The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
49
|
structure length |
49
|
Chain Sequence |
GSSGSSGSCQYQDLLSNCDSLKNTAGCEHELLKEKCKATCLCESGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of RSGI RUH-032, a cystein-rich domain of CRISP-2 from human cDNA
rcsb |
| molecule keywords |
Cysteine-rich secretory protein-2
|
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
5
|
| structure length |
49
|
| sequence length |
49
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Crisp domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1WVR A; 1XX5 A; 2A05 A; 2GIZ A; 2DDB A; 1RC9 A; 2EPF A; 2DDA A; 1XTA A; 3MZ8 A; 2CQ7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4AVZ A; 4DYQ A; 4Y3O A; 4Y4R A; 1XC5 A; 2E1O A; 3ABU A; 4XOT A; 2BVM A; 2ECB A; 2ZXI A; 5F04 A; 2W82 A; 3LA2 A; 5FD5 A; 3CO6 C; 1CGP A; 1BR1 A; 4IL6 C; 2PBI A; 2HZD A; 3L09 A; 4PJM A; 1KQ0 A; 2M3A A; 4QPQ A; 1P4A A; 4ZDL A; 4H0E A; 4M3F A; 1DU6 A; 2ZB9 A; 3B6C A; 2LKS A; 3TKY A; 2V6C A; 4MGR A; 1TWG J; 3NRV A; 4IQJ A; 2KHM A; 3RZO J; 4A5M A; 4DQ2 A; 5E3O A; 2IXS A; 1YW9 A; 2ICW G; 3BWG A; 4D7M A; 1F5T A; 3HL2 A; 3I53 A; 3IKV A; 3NAU A; 1Y8R B; 3P7N A; 5FKO A; 4AC0 A; 4K2E A; 2WAQ A; 1QHH D; 2HQA A; 1X2N A; 3PSF A; 2B0L A; 4LLL A; 3TP3 A; 2ACJ A; 5IYB J; 5D8L B; 2LTP A; 1O7F A; 4ESB A; 1JUP A; 3J7A O; 1HDP A; 4CCJ A; 3DPT A; 2ZSI B; 3E97 A; 3HJE A; 4I98 B; 2A6H F; 2HQ5 A; 3WTV C; 1YJN I; 2O9L A; 1OPC A; 3ABT A; 2DA5 A; 3K6G A; 3HIF A; 5L3E A; 4BY1 J; 5LEK A; 1R5I D; 2EZK A; 2W4S A; 3H0G J; 5D5U B; 5J1R A; 4NHJ A; 1FY7 A; 5DD8 A; 2ZBK A; 5ICE A; 3WTU C; 1WJF A; 3OYA A; 5F0C A; 1WH7 A; 4E7H A; 1O57 A; 4BS9 A; 1BN5 A; 1DUX C; 1VQK I; 5IP7 J; 4KIS A; 3S8P A; 3AKZ A; 1MIJ A; 2KIQ A; 3AAF A; 3CP8 A; 2AO9 A; 5ERI A; 2CRG A; 3B02 A; 4C9Y A; 4HOB A; 3H3Z A; 4YIF A; 3BJ6 A; 3U1K A; 1ZKG A; 1WI9 A; 2KDO A; 3IHU A; 3T0Y A; 2A3S A; 4BGD A; 3B6A A; 2W00 A; 2OA4 A; 1GDT A; 4CCO A; 5LGU A; 4B4C A; 4BDY A; 2NS0 A; 3A02 A; 3VDX A; 1BW6 A; 2NOG A; 2Y31 A; 1E17 A; 4G12 A; 3H36 A; 1ZHF A; 3HRT A; 3H35 A; 3HZJ A; 4M6V A; 1SAX A; 3K4B A; 3NEU A; 1XDS A; 2CU7 A; 1R4N B; 5EGO A; 2HWV A; 4G7H F; 3ZQC A; 3CUQ C; 2JRM A; 4U87 A; 1O4X A; 3FIS A; 4FE4 A; 2MD5 A; 3DEE A; 2A68 F; 4HG2 A; 1XMA A; 3HYI A; 4V19 K; 2HQN A; 2JA6 J; 3WOD F; 3ML6 A; 1KGS A; 2COM A; 4Y52 J; 2MLG A; 2JPB A; 3K10 A; 2M34 A; 1BIA A; 1ZRE A; 1HW1 A; 3HGY A; 1SEU A; 2FMY A; 2HNH A; 2DMP A; 5GTH C; 4XLP F; 4RDU A; 2E1M C; 2L7M P; 2Y0S A; 5J40 A; 5KCM A; 5M3M J; 4UXN A; 3L2Q A; 4HDV A; 2IRF G; 3FM3 A; 4XOR A; 2IT0 A; 2O7O A; 3H1C A; 4IPA A; 3LFK A; 4ZYA A; 4HF1 A; 3OV8 A; 1FPQ A; 2CQ7 A; 1VQN I; 1WJD A; 2E60 A; 2QKL B; 2Z5U A; 3DTI A; 2STW A; 2DT7 B; 5EEH A; 4OMY A; 1VTN C; 2N8G A; 1LFU P; 5EGO B; 1JKR C; 3MD2 A; 1OCP A; 2E36 A; 1O3Q A; 4E7J A; 1VQ8 I; 1PJR A; 2RVC A; 1MBK A; 2X1C A; 4FTH A; 1U2W A; 3L1P A; 4M3D A; 3J81 Z; 2HDW A; 1FWZ A; 3LSP A; 2D2W A; 3U21 A; 3G71 I; 4HST A; 2DJN A; 1SAN A; 2QBY A; 3BOQ A; 9ANT A; 1W0U A; 2HKO A; 4A3L J; 2M0C A; 4EEF G; 3QYF A; 5ICG A; 5J4V A; 1J59 A; 2I5U A; 1E3H A; 1MMG A; 3DEU A; 3T8R A; 2JK3 A; 3HOV J; 2HOA A; 5FLM J; 2VUM J; 3S2H J; 2P4W A; 4KFC A; 1SMY F; 5E1Z B; 3KP5 A; 2HEO A; 4BKX A; 2XIG A; 3V42 A; 1K61 A; 3DFG A; 1MNM C; 2GIZ A; 2OTL I; 2QF7 A; 3K70 C; 1IW7 F; 3N4M A; 1R1U A; 2EFP A; 1FTT A; 2LF7 A; 3LQQ A; 4BXX J; 2QQ9 A; 1RPW A; 2VB6 A; 5D5V B; 4CYC A; 1SD5 A; 4BJT A; 1TWA J; 1HQC A; 3HXL A; 4DOZ A; 1SVO A; 2V7F A; 5FKN A; 1UEL B; 4HRI A; 2X6W A; 4P9U A; 1GLN A; 3CUO A; 5ED4 A; 3KEQ A; 4L5J A; 1Z6T A; 1Z7U A; 3G1L A; 3FDY A; 3FWE A; 5JI6 A; 2K9S A; 4ZYD A; 4ENM A; 3U2R A; 1S5L C; 2DJI A; 1ZGA A; 1FMW A; 1TW2 A; 4MLO A; 5CVV A; 5KAF C; 3H9G A; 1ZH5 A; 3CMM A; 3WTZ A; 2DDA A; 5D8K B; 2E19 A; 4KMU X; 1JHH A; 2XUB A; 5L3C A; 1JHF A; 5HNF A; 5B5E C; 3BTL A; 5K1Y A; 3DKX A; 3K70 D; 3WTT C; 1XSX A; 3IRR A; 3WTS C; 2QQA A; 4XMY A; 4IKF A; 1BR2 A; 1W5T A; 3MQ0 A; 3RKW A; 4CYC B; 2IA2 A; 1HW5 A; 3BZ6 A; 2X1E A; 4M6Y A; 2GXG A; 3HEF A; 4OIN F; 1S7E A; 2XPU A; 3E3V A; 2E7W A; 3GO5 A; 3V8L A; 3VYR B; 5B1A H; 5IT9 Z; 1XX5 A; 2KJC A; 2MGQ A; 1NK3 P; 2L7Z A; 4QLC U; 2LOO A; 4S0H B; 3HM5 A; 2IEK A; 4B09 A; 2M8G X; 3C7J A; 3JW4 A; 4BE2 A; 2HVS A; 1YIT I; 5KK1 A; 1T39 A; 1MND A; 2VQC A; 1SMT A; 2DMQ A; 2XV4 S; 1ETV A; 2KFD A; 3ZXS A; 2KLO A; 2QUF A; 3S1R J; 1G3Y A; 3LSJ A; 3ZMT A; 2PMZ N; 1ETK A; 2DQL A; 2RC4 A; 2H8W A; 1BR4 A; 3K0L A; 4A3J J; 4DZJ A; 1I5Z A; 5FLX Z; 1JJ6 C; 2LRD A; 3E5X A; 2PN6 A; 3AG4 H; 1D5Y A; 2MC3 A; 3DKY A; 2X48 A; 3L2W A; 3ZCO A; 2EFO A; 2DYS H; 4FET A; 2Z1D A; 3CC4 I; 2DTZ A; 1LDD A; 1SFK A; 2RRE A; 1JUM A; 1UST A; 2XVC A; 1XN7 A; 3OIO A; 4NBQ A; 5F1R A; 1U3E M; 3L00 A; 3OYJ A; 1FP2 A; 4B8X A; 1X1C A; 3FMS A; 3ABM H; 3WG9 A; 3TO9 A; 3BPV A; 3H5A A; 4OOI A; 2HTJ A; 2M30 A; 3C2G A; 3HOW J; 2K7L A; 3SJM A; 1QZE A; 2VC0 A; 4W97 A; 1Y0N A; 5D6E A; 3CJQ B; 3H3U A; 3Q0V A; 2XKP A; 3L9F A; 3MEX A; 2ME0 A; 5EG0 A; 1DU0 A; 2DT6 A; 4FX0 A; 2KIM A; 5GPC A; 3AL0 B; 3GTM J; 2FBH A; 2R5Y A; 1ZTR A; 2X9D A; 3I9V 2; 4WXD A; 5KAI C; 3PQJ A; 3GZ6 A; 3QP5 A; 3BR1 A; 5HLG A; 2V1D A; 3HOY J; 2CQX A; 4RAZ A; 2DPD A; 4CGZ A; 1RR8 C; 1BOB A; 2WWY A; 2WY8 Q; 4BQA A; 2M9H A; 6PAX A; 1T0F C; 1TQI A; 1LDK B; 3R0J A; 4EJU A; 4GCV A; 3WGI A; 1HW2 A; 1DP7 P; 4Q47 A; 1Z3X A; 3KE2 A; 4H4K C; 5TGT A; 2BYV E; 5CJ9 A; 5H6R A; 4AVP A; 3CCL I; 2LF8 A; 3ABL H; 4LLN A; 3M8J A; 2GXA A; 3KFW X; 5EG0 B; 4O3M A; 3V7R A; 1IC8 A; 1YRN A; 4XSZ F; 4D9J A; 2WA0 A; 4CCL A; 4HX7 A; 1MBE A; 3R4K A; 1BM9 A; 3LSI A; 3S93 A; 1OYI A; 4U7D A; 2R5Y B; 3S2D J; 3LL7 A; 2MSY A; 1VQM I; 2IA1 A; 3TW6 A; 5FGM A; 4WK8 F; 2FQ3 A; 4PJN A; 1Q1H A; 1BIB A; 1QRY A; 3CLQ A; 2KQR A; 3VSL A; 2IJL A; 1RI7 A; 5JLX A; 3WU2 C; 4ENJ A; 2BXY A; 4XBF A; 1VQ6 I; 1QO0 D; 1G3S A; 1SD4 A; 1I6H J; 2F6C A; 2OUM A; 3JRF A; 4IZZ A; 5L3G A; 3PIO F; 1MKM A; 2F5E A; 3DWL E; 3SDB A; 3ZQF A; 2A6T A; 4DW6 A; 1BOA A; 4IOC F; 1WHU A; 1MW7 A; 2QZ8 A; 4A6D A; 4CCM A; 5EDN A; 4JX4 A; 2CV2 A; 3PL8 A; 3BLY A; 2GIV A; 2BY1 A; 4XLA A; 1TWC J; 1SVM A; 2V9K A; 3VOE A; 5HVQ C; 3CCU I; 2VAS A; 3OR1 C; 1YIO A; 2OAZ A; 2OQG A; 5J8C A; 5C44 J; 3B73 A; 3FK7 A; 2BY0 A; 2FRH A; 3C2B A; 3EPZ A; 3IH4 A; 3RPU D; 5KNL A; 3COA C; 3BT9 A; 3M8F A; 4L0Z B; 2KIF A; 2EA4 A; 4KN4 X; 1W5S A; 3QYE A; 4RMN A; 1YG2 A; 3GFL A; 2W85 A; 1KQ9 A; 3NAR A; 3M1E A; 1PP8 F; 1J9I A; 2NVY J; 2FSW A; 3JRI A; 4HBL A; 2O8X A; 4YEJ A; 4BXF A; 2K40 A; 4XIC A; 1YQA A; 4XRM A; 1TP4 A; 2ZNZ A; 1A6Q A; 1ON2 A; 3JRD A; 2MYS A; 2D1H A; 2K9L A; 4HEA 2; 5M5X J; 4LG3 A; 2PX9 A; 1TQP A; 4EVI A; 4Y7N J; 2XKO A; 2JA7 J; 1BBY A; 1X1P A; 4KIC A; 2Z3Y A; 3Q3S A; 1WJC A; 4A3F J; 2G0E A; 2PJR A; 3BPX A; 3KYD B; 3VYS B; 1ERD A; 1DGR M; 4G7Z F; 1R7J A; 2HPI A; 3Q0W A; 1WJA A; 3KZZ A; 2Q1Z B; 5FRN A; 4KT5 C; 3Q9V A; 3OYL A; 4A3M J; 5BMZ A; 1Z05 A; 1QZZ A; 3BR0 A; 3TO6 A; 1MJ9 A; 2FE3 A; 3DU5 A; 3LSH A; 4N9H A; 3WE2 A; 4F93 B; 1IRZ A; 4YFN F; 2Y9Y A; 3V7S A; 4IHY A; 2MG4 A; 2JQ7 A; 2O0Y A; 2HYJ A; 4IHT A; 3OYF A; 1AHD P; 2YU9 J; 2ZJR F; 2ZXH A; 2EWN A; 1PVE A; 3ZN0 A; 4EAT A; 4UVA A; 2OCC H; 3PNY A; 2P6T A; 1IN5 A; 2JJ7 A; 2FEZ A; 3EET A; 2PJR B; 4C3J J; 5BPD A; 3D5L A; 4GYG A; 2ZFU A; 5DEQ A; 3RKX A; 1DPR A; 1GVD A; 3S1M J; 3ZQ7 A; 4D5F A; 2OBP A; 2RQP A; 2L7F P; 5DCF A; 4WCG A; 2K27 A; 3SYT A; 5C3E J; 2IS1 A; 1APL C; 2IW5 A; 2EFN A; 5IP9 J; 3ULQ B; 3L2C A; 3BJA A; 5HNH A; 3BG9 A; 2HZT A; 1VQ4 I; 4RB2 C; 5KVR A; 1QVT A; 3C3W A; 4PFP A; 3TOB A; 4A0Y A; 4BEH A; 2FUG 2; 1AWC A; 3WTW C; 3V4G A; 1A04 A; 4I76 A; 1JTX A; 1RKT A; 2K3F A; 2Q8K A; 3EDP A; 2BW3 A; 3L2R A; 1GVJ A; 4BU2 A; 2LY2 A; 3FIW A; 2PQ8 A; 4RAG A; 3I4P A; 3ZGK A; 1IJW C; 1S72 I; 3NWT A; 2P7V B; 5LGN A; 1WJ5 A; 4JOM A; 4ON0 A; 4IO9 F; 2M87 A; 3W2A A; 2EIJ H; 3PNV A; 5JFR A; 4KA4 A; 4PK4 A; 4AWX B; 5F1J A; 4II2 A; 1TBX A; 2VT3 A; 4AYB A; 1Z9C A; 2IVM A; 4V2F A; 2BY3 A; 1RC9 A; 3IV5 A; 2AS5 F; 3E6C C; 2HPM A; 1LEA A; 1XTA A; 3RQ4 A; 2IS2 A; 3F8B A; 1B1B A; 4XQF A; 1P6R A; 2VIX A; 3MCZ A; 2ISY A; 1F36 A; 3FMQ A; 3KPH A; 2W24 A; 2UXX A; 1SFU A; 4C3H J; 4N4O B; 2DPU A; 1G3T A; 1IZ1 A; 1R49 A; 4BEH B; 1UZC A; 3K2A A; 2OV7 A; 5FFX A; 1J09 A; 3E6D A; 4B48 A; 2QSF X; 3IRQ A; 1R00 A; 4GYI A; 2D45 A; 5HDG A; 3IH2 A; 1TZL A; 2XB0 X; 1BI1 A; 4JQF A; 2XPV A; 3GXO A; 2BW3 B; 4UUT A; 1I3Q J; 1U9N A; 2HI3 A; 3IWZ A; 4DIQ A; 2R93 J; 2Y30 A; 5FFZ A; 1KU2 A; 2CQK A; 3ECH A; 4NC7 A; 2DFI A; 5HS8 A; 3M07 A; 4UHT A; 1T56 A; 3RDI A; 1EJ9 A; 3H92 A; 4F3Q A; 3KCC A; 1PYV A; 2I8D A; 3KP6 A; 5LRS A; 4AM3 A; 1K78 A; 2CFO A; 3WGH A; 3RYP A; 4X1E A; 4G9Y A; 3FXU A; 3FXM A; 1U9O A; 1YE9 A; 2MD0 A; 4M3B A; 1W1W E; 2GA1 A; 1HDD C; 2KKO A; 3MKW B; 1F1Z A; 2DT5 A; 3PO3 J; 2K85 A; 3BY6 A; 4MQV A; 3SHF A; 4BAY A; 1I27 A; 1G8X A; 1N75 A; 2FX0 A; 4ETS A; 3FXK A; 5BOX A; 4DYR A; 1X3U A; 4ZTJ A; 1WSU A; 5FB2 A; 3FHN A; 4PSW A; 2W48 A; 4I6Z A; 1W36 D; 1BI2 A; 4KDP A; 1LB2 A; 2EIK H; 2FU4 A; 1RR7 A; 4Y17 A; 2VT2 A; 2QQB A; 5JVT A; 1T6S A; 5TIS C; 3MFK A; 3O3K A; 3J80 K; 4HLY A; 4IVN A; 3JTG A; 2ZME C; 4E70 A; 2WBM A; 2JVH A; 1R5G A; 2E5Z A; 5D5X B; 2XF6 A; 1UAA A; 4BE1 A; 1OR7 C; 1K78 B; 4EGZ A; 1IGN A; 2V1N A; 1H88 C; 3CF5 F; 1XCV A; 3I59 A; 3R6S A; 3BRO A; 3JRE A; 1KU7 A; 2FD5 A; 1SD6 A; 1KU3 A; 4AIK A; 4UB8 C; 4KYW A; 1BL0 A; 3EUH C; 5K5Q A; 3H5R A; 1LNW A; 4B3A A; 3GFJ A; 2YX7 A; 2L0K A; 1TL8 A; 2H6B A; 3M9A A; 4I0B A; 3PO2 J; 1MNE A; 1JT6 A; 3VPR A; 2VE9 A; 1I6X A; 2XAU A; 1TNS A; 2D5V A; 1K6O A; 1JE8 A; 1IDY A; 1OQY A; 1WGX A; 3ZQG A; 1ETQ A; 5FKM A; 5J6X A; 2GAU A; 5J1Y A; 4YIR X; 2W84 A; 2DXI A; 3I0T A; 3BG5 A; 4V2G A; 2HFH A; 5E20 A; 3JTH A; 2CQQ A; 4XKV A; 2VPR A; 4OIO F; 1J7K A; 1OMI A; 1TTY A; 5D4S A; 1FC3 A; 4WF2 A; 1FSH A; 2JPC A; 3I59 B; 1NG7 A; 1DGW Y; 4XOP A; 2IGM A; 1BJZ A; 3F22 A; 4LLG F; 1OCT C; 2CGP A; 1ZN2 A; 2DFF A; 3H9Q A; 2ELJ A; 2H09 A; 4LMY A; 1D3Y A; 4G6D A; 2W57 A; 3F23 A; 2KIS A; 3ZOB A; 2M7B A; 2JUG A; 1IAW A; 2GBY A; 2JT1 A; 4FHT A; 2J5P A; 1GHC A; 1XMK A; 5EYR A; 1WJB A; 2NAZ A; 5HLT A; 1H0M A; 4E7K A; 2TRT A; 3LST A; 1WFX A; 3F21 A; 1ULY A; 1Z0X A; 1A35 A; 2X85 A; 5C4X J; 2JA2 A; 3W6K B; 3HBL A; 4UB6 C; 2HTS A; 5DCM A; 1QZY A; 2CV0 A; 1IRX A; 4IRH A; 3OSF A; 4OAY A; 3DQV C; 3K4K A; 3H5N A; 2DTR A; 2BV6 A; 1IUY A; 4AID A; 3ZMS A; 2R7Z J; 4ZC3 A; 3G3Z A; 2CYY A; 1JI8 A; 3HKZ A; 1QPM A; 2K9M A; 3HRM A; 1HST A; 4HQE A; 4RB0 A; 5J8F A; 4KIB A; 4LOC A; 5ICC A; 1MJA A; 4N0B A; 2XGD A; 1AOY A; 1G3W A; 3CES A; 1W7P D; 3E5U A; 1D8K A; 3KX2 A; 2XGE A; 3GZ5 A; 1H9G A; 3QOD A; 3HOS A; 5DTD A; 4F92 B; 4LIV A; 4UVC A; 2VJI A; 3MZ8 A; 3KLN A; 4ZZL A; 3IKT A; 2UWM A; 1TC3 C; 3HRS A; 1WJE A; 5DCM B; 1IXS B; 5FO5 A; 3ECO A; 1X3Z B; 4PJL A; 2ELK A; 2NYX A; 4XK4 A; 2M4K A; 2WY7 Q; 3KYL A; 3DBR B; 1DDN A; 1XCB A; 4I09 A; 3QAH A; 3CLO A; 1ZLK A; 1TQM A; 1RES A; 4E7Z A; 5HDN A; 3TQN A; 3ZMD A; 1NG6 A; 2H27 A; 3BTI A; 2E35 A; 3HSR A; 1V55 H; 1P7I A; 2OZ6 A; 5H20 A; 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