The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
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sequence length |
46
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structure length |
46
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Chain Sequence |
GKSPEEMYIQQKVRVLLMLRKMGSNLTASEEEFLRTYAGVVNSQLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Cell adhesion/cell cycle
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Mechanism of phosphorylation-dependent binding of APC to beta-catenin and its role in beta-catenin degradation
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Beta-catenin
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| total genus |
17
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| structure length |
46
|
| sequence length |
46
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-04-07 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Beta-catenin-interacting ICAT |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1T08 B; 1M1E B; 1LUJ B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1TWC J; 5K7Z A; 4CA0 A; 1SFX A; 4OIO F; 4A2U A; 2M34 A; 1KQ9 A; 2QKM B; 4JK1 X; 3HTU A; 4BBS J; 3PNT A; 2V9P A; 2E5Z A; 2R7D A; 1W7P A; 2L0K A; 3V42 A; 4B48 A; 4AM3 A; 3QYB A; 2M30 A; 1I50 J; 2EBI A; 1YRN A; 5BS6 A; 1ACI A; 3W6K B; 2HTS A; 5A2Q Z; 2DA1 A; 2I5U A; 5KAI C; 1S6L A; 1LEB A; 2NVU B; 1R00 A; 4FIS A; 3OYK A; 1O3Q A; 3LNQ A; 2R7Z J; 3G3Z A; 2GBY A; 2FNP A; 2XF5 A; 1WJB A; 2FJ1 A; 4YFK F; 1TQM A; 4E6K G; 3HSE A; 4XK4 A; 4J00 A; 3R61 A; 2L7F P; 3ZQL A; 1VQ6 I; 3ZQG A; 1LE8 A; 5TJJ A; 1Z6T A; 1XSX A; 4GCV A; 2HFH A; 2DTZ A; 2L9S A; 3GTL J; 4M6Y A; 2HVR A; 4ON0 A; 4XLA A; 3L2C A; 3I59 B; 3FMQ A; 5JHU A; 4XOR A; 4F55 A; 5L3B A; 1IGN A; 1LJ9 A; 2F4I A; 5IOY A; 5HNF A; 3F72 A; 2ELJ A; 2Q2E B; 4BY1 J; 1MD0 A; 5F0F A; 1A6I A; 4XRM A; 2M5W A; 1YG2 A; 2FE3 A; 2STT A; 2JVG A; 3GCM A; 2R3S A; 1D5V A; 4Y17 A; 4EJT A; 5TGT A; 2VOO A; 3FBN B; 2WAF A; 2ADU A; 3TOA A; 5D5V B; 1QO0 D; 2B7E A; 4ITV A; 5B66 C; 2ETH A; 4E7L A; 2MH2 A; 1IRZ A; 2HPI A; 5TRD A; 2FBI A; 3VPR A; 5LHH A; 1IV6 A; 1MNE A; 4F3Q A; 1P2F A; 5HS9 A; 5J8F A; 3DLL F; 1I3A A; 1H8A C; 2GXA A; 3CUQ C; 3DLA A; 4KDP A; 2IT0 A; 1IDZ A; 5E1X A; 2QLZ A; 3KPH A; 1OYY A; 3PNV A; 5H6R A; 5HLG A; 2FNA A; 1YYV A; 1AWC A; 4RS8 A; 3LAJ A; 5LLQ A; 1OPC A; 3KEO A; 3TO6 A; 3HB9 A; 1U5T A; 4EM2 A; 2W85 A; 4XOT A; 2W57 A; 2QKL B; 3ZMU A; 3H0G J; 1DPU A; 1W5T A; 1H89 C; 1R58 A; 4UY8 I; 2KLO A; 3MAJ A; 3S14 J; 2IXS A; 2V26 A; 1U3E M; 5CVJ A; 1FSE A; 1U9O A; 3D5S C; 1KU7 A; 1HA8 A; 2EIM H; 2KIF A; 1OQY A; 3CF2 A; 4LMY A; 5F6F A; 4NUB A; 1X1A A; 1JKQ C; 2JA8 J; 1R1T A; 4A12 A; 1X1P A; 3KZI C; 1Z91 A; 5J8C A; 3F8N A; 1U8R A; 6PAX A; 2CV0 A; 3RCO A; 5D6F A; 5LBQ A; 1JI8 A; 5LGU A; 1WFX A; 1HC8 A; 5LGT A; 3O6B B; 4HSR A; 5FKM A; 5DTD A; 3VEP A; 1XGO A; 4WX9 A; 2OU2 A; 3FXL A; 1XN7 A; 4KMU X; 2JT1 A; 4HG2 A; 3MZH A; 1QPI A; 3K6G A; 4HEA 2; 1KU3 A; 2L9V A; 1T6S A; 2V1N A; 3SDB A; 1SFO J; 1Z21 A; 5GAH J; 1ETX A; 1V55 H; 3UNG C; 3OS2 A; 1SEU A; 2QYO A; 4E4H A; 4A6E A; 3GZ5 A; 2CV2 A; 3RQ4 A; 1ZH5 A; 3O8H A; 1FBQ A; 1TT5 B; 3ELK A; 2Q0O A; 3C2B A; 4IRG A; 4WXH A; 1ETK A; 5E3O A; 4R8H A; 1I1G A; 3MKW B; 1HCR A; 4N4N B; 3OMY A; 1R7J A; 4M74 A; 3GVA A; 4IOC F; 4V2G A; 1W5S A; 1IRG A; 4UV8 A; 1ERD A; 3KIO A; 2C6Y A; 1MMN A; 1TZL A; 1J0R A; 2DA3 A; 2Z2S B; 3NEU A; 4CO8 A; 3WTV C; 1DQU A; 1LKX A; 3QU6 A; 1MZB A; 1ZK8 A; 2DJN A; 2XF6 A; 4UVB A; 3WG9 A; 5F0C A; 2VBX A; 1U8B A; 2Q1Z B; 1XSD A; 3OV8 A; 1G59 A; 1UJ8 A; 3DTE A; 4I01 A; 4PUS A; 5DS9 A; 3EUK L; 3RDI A; 3S93 A; 4EGZ A; 3BG6 A; 3LOC A; 3V8J A; 1W7P D; 3GTK J; 4MNU A; 3H35 A; 1RZ4 A; 3RSN A; 3BWG A; 5FFZ A; 2CV1 A; 5FRN A; 4LOC A; 4IJA A; 3OOU A; 2V9V A; 2H1L A; 3WE2 A; 2QQA A; 3HKZ N; 3E5X A; 1L3L A; 2DYR H; 4KN4 X; 3CF5 F; 2O0Y A; 3S1Q J; 1K7A A; 4XKB A; 3O8G A; 4WXD A; 3E3V A; 4BUP A; 5DDG A; 2DMT A; 2IP2 A; 2LH9 A; 2XB5 A; 3HKZ A; 3GWZ A; 2OC6 A; 2ZJQ F; 3COA C; 2JMW A; 2KL4 A; 1S8N A; 2EV0 A; 2OAZ A; 1U0J A; 1NK2 P; 5LRR A; 1Z3X A; 1ZGW A; 1WI3 A; 2PMU A; 1YJN I; 4ETS A; 2HI3 A; 3W6V A; 4IX7 A; 4O6J A; 4XOP A; 3OYC A; 2K3F A; 3HSR A; 1PDN C; 4PJ0 C; 2BZT A; 2LOO A; 2Y30 A; 5J1R A; 2HPM A; 3GTP J; 1D1C A; 2W25 A; 3DFG A; 2K9N A; 5E18 F; 1T0F C; 2R7W A; 1LFB A; 3QPT A; 4D5F A; 3GME A; 2X6O A; 2QM3 A; 3F9K A; 1B72 B; 4BYY A; 3BCB A; 1P4A A; 4L9J A; 4LB5 A; 3IUO A; 1R5H A; 3R0J A; 2ME6 A; 5KHD A; 3I0T A; 1D1A A; 4EV0 A; 5F1R A; 2H8W A; 2DAO A; 3GF2 A; 3LSH A; 2K40 A; 4L9T A; 2UZK A; 1NK3 P; 4Q47 A; 5ILU A; 1GHC A; 1GXQ A; 4HNU A; 3EPZ A; 3QQA A; 3GXO A; 3GTJ J; 5ICC A; 1O7L A; 2LF7 A; 4B44 A; 4E7K A; 1QGP A; 1HKT A; 2LK2 A; 2CQQ A; 2IW5 A; 1J75 A; 4L5E A; 2K9Q A; 1HOM A; 2ZKZ A; 2EIL H; 4IHT A; 1QZZ A; 3TQN A; 1XMX A; 1JXS A; 2IS4 A; 5GTI C; 3REO A; 2V9K A; 4CZC A; 2ZSI B; 1K61 A; 2K86 A; 3V7C A; 2PQ8 A; 3QAH A; 3SZG A; 1E3O C; 1YW7 A; 1V5G A; 2E7X A; 2KRF A; 2L01 A; 1XGM A; 4RA2 A; 5A2Q K; 1FOK A; 1J9I A; 2Z1D A; 4M9Z A; 1MIJ A; 2XVC A; 1JKP C; 2LR8 A; 1Z0X A; 2B0L A; 1BJZ A; 1P92 A; 2E19 A; 1OFC X; 2GQQ A; 3ZMS A; 4U0Y A; 2ID3 A; 1ZR2 A; 2EPF A; 1MSE C; 4X1E A; 3VYS B; 5LRS A; 4GXO A; 1A36 A; 4NC7 A; 2QQB A; 3H5A A; 1Z67 A; 2FOK A; 2X6X A; 3G1O A; 5DCF A; 1BI0 A; 1P4X A; 3HRT A; 4D5C A; 1W36 C; 3M3Y J; 3K4K A; 3CJQ B; 2CUJ A; 4WWC A; 4IQJ A; 3E5U A; 1WJA A; 4RB2 C; 1G4D A; 5FKN A; 1S3J A; 1SFU A; 3ZXS A; 3U9G A; 1SD7 A; 1T08 B; 1OR7 A; 2E34 A; 3BJO A; 4XMY A; 3DQV C; 2JRM A; 4A3I J; 4G7Z F; 3QOD A; 4A3F J; 4YEJ A; 4KJZ A; 1FWZ A; 2ZC2 A; 3BQZ A; 3F3X A; 1IN6 A; 2F5D A; 3HUG B; 1B59 A; 4HLY A; 1ETV A; 1QPM A; 3L2U A; 3HSF A; 1IN7 A; 2XHK A; 1D1B A; 5EEG A; 1BBY A; 1SMY F; 3CLO A; 2FXA A; 4HF2 A; 4RAG A; 2VT3 A; 1TWH J; 3LA7 A; 1KZH A; 4HLX A; 3I4N J; 2LRE A; 2FRH A; 3E97 A; 2EFW A; 4ZTJ A; 1GXP A; 1FT9 A; 4LJZ F; 2YU3 A; 4II2 A; 1P4W A; 2IS6 A; 4G7H F; 3WTY C; 2MBF A; 2GIZ A; 1VQO I; 1PP8 F; 1HKS A; 3H9J A; 3CQZ J; 1Y1V J; 3TP0 A; 3K1M A; 2ZJR F; 2LKS A; 2EQR A; 2IPQ X; 2E2H J; 3L2V A; 5JFR A; 3IH3 A; 5L3C A; 2NVQ J; 4I6Z A; 2PLY A; 2EK5 A; 1YS7 A; 3HGG A; 4G6Q A; 4RM3 A; 1DGR M; 2EZL A; 1H88 C; 4RAZ A; 1FJL A; 3JR9 A; 5EGO A; 1QQI A; 3G4S I; 1LNW A; 2L02 A; 3MD2 A; 2DA4 A; 3JRD A; 2LY2 A; 3IL2 A; 1ZKG A; 2VL8 A; 3WGI A; 4FE7 A; 4BDY A; 3A1Y A; 1ZGA A; 1KYW A; 3FWE A; 5BOX A; 1T33 A; 3ASO H; 1S72 I; 1Y0U A; 4AC0 A; 3W2W A; 3EQL F; 3BC8 A; 2IAI A; 4U0V A; 1OCR H; 3HDD A; 3KYD B; 3I59 A; 3OOP A; 3WTU C; 4RAY A; 1RC9 A; 3IKV A; 4BHC A; 3M8F A; 2XAS A; 4CDG A; 1SFE A; 4F7Z A; 2JUC A; 2Q2E A; 2QSG X; 1TQI A; 1BM9 A; 2P5V A; 2LKX A; 1ZR4 A; 4JX5 A; 2QCO A; 4CCK A; 2BGC A; 3Q0W A; 5GAD J; 5CVR A; 4IOA F; 4CCM A; 1GVD A; 3CO6 C; 2EIJ H; 2ZXI A; 5CQE A; 4BEH B; 4XRF A; 1HXD A; 3L2W A; 1B9N A; 5E17 F; 2EIN H; 3OYL A; 2DA6 A; 3JRE A; 1G2H A; 1AU7 A; 3I55 I; 4BJ5 C; 4ESB A; 3NAU A; 5D4S A; 2CG4 A; 2QBY B; 3QPS A; 5IPA A; 2MGQ A; 4JBA A; 4H0E A; 5AON A; 3RZD J; 2ZME A; 3CCL I; 1HSJ A; 3CO7 C; 3BTL A; 5IT3 A; 3RI4 A; 1K78 B; 1WH7 A; 3W3C A; 4ABZ A; 2XAJ A; 1Q1H A; 2HQN A; 2GA2 A; 1D8K A; 3KEQ A; 1X2M A; 5IY5 H; 4PK4 A; 3ZP5 A; 1XMA A; 2K85 A; 2HYF A; 3SEZ A; 1QNT A; 4IVN A; 4QTR A; 2OTL I; 1ZG3 A; 1O3T A; 1JUP A; 2BW3 B; 2W1O A; 2R7U A; 1J5Y A; 3TO9 A; 3DTI A; 1JT6 A; 1X3Z B; 2HKX A; 1FTZ A; 1DPR A; 2K4J A; 2O8K A; 1IW7 F; 2TRT A; 2L3D A; 3MWM A; 4HDV A; 3M4O J; 2R92 J; 3C2G A; 5HNH A; 3F8M A; 2R7F A; 3K1P A; 2A07 F; 3PFY A; 2BY1 A; 3A03 A; 3JW4 A; 2X1C A; 3B02 A; 2X6Y A; 4KIT B; 2EWN A; 5K5Q A; 5HVQ C; 1D0X A; 5BQT A; 2BXY A; 2H27 A; 1CQT A; 2WAE A; 4AIJ A; 4C3H J; 1MJ9 A; 3RYP A; 3K4L A; 1TTY A; 2X51 A; 5GAG J; 4IHV A; 1OIS A; 4BNC A; 3V4G A; 1Y56 A; 3VYT B; 3CCE I; 2H09 A; 3PM1 A; 2NVX J; 4IHY A; 1KQ8 A; 5GP9 A; 1FYM A; 3U21 A; 2A6H F; 4M6X A; 4RLQ A; 2M7B A; 4G9Y A; 2EFO A; 3FXQ A; 2HEO A; 5HOO A; 4C30 A; 5HLI A; 2DPU A; 4OIQ F; 3GLX A; 1MND A; 4BE1 A; 2OCC H; 2Z5U A; 4M9S A; 3V8L A; 3QP6 A; 4W1U A; 4FE4 A; 5C3E J; 2EH3 A; 3I4P A; 3GX4 X; 2CO5 A; 2EV6 A; 3DCF A; 2VKH A; 4CXF A; 4PGH A; 2LBF B; 1XG1 A; 2QEN A; 4YIR X; 2A69 F; 4RGU A; 1HF0 A; 3LSR A; 5IP7 J; 3VFZ A; 4RGS A; 1MBK A; 3GTM J; 4LK0 F; 4S0H B; 4MQ9 F; 2N8G A; 3ISP A; 2BYV E; 4XL9 A; 4NHJ A; 3MKY B; 2A6E F; 4XSZ F; 1HW1 A; 3EUH C; 4NQW B; 1WCM J; 2O61 A; 4BU2 A; 4XIC A; 1W1W E; 3D5R C; 3TW6 A; 4MTD A; 1LQ1 A; 5EZH A; 3Q0U A; 4WXC A; 3FIW A; 4XKC A; 2MC4 A; 3OL3 A; 3CDI A; 1QHG A; 5J47 A; 5FRO A; 4B4C A; 1ON1 A; 3TKY A; 2JQ7 A; 4D9J A; 2OV7 A; 2DFI A; 3KP6 A; 4FET A; 3E6C C; 2M3A A; 4M3G A; 3FHN A; 3L7W A; 4E70 A; 3MCZ A; 2KDO A; 2M8E A; 1OCC H; 4X6A J; 1ENH A; 4BL0 B; 3NWS A; 5H6Q A; 3MQ0 A; 2O9L A; 4PFO A; 3RPU A; 2QVO A; 1MBF A; 5FD6 A; 2ECC A; 1T95 A; 1TNS A; 2X6W A; 3QRF F; 3K10 A; 2JJ7 A; 3R4K A; 1HW5 A; 4XON A; 1U9N A; 1B72 A; 2MC3 A; 2Y31 A; 2KQR A; 4MEY F; 3E6M A; 3LL7 A; 4DYR A; 1QA6 A; 1LUJ B; 3BOQ A; 1BI2 A; 3SEQ A; 2HZD A; 3V7R A; 5EF6 A; 2STW A; 3OR1 C; 3J81 Z; 3KYL A; 2RAE A; 2AQE A; 3CDH A; 4C9Y A; 1W36 D; 2IGM A; 4OIN F; 3N05 A; 2ICW G; 3VYR B; 3MKL A; 1XPX A; 2EZI A; 1RR8 C; 2L7K A; 2UXX A; 2HOT A; 1GVJ A; 1J2X A; 3JTH A; 2HNH A; 2VE8 A; 3HHH A; 5FKK A; 4M71 A; 1Q1V A; 4MHG A; 1ETY A; 1JHF A; 1S9H A; 3N4M A; 3OIQ A; 4X0G A; 4AVZ A; 4HX7 A; 4ENK A; 1KYZ A; 5M5X J; 4XN0 A; 3CMA I; 2KFD A; 3D1N I; 3FZV A; 5E8I A; 1BIB A; 3FKI J; 3M1E A; 1EKE A; 1JT0 A; 2VKE A; 2LP0 A; 1VQ5 I; 4P96 A; 2EA4 A; 3ABK H; 3K0L A; 3S8P A; 2VB6 A; 4B3X A; 2ZSH B; 4NC6 A; 4MFE A; 5DD8 A; 2CFO A; 4Y13 A; 3BR3 A; 2HS5 A; 3BG7 A; 3BR1 A; 3LSG A; 4IF4 A; 2I8D A; 4JOM A; 2ID6 A; 5HOD A; 4XLE A; 1IUF A; 1SVO A; 1EH7 A; 3S3O A; 1RUN A; 2JA7 J; 1TQP A; 4ZTF A; 4PCQ A; 1I1S A; 5B3S H; 3P9K A; 4A69 C; 5LHG A; 4FTH A; 2KRH A; 2ZJP F; 4DQ2 A; 3PFI A; 4QIW N; 5IYB J; 4QSH A; 1VQ8 I; 2MG4 A; 4MLO A; 4RLF A; 4EJU A; 3OIP A; 1ZHF A; 3PSI A; 1YW8 A; 3WHC A; 4HX8 A; 5H2F C; 3AG2 H; 1TBX A; 3K69 A; 2E5N A; 2XAH A; 2R93 J; 1FBU A; 3EUH A; 5EJC A; 1SC7 A; 1IRX A; 4YII A; 3VSK A; 4JYK A; 1OYW A; 1ZRE A; 2KT0 A; 3E6D A; 1SAX A; 2P81 A; 2A6T A; 3IAM 2; 3OYE A; 2K9S A; 3JCU C; 1ZAR A; 2DMP A; 2LY9 A; 1F43 A; 4IXA A; 2WAD A; 3ABU A; 3HUG A; 4QWQ A; 4LD5 A; 3AAF A; 1LFU P; 3ABT A; 3BCA A; 3GTQ J; 4YIF A; 5GAE J; 4BH9 A; 4BAC A; 4UVC A; 3DBL B; 2G7U A; 2VQG A; 2EFN A; 4XID A; 4KA4 A; 3DXJ F; 4BAY A; 3S1R J; 4OMZ A; 1F9N A; 3BLY A; 2FSW A; 3MEX A; 2CW7 A; 3BG5 A; 3RZO J; 3CLQ A; 3G1L A; 1FBS A; 3ZQF A; 3QPH A; 1UG0 A; 3PL8 A; 4Y15 A; 2R5Z B; 1MDM A; 3BT9 A; 4I76 A; 1MGT A; 3DKX A; 4D7N A; 3G73 A; 3OIO A; 3K70 D; 2DN0 A; 3AL0 B; 2OPT A; 2JN6 A; 1I6X A; 4GRI A; 1BR4 A; 4H4K C; 2W48 A; 1U6G A; 1ZLJ A; 1X1C A; 1ETW A; 3BJ6 A; 1A35 A; 3KEY A; 4GFB A; 4ENJ A; 1PYV A; 5KCM A; 2X0L A; 3LSI A; 1T2K A; 2EJR A; 4HX4 A; 2JWT A; 4N9H A; 2A5Y B; 4AIH A; 4B8X A; 2DOD A; 1STZ A; 2O8X A; 3OL4 A; 4HW0 A; 4P9F A; 2A05 A; 1IRF A; 1WJ5 A; 2ZFW A; 4BQA A; 3HOZ J; 5J6X A; 4M3B A; 4TV7 A; 1I39 A; 1I3Q J; 4CCN A; 1QVT A; 4ZYD A; 3RKY A; 1B8I A; 2H94 A; 2UUZ A; 2RQP A; 2WY7 Q; 1F1Z A; 1A31 A; 1RIO H; 3BY6 A; 1X3U A; 1MW7 A; 5JI6 A; 1TW3 A; 4A3D J; 2W24 A; 1W5C C; 1H9T A; 3FK7 A; 1WI9 A; 2HOA A; 4P55 A; 1RRJ A; 3HOX J; 1Y39 A; 3MZY A; 4XLC A; 1VZ0 A; 4YFN F; 2HVQ A; 2Y9Z A; 1FLI A; 1FOX A; 4XN3 A; 2PN6 A; 3HM5 A; 2GLO A; 3V7S A; 4Q48 A; 3RTR A; 3CMY A; 2FU4 A; 1UST A; 2YX4 A; 3PUF A; 3FHZ A; 2IGO A; 2ESH A; 3RPU D; 3J7A O; 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