The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
49
|
structure length |
49
|
Chain Sequence |
GSSGSSGSCQYQDLLSNCDSLKNTAGCEHELLKEKCKATCLCESGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of RSGI RUH-032, a cystein-rich domain of CRISP-2 from human cDNA
rcsb |
| molecule keywords |
Cysteine-rich secretory protein-2
|
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
5
|
| structure length |
49
|
| sequence length |
49
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Crisp domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1XX5 A; 1RC9 A; 2DDA A; 2GIZ A; 2DDB A; 2EPF A; 2CQ7 A; 1XTA A; 3MZ8 A; 1WVR A; 2A05 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1YW7 A; 5IOZ A; 3TDU C; 2M1B A; 4OU0 A; 4A3F J; 1PVE A; 4QLC U; 4RB2 C; 1KU9 A; 2BZT A; 1YX5 A; 1RI7 A; 1MND A; 1G8X A; 2XRL A; 2W82 A; 2DMU A; 3W2W A; 4U0V A; 2RC4 A; 1X1D A; 3DU6 A; 4PK4 A; 5CQE A; 2GWR A; 1C0W A; 4B3X A; 5ILU A; 4QTR A; 3OS0 A; 4RS8 A; 1L3L A; 3WOD F; 3JRI A; 4XR6 A; 2A5Y B; 1WI9 A; 4YIF A; 2XPU A; 3H9Q A; 3KE2 A; 3HDD A; 3JW4 A; 1S7A A; 3KP5 A; 3QU6 A; 2JT1 A; 1W36 C; 4EM1 A; 5LHI A; 4CCN A; 2IA1 A; 3IV5 A; 1Z1D A; 2D1H A; 2RN7 A; 4AIJ A; 1WSU A; 2HDC A; 2DDA A; 4L5E A; 2E35 A; 1X3W B; 1FBS A; 3E7L A; 1A6I A; 2LKS A; 1WJF A; 1J2X A; 4U7D A; 3LSG A; 3TW7 A; 1QHG A; 5FLV A; 2JA7 J; 4NC8 A; 2A6E F; 2BW3 A; 1SMY F; 4IZZ A; 4I0A A; 2F4M B; 4KN7 X; 3I5U A; 2JA8 J; 4G7Z F; 3ML6 A; 1TWC J; 4B4C A; 2ZXJ A; 4G12 A; 4CIC A; 4WK8 F; 1YJW I; 4M9Z A; 2LY1 A; 4QPQ A; 4YFX F; 5FD6 A; 3CDL A; 4B43 A; 3HTU A; 3I64 A; 2ISY A; 3C3W A; 3D0S A; 3E0J B; 4HA8 A; 4HNV A; 2ZJR F; 2FOW A; 3HOT A; 1WH7 A; 4AIH A; 5E3O A; 2EFN A; 4BXU A; 3K1N A; 1V5F A; 1AKH A; 2STT A; 3H5R A; 1I6X A; 3BR1 A; 2K3P A; 1B1B A; 4DJA A; 5L3G A; 2VQG A; 4XM3 A; 2HZD A; 2XAJ A; 2R7U A; 4UVB A; 2Y9Z A; 3K4N A; 2ECC A; 5AON A; 5FO5 A; 2XAU A; 3IKT A; 4PJN A; 1S7O A; 4LLN A; 1UHM A; 2B9S A; 4J01 A; 5CQG A; 3MWM A; 1EH8 A; 1VND A; 2HOE A; 2JSC A; 5LFA A; 2VIX A; 3H36 A; 4LOC A; 3KP7 A; 4PSX A; 2BEO A; 1TQI A; 1BC8 C; 2RNJ A; 5IT9 K; 3ZMU A; 3HTS B; 1Z7L A; 2A68 F; 3S3N A; 1SVO A; 1VZ0 A; 1WJA A; 3VEP A; 3FK6 A; 5FRN A; 4HOB A; 2X6O A; 3Q3S A; 2DQR A; 1RUN A; 1A6Q A; 1FY7 A; 2HPM A; 1FYK A; 3BTI A; 4YEJ A; 4CHU A; 2QBY A; 3G3Z A; 2PN6 A; 4D0P A; 2QYO A; 1MMA A; 3O8H A; 4AVZ A; 3BQY A; 1QVU A; 1ZG3 A; 1T6S A; 5K5R A; 1TNS A; 4ON0 A; 1R1V A; 1ZN2 A; 3MFK A; 1F9N A; 1MBE A; 1YS6 A; 1V55 H; 2R5Z B; 2DMT A; 3DU5 A; 1FC3 A; 4LIT A; 4FIS A; 5EZH A; 4JX5 A; 3ZCO A; 1W7P D; 4C3H J; 4RGS A; 2DJN A; 2LBF B; 3V8L A; 2LH9 A; 4BHB A; 4BAC A; 3UKG A; 5EGO B; 1V54 H; 1XGO A; 1ZR2 A; 2JVG A; 3CDI A; 2VE8 A; 3M3Y J; 1MBH A; 2DK5 A; 2PBI A; 1UJ8 A; 2EFP A; 3MKL A; 3W6K B; 2HS5 A; 3HOZ J; 2HU9 A; 2B7E A; 3HSF A; 1JT6 A; 3CTA A; 4D5C A; 4GFB A; 1RPW A; 2JSP A; 3F8F A; 2NVT J; 1HSJ A; 1OIS A; 1MH4 A; 1OYY A; 4LLL A; 2I5U A; 3KP6 A; 2ZFW A; 5IYC J; 4DQ2 A; 1K78 B; 3HBL A; 2DA7 A; 3GLL A; 1GV2 A; 4EEF G; 1B59 A; 3PNY A; 1CQT A; 4HF1 A; 1QZY A; 1FIA A; 3G2B A; 2BE5 F; 2NOJ B; 4A2U A; 2GXB A; 3M1C A; 3F6O A; 4HG2 A; 2WAF A; 2WV0 A; 4BJ6 C; 2QEN A; 2RRE A; 3QRF F; 4NUB A; 1LEB A; 3H35 A; 2FXA A; 4V19 K; 4XLE A; 1B72 B; 2CWE A; 3QPL A; 4DNC A; 4EV0 A; 2OTJ I; 2X48 A; 3BJA A; 2YR2 A; 4RGX A; 4DBR A; 4EM2 A; 2DXI A; 2HYJ A; 1R36 A; 3F9K A; 1JE8 A; 1VQ7 I; 3TW6 A; 1GV5 A; 4HDV A; 1JKR C; 1X1A A; 3FXQ A; 3OYE A; 2FNP A; 3JRH A; 5IY5 H; 1WRJ A; 2VI6 A; 5TJJ A; 1FP2 A; 2I8D A; 2ZJP F; 2LG4 A; 1QA6 A; 5JR3 A; 3G73 A; 2YU9 J; 3RKX A; 1QZE A; 3D5S C; 2XIG A; 4LGW A; 1RET A; 3WTY C; 4ZDO A; 2D5V A; 5ICE A; 5ICF A; 1FTT A; 3ZN1 A; 3WG9 A; 4BBS J; 5HLI A; 3WU2 C; 4UVC A; 2CG4 A; 2O3F A; 1EH6 A; 2YU3 A; 2X6X A; 2NRA C; 4HRI A; 4EJW A; 3K70 D; 3S8P A; 4A3E J; 5EEA A; 1K6Y A; 2B0L A; 1ETY A; 3SZP A; 1P4W A; 2A69 F; 2MW8 A; 2FUG 2; 3BZK A; 3D5R C; 4Y7N J; 4KT6 A; 4JK1 X; 3DTK A; 3J80 K; 1QU3 A; 4FX4 A; 2VBY A; 3S3M A; 2PFB A; 3K0L A; 2PMU A; 2VJI A; 4L18 B; 4R8H A; 2IS1 A; 2DOE A; 3ELK A; 3AL0 B; 2VC1 A; 2DMP A; 1I5Z A; 3ZMZ A; 1S9H A; 4L0Y B; 2E5Z A; 2QF7 A; 4E7Z A; 4KT5 C; 1I6H J; 1U78 A; 4J19 A; 5M5Y J; 2L02 A; 3LSH A; 1FOK A; 3L2W A; 4N0B A; 1MNE A; 2BBY A; 1HDP A; 3OOP A; 4XK4 A; 3I59 B; 4JOM A; 4PSW A; 1KYW A; 5BQT A; 2HXI A; 3HOW J; 1R9T J; 3MMY B; 2P4W A; 3O3K A; 2L4M A; 5C3E J; 3NWS A; 2DFF A; 3QOD A; 3ZMV A; 2ESH A; 2QCO A; 1XGS A; 4WF2 A; 4XKW A; 1ZEL A; 2EFQ A; 2E7X A; 3FXU A; 3AFH A; 1T08 B; 3Q0V A; 2VE9 A; 3F21 A; 3F0C A; 3R61 A; 3BR5 A; 3ZR8 X; 4V2G A; 4A5M A; 1WPK A; 3S17 J; 1Q1H A; 3FMS A; 4IEJ A; 2BY3 A; 3RCO A; 2LSO A; 3WGH A; 2KIQ A; 3F3X A; 1LDK B; 1U8B A; 1T56 A; 4HAM A; 1R1T A; 2MLK A; 4C2M J; 3ASN H; 2LY2 A; 3IC7 A; 3K9T A; 2E60 A; 2ZME B; 4FET A; 3DCF A; 2K27 A; 3WTW C; 1D1A A; 2WY8 Q; 3WE3 A; 4IXA A; 2QQ8 A; 1D1B A; 3L09 A; 3SYT A; 5GPC A; 3ZQL A; 3M7G A; 3HOU J; 4M3D A; 1X58 A; 4G9Y A; 2JRT A; 1VQM I; 2E7W A; 2PX9 A; 1KZH A; 2HXO A; 5K7F A; 3V8J A; 3FHZ A; 3DEU A; 2CUF A; 1QZZ A; 5CKT A; 4ESJ A; 2KQR A; 3LQR A; 2Y31 A; 4KIC A; 1KU2 A; 4O3M A; 2DDB A; 2OC6 A; 1FTZ A; 1MJB A; 2JWT A; 3VOE A; 3HUG B; 4BBR J; 1LB2 A; 3TBI A; 4AVP A; 4BHP A; 2XAG A; 5CJ9 A; 1D0X A; 1LJ9 A; 2VPL A; 3DKX A; 1LQ1 A; 3OYI A; 3JTG A; 1TT5 B; 2BHY A; 2A6H F; 3HOV J; 1T95 A; 4A6D A; 1WHU A; 5E20 A; 1FOY A; 3H9G A; 3H0D A; 3ROU A; 5CVV A; 1TL8 A; 1ULY A; 4HEA 2; 5GAD J; 2Y69 H; 2R7Q A; 2DFE A; 4XID A; 3O2P E; 4R1H A; 5J1Y A; 3JR9 A; 1ZYR F; 1FZP B; 4LMY A; 3O6B B; 4KNY A; 1HW2 A; 5E3N A; 3C2H A; 1K4T A; 5BNG A; 3KLO A; 4PUS A; 1P4A A; 4ESF A; 2WC2 A; 1EF4 A; 3K4C A; 3T1B A; 5ICG A; 1CGP A; 5KCM A; 1IRG A; 1V5G A; 3I56 I; 3VSL A; 4B8X A; 1O4X A; 3AL0 C; 1IN4 A; 5B3S H; 3HRM A; 2JPC A; 2O8X A; 5CLS A; 1APL C; 1VQK I; 1XG1 A; 4C3I J; 5ILV A; 2KJB A; 5BOX A; 3IRR A; 2KIS A; 1VI0 A; 1YJ9 I; 1S6L A; 1IAW A; 1X3U A; 1EA3 A; 1WJE A; 2KPM A; 2DBB A; 2V1N A; 5JHF A; 1DDN A; 2P5L C; 3KYD B; 2XKP A; 3LOC A; 3T8R A; 4OIQ F; 1HF0 A; 2O7O A; 3H3Z A; 1VQP I; 4FHT A; 3HHG A; 1Z3Y A; 1YO5 C; 2R3S A; 4HQM A; 3J80 Z; 3CO7 C; 2HVQ A; 3W2A A; 5J47 A; 1SFU A; 4MHG A; 1K6O A; 5FLX K; 2VJ4 A; 1MW7 A; 3CES A; 3CJQ B; 2EWN A; 1ETX A; 4AUX A; 2Z1D A; 2ZJQ F; 2M0M A; 3KP3 A; 2DPD A; 5D4R A; 4ZYH A; 4L9N A; 1JKQ C; 3GX4 X; 3JSP A; 2B63 J; 3K4M A; 4BYY A; 3WTV C; 1LEA A; 3G6E I; 3CO6 C; 2CQK A; 1ZK8 A; 1BN5 A; 2WAQ A; 3BRO A; 5EEG A; 1ZR4 A; 4E7K A; 3QOP A; 3CCE I; 1E17 A; 4GDF A; 4RGR A; 3GTM J; 2L5Q A; 1XC5 A; 3L9F A; 1YYV A; 2VT3 A; 1HOM A; 3Q0U A; 5GTH C; 2F5F A; 1PP8 F; 3A01 B; 4G7O F; 2OCC H; 4BNC A; 2ME6 A; 2XKO A; 3OIP A; 4UV8 A; 4XOR A; 3I55 I; 4A0X A; 3RPU A; 2VXD A; 2G7U A; 1F36 A; 4HQE A; 2CSO A; 5K5O A; 3OOU A; 2R93 J; 3LAJ A; 4NB5 A; 2MFZ A; 1U6G A; 5JLX A; 4M3G A; 3SJM A; 4BU2 A; 1IXS B; 4NQW A; 1GHC A; 2KKO A; 1MDM B; 4P96 A; 1BIA A; 2PMZ N; 4CYD A; 1F4K A; 3J7A O; 2IA2 A; 2LNB A; 1I1G A; 4BAY A; 4GYG A; 4CA0 A; 3LL7 A; 2CH0 A; 1WFX A; 3KYL A; 3ZQQ A; 3AKZ A; 3GTJ J; 3ERE D; 3D1N I; 5M5X J; 4UUV A; 1TQM A; 2EZK A; 2R7X A; 2KRF A; 3CCM I; 1P7I A; 2VBZ A; 2GOX B; 3KCC A; 4DBQ A; 3W3C A; 4I76 A; 2VQC A; 5E1Z B; 4MGR A; 2LYC A; 3VSK A; 3GFL A; 5LEK A; 1NG7 A; 4U0Y A; 4G7H F; 3K1P A; 5HLH A; 4WCG A; 2HR3 A; 4LG0 A; 4BE1 A; 1MBG A; 4JYK A; 3Q0W A; 4F93 B; 1T33 A; 5E8G A; 4C30 A; 3WG7 H; 2NOG A; 4J00 A; 1W4M A; 2WB1 N; 3U1D A; 2YS9 A; 4MFD A; 2TDX A; 3HKZ N; 1ZRF A; 2CQQ A; 3CJR B; 3BR0 A; 4LG3 A; 2DW4 A; 3GME A; 1XGN A; 3JRD A; 5E3L A; 1VQN I; 2HZT A; 5HDN A; 2RVC A; 1HLV A; 5L3C A; 1VQ5 I; 4BXX J; 2FBI A; 4Y3O A; 3BZC A; 1FOW A; 2H1K A; 3ASO H; 3LSJ A; 2MH9 A; 4DYQ A; 4FAS D; 1U5T B; 4XOP A; 2CQ7 A; 4XN3 A; 2E19 A; 3FXR A; 4IRI A; 3QPS A; 2CV1 A; 3N05 A; 1I50 J; 1FYM A; 1MMD A; 4PJL A; 6PAX A; 4C9Y A; 3GTQ J; 4ETS A; 3MEX A; 4L9J A; 5LGU A; 3QP5 A; 1ETV A; 3WTS C; 2KIF A; 2P7V B; 2Y0M A; 3KX2 A; 2HYG D; 3H1C A; 4HNT A; 3IH3 A; 3ISP A; 1DP7 P; 2GXA A; 2ZNY A; 4ENJ A; 3F72 A; 4M72 A; 1Z3X A; 1ON1 A; 2FBH A; 1XMX A; 3A4C A; 1Z6R A; 4HPQ A; 1TC3 C; 1XDU A; 1G6N A; 1KA8 A; 3CUQ B; 2DMQ A; 2ACJ A; 2DU9 A; 3OR1 C; 1VTN C; 4E70 A; 3DTE A; 4D9J A; 3OL4 A; 2XAF A; 2WAE A; 2ZSI B; 2F4I A; 5DM7 F; 1BOB A; 1FBQ A; 1RNL A; 3HPH A; 4BXF A; 1X2M A; 5HNF A; 3RZO J; 1V4R A; 3GFJ A; 4KN4 X; 4GCV A; 3BP8 A; 4DOZ A; 2E5N A; 5BMZ A; 2JQ7 A; 3LST A; 2DOA A; 1O57 A; 2F6C A; 2KHM A; 4DW6 A; 2CQN A; 2EV6 A; 4DYR A; 3OYM A; 1FP1 D; 2NXN B; 3P9I A; 4XIC A; 3CF5 F; 2F5V A; 1QGP A; 2OU2 A; 3UR3 C; 3DBL B; 1EJ9 A; 2Y0S A; 5FRM A; 3C18 A; 3CLO A; 3GTG J; 2F2E A; 3Q9V A; 3BG3 A; 2X85 A; 1Z7U A; 1ON2 A; 2VLA A; 3FIW A; 5L3E A; 1GUU A; 3H5N A; 4I2O A; 1PYV A; 1G3T A; 1IC8 A; 2JN6 A; 1OLT A; 3GXO A; 2BY2 A; 3EYY A; 1PUF A; 1AWC A; 2VQH A; 2HKX A; 1QO0 D; 1YJN I; 1P2F A; 1BI1 A; 3SEQ A; 1JUP A; 3CCL I; 4A0Z A; 4HF0 A; 1R4M B; 2EA2 A; 3K2A A; 3V8K A; 4A3D J; 1O7L A; 2V4J C; 4ZYD A; 3S3O A; 2CJJ A; 3CZ6 A; 3FWE A; 3KFW X; 3ZN0 A; 5DD8 A; 3U2R A; 2ZNZ A; 2JTV A; 3LSI A; 2HQN A; 1ITY A; 2Q8K A; 4ANJ A; 4C3J J; 2HGC A; 2V9P A; 1PDN C; 1O3T A; 4FE7 A; 3LAP A; 3VB2 A; 4RBO A; 2CFO A; 5CPR B; 1ONV A; 2XPW A; 2XAS A; 3F8N A; 2L2O A; 2CS3 A; 3GUD A; 1HKS A; 3OYN A; 4RDU A; 2HOT A; 3A03 A; 3PNV A; 2EZL A; 1MH3 A; 4RA2 A; 2V6E A; 1Y1W J; 1B8I A; 2HVS A; 3OYB A; 4XKC A; 1DPU A; 1R49 A; 3BTL A; 2WTE A; 1YW9 A; 1TWG J; 2JUC A; 5BS6 A; 2CO5 A; 1R58 A; 4KIT B; 4EJT A; 1IN6 A; 2DPU A; 1Y6I A; 1U5T C; 2VBX A; 4C2U A; 1IXR C; 2JA2 A; 2OZU A; 4KUM A; 3L2U A; 5HS8 A; 4OIO F; 2XF5 A; 5IT3 A; 1SAX A; 2XGC A; 2FSW A; 3PSF A; 4ZC3 A; 1FSH A; 1WQ2 A; 4Y17 A; 3IWF A; 4LIU A; 2JZY A; 2VBW A; 1UZC A; 3I4N J; 3K7A J; 2GOM A; 3LWF A; 1FYL A; 3D5L A; 4B48 A; 1W5T A; 5EG0 A; 1N78 A; 1E2X A; 4Q47 A; 3S14 J; 1BA5 A; 3B02 A; 3OYK A; 3ZQC A; 2KZV A; 4I0B A; 2V1D A; 3DWL E; 4ZZL A; 5FKN A; 3CUQ C; 1QVT A; 3IKV A; 5LGT A; 3L2V A; 2R7D A; 4E7H A; 3EET A; 4L9T A; 2JVH A; 4A12 A; 2O5R A; 2DA4 A; 4MTD A; 2PJR B; 3VYU B; 2K9Q A; 3WTZ A; 5FJ8 J; 2H09 A; 1XGM A; 1W36 D; 1OYW A; 1BR2 A; 3G1L A; 4A69 C; 2JPB A; 1DGW Y; 1R4N B; 1O3S A; 4Q4Z F; 2EH3 A; 3W2V A; 2W7N A; 2G0E A; 3S1R J; 4AYB N; 3EUH A; 3WTT C; 1BL0 A; 1DU0 A; 3KEY A; 4AU7 A; 5HVQ C; 1KQ0 A; 4W97 A; 1XPX A; 4YIR X; 2UZK A; 1NTC A; 5KAI C; 4IRG A; 3HOY J; 2ZFU A; 1NG6 A; 1SAN A; 4H0E A; 1ZRE A; 4Q5S F; 2E36 A; 5TGT A; 1XCB A; 3T0Y A; 3Q9S A; 2YSR A; 3IWZ A; 3M8J A; 4P9U A; 1X19 A; 1X3Z B; 1N25 A; 2FBK A; 2KLO A; 2MH2 A; 3K2Z A; 5LHG A; 3HYI A; 4CYC A; 2NVY J; 4CDG A; 3ABL H; 4DGW B; 2GIZ A; 2OBP A; 2Z3Y A; 2IAI A; 1VQ4 I; 3N97 A; 2L0K A; 1N75 A; 2V9V A; 3TP3 A; 4FT8 A; 3KEO A; 3R60 A; 5J4Y A; 3S1M J; 2XVC A; 2AQF A; 3I53 A; 4MO7 A; 3SEZ A; 4ESB A; 1H89 C; 2M8E A; 2K40 A; 5HS9 A; 2EBI A; 4JX4 A; 1BW6 A; 3TOA A; 4ZZD A; 1E0E A; 2ZC2 A; 4OIR F; 4RB1 A; 5C4J J; 3HHH A; 5ICC A; 2ZBK A; 2XRO A; 1SFX A; 2V79 A; 1MGT A; 2GQQ A; 4D7M A; 4X1E A; 2E1N A; 4NC7 A; 4M3B A; 4CSW A; 3QAH A; 1IF1 A; 1WWX A; 2FEZ A; 2FE3 A; 4A3M J; 4TV7 A; 1Z05 A; 3WU0 A; 5K7H A; 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