The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
22
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sequence length |
65
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structure length |
65
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Chain Sequence |
SQQIATAKDKYEWLVSRIVKNHNENWLSVSRKMQASPEYQDYVYLEGTQKAKKLFLQHIHRLKHE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
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| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
NMR structural studies on human p190-A RhoGAPFF1 revealed that domain phosphorylation by the PDGF-receptor alpha requires its previous unfolding.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Glucocorticoid receptor DNA-binding factor 1
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| total genus |
22
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| structure length |
65
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| sequence length |
65
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-09-02 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | FF domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CQN A; 1UZC A; 4FQG A; 2E71 A; 2LKS A; 2KIQ A; 2DOF A; 2K85 A; 2JUC A; 2B7E A; 2KIS A; 2KZG A; 2L9V A; 2KFD A; 2DOE A; 2DOD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1GDT A; 4JOM A; 4UVA A; 2VT3 A; 2O0Y A; 1WJ5 A; 2YX4 A; 1H8A C; 2LRE A; 1MBG A; 1XSV A; 2LSO A; 3ZQ7 A; 1P4W A; 2WB1 A; 3NQO A; 2UXX A; 1X3U A; 3K9T A; 3G4S I; 1EH8 A; 3CUQ B; 4XLP F; 1Y56 A; 4A3J J; 2KJC A; 4NQW B; 2X6Y A; 2DCE A; 2DJI A; 4A3B J; 2XAQ A; 1DGR M; 1TW3 A; 2OCE A; 1U5T A; 2E19 A; 1XGN A; 1LEB A; 1AKH A; 1ZGJ A; 2E60 A; 1X58 A; 1RES A; 1K4S A; 3QU6 A; 3KX2 A; 3ZR8 X; 4E7S A; 2XUB A; 3HRM A; 2DPU A; 2LMD A; 4I01 A; 1JHH A; 1Y39 A; 2CV2 A; 1FBU A; 2QGU A; 2W7N A; 2JA8 J; 1UJ8 A; 4E7L A; 1BI0 A; 4H4K C; 1T56 A; 2PMZ A; 3CUQ A; 4BS9 A; 3ONQ A; 2STT A; 2NXN B; 3DU6 A; 4DBR A; 2X4H A; 1HQC A; 1BM9 A; 3WTS C; 3BP8 A; 2VJ5 A; 2ZB9 A; 1TWC J; 1B72 A; 1R5G A; 4A12 A; 2GM4 A; 1GXP A; 1MJA A; 2JMW A; 4G94 A; 1IXS B; 4HX8 A; 1J75 A; 1ZLK A; 3WU2 C; 2HVS A; 4HEA 2; 5LRR A; 4A3E J; 1Y1W J; 5FD5 A; 4LB6 B; 1R36 A; 2LG4 A; 3ZMV A; 4XLE A; 1SD4 A; 1GVD A; 3I71 A; 4YFK F; 1E3O C; 4BJT A; 3S1Q J; 4CCO A; 1Y6I A; 1XPX A; 2FBK A; 3H9Q A; 3E6C C; 1ZK8 A; 1I5Z A; 2DT7 B; 2MSY A; 2YR2 A; 4IQJ A; 4FHT A; 2COB A; 2HTJ A; 3CMM A; 3RSN A; 4C3J J; 2FD5 A; 4LK1 F; 3GTO J; 1K78 A; 3ZQC A; 4IKF A; 2R7Q A; 2CWE A; 4FCY A; 4M6X A; 4EJW A; 2BY2 A; 4NB5 A; 3JRG A; 2Z33 A; 2HOT A; 2Z2S B; 2BY1 A; 1LJ9 A; 1MIJ A; 2DA7 A; 3OMY A; 3WE2 A; 1SVO A; 3OV8 A; 3FXU A; 4CA0 A; 3FXO A; 3WTY C; 1VQ4 I; 2XGX A; 5HNF A; 2L9R A; 1TL8 A; 2LLK A; 3L9F A; 2OZU A; 1YO5 C; 1D5V A; 2FEZ A; 2G0E A; 4BHC A; 2ECC A; 4ABZ A; 2IGK A; 2HS5 A; 2X48 A; 4BQQ A; 1G8X A; 2DMN A; 2CGP A; 1WCM J; 1SAU A; 1TNS A; 3RKY A; 3H5A A; 2M3A A; 4IX7 A; 2R7T A; 4KIT B; 2DOD A; 2I8D A; 3UKG A; 4RAG A; 5A2Q K; 1D0X A; 1KON A; 2WAF A; 3Q0U A; 2EZK A; 2KIM A; 1EKE A; 4XKC A; 1JGS A; 1YI2 I; 1S7E A; 1ZEL A; 1P4A A; 2F4O B; 3SDB A; 1VQO I; 4XON A; 1S6L A; 3SJM A; 3KEY A; 2DDA A; 1JT0 A; 2RGV A; 4M3F A; 3R61 A; 4QPO A; 2O8X A; 4LD5 A; 3OIQ A; 4GO1 A; 4D9J A; 1XS9 A; 2BVL A; 5DCM B; 2XC7 A; 4EMS A; 1NH3 A; 2DQR A; 1BR2 A; 4XQF A; 1PP7 U; 2ADU A; 4IZZ A; 3M07 A; 3CCV I; 1W36 C; 1CGP A; 1V3F A; 3FXR A; 3TO6 A; 3ABL H; 3KP5 A; 5H2F C; 9ANT A; 5B66 C; 2R7W A; 2VLA A; 1T6S A; 2HOA A; 2NS8 A; 5BS6 A; 1P7I A; 4AIK A; 1JJ6 C; 3S2H J; 2KIS A; 1D5Y A; 2VOO A; 4IRG A; 4AWX B; 2F2E A; 4CYC B; 4A3M J; 1QZZ A; 3C1D A; 3BC8 A; 5K5O A; 3NAR A; 1OJL A; 2HYF A; 1YW9 A; 2HQA A; 2D2W A; 2OTL I; 3DCF A; 2ELJ A; 4FE4 A; 5CVI A; 1JUP A; 5CLS A; 1SFU A; 3A01 B; 3WGH A; 4L0Y B; 3DTE A; 2Y2Z A; 5GTI C; 1RIO H; 1UFM A; 5IYB J; 4ESB A; 4YG2 F; 1FYL A; 1JT6 A; 1RKW A; 2DA5 A; 3KEQ A; 2KHM A; 3OYK A; 1SVM A; 5KAI C; 4A3I J; 3RQ4 A; 2ZME C; 1MGT A; 2G9W A; 2R5Z B; 1A31 A; 4WX9 A; 1R49 A; 1X1B A; 3AG1 H; 5GP9 A; 2VKH A; 2NOG A; 3M3Y J; 5LHI A; 4ZDO A; 2HOE A; 4LLG F; 2F5D A; 3MZY A; 3QYE A; 5HLT A; 3QWL A; 2XRL A; 4CYC A; 3S17 J; 5TIS C; 1WJF A; 2QYO A; 4ZDP A; 3AFH A; 4OAZ A; 4DZJ A; 1B6A A; 5EJC A; 2JVG A; 3OSG A; 4AM3 A; 3IL2 A; 1I3A A; 1VND A; 1JJ8 C; 4O5V A; 2FU4 A; 3FIS A; 5E1X A; 4L9T A; 3A01 A; 2D1H A; 3BR1 A; 3JW4 A; 2ACJ A; 4IEJ A; 2QA4 I; 2KRF A; 1T2K A; 4RLQ A; 2HFH A; 2JPB A; 3KYL A; 2EIJ H; 1FC3 A; 3I5U A; 3HDD A; 4A2U A; 2FBI A; 2XKP A; 2M8G X; 2WAD A; 4MQ9 F; 1OCO H; 2WB1 N; 5B5E C; 1VQP I; 1K83 J; 4N9I A; 3S8P A; 1YQA A; 4HNT A; 3JRH A; 1Z1D A; 4J01 A; 3CLO A; 2AQF A; 2JA6 J; 2DTZ A; 1RKT A; 2Y9Z A; 1J0R A; 4BHB A; 3BG6 A; 4BQN A; 3RDI A; 2FX0 A; 3WHB A; 4FTH A; 2W85 A; 1D8K A; 4IHY A; 2ZSH B; 3DPL C; 3GLL A; 4BNC A; 1SEU A; 2QSG X; 1VZ0 A; 3IV5 A; 1VF9 A; 2OJE D; 4A3F J; 3ZN0 A; 5M3M J; 1ZG3 A; 1OYI A; 4OMZ A; 2W57 A; 4NDL A; 2DU9 A; 1YX5 A; 4BDY A; 1MW7 A; 2RRE A; 2Z16 A; 1Z0X A; 4JX4 A; 2PMZ N; 2MD5 A; 2P8T A; 4HDU A; 1LDJ A; 4RB1 A; 5LHG A; 1V5G A; 2O3F A; 2D45 A; 1CQT A; 1TW2 A; 2IA1 A; 1WWX A; 2X6W A; 3BWG A; 3C2G A; 3HOZ J; 1UHS A; 2BZT A; 2IA2 A; 2DAO A; 4L0Z B; 3IHU A; 2ZJ2 A; 1AA7 A; 2R7O A; 3FHN A; 2E1C A; 5FLX Z; 1AWC A; 3WOD F; 5M5Y J; 3DPU A; 3MQ0 A; 2EH3 A; 4MNU A; 2BV6 A; 1TWF J; 4XLF A; 1W4M A; 1T95 A; 1JUS A; 2ICW G; 3DFG A; 3FMS A; 2OTJ I; 2CUF A; 5HNH A; 1LFP A; 3N4M A; 3HRS A; 2GAU A; 3M8E A; 1KZH A; 3AG2 H; 4XLH A; 4XN3 A; 5M5W J; 1U8R A; 5EZH A; 3T8T A; 3HIF A; 5TJJ A; 1TT5 B; 1X4O A; 3DPT A; 2WWY A; 3QOD A; 1DPU A; 3ECO A; 5E79 C; 1TWG J; 3IUO A; 3HC7 A; 5ILS A; 3KET A; 3ZMD A; 2IVM A; 3FXJ A; 3IKT A; 4PSX A; 1LFU P; 3MFK A; 1HC8 A; 3PNT A; 2LKP A; 2ZME B; 2MLG A; 3BPX A; 2HR3 A; 3ASN H; 4ZZL A; 4B4C A; 2DA3 A; 2M1B A; 4LIV A; 2LK2 A; 1WPK A; 1Z67 A; 2WAE A; 1X2N A; 3K4B A; 3LSG A; 4XLC A; 2J5P A; 2G7H A; 2FNA A; 2P7V B; 2V26 A; 1JXS A; 2TRT A; 1TLH B; 3BG7 A; 2XF7 A; 3F6O A; 2GXA A; 2ZC2 A; 3HOS A; 1YS7 A; 4XN0 A; 2V1U A; 1A04 A; 1ONV A; 2K3F A; 1OFC X; 1E3P A; 1XGM A; 3OL3 A; 4O3M A; 2DN0 A; 2L01 A; 3KZY A; 4CCM A; 3HZJ A; 2YU3 A; 1D1A A; 1BOA A; 1PP8 F; 3O6B B; 4JYK A; 1YHQ I; 2DK8 A; 3PUF A; 3K0L A; 1H9G A; 3L00 A; 2GA2 A; 5D6E A; 3OS2 A; 4I99 C; 1WVR A; 3IAS 2; 4ZTF A; 1K4T A; 1N77 A; 3VB2 A; 3T8R A; 3CLQ A; 1JKP C; 2IW5 A; 3I59 B; 5IP6 A; 2KFD A; 1T0F A; 3BJA A; 3H0G J; 4I02 A; 4XNF A; 1TWH J; 4Y15 A; 3HJE A; 3WGG A; 2W82 A; 5ICG A; 4C30 A; 3OYH A; 2XGE A; 1R6R A; 1IW7 F; 4BAC A; 1H89 C; 2RKH A; 4WXC A; 1LFB A; 2LBF A; 3TKY A; 3LAJ A; 1LVK A; 2DFE A; 4WXH A; 1JUM A; 3GTQ J; 4A93 J; 3S3O A; 2EZI A; 3TP3 A; 3AG3 H; 3S32 A; 5CPR B; 3OR2 C; 2BW3 A; 2QQB A; 3U21 A; 5DEQ A; 1JHF A; 1VQ9 I; 2DW4 A; 3I59 A; 3P5J A; 3RKQ A; 1RR8 C; 3FKJ A; 3WHC A; 4D7N A; 1Z3X A; 4CO8 A; 3IAM 2; 3DLA A; 4N4N B; 1IN7 A; 3NEU A; 2C6Y A; 2WY7 Q; 3DBL B; 3I4P A; 3BJ6 A; 3L2R A; 5CVJ A; 1MMG A; 2RVC A; 3GTK J; 4BBR J; 2WAQ A; 3HTS B; 2DOE A; 4BU2 A; 3RJP A; 2LC2 A; 4DNC A; 3HOV J; 2TCT A; 4WCG A; 2XDV A; 3FXL A; 1KQ0 A; 4D7M A; 2JQ7 A; 3ZMU A; 4L9V A; 5LD2 C; 2FNP A; 2KLO A; 2CQ7 A; 3GEZ A; 3V7C A; 3G71 I; 4R79 A; 1IN5 A; 4I0A A; 3ZGK A; 1DU0 A; 3EUK L; 2NVT J; 1JKQ C; 2VBW A; 3BG3 A; 3GTM J; 3PO3 J; 3P9K A; 3FZV A; 3FIW A; 1MMN A; 2PG4 A; 3EUH C; 3ZMS A; 5DYM A; 5EG0 B; 4OAY A; 1XSX A; 2A5Y B; 4ON0 A; 2V9V A; 1BIB A; 3ZRG A; 1HA8 A; 2EIK H; 4A69 C; 3DEU A; 2ZXW H; 3F8F A; 4OWR B; 3CUO A; 2UXN A; 4L9J A; 2IGO A; 2UZK A; 2LFB A; 5FLV A; 3CCL I; 3CCU I; 1ZN2 A; 1FOX A; 1R5H A; 4LMY A; 4GDF A; 1QQI A; 2JTV A; 1MSE C; 1B4A A; 5K7Z A; 5DUI A; 2DDB A; 3DQV C; 1QPI A; 2B9S A; 4AD9 A; 3V8K A; 5DDG A; 4UY8 I; 2DQL A; 1TZL A; 1GV5 A; 2FRH A; 2HGC A; 4XIC A; 3OYD A; 3DTK A; 2DO7 A; 4HZF A; 3MKW B; 4EGZ A; 1DPR A; 3DU5 A; 4XL9 A; 2XAS A; 3E5X A; 4AIJ A; 2QBY B; 5GAE J; 2QLZ A; 2GIV A; 2HTS A; 5DM6 F; 1WI3 A; 4FQG A; 2P81 A; 4DYQ A; 2IGM A; 1F4K A; 1YS6 A; 2PN6 A; 1U3E M; 1UG0 A; 3CUQ C; 5C4X J; 2QSF X; 1DGW Y; 3TW6 A; 1HXD A; 1EH6 A; 2BVM A; 3QOE A; 3TP0 A; 1KA8 A; 2F5F A; 4B09 A; 2IP2 A; 2YU9 J; 1MBE A; 4XID A; 4DQ2 A; 1POG A; 4ASN A; 1R1T A; 3CJT B; 1VQL I; 2HU9 A; 2L02 A; 1UG2 A; 2K9N A; 3L09 A; 4IXA A; 2QEN A; 2NVY J; 4D0P A; 3K1N A; 3QAH A; 3Q0V A; 5F08 A; 1QU3 A; 1O3Q A; 4C2T A; 2L7Z A; 1VQ8 I; 3JRA A; 4XRS G; 2CS3 A; 2E1O A; 4FT8 A; 3PSF A; 4KN4 X; 3OYJ A; 3CDH A; 3M1E A; 2VKD A; 3WU0 A; 3K1M A; 2HNH A; 1DP3 A; 3HXL A; 1KU3 A; 3K4L A; 1FOW A; 2CUE A; 3F0C A; 3JRI A; 2WV0 A; 3GFI A; 2V79 A; 1ACI A; 3ZXS A; 3U2R A; 2MYS A; 1Z91 A; 3Q3S A; 2PX9 A; 2EWN A; 3R0J A; 3W2V A; 4QTR A; 4EJT A; 4NC7 A; 5DV5 A; 1UHM A; 3CC7 I; 3OOP A; 5IPA A; 2A68 F; 3EET A; 2XAU A; 1G59 A; 3BTC A; 1Z05 A; 4PK4 A; 1NK2 P; 1V5F A; 1ZGW A; 1FYM A; 1IN4 A; 3B6A A; 4DOZ A; 2GXG A; 1MZB A; 1FWZ A; 4G8X A; 1HLV A; 1OPC A; 1O3R A; 2LRD A; 3JTH A; 1MSF C; 3OYA A; 4HG2 A; 4ZYE A; 1PJR A; 1XTA A; 2KZV A; 5F0F A; 3I58 A; 4BAY A; 2BXY A; 3ESW B; 3MEX A; 4NC6 A; 3TGN A; 4BXU A; 2E71 A; 2E1M C; 3E6B A; 4G6T B; 2M7A A; 3GW2 A; 4A3L J; 2D5V A; 2XB5 A; 3JAM Z; 1G3Y A; 1WJA A; 3W6J B; 1P2F A; 3ASO H; 3OYE A; 5LGN A; 2BY0 A; 2Q2E B; 2RV8 A; 2GA1 A; 3LSI A; 2M30 A; 3UNG C; 2KKO A; 3B6C A; 4CCK A; 4FET A; 1LNW A; 3PFI A; 1I1S A; 2NVX J; 1K7A A; 3J7A O; 3CJN A; 4GCV A; 5L3F A; 1HF0 A; 3J81 K; 4EJU A; 3I4N J; 3RIR A; 4OIR F; 4XLN F; 4OIQ F; 1S7O A; 1I3Q J; 3HSR A; 4HSR A; 1KU7 A; 3F23 A; 3FXM A; 1R23 A; 3L1P A; 1WFX A; 1SD7 A; 2V9P A; 1STZ A; 3RKW A; 2H1L A; 4PDK A; 4UVC A; 2E5Z A; 4A0Y A; 2WC2 A; 5LFA A; 3BTL A; 1AKH B; 4ZYA A; 2CMP A; 2KDZ A; 3IH2 A; 5IOY A; 2Q2E A; 5IT9 Z; 3GTJ J; 2MAB A; 1V5E A; 3R0A A; 2OC6 A; 1OCC H; 2HQR A; 3BJO A; 2GQQ A; 5E3O A; 1MNM C; 2O6G E; 3KIO A; 1A5J A; 4M9Z A; 2R7S A; 2A5W A; 1XCV A; 2BOL A; 1D3Y A; 3ERM A; 3KP7 A; 4CIC A; 3CO6 C; 1W7P A; 4DZP A; 4LIT A; 1X3W B; 2HQ5 A; 2Y9Y A; 1R22 A; 1MDM A; 2EZL A; 5EEG A; 3VPR A; 4BYY A; 3WTX C; 1OYW A; 2W00 A; 3OY9 A; 3I55 I; 5M3F J; 3I4M J; 3F8N A; 2VAS A; 4BE0 A; 3QPT A; 3DXJ F; 1SAN A; 3KFW X; 3MMY B; 1BR4 A; 1ZKG A; 2EB7 A; 1B72 B; 2K9M A; 2CU7 A; 3D5L A; 4IVN A; 3RYR A; 2R7V A; 1T08 B; 2ELH A; 3L2V A; 3CC2 I; 2Y0M A; 4HW0 A; 4UV8 A; 2DPD A; 4WXD A; 3GTP J; 1G6N A; 2CFO A; 2WAQ N; 4HOB A; 3G73 A; 1W36 D; 2KDO A; 1USS A; 2O5R A; 1RUO A; 3LAP A; 3SHF A; 2YUS A; 4C9Y A; 2A05 A; 4EJV A; 3J7A Y; 2GIZ A; 2W48 A; 2KPM A; 5K1Y A; 2KIU A; 3E97 A; 2X85 A; 1LPQ A; 3H35 A; 3OS0 A; 1RI7 A; 1ENH A; 1K78 B; 3HOT A; 1W0U A; 4BUP A; 4B44 A; 4Q47 A; 1LB2 A; 5ERI A; 4MQV A; 4I0B A; 5ILV A; 2EV5 A; 1TBX A; 1Y0N A; 1CF7 B; 2ZBK A; 4RGX A; 2XB0 X; 1KQ8 A; 4LG3 A; 2P6T A; 1BI1 A; 1HW5 A; 2DA2 A; 2LY9 A; 1Q1H A; 1WRJ A; 3JR9 A; 2P6S A; 5FGM A; 4EVI A; 4XSX F; 4L5E A; 1BOB A; 1BJZ A; 2RC4 A; 4B1R A; 5FD6 A; 4XOR A; 1AHD P; 3LQQ A; 4JBA A; 4NNJ A; 4I2O A; 4RGU A; 1IJW C; 3BG5 A; 4CYD A; 2HVR A; 3K2A A; 2DOA A; 2E1M B; 3SZP A; 4IHS A; 2F6C A; 2L3D A; 3Q5F A; 1VFC A; 1D8J A; 1FIA A; 3G3Z A; 1EV7 A; 3W2W A; 4IL6 C; 2JK3 A; 2CQN A; 2MH2 A; 2GWR A; 3ZQG A; 3KP4 A; 2ZXJ A; 2HYG D; 2I5U A; 1RPW A; 1CF7 A; 2QSH X; 2X1C A; 1P6R A; 4BY7 J; 4A5M A; 1WI9 A; 2VQG A; 5D5W B; 1LUJ B; 4I7H A; 2V1N A; 5J6X A; 3ZCO A; 3Q9S A; 2HPM A; 2ME0 A; 2JZY A; 1JKR C; 3LFU A; 5FKM A; 1ETX A; 1T38 A; 2HYJ A; 4V19 K; 2OQG A; 4XKB A; 1VQK I; 2OAZ A; 3QOP A; 4G6Q A; 1WJB A; 4L9N A; 3ROU A; 3R60 A; 2NNY A; 3GF2 A; 3G1L A; 4OIP F; 2A07 F; 2HZD A; 1ZRE A; 5FJ8 J; 3GVA A; 4CH7 A; 4G7Z F; 1HOM A; 2FE3 A; 1Z77 A; 5DM7 F; 1WSU A; 2IS2 A; 1YYV A; 5EGO B; 3HTU A; 3DEE A; 4AYB A; 5CVV A; 1NTC A; 2GOM A; 2NOJ B; 4PCQ A; 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