The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
71
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structure length |
71
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Chain Sequence |
GAPAKSPEEMYIQQKVRVLLMLRKMGSNLTASEEEFLRTYAGVVSSQLSQLPQHSIDQAAEDVVMAFSRSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The crystal structure of the beta-catenin/ICAT complex reveals the inhibitory mechanism of ICAT.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Catenin beta-1
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| molecule tags |
Structural protein
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
19
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| structure length |
71
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| sequence length |
71
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-05-22 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Beta-catenin-interacting ICAT |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1T08 B; 1M1E B; 1LUJ B; #chains in the Genus database with same CATH topology 4G12 A; 2P81 A; 2ESH A; 3FKJ A; 3O8H A; 3LWF A; 3U21 A; 3OYD A; 1J0R A; 3CO7 C; 3CDI A; 4X1E A; 4I6Z A; 3QYF A; 1UHS A; 1X58 A; 4IHX A; 3DQV C; 1ENH A; 1BI1 A; 1FIP A; 2AXL A; 2ECB A; 3K1P A; 3BQY A; 2XRN A; 1UZC A; 2BVM A; 2LR8 A; 1BR2 A; 5CVU A; 3HGY A; 3JW4 A; 4A0Y A; 2HQR A; 2WA0 A; 2R7X A; 2JMW A; 3A0H C; 1FP1 D; 2CYY A; 3NQO A; 3RTR A; 1T38 A; 3OR2 C; 3JAM K; 1PDN C; 2XV4 S; 2KIU A; 1ZRF A; 1VF9 A; 4ASN A; 4QTR A; 3HXL A; 2K9M A; 4MTE A; 3BRO A; 3F6V A; 3GWZ A; 2LK2 A; 1MBG A; 3B6A A; 3HHG A; 2F2E A; 4LLG F; 2HVR A; 1VQ4 I; 1PP8 F; 3NRV A; 3RYP A; 1F36 A; 4CCO A; 1U6G A; 3BJ6 A; 3QWL A; 3FXU A; 4AC0 A; 4FE7 A; 2DA1 A; 2VOP A; 2Q1Z B; 4IXA A; 3BG5 A; 2FBK A; 5H6Q A; 4I98 B; 3PSI A; 4V2G A; 4BL0 B; 2VQH A; 1POG A; 2NNY A; 2JT1 A; 5CKT A; 3ZN1 A; 4C9Y A; 2LY9 A; 1YIT I; 3TDU C; 3RPQ A; 5EGO B; 2WB1 A; 2DMQ A; 1JT6 A; 2VC0 A; 2B7E A; 5BPI A; 4XLE A; 3FK6 A; 3FF5 A; 3AKZ A; 4L0Z B; 1FPQ A; 4N0B A; 3ERM A; 5CVJ A; 3C2B A; 4BUP A; 4P1W A; 1IAW A; 2Y2Z A; 1YFH A; 1WHU A; 2KRH A; 3QPS A; 4IHW A; 4S0H B; 2ZB9 A; 1BR4 A; 1OCP A; 2JZY A; 1YO5 C; 2LVS A; 4JK1 X; 2GZW A; 3T5X A; 4CCN A; 4A3L J; 3F9K A; 2IRF G; 1Z3Y A; 2DJN A; 4HW0 A; 4HOB A; 3EUH A; 4PFO A; 1WCM J; 2YS9 A; 5LRS A; 4HX7 A; 3LA2 A; 2P5K A; 4R8H A; 1XDS A; 2DDA A; 2XHK A; 1H9T A; 2GLO A; 1HDD C; 2NVU B; 4CHU A; 3RIR A; 1UB9 A; 1BOA A; 1A35 A; 4DGW B; 2DK5 A; 5LGT A; 3AAF A; 3COA C; 3FKI J; 2NS7 A; 3IUO A; 3BOQ A; 1WRJ A; 4XK4 A; 2UWM A; 2QLZ A; 2GA2 A; 3VOD A; 1Q1H A; 1LDD A; 2HXI A; 2Z99 A; 2VQC A; 3OOU A; 4BHC A; 2P0W A; 3A03 A; 3HOV J; 3PNT A; 3L1P A; 3OYA A; 3BR5 A; 3GFJ A; 2P7C B; 2VKD A; 2XUB A; 3GTJ J; 4BQQ A; 5LD2 C; 2EQR A; 4U87 A; 3OYL A; 1IV6 A; 1NHA A; 3S2H J; 3S1R J; 3N97 A; 4JX6 A; 4KIT B; 3L2R A; 3OS2 A; 5CQE A; 3QP6 A; 3S3M A; 2MFZ A; 1R1T A; 1ZRC A; 2XSD C; 4I7H A; 1IRX A; 1XTA A; 4CZC A; 2HPM A; 1N25 A; 1FZP B; 3F8F A; 2YU9 J; 1A6I A; 1QZE A; 1ETW A; 2G7H A; 1P4A A; 2KJC A; 3R60 A; 4HEA 2; 4ANJ A; 3R0A A; 4QIW N; 1SVL A; 2PQ8 A; 4BAY A; 2BHZ A; 3FXM A; 2F4O B; 2DPD A; 3AG1 H; 1TWG J; 2XRO A; 4RDU A; 3TOB A; 3OYJ A; 1LKX A; 3PUB A; 3GEZ A; 4F91 B; 5HS7 A; 1JUM A; 4CCM A; 1FYL A; 2DK8 A; 4ZYA A; 4N4O B; 3MZY A; 3HTU A; 4FQG A; 3K9T A; 3ONQ A; 4LJZ F; 1I27 A; 5HDG A; 1G59 A; 4XOT A; 5EZG A; 1LUJ B; 5EG0 A; 5HVQ C; 2VON A; 1J59 A; 5BMZ A; 4G8X A; 2MH9 A; 4E4H A; 3JRG A; 2DA6 A; 2BVL A; 2IA0 A; 3FX3 A; 5E3N A; 3CCU I; 3CC7 I; 1LVA A; 5KK1 A; 3PIO F; 2L2O A; 2JA8 J; 2KDO A; 4ZYG A; 3FXL A; 2EBI A; 1XN7 A; 1J7K A; 2ZO4 A; 2OAZ A; 3E7L A; 3M7G A; 3JCU C; 4DNC A; 1F4K A; 4HF0 A; 3RZO J; 4U0V A; 2IPQ X; 3GLX A; 3OYN A; 2X1E A; 3J81 Z; 3EUA A; 2BGC A; 4IVN A; 2VXZ A; 5L3B A; 4BHB A; 2KIQ A; 1R49 A; 1NG6 A; 3I59 B; 4GO1 A; 1K78 B; 4KIB A; 2EV0 A; 2FEZ A; 2KHM A; 2NYX A; 2KIS A; 2RQP A; 3NEU A; 3OIQ A; 5D8L B; 2ZJR F; 4EGY A; 4I76 A; 2BOL A; 1I3A A; 3S32 A; 3IKV A; 2VL8 A; 1RR8 C; 1R1V A; 3K69 A; 2L7K A; 3LSP A; 1RI7 A; 3JRH A; 1ACI A; 2OD5 A; 1KU9 A; 1IRF A; 1IW7 F; 2ZXW H; 2DW4 A; 1GVJ A; 1DGR M; 3CLQ A; 3CF2 A; 4Y52 J; 3KP2 A; 1UMQ A; 5JVT A; 4II3 A; 5EJC A; 5ED4 A; 1MDM A; 5FKL A; 4B09 A; 1OR7 A; 2O8K A; 1Z6R A; 2DOD A; 3E3V A; 2LRE A; 3I54 A; 3T8T A; 4PJL A; 2HOS A; 2OZ6 A; 4G94 A; 3WTZ A; 4OIP F; 2VBW A; 3GTM J; 4Q47 A; 1V54 H; 4E7K A; 2LBF B; 1G3W A; 3ZQH A; 3HOS A; 2WC2 A; 3E6C C; 2VJJ A; 1KA8 A; 3GFI A; 2A05 A; 5IP7 J; 1A31 A; 2ECC A; 2BBY A; 3CMM A; 2FJ1 A; 5LRR A; 2F5E A; 2EFQ A; 5LEK A; 1FBU A; 5E1X A; 4ZDL A; 2ZJP F; 5FLV A; 3PNY A; 1Y0U A; 1IDY A; 3PO3 J; 4BGD A; 4MFD A; 3F3X A; 4O5V A; 1KYZ A; 1S6L A; 2M1B A; 3I55 I; 4I02 A; 3ZQC A; 4ZYH A; 4E7H A; 1K61 A; 4GGG A; 4NB5 A; 4BE0 A; 2QKM B; 4U7B A; 3I56 I; 1PUE E; 4ETS A; 3ZR8 X; 4BJT A; 4L9N A; 3TO7 A; 4J19 A; 2M8G X; 3CMY A; 1VQP I; 2ID3 A; 2KRF A; 1F9N A; 1WJA A; 5BPD A; 3H3V K; 1V4R A; 2HR3 A; 1P6R A; 3KP5 A; 3JRF A; 4W1U A; 5TRD A; 2OTJ I; 1AOY A; 4Y15 A; 4RA2 A; 4ZC3 A; 2P7V B; 1Z91 A; 4XLP F; 2A61 A; 5BQT A; 2F6C A; 2EH3 A; 5A2Q Z; 2ME0 A; 3K7A J; 2K5C A; 2JVG A; 3HC7 A; 1R5H A; 2Y75 A; 2O0Y A; 5JI6 A; 3CCR I; 1ONV A; 2R7W A; 3S16 J; 3WTU C; 3OYF A; 3F72 A; 3G71 I; 3GTO J; 3ZMD A; 1Y6I A; 3LMM A; 2PMU A; 1SD4 A; 1MBF A; 2LH9 A; 3WHC A; 4GYG A; 1GLN A; 4BDY A; 2XAS A; 2W1O A; 3ZQI A; 5IY5 H; 4RGX A; 1VQL I; 3E6D A; 1R5I D; 5D5U B; 1ZHF A; 3W3C A; 1JTX A; 3H92 A; 4UUS A; 2DA5 A; 2F5V A; 4XRS G; 3FMS A; 2XAF A; 2GM4 A; 1JI8 A; 1QPI A; 2VAS A; 1ZRD A; 1LB2 A; 2EJR A; 2O7O A; 2G9W A; 3BZK A; 1APL C; 2V9P A; 3CTA A; 2MLG A; 4KT5 C; 1D1C A; 4XKW A; 4MQ9 F; 1VQ8 I; 4A3J J; 2CQ7 A; 1W36 D; 4XRF A; 2CUJ A; 2YSR A; 4UB6 C; 1MMS A; 3GXO A; 3JRB A; 3O3K A; 4I01 A; 3RKX A; 4B1R A; 4KN4 X; 1RES A; 3WE2 A; 3IRR A; 3DPU A; 2DPU A; 3B02 A; 2MYS A; 2KT0 A; 2D5V A; 4HSR A; 5EGO A; 2H94 A; 3FM5 A; 4UXN A; 2PJR A; 2PN6 A; 3KZY A; 4LIU A; 1MMA A; 4L9T A; 4GFB A; 3J7Y J; 1FMV A; 3VDX A; 2RV8 A; 1WPK A; 4UHT A; 3MVP A; 2EZH A; 5HOO A; 4HAM A; 5DDG A; 2QZ8 A; 1XS9 A; 5K5R A; 5HLG A; 2DMT A; 2V9K A; 2HXO A; 1RRJ A; 5KAF C; 5EYR A; 2UV1 A; 2ZC2 A; 2HDD A; 1TNS A; 2K86 A; 4PJJ A; 4OU0 A; 3T0Y A; 1ZR2 A; 1K83 J; 3AG3 H; 2HQN A; 2IAI A; 2EB7 A; 2MGQ A; 3ZMT A; 3SQN A; 2E5Z A; 5FKM A; 4L0Y B; 3HTS B; 2XGE A; 5F64 A; 4XL9 A; 2L9V A; 1QU3 A; 1DGW Y; 3K4J A; 4YG2 F; 2PMZ A; 5JLX A; 3HEF A; 3MQ0 A; 1LFU P; 2ZNZ A; 2WAE A; 4HQM A; 3S17 J; 5C3E J; 2R93 J; 5F1R A; 5FKK A; 4N9I A; 4I0B A; 3DTK A; 5M5X J; 4EJV A; 2NOJ B; 2OZU A; 1UG2 A; 5B1A H; 3FXO A; 2NNN A; 3K4N A; 1TZL A; 3HRM A; 1LDJ A; 4XR6 A; 3S2W A; 2RGV A; 3SEZ A; 4NHJ A; 1ZGA A; 5K5O A; 3J80 Z; 2HYF A; 2EFP A; 2YU3 A; 2ZME A; 1W0U A; 4R1H A; 4XN3 A; 5E17 F; 5GAD J; 4OIQ F; 4PSX A; 1BJZ A; 3OWT A; 2EV5 A; 4KDP A; 2HTJ A; 1RUN A; 1AWC A; 2K40 A; 5ICG A; 1SFU A; 2BW3 A; 2D1V A; 2OTL I; 2LYC A; 2H6C A; 4WXC A; 1ODD A; 2BE5 F; 3K2Z A; 3AL0 C; 1RKT A; 3LOC A; 1TWH J; 3KPH A; 1HBX G; 2M87 A; 1Z7U A; 2RVC A; 2ZFU A; 2IGO A; 2V6C A; 1LPQ A; 2D45 A; 3CUQ C; 3MAJ A; 4M9Z A; 3GZN B; 2EZL A; 3L00 A; 3CES A; 4MNU A; 5GPA A; 3R6S A; 2OCE A; 4BNC A; 1R00 A; 1ETX A; 2DFE A; 3OYC A; 1YS6 A; 3ELK A; 1B59 A; 2Z33 A; 2DI3 A; 1Q1V A; 2MAB A; 2Y48 A; 2YUS A; 1ZG5 A; 3GX4 X; 4QSH A; 2Z5U A; 1MIJ A; 1TW2 A; 5IP9 J; 2VPL A; 5EF6 A; 2JWT A; 2YR2 A; 1HCR A; 3IH2 A; 1H9G A; 2CO5 A; 4HV5 A; 4RMN A; 5ILV A; 4M9S A; 2VBZ A; 1MJB A; 4BXF A; 3OS1 A; 2W82 A; 3LL7 A; 2XAG A; 1W0T A; 3S1N J; 5TJJ A; 2HZD A; 1MBH A; 3DPT A; 1XD7 A; 3U1D A; 4CDG A; 2FD5 A; 1B1B A; 4CA0 A; 2PX9 A; 1ULY A; 5DTD A; 1UCR A; 3TBI A; 2QQB A; 2R4G A; 3W6V A; 2MA3 A; 3EYI A; 5EG0 B; 4ENK A; 5JVG F; 1LEB A; 2Y30 A; 2FU4 A; 1JHF A; 3P9C A; 3JRE A; 1G6N A; 4ZDO A; 3GME A; 2VBY A; 4L9V A; 1TWA J; 2L9N A; 2QSF X; 3QPT A; 4CXF A; 2IS4 A; 4HBL A; 4P96 A; 2IS2 A; 2VI6 A; 4A3G J; 1O57 A; 3ABU A; 1E17 A; 1J9I A; 3CC4 I; 3GTK J; 5EZH A; 1IRZ A; 1JHH A; 4XKC A; 2NVY J; 3DPL C; 2R7O A; 1GVD A; 4XMY A; 5D4S A; 2R0Q C; 3JRA A; 2OF7 A; 5IYB J; 4YFN F; 1BIA A; 1LVK A; 1V5F A; 5LBQ A; 3A4C A; 2FQ4 A; 5L3C A; 4EM1 A; 3CJT B; 3HM5 A; 1D0X A; 4IOC F; 3LQQ A; 1YJ9 I; 1T98 A; 1RET A; 5IYC J; 1K4S A; 5BNG A; 4PDK A; 1PJR A; 3IH3 A; 3K10 A; 4OIN F; 2QEX I; 1IUF A; 2LLK A; 1MNM C; 3OY9 A; 4UY8 I; 1Z21 A; 1QO0 D; 1UAA A; 3JTH A; 4Y33 A; 2KRC A; 1HKS A; 2EFW A; 1DUX C; 3DBH B; 4AM3 A; 1G2H A; 1KGS A; 2H8W A; 4G9Y A; 2B0L A; 1FP2 A; 2PMH A; 3BJA A; 4OOI A; 1ZG1 A; 4BXU A; 2V6E A; 1SC7 A; 1ZK8 A; 4XNF A; 3OYI A; 4IRH A; 4LB6 B; 2WWY A; 2DTZ A; 4YIR X; 2EFO A; 4IQ4 A; 3FMR A; 5JFR A; 1QNT A; 1R6R A; 2V1D A; 3WU1 B; 3RZD J; 2GIZ A; 5EEG A; 3A01 A; 4AIK A; 2IS1 A; 1D5Y A; 3DBL B; 3OYK A; 1X3Z B; 2VB6 A; 2KQR A; 3VEP A; 5E1W A; 4D5C A; 2DOA A; 4CO8 A; 1N77 A; 2KZG A; 3I4M J; 1KYW A; 4EJW A; 4QPQ A; 2XB0 X; 3BT9 A; 1D3Y A; 2XF5 A; 3M1C A; 1IXS B; 1P9Q C; 1QA6 A; 2EFN A; 4BEH A; 3H5A A; 4Q48 A; 5HNF A; 5ICE A; 1R1U A; 4G7O F; 4A69 C; 2CUE A; 3HBL A; 2GQQ A; 2DA3 A; 3EYY A; 3REO A; 2E19 A; 1JKR C; 3ABT A; 2CQK A; 3H9Q A; 2OC6 A; 1W5S A; 4JBA A; 2JA6 J; 1FJL A; 2VKV A; 3LNQ A; 2BY2 A; 4EJO A; 2JK3 A; 3JRC A; 1W5T A; 5DD8 A; 4E7S A; 2CRG A; 4ENN A; 4M6V A; 1KU3 A; 1Y1V J; 3B73 A; 4CZZ A; 3RCO A; 4BS9 A; 2K9S A; 2OQR A; 3KFW X; 4IZZ A; 4ZDP A; 4XLH A; 4Y7N J; 3LQR A; 3QU3 A; 2MLK A; 1N78 A; 2VPR A; 2EZK A; 5B5E C; 1T95 A; 2LMD A; 2VN2 A; 2C6Y A; 1R5G A; 2VJ5 A; 1TLH B; 3FXQ A; 2M3A A; 3KE2 A; 4M74 A; 1MBE A; 4KA4 A; 3GTL J; 2P6S A; 1TQM A; 2DQL A; 2KJB A; 5GPC A; 3LSR A; 3WOD F; 4NQW B; 1WH5 A; 3AFH A; 2A3S A; 4LIV A; 1NG7 A; 1EJ9 A; 2Z1D A; 4L5J A; 3OOP A; 1SAU A; 4XLN F; 4CH7 A; 2E60 A; 4IQJ A; 1K6Y A; 1WJD A; 4NDL A; 2WTE A; 2H6B A; 4UUS B; 1BN5 A; 2GBY A; 1ETQ A; 2DMN A; 3DKY A; 1VQN I; 2E1C A; 4A6D A; 3G73 A; 2BHY A; 5FKO A; 3GZ5 A; 4YRV A; 4U7D A; 1NTC A; 1JGG A; 3CD6 I; 2M7B A; 2UZK A; 4C30 A; 1HQC A; 5B3S H; 4XIC A; 1OYY A; 2DAO A; 3GUD A; 1I1S A; 2IVM A; 4A2U A; 2PLY A; 4IHV A; 4MLO A; 4HDU A; 2CQQ A; 4XM3 A; 4MHG A; 2DFH A; 2OA4 A; 2E35 A; 4RAZ A; 1OCT C; 3A0B C; 3CME I; 1LFP A; 2RKH A; 2KMU A; 2LNB A; 2XF7 A; 4W97 A; 2CMP A; 1FX7 A; 1O3T A; 4JOM A; 2NAZ A; 2NS8 A; 2PJR B; 3RPU A; 2RNJ A; 1XCV A; 3H9G A; 5FO5 A; 2FNP A; 4BYY A; 2L5Q A; 2GA1 A; 3CQZ J; 4P9U A; 4WXH A; 1C0W A; 4IEJ A; 3MFK A; 1IN7 A; 1ZTR A; 3S15 J; 1HOM A; 4IKF A; 3QAH A; 4DW6 A; 4S05 A; 1X1B A; 2COB A; 1UEL B; 1P92 A; 4PGH A; 1XDU A; 5CJ9 A; 4FCY A; 2VKE A; 1QGP A; 5D6E A; 1OLT A; 4ON0 A; 1GV5 A; 1TT5 B; 2LRD A; 2E34 A; 5DUK A; 4E7L A; 3OL3 A; 3FMQ A; 1S7E A; 5FLM J; 1ITY A; 3L2U A; 3H0D A; 3G2B A; 4J01 A; 1S7O A; 3M4O J; 4P9F A; 2H09 A; 3V7R A; 3NWS A; 1JKP C; 2FUG 2; 2LKS A; 5DS9 A; 1ZAO A; 3TP0 A; 3IAS 2; 4MQV A; 2VT3 A; 3HRU A; 5D5W B; 4RM3 A; 4MIM A; 5AON A; 1I1G A; 1T6S A; 5E3O A; 4NNJ A; 3OYG A; 4ZZD A; 1IN8 A; 2HDW A; 2X51 A; 3ZQF A; 2GOX B; 3HSF A; 4O3M A; 3V42 A; 5FRO A; 2QVO A; 4BE2 A; 1OYW A; 4GRI A; 1MJ9 A; 3ISP A; 3WG7 H; 2VOO A; 3A1Y A; 4P5O A; 2ZME B; 2KPM A; 1I50 J; 3EDP A; 1GDT A; 4FE4 A; 3ABK H; 4ZTF A; 2N8G A; 2L7F P; 3EET A; 3RQI A; 3CC2 I; 2ADU A; 3VB2 A; 1MSF C; 4IHS A; 1VQ7 I; 5FRM A; 1YHQ I; 2BW3 B; 5L3D A; 2QSG X; 5DCF A; 1IRG A; 3I5U A; 1FSE A; 2GAU A; 1WH7 A; 1SFK A; 1Z67 A; 3C1D A; 3N05 A; 3O8G A; 1T0F C; 1SAN A; 2PI0 A; 3H0G J; 5E1Z B; 2A07 F; 4I99 C; 3KEQ A; 2JN6 A; 2DQR A; 2R3S A; 2KIF A; 3V8L A; 1BIB A; 2WAQ A; 5BOX A; 2L0K A; 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