The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
49
|
structure length |
49
|
Chain Sequence |
GSSGSSGSCQYQDLLSNCDSLKNTAGCEHELLKEKCKATCLCESGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of RSGI RUH-032, a cystein-rich domain of CRISP-2 from human cDNA
rcsb |
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
Cysteine-rich secretory protein-2
|
| total genus |
5
|
| structure length |
49
|
| sequence length |
49
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Crisp domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2GIZ A; 2DDA A; 1RC9 A; 3MZ8 A; 1XX5 A; 2CQ7 A; 2EPF A; 1WVR A; 1XTA A; 2A05 A; 2DDB A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2R4G A; 1TC3 C; 1D1B A; 4AD9 A; 1IDY A; 3ZR8 X; 2K27 A; 1FEX A; 2BW3 B; 4XOT A; 2LK2 A; 1KQ0 A; 1T38 A; 1HDP A; 1IGN A; 1BC7 C; 1HSJ A; 4JX6 A; 1JKR C; 4AID A; 4L5I A; 3FBN B; 3I54 A; 5KCM A; 1R9T J; 3OIQ A; 5C4J J; 1DPU A; 3F6V A; 1O4X A; 3S1R J; 2A61 A; 2O5R A; 1P4X A; 2KRH A; 2WBM A; 3KET A; 1LKX A; 3I64 A; 1VQ4 I; 2ID6 A; 2ZSH B; 5J40 A; 3L2R A; 3JRD A; 5KVR A; 2R7R A; 5FFX A; 1Z05 A; 2K9M A; 4E7S A; 2CFO A; 3OSF A; 3H3U A; 4M3G A; 1VQP I; 2KIQ A; 3E6C C; 3W6K B; 2DT5 A; 1OFC X; 3T1B A; 3IWF A; 3DBH B; 4LGW A; 3V7R A; 3J7A O; 1SMY F; 1A35 A; 4RGU A; 2VKD A; 3DLL F; 5FKK A; 1NK2 P; 1LVA A; 3RI4 A; 2STW A; 5HS7 A; 3MN2 A; 2DPD A; 2VQC A; 3HZJ A; 2TCT A; 2HYG D; 4PJL A; 3CLO A; 2FML A; 1GXP A; 3VSL A; 4U88 A; 2HKO A; 3BTL A; 1ERD A; 2KJC A; 2MSY A; 2H8R A; 1KU7 A; 3QQA A; 5FD6 A; 3GFJ A; 2A6T A; 2DA5 A; 4HA8 A; 1ZRE A; 5LHH A; 1MDM A; 4EV0 A; 2HDC A; 1P2F A; 4OAZ A; 5J6X A; 1D8J A; 3E6M A; 4JBA A; 2XVC A; 4U7D A; 3PUF A; 3BG3 A; 2JVH A; 1VZ0 A; 2V9K A; 2PLY A; 2IA0 A; 1O7F A; 5LHI A; 4HF0 A; 1VQ6 I; 4X1E A; 1X58 A; 1X2M A; 2HDW A; 3PNT A; 4CO8 A; 5GPA A; 3MCZ A; 4XN0 A; 4GXO A; 1GDT A; 2BBY A; 2XAF A; 4KT6 A; 4BH9 A; 1RZ4 A; 4OIO F; 2ECC A; 1ZGJ A; 3KZZ A; 5ICG A; 2Y75 A; 4I6Z A; 4EQQ A; 5IYC J; 3JRC A; 3LAJ A; 1YIT I; 5C44 J; 1QHH D; 2R5Z B; 2XRN A; 1W4M A; 3S3N A; 3KFW X; 4BBR J; 4OOI A; 1SD6 A; 2EV0 A; 2LRE A; 2DFI A; 3RTR A; 1ZTR A; 1X3Z B; 2COB A; 2IGO A; 1ETV A; 3OOU A; 4XQF A; 2R7F A; 2ISZ A; 1RUN A; 4XRS A; 2BXZ A; 4MEY F; 3FMR A; 2DFH A; 4LB6 B; 5LRR A; 3JRI A; 2KP6 A; 4II2 A; 3D0S A; 2GLO A; 4BHC A; 1K4T A; 1SD5 A; 1R1T A; 4LG3 A; 1RC9 A; 3H5R A; 1FPQ A; 2IGK A; 2OZU A; 3I4P A; 3PFI A; 4LG0 B; 1D1C A; 5FJ8 J; 2EZI A; 1QO0 D; 1BBY A; 4IHT A; 5HOD A; 2V1D A; 2E7W A; 2MA3 A; 2Q2E B; 1OYW A; 1WRJ A; 2AQF A; 3F8N A; 5LHG A; 3O6B B; 3BOQ A; 1I3Q J; 2E1N A; 3PL8 A; 4E7Z A; 3H0D A; 3G1M A; 3L2W A; 5GTH C; 1HW5 A; 2I8D A; 4B09 A; 5CVU A; 1G4D A; 2OU2 A; 1PVE A; 2MAB A; 4PJN A; 4N9H A; 2CSO A; 3AG1 H; 4HX4 A; 4KIC A; 1D0X A; 2LC2 A; 5DD4 A; 3K70 D; 1KQ8 A; 3ZCO A; 2ELH A; 3H36 A; 2W85 A; 3GZ6 A; 1IN5 A; 1B72 B; 3FX3 A; 1WI3 A; 1T6S A; 1MMS A; 3F8F A; 1MJ9 A; 1AU7 A; 3DP7 A; 1BI3 A; 2M30 A; 3B6A A; 3K4J A; 4EJU A; 5F0C A; 3GFI A; 5FRM A; 5E1Z B; 3J7A Y; 1DQU A; 2R3S A; 4KUM A; 1BI2 A; 1K83 J; 4C3I J; 1K6O A; 2R7S A; 2KPM A; 1U0J A; 5HLH A; 4ZYE A; 1ZYR F; 1VQO I; 4P1W A; 3VYS B; 4XLF A; 4FX4 A; 2I10 A; 3BTC A; 3NEU A; 1R5G A; 3QRF F; 1V54 H; 3PM1 A; 3I71 A; 1EA3 A; 1XGS A; 3MZY A; 3KYL A; 5IT9 K; 1P7J A; 1WQ2 A; 4DYQ A; 4HDV A; 4YFK F; 2JPC A; 1GLN A; 1ODD A; 3D5L A; 3LOC A; 3CME I; 3HB9 A; 4CHU A; 2EFQ A; 3OYG A; 2QEX I; 5B1A H; 2EBI A; 1JT0 A; 1O3R A; 2YX4 A; 3A2K A; 1K6Y A; 3EET A; 3G71 I; 4NC8 A; 3CJQ B; 3ZMS A; 4I0B A; 4UVC A; 4L9J A; 5HLI A; 4I99 C; 1Q1H A; 3CCJ I; 2WAF A; 1VQ5 I; 3GX4 X; 2DMN A; 1FYM A; 1I1S A; 3WTV C; 5BS6 A; 3EUK L; 1B1B A; 3VDX A; 3FXM A; 1AKH A; 2V1X A; 1Y8Q B; 1MD0 A; 1WVR A; 3LSM A; 3VOD A; 1ZLJ A; 4OMZ A; 1D8K A; 3K4L A; 3GYH X; 3P7N A; 3L00 A; 1LEB A; 5J8C A; 2ZXH A; 3OYE A; 1WSU A; 1BN5 A; 2R93 J; 5D6E A; 2LR8 A; 4CH7 A; 3HOT A; 4KIT B; 1JGS A; 2CO5 A; 3IH2 A; 4IJA A; 1YS7 A; 1GV2 A; 3BJA A; 4M9S A; 4FE7 A; 4FE4 A; 4MQ9 F; 2GXB A; 2VJ5 A; 4XRF A; 1G6N A; 5DDG A; 3U2R A; 2XPW A; 2DDA A; 2A6H F; 2PMZ A; 1LDD A; 5IPA A; 2G7H A; 3DKX A; 4A6D A; 3K4M A; 5DM7 F; 1JHF A; 4PJ0 C; 1IDZ A; 3DBR B; 2LH9 A; 2P81 A; 2W4S A; 1E3H A; 3TP3 A; 3W2V A; 2LKX A; 2X48 A; 4ENM A; 3VYT B; 3DU6 A; 4D7M A; 2QZ8 A; 2EA4 A; 3K7A J; 3FKI J; 2WY8 Q; 1MDM B; 1MBF A; 5CVR A; 4ZC3 A; 5LGU A; 1AHD P; 4C2U A; 2EV6 A; 2W7N A; 1ONV A; 1SC7 A; 1YQA A; 3KX2 A; 4LMY A; 4DOZ A; 3HBL A; 3O8H A; 3I3L A; 1S72 I; 4JOM A; 3J81 Z; 3K1M A; 3S17 J; 3GZ5 A; 4J00 A; 3M1C A; 4MNU A; 1WI9 A; 3FXQ A; 1Z91 A; 5J4V A; 1IXS B; 1XD7 A; 1BR2 A; 2VQL A; 3ZQG A; 3V8J A; 3BPV A; 1FYK A; 2BVL A; 3I55 I; 4BJ6 C; 4QIW N; 2FEZ A; 5E20 A; 3G2B A; 2IS4 A; 4N9I A; 1JJ8 C; 2A5Y B; 1L0O C; 3ZQH A; 3OYC A; 3E6D A; 2OV7 A; 1ZEL A; 1X4P A; 5M5Y J; 1XMK A; 5LD2 C; 3E6B A; 4Y17 A; 3KYD B; 2CQ7 A; 1ULY A; 2Z99 A; 4IQ4 A; 3ZOB A; 3J7Y J; 2ZME A; 3E0J B; 2PJR A; 3HOZ J; 2YU3 A; 2XF7 A; 3T5X A; 2Z5U A; 4XBF A; 3ZQC A; 4ZTF A; 1JKQ C; 3M8F A; 2H6C A; 1R5H A; 4MHG A; 4HG2 A; 2IT0 A; 1XMA A; 5BQT A; 2ZJ2 A; 3CP2 A; 3E1S A; 5DUK A; 1F4K A; 3HJE A; 4C30 A; 5DM6 F; 1KU2 A; 2JWT A; 2CUE A; 1BL0 A; 4A3L J; 4KFC A; 3JSP A; 4XLE A; 4U0W A; 4QPO A; 2L5Q A; 3R4K A; 2HKX A; 2Y0S A; 5F0F A; 1AWC A; 1JT6 A; 4XON A; 2QSH X; 3JRH A; 3TOA A; 3SFI A; 4WK8 F; 3AFH A; 4YFN F; 4XKB A; 1ZGW A; 1DDN A; 5K7F A; 1DUX C; 4G94 A; 3GUD A; 4M9Z A; 1E3O C; 2PMH A; 2KHM A; 1D0Z A; 4W1U A; 3CDI A; 3ZQF A; 4GDF A; 5D5X B; 2O8X A; 1R1U A; 2P6S A; 3M1E A; 1YIJ I; 1DP7 P; 1J5Y A; 3HL2 A; 3S1N J; 5K7H A; 2IW5 A; 2XIG A; 3HGY A; 1FC3 A; 4LLG F; 4G7O F; 3QU6 A; 2HS5 A; 2CUZ A; 2PBI A; 4MEX F; 3WHB A; 3COA C; 4D5C A; 1JTY A; 2DYR H; 1ZGA A; 2JSC A; 3BT9 A; 3SZG A; 4DGW B; 4PSX A; 2FOW A; 3K69 A; 5ICF A; 3JW4 A; 3TW7 A; 4GGG A; 5F64 A; 2JRM A; 5HOO A; 3F21 A; 2JA8 J; 1FZP B; 5IP7 J; 5D8K B; 3IRR A; 2ZNZ A; 4DYR A; 3MKY B; 4ESB A; 1TP4 A; 3K6G A; 2ELJ A; 1RR7 A; 2EZH A; 1UB9 A; 3DEE A; 3Q3S A; 4TV7 A; 3SZT A; 1QU3 A; 3WTZ A; 2P4W A; 3CCL I; 3JTG A; 4NBQ A; 1WJD A; 4BY7 J; 4LK1 F; 5ILU A; 4ETS A; 2STT A; 1D1A A; 2EFP A; 3OL4 A; 5E3O A; 2AXT C; 1RPW A; 1T0F A; 4A3C J; 4H4K C; 2DOE A; 2RNG A; 4DW6 A; 2VI6 A; 1KU3 A; 1MBH A; 2H94 A; 2KT0 A; 2KIU A; 5CQE A; 2GXA A; 3WGG A; 3GVA A; 3O8G A; 4A3M J; 4LLL A; 5F0H A; 4E7L A; 3AL0 B; 2GWR A; 4Q48 A; 2TDX A; 4QPQ A; 5HLT A; 2VON A; 2W82 A; 1IUY A; 4CCK A; 1JKO C; 1ACI A; 1HOM A; 3F23 A; 3BTJ A; 1GXQ A; 3M07 A; 2R7T A; 3ERE D; 3HHG A; 1MGT A; 3GLX A; 3HEF A; 5FD5 A; 5FKL A; 1K4S A; 2O9L A; 1EH7 A; 1W7P A; 4BU2 A; 2J5O A; 5L3B A; 2NXN B; 4D5F A; 3OYD A; 4IHY A; 4BAY A; 1MMD A; 2VE8 A; 4M72 A; 3QOE A; 5H2F C; 4D0P A; 3KEQ A; 3GTG J; 3I9V 2; 4ZYA A; 3PJR A; 3SFZ A; 3EYI A; 5LFA A; 4OIN F; 3ULQ B; 3HRU A; 3U1D A; 5GAE J; 4MFD A; 4JK1 X; 3ESW B; 3HSF A; 1EKE A; 4I01 A; 1BW5 A; 2X1C A; 3KE2 A; 1S7E A; 4QTR A; 2NRA C; 2KRF A; 2RN7 A; 1YW7 A; 2KDO A; 3QPL A; 3CO7 C; 1XPX A; 1BJA A; 3IH4 A; 5H6R A; 1HLV A; 5DS9 A; 3S3M A; 2VJI A; 4PGG A; 2WAQ A; 4UXN A; 3OYJ A; 5KAI C; 2OQG A; 2GAU A; 2P5L C; 1YW9 A; 1VFC A; 4NUB A; 4A0Z A; 5EF6 A; 3ASO H; 1KGS A; 5E1W A; 3L09 A; 4V2G A; 3CJN A; 4A0Y A; 2R0Q C; 2LRD A; 2R7Q A; 4A2U A; 1QA6 A; 1PUE E; 4WCG A; 2A5W A; 4E7K A; 2RNJ A; 2OAZ A; 4F93 B; 1T39 A; 2DOA A; 3LAP A; 5EEG A; 1YS6 A; 4XRS G; 1FBQ A; 1DU0 A; 1WFX A; 1MJB A; 1U5T C; 3ZP5 A; 2HDD A; 4BKX A; 1BI0 A; 2HI3 A; 1DP3 A; 1T98 A; 4Y7N J; 5FLX Z; 1A6I A; 3WG9 A; 3PQK A; 1OLT A; 2E19 A; 3LMM A; 5EZG A; 3V7S A; 2QEN A; 2IP2 A; 1LQ1 A; 1S5L C; 3OYB A; 2ZME B; 1Z6T A; 2PJR B; 2VBZ A; 1H0M A; 1IJW C; 3GTJ J; 3MWM A; 1R6R A; 1WPK A; 3FHZ A; 3CMA I; 4MTE A; 4XR6 A; 3VSK A; 1QNT A; 2NVT J; 2XKO A; 3N4M A; 2GQQ A; 4DJA A; 3WU1 B; 4KIS A; 1YFH A; 3BZC A; 3LA7 A; 5K5Q A; 4B3X A; 3WTY C; 4A0X A; 4IO9 F; 1FX7 A; 2X4H A; 5DV5 A; 2H1K A; 2AS5 F; 3QYF A; 3KP7 A; 4CSW A; 4BE1 A; 1EH8 A; 4ENN A; 1LDJ A; 3DQV C; 3HOS A; 1ZG5 A; 2VBW A; 3OYF A; 3FXL A; 2FD5 A; 4IVN A; 2ZBK A; 2DDB A; 2A69 F; 3TBI A; 4BAC A; 2K9L A; 2W57 A; 2XAS A; 2V1U A; 1POG A; 5D8L B; 5LLQ A; 3B73 A; 3S1M J; 4OMY A; 2QQ8 A; 3H35 A; 2LY9 A; 1K79 A; 3NQO A; 2KLO A; 1UCR A; 3OS0 A; 2BOL A; 2HQR A; 4CCL A; 2CMP A; 2DA4 A; 1I27 A; 2KDZ A; 5D5W B; 4LJZ F; 3H5N A; 2XF6 A; 4MO7 A; 5D6F A; 1REP C; 3S93 A; 1Y0N A; 3ML6 A; 4BDY A; 4YG2 F; 3LFK A; 1U2W A; 2DK5 A; 2NOJ B; 1RET A; 2FUG 2; 2JN6 A; 4YFX F; 5LEJ A; 5C4X J; 2V9P A; 3E7L A; 3JSO A; 3W6V A; 1G2H A; 1W5T A; 4Y3O A; 1LDK B; 2VE9 A; 2VIX A; 3O3K A; 1MND A; 1XMX A; 2NS7 A; 4DNC A; 2L7F P; 1GUU A; 1H8A C; 3JRB A; 1BJZ A; 4FET A; 1TT5 B; 3ERM A; 1HKT A; 4BNC A; 2DA2 A; 2EA2 A; 5DTD A; 1BR4 A; 2IAI A; 3GFL A; 4FT8 A; 4RM2 A; 1V55 H; 2HR3 A; 2MC4 A; 5FKO A; 3DPU A; 5CVI A; 4Y52 J; 1R5I D; 5ICC A; 2L4M A; 1RES A; 4Y4R A; 5GAH J; 4UY8 I; 2Y0M A; 3QPT A; 3HC7 A; 3G6E I; 1OCT C; 4AYB A; 3IH3 A; 2DA6 A; 2F5D A; 4FCY A; 1QQI A; 1UG2 A; 3EUA A; 3PO2 J; 2PJP A; 2ELK A; 4AWX B; 1W0T A; 4BQN A; 4EVI A; 2XPV A; 2JA2 A; 1TLH B; 5HDG A; 2E2I J; 4EJT A; 2NS8 A; 4Y33 A; 3IWZ A; 3FKJ A; 4II3 A; 5FLM J; 2JA7 J; 3RDI A; 2HFH A; 2QVO A; 4FIS A; 1ZR2 A; 1G3Y A; 3CF2 A; 1QZZ A; 3H0G J; 2M87 A; 3VYU B; 2CQX A; 2BY3 A; 4M6V A; 3HUG A; 4XLP F; 4NHJ A; 1JI8 A; 1Q1V A; 1W7P D; 1WWX A; 3GTO J; 2VKH A; 3BY6 A; 4K2E A; 2LSO A; 3G4S I; 1XSX A; 5DEQ A; 3VOE A; 2XF5 A; 2DCE A; 2CV1 A; 1U9O A; 2F5V A; 4HF1 A; 2QKL B; 3CO6 C; 4AIJ A; 2DXI A; 2GIZ A; 1T33 A; 3LA2 A; 3H9G A; 2W25 A; 3GTL J; 1EF4 A; 2E1C A; 2HQA A; 4CUG A; 2QGU A; 2JQ7 A; 2XKP A; 3BQY A; 2OTJ I; 1ENH A; 1MMG A; 1IO2 A; 2ZCW A; 3FXJ A; 4HV5 A; 1LFB A; 3SJM A; 2IA2 A; 3QPS A; 4RBO A; 1ZRC A; 4Y13 A; 2JJ7 A; 2DOD A; 4LIV A; 2Z16 A; 4EJO A; 4MGR A; 1ZLK A; 4HF2 A; 1P6R A; 1LPQ A; 2LMD A; 4BBS J; 2HOT A; 2MBF A; 3BG9 A; 1IV8 A; 3H92 A; 2E1M C; 4EJV A; 4HV6 A; 2OUM A; 5DUI A; 2VL8 A; 2Y48 A; 3CUQ A; 3X2Q H; 4U7B A; 1OMI A; 2R7W A; 2ESN A; 4HX7 A; 4QSH A; 4HRI A; 4B44 A; 2VJ4 A; 2M5W A; 4XMY A; 2XAH A; 2PFB A; 4CZC A; 3H3V K; 3W3C A; 4D7N A; 2JVG A; 1R4M B; 2PX9 A; 2GM4 A; 3BQZ A; 4D9J A; 2QCO A; 3H9J A; 4I09 A; 3SHF A; 4DYC A; 2BV6 A; 3HKZ N; 3R0A A; 3MQ0 A; 3BR5 A; 5CPR B; 4BE0 A; 4DBR A; 4NC7 A; 5HVQ C; 1DPR A; 1XGO A; 3C2H A; 2N8G A; 1KU9 A; 3FDY A; 3GTP J; 1IN8 A; 2FMY A; 4CCO A; 1YTY A; 5E8G A; 3Q0W A; 1BW6 A; 3KLN A; 3CJT B; 1V3F A; 4NDL A; 5HS8 A; 4ZZD A; 4RB3 C; 4Q5S F; 4F52 A; 1X1B A; 2HYJ A; 1HA8 A; 5D4S A; 3K0L A; 1OCO H; 2LFB A; 3DTK A; 2G0E A; 2WC2 A; 2DQR A; 4GRI A; 1EV7 A; 3QYE A; 4EGY A; 1X1P A; 2EIK H; 2VXD A; 5IOZ A; 4AC0 A; 2P7C B; 1FP2 A; 1O7L A; 1Y56 A; 1MMA A; 2QSF X; 5FKN A; 1FYL A; 1IXC A; 5FKM A; 4JX4 A; 4GFB A; 3PSI A; 1BR1 A; 4BUP A; 2L9N A; 1QBJ A; 4YRV A; 3HRT A; 1Z1D A; 3EUH C; 2ZFU A; 5C3E J; 2JA5 J; 1FTT A; 2L7M P; 3S16 J; 4WXC A; 1TNS A; 2L01 A; 3FXK A; 3Q0U A; 3RQI A; 3JRA A; 1J0R A; 4KA4 A; 4QWQ A; 1OR7 A; 4B47 A; 3ASN H; 1X1C A; 4NNJ A; 5TJJ A; 5KHD A; 3A0H C; 2GXG A; 1IN6 A; 1SFX A; 1WKM A; 2DK8 A; 3TGN A; 4WF2 A; 5K5O A; 2GIV A; 1X3U A; 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