4IJAA

Structure of s. aureus methicillin resistance factor mecr2
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
377
structure length
363
Chain Sequence
PMNDNEKRVLREIYNHHNISRTQISKNLEINKATISSILNKLKYKSLVNEVGGGRKPILLKVNHLYGYFISLDLTYSSVEVMYNYFDGNVIKHESYDLPDEKVSSILSIIKKHIDIQEKLDTYNGLLGVSVSIHGVVDNEQHVTYGISIAKKIKEITNVPVVVENEANLSALYERNFNHNLSYNNLIALSIHKGIGAGLIINNQLYRGANGEAGEIGKTLVSKVSDNVEIFHKIEDIFSQEALLHNLSNQLNEKMTLSKLIQFYNEKNPVVVEEMEQFINKIAVLIHNLNTQFNPNAIYINCPLFNEMPEILEAIKNQFKQYSRNEIQIKLTSNVKFATLLGGTLAIIQKVLQINDIYLDIKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-Function Studies of the Staphylococcal Methicillin Resistance Antirepressor MecR2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords XylR protein
molecule tags Protein binding
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
total genus 128
structure length 363
sequence length 377
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
A PF01047 MarR MarR family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 4ijaA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ijaA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ijaA03
4HDUA 2A41A 4HA8A 4U0WA 4BRCA 5BPNA 3SZPA 2FXUA 1O3SA 2HDCA 5AQPA 2AXLA 3ZPLA 3HHGA 4P9UA 4L9TA 3HSEA 5L3FA 2DK5A 3UKRA 2RN7A 1U78A 2Q2EA 4H0TB 3HSFA 1U5TB 1EH8A 2XAJA 1GLLO 1XMKA 3GYHX 3L09A 3ZMTA 4RAZA 1I6XA 1ATNA 2H3GX 1BIBA 5DD8A 1TYQA 1LB2A 5K5OA 2YSRA 4KIFA 4B1YB 1GLJO 2G7HA 1KU2A 2HKOA 3QFPA 1ZBSA 3C7JA 3L9FA 2BUPA 2D1HA 4JBAA 2EWNA 1KAYA 4CZLA 4RGRA 1SMTA 1BI2A 5FB2A 3LWFA 5AQXA 4LLNA 4K42A 3WTWC 3ATVA 2QWPA 2Z33A 5ILVA 4Q48A 2CH6A 3MN7A 2P5KA 3FZKA 1J75A 5E84A 1FP2A 1X3UA 3QB0A 5D4RA 2FBHA 1ZAOA 2O03A 1ZRCA 2GUPA 2X0LA 2H27A 4U7DA 4L0ZB 4OIQF 1QQIA 2YHWA 1MZBA 1LEBA 1TUYA 5ED4A 4Q47A 3J81Z 3CUQA 4CXFA 3JXUA 1HJOA 3VERA 1TW2A 1Z6RA 3ENOA 2ZCWA 1ON2A 3MAJA 3V4GA 3G25A 1O7LA 4CI6A 2FMLA 4MLHA 3V7CA 5BOXA 2JSCA 1P4AA 2HZTA 3WTTC 4Y17A 5DEQA 1IRFA 4A61A 4JQFA 1YO5C 3PQJA 3DQVC 4GCVA 2XASA 4NB4A 1R1TA 1DDNA 1NM1A 1BA0A 2ZGZA 5HS8A 1GHCA 2VE9A 2D1VA 2HYGD 1V4SA 1ZH5A 2BBYA 3O2PE 4WF2A 1P2FA 2GIVA 4DQ2A 3L7WA 5LHHA 4OMYA 3PFIA 1T39A 1WSUA 1RI7A 3J8AA 1ZARA 5CVVA 5AZJB 3ZETB 5IT9K 1R36A 4A62A 1T0FA 2VBXA 3LDLA 1BOAA 3TU5A 1HKBA 4BGAA 4WXCA 1R58A 3LDQA 3MWMA 1J9IA 5H20A 2CG4A 1T38A 1DPRA 5AQHA 2LSOA 3P7NA 2B0LA 3E5UA 2DPDA 3D2EB 3H3ZA 3I53A 4OIOF 3BJ6A 4M63C 1B1BA 4LD5A 2DW4A 3BWGA 1JGSA 1GVJA 2STTA 3UE5A 2Q0OA 5HDGA 3E6MA 3EETA 1ZYRF 4ZYEA 5E20A 4L5JA 4ZZDA 1SD6A 3D0SA 4A6EA 4AD9A 2E2OA 2PI0A 4O5FA 3ZQ7A 1K7AA 3DP7A 1S7OA 2V52B 2M1BA 3ATUA 4EAHD 3WE3A 4I09A 3VODA 4FWRA 4LJZF 1R5GA 3N4MA 2FF3B 4HV6A 4PKIA 5ICEA 3I59A 4RGUA 1J6ZA 4BQLA 2EA4A 1IN8A 4I2OA 4HZFA 1YIOA 3GL1A 4CD1A 5FPEA 2E2QA 1QGPA 2P6SA 4CDGA 5FLXK 2FOKA 1BC7C 1NLVA 4BRIA 3RPQA 2F9WA 3FMQA 2PG4A 1O3QA 2XGXA 4ZYHA 2J5OA 4EFHA 4KA4A 4CZHA 3JW4A 1XDUA 2RGVA 2CYYA 4EJWA 2UWMA 1IAWA 4HAMA 4RGSA 1BG3A 3JS6A 5JLHA 5KPZA 3CJNA 1LEAA 4CD3A 1B9MA 1BN5A 4A0XA 3OHRA 2HF3A 4IPAA 3RYRA 2GQQA 3M3ZA 2F9TA 3VF6A 5IT9Z 1MDMA 3ISPA 5AQQA 2QYOA 5LGUA 1ZC6A 3WTUC 2M45A 1HSJA 1RFQA 3HOTA 1TW3A 2UZKA 1W5SA 1HQCA 4M9XA 2LF8A 5E1ZB 3CJAA 3LFKA 4YG2F 4KNYA 2H6BA 4ESJA 3FM3A 1X9JA 2IVNA 2LDUA 4ZYDA 4KMFA 1QO0D 2IA1A 3GF2A 1U5TC 4M74A 5JHUA 5EY4A 1IN7A 1HX1A 2CH5A 2HYFA 3SHFA 4M9ZA 2A5YB 3W6KB 3RTRA 4BRAA 4CBXA 3WU0A 1FLIA 3VEPA 2K4JA 4CBWA 3J80K 1IJJA 1NGBA 5HDNA 3O5BA 5ILUA 5AQLA 1UFMA 5J6XA 3UKRB 4LFUA 1D4XA 2E7WA 1NGCA 4H0YB 1K8KA 2GEMA 1Y0UA 2F5CA 5HLIA 5AFUA 2ADUA 1DUXC 5KPTA 1Q18A 2R3SA 5AQVA 1HPMA 1NGEA 1OKRA 3TOBA 3Q9VA 1TYQB 5ILSA 1Z05A 3TQNA 1T6SA 3WGHA 3ABTA 2F5DA 1HW1A 2P9KB 3WUHA 3R9PA 1S7AA 3R4KA 1L0OC 5FPDA 2HWVA 3TO7A 3FF5A 3AAQA 2MBFA 4FO0A 4BR0A 2NAZA 1V3FA 5LJWA 4HX8A 3IFRA 1SMYF 3UB5A 1K6OA 2XAHA 1S6LA 4F9OA 2FU4A 4HF1A 1HKSA 1R7JA 3DKWA 4H5WA 4L9VA 4B1XB 3C1DA 1LCUA 1IXRC 1HKQA 1K78B 3O8MA 4BR4A 2O3FA 1QPMA 3RYPA 1XB4A 3FMSA 4BRGA 4XH5A 2EV0A 1FYMA 1Z1DA 1ONVA 3FX3A 1U2VA 1B4AA 2DO7A 4EGZA 2M30A 1KYZA 4AIKA 3CUQB 3MQ0A 2VCPA 2W41A 5EEGA 3ECOA 2D4WA 3F9MA 2VOOA 1TTYA 1XCBA 2OAZA 4WXHA 2E88A 1NGAA 4E1JA 1CZAN 4XBFA 5IT3A 3TO6A 2HF4A 3HRTA 2R7FA 1F5TA 2M8EA 1QZ6A 5LRSA 1OYYA 3WXIA 3RDIA 3SMPA 3ZP5A 4BRLA 4NB5A 2XAGA 2UYTA 1KAZA 4BC3A 4KUMA 2Q31A 2HQNA 3IRRA 3HBTA 3K1PA 2VYPA 2HR3A 2PQ8A 1S3XA 1USSA 2FNAA 3LQRA 3EKUA 4I7HA 3D2EA 2QZ8A 2WWYA 4U7BA 2E7XA 3U2RA 1BM9A 1JXSA 1G99A 4N9HA 2NS0A 4I6MB 5D6EA 4KMUX 2FBIA 3KE2A 2GA1A 1BIAA 1E4GT 3V7SA 3KLNA 3ENHA 2E1CA 2XAQA 3F8CA 4A5MA 1GXPA 3H3UA 1D8JA 4WQ5A 3AAPA 2PBDA 1HXDA 2HKXA 2PAVA 1REPC 4YFNF 1J5YA 1G4DA 4CICA 2OANA 1U2WA 3CJ9A 3F8MA 2V7YA 2BYVE 5AQJA 1U6GA 1ON1A 3WQUA 1YS7A 3M8FA 3O4WA 3L2CA 2ZGYA 1RIOH 2HEOA 3BPXA 4BR7A 1YYVA 2HFHA 1V4TA 2F2EA 2AA4A 4WQ4C 2ELHA 3RIRA 5HDKA 1KAXA 5D5VB 3KZZA 2YU3A 4P9FA 1C0FA 5LBQA 2MA3A 4P5OA 4BR5A 3RJPA 2FBKA 4I02A 4GYIA 2AP1A 2MC3A 3FZLA 4AWXB 3TGNA 2F5EA 1TQPA 4YFKF 3VOVA 5HS7A 3I59B 4MNUA 3RSEB 1TUUA 2E1YA 3P4IA 2EFPA 3IKTA 4BRFA 2PBIA 1GXQA 5LHIA 4LK1F 3KP2A 3I33A 4WK8F 3T0YA 2V51B 1OPCA 2DPUA 4HYEA 3WTZA 1MWKA 1LDDA 2W57A 2Q1NA 1ZRFA 2L02A 3LA2A 1IN6A 2VN2A 4DQ8A 4BC4A 2VWBA 3R0JA 1EH7A 4S05A 2ZMEA 3DXMB 2ITMA 3WE2A 3B8AX 3RKXA 1D3YA 1O7FA 2DQRA 2VBWA 5LRRA 1HLUA 2ISYA 1MDMB 3J81K 4ESFA 2EA2A 4P55A 3E5XA 5HS9A 4OIRF 5TKYA 1C0WA 4ZH4F 5DYMA 1KA8A 1DP7P 1W7PD 5LEJA 3E5QA 1YVNA 3QBWA 3T8RA 1NGFA 2EJRA 5EVZA 2I7NA 2EFWA 3RI4A 4H5VA 1BC8C 5BS6A 2NRHA 4CGZA 1TQIA 2RQPA 2RNJA 1P6RA 3IL2A 1BI3A 4MHGA 4Q4ZF 1J59A 1J0RA 2QXLA 3BJOA 4Y15A 3O6WA 4MQ9F 3KEQA 4N9IA 3TDZC 3ZEUB 4IRIA 3H1VX 2L01A 1RZ4A 5HLHA 3L00A 4HF2A 5DDGA 3DV8A 4H5NA 1NGJA 5L3CA 1HUXA 2PMUA 4M7XA 3ZMUA 5ICGA 4G8XA 1SD7A 1SZ2A 2FQ3A 1IRGA 1HKTA 1S3JA 3TO9A 2W24A 3EDPA 5LEKA 2P9KA 3ZMZA 4HQEA 4KT5C 3BROA 5JI6A 3BF3A 3FWEA 1MWMA 6PAXA 2KJBA 1UCRA 2VONA 1SD4A 3CIPA 1QZZA 3ML6A 1K8KB 1F9NA 3K2ZA 1QNTA 3GZ6A 3W3DA 3GUDA 4XLNF 2L4MA 4UVBA 3O3KA 5AIQA 1R00A 1FSHA 2A61A 1OKJA 4HV5A 5AFUH 5HLGA 2V9VA 2KIUA 2YX7A 5HVQC 3FZMA 3E6BA 4DHYA 1R23A 5LJVA 2FSNA 3HYIA 4RAYA 1K78A 1XUPO 1KGSA 3CTAA 2A5XA 2PFBA 3DXKB 2J4RA 2RKHA 2A6EF 2GZWA 2K86A 2FSKA 3EKSA 4BREA 3CUQC 2QWMA 3VEOA 3S2WA 4JD2B 2Q97A 4ON0A 5KVRA 2A69F 1MJAA 4BAYA 2I7PA 3HHHA 2FNPA 4FWSA 2DU9A 2P7CB 4Z2YA 4HX4A 1O3RA 1ZREA 2KRFA 4ENNA 1SFEA 4FWMA 2PN6A 5F64A 2YPRA 4I0AA 3WT0A 3GWZA 2XV4S 4OMZA 1NMDA 2NLXA 1GLAG 2A6HF 4WYBA 3JTGA 3ZX0A 5TRDA 2Y75A 4M72A 4FOIA 2QWLA 2FA5A 2HGCA 2P9UA 2VXZA 1U2VB 4FWPA 3FZVA 1Z91A 5AIPA 3C7NA 5H6QA 2L4AA 2KKOA 3HRMA 3SZTA 5AQGA 4A2AA 3EO3A 1X3NA 5LY3A 2JT1A 4QLCU 2XRNA 3FHZA 4I6MA 3SQNA 1O57A 1ZLKA 2IRFG 3MEXA 1R59O 3QPHA 4I0BA 3GG4A 2V1DA 1G6NA 5BREA 1Y64A 3PQKA 5CJ9A 1KU7A 2GWRA 2M5WA 2VBZA 4G7ZF 2VE8A 4XRFA 4HW0A 2ISZA 3GFIA 1WQ2A 3H3NO 4KICA 1WWXA 4GY2B 3R6SA 4KBOA 3ZN0A 2QLZA 4CZEA 2IA0A 4BYYA 3GE1A 3CERA 3O80A 1TLHB 5CLSA 3HM8A 1G3TA 1KQ9A 1XQSC 1RNLA 2NNNA 2IIRA 1B6AA 4PL7A 3K1MA 1ULYA 2G7UA 2VT3A 1FWZA 3VOEA 2H94A 5BQTA 2ASOA 1BBYA 2A3ZA 4CZZA 2WUSA 1QHAA 2UXXA 4YDUA 5J8FA 3H45C 3KP5A 5B8HA 2D2WA 3FFKB 2Z3YA 4L0YB 3DF8A 4L9NA 4PDKA 2X4HA 3RSEA 1TNTA 2Z5UA 2K02A 4QS8A 5DUKA 3QRFF 3HSCA 3DPTA 5FFZA 4U0VA 1HW2A 4IXCA 1AOYA 4MO5A 1ODDA 3HIFA 4JK1X 4UXNA 3WU1B 1W5TA 4AIHA 2E2NA 2OA4A 4I01A 2V6CA 1XGMA 5D6FA 2XROA 3LM2A 4BG8A 2ZF5O 5L3GA 3CO6C 4G7OF 4BHCA 1BJAA 3ULQB 2ZO4A 2H6CA 3WQTA 3E97A 1U6ZA 4UHTA 1VTNC 3DXMA 4JN4A 4Z94A 3ECHA 5DCFA 4ENKA 1XD7A 1EV7A 1BA1A 3K9TA 1P8ZA 3F6OA 3JSPA 2A42A 1ZG5A 1BI0A 1CF7B 1CGPA 3JSOA 1F1ZA 4CHUA 1AWCA 3COAC 2DBBA 3E6CC 4LLGF 3QDKA 3VENA 3K0LA 4FHTA 4MQVA 1MA9B 3FLCO 1KYWA 4HQMA 3F6VA 1C0GA 4O8KA 3BP8A 1R1UA 2ZMEB 2ZFWA 3LAPA 3T8TA 2Z9OA 1YUWA 1XSVA 3KP4A 1WUAA 1MJ9A 3VGKA 3QBXA 1J2XA 1NWKA 3ZEUA 1ESVA 3KEOA 1FSEA 3EUHA 3HUGA 3IRQA 4LB6B 4G9YA 4KFCA 1IG8A 3DWLA 4OINF 1YW9A 2P9IA 2DQLA 3EZWA 2EV6A 3VPZA 3KZYA 3ZMVA 3WXKA 4BGBA 3BDDA 5E8GA 4G7HF 3M9AA 5HOOA 3WEEB 1H9TA 4LLLA 3L0QA 3FXUA 4ESBA 3WGGA 1NGHA 5AONA 1G3SA 3WODF 3IC7A 2EB7A 4CBUA 3DJCA 5D4SA 5ADXA 3AARA 5DCMB 2OQRA 5AZIB 1KU9A 4OOIA 4CYDA 2QW9A 4HTLA 2H09A 2L3DA 4PZJA 3U9GA 5FD6A 3NQOA 2EFQA 4J8FA 3QAHA 4FWLA 4L18B 3LA7A 4WX9A 2P9SA 3DPLC 5DD4A 4KIGA 2V79A 2Y0MA 1IXSB 3EN9A 5BPDA 2BTFA 3DXKA 1Z9CA 2DPNA 1YLFA 1FP1D 1UHMA 1SD5A 2CW0F 4JD2A 1NGIA 2Q2RA 2VC0A 5F2RA 4GYGA 1GLDG 3QICA 3IHUA 4BQAA 2LKPA 2ZWHA 1FX7A 4EHTA 2RV8A 1JCGA 2XKPA 3GOIA 2DK8A 3V7RA 3ABUA 3CLOA 2KIFA 1T2KA 4IXAA 1SFXA 2W25A 2QWNA 4EJTA 3KZBA 5A2QK 1U8RA 4RCHA 4MEXF 3GLXA 5D5UB 1XGSA 4PCQA 4EM0B 1YW8A 1I5ZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4HDU A;  2A41 A;  4HA8 A;  4U0W A;  4BRC A;  5BPN A;  3SZP A;  2FXU A;  1O3S A;  2HDC A;  5AQP A;  2AXL A;  3ZPL A;  3HHG A;  4P9U A;  4L9T A;  3HSE A;  5L3F A;  2DK5 A;  3UKR A;  2RN7 A;  1U78 A;  2Q2E A;  4H0T B;  3HSF A;  1U5T B;  1EH8 A;  2XAJ A;  1GLL O;  1XMK A;  3GYH X;  3L09 A;  3ZMT A;  4RAZ A;  1I6X A;  1ATN A;  2H3G X;  1BIB A;  5DD8 A;  1TYQ A;  1LB2 A;  5K5O A;  2YSR A;  4KIF A;  4B1Y B;  1GLJ O;  2G7H A;  1KU2 A;  2HKO A;  3QFP A;  1ZBS A;  3C7J A;  3L9F A;  2BUP A;  2D1H A;  4JBA A;  2EWN A;  1KAY A;  4CZL A;  4RGR A;  1SMT A;  1BI2 A;  5FB2 A;  3LWF A;  5AQX A;  4LLN A;  4K42 A;  3WTW C;  3ATV A;  2QWP A;  2Z33 A;  5ILV A;  4Q48 A;  2CH6 A;  3MN7 A;  2P5K A;  3FZK A;  1J75 A;  5E84 A;  1FP2 A;  1X3U A;  3QB0 A;  5D4R A;  2FBH A;  1ZAO A;  2O03 A;  1ZRC A;  2GUP A;  2X0L A;  2H27 A;  4U7D A;  4L0Z B;  4OIQ F;  1QQI A;  2YHW A;  1MZB A;  1LEB A;  1TUY A;  5ED4 A;  4Q47 A;  3J81 Z;  3CUQ A;  4CXF A;  3JXU A;  1HJO A;  3VER A;  1TW2 A;  1Z6R A;  3ENO A;  2ZCW A;  1ON2 A;  3MAJ A; 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 2KZZ A;  5KHD A;  2PJP A;  3VEX A;  5JFR A;  4JKH A;  1YS6 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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