The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
71
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structure length |
71
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Chain Sequence |
GAPAKSPEEMYIQQKVRVLLMLRKMGSNLTASEEEFLRTYAGVVSSQLSQLPQHSIDQAAEDVVMAFSRSE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The crystal structure of the beta-catenin/ICAT complex reveals the inhibitory mechanism of ICAT.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Catenin beta-1
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| molecule tags |
Structural protein
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
19
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| structure length |
71
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| sequence length |
71
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-05-22 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Beta-catenin-interacting ICAT |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1LUJ B; 1M1E B; 1T08 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 4EAT A; 4GRI A; 4HLX A; 5HVQ C; 1Z6R A; 5BOX A; 1K4T A; 2FOW A; 1G6N A; 1JUS A; 1VZ0 A; 2Y30 A; 4GXO A; 1MGT A; 1P4W A; 3VSL A; 3SQN A; 3H0D A; 1VND A; 4EGZ A; 4BJ5 C; 2BW3 B; 4XLC A; 1W0U A; 1IF1 A; 2QUF A; 1WJF A; 2X85 A; 3ZN0 A; 3RDI A; 1S72 I; 4HST A; 4MO7 A; 4KT5 C; 3V8J A; 3OS1 A; 5DM6 F; 3L9F A; 4LLL A; 4AWX B; 4UB6 C; 5LEJ A; 3I0T A; 2GWR A; 2FEZ A; 2Q8K A; 5EG0 B; 2WAF A; 3SXY A; 4YRV A; 2VKE A; 1MBK A; 1WJA A; 4GDF A; 1RNL A; 2P5L C; 2VJ4 A; 1IUY A; 4WF2 A; 5FB2 A; 1TL8 A; 5DYM A; 2GBY A; 5BS6 A; 4YG2 F; 3K69 A; 4AID A; 1RR8 C; 2F2E A; 2OCE A; 2BY0 A; 2CQ7 A; 2RN7 A; 4BE1 A; 3BG7 A; 2EA4 A; 2X6X A; 4CUG A; 2LOO A; 4Y17 A; 5E8I A; 4GGG A; 3RIR A; 3COA C; 1W7P A; 2X1C A; 3IWZ A; 1S29 A; 2IEK A; 1K61 A; 1A36 A; 1T8I A; 3S32 A; 4RBO A; 3A0B C; 2B63 J; 2XKO A; 3TGN A; 4IHV A; 3W6K B; 2DXI A; 1GDT A; 1JT0 A; 1FSE A; 2IRF G; 1B72 B; 2VBY A; 5LHG A; 1MW7 A; 1WPK A; 1NTC A; 2M1B A; 2E5Z A; 4AUX A; 5JFR A; 3I4M J; 1BIA A; 3K1M A; 2I5U A; 3RPU D; 3OYN A; 1S8N A; 1SC7 A; 2DT5 A; 5JHF A; 3GF2 A; 1Y39 A; 1LJ9 A; 5J6X A; 4A5N A; 3M1C A; 1XCV A; 1WKM A; 4U0V A; 3VYT B; 4I99 C; 5J1U A; 1WVR A; 3TL4 X; 4A0Y A; 1OJL A; 1KU7 A; 3HTS B; 5J8C A; 1O7F A; 2XGE A; 3FXM A; 4Y4R A; 4IL6 C; 1R71 A; 1FOY A; 1CGP A; 3GFI A; 3GTP J; 1R22 A; 2M4K A; 3K2A A; 1V5E A; 2DA2 A; 2W85 A; 3LFU A; 2XGX A; 3OYF A; 1NG6 A; 4XLN F; 1BJA A; 4KIG A; 3FMQ A; 4ZYE A; 1ULY A; 1H9T A; 4G7H F; 1S7A A; 2B0L A; 2LDU A; 3HSR A; 2HNH A; 2IP2 A; 5B5E C; 1ZKG A; 3TW6 A; 4PFP A; 1R4M B; 3CP2 A; 5HNF A; 1TP4 A; 5H6R A; 1NK2 P; 5IPA A; 1KQ8 A; 3CUO A; 3DPL C; 1QVT A; 3PIO F; 1S3J A; 5TIS C; 2IGK A; 4BXU A; 2P6T A; 2HU9 A; 2X6O A; 3S3O A; 4IHY A; 2CV2 A; 4Q4Z F; 3KZZ A; 3KP7 A; 4D7M A; 2L7Z A; 2IT0 A; 3QWL A; 1IV8 A; 3EUK L; 2R7R A; 5J8F A; 2XGD A; 2YX7 A; 4M73 A; 5KVR A; 2RKH A; 2X48 A; 2M7A A; 3VFZ A; 2KIU A; 5J3L A; 1V5G A; 1OCC H; 3K1P A; 2LF7 A; 3ECO A; 4C30 A; 1E3O C; 1YW9 A; 3CCE I; 4E7L A; 3LNQ A; 4BQQ A; 3FBN B; 1RUO A; 1AKH B; 1D0Y A; 3DEU A; 1I50 J; 4C9Y A; 4FCY A; 1MZB A; 1BJZ A; 1N25 A; 3WTZ A; 2X9D A; 4J00 A; 2NVX J; 4LIV A; 1ZRE A; 5EYR A; 1BI2 A; 1JTY A; 4PJ0 C; 3IKV A; 4BJ6 C; 2CQK A; 3CMA I; 1MDM A; 1R6R A; 5L3F A; 5EGO A; 1ZYR F; 3MZ8 A; 4DZJ A; 5DM7 F; 1WCM J; 5H6Q A; 3VYU B; 4A3J J; 3M9A A; 2IGN A; 3LSM A; 5C4J J; 2VON A; 4DGW B; 1IDZ A; 4A93 J; 4BQN A; 3CDH A; 4E6K G; 2MLG A; 3OYM A; 3HBL A; 1FT9 A; 2OBP A; 3J7A Y; 2ZXH A; 1QBJ A; 4H0E A; 2VB6 A; 3C2B A; 3PL8 A; 3H5N A; 1X1B A; 2V1X A; 4FAS D; 3E5U A; 3K4N A; 3VPR A; 1ZQ3 P; 2NS8 A; 3MMY B; 1XX5 A; 3LA7 A; 4P9U A; 4A12 A; 1YW7 A; 1LUJ B; 2QYO A; 2VI6 A; 2DTZ A; 2VBW A; 2L7F P; 4KN4 X; 2L3D A; 2DK8 A; 2WY7 Q; 3ZQC A; 3ZQQ A; 2FBH A; 2HXO A; 5D4R A; 1R9T J; 1MKM A; 4DYQ A; 4LMY A; 2MGQ A; 3U9G A; 4BL0 B; 2XDV A; 2IGO A; 2VAS A; 3TW7 A; 5HS8 A; 1SFE A; 2XSD C; 4R8H A; 4PDK A; 4E7J A; 1IZ1 A; 1RC9 A; 2XRL A; 3QYE A; 4LG0 A; 2JA7 J; 4G6T B; 4ZZL A; 1FYL A; 5FKN A; 1OYY A; 3DLL F; 2KRF A; 1A35 A; 3OL3 A; 1VQ6 I; 4FT8 A; 4A69 C; 4H4K C; 3WOD F; 1NK3 P; 4MQ9 F; 2M7B A; 1XGS A; 4M71 A; 3TO7 A; 3A01 B; 2L01 A; 1TNT A; 3T8R A; 4N9H A; 3QPL A; 2QEX I; 2R7S A; 4DBQ A; 4AC0 A; 2VJI A; 3TKY A; 4Q48 A; 4CCN A; 1QPI A; 2Y0M A; 4RA2 A; 2LK2 A; 1LE8 B; 4BBR J; 1YJN I; 1R58 A; 1TWF J; 2CG4 A; 1R49 A; 1DP7 P; 4RAZ A; 2XAJ A; 4XKC A; 5B1B H; 1HLV A; 2LYC A; 4LIT A; 2GXB A; 3KIO A; 5D5U B; 3QOP A; 2EZH A; 1YLF A; 2L54 A; 5F0F A; 5FLV A; 3CJN A; 1HW2 A; 4G8X A; 2ZSH B; 5K7F A; 4AU7 A; 3GVA A; 4I09 A; 2P5K A; 3LL7 A; 1O57 A; 2DMQ A; 4ZTF A; 3GCM A; 1FEX A; 1T98 A; 5DUI A; 1XGM A; 2K4J A; 4Z2Y A; 1VQL I; 5FFX A; 1BI3 A; 1JT6 A; 1F36 A; 5F08 A; 1PP8 F; 2MSY A; 2PJP A; 1LB2 A; 2PBI A; 2Q1Z B; 1ETW A; 4HG2 A; 3GTM J; 2UXX A; 5J4Y A; 4OIP F; 2DMU A; 4L5E A; 3DP7 A; 2DBB A; 4G6Q A; 2A6T A; 2R0Q C; 4HX8 A; 4EV0 A; 2R3S A; 2HXI A; 3GZ6 A; 1K7A A; 3GBG A; 5BNG A; 2XF5 A; 5E1Z B; 5KCM A; 2HKO A; 4P5O A; 3L7W A; 3OL4 A; 5FRM A; 1MNM C; 2V1N A; 2HOE A; 1U0J A; 3LSJ A; 2QSH X; 3HG9 A; 2KRH A; 4D5F A; 3CF2 A; 3M1E A; 2QLZ A; 4XM3 A; 4FHT A; 4M3E A; 4L9J A; 2BHZ A; 3CC2 I; 3TDU C; 3CC4 I; 4XL9 A; 3OYC A; 1HDP A; 1X3W B; 3HOT A; 1KYW A; 3P9K A; 3CF5 F; 3U2R A; 5GTI C; 2R5Y A; 3H5A A; 2Y9Z A; 5GAH J; 4II3 A; 2QWW A; 1JTX A; 3HSF A; 3FXJ A; 1X3U A; 2TCT A; 3K4K A; 3TBI A; 1UHS A; 3BR6 A; 2M0M A; 4RGS A; 1X2M A; 2ISZ A; 2LR8 A; 1SEU A; 4RLF A; 3WG9 A; 3ZN1 A; 2M45 A; 3QRF F; 3LSK A; 3HEF A; 4ZZD A; 3EDP A; 3D5R C; 1YQA A; 1SVM A; 3J7A O; 4C2T A; 4WXH A; 4RDU A; 2DW4 A; 4RB0 A; 1R36 A; 3F3X A; 3OS2 A; 1AU7 A; 2GOM A; 4KIB A; 2L5Q A; 2O0Y A; 1GT0 C; 4GFB A; 4RS8 A; 1LFB A; 2NOG A; 4CCJ A; 4XLE A; 2MH2 A; 4A3K J; 1D1A A; 1KZH A; 2ZXW H; 2JN6 A; 2OJE D; 3I4P A; 5FD5 A; 1FP2 A; 1SMT A; 2LTP A; 3OWT A; 4L5I A; 4PSW A; 1UST A; 3J81 Z; 1UFM A; 4CZZ A; 4EM1 A; 3KET A; 3AL0 C; 3BG5 A; 2M8E A; 2ELJ A; 2E2I J; 1ZGJ A; 2DDB A; 3JSO A; 3DKY A; 2VQG A; 1YS6 A; 3KYC B; 4MFE A; 1TW2 A; 3ERE D; 2R5Z B; 5ED4 A; 3ECH A; 1KON A; 2CUE A; 2PMH A; 1WJD A; 1U9N A; 4KT6 A; 5JI6 A; 1W36 C; 4BY1 J; 9ANT A; 1L0O C; 4QPO A; 2RNJ A; 4XLP F; 2W82 A; 4CCO A; 4QIW N; 2JT1 A; 2UWM A; 2K27 A; 1X2N A; 1PVE A; 1GLN A; 1Y1V J; 4HF0 A; 4IVN A; 4BEH B; 2PJR B; 2DO7 A; 1JE8 A; 3E0J B; 3PSF A; 4A2U A; 1SD5 A; 5CKT A; 3KP4 A; 2PN6 A; 4LLG F; 3Q9S A; 4KUM A; 4L9N A; 2EH3 A; 1APL C; 2QF7 A; 1MJ9 A; 1HKT A; 3PQK A; 2R7U A; 4BQO A; 3J7Z I; 4YEJ A; 5IYC J; 3SDB A; 3L2V A; 3HOY J; 1J59 A; 2IS2 A; 1K6Y A; 1PUE E; 3CUQ A; 3ML6 A; 3NAU A; 1G8X A; 3Q9V A; 5HDN A; 1QVU A; 3JW4 A; 4HQE A; 2R4G A; 4CYC B; 2LH9 A; 5D5X B; 4HAM A; 3NAR A; 5HOD A; 1XDU A; 2Z1D A; 4RB2 C; 4X6A J; 2AS5 F; 2VQC A; 2FOK A; 2LBF B; 1UEL B; 1KYZ A; 2DN0 A; 4JYK A; 4N4N B; 3S2H J; 1D5V A; 2RGV A; 3ZQL A; 3IRR A; 2E35 A; 1WWX A; 1TWH J; 2Y48 A; 2VOD A; 3BR5 A; 4DJA A; 2ZME B; 2ZNZ A; 1W4M A; 4MTD A; 4YEL A; 4A0Z A; 3BTC A; 3E5Q A; 3TDZ C; 4BUP A; 2KJC A; 5K7Z A; 2LD5 A; 2EFQ A; 1I3A A; 4ITV A; 1IRF A; 4LK0 F; 4HF1 A; 1QRY A; 2EFO A; 3K7A J; 1MJB A; 1T33 A; 2DOA A; 5TJJ A; 3UKG A; 2ELK A; 2CQN A; 1HW5 A; 1IXC A; 3HUG A; 1F4K A; 2JRT A; 2KDZ A; 4HLY A; 3RZD J; 1ORK A; 1MD0 A; 3JCU C; 2JA6 J; 1ETY A; 3LST A; 2R5Y B; 1RI7 A; 2ZSI B; 5F64 A; 4ZYA A; 1OLT A; 5EEG A; 1O3S A; 3MQ0 A; 4BDY A; 1FTT A; 1ZG1 A; 1POG A; 2R92 J; 2X1E A; 3CMM A; 1R23 A; 3IV5 A; 1EH7 A; 3CMY A; 1ZK8 A; 5HLI A; 3JRD A; 5KHD A; 3F22 A; 3QP5 A; 3CLQ A; 3V7S A; 4UY8 I; 3L1P A; 3FXL A; 3QU3 A; 2CMP A; 1G3W A; 1G3T A; 2EWN A; 3B73 A; 2EZI A; 3FXU A; 1LVK A; 1YHQ I; 4CA0 A; 2AO9 A; 4HW0 A; 1WI9 A; 3RKY A; 1I27 A; 1WSU A; 1FMW A; 3N97 A; 2MD0 A; 3QOD A; 3UNG C; 2BW3 A; 2QZ8 A; 5FLM J; 1T38 A; 3FZV A; 2C6Y A; 2O5R A; 3GWZ A; 1I3Q J; 1RUN A; 1RR7 A; 3HRS A; 3V8L A; 2DYS H; 2D2W A; 2XB5 A; 2XF6 A; 3KEQ A; 3QAH A; 3LFK A; 3RPU A; 4PSX A; 4OIQ F; 5DCF A; 2M5W A; 3KP6 A; 4HNT A; 3OYA A; 2IJL A; 2OZ6 A; 5A2Q K; 3MZH A; 2UV1 A; 2DT6 A; 3K10 A; 1STZ A; 1FPQ A; 3ABM H; 3GTJ J; 5EG0 A; 2XVC A; 3GYH X; 2A6H F; 2D5V A; 2LG4 A; 3DFG A; 4RGU A; 4DBR A; 4ESF A; 5GAD J; 2B7E A; 1ZRC A; 1HQC A; 5JVG F; 4MEX F; 3HOV J; 1FLI A; 5EEH A; 5F04 A; 3MEX A; 2OV7 A; 1FBS A; 3V7C A; 2F48 A; 1HC8 A; 1T6S A; 4IX7 A; 1IUF A; 4AYB A; 1D3Y A; 2Y0S N; 3I58 A; 5JR3 A; 4DW6 A; 4AIK A; 2F6C A; 3IAM 2; 2FXA A; 4CHU A; 2HVQ A; 5EF6 A; 3OYJ A; 2R93 J; 1W5S A; 5BMZ A; 3WE3 A; 1WGX A; 3M8J A; 1XSV A; 3ZXS A; 1W36 D; 2P81 A; 3GUD A; 3H36 A; 4AIJ A; 4XKW A; 1FOW A; 1TWC J; 3HHG A; 3EUH A; 2KHM A; 1WZ2 A; 2TDX A; 3VYR B; 4XID A; 3ZMU A; 1B72 A; 1W0T A; 2VJJ A; 3ABK H; 1IGN A; 3CUQ B; 4OIO F; 3OS0 A; 1VF9 A; 5HNH A; 2VKV A; 2FNA A; 2LRE A; 1USS A; 1TWG J; 3AG4 H; 3L2W A; 4BNC A; 2Z2S B; 1YFH A; 4F7Z A; 2GXA A; 1YX5 A; 3JRF A; 5LGT A; 4JQF A; 3S3M A; 1B8I B; 2EIM H; 4KIS A; 4FX4 A; 1J75 A; 2V26 A; 4MNU A; 2HPI A; 3DQV C; 5GP9 A; 2Y31 A; 4M72 A; 4U87 A; 4ZYD A; 1ITY A; 4FE7 A; 5HDG A; 2VPR A; 3EET A; 4V2G A; 4XOP A; 1YI2 I; 2JUC A; 4NNJ A; 5ICG A; 5IT9 Z; 2MYS A; 3HOZ J; 3GFJ A; 2P6S A; 3ABU A; 3JAM Z; 2FE3 A; 3WTU C; 3VOE A; 2DU9 A; 3H0G J; 3IWF A; 3IL2 A; 3GTQ J; 2WAQ A; 2QSF X; 4HZF A; 2UUZ A; 5EZH A; 4BXX J; 2MG4 A; 5J47 A; 1OCT C; 3HXL A; 4YII A; 3FHZ A; 3EYI A; 1HOM A; 5JLX A; 2D45 A; 1BM9 A; 4EJO A; 3KEO A; 2JJ7 A; 3FK6 A; 2Z33 A; 1R5G A; 1SVL A; 2PG4 A; 3AKZ A; 1VQK I; 1FBQ A; 3PQJ A; 2YPR A; 3DEE A; 4LG3 A; 3R6S A; 3ZRG A; 3SEZ A; 4N4O B; 1QPM A; 1JXS A; 2XAQ A; 1KQ9 A; 4XOR A; 2VL8 A; 2YX4 A; 2V7F A; 4IRG A; 3H3U A; 1P4X A; 2EIN H; 4Y15 A; 5AON A; 2B9S A; 5M5W J; 5AIQ A; 2KIS A; 3HRT A; 1WH5 A; 1IN5 A; 2R7F A; 4A0X A; 5GAG J; 3KX2 A; 2UXN A; 2KRC A; 3NWT A; 2OUM A; 1E3P A; 2A3S A; 5JHU A; 3TP3 A; 4DNC A; 2Q0O A; 1OMI A; 3MD2 A; 3REO A; 1AKH A; 2Z16 A; 1EH8 A; 1QZZ A; 2FJ1 A; 2HOT A; 4XIC A; 1MMA A; 1VQ9 I; 3BT9 A; 3M4O J; 1O7L A; 1FX7 A; 5FKO A; 3DCF A; 3GO5 A; 3RYP A; 1OCR H; 5IP6 A; 4RAG A; 2MA3 A; 1T2K A; 1BL0 A; 2HQN A; 5BPD A; 1V4R A; 1TBX A; 2NVQ J; 4B47 A; 2HDC A; 3F8M A; 4IRI A; 2BZT A; 3I3L A; 1D0X A; 4Q5S F; 1J2X A; 2GIV A; 2K02 A; 5DCM B; 4BXF A; 1F1Z A; 3FHN A; 2COB A; 2HDW A; 4A3G J; 3CJQ B; 3HHH A; 4WX9 A; 1MIJ A; 1QQI A; 2CUF A; 3FKI J; 1PYV A; 5ILU A; 4LD5 A; 4WCG A; 4ENM A; 5FLX Z; 3KYL A; 3PUB A; 3WG7 H; 1TQI A; 2XPU A; 3CME I; 3A2K A; 2X6W A; 2I10 A; 4S05 A; 3JRC A; 3S16 J; 2D1H A; 2WTE A; 4HBL A; 2KL4 A; 4CSW A; 5DTD A; 2JUG A; 2X4H A; 5E17 F; 3B02 A; 3WTV C; 2WB1 A; 3LSR A; 4DOZ A; 5J4V A; 2JPB A; 2NVU B; 3I55 I; 1BIB A; 2XV4 S; 1OCO H; 1D0Z A; 5IT3 A; 4CXF A; 2E1M C; 1SFX A; 2LKS A; 1BOB A; 2XF7 A; 2O8K A; 5L3G A; 4A6E A; 5TRD A; 3DPU A; 3NQO A; 3B6A A; 1Q1H A; 1FIA A; 2FUG 2; 2O6G E; 1IN7 A; 4LOC A; 3S17 J; 2ZB9 A; 2H1K A; 3ISP A; 4D7N A; 4L18 B; 3ZGK A; 1EJ9 A; 5EJC A; 3A01 A; 5B3S H; 2A07 F; 4HQM A; 2DTR A; 4PJJ A; 4UUV A; 4IQ4 A; 3CCL I; 3EYY A; 1Z9C A; 1YJ9 I; 2WAD A; 1UB9 A; 3G3Z A; 2DJI A; 5IP9 J; 1LE8 A; 1BR1 A; 2CQX A; 2OAZ A; 3UR3 C; 2OF7 A; 2MC4 A; 2OD5 A; 2K7L A; 3A1Y A; 3O8G A; 3FIS A; 1LNW A; 2VUM J; 1BC8 C; 2DJN A; 2JVG A; 2WAQ N; 2LC2 A; 3ZMZ A; 2NXN B; 4AD9 A; 1B59 A; 3QPH A; 1U9O A; 3I56 I; 4MQV A; 1Z1D A; 2E34 A; 3S15 J; 1ZAO A; 2LRD A; 3LA2 A; 3F6V A; 3OIO A; 2VT2 A; 3GX4 X; 3HKZ A; 3SDG A; 2DI3 A; 1KA8 A; 1FYK A; 2E1N A; 4XK4 A; 3E3V A; 3FM5 A; 4IPA A; 3BQY A; 1Z7U A; 3DTK A; 1S7E A; 3I59 B; 5DD8 A; 3G1M A; 2K9S A; 5LFA A; 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