4IJAA

Structure of s. aureus methicillin resistance factor mecr2
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
377
structure length
363
Chain Sequence
PMNDNEKRVLREIYNHHNISRTQISKNLEINKATISSILNKLKYKSLVNEVGGGRKPILLKVNHLYGYFISLDLTYSSVEVMYNYFDGNVIKHESYDLPDEKVSSILSIIKKHIDIQEKLDTYNGLLGVSVSIHGVVDNEQHVTYGISIAKKIKEITNVPVVVENEANLSALYERNFNHNLSYNNLIALSIHKGIGAGLIINNQLYRGANGEAGEIGKTLVSKVSDNVEIFHKIEDIFSQEALLHNLSNQLNEKMTLSKLIQFYNEKNPVVVEEMEQFINKIAVLIHNLNTQFNPNAIYINCPLFNEMPEILEAIKNQFKQYSRNEIQIKLTSNVKFATLLGGTLAIIQKVLQINDIYLDIKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Protein binding
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
publication title Structure-Function Studies of the Staphylococcal Methicillin Resistance Antirepressor MecR2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords XylR protein
total genus 128
structure length 363
sequence length 377
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
A PF01047 MarR MarR family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 4ijaA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ijaA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ijaA03
2PN6A 3E97A 2FF6A 3K1NA 2P9KB 3GG4A 3JTHA 2JSCA 2ZMEB 1G6NA 3CJ1A 1SFEA 3IKVA 1C0GA 5HLGA 1GLJO 5AZIB 2GWKA 4DB3A 4XSZF 1BA1A 3EYIA 1J6ZA 1A04A 1QBJA 1LOTB 2R7FA 3EL2A 4R1HA 1NGGA 4O5FA 5AQQA 4BRIA 2V1UA 3VGMA 1J0RA 4AM6A 4L9JA 3DPLC 3BF1A 5K5OA 2COMA 2ZWHA 2K86A 4Y17A 3WXLA 3E6BA 5DCMA 3VODA 2PLYA 1JCGA 4YFNF 2CGLA 3VEPA 3MQ0A 3O6BB 2P9NB 3D5LA 5FB2A 3L09A 1BG3A 2Z9OA 4BNCA 2XHKA 2D0PA 4M74A 1KXPA 4ENKA 3VOEA 4FWNA 1P4WA 3RSEB 5ADXH 4WXCA 2CW0F 4WF2A 5BPNA 3SLCA 2L4MA 5KQ8A 1IN4A 3H3OB 4WXDA 2P9PA 3E6DA 2PMHA 3T5XA 3ENHA 1RGIA 2RKHA 1J7KA 4CI6A 2Q97A 2WUSA 1Z7UA 2BEOA 5K1YA 3ML6A 2CH5A 5BPIA 4EQQA 4L18B 3O4WA 5LBQA 2PI0A 3WXIA 4M63C 4HX4A 2PJPA 3LQQA 4L0ZB 2L4AA 2DPUA 1ZG5A 1EV7A 4PCQA 4WCGA 5AQUA 1UHMA 2ISYA 1YUWA 1ZLJA 1HKGA 3U8XA 5CVVA 3WTWC 4G6DA 3CJ7A 3U9GA 4BRNA 1S3XA 2RDPA 4H0XB 2QYOA 2OQGA 3QAHA 4BRLA 4WQ5C 2H6CA 1MKMA 2ZGZA 4KBOA 4MLEA 4GO1A 1KGSA 3FZLA 4H0TB 4EJUA 1STZA 3OOPA 1K78B 5ELZA 3GO5A 1ZGAA 3LAJA 5CVJA 5E8IA 4UV9A 3JTGA 2VT2A 3GXOA 1QGPA 4I01A 2FBKA 2CQKA 1FYLA 3RYPA 3BWGA 1J2XA 2IPQX 3BPXA 3BPVA 1U2VA 1FP2A 1O3TA 3F9MA 3SMPA 1DPUA 2ETHA 2D0OA 4OIOF 2V7YA 3CO6C 3DAWA 3QPTA 5DD8A 4F7ZA 3C18A 1TLHB 3OV8A 1JE8A 3MK6A 1HLUA 2QWLA 2O8XA 4GNIA 2GXGA 4IPAA 3NRVA 3LDPA 1HPMA 2CH6A 3H6EA 2LNBA 3HZ6A 5F2RA 3JW4A 2FF4A 2P5LC 3VGLA 3WQTA 2ACJA 4FOIA 4EMSA 4BC3A 5BQTA 2E1ZA 2F5DA 5F1RA 3C7JA 3S41A 1BJAA 4BR0A 2A5XA 4KMUX 1XUPO 5ICFA 3WEEA 2W57A 1K6OA 2BYVE 3VERA 4RWTA 1IAWA 2O61A 3DP7A 4GYIA 1R1UA 4RB1A 4Z94A 3RPUA 4EJOA 2JRTA 3ECOA 2V51B 3NQOA 5JLHA 1XGMA 3KFWX 2GTDA 1T6DA 2FXUA 4LFUA 2IVNA 3CJCA 3H92A 3P9CA 3N4MA 2J5PA 1Y64A 4DQ8A 3K9TA 4OIPF 4DCHA 3CUQA 1XD7A 5AQXA 5L3EA 3ATUA 4Y13A 1BI0A 3KVGA 1WSUA 2QENA 4GGGA 1R1TA 3AARA 4EJWA 5LGNA 3JSOA 3H45C 4CJ7A 5IT9K 1XDUA 3QICA 1SD6A 4KYWA 2B0LA 1O3RA 2OQRA 4BRKA 1WI9A 3E6MA 5HDNA 1DGKN 4L9NA 2FXAA 2W25A 3FXQA 2DI3A 4CBWA 3KP5A 1Q18A 3CLOA 3WGGA 4QS8A 3DXMB 5F0XA 4KIGA 1REPC 4RB2C 4AIJA 1IN5A 4WXHA 5CLSA 4G8XA 3ABTA 3UB5A 3E3VA 3P9IA 2IVPA 2Q2EA 4UHTA 2D1HA 3ZX3A 2V6CA 4G7HF 3ID8A 2FQ3A 2EJRA 3WTVC 3GFMA 1KYZA 1SFXA 3SFZA 2Q8KA 2PQ8A 3KP3A 3WXKA 4GY2B 3IC7A 4M9XA 1ATSA 3KLNA 5DV5A 2BBYA 4HF0A 5HDGA 1DUXC 1X3UA 4A2UA 1XQSC 4OMYA 4JK1X 4KMFA 2P9IA 5CYVA 1QQMA 3HRTA 3CQXA 1Z6RA 2P9LA 4EIAA 1LDJA 1IXRC 2MC3A 3O80A 4UXNA 2K7LA 3RKWA 3WTSC 4CZJA 3GW2A 2YJFA 1FNNA 2P9PB 1SAXA 2OAZA 5LRRA 4BRGA 5AQSA 4FPAA 3E5UA 3G3ZA 3M9AA 3MMVA 1G3WA 3O1BA 1L3LA 2M8EA 2VBWA 4JD2A 4P55A 4XRFA 1O3SA 3F8FA 4HW0A 3LWFA 5LRSA 1ONVA 2QW9A 5DUIA 5EEHA 3DXKA 2ZJ2A 3WU0A 4LLNA 3GYHX 4B1VA 4CDGA 4DNCA 1AWCA 2HFHA 4OIRF 4EM1A 2VE9A 3MCPA 3UKRA 2OD5A 5CVUA 4BRMA 2P9UA 1QO0D 4BC5A 2QQBA 4Y0WA 2L02A 3IMXA 5JFRA 2NRAC 4WQ4A 1ZGJA 1KU3A 3CETA 1JHHA 1IUYA 3CHWA 3BF3A 1RZ4A 3E5QA 2V9VA 4UV8A 1R1VA 3A5LC 3QFUA 1T0FA 4A0XA 2YJEA 2EA4A 1W7PD 2P4WA 5DUKA 2MLGA 5AQPA 2ASOA 5AQFA 3NEUA 1LNWA 1SD4A 3IRQA 5HS8A 2FNPA 2HZTA 3L0QA 1HXDA 2L3DA 1MJ9A 3I0TA 4RB0A 3ABUA 3TPQA 3OHRA 2H6BA 2WWYA 3LAPA 1OKJA 3EKSA 3V8LA 5JR3A 4A12A 3IDHA 3MN6A 1L0OC 3ULQB 5DCFA 4CZHA 3ZMDA 4P9FA 3FWEA 3HSRA 2ZBKA 4KT5C 4BREA 4MHGA 2NYXA 5BR9A 3KP4A 2CG4A 3HTVA 3VEYA 3VEZA 2PAVA 1U2VB 3FZKA 1HKSA 1G4DA 1U6GA 1BIBA 2ZNYA 2CGJA 4OU0A 3Q9VA 5A2QZ 1G99A 3RTRA 2H27A 4ETSA 2MH9A 5DYMA 3KCCA 1E4GT 1GLFO 1OR7A 3BJ6A 3CJ9A 3F8BA 5AQRA 4CZEA 4E1JA 2CWEA 4CZMA 2A5YB 2OANA 4B1ZA 3O8MA 1NGBA 4UVBA 2NLXA 4UNOA 4L0YB 4RGSA 2A69F 2PEXA 1ZRFA 2FBIA 5E8GA 3R61A 2CGPA 1SD7A 2FEZA 3SQNA 4M9SA 4A2BA 4LMYA 5AIQA 3R0AA 1S29A 2Z33A 1GLEG 4EFHA 1FOKA 1P2FA 4OOIA 5LJWA 4ENMA 4NQWA 5D8KB 5J8CA 4Q5SF 3VEXA 1BC7C 1NGIA 2YCHA 2DLLA 5AIPA 2EV0A 3BY6A 3LDOA 2P7CB 5D6FA 2E88A 3V7RA 3GZ5A 4RGUA 1LVAA 4IVNA 5D5XB 1ZN2A 3HBTA 4M9ZA 2QBYB 2IA2A 5E1XA 3MN9A 2Y0MA 2QWWA 4EV0A 4EM0B 1LDKB 1KA8A 2M45A 4U0WA 1ODDA 3CJNA 3R8EA 3ECHA 2LDUA 2MD5A 1XCBA 3GLXA 4A5MA 3JAMZ 3GUDA 5K5RA 4BQZA 1QZ6A 5E1WA 1U5TC 2FSNA 5KQDA 4I98B 5BREA 4XLPF 4BRDA 4BHBA 1USTA 1J59A 3K1MA 2FMLA 1LEAA 4LK0F 3GFJA 4H03B 3FX3A 4HA8A 3W3DA 2IA1A 2GAUA 1OKRA 4LLLA 4H0PA 5JMVA 3KHYA 1PUEE 1Z05A 2Z5UA 1WKMA 3EYYA 3MN7A 1WRJA 4B09A 5ILVA 3EKUA 1EH6A 5KPRA 3HTSB 2JT1A 1B6AA 2JTVA 2P5VA 3ZP5A 1ZBSA 2P9IB 2CFXA 1J9IA 2DBBA 1NM1A 2P9LB 4K25A 3T8RA 2YSRA 4XSXF 3WTZA 4I7HA 3BZ6A 2G7HA 6PAXA 1E2XA 3D0SA 5CVRA 5AQGA 5FD5A 2HQNA 2HS5A 2DQLA 1XCVA 3RPQA 2NS0A 2W41A 4L9TA 3I59A 3V8JA 4I6MA 5AQHA 5AQOA 2HTJA 4LG0A 5L3CA 1XDSA 3WE2A 4JD2B 4N9HA 3R60A 1XGNA 4U0YA 5E20A 1F4KA 4P5OA 4MTDA 1HKCA 3DXKB 2ELHA 4B1YB 5AQKA 1HKTA 5I9EB 1BC8C 1XMAA 3KZZA 3AAQA 1I27A 1YW8A 4G94A 4YIFA 1HW1A 5IT3A 4FWOA 2HYFA 4AD9A 4BR5A 1UB9A 1G3TA 4WX9A 1BIAA 3GOIA 5L3FA 2GA1A 1R22A 3HUGA 3ZQ7A 2E8AA 2DPNA 1YS6A 5FFZA 1W5TA 1C0FA 1XMKA 1B59A 4WWCA 2DU9A 4CZZA 2E2OA 3M7GA 1R7JA 1IF1A 2QWQA 1RIOH 4PGHA 2P5KA 5ED4A 2ITMA 1B4AA 2RGVA 2W85A 4K2EA 3C0BA 3HRMA 4BHPA 3LDLA 3SMSA 2VYPA 2FF3B 2RNJA 5LJVA 3KE2A 4HLYA 4OMZA 1HSTA 5HOOA 2WC2A 1OYIA 3PQKA 3DFGA 3ULEB 4BR9A 4PZJA 3HYIA 2ZGYA 4PKGA 4RB3C 2MA3A 3TOBA 4IXCA 2RN7A 2QQ9A 3FXRA 4HTLA 1V4SA 5ADXA 3Q5FA 1U8RA 3F8CA 1V4TA 1B9NA 2LKPA 3BP8A 3HTUA 1BN5A 2FA5A 4H5WA 1ZG3A 4IWVA 2X4HA 2GWRA 2EV6A 1GLCG 3D2EA 3JXUA 4ISEA 1ZLKA 3P7NA 4Q47A 5BN9A 2EFNA 3HHGA 2HWVA 2EK5A 3M8FA 2ZF5O 3ZEUA 1BUPA 2FLOA 2M5WA 4A0ZA 3M1FA 2OZUA 4MTEA 4ZYHA 4PGGA 1C0WA 3H1QA 4BRPA 3UKUA 3BJOA 3TDUC 3CTAA 4MNUA 4IF4A 1ZG1A 3BDDA 4ESBA 3SZPA 3IL2A 1YW9A 3I5UA 3QOPA 4IJAA 1LB2A 1Z1DA 2OBPA 5DEQA 4BGBA 2IJLA 3MFKA 1IXCA 4MEYF 3FMSA 3L2CA 5DDGA 4A2AA 1QZ5A 2VXZA 4CZIA 2BV6A 5LGUA 1OYWA 2NNYA 4QS9A 2RVCA 1WUAA 4Q4ZF 2P9SA 2W24A 1NLVA 3EZWA 2R3SA 3VOVA 3C3WA 4RS8A 1YTYA 1W5SA 1SFUA 3S2WA 5LEJA 3F22A 1MA9B 4IO8A 4HWIA 3WU1B 3ENOA 1D5VA 5TKYA 4EGZA 2ZNZA 1QNTA 4BYYA 1K7AA 5FLXZ 3WODF 4FX4A 1U5TB 3HI0A 4EHUA 4LD5A 1GXPA 4G7OF 5ICEA 4P96A 4EVIA 5IT9Z 1FSHA 2DW4A 1G3YA 1OMIA 1BA0A 4HLXA 1J75A 5FPEA 4Y15A 3O3KA 1K8KA 3VF6A 4BR4A 5LLQA 1BO5O 2O03A 4AIKA 2D1KA 2VOOA 1MJBA 2GA2A 3TDZC 1ESVA 1NGFA 1FPQA 5AQYA 4HBLA 2L54A 1NGJA 1YG2A 2XKOA 3LA3A 3CUQC 4CXFA 3N97A 2EFPA 3SK3A 3LDNA 2HKOA 3GX4X 1RFQA 4AWXB 1R58A 2H94A 5BRFA 2QUFA 5FLXK 3D2FA 2MLKA 2J4RA 4BG8A 3B73A 4IRIA 4JHDA 3QB0A 2G7UA 5F6FA 4L5JA 3VESA 1DP7P 2O3FA 5BMZA 2EWSA 2QWRA 2BTFA 5LHHA 1YXQA 2HEOA 3HRSA 1TUUA 4MEXF 4FT8A 1FY7A 3I64A 3T0YA 5JLFA 3LA2A 3I59B 2EV5A 2VN2A 2ZXJA 4ESFA 2PMUA 2Z99A 3WQUA 1I1GA 3MZHA 2H09A 4PDKA 1CF7A 3FMRA 1IZ1A 5FPNA 3H3NO 4HX8A 3J81K 4HQEA 2BGCA 2GUPA 2A61A 2DPDA 1MWMA 1YLFA 1NBWA 3SXYA 3LDQA 4B1XB 2PBIA 1O7FA 2QM1A 1BU6O 4BRFA 1F5TA 5DCMB 3KEOA 3LFKA 4NO7A 3ZMVA 1SD5A 5B8HA 2CGKA 2IIRA 2JZYA 2HF4A 4IZ9A 5FD6A 3RIRA 1TQMA 2X0LA 4YFKF 2K4JA 4IJNA 3FHZA 5AQWA 3E6CC 4I0BA 3F3XA 3TQNA 4AVPA 1IN7A 2VBXA 4U7BA 1Q1HA 5KK1A 3BROA 3ZMUA 1BOTO 2J5OA 4EJVA 3B02A 4FO0A 2QM3A 4KICA 4GXOA 2LF8A 3TO7A 2I7NA 2GZWA 4CBUA 3O5BA 2YHXA 5EVZA 1GXQA 1Z9CA 2FU4A 3DJCA 1R59O 3FM5A 4QS7A 1HJOA 3J8AA 2Q1NA 3O6WA 1ZREA 4HDUA 3CJAA 3FR0A 4UUVA 3D2EB 3JSPA 1H0MA 4H5TA 3KP6A 1P4XA 3HM8A 2O0YA 2YU3A 3L7WA 5AONA 2P9KA 4WQ4C 2EFOA 2VC1A 1LCUA 1GLDG 4U0VA 2VC0A 2NAZA 5AZIA 5H20A 1X3NA 3BJAA 3WTXC 4G6QA 4A62A 1T39A 2XAJA 2DO7A 2AA4A 5AQVA 3H3ZA 5D6EA 1Z91A 3C1DA 1ZAOA 2Q2RA 3UKUB 5TJJA 5D5UB 1S7OA 4YFXF 1NMDA 1ZRDA 3REOA 4YDUA 1ZARA 1H1VA 3C7NA 2HR3A 2UXNA 4B8XA 2A41A 4JN4A 2DQRA 4P9UA 5EY4A 2E1NA 2CSOA 1GLLO 1H9TA 1RUNA 2DT5A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2PN6 A;  3E97 A;  2FF6 A;  3K1N A;  2P9K B;  3GG4 A;  3JTH A;  2JSC A;  2ZME B;  1G6N A;  3CJ1 A;  1SFE A;  3IKV A;  1C0G A;  5HLG A;  1GLJ O;  5AZI B;  2GWK A;  4DB3 A;  4XSZ F;  1BA1 A;  3EYI A;  1J6Z A;  1A04 A;  1QBJ A;  1LOT B;  2R7F A;  3EL2 A;  4R1H A;  1NGG A;  4O5F A;  5AQQ A;  4BRI A;  2V1U A;  3VGM A;  1J0R A;  4AM6 A;  4L9J A;  3DPL C;  3BF1 A;  5K5O A;  2COM A;  2ZWH A;  2K86 A;  4Y17 A;  3WXL A;  3E6B A;  5DCM A;  3VOD A;  2PLY A;  1JCG A;  4YFN F;  2CGL A;  3VEP A;  3MQ0 A;  3O6B B;  2P9N B;  3D5L A;  5FB2 A;  3L09 A;  1BG3 A;  2Z9O A;  4BNC A;  2XHK A;  2D0P A;  4M74 A;  1KXP A;  4ENK A;  3VOE A;  4FWN A;  1P4W A;  3RSE B;  5ADX H;  4WXC A;  2CW0 F;  4WF2 A;  5BPN A;  3SLC A;  2L4M A;  5KQ8 A;  1IN4 A;  3H3O B;  4WXD A;  2P9P A;  3E6D A;  2PMH A;  3T5X A;  3ENH A;  1RGI A;  2RKH A;  1J7K A;  4CI6 A;  2Q97 A;  2WUS A;  1Z7U A;  2BEO A;  5K1Y A;  3ML6 A;  2CH5 A;  5BPI A;  4EQQ A;  4L18 B;  3O4W A;  5LBQ A;  2PI0 A;  3WXI A;  4M63 C;  4HX4 A;  2PJP A;  3LQQ A;  4L0Z B;  2L4A A; 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 1R23 A;  5KAF C;  3LPT A;  3T7Z A;  3DXM A;  3O4Q A;  2VKD A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 2PN6 A;  3E97 A;  2FF6 A;  3K1N A;  2P9K B;  3TSU A;  3GG4 A;  3JTH A;  2JSC A;  2ZME B;  1G6N A;  3CJ1 A;  1SFE A;  3IKV A;  1C0G A;  5HLG A;  1GLJ O;  5AZI B;  2GWK A;  4DB3 A;  4XSZ F;  1BA1 A;  3EYI A;  5C10 A;  1J6Z A;  1A04 A;  1QBJ A;  1LOT B;  2R7F A;  3EL2 A;  4R1H A;  1NGG A;  4IOA L;  3CCR N;  3E9P A;  4O5F A;  5AQQ A;  4BRI A;  2V1U A;  3VGM A;  1J0R A;  4AM6 A;  4L9J A;  3DPL C;  3BF1 A;  5K5O A;  4YOX A;  2COM A;  2ZWH A;  3EE9 A;  2K86 A;  4Y17 A;  3WXL A;  3E6B A;  5DCM A;  3VOD A;  2PLY A;  1JCG A;  3P39 A;  4YFN F;  2CGL A;  2HBK A;  3VEP A;  3MQ0 A;  3O6B B;  2P9N B;  3D5L A;  5FB2 A;  3L09 A;  2RHK A;  1BG3 A;  3N4Q A;  2Z9O A;  4BNC A;  2XHK A;  2D0P A;  4M74 A;  1KXP A;  4ENK A;  3VOE A;  4FWN A;  1P4W A;  3RSE B;  5ADX H;  4WXC A;  2CW0 F;  4WF2 A;  5BPN A;  3SLC A;  2L4M A;  5KQ8 A;  1IN4 A;  3H3O B;  4WXD A;  2P9P A;  3E6D A;  2PMH A;  3T5X A;  3ENH A;  2PFU A;  1RGI A;  2RKH A;  1J7K A;  4CI6 A;  2Q97 A;  2WUS A;  1Z7U A;  2BEO A;  5K1Y A;  3ML6 A;  2CH5 A;  5BPI A; 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