The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
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sequence length |
46
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structure length |
46
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Chain Sequence |
GKSPEEMYIQQKVRVLLMLRKMGSNLTASEEEFLRTYAGVVNSQLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Mechanism of phosphorylation-dependent binding of APC to beta-catenin and its role in beta-catenin degradation
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Beta-catenin
|
| molecule tags |
Cell adhesion/cell cycle
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
17
|
| structure length |
46
|
| sequence length |
46
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-04-07 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Beta-catenin-interacting ICAT |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1LUJ B; 1T08 B; 1M1E B; #chains in the Genus database with same CATH topology 3WTZ A; 5M3M J; 1FP2 A; 1L0O C; 2RQQ A; 2HR3 A; 4B09 A; 5EGO B; 4I6Z A; 3HZJ A; 2K40 A; 2QYO A; 3Q0V A; 3KYL A; 2ELH A; 2OC6 A; 1T8I A; 3CTA A; 3LA2 A; 5TIS C; 2ISY A; 1XX5 A; 4KIF A; 2VPL A; 2STT A; 3G2B A; 1ZRF A; 5EEH A; 3IUO A; 4OIP F; 3ZMT A; 1I1G A; 1R6R A; 1SFO J; 3S16 J; 2CUJ A; 3ZMV A; 1IG7 A; 3SEZ A; 4Y17 A; 4HLX A; 2XGX A; 4WF2 A; 5DDG A; 3CME I; 1NTC A; 3HOV J; 1R4N B; 1BW6 A; 2DTR A; 1PP8 F; 3H9J A; 1ZTR A; 3RCO A; 1MDM B; 5LRS A; 2Z2S B; 4L9T A; 4RB1 A; 4J19 A; 2K86 A; 4U7D A; 2QQB A; 2MH9 A; 4MHG A; 4DYR A; 2VE8 A; 3S1M J; 1DGW Y; 4U7B A; 4HDV A; 2E2J J; 3CCQ I; 3F21 A; 2UWM A; 3L2Q A; 4XKB A; 3TOA A; 1UB9 A; 4P5O A; 3HDD A; 3K7A J; 3JTH A; 2VT3 A; 4IQJ A; 1NH3 A; 4HF1 A; 4KIS A; 3HC7 A; 3SQN A; 4FIS A; 2FQ4 A; 4XLC A; 1YJW I; 3H3Z A; 3V7S A; 5E79 C; 5CQE A; 5F0C A; 4OAZ A; 2ZME A; 3V7R A; 3VDX A; 2MFZ A; 2JPC A; 1U9N A; 1KYZ A; 3H92 A; 4J01 A; 5HNF A; 5DUK A; 3PSI A; 4G12 A; 4JOM A; 5CLS A; 3OY9 A; 4LB6 B; 5CVJ A; 4F55 A; 3CF5 F; 1U9O A; 2ZXH A; 2WWY A; 5E3N A; 2CV2 A; 2WAQ A; 3BJA A; 1ERD A; 2GOM A; 1TL8 A; 2D1H A; 4BYY A; 3D0S A; 2JSC A; 3BG9 A; 4HSR A; 3ZN1 A; 3DPL C; 3ML6 A; 2DOA A; 3FIS A; 3CC4 I; 1Z9C A; 3OOP A; 3JRE A; 1T0F A; 2FQ3 A; 2M4K A; 2OCC H; 4L18 B; 2OD5 A; 2R7S A; 2H8R A; 5E3M A; 1EV7 A; 3MKY B; 1FBS A; 1FJL A; 1BN5 A; 2VAS A; 1ZK8 A; 4II2 A; 3ZRG A; 3E7L A; 1R22 A; 4BHP A; 5ERI A; 1HST A; 3B6A A; 3GTK J; 4B1R A; 3OYD A; 2LY1 A; 4RGU A; 3CMM A; 1G3Y A; 2M0M A; 2J5O A; 2R92 J; 4D9J A; 3GTQ J; 4WCG A; 4U0Y A; 3MEX A; 4BQA A; 1JUP A; 3BY6 A; 3A01 B; 5FKL A; 1PUF B; 1BR2 A; 3MFK A; 2GA2 A; 2I10 A; 5GTI C; 1ZLJ A; 1OPC A; 1H8A C; 2VQL A; 4LLG F; 1JKO C; 3LFU A; 4BJ6 C; 2PN6 A; 2OTJ I; 4XLH A; 4NQW B; 4UNO A; 2G9W A; 1D8J A; 1SFK A; 3GXO A; 5K5Q A; 3HGY A; 1HXD A; 5F0F A; 3ZCO A; 2LRD A; 1RZ4 A; 3GLX A; 5H6Q A; 1IXR C; 4EJU A; 2Z33 A; 1YS7 A; 2NAZ A; 2ZNY A; 1LEA A; 3AG3 H; 4DYQ A; 1I5Z A; 2XGE A; 3QQA A; 1Z0X A; 5K5R A; 2CQX A; 1DGR M; 2BW3 B; 2DFF A; 4RDU A; 5IP6 A; 1AWC A; 1IC8 A; 4XID A; 2ISZ A; 5F64 A; 2VI6 A; 1KA8 A; 3OYI A; 3BR5 A; 1YQA A; 2CW0 F; 3NAR A; 3BQZ A; 3BT9 A; 3GF2 A; 4QLC U; 5GAH J; 4XIC A; 2H8W A; 2K02 A; 3IAS 2; 1JKP C; 2ZXI A; 2R7X A; 5D6E A; 5LHH A; 2NVY J; 4EQQ A; 4XLN F; 3EQL F; 1ETX A; 3U1K A; 2JA2 A; 4DGW B; 3L2V A; 2F5F A; 2ZJR F; 4E7K A; 4MQV A; 1Q1H A; 2HOE A; 3T8R A; 5K7F A; 1MBF A; 2DMU A; 4BJ5 C; 4ZJZ A; 2CG4 A; 3DLL F; 4HLY A; 1C0W A; 2FSW A; 4WXH A; 1K78 B; 3IV5 A; 1DUX C; 1MIJ A; 3OS2 A; 3BWG A; 2GBY A; 1DPU A; 4UHT A; 3LSH A; 3BG3 A; 1CF7 A; 3ZPL A; 1FY7 A; 2LD5 A; 4A6D A; 1MMS A; 5GAD J; 1MJ9 A; 3NEU A; 2JRM A; 4LJZ F; 3DQV C; 1A35 A; 1PVE A; 1R5G A; 2RKH A; 2EFP A; 2PJR A; 4I02 A; 1W5S A; 1R1U A; 3OR2 C; 5FKM A; 3PNV A; 4YIF A; 1XPX A; 4OOI A; 4HDU A; 3I55 I; 4J00 A; 2FMY A; 2VKE A; 3KP3 A; 3OYH A; 3DBL B; 3E5X A; 3DTK A; 3FK7 A; 2Q8K A; 3WTW C; 5B1B H; 3SXY A; 1FYM A; 2OQG A; 3QYF A; 3GCM A; 4LMY A; 4UVA A; 1OCR H; 2DMT A; 3AKZ A; 3FHN A; 1YFH A; 1JKQ C; 3TGN A; 4FX4 A; 1R49 A; 5EYR A; 3F8N A; 2OUM A; 1LVA A; 3MZH A; 3K0L A; 4C3H J; 4E7L A; 3LSJ A; 2LOO A; 3SZP A; 1XD7 A; 1UFM A; 1NG6 A; 2JA5 J; 3Q9V A; 4MNU A; 2JVG A; 4E6K G; 2W85 A; 2Z1D A; 2QZ8 A; 3JR9 A; 2LBF A; 2EFW A; 2XKO A; 5D6F A; 4BUP A; 2M9H A; 2RAE A; 2C6Y A; 2OF7 A; 1XMK A; 3I53 A; 4BHB A; 1A31 A; 3BQY A; 2WB1 N; 2E7X A; 3PM1 A; 2DPD A; 4Y33 A; 4FQG A; 1JI8 A; 1EF4 A; 2UXX A; 1W36 C; 5LEJ A; 3Q0W A; 1MSE C; 2HOS A; 1WH7 A; 2JQ7 A; 1X4P A; 2HXO A; 3NRV A; 2Q0O A; 3CCR I; 2BHY A; 2G7H A; 1WCM J; 3M1C A; 3K1P A; 4M3F A; 3ERE D; 4L9N A; 1HW5 A; 2KFD A; 1OYW A; 2V26 A; 3L2W A; 2DA2 A; 2R5Z B; 4I0B A; 2HU9 A; 2EIL H; 3FHZ A; 1IN4 A; 3CCV I; 3WTV C; 2L7K A; 5F0H A; 2PEX A; 3FK6 A; 4B47 A; 3PSF A; 1FNN A; 1X3W B; 4RA2 A; 3ZQG A; 2VON A; 2Y9Z A; 3T5X A; 2EIK H; 3W2W A; 3PIO F; 2XPW A; 2FJ1 A; 4GFB A; 2XB5 A; 1B8I A; 4LK0 F; 3U2R A; 1ZAO A; 4YFK F; 3I58 A; 2X1E A; 3FMR A; 3R0J A; 1YX5 A; 2P6S A; 4GYG A; 5HOD A; 2HQA A; 2H27 A; 4I0A A; 4U0W A; 6PAX A; 3FKJ A; 4PJL A; 2P6T A; 1SEU A; 5EG0 B; 1FEX A; 4P96 A; 2GXA A; 2PX9 A; 3WGH A; 1WSU A; 1EH6 A; 2M34 A; 2XPV A; 1U6G A; 4HST A; 2R0Q C; 3J7A Y; 3LQR A; 4HYE A; 1JGG A; 3FM5 A; 4F91 B; 1QO0 D; 3ELK A; 5HDK A; 2VJ5 A; 2LKS A; 1XSX A; 2Y9Y A; 1ZLK A; 1Y56 A; 4JBA A; 4YEL A; 3BJO A; 1GVD A; 1V55 H; 1B9N A; 5HS8 A; 3TED A; 5GP9 A; 2PFB A; 3F0C A; 1ZRD A; 4HNV A; 3CES A; 4E7I A; 2OU2 A; 4I01 A; 3FX3 A; 2JMW A; 5J8F A; 4OIQ F; 3H35 A; 1N77 A; 3KFW X; 3HKZ N; 2J5P A; 4XRS A; 3J81 Z; 3LFK A; 3FXO A; 4A3D J; 3E5U A; 4CGZ A; 3K69 A; 1IW7 F; 4Y15 A; 3BJ6 A; 3KX2 A; 1MJA A; 2KDO A; 5F27 A; 4MFD A; 4C30 A; 4ZYD A; 2PI0 A; 1D0Z A; 1P7J A; 1QRY A; 4Y52 J; 3QAH A; 4PCQ A; 5ILS A; 5D5W B; 3KCC A; 1QZY A; 4PSW A; 3ZOB A; 3GZ6 A; 1Z1D A; 3A0H C; 1IRG A; 2E19 A; 1QPM A; 2WY8 Q; 1JTX A; 4IXA A; 4XLP F; 2VJJ A; 2VUM J; 1IN6 A; 3L1P A; 1H0M A; 5GAG J; 3OYJ A; 3GUD A; 5HDG A; 4I2O A; 2MG4 A; 2AQE A; 2PBI A; 2Q1Z B; 4XON A; 2FML A; 3S17 J; 2CW7 A; 4PZJ A; 4B48 A; 4RAF A; 3WGI A; 2M87 A; 3TP0 A; 1WRJ A; 2EV0 A; 2QWW A; 1TWH J; 3G73 A; 3JRB A; 4AYB N; 3MD2 A; 5BQT A; 1N75 A; 4D7M A; 4XM3 A; 1ETW A; 2N8G A; 3GEZ A; 1E2X A; 3C18 A; 5LEK A; 3W2A A; 2KZV A; 1E0E A; 3ISP A; 3QU3 A; 4AID A; 4M3G A; 1JE8 A; 2DOD A; 3IP4 B; 2KIF A; 4YFN F; 4UV9 A; 3MZ8 A; 4KN7 X; 5C4X J; 3HOU J; 1VQ4 I; 4G6D A; 1U2W A; 1YI2 I; 1WGX A; 1RUO A; 4A5M A; 4ESF A; 4KIB A; 3VYT B; 4EJW A; 2K5C A; 2XF6 A; 4AU7 A; 1QHH D; 1UHM A; 2QF7 A; 3H9G A; 1W7P B; 1OYI A; 5FD5 A; 3L2C A; 2JPB A; 2PJP A; 2ZO4 A; 1W5C C; 5CQG A; 2DQL A; 4AVZ A; 2PMZ N; 3H5N A; 3OYE A; 4LGW A; 2P81 A; 3VEP A; 4BBS J; 2OAZ A; 1K4S A; 2K9N A; 2O0Y A; 4CXF A; 5C44 J; 4ETS A; 4A3F J; 1A6Q A; 2ZXJ A; 4PFO A; 2HPM A; 3DEW A; 1X19 A; 1D5Y A; 1LNW A; 2CQK A; 2PMH A; 3M7G A; 1UHW A; 2GM4 A; 2L5Q A; 3VSL A; 4CIC A; 3KPH A; 5BPD A; 2KIU A; 4BY7 J; 3DEU A; 3LST A; 1OCP A; 2LYC A; 1J9I A; 2XAJ A; 1ETV A; 5ILU A; 2MLG A; 1ON2 A; 3S1N J; 3MVP A; 3FF5 A; 1DP7 P; 2OTL I; 1JJ6 C; 2D1V A; 4HX8 A; 1HKQ A; 3K6G A; 3V7C A; 4LG0 B; 5FFX A; 2IT0 A; 2B7E A; 4EGZ A; 1KON A; 3ABM H; 3DKY A; 5HNH A; 4R8H A; 4A3I J; 1F36 A; 5HOO A; 3HUG B; 4KDP A; 1KQ8 A; 1IUF A; 3KYD B; 3FZV A; 2F2E A; 2Y30 A; 3FDY A; 4LOC A; 2XAQ A; 1S9H A; 5JLX A; 3JAM Z; 1FTZ A; 2K3P A; 3I56 I; 2ZNZ A; 3QP5 A; 4UV8 A; 2DT5 A; 4E7Z A; 1YHQ I; 1JHF A; 4ASN A; 3WTU C; 3P9I A; 3VYU B; 3RKW A; 1FC3 A; 3R4K A; 5AON A; 1SVM A; 2EFO A; 1XCV A; 2Y0M A; 1MSF C; 2VQH A; 4E70 A; 4EJV A; 3C3W A; 2O9L A; 2H6C A; 3HHH A; 2O03 A; 3H5A A; 1VQ6 I; 4YRV A; 2W82 A; 1B59 A; 3K1N A; 3H9Q A; 1B4A A; 1IV8 A; 3OYG A; 2VKH A; 1MMA A; 2L4M A; 2X6W A; 2DBB A; 2ESH A; 3W2V A; 4GXO A; 3CJR B; 3OIO A; 3BPV A; 3DWL E; 2FOK A; 4RGS A; 1OMI A; 3JAM K; 2MSY A; 4IX7 A; 4KYW A; 5HLI A; 2BOL A; 4PUS A; 3OS0 A; 1N78 A; 2KDZ A; 4RB3 C; 1J0R A; 2E1C A; 5DCM A; 4ON0 A; 1QHG A; 5JLW A; 4X6A J; 5JFR A; 2KPM A; 1T39 A; 4UY8 I; 4JX6 A; 4GRI A; 4OMZ A; 4CCN A; 3TL4 X; 1BI1 A; 3GX4 X; 2JSP A; 1DDN A; 4A0Z A; 2CS3 A; 4G8X A; 4XSZ F; 3RDI A; 2XRN A; 2VBZ A; 1YYV A; 2DJN A; 4M9S A; 5IT9 Z; 2YX4 A; 2FNP A; 2WAQ N; 2X85 A; 3U21 A; 5IOY A; 4M71 A; 5E1Z B; 5F04 A; 2JA7 J; 3X2Q H; 1HSJ A; 1MBJ A; 2E5Z A; 1O3R A; 3GVA A; 2DO7 A; 1BR1 A; 2RVC A; 2EZK A; 4DZJ A; 3D1N I; 2LY2 A; 1QQI A; 3JW4 A; 4FT8 A; 4XOT A; 3JSO A; 3NQO A; 1D1B A; 2HNH A; 5E17 F; 3CUO A; 4BAY A; 4CH7 A; 1OIS A; 4O6J A; 2XIG A; 2H09 A; 4ZDL A; 2M30 A; 2KHM A; 2ID6 A; 2IXS A; 2W48 A; 3HOX J; 4N4O B; 5BOX A; 3EUH C; 3N97 A; 3L2U A; 3QPT A; 1KGS A; 3BC8 A; 3QOE A; 2CFX A; 2LRE A; 5EGO A; 2Q2E A; 3LL7 A; 1WJB A; 1OYY A; 2H94 A; 2VC1 A; 3CC7 I; 1JHH A; 4MEX F; 3FKI J; 4G7H F; 2A5W A; 3QPS A; 2X48 A; 2IEK A; 1RKT A; 3RJP A; 2O5R A; 4XSX F; 1H89 C; 2DT7 B; 2E36 A; 1GV2 A; 4HV6 A; 4OIO F; 4BGD A; 1SFU A; 1KU2 A; 3C7J A; 5CVI A; 2HKX A; 4UUS A; 4BDZ A; 3OYM A; 2D2W A; 5B1A H; 4V2F A; 2L4A A; 3QYB A; 1HW2 A; 1KU9 A; 1JT6 A; 4A3E J; 3WG7 H; 1FYL A; 4EV0 A; 3ZQC A; 3OIQ A; 4CCO A; 4P9U A; 1QU3 A; 3N05 A; 3O8H A; 1XG1 A; 1X1C A; 1NHA A; 2IGM A; 4UXN A; 3K4M A; 1OCO H; 3KEQ A; 3BLY A; 3QWL A; 2NVQ J; 4C3I J; 4H0E A; 4DOZ A; 3S14 J; 5FKK A; 2BEO A; 3IH2 A; 3CLO A; 4ESJ A; 2M2E A; 5JVT A; 1G8X A; 3D5S C; 1IN7 A; 4XKW A; 3PO2 J; 2W25 A; 4ZYA A; 1RIO H; 2BY0 A; 5ED4 A; 1HLV A; 2DI3 A; 2JA8 J; 1EJ9 A; 4L5E A; 1W36 D; 1YOV B; 4PJN A; 1TT0 A; 2V1X A; 1AU7 A; 3GTP J; 1U8B A; 3R0A A; 4LLL A; 5LGN A; 1PJR A; 4PGG A; 1T95 A; 3I54 A; 2HKO A; 3OYK A; 1ZG1 A; 2GXG A; 2QKM B; 3LNQ A; 4IHS A; 2E2I J; 2DOE A; 4HX4 A; 4DYC A; 5IP9 J; 3Q3S A; 4S04 A; 3WU1 B; 4G6Q A; 1VF9 A; 2W1O A; 1H9G A; 2BBY A; 2FRH A; 4QPQ A; 1A36 A; 2XF7 A; 5CPR B; 4PGH A; 4RGR A; 3S2W A; 4BQO A; 5L3B A; 5J4Y A; 4PJ0 C; 4IHY A; 4JK1 X; 2W57 A; 3S2D J; 3RPU D; 4O5V A; 2LFB A; 3K4C A; 1ZRE A; 1YJN I; 5IYB J; 3A4C A; 2FE3 A; 1D3Y A; 2AQF A; 2TCT A; 4JQF A; 5FGM A; 4O3M A; 2VJ4 A; 1I3Q J; 5J1R A; 2NXN B; 3I9V 2; 4UVC A; 4ZZD A; 4UVB A; 2GZW A; 3S1Q J; 5EJC A; 2M45 A; 4CCJ A; 1U8R A; 3GME A; 3BRO A; 4ZDO A; 2A05 A; 2LR8 A; 4YG2 F; 1ODD A; 2CSO A; 4XKC A; 3FIW A; 1B9M A; 3I64 A; 4G9Y A; 1UZC A; 2QBY B; 1GLN A; 1WVR A; 2DDA A; 4A3C J; 3DXJ F; 3KET A; 4Y4R A; 3HEF A; 1QZZ A; 3ZMD A; 1XMA A; 2R7V A; 1BA5 A; 1F1Z A; 1P4X A; 4HOB A; 1IN8 A; 1OKR A; 5FFZ A; 1QNT A; 3F8F A; 4CYC A; 2MGQ A; 3GTG J; 2MBF A; 3RPU A; 4DJA A; 2CO5 A; 2YX7 A; 2BW3 A; 3M4O J; 5IOZ A; 5IYC J; 3MKL A; 1I27 A; 3F9K A; 2JUG A; 1Y8Q B; 3ONQ A; 4L9V A; 1ZYR F; 3QPL A; 3RZD J; 1Y1V J; 3HL2 A; 4PJJ A; 1I50 J; 3CQZ J; 1BC8 C; 4HZF A; 1IF1 A; 3BCB A; 2HWV A; 4A0Y A; 2BY3 A; 5KHD A; 2QLZ A; 1XSD A; 2HDD A; 2EQR A; 1R23 A; 1XTA A; 3ABK H; 1X4O A; 3GO5 A; 3SDB A; 3I71 A; 5CYV A; 3Q5F A; 5FLM J; 2IBD A; 3MKZ A; 2CJJ A; 1LFU P; 4Y3O A; 5J1Y A; 1AA7 A; 5L3F A; 5J6X A; 3OSF A; 3F8B A; 1FOY A; 2ECB A; 3WOD F; 4BE0 A; 2MAB A; 2R7D A; 3V8J A; 5D5U B; 1BJA A; 2CUZ A; 4MEY F; 3BR0 A; 4ENM A; 4IHW A; 2DFE A; 3WE3 A; 3ROU A; 1OFC X; 4LFU A; 4BXU A; 2K9S A; 2ESN A; 3EDP A; 2YS9 A; 4GGG A; 3B73 A; 2LG4 A; 4M73 A; 4ZTJ A; 1RKW A; 1YG2 A; 3K4J A; 1LFB A; 4BNC A; 1L3L A; 3BR3 A; 1S6L A; 2WV0 A; 4MO7 A; 1YJ9 I; 4YFX F; 4M3B A; 3GZ5 A; 1Z67 A; 4JX4 A; 5A2Q Z; 4G7Z F; 2TDX A; 2DA3 A; 3K9T A; 1YO5 C; 3GYH X; 2I8D A; 1YX3 A; 2GIZ A; 4HW0 A; 1WJE A; 3OYL A; 3H3V K; 2VBX A; 2Z99 A; 3RQ4 A; 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