3BP8A

Crystal structure of mlc/eiib complex
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
396
structure length
381
Chain Sequence
DQIKQTNAGAVYRLIDQLGPVSRIDLSRLAQLAPASITKIVREMLEAHLVQELEVGLVVETEAWHYLSLRISRGEIFLALRDLSSKLVVEESQELALKDDSPLLDRIISHIDQFFIRHQKKLERLTSIAITLPGIIDTENGIVHRMPFYEDVKEMPLGEALEQHTGVPVYIQHDISAWTMAEALFGASRGARDVIQVVIDHNVGAGVITDGHLLHAGSSSLVEIGHTQVDPYGKRCYCGNHGCLETIASVDSILELAQLRLNQSMHGQPLTVDSLCQAALRGDLLAKDIITGVGAHVGRILAIMVNLFNPQKILIGSPLSKAADILFPVISDSIRQQALPAYSQHISVESTQFSNQGTMAGAALVKDAMYNGSLLIRLLQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Analyses of Mlc-IIBGlc interaction and a plausible molecular mechanism of Mlc inactivation by membrane sequestration
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative NAGC-like transcriptional regulator
molecule tags Transcription
source organism Escherichia coli
total genus 103
structure length 381
sequence length 396
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3bp8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3bp8A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3bp8A03
2PLYA 4BHCA 4S05A 2RVCA 1NBWA 2CQKA 3FXUA 4BR7A 1FWZA 2VT2A 4HDUA 2P7VB 1WI9A 2V7YA 3GFJA 2DPNA 4IRIA 1P2FA 2KKOA 2IVOA 3JSOA 4EMSA 1KU9A 1T6CA 3BF1A 4BRMA 2ZJ2A 1Z91A 3DP7A 4H5VA 3V4GA 4A5NA 1FX7A 5F6FA 3ULEB 5E17F 4XLNF 1SMYF 2VBXA 2VN2A 2NYXA 2W25A 3QRFF 5AQJA 5L3GA 4R79A 1X3NA 4B1ZA 2LF8A 4BGBA 4HAMA 2J5OA 2F5FA 2QXLA 3D2EB 2LF7A 2BGCA 3IWFA 3R0AA 4P55A 4IVNA 3RKWA 5IT9Z 2W85A 1X3UA 3N4MA 3NQOA 2ISYA 1CGPA 5F2RA 3HYIA 5TRDA 4IJNA 1KAXA 1GLLO 4P5OA 5DYMA 2E2QA 1HKGA 3IMXA 4FO0A 4L0ZB 2XAGA 5FO5A 4FL9A 1TLHB 3I0TA 4KN4X 5BN8A 3LDLA 4CJ7A 4LLNA 4K43A 1T6SA 1FZPB 2ESHA 4KBOA 3O1BA 4HQEA 2GEMA 2KIUA 4GNIA 1D8JA 4EJTA 5B8HA 4A2AA 5IT9K 3ULQB 4FPAA 2ASPA 2QBYB 2ASOA 1YG2A 5ILVA 1KGSA 1ZXOA 3RSEB 4ON0A 3DPLC 2GTDA 5FGMA 3ZN1A 1HW2A 1KYWA 3FM3A 4GXOA 3H3OB 2HQRA 3S2WA 2XUBA 1ODDA 3F8CA 3GW2A 2P9NB 4H0TB 2GA1A 1X3MA 2PMUA 3T0YA 2YSRA 2QM1A 1SD6A 2K4BA 5JICA 4JN4A 2GWRA 3F21A 3DXMA 5LY3A 1SQKA 4JD2A 1KU7A 3M6GA 3VPZA 3T1BA 1HKTA 4IJAA 4HWIA 5E8GA 2V52B 5BPNA 4HLXA 3IFRA 4O5VA 1BBYA 3OHRA 2ELHA 3KEOA 3VEWA 3UE5A 3SHFA 4L9TA 5H6RA 5E1XA 3F8FA 1G3SA 3LDOA 1SD7A 2A61A 1C0WA 3KHYA 3FM5A 3KZYA 1YW8A 1NGAA 1KU3A 3BJOA 3HSRA 4A2UA 4IRHA 2P9SA 2ZF5O 3FMRA 1RIOH 1FC3A 4MHGA 3WODF 3ZETA 1AWCA 2EJRA 4H0PA 4A0YA 4EQQA 3FMQA 2JPBA 4BRFA 1O3RA 4IXCA 2K27A 1O3QA 1HJOA 3U2RA 4UVBA 3K9TA 1BC7C 5FLXZ 1L3LA 3RIRA 4BR5A 2VT3A 3COAC 4OIOF 4U0YA 4FWOA 3Q9VA 2FF4A 1NGGA 6PAXA 1NGHA 1X9JA 2O03A 4M71A 1IUYA 4A2BA 5AQHA 5K1YA 4M7XA 4O3MA 4PKIA 1SD5A 1JHFA 3F6VA 3UKRA 2A3ZA 5BPMA 4ENMA 3A5MC 1EV7A 4I0BA 3T8RA 3L00A 4HV6A 4OOIA 4A5MA 2FEZA 4J8FA 3MN6A 1NGCA 4BRPA 1BDGA 1ZREA 2E1YA 2XAQA 1MKMA 3U9DA 2G9WA 1TTYA 5D5WB 5FPEA 4RB2C 4YDUA 4A0XA 5J8FA 5FLXK 3IKTA 4ETSA 4HV5A 1WOQA 2CGJA 2QWLA 3ZMTA 4CO8A 3MK6A 2D1VA 4YIFA 4BGAA 1QZ6A 2DK5A 5ADXA 1G3YA 3J80Z 3KETA 1YS6A 3D7EO 2BV6A 4AIHA 3UKUA 4JNEA 4KIGA 1SFEA 2YI1A 5KK1A 5FD6A 1MA9B 3PQJA 5AQXA 3KP5A 1Z7UA 3P7NA 2QQBA 3QU3A 5AZIA 5E18F 4M73A 3QP6A 4I09A 5D5UB 3EKSA 3W6JB 5AFUH 1SAXA 1UHMA 3WGIA 1J0RA 2FF6A 2HF4A 4PGHA 4CZZA 1XDUA 5BPLA 1IN4A 2M87A 1R36A 3J80K 3CJBA 1LEAA 3GVAA 3QB0A 1TQPA 2EFQA 1E4GT 1QZ5A 3FLCO 2L3DA 4IXAA 4AM7A 3K1NA 4PL7A 2P6SA 2VCPA 3CETA 3FR0A 3ISPA 4HDVA 1ZARA 4WYBA 1I1GA 2A5YB 2GAUA 2M5WA 3IWZA 4FX0A 3WTTC 4KA4A 1T2KA 1LCUA 1XD7A 3HSCA 3CO6C 2WC2A 4Q5SF 4BREA 2EK5A 2NRAC 2UWMA 3RPUA 1BM9A 1QQOA 1IN7A 2V6CA 3ZMSA 4EJWA 4LFUA 3VEPA 3VEXA 3R9PA 4BR9A 3REOA 4EJUA 3M8FA 2ADUA 3HRUA 2OBPA 1P4AA 3LFKA 4A62A 1XB4A 4HF1A 1IF1A 1YTYA 2HF3A 4IHTA 3ZMUA 3N97A 5LRRA 3NRVA 2W84A 2HKOA 3MMVA 4UXNA 5DUKA 1U5TA 1FYKA 3EL2A 1TQIA 1Y0UA 4CZEA 2ZBKA 3E3VA 1JXSA 4DHYA 3KEQA 1BOTO 3WTYC 3C1DA 4XSZF 1XMAA 5ELZA 3IC7A 3WXJA 4G7HF 1WSUA 3EDPA 1YXQA 2RV8A 4FWLA 3Q9SA 1B9MA 3FZHA 4BHBA 1XGMA 2FNAA 2OZUA 4OMYA 5LJWA 5HLHA 1NHAA 1TW2A 1T6DA 3ML6A 3I53A 4KIBA 2FBHA 4I0AA 4RGSA 4HW0A 2P9UA 2BEOA 1E4FT 3K2ZA 2D4WA 3WEEB 1CZAN 1YVNA 2HGCA 3G25A 3EYYA 1BIAA 3TO9A 3C7JA 4RB3C 5AQYA 4IRGA 5F0XA 3LWFA 1J59A 5JLFA 3J7AO 3L6QA 2XAFA 3QBWA 5E84A 1HX1A 3HTUA 4Y0WA 2L4MA 3FGUA 3U8XA 3E6BA 4WK8F 4BXUA 4XSXF 3AAFA 1USTA 2CW0F 2QM3A 1WWXA 4I6MA 2HWVA 1XCVA 2X0LA 5KPZA 1PP8F 1FPQA 3QAHA 3F8MA 5AZJB 2VWBA 3A5OC 4A61A 1XMKA 3SZTA 4Y17A 3U4LA 2RGVA 4BC2A 3MZHA 2X4HA 2PMHA 2H6BA 2ZGYA 3E6CC 3DKWA 3FWEA 2J4RA 4CZFA 1SMTA 1FNNA 1W4MA 4ENJA 3HRMA 3FMSA 1SFUA 3DV8A 1FBQA 1T39A 4WXHA 2Q31A 2YU3A 3KFWX 3ZPLA 4CD1A 3I8BA 5D6FA 3C7NA 2JT1A 4MQVA 1QBJA 2D2WA 5LGUA 4LD5A 2EV6A 4HX4A 4BRKA 1KA8A 1ZRFA 1ZG3A 3GUDA 2IJLA 4A0ZA 1ZC6A 1HKSA 5FPNA 2HKXA 3WUHA 2Y48A 4JBAA 1FT9A 2CYYA 3BDDA 2OQGA 1NGBA 3V8LA 2CWEA 4OIPF 3K1MA 1ZHFA 1MJAA 3HIFA 3GYHX 3VETA 1QO0D 3MDQA 1ZG5A 4Z94A 2BYVE 2PFBA 3L0QA 2P5VA 4H0YB 3GE1A 3DWLA 4LLLA 2P9KA 4NB5A 4FSVA 5L3BA 1QHAA 2PI0A 1BN5A 4Q48A 4TV7A 4BRQA 2LDUA 1MZBA 4ENNA 5AQIA 1YLFA 2XGXA 4XEIA 2P9PB 3JSPA 1MJ9A 3KP2A 3ENOA 2DQLA 1R59O 5L3FA 5AFUA 2A07F 1E2XA 2HFHA 5HS7A 2XASA 5BRDA 3VENA 2I7PA 4ZH4F 2O61A 2R7DA 2VBZA 1TUYA 1DKGD 1Q1HA 3C3WA 3LQQA 1FP1D 3B8AX 2D0OA 4R8HA 2IPQX 2TDXA 1LJ9A 2CO5A 3BJAA 2FLOA 1OKJA 2JZYA 3BPVA 4BRDA 2FNPA 1IN5A 2VBYA 1FBUA 3CJCA 4JAXA 4G94A 3VF2A 1JE8A 4BRCA 1F1ZA 2VOOA 2C6YA 1U6ZA 1K8KA 3LAJA 2UZKA 1QZZA 5LRSA 2E20A 1R5GA 2FU4A 4Z2YA 3V7SA 2GXGA 4ESFA 5HDKA 3LM9A 5AQGA 2H09A 4CZLA 2XROA 1NWKA 3DAWA 3ECOA 1AOYA 3NEUA 2HEOA 3H46O 4BRNA 3KP4A 1ZLJA 2HTJA 4MQ9F 3ATVA 1O7LA 1YW9A 1CF7A 3CO7C 4M6XA 2XAJA 3CERA 2RQPA 2ZMEB 1KYZA 2FSNA 3KE2A 3D5LA 4YG2F 2Q0UA 3KLNA 3I33A 3KLOA 2QWWA 5K5OA 2HDCA 3ZEUB 3H3ZA 1ATNA 4D0PA 5DD8A 1TNSA 1NGJA 1TW3A 1F5TA 4BR0A 4O5FA 4UV8A 3QU6A 2NNNA 2I7NA 5ED4A 4NHJA 4OIRF 5EEHA 1T44A 2Q8KA 5BPDA 1UFMA 2A6HF 3WU0A 4EJVA 1K79A 4EM1A 5L3CA 4B8XA 3P9KA 3BF3A 3LQRA 3IHUA 1NGIA 2MLKA 3F22A 2E2PA 1LOTB 5BPIA 4ZYHA 2QWOA 4BROA 4RGUA 2E8AA 1BI0A 4AM6A 4EHUA 4A6DA 1LQ1A 2J5PA 1I6XA 3MZYA 2NNYA 3HOTA 3ECHA 2ASMA 5LHGA 4K42A 3I64A 1S8NA 1MDMA 2NLXA 2Q0OA 1JCFA 4RCHA 4YDUC 4CYDA 4LK1F 3V8JA 2P9IA 3QBXA 2A40A 3J81Z 3WTXC 1NGDA 4LLGF 1NMDA 3KZZA 1FOKA 1BWFO 2WWYA 4B1VA 4RB0A 1REPC 4FT8A 4RTFD 3ZQ7A 1MDUB 1QNTA 2KJCA 3O5BA 3CQYA 1ZH5A 5AR0A 3V7RA 1T0FA 1K7AA 4Q4ZF 4ZZDA 2KIFA 3EN9A 4QLCU 2QW9A 1R22A 3LDQA 2XRNA 3LDNA 4LB5A 1RGIA 2W57A 1MD0A 3KCCA 5D5XB 3MCPA 2WUSA 3LA3A 3J81K 4LG0B 2EFNA 4G6QA 2E1CA 1Q18A 4MO4A 3ZMZA 2DW4A 2YX4A 3DFGA 5AQRA 3CJNA 2PG4A 2IVMA 4CBWA 1S7AA 1P8ZA 3O6WA 1Z1DA 2BTFA 2DQRA 1ZBSA 2STTA 3PFIA 5BS6A 3CUQA 1HKBA 3C18A 2H3GX 1H9TA 4A12A 3WE2A 2RN7A 4CGZA 3QOPA 3VGLA 1GLJO 3DXKB 4KDPA 1YW7A 5CVRA 5DCMA 1KU2A 4N0BA 3IRRA 3QP5A 1RUOA 2A42A 1KQ8A 2F9WA 1U2VA 3IKVA 4AIKA 2HMPA 1FSEA 2HOEA 2W41A 1RNLA 3LAPA 2E1NA 4LJZF 3CJ7A 4FWNA 3HHHA 4ISGA 3ENHA 2GQQA 2GWJA 3VF6A 1R5HA 1Y64A 3EUHA 3CIPA 2ACJA 3TQNA 2CGPA 4MLEA 1XN7A 1U5TC 2IIRA 4BYYA 3HZ6A 4HX8A 3TPQA 1DEJA 1FP2A 2JRTA 4LK0F 2GA2A 3HBTA 3SK3A 4LGWA 4UV9A 5EVZA 2P9LB 1FBSA 2Q2RA 1GVJA 2OA4A 4ESJA 3K69A 5BREA 2RNJA 2VC0A 2ESNA 5K5RA 5AIPA 3ERED 4DQ8A 4I7HA 2NRHA 3GLXA 1QPMA 3HI0A 3BEXA 5CYVA 1H1VA 4OINF 1D3YA 3RTRA 2P8TA 3K0LA 3HHGA 2QVOA 1TYQB 3RYRA 2P9KB 3F23A 1BA0A 4YFKF 3UB5A 3FF5A 1EH6A 3D2FA 1MWKA 3K1PA 5BQTA 2PBDA 4L9JA 4JHDA 4QS8A 1H0MA 1SD4A 4NQWA 1GXPA 3BWGA 2O8XA 4RWTA 1ZRCA 2A41A 1W5SA 3G73A 5CVIA 4B1YB 3D0SA 3ZX0A 4BNCA 4KMUX 1O3TA 3I54A 2FSKA 4CZKA 5I9EB 2GUPA 1WQ2A 1OYWA 5L3DA 3BZ6A 2XKOA 1J2XA 1XGNA 3P9IA 3EETA 5DCFA 3WXIA 3FZFA 1P4XA 5A2QZ 4G6DA 1GLBG 4GYIA 3I59A 4K41A 5D4SA 1IXSB 2Z9OA 3ZMDA 4WX9A 4WCGA 3G3ZA 5CVVA 3BPXA 2OZ6A 4FOEA 2UXNA 2MC3A 4H5RA 4ZYEA 5AQMA 1V3FA 1YAGA 2QYOA 5KPTA 5D8KB 4BVOA 1SAZA 3H6EA 1IN8A 1S29A 3F8NA 3LA7A 1ZGAA 1W7PA 4M9SA 2PEXA 4BC5A 3W3DA 1IW7F 3R0JA 3R60A 1S3JA 1P92A 4EHTA 5ILSA 5DV5A 5L3EA 3ID8A 5AQPA 2OU2A 2VBWA 4G7OF 4B1XB 2ZXJA 3MN9A 4XH4A 4GYGA 3JXUA 3EZWA 1K78B 2FBIA 5A2QK 4WQ5A 3O6BB 4LMYA 1S22A 3BOQA 3WGHA 2P4WA 3WTZA 1BOAA 4GO1A 2KHOA 3H1VX 4BC4A 1YS7A 5HS9A 2VODA 1H9GA 2Z99A 4EFHA 3BROA 2EA2A 3M9AA 3RDIA 1LVAA 2K7LA 2P5LC 4OMZA 2ITMA 3GFIA 3IL2A 5E20A 2Q2EA 1G99A 3WXLA 2Z33A 5AQVA 2VE8A 3ULEA 3KVGA 4FWMA 4AIJA 5E1ZB 2Z3YA 5LGNA 3ZX3A 2F2EA 2UXXA 3LSTA 4UNOA 1J75A 1TQMA 3FE1A 2M30A 5TJJA 1BUPA 3QMLA 1DDNA 1FY7A 3D2EA 2LNBA 3RJPA 4IWVA 4RAYA 4B1WB 2FA5A 1HPMA 5FFXA 4MGRA 1USSA 2CH6A 5ICGA 2QQ9A 3VESA 1XSVA 5LBQA 3TO6A 2KJBA 4CZJA 2Q36A 2HS5A 3U9GA 4HLYA 5CVJA 2W40A 5E8IA 3L9FA 2MBFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2PLY A;  4BHC A;  4S05 A;  2RVC A;  1NBW A;  2CQK A;  3FXU A;  4BR7 A;  1FWZ A;  2VT2 A;  4HDU A;  2P7V B;  1WI9 A;  2V7Y A;  3GFJ A;  2DPN A;  4IRI A;  1P2F A;  2KKO A;  2IVO A;  3JSO A;  4EMS A;  1KU9 A;  1T6C A;  3BF1 A;  4BRM A;  2ZJ2 A;  1Z91 A;  3DP7 A;  4H5V A;  3V4G A;  4A5N A;  1FX7 A;  5F6F A;  3ULE B;  5E17 F;  4XLN F;  1SMY F;  2VBX A;  2VN2 A;  2NYX A;  2W25 A;  3QRF F;  5AQJ A;  5L3G A;  4R79 A;  1X3N A;  4B1Z A;  2LF8 A;  4BGB A;  4HAM A;  2J5O A;  2F5F A;  2QXL A;  3D2E B;  2LF7 A;  2BGC A;  3IWF A;  3R0A A;  4P55 A;  4IVN A;  3RKW A;  5IT9 Z;  2W85 A;  1X3U A;  3N4M A;  3NQO A;  2ISY A;  1CGP A;  5F2R A;  3HYI A;  5TRD A;  4IJN A;  1KAX A;  1GLL O;  4P5O A;  5DYM A;  2E2Q A;  1HKG A;  3IMX A;  4FO0 A;  4L0Z B;  2XAG A;  5FO5 A;  4FL9 A;  1TLH B;  3I0T A;  4KN4 X;  5BN8 A;  3LDL A;  4CJ7 A;  4LLN A;  4K43 A;  1T6S A;  1FZP B;  2ESH A;  4KBO A;  3O1B A;  4HQE A;  2GEM A;  2KIU A;  4GNI A;  1D8J A;  4EJT A;  5B8H A;  4A2A A;  5IT9 K;  3ULQ B;  4FPA A;  2ASP A;  2QBY B;  2ASO A;  1YG2 A;  5ILV A;  1KGS A;  1ZXO A;  3RSE B;  4ON0 A;  3DPL C;  2GTD A;  5FGM A;  3ZN1 A;  1HW2 A;  1KYW A;  3FM3 A;  4GXO A;  3H3O B;  2HQR A;  3S2W A;  2XUB A;  1ODD A;  3F8C A;  3GW2 A;  2P9N B;  4H0T B;  2GA1 A;  1X3M A;  2PMU A;  3T0Y A;  2YSR A;  2QM1 A;  1SD6 A;  2K4B A;  5JIC A;  4JN4 A;  2GWR A;  3F21 A;  3DXM A;  5LY3 A;  1SQK A;  4JD2 A;  1KU7 A;  3M6G A;  3VPZ A;  3T1B A;  1HKT A;  4IJA A;  4HWI A;  5E8G A;  2V52 B;  5BPN A;  4HLX A;  3IFR A;  4O5V A;  1BBY A;  3OHR A;  2ELH A;  3KEO A;  3VEW A;  3UE5 A;  3SHF A;  4L9T A;  5H6R A;  5E1X A;  3F8F A;  1G3S A;  3LDO A;  1SD7 A;  2A61 A;  1C0W A;  3KHY A;  3FM5 A;  3KZY A;  1YW8 A;  1NGA A;  1KU3 A;  3BJO A;  3HSR A;  4A2U A;  4IRH A;  2P9S A;  2ZF5 O;  3FMR A;  1RIO H;  1FC3 A;  4MHG A;  3WOD F;  3ZET A;  1AWC A;  2EJR A;  4H0P A;  4A0Y A;  4EQQ A;  3FMQ A;  2JPB A;  4BRF A;  1O3R A;  4IXC A;  2K27 A;  1O3Q A;  1HJO A;  3U2R A;  4UVB A;  3K9T A;  1BC7 C;  5FLX Z;  1L3L A;  3RIR A;  4BR5 A;  2VT3 A;  3COA C;  4OIO F;  4U0Y A;  4FWO A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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