZ F; 2ZME A; 2AHQ A; 1Z21 A; 4QSH A; 2XSD C; 2VBX A; 4H0E A; 3EQL F; 4L0Z B; 4L5I A; 5K7H A; 3L2V A; 5EEG A; 1YX3 A; 3RZO J; 2XUB A; 4ZYA A; 1UST A; 4LG3 A; 2BY0 A; 1N25 A; 1S9H A; 4JX5 A; 1T95 A; 2DOD A; 4BS9 A; 3ERE D; 1OCC H; 4X0G A; 2FOK A; 2XC7 A; 4O5V A; 3L00 A; 3CCM I; 2K40 A; 2QBY A; 2M2E A; 2LKX A; 1FC3 A; 1VQ7 I; 2JK3 A; 4UXN A; 1Q1V A; 4LG0 B; 4CCK A; 2VJ4 A; 3QYE A; 1RR7 A; 1JKQ C; 3GYH X; 1PVE A; 3CUQ A; 3K70 D; 5FRN A; 4BNC A; 1W5T A; 3S2W A; 3K4B A; 1JXS A; 4Y52 J; 3K1M A; 3OR1 C; 4HLX A; 3T8T A; 4MFE A; 1WJB A; 3HGG A; 1W5C C; 5TJJ A; 3IUO A; 4UVB A; 5L3D A; 2ELJ A; 2DFH A; 4RB0 A; 1LQ1 A; 2CO5 A; 3F0C A; 1FOX A; 3W6K B; 2A05 A; 5E3N A; 3FKJ A; 4CCL A; 4R1H A; 4EGZ A; 2A3S A; 3DCF A; 1FTZ A; 1I27 A; 2LP0 A; 3K4K A; 1ZYR F; 1FX7 A; 1RKW A; 1JJ8 C; 1T0F C; 4BQQ A; 2AQF A; 3WOD F; 4NUB A; 1J2X A; 4M74 A; 1P9Q C; 4FAS D; 4FT8 A; 2HU9 A; 2H8W A; 1P6R A; 1DU0 A; 1KQ0 A; 4XN0 A; 3VOD A; 2ZBK A; 2CWE A; 1WJC A; 3B73 A; 3S2D J; 3LSH A; 2V6E A; 4E7I A; 1FY7 A; 3GF2 A; 1Y39 A; 2BV6 A; 4MTE A; 4B3X A; 1JTX A; 1FNN A; 1YJN I; 3T5X A; 4KUM A; 2O8K A; 4K2E A; 4XLE A; 4AVZ A; 4MTD A; 2XDV A; 2HWV A; 4IEJ A; 3REO A; 3K4C A; 1YIO A; 2OQR A; 1LVA A; 1S72 I; 3CLQ A; 1FMW A; 1IC8 A; 3GEZ A; 2K9Q A; 1FYK A; 4LD5 A; 1BIB A; 2HOE A; 3GTP J; 2QKL B; 2OZ6 A; 1ZEL A; 4RS8 A; 3I4M J; 3TO6 A; 3DPL C; 4QPO A; 1T8I A; 5KNL A; 3LL7 A; 3FHZ A; 4RMN A; 2OTJ I; 2VKV A; 2ECB A; 2CQQ A; 4AIH A; 3OOU A; 4P96 A; 3KP2 A; 1GV2 A; 3RJP A; 4MQ9 F; 2VAS A; 5GAH J; 4XOR A; 1Z1D A; 2UXX A; 1YLF A; 3CP2 A; 1YIT I; 3MZY A; 2M4K A; 1D0Y A; 2KIQ A; 1U9N A; 4M3B A; 4ESJ A; 5HLI A; 5HLH A; 5CVR A; 2JPB A; 4N4N B; 2DA2 A; 3OYG A; 3VSL A; 3JRG A; 2LD5 A; 2JA8 J; 1AHD P; 3GTQ J; 2RRE A; 3ULQ B; 4BXU A; 4PJM A; 3IWF A; 2LRD A; 2B0L A; 1X3Z B; 4A5N A; 4JQF A; 1S7O A; 4P55 A; 2QEX I; 3GVA A; 1G3Y A; 4XL9 A; 4FX0 A; 4CUG A; 2R92 J; 3EYI A; 4Y13 A; 1WI9 A; 3R60 A; 1K6Y A; 2O03 A; 2FUG 2; 2M0C A; 4ZDP A; 3JRI A; 1IRZ A; 3QRF F; 4TV7 A; 3NRV A; 3W2V A; 3K10 A; 3HUG B; 1IRG A; 1X1D A; 5J6X A; 2R7W A; 4RM2 A; 1T56 A; 4DYR A; 4DNC A; 1VND A; 1XCV A; 1UG2 A; 2FBI A; 2JSC A; 1ETQ A; 1IN7 A; 5DCF A; 1TWC J; 1RUO A; 1Y8R B; 3F21 A; 2XAS A; 1ZGJ A; 3L7W A; 5JFR A; 5J1U A; 3LA2 A; 4EGY A; 3A4C A; 3EUH C; 2EA2 A; 1YHQ I; 2RQP A; 2ZJ2 A; 3KPH A; 3R4K A; 1UHM A; 4M73 A; 1XGO A; 4PCQ A; 4BL0 B; 2HQ5 A; 2CQK A; 4II2 A; 4ZYG A; 1JUM A; 2OCE A; 1OCR H; 4CCO A; 1XPX A; 3M3Y J; 1YIJ I; 1K7A A; 1WCM J; 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