1EH6 | Genus

Total Genus 43

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	43
sequence length	177
structure length	168
Chain Sequence	CEMKRTTLDSPLGKLELSGCEQGLHEIKLLGEVPAPAAVLGGPEPLMQCTAWLNAYFHQPEAIEEFPVPALHHPVFQQESFTRQVLWKLLKVVKFGEVISYQQLAALAGNPKAARAVGGAMRGNPVPILIPCHRVVCSSGAVGNYSGGLAVKEWLLAHEGHRLGKPGL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
publication title	Active and alkylated human AGT structures: a novel zinc site, inhibitor and extrahelical base binding. pubmed doi rcsb
molecule keywords	O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE
total genus	43
structure length	168
sequence length	177
ec nomenclature	ec 2.1.1.63: Methylated-DNA--[protein]-cysteine S-methyltransferase.
pdb deposition date	2000-02-18

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01035	DNA_binding_1	6-O-methylguanine DNA methyltransferase, DNA binding domain
A	PF02870	Methyltransf_1N	6-O-methylguanine DNA methyltransferase, ribonuclease-like domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.10.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Arc Repressor Mutant, subunit A	Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain	1eh6A02
3.30.160.70	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Double Stranded RNA Binding Domain	Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase domain	1eh6A01

2COMA 2Y48A 1JXSA 1QPMA 4GXOA 3IRQA 1O7LA 2V79A 3TKYA 2VN2A 3ZMUA 3TO6A 3JTHA 4ZH4F 4FX0A 4UV9A 1Z1DA 4A0ZA 1NHAA 4A5MA 1B59A 1Z91A 2PBIA 4BHPA 2WV0A 1I1SA 4XBFA 3P9IA 4HX8A 3F8BA 5D4SA 2GA2A 4MQVA 3KLOA 2M30A 3HIFA 2V9VA 4LB5A 2VBWA 4EV0A 3HHHA 2YX7A 1DP7P 4ON0A 2G7HA 3J80Z 4ZYDA 2DI3A 1EH7A 1U3EM 2VE9A 4A6DA 1HXDA 3QP6A 4IRHA 3WGHA 4EGZA 4UVAA 3RI4A 3DPTA 1U5TB 5JVTA 2PG4A 2HQNA 4MHGA 1LNWA 2DQLA 1QZYA 1FPQA 3BPVA 1XDSA 2PMUA 2EA2A 4PZJA 4KNYA 2RV8A 4LFUA 4HLYA 2V6CA 1LEBA 1BM9A 5DCMB 4OIPF 3EUHA 5LLQA 2RQPA 3J7AO 1IXCA 5L3EA 5E20A 5ICEA 3PFIA 2MLKA 4IHTA 4HAMA 2RGVA 5HOOA 1O3RA 2H6CA 2F5EA 5L3CA 3FMSA 4BAYA 2A07F 1FZPB 2IA0A 5HLHA 4O5VA 1Z6TA 1W7PB 3M8FA 2O6GE 4PGHA 1IZ1A 2FMYA 4Y13A 4ENMA 3I64A 2EFNA 1HKTA 4N9IA 2FBKA 2IT0A 3LA7A 2HFHA 4HX4A 1BBYA 1PDNC 4HLXA 1R23A 3E6DA 1ULYA 1MZBA 3HOTA 2ISYA 3RYPA 5E17F 2GIVA 3KE2A 1XGOA 1FX7A 1SD7A 3W6JB 4TV7A 1W4MA 1UHWA 4H0EA 1LJ9A 3MQ0A 2A68F 2NNNA 1KQ0A 3KP6A 1SAXA 4HBLA 5BOXA 5IT9Z 1R7JA 2MLGA 4U7BA 2Q0OA 3H3UA 4UXNA 1O3SA 3F6OA 2RDPA 1TW3A 4Q5SF 1HW1A 2IA2A 2VC0A 2TDXA 4EQQA 4WXDA 2H27A 2OAZA 3C3WA 1GVJA 2XASA 4EJWA 1OPCA 3CLOA 3WTZA 1WQ2A 2HDCA 2EFWA 4HF0A 3J80K 2RNJA 2EJRA 1ZN2A 2ZNYA 2IA1A 1XGNA 2MH2A 2ZCWA 4OINF 4U0YA 2HTSA 2K27A 4WF2A 2DTRA 1V3FA 5FFZA 3OV8A 3GXOA 1WWXA 1J59A 5LHGA 4U7DA 4OOIA 1UCRA 3I71A 3FM3A 3F23A 3JAMZ 5E18F 3GEZA 4E70A 4RGXA 1SD4A 1ZREA 1IUYA 3C18A 3LSTA 3JSPA 3V8JA 4XLPF 2ZMEA 2A69F 2L01A 2FRHA 2E1CA 2HTJA 4ENNA 4HYEA 1FWZA 5D6FA 1J7KA 1XD7A 5D8KB 2NS0A 1IRFA 2Q2EA 3F6VA 1BJAA 1GXQA 2BEOA 2DQRA 1ZGAA 3FWEA 3FXQA 2B0LA 2PQ8A 2MA3A 2XIGA 4I98B 2P5LC 3GO5A 2YU3A 4XSXF 2E7XA 2C6YA 2MC3A 1OKRA 5HS9A 4MQ9F 2DAOA 3JTGA 5ICCA 2YPRA 2A61A 2L54A 1G3YA 5CJ9A 1BOAA 1IN7A 1YO5C 2F2EA 4A12A 2XV4S 4MGRA 3WU1B 1ZG3A 3QPTA 4ZZDA 5HDGA 5CVRA 4RGUA 1LQ1A 4RS8A 2GA1A 4M71A 4BH9A 4PGGA 5D5XB 5ICGA 1S3JA 3HUGA 3GFJA 1XSDA 1U6GA 2QBYB 1RIOH 5FD5A 4MTEA 1FBUA 2FXAA 2FE3A 1DDNA 5DCFA 1XMKA 1TQIA 3I59A 1WRJA 3RKWA 2VXZA 5D4RA 4KIBA 5CVIA 5BMZA 1SD6A 4K2EA 1ZAOA 2NYXA 2HEOA 3AAFA 3WTYC 4RB3C 2QQBA 5A2QZ 1SMYF 2P7CB 4A2UA 1B1BA 4EM0B 3GFIA 4LLGF 2DLLA 3M9AA 1T39A 3ULQB 1B4AA 1KU3A 1SFEA 2XKPA 1QGPA 1WKMA 2ACJA 4UHTA 1R58A 4RGSA 3B73A 4L5IA 2RC4A 4EJOA 3I53A 4B09A 5H6QA 3ZN1A 5LGTA 3F3XA 3K1NA 1EV7A 4DQ2A 4HQMA 1BN5A 1LDDA 5LBQA 4FX4A 4Q4ZF 1IXSB 4M9SA 3COAC 1BIBA 1T0FA 3RJPA 1HQCA 4FHTA 4IRIA 2ZMEB 2UXNA 3RDIA 3RPUA 1SMTA 2JSCA 1QNTA 5CVUA 4M6YA 3ECOA 3LQRA 2E1NA 3FXRA 3ERED 1XMAA 2Z5UA 5TJJA 1JE8A 3MAJA 3E6CC 3KP2A 1F5TA 1G3TA 1FP1D 2E7WA 4EMSA 1B6AA 5L3DA 1JHFA 2UXXA 2QENA 2M5WA 2ZJ2A 2XROA 3NEUA 1EH6A 5FLXK 2ETHA 4IHSA 2CYYA 2BE5F 2LF7A 2DBBA 1RZ4A 1IAWA 4L9TA 2BYVE 4P5OA 4P9UA 4Q47A 4YIIA 3KP3A 5LEJA 4EM2A 2VBYA 2HZTA 4RAYA 2RKHA 1R1TA 3V7CA 3ZP5A 4G7ZF 5E8IA 3QRFF 1XN7A 1S8NA 3IC7A 1XCBA 2DFIA 3GUDA 5FO5A 2EA4A 4D0PA 4ZYGA 5F6FA 4OMYA 2KIFA 1ZRFA 3DEUA 1W5TA 2V1XA 1F4KA 4GYIA 4EGYA 3REOA 5JR3A 1TNTA 5K5QA 4LMYA 4A5NA 2K02A 3MWMA 1BI0A 2ELHA 2HKXA 4AIJA 3I59B 2HQRA 2K7LA 4IVNA 2QQAA 5DD8A 3T8RA 3V8LA 1XSXA 4ASNA 2JTVA 4KUMA 3BZ6A 3T0YA 1FT9A 1OYWA 2MBFA 4L9JA 5ED4A 2ESHA 1T38A 1MGTA 5EEHA 1H9TA 4M9ZA 1E17A 3WGGA 4O3MA 2FMLA 4CICA 1VTNC 2O3FA 2KIMA 3LWFA 4UUVA 1GHCA 1XSVA 3RKYA 1TTYA 2DW4A 2W85A 1PP7U 2A5YB 3OOPA 3K69A 2MD5A 5JI6A 2EB7A 1QQIA 2JT1A 1R1VA 2ZBKA 5HS8A 3EETA 4FT8A 4HW0A 3F8FA 4HDUA 4EJVA 2IP2A 5ILUA 1YYVA 2J5OA 1T2KA 3RYRA 2ESNA 3ABTA 1KU2A 4P96A 3CO6C 3O2PE 1R5GA 3TDUC 3I58A 5ILVA 2EV0A 1HKQA 2BGCA 1T6SA 2UWMA 4KT5C 2QQ9A 2STWA 1ZRDA 3QP5A 1AOYA 1XGSA 1TW2A 2OQGA 4U0VA 1D8JA 3H3ZA 3ELKA 3K2ZA 1H9GA 4YG2F 2DU9A 1KYWA 1ZYRF 4HV6A 2GQQA 3SFZA 3R60A 3DFGA 2EK5A 2HYFA 4N0BA 3D5LA 3IKTA 4G6DA 1H0MA 4KFCA 1OR7A 3CJNA 3VB2A 4HF2A 1D3YA 4LG0A 1E2XA 4WWCA 2H09A 2Z99A 4LLNA 1O57A 3K0LA 1BI1A 3N4MA 2HGCA 2VOOA 1U78A 3BOQA 2X0LA 5DYMA 1R1UA 4OMZA 2IVMA 5F1RA 1JHHA 1IXRC 2QBYA 4WCGA 1LEAA 1OYYA 4RB0A 1LDKB 2PI0A 4L0ZB 3L7WA 4KN7X 2H94A 4RB1A 4CYDA 4UNOA 2LKPA 3VFZA 2HYGD 3JSOA 2F5CA 2LDUA 5L3GA 4F7ZA 2Y75A 2XRNA 1TBXA 3BJ6A 3BJOA 1D5VA 1K7AA 4LGWA 1QBJA 2HOEA 2M87A 3BWGA 3M7GA 2L02A 3MEXA 3R6SA 3P9CA 3E3VA 3C1DA 2OZUA 4HOBA 1I6XA 5CVJA 3E97A 4I7HA 4XRFA 1ZG1A 4I09A 4MNUA 4HZFA 3FM5A 5D5VB 3F8CA 4QWQA 4MTDA 5E8GA 3LA3A 3BDDA 2CO5A 4ZZLA 3EQLF 1P92A 3HTUA 3P9KA 4YFNF 4JBAA 3M8EA 4G7HF 4GCVA 3TOBA 1HSJA 4IJAA 2P6TA 4YFKF 3SHFA 4BQAA 1L0OC 4EJTA 3J81Z 2VBZA 1YW8A 1YQAA 5HLIA 1T98A 4M74A 3WE3A 3LAJA 5CLSA 1YS6A 5HVQC 1MJAA 2XUBA 5ERIA 5E1WA 4BHCA 5FB2A 3FX3A 5E1XA 4LK1F 1Q1HA 1F1ZA 3BPXA 2DK8A 5BPIA 3GVAA 3DF8A 3ROUA 2WWYA 1O3QA 2QUFA 4LG0B 3T5XA 3M1EA 3K1PA 3R61A 3CUOA 4IXAA 4WK8F 5J8FA 2XAJA 4G6QA 3ZMSA 3LQQA 1P6RA 2KKOA 1J9IA 1DPUA 3ZN0A 4N9HA 1UB9A 2D1HA 2W25A 3TGNA 1ONVA 1ON2A 3W6KB 4L9VA 3ZMVA 5DUIA 1ZGJA 1Y0UA 2P5KA 6PAXA 4ZYHA 5IT9K 1YTYA 5BPDA 5HLGA 4BYYA 3E5QA 2XGXA 5KK1A 3L00A 2ISZA 2XAGA 3GFLA 3WTUC 2WC2A 3ZMTA 3F72A 3WU0A 4ENKA 1ZRCA 4HF1A 1CGPA 5CYVA 3KETA 4OIRF 3T1BA 2L3DA 4KYWA 3L2CA 2JPCA 2VE8A 1CF7A 2IW5A 2P5VA 3QU3A 1KU7A 1J2XA 4WX9A 3VODA 5LEKA 4G8XA 4IPAA 1V4RA 3CUQC 3R0JA 2O61A 4IRGA 4M6XA 3HHGA 1UFMA 2FBIA 2LNBA 2KJBA 2FEZA 1O7FA 3DV8A 4Q48A 2GAUA 3JAMK 3MCZA 5FGMA 2XVCA 4R79A 4G94A 3LFKA 3WODF 3KCCA 2VC1A 4U88A 3LAPA 4QLCU 4A0YA 2PLYA 5KVRA 3E6MA 2KIUA 3QOPA 4RB2C 3I4PA 1FOKA 4AIHA 2STTA 3KEOA 4NB5A 3FMRA 3O3KA 1IN6A 1MKMA 4AVPA 2ZNZA 2K4BA 1S29A 3CUQA 2IPQX 1FBSA 1KA8A 3ML6A 2YSRA 3U9GA 2W24A 1J75A 3MFKA 2X4HA 1B9MA 4EVIA 4LLLA 5AIQA 4ZYEA 3BROA 2K4JA 1I27A 4OIOF 1UHMA 1HW5A 2ADUA 5DD4A 3SXYA 3DQVC 1I5ZA 2HWVA 1GXPA 1PUEE 2IJLA 3RKXA 2HS5A 5D8LB 1S6LA 1X3UA 2PN6A 3RIRA 1IW7F 1XGMA 1WSUA 5LGNA 3E5XA 3WTVC 2OU2A 3KP7A 4CHUA 1B9NA 3ZMZA 2R3SA 1FP2A 2VT3A 1XCVA 1KQ8A 2F5FA 4I0AA 2NNYA 5DUKA 1R5HA 4JK1X 1MD0A 1QO0D 2BV6A 3PQKA 1YIOA 2J5PA 3CO7C 4NQWA 1YS7A 2CGPA 3ECHA 4KN4X 4KMUX 2G7UA 3KZYA 1IN5A 1W5SA 1IF1A 1USTA 1ZARA 2ZKZA 2UZKA 2K86A 2DPDA 3GW2A 5A2QK 3HTSB 1CF7B 5BS6A 2A6EF 1USSA 3I0TA 1FBQA 1P4AA 3GFMA 3HRUA 1ZHFA 3JW4A 2O8XA 1YFHA 4KIFA 4M72A 2PEXA 3T8TA 5LHHA 4A6EA 3BP8A 3K1MA 1KGSA 3GZ6A 3HSEA 2DO7A 4G9YA 4L18B 3GZ5A 2V1DA 4BXUA 5L3FA 1ON1A 3H92A 3IKVA 1RUOA 2AXLA 4UV8A 1FC3A 1STZA 3WGIA 4HV5A 5TRDA 3ZQ7A 5ILSA 2WTEA 3E6BA 3F8NA 1Z7UA 2VBXA 4I2OA 3ABUA 3G3ZA 2R7FA 2OBPA 3C7JA 3CUQB 1FSEA 4OIQF 5HDNA 3NRVA 1U8RA 3PQJA 2KRFA 3F22A 4G7OF 3R0AA 1G3SA 2RN7A 2ZO4A 3HRTA 1Z05A 3P7NA 3SQNA 2R7DA 5HS7A 4AD9A 1MJBA 3U2RA 3KLNA 4ETSA 3GYHX 2RVCA 3V7SA 1IN8A 2QZ8A 2LF8A 5JFRA 2JPBA 1REPC 4L5JA 3D0SA 3HOSA 1G6NA 3R4KA 2GZWA 4P55A 2CFXA 1FY7A 3N97A 4LJZF 2PMHA 4O6JA 1BC7C 4AIKA 1FNNA 2PJPA 3IHUA 1DPRA 4HX7A 3KP5A 3KP4A 3RTRA 3HYIA 4BNCA 4ESBA 2FSWA 4EJUA 1F9NA 2F5DA 3WE2A 2ZXJA 3S2WA 2NRAC 1ZG5A 4OU0A 3I54A 1KQ9A 3TDZC 3SZTA 3E5UA 4L0YB 5DV5A 4B8XA 3WTXC 3IRRA 4ESJA 1KU9A 2OA4A 5L3BA 4UVBA 1Z6RA 2GXGA 4GO1A 2Z9OA 2D1VA 4P9FA 3DPLC 1HKSA 3TQNA 1ZLKA 5H6RA 4RGRA 1G3WA 3SZPA 4JQFA 1OMIA 4R8HA 2QVOA 4ENJA 2AS5F 3WTWC 1HSTA 1HBXG 2FNPA 1P4WA 5BQTA 2L4MA 1QZZA 4M9XA 2M8EA 1AWCA 4MEYF 5D5WB 1HW2A 3O6BB 5HDKA 3CTAA 5D5UB 3ZPLA 4HQEA 2JRTA 1MDMA 4I02A 2FBHA 1J5YA 3TOAA 5H20A 2DK5A 3HRMA 3RPQA 1FYMA 1P4XA 3MZYA 3IWZA 3KEQA 1FYKA 1TQPA 2O03A 3WTSC 2CSOA 2D2WA 5FD6A 1XDUA 4I0BA 3L09A 1K79A 3IWFA 4CO8A 1BI2A 5D6EA 3DP7A 3HSRA 4I01A 1D8KA 2DPUA 2OQRA 2G9WA 2FF4A 5E1ZB 2Z3YA 5LRRA 2HR3A 2EV5A 2XAFA 5F64A 4ESFA 5K5RA 4Y17A 1FSHA 1P2FA 2JZYA 3GLXA 4EM1A 5J6XA 2M1BA 3FXUA 3B02A 1SFUA 4BHBA 4A0XA 1KYZA 2FNAA 4KICA 5J8CA 5FLXZ 1J0RA 4NHJA 1LVAA 1ZLJA 2EV6A 1A04A 4HA8A 3NQOA 4WXCA 4HDVA 1FYLA 1FLIA 2CQKA 2KJCA 3IL2A 4DNCA 2IRFG 1SFXA 1RUNA 3GF2A 3EDPA 3V7RA 3FHZA 2A6HF 2CG4A 4CGZA 4RAZA 1K78A 4CXFA 3QPHA 2VOPA 3Q9VA 5AONA 1BC8C 3G73A 3VOEA 2H6BA 1R22A 1TNSA 5LRSA 3HRSA 4Y15A 4L9NA 1TQMA 3QAHA 3K9TA 2W84A 1U2WA 3FF5A 2P7VB 4IF4A 5JHUA 4YFXF 5EEGA 2CW0F 4PCQA 2OD5A 3BJAA 1S7OA 1U5TC 2ZFWA 4LD5A 1YG2A 2BBYA 1JGSA 4XLNF 5K1YA 4Z2YA 3DXJF 4U0WA 1LB2A 2CWEA 3Q9SA 1OYIA 1R36A 4UVCA 2FQ3A 2EFOA 3ZMDA 1YW9A 3TO9A 2Z33A 5DDGA 2PFBA 1YLFA 5AIPA 4CZZA 2XKOA 1L3LA 4KMFA 3HSFA 4R1HA 4GGGA 1YW7A 4S05A 4AWXB 2YR2A 2V1UA 3ISPA 2O0YA 2GXBA 1G4DA 1DUXC 2D45A 3LA2A 1PP8F 2OZ6A 2P4WA 1XB4A 2NAZA 1O3TA 3TO7A 1C0WA 4M73A 2FOKA 1I1GA 1MJ9A 2M45A 3WTTC 1U5TA 2FU4A 3U1DA 1S7AA 2VT2A 5IT3A 1IN4A 1MDMB 5FFXA 3VEPA 2FA5A 1K6OA 1TLHB 2XAQA 2QWWA 4CDGA 3KZZA 3MZHA 2XHKA 3GWZA 4KIGA 3Q5FA 2EWNA 3GX4X 5K5OA 3L9FA 5DCMA 3F8MA 1BIAA 2W57A 1Z9CA 1LDJA 1IRGA 4LK0F 5DEQA 3V8KA 2P8TA 4PDKA 3J81K 2QLZA 3CDHA 1ZH5A 2EFQA 2HKOA 1RI7A 3WG9A 1RNLA 1W7PD 2L4AA 4MEXF 3KFWX 1W7PA 1R00A 5LHIA 2Q8KA 3I5UA 5ICFA 4S04A 2A3SA 3EYYA 4WXHA 3QU6A 2QM3A 5CVVA 1EH8A 4KDPA 2Y0MA 2VODA 2GWRA 4KA4A 4XSZF 2LSOA 2XAHA 3F21A 5LGUA 4YIFA 2EFPA 4GYGA 1K78B 3FMQA 3FZVA 2P6SA 3EYIA 2QYOA 2VONA 1WI9A 3DKWA 4LB6B 1ODDA 3V4GA 2MH9A 1BI3A 2DT5A 2YX4A 1SD5A 3BY6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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1EH6A

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations