The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
71
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structure length |
71
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Chain Sequence |
GAPAKSPEEMYIQQKVRVLLMLRKMGSNLTASEEEFLRTYAGVVSSQLSQLPQHSIDQAAEDVVMAFSRSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The crystal structure of the beta-catenin/ICAT complex reveals the inhibitory mechanism of ICAT.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Catenin beta-1
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| molecule tags |
Structural protein
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
19
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| structure length |
71
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| sequence length |
71
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-05-22 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Beta-catenin-interacting ICAT |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1T08 B; 1M1E B; 1LUJ B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1ZAO A; 4OIP F; 3BLY A; 3DWL E; 3FIW A; 1EH6 A; 3OIP A; 1FZP B; 1N75 A; 1X58 A; 5AON A; 2JVG A; 3HZJ A; 4JOM A; 3EUH C; 3HKZ N; 4HPQ A; 5D8K B; 1DGR M; 4P96 A; 5EG0 B; 2F5D A; 1J09 A; 2KIM A; 4BGD A; 2QA4 I; 1TWF J; 2KP6 A; 1X2M A; 4EM1 A; 1JUM A; 1EF4 A; 1LFP A; 3GTJ J; 4NDL A; 2QUF A; 3C7J A; 2E1C A; 5IY5 H; 1JT0 A; 3R6S A; 4KMF A; 4PJJ A; 1B59 A; 3S32 A; 1ZR4 A; 3MZH A; 3OV8 A; 1S7E A; 5DD8 A; 3CO6 C; 3RYP A; 1K4T A; 2V9P A; 3CJR B; 2DK8 A; 3J7Z I; 2VQL A; 1WJA A; 2L3D A; 3K70 D; 3HHH A; 2NS8 A; 2Y69 H; 3FXU A; 1R22 A; 2LKP A; 5IT9 K; 2H1K A; 3OL4 A; 1HW2 A; 5F1R A; 3RZO J; 1BIB A; 2PN6 A; 4UUT A; 3SYT A; 2DFI A; 2KFD A; 4M3E A; 2XAU A; 3BTI A; 4A93 J; 5CVR A; 2FBK A; 2K86 A; 3CDH A; 1E0E A; 3RSN A; 3WTS C; 1B1B A; 4XLN F; 2HQA A; 1QPM A; 4LG0 B; 2R0Q C; 3AG2 H; 4WK8 F; 1BI2 A; 1HKQ A; 1N25 A; 4P5O A; 5H6Q A; 2ME0 A; 2OA4 A; 4Z2Y A; 3H5A A; 4ZTJ A; 3F9K A; 3BT9 A; 1YOV B; 2X85 A; 2QSH X; 1G3T A; 2JRM A; 5EGO A; 2JUC A; 2M8E A; 1IN7 A; 1LFU P; 2Z3Y A; 4QTR A; 3BR2 A; 2CFX A; 2DOE A; 3DCF A; 3G2B A; 1R36 A; 4CSW A; 4XLP F; 2COM A; 2XF6 A; 1IXS B; 2PBI A; 4YIR X; 1QZE A; 4A3G J; 2NVU B; 4ZDP A; 4M9S A; 1D5Y A; 5GTI C; 2DK5 A; 2M34 A; 4HX8 A; 4XKC A; 4LIT A; 3SEZ A; 2H09 A; 4I0B A; 5DEQ A; 4WXC A; 3CCL I; 4G94 A; 2LG4 A; 3K0L A; 3IAM 2; 2ELK A; 3COA C; 5EYR A; 1MMN A; 4CA0 A; 1N78 A; 3H36 A; 2Q2E A; 2Z2S B; 3WTW C; 3R0J A; 2K85 A; 2O8X A; 3I0T A; 4LLN A; 4EJT A; 2KHM A; 2DQR A; 4RGU A; 3BTC A; 3RTR A; 1BC8 C; 1F43 A; 2DU9 A; 4R79 A; 2DYR H; 4XNF A; 2DJN A; 4GXO A; 1KU2 A; 1ETY A; 4OMY A; 3GZ6 A; 3OWT A; 2HOT A; 2VC1 A; 3FF5 A; 1LNW A; 5D8L B; 4M3D A; 2X0L A; 1JTY A; 3MZ8 A; 2AXL A; 5DYM A; 4A3F J; 3L2R A; 4F92 B; 2R7V A; 2STT A; 2M87 A; 1JJ6 C; 2HPM A; 4ABZ A; 2V9K A; 3K6G A; 3JSP A; 1IRF A; 2A5Y B; 2FXA A; 3L00 A; 1Y8Q B; 2ESH A; 2FBI A; 3E97 A; 5E17 F; 4D5F A; 2ZNZ A; 3FK6 A; 3A02 A; 4OAY A; 1RRJ A; 3ZN1 A; 1OCC H; 4I0A A; 4BQN A; 1H0M A; 3H3Z A; 1VQ4 I; 3BWG A; 1ZR2 A; 2G9W A; 1BA5 A; 4HNV A; 3FK7 A; 4MLO A; 2HZT A; 2P81 A; 2MA3 A; 4M74 A; 5LRR A; 2ME6 A; 2MD5 A; 3TP0 A; 4AYB A; 4UB8 C; 4YFX F; 1Z67 A; 3Q0U A; 2KDO A; 4CH7 A; 2ZJQ F; 3V7C A; 1MNM C; 2VOO A; 2LY2 A; 2PLY A; 4DYQ A; 3WTT C; 3I54 A; 4CUG A; 2XGX A; 3ZCO A; 3E6C C; 5LHG A; 3C2G A; 3FMQ A; 4PJN A; 3JRG A; 4ENJ A; 3LQR A; 4IRG A; 5F04 A; 2BVL A; 1FBU A; 4BEH A; 3DQV C; 3ERE D; 1RKW A; 5A2Q K; 3J81 K; 2BY0 A; 2K9N A; 3BY6 A; 4LB6 B; 1JE8 A; 4PZJ A; 1ITY A; 2ESN A; 4N4N B; 4N0B A; 4F3Q A; 2LK2 A; 1K6Y A; 4ZJZ A; 2R5Y A; 3WOD F; 1AKH B; 1XDU A; 4HLY A; 1CF7 B; 2DJI A; 1ZRF A; 2P5V A; 1FX7 A; 4E6K G; 1UCR A; 4FT8 A; 3BJA A; 4BQA A; 3E5U A; 4NC8 A; 2X4H A; 1U5T A; 4D0P A; 2AXT C; 1OCR H; 2ZB9 A; 3ML6 A; 1RZ4 A; 1RNL A; 2W48 A; 3C2B A; 3ZQ7 A; 2NNN A; 1P9Q C; 2X6W A; 2Y0S N; 4BJT A; 2BY2 A; 1FJL A; 1TT5 B; 4OMZ A; 3PL8 A; 2KL4 A; 2P7C B; 2PQ8 A; 1SVL A; 3OS2 A; 3F6O A; 2XAJ A; 1W5C C; 1W5S A; 3SZT A; 3EYY A; 1HCR A; 4U7B A; 1BM9 A; 2FJ1 A; 3K70 C; 2Y2Z A; 1WJC A; 4MGR A; 3I59 B; 1UB9 A; 5AIQ A; 5KVR A; 3GO5 A; 3H9Q A; 3KIO A; 3JRD A; 4WXH A; 4PJL A; 1B6A A; 1XGO A; 1SFK A; 3OSF A; 2EIM H; 1ZRC A; 3M8E A; 3BQZ A; 3IUO A; 3CLO A; 3OIQ A; 3A1Y A; 4RAF A; 4A0X A; 2XC7 A; 4AIH A; 4Y7N J; 4KN7 X; 2X1D A; 1U9N A; 2O5R A; 2PMZ A; 2V7F A; 3VFZ A; 4D7N A; 2XSD C; 3BCA A; 3OIO A; 5TRD A; 4G12 A; 1VQK I; 2OZ6 A; 4NNJ A; 3HM5 A; 4DYR A; 5L3B A; 5J47 A; 3KCC A; 2UUZ A; 2L9R A; 5K5Q A; 3A2K A; 3KEY A; 2JQ7 A; 3RKX A; 1G3S A; 3GTM J; 2LTP A; 1LEB A; 1KON A; 4UVC A; 2QEX I; 1Z0X A; 5FFZ A; 4M3F A; 2CW0 F; 3U1D A; 2A3S A; 4XLH A; 2L4M A; 1JKP C; 1OCP A; 2GIV A; 1FMW A; 3T8R A; 3LST A; 2CJJ A; 1YIJ I; 1QVU A; 3KP5 A; 3HOU J; 3KYD B; 3REO A; 3QQA A; 2XRO A; 3MKY B; 3ZR8 X; 3ELK A; 1L0O C; 4BUP A; 2BBY A; 4MQ9 F; 5KAI C; 4B48 A; 1FIA A; 1UFM A; 3ZMD A; 1PUF B; 3HHG A; 3MD2 A; 3RQ4 A; 3CCJ I; 2EV0 A; 2HDD A; 3P9C A; 2ZCW A; 2V4J C; 1J5Y A; 3MVP A; 1D0X A; 1SD5 A; 2X9D A; 3CF5 F; 2JPB A; 3S1R J; 2HTJ A; 2HR3 A; 2EA2 A; 1TWH J; 2O7O A; 5F0H A; 3WGG A; 3CUQ C; 3PJR A; 3ZQL A; 2JA6 J; 1FLI A; 2I10 A; 1J9I A; 4CO8 A; 4CZZ A; 1P6R A; 2FNA A; 2M45 A; 1YJW I; 1I50 J; 4XLE A; 1TW2 A; 5L3D A; 2HYF A; 4JQF A; 2NXN B; 3EET A; 3VSK A; 4A3D J; 1O57 A; 1FIP A; 3HOX J; 3WU0 A; 1WH7 A; 1F5T A; 2E7X A; 3OYG A; 2JPC A; 5J3L A; 2IA1 A; 3LFK A; 2EZI A; 1LQ1 A; 1ETW A; 1W36 D; 3Q0V A; 3H9J A; 1K78 B; 3VWB A; 1VTN C; 2F5F A; 1XDS A; 5FRM A; 1POG A; 2QCO A; 2YU3 A; 4FTH A; 5BS6 A; 4FIS A; 5D5U B; 1OPC A; 2XPW A; 2M7B A; 2R5Z A; 1D1A A; 3JRC A; 1NHA A; 3TOB A; 3CMY A; 1GLN A; 2R7D A; 3GBG A; 4CYC A; 1IN4 A; 3QWL A; 1XTA A; 2FOK A; 3F3X A; 4M6Y A; 4A3C J; 3CQZ J; 4BE1 A; 2O61 A; 1MGT A; 5FKM A; 2QVO A; 2WAE A; 1VF9 A; 1F1Z A; 3HYI A; 3TGN A; 2B9S A; 3FXM A; 3BR0 A; 3W3C A; 2MH2 A; 4MTD A; 4I99 C; 4HQE A; 1QBJ A; 4I7H A; 2W82 A; 3EUK L; 1MDM A; 1B8I A; 3O8H A; 2VPL A; 3DTK A; 2P6S A; 2QWW A; 4UUV A; 4X0G A; 5CVU A; 2XAH A; 1QQI A; 1UHM A; 2WBM A; 4Y13 A; 2VLA A; 2CV0 A; 3SJM A; 4KIC A; 5LRS A; 3FBI B; 5F27 A; 1Y0U A; 3C18 A; 5FJ8 J; 1RIO H; 2PMU A; 2A6T A; 3EDP A; 4RBO A; 2HVQ A; 2IVM A; 5KCM A; 1JKR C; 5DUI A; 1OCO H; 3V8K A; 4P9F A; 1MH4 A; 1AOY A; 2QGU A; 2Q0O A; 3ABL H; 3K4K A; 2Z1D A; 1OYI A; 1R5I D; 2M2E A; 3M9A A; 4HYE A; 2LMD A; 4DW6 A; 4Z6Y A; 1VQ6 I; 1FNN A; 3DLA A; 4W97 A; 1SMT A; 4BS9 A; 3ZRG A; 1ACI A; 3D5S C; 2B7E A; 3P9I A; 1FTT A; 5CVI A; 2DLL A; 1K6O A; 3HG9 A; 2CS3 A; 4CCN A; 5F0F A; 1T98 A; 1A5J A; 1IN8 A; 5GAE J; 3CZ6 A; 3WHC A; 2CUE A; 4Y52 J; 3HOY J; 5HDG A; 2M5W A; 2L01 A; 5HVQ C; 3WGH A; 2EFW A; 3ZMU A; 1E17 A; 4BXF A; 2HWV A; 2RNJ A; 2M0C A; 2RKH A; 3QYE A; 2LBF B; 1FYK A; 2FEZ A; 3QU6 A; 4YRV A; 1ZG5 A; 4EJO A; 3J80 K; 2EFP A; 3R4K A; 5E79 C; 4HW0 A; 3CUQ B; 3OYL A; 4LK1 F; 1U9O A; 2V6C A; 3GTL J; 5E8G A; 3BG6 A; 4CXF A; 3FHN A; 2DTR A; 4EJV A; 1BBY A; 3PFI A; 3HL2 A; 5IP9 J; 5FKK A; 3CD6 I; 1SAX A; 3GTO J; 2HEO A; 4M9Z A; 2NYX A; 2GZW A; 2TDX A; 4G9Y A; 2KZG A; 4Q4Z F; 1WJE A; 2FX0 A; 4IX7 A; 4EVI A; 2K3P A; 2KLO A; 2HTS A; 2GWR A; 5EF6 A; 1X3W B; 1MMS A; 3OYM A; 1IXR C; 4LG3 A; 4XKB A; 3G1O A; 5K1Y A; 4DGW B; 5D6F A; 1YE9 A; 1B72 B; 3FXJ A; 3KZY A; 3I9V 2; 1WHU A; 2O03 A; 2PJP A; 3FDY A; 1AA7 A; 4B3A A; 5TGT A; 2COB A; 2E60 A; 1YIO A; 1TNS A; 2DOA A; 1USS A; 1FYL A; 4ON0 A; 2QBY A; 3SXY A; 5B66 C; 2W7N A; 4D9J A; 1RES A; 2UXN A; 2K7L A; 4PSX A; 2ADU A; 3FM5 A; 4XRF A; 4YFN F; 2JUG A; 5CKT A; 4HX7 A; 2KQR A; 3NEU A; 3L2W A; 1QRY A; 4LD5 A; 2ZC2 A; 2BW3 A; 3RPU A; 2FOW A; 1XCB A; 4M3G A; 3VOE A; 2IS2 A; 3BTL A; 4R1H A; 4HV6 A; 1T8I A; 4M6V A; 2STW A; 3BG7 A; 4GCV A; 3U1K A; 3CC2 I; 2P5L C; 2OCC H; 2E7W A; 1W1W E; 4XRS A; 4XON A; 3LNQ A; 2LF8 A; 3KLO A; 1W36 C; 1YS7 A; 2M8G X; 5JR3 A; 5FRO A; 2MBF A; 2QQ8 A; 5E1W A; 1MMD A; 1O4X A; 4Y17 A; 5IYB J; 2VL8 A; 2FF4 A; 1L3L A; 1I3A A; 2XRL A; 3EUH A; 2FMY A; 1V5G A; 3EUA A; 1K79 A; 1T6S A; 2FE3 A; 2DMU A; 2Y48 A; 5LGU A; 2X6O A; 3CUO A; 1ZRE A; 3HOZ J; 3KP2 A; 3OYD A; 4XSZ F; 1X4O A; 3TL4 X; 3DPU A; 4U0V A; 3U2R A; 2MSY A; 1WVR A; 4PFP A; 4B47 A; 3FMS A; 3GYH X; 4PFO A; 4KIT B; 2MLK A; 2NRA C; 3GUD A; 5H20 A; 3IL2 A; 2D1V A; 1G3W A; 2PJR B; 1TL8 A; 1JHH A; 2WAD A; 1D8J A; 3IWF A; 4I6Z A; 2EQR A; 1IC8 A; 2KZV A; 3JAM K; 2ECB A; 2K9Q A; 2RVC A; 1FSE A; 1WKM A; 4GGG A; 2VBW A; 1VQP I; 3KFW X; 4BQQ A; 2H8W A; 1NG6 A; 2XDV A; 5DCF A; 2GQQ A; 3JRH A; 3BG9 A; 3MN2 A; 3C3W A; 1JKO C; 2EK5 A; 1ZLJ A; 5BPI A; 5DUK A; 5CVV A; 2GOM A; 2L5Q A; 3RKY A; 5GAH J; 1IV6 A; 1FTZ A; 1WJD A; 1T0F C; 4O6J A; 3Q5F A; 1YFH A; 1GHC A; 4HF1 A; 1SD4 A; 1P2F A; 4OIO F; 3BR5 A; 1FBS A; 5BMZ A; 2RNG A; 5HDN A; 3L2U A; 3S2D J; 4G6D A; 1XSX A; 3OMY A; 2I5U A; 4MNU A; 4UHT A; 2CU7 A; 4YIF A; 5HNF A; 4WF2 A; 1IW7 F; 3HOV J; 2IS4 A; 4NHJ A; 5J6X A; 2V1D A; 5DV5 A; 4II2 A; 2FUG 2; 4QLC U; 3NWS A; 3LA2 A; 2ZME B; 1OYW A; 4U7D A; 2KPM A; 2G7H A; 4YG2 F; 5E8I A; 4RGX A; 4ETS A; 1BJZ A; 5LHI A; 1YRN B; 3GLL A; 2VKE A; 4EMS A; 1BR1 A; 2D1H A; 3BCB A; 4BU2 A; 4XRS G; 1YW8 A; 1SD6 A; 4FX0 A; 3ZQG A; 2VJ4 A; 4G7H F; 3RDI A; 3JCU C; 1MBH A; 3C1D A; 3OOU A; 2A61 A; 5IT9 Z; 1IRG A; 3K4B A; 1ETK A; 3IV5 A; 1ETO A; 2WTE A; 4XM3 A; 1LB2 A; 3RKW A; 4NC7 A; 5BOX A; 1FOX A; 3V8J A; 5E20 A; 1JHF A; 1W7P A; 1CQT A; 2UV1 A; 3L1P A; 2NOJ B; 2NS0 A; 4HZF A; 5ILS A; 4EGZ A; 3MQ0 A; 2IGN A; 1DU6 A; 4LIU A; 4F91 B; 4GO1 A; 3GFI A; 2LRE A; 3RZD J; 4AYB N; 2E19 A; 2EV6 A; 4H4K C; 4ESJ A; 1VQ7 I; 5C3E J; 3TO9 A; 4EJW A; 1DUX C; 4LGW A; 3U9G A; 1MBK A; 1ZGJ A; 1BOA A; 2BXY A; 2IA2 A; 2H6C A; 1A6I A; 2ZFW A; 5H6R A; 1LEA A; 2R93 J; 4IRI A; 5EJC A; 4UUS B; 1PP8 F; 3G3Z A; 5LLQ A; 1M1E B; 2E35 A; 3K1P A; 1XB4 A; 2E34 A; 5HS9 A; 4RA2 A; 1SMY F; 4BY1 J; 1FWZ A; 3QOP A; 2O6G E; 5HS8 A; 2YR2 A; 1GV5 A; 5JLW A; 2X1C A; 3LSG A; 4MIM A; 2M4K A; 2F5E A; 1TWC J; 5J40 A; 3AG1 H; 2EIK H; 1HC8 A; 1A04 A; 3FWE A; 4LFU A; 1X2N A; 5CVJ A; 2IP2 A; 4Q47 A; 2HU9 A; 2IW5 A; 2MW8 A; 3I71 A; 2BY1 A; 2VXZ A; 1OLT A; 4Q5S F; 4AWX B; 5L3E A; 5B1A H; 1G2H A; 1Z3X A; 4HSR A; 3CP8 A; 1MMA A; 3CC4 I; 1Y56 A; 2KJC A; 2PFB A; 1YLF A; 3KE2 A; 1XPX A; 1ZKG A; 3KPH A; 3JRI A; 4I2O A; 3VSL A; 4PGH A; 4K2E A; 4XKW A; 4YII A; 4CZC A; 2JSP A; 4IOA F; 1DPR A; 2HGC A; 2WAF A; 4U0Y A; 1YTY A; 3FKJ A; 2ZBK A; 1IRX A; 2O9L A; 2YU9 J; 3DEE A; 1JGS A; 1OIS A; 1GVJ A; 2CW7 A; 2GAU A; 3H92 A; 2M30 A; 4IOC F; 4A3B J; 2DT7 B; 1QHH D; 2DCE A; 5D5W B; 5HS7 A; 3U21 A; 5K7H A; 3KET A; 3NAR A; 1G6N A; 1ZGW A; 3K4J A; 2ZXJ A; 2PMZ N; 3MCZ A; 4AID A; 5LEJ A; 1XGN A; 1LDJ A; 2NOG A; 3SEQ A; 1K7A A; 5E3O A; 5K7Z A; 2VXD A; 1ZEL A; 1V3F A; 5CLS A; 1SEU A; 3DKW A; 1J75 A; 2DXI A; 3GF2 A; 3VYR B; 4CIC A; 1RPW A; 2DPU A; 2VIX A; 2Y75 A; 2M9H A; 2X6Y A; 1JUS A; 4FCY A; 2IRF G; 2HVR A; 2KKO A; 1BR2 A; 5EEG A; 3BG5 A; 3BJO A; 2F4I A; 2OC6 A; 2QF7 A; 3SHF A; 5A2Q Z; 3FX3 A; 4YEL A; 3J81 Z; 3K9T A; 1E3P A; 1A6Q A; 4AU7 A; 4EV0 A; 1T95 A; 4A6E A; 2NVX J; 3FZV A; 4IO9 F; 2MGQ A; 2R7W A; 1VQ5 I; 2LLK A; 5D6E A; 3IC7 A; 1Z77 A; 1ZH5 A; 2XGE A; 4HDV A; 4YEJ A; 3S1Q J; 4B3X A; 1ZK8 A; 4XMY A; 4IHV A; 4JX5 A; 5JI6 A; 5K5O A; 3BQY A; 2IJL A; 2JT1 A; 3ABU A; 3CCQ I; 4MQV A; 3FIS A; 1MBJ A; 1UZC A; 2Z99 A; 1TNT A; 4ZDL A; 3A0B C; 1T33 A; 2XAF A; 1MW7 A; 3HUG B; 2P4W A; 2EJR A; 2F4M B; 3TP3 A; 3AKZ A; 4X1E A; 1X19 A; 3A4C A; 1YS6 A; 1WH5 A; 2K9S A; 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