The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
|
sequence length |
83
|
structure length |
83
|
Chain Sequence |
GSSGSSGEKEDSKTRGEKIKSDFFELLSNHHLDSQSRWSKVKDKVESDPRYKAVDSSSMREDLFKQYIEKIAKNLDSSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the third FF domain of human transcription factor CA150
rcsb |
| molecule keywords |
Transcription elongation regulator 1
|
| molecule tags |
Transcription
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
17
|
| structure length |
83
|
| sequence length |
83
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01846 | FF | FF domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | FF domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CQN A; 2DOE A; 2LKS A; 2KIS A; 2E71 A; 2L9V A; 4FQG A; 2B7E A; 2DOD A; 2DOF A; 1UZC A; 2KIQ A; 2KFD A; 2K85 A; 2JUC A; 2KZG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2EA4 A; 3DU6 A; 1MDM B; 4PZJ A; 4L9N A; 2LYC A; 2VPL A; 2KRH A; 2QQ8 A; 1GHC A; 2JUG A; 4LOC A; 2OZ6 A; 4CH7 A; 3H3V K; 2HU9 A; 3I0T A; 3VWB A; 2OU2 A; 3MN2 A; 1G8X A; 2FOK A; 1D0X A; 3RKY A; 4E7J A; 3ABM H; 2CV2 A; 4BDY A; 1QZY A; 1SMT A; 1CF7 B; 3VYU B; 1EH6 A; 1LVA A; 2EFP A; 2VLA A; 2MC4 A; 4GCV A; 3H36 A; 3ZXS A; 1D5V A; 2KFD A; 2QEN A; 4KT6 A; 4NUB A; 4RLF A; 3ABL H; 2L9S A; 1W7P B; 5A2Q Z; 3A2K A; 3SFI A; 4XOP A; 4OIN F; 1NH3 A; 3DXJ F; 4Q4Z F; 2A07 F; 2G7H A; 4FE4 A; 3WTU C; 5JVG F; 1P7J A; 3BJ6 A; 4G7H F; 2E1M B; 1XDS A; 2TDX A; 4HST A; 1X19 A; 1NG6 A; 3BR3 A; 4GGG A; 4UY8 I; 3JRB A; 3WOD F; 2ESH A; 3GF2 A; 1G4D A; 1MKM A; 2Z5U A; 2ETH A; 3QOD A; 4RB1 A; 4NC6 A; 4B09 A; 3RJP A; 1YX3 A; 1MBH A; 3GTK J; 5K7Z A; 1U9O A; 3GW2 A; 4C3I J; 1I5Z A; 1N75 A; 3K4N A; 4I01 A; 5BPD A; 5GAG J; 1OLT A; 4B48 A; 2P6S A; 2DQL A; 2ZME A; 2XSD C; 1K4S A; 5LHH A; 1HF0 A; 5L3E A; 4W97 A; 3V7R A; 5IT9 Z; 2LNB A; 1YX5 A; 4AIJ A; 1ETY A; 3E6B A; 3HZJ A; 1QO0 D; 1JUP A; 1ZK8 A; 3S15 J; 2A6T A; 3SEZ A; 4DIQ A; 5HLG A; 2ELH A; 3O8G A; 4P55 A; 2HDW A; 2HQ5 A; 4HBL A; 4JP0 A; 2K9S A; 3R60 A; 1JE8 A; 3MEX A; 1B1B A; 2HDC A; 1JXS A; 3QYF A; 2NVU B; 1Z1D A; 4ENN A; 2PX9 A; 2V9P A; 4EAT A; 3ZR8 X; 5E3O A; 2MBF A; 3C18 A; 1UHW A; 3L2U A; 4QWQ A; 4IOC F; 1UZC A; 5H2F C; 2ID3 A; 3TED A; 2PG4 A; 1FT9 A; 1OMI A; 5KAI C; 2UXN A; 1U2W A; 4IKF A; 3GZ6 A; 1S5L C; 2CW7 A; 3S3M A; 2EFN A; 3OIO A; 1ZH5 A; 5F6F A; 4AUX A; 1OCT C; 3DCF A; 4HNT A; 1VI0 A; 4FT8 A; 4WK8 F; 2QGU A; 4LK0 F; 4EJU A; 1MBG A; 4IHW A; 2DN0 A; 2WY8 Q; 2M4K A; 4A3E J; 1T6S A; 3WGH A; 2DA5 A; 4PFO A; 4UVC A; 5DS9 A; 1U9N A; 1IXS B; 2EB7 A; 1ETO A; 4S04 A; 4ZTJ A; 1QPM A; 3CCR I; 1LUJ B; 1WJB A; 4B3X A; 1FWZ A; 1IXC A; 1PYV A; 2NRA C; 3A01 B; 3BJA A; 2VC1 A; 1DUX C; 2W85 A; 1XB4 A; 2YUS A; 5CVU A; 4ZYD A; 2CMP A; 1ONV A; 3C7J A; 4BEH B; 2JPC A; 4L5J A; 4V2F A; 2JA7 J; 1KYW A; 3I54 A; 1SFK A; 2E60 A; 3GTO J; 2GXG A; 1ITY A; 3KP6 A; 2W24 A; 2HVR A; 4YEL A; 5BOX A; 1ULY A; 2ZXW H; 2WBM A; 4L18 B; 2VJJ A; 1UJ8 A; 5F1R A; 4BQN A; 1YFH A; 2GA1 A; 3HUG A; 4HX4 A; 4XN3 A; 4HV5 A; 5HNF A; 1IRF A; 3I59 A; 4V19 K; 2BE5 F; 4F93 B; 2JQ7 A; 2EV5 A; 4LLG F; 4FTH A; 1VQM I; 3KP2 A; 2M5W A; 2F4O B; 3ZQI A; 4D0P A; 2XRL A; 4ZDL A; 3VOE A; 3U2R A; 3DF8 A; 3I9V 2; 4A3L J; 2UXX A; 5DYM A; 2R5Y A; 5M5W J; 1OIS A; 2Z3Y A; 1IN4 A; 4E7I A; 3IL2 A; 1QA6 A; 2E2I J; 3OSF A; 3DTK A; 3A0H C; 3PNY A; 4G94 A; 2LF8 A; 3MKW B; 3ZQH A; 2D1H A; 3S3N A; 3FMQ A; 3I4M J; 3J7Y J; 3HOY J; 4PCQ A; 1W0T A; 1ZG3 A; 3U9G A; 2P6T A; 4GXO A; 2DOA A; 5DEQ A; 1T8I A; 4MIM A; 4QTR A; 3OYF A; 5CVJ A; 5KVR A; 3JRD A; 2W25 A; 1ZHF A; 5D8L B; 2YX4 A; 2EZL A; 2HZD A; 3L2R A; 4XLP F; 3K9T A; 3ZN1 A; 5B5E C; 3DKY A; 2IGN A; 3HXL A; 4KIC A; 1ETK A; 2Z16 A; 3P9C A; 2K5C A; 3KP3 A; 4CUG A; 3Q3S A; 5GPC A; 2M45 A; 3LWF A; 3IRR A; 4I6Z A; 1SVO A; 2QZ8 A; 3I53 A; 3ZQG A; 2MG4 A; 4TV7 A; 3SZP A; 3K10 A; 2XV4 S; 1RRJ A; 2ZO4 A; 2HTS A; 2VOP A; 2XB0 X; 1KA8 A; 1KU2 A; 5LD2 C; 2LY1 A; 1XN7 A; 3S16 J; 2IA0 A; 1TL8 A; 1QZE A; 2F5E A; 3PFI A; 1R1T A; 4A3F J; 3IC7 A; 3CUO A; 4BUP A; 1F36 A; 1S6L A; 3AG3 H; 4BQO A; 2DK5 A; 1JKQ C; 1SFE A; 3JRI A; 3BT9 A; 4G7O F; 4M74 A; 1XGO A; 2HNH A; 2N8G A; 3CO6 C; 4HX8 A; 1IN8 A; 1R36 A; 3LA3 A; 4FX0 A; 5LBQ A; 2ZJ2 A; 3L2V A; 1YRN A; 3K4L A; 2GXA A; 5D5V B; 3CD6 I; 3J80 Z; 3GBG A; 1JT0 A; 3TDU C; 3GTP J; 3HOZ J; 1SD5 A; 1T98 A; 1ZG5 A; 2MH9 A; 3OYI A; 2FRH A; 1BJA A; 2GQQ A; 1IV8 A; 4JK1 X; 2VN2 A; 3O2P E; 2BOL A; 2E1N A; 4Y52 J; 2DOD A; 4A3J J; 3S1R J; 3BG9 A; 3PNV A; 1O4X A; 3I71 A; 3BTL A; 3VPR A; 3HB9 A; 1R58 A; 2A68 F; 4A5N A; 1OCZ H; 5FGM A; 2VI6 A; 3NQO A; 2EIK H; 2PMZ A; 3M7G A; 3U1D A; 1WZ2 A; 3PL8 A; 4XRS G; 5K5Q A; 1PUF B; 2LBF A; 5AIQ A; 1LEA A; 1TQM A; 2E1C A; 4PSX A; 4D5F A; 3BR1 A; 4Q47 A; 3PUB A; 3NEU A; 5J40 A; 1SFX A; 2IJL A; 1FIP A; 3MAJ A; 3EDP A; 1Z05 A; 1XTA A; 2LSO A; 1TT0 A; 1Q1V A; 4AID A; 1DGW Y; 3GFJ A; 2E5N A; 2ZNZ A; 5ICG A; 2H8R A; 1B72 A; 1MBE A; 1YTY A; 3GUD A; 2GOX B; 3L7W A; 2JWT A; 3CJT B; 4I09 A; 1HA8 A; 1J2X A; 3F9K A; 2KHM A; 1S7A A; 3G1L A; 3IHU A; 2ZBK A; 4EVI A; 4RB2 C; 1VQ5 I; 1UMQ A; 1FBQ A; 2EZH A; 4PUS A; 2AXL A; 4UVA A; 1BIB A; 4HG2 A; 4KYW A; 1A04 A; 3HRS A; 4NDL A; 4ZYH A; 3DQV C; 3FK7 A; 1FPQ A; 1VF9 A; 4IHV A; 2H1K A; 3SDG A; 3V8J A; 4IPA A; 4CCO A; 2ZJP F; 3ML6 A; 4DOZ A; 5EZH A; 3CMA I; 2F4I A; 5CJ9 A; 1BOB A; 1N78 A; 4JYK A; 1BL0 A; 4AWX B; 2Y30 A; 1W7P D; 2D1V A; 5EEH A; 1ZRD A; 4HV6 A; 2FUG 2; 4ZH4 F; 1LKX A; 4KIS A; 4LJZ F; 5D6F A; 4UB8 C; 1TWF J; 3SEQ A; 1BBY A; 2O8K A; 4BAY A; 1TQI A; 5CLS A; 1YYV A; 1YW9 A; 2ZSI B; 3DTI A; 3B73 A; 4KDP A; 1PJR A; 2WAD A; 5TGT A; 3ZMZ A; 3RQI A; 2G0E A; 3Q9V A; 4A6D A; 1OCO H; 2WAQ N; 1SMY F; 4PJN A; 4RLQ A; 4NB5 A; 1OFC X; 1VQO I; 1K78 A; 1XCB A; 2CQQ A; 2P8T A; 1R71 A; 5CKT A; 4D7N A; 3SQN A; 5LRS A; 2LG4 A; 2ZC2 A; 4G8X A; 1LVK A; 2PN6 A; 4Z2Y A; 4EGZ A; 4OIO F; 3CLQ A; 2MYS A; 4LG0 B; 1O7F A; 4XRF A; 2XAF A; 3BZ6 A; 2JK3 A; 1IUY A; 4XBF A; 2P7V B; 4A3M J; 4U7B A; 1IG7 A; 3GZN B; 3JW4 A; 4DZJ A; 3ZQC A; 1EJ9 A; 1HKQ A; 1FP2 A; 2A61 A; 2DDA A; 3LSK A; 2L9V A; 3UR3 C; 3J7A Y; 5ICF A; 2KIF A; 1LFU P; 4B3A A; 2XSJ C; 1WI9 A; 2H6B A; 2BVL A; 1FOW A; 1DP3 A; 2V4J C; 3H0D A; 3JAM K; 5H20 A; 1X1B A; 3FXU A; 2DT6 A; 3HRT A; 2M8G X; 1Z67 A; 5ICC A; 3SJM A; 2PEX A; 2EK5 A; 1LE8 B; 2VQC A; 2K27 A; 1Y8Q B; 2MAB A; 5CVV A; 1VQ6 I; 1ZEL A; 5F0F A; 2LF7 A; 4CCJ A; 5K7H A; 4KN7 X; 2WAE A; 2GBY A; 2HOE A; 3GYH X; 5HDN A; 1YS7 A; 2YU3 A; 5D5X B; 2K7L A; 2XPV A; 3PIO F; 1N25 A; 4YFN F; 1VQP I; 2VBW A; 3ECO A; 4D5C A; 2OBP A; 2QF7 A; 5D5W B; 1SAU A; 2A3S A; 5JFR A; 5FLX K; 2K9N A; 1Z91 A; 4KNY A; 2I8D A; 2VC0 A; 2R7R A; 5IOY A; 1HLV A; 3QPL A; 2PJP A; 5L3D A; 1Y0N A; 3I3L A; 2RDP A; 4C3J J; 1OYW A; 2XKP A; 4C9Y A; 1LFP A; 3LSH A; 4LMY A; 3I55 I; 5JLW A; 2V79 A; 4YRV A; 2L7K A; 3FXL A; 5FFX A; 4BE1 A; 4BH9 A; 3F22 A; 4N4N B; 3VYR B; 4BL0 B; 2IP2 A; 2Y75 A; 2Q0O A; 1MW7 A; 1XG1 A; 2I10 A; 4CYC A; 1ZQ3 P; 1G59 A; 1WCM J; 9ANT A; 3MVP A; 3TQN A; 2X1C A; 3T1B A; 1WRJ A; 3EQL F; 2DQR A; 3F8B A; 3CUQ C; 4M6Y A; 4XLH A; 1QBJ A; 1MD0 A; 2QKL B; 1O3R A; 3MZY A; 4X6A J; 2D2W A; 1DGR M; 2X6O A; 1JUM A; 1YW8 A; 1RZ4 A; 2QM3 A; 4YII A; 2EFQ A; 3K1M A; 2CQN A; 5E1X A; 4FIS A; 4XRS A; 1HSJ A; 2GIV A; 3DPT A; 2DO7 A; 1IW7 F; 2WA0 A; 5GPA A; 4QPO A; 2KZV A; 2BY3 A; 2M34 A; 4RAZ A; 2O7O A; 3QYE A; 4P1W A; 2P0W A; 4BHC A; 1UG2 A; 3EYI A; 2IGO A; 5D8K B; 2WB1 A; 4B4C A; 2PI0 A; 2CWE A; 3HYI A; 4RDU A; 5M5X J; 2EBI A; 1MBJ A; 1ZAO A; 1JTY A; 2QWW A; 1JJ8 C; 4C2M J; 1E3O C; 1T95 A; 3A02 A; 1SVM A; 3CDL A; 3JSO A; 1Y1V J; 4XL9 A; 3HSE A; 1J09 A; 5KHD A; 4LG3 A; 3KLO A; 1GVJ A; 3OWT A; 2UZK A; 1FY7 A; 2WV1 A; 4ZZD A; 2JRM A; 5ILV A; 4P96 A; 3LAJ A; 1UHS A; 1I1G A; 2L3D A; 1YJ9 I; 2AHQ A; 5BMZ A; 5DUK A; 2XKO A; 2A05 A; 3HBL A; 3MWM A; 2XIG A; 3A03 A; 3QPS A; 4G6Q A; 2W82 A; 1ZTR A; 1AU7 A; 1SC7 A; 2ADU A; 5FKM A; 4AD9 A; 1E0E A; 3JRF A; 4L9T A; 4N4O B; 2RN7 A; 3EUH C; 4AVZ A; 1V54 H; 3K69 A; 2HZT A; 2P5K A; 2HYF A; 3DKW A; 2B7E A; 2VPR A; 4RB0 A; 3LFK A; 1XPX A; 2EWN A; 3ABK H; 5IP7 J; 4II3 A; 4M72 A; 1X1A A; 5HDK A; 3I56 I; 2HPM A; 1JHH A; 4R8H A; 4WX9 A; 1ON1 A; 2AQF A; 1Z3Y A; 2JT1 A; 3TW7 A; 2BXZ A; 3BY6 A; 2EV6 A; 3T8T A; 3J7A O; 2F2E A; 1IC8 A; 2UWM A; 3HM5 A; 4L0Z B; 4RB3 C; 4EJV A; 4ZC3 A; 2OCE A; 3X2Q H; 4KIT B; 3FX3 A; 1H88 C; 3ERM A; 4IOA F; 3TW6 A; 1VQ8 I; 4BDZ A; 4BY1 J; 2VE9 A; 2CYY A; 3E6D A; 1VQ9 I; 3OYA A; 1RR8 C; 2XAG A; 1FSH A; 3KEQ A; 3LSP A; 2KPM A; 1Y1W J; 4IHY A; 2DPU A; 2V1X A; 4QIW N; 2HYG D; 3HKZ N; 1VND A; 3E5U A; 2M7A A; 1MDM A; 2H8W A; 3F3X A; 3JRA A; 5JHU A; 3KEY A; 3FMR A; 3IH2 A; 2ELJ A; 2DDB A; 2HQA A; 2QBY B; 4IL6 C; 4IXA A; 1GV5 A; 4MQ9 F; 1JKP C; 2B0L A; 4B43 A; 3BG6 A; 3L9F A; 3GWZ A; 1DU0 A; 4CCL A; 4Y33 A; 2DYR H; 3OS0 A; 4BE0 A; 3LA2 A; 1AWC A; 1NG7 A; 2RKH A; 2K40 A; 2NOG A; 1RET A; 3CZ6 A; 1VQN I; 2STT A; 1MBK A; 2P81 A; 2FMY A; 1K6Y A; 1MGT A; 4QPQ A; 1QHG A; 2L7Z A; 2HTJ A; 4RM3 A; 1AKH A; 2XGD A; 5LGU A; 1BR4 A; 4Y4R A; 2HVS A; 2ZXI A; 4F55 A; 2DPD A; 5BPI A; 5DCM A; 3FF5 A; 5DUI A; 3PQK A; 3H9G A; 4J00 A; 2EQR A; 2FQ4 A; 3KP5 A; 1RR7 A; 2CU7 A; 4BYY A; 2OC6 A; 2Y0M A; 5FRN A; 2Y2Z A; 4D7M A; 1SAN A; 3FKI J; 3D5S C; 2KJB A; 3F8C A; 2LDU A; 3H35 A; 3OYE A; 2CJJ A; 2XF7 A; 1JTX A; 4XSX F; 1X1P A; 2E2H J; 4ZTF A; 4LLN A; 2H27 A; 1ZGA A; 1OCC H; 3HOS A; 4E7K A; 2XVC A; 5HLT A; 3SZT A; 4B1R A; 1BJZ A; 4G6T B; 4HRI A; 1FX7 A; 4GFB A; 1GV2 A; 5HNH A; 1IO2 A; 2E36 A; 4EV0 A; 4ENM A; 2HOA A; 2CS3 A; 5ED4 A; 4A6E A; 5CQG A; 3HOV J; 4M6X A; 3JAM Z; 1TTY A; 3GCM A; 3VEP A; 3EET A; 2CFX A; 3RZD J; 4UUS A; 3HHG A; 4BHB A; 1U5T B; 2JVH A; 2V26 A; 4I0B A; 5B1B H; 3DLL F; 4I02 A; 1AHD P; 3QWL A; 4MGR A; 4IX7 A; 3AG2 H; 1H0M A; 3DFG A; 4ENK A; 1I1S A; 3LA7 A; 2FBH A; 4I76 A; 2XGX A; 1TNT A; 5FO5 A; 2L7F P; 3IRQ A; 4KJZ A; 2VKE A; 1G3S A; 3JR9 A; 2MSY A; 4ITV A; 5GP9 A; 3GTM J; 2ZXJ A; 5FLX Z; 2F48 A; 1WPK A; 5FRO A; 2R7T A; 4EM1 A; 1F1Z A; 4JX4 A; 2L02 A; 2MFZ A; 1Z21 A; 3BRO A; 3FXK A; 1FP1 D; 2PFB A; 3ECH A; 4EEF G; 4RGU A; 2ID6 A; 2J5O A; 4DYR A; 2KJC A; 1W5T A; 4ESF A; 2M7B A; 3OY9 A; 2ZSH B; 2EIM H; 3V7S A; 1FOY A; 2K4J A; 3OYM A; 4HAM A; 1I27 A; 1HC8 A; 4UUV A; 3TP3 A; 5B66 C; 4IJA A; 5E8G A; 3K70 C; 2B63 J; 5C4J J; 1J9I A; 4U7D A; 2L01 A; 2XGE A; 4A3K J; 1RIO H; 3WTS C; 5E8I A; 2OA4 A; 5FKK A; 1PP8 F; 3LQQ A; 3BTC A; 3TKY A; 1FOX A; 2R7O A; 1REP C; 3ZMV A; 1R22 A; 2ME0 A; 3DBH B; 2DU9 A; 1SD7 A; 2EIL H; 1Z0X A; 5JHF A; 1KON A; 4M3B A; 3OYN A; 1VQ4 I; 1X2M A; 2R7D A; 3PSF A; 2DLL A; 2ZCW A; 2Y0S N; 5IYD J; 1B8I A; 4EMS A; 1K79 A; 3KP7 A; 2CV1 A; 2OD5 A; 4D9J A; 2STW A; 2R7Z J; 2WTE A; 2VUM J; 4XKW A; 3BR2 A; 3ULQ B; 5EGO B; 4XMY A; 2EIJ H; 1OQY A; 3WG9 A; 1UFM A; 5FD5 A; 4IO9 F; 4UHT A; 4Y7N J; 3DPL C; 4NQW B; 2ZME B; 2X6X A; 3CC4 I; 2KQR A; 1TW3 A; 2EA2 A; 4KMU X; 1JKR C; 1Y56 A; 3TO7 A; 1J59 A; 5J4V A; 4AIK A; 5HLI A; 2ZB9 A; 2JSP A; 2DCE A; 2Q2E A; 3P9I A; 3K2A A; 4C2T A; 1JKO C; 5J1Y A; 4MNU A; 1EH7 A; 2M8E A; 3V8L A; 1ETQ A; 3DEW A; 2VBY A; 3NAU A; 2ME6 A; 3GTG J; 1RUO A; 4PDK A; 2CUZ A; 2JSC A; 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