The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
49
|
structure length |
49
|
Chain Sequence |
GSSGSSGSCQYQDLLSNCDSLKNTAGCEHELLKEKCKATCLCESGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of RSGI RUH-032, a cystein-rich domain of CRISP-2 from human cDNA
rcsb |
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
Cysteine-rich secretory protein-2
|
| total genus |
5
|
| structure length |
49
|
| sequence length |
49
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Crisp domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1WVR A; 3MZ8 A; 2A05 A; 2GIZ A; 2EPF A; 2DDA A; 1XTA A; 1RC9 A; 1XX5 A; 2CQ7 A; 2DDB A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1S5L C; 1WJC A; 1GDT A; 5LD2 C; 4PSW A; 3O3K A; 2KDO A; 1YRN B; 4EM2 A; 1TWA J; 2L9R A; 1MSF C; 3C2B A; 1Z0X A; 2Y2Z A; 2QLZ A; 3GTM J; 2NXN B; 2V1U A; 4C3J J; 2HVS A; 3E5Q A; 3FBN B; 1R9T J; 3S1N J; 1UMQ A; 1X4P A; 4HPQ A; 2IGO A; 2M9H A; 1JJ8 C; 1YRN A; 3O6B B; 2XPW A; 3W6J B; 2HEO A; 3MD2 A; 3ZQC A; 3FZV A; 1TQM A; 1YW8 A; 2L7F P; 3NWS A; 3DEU A; 1T98 A; 2R7S A; 3GTJ J; 4D0P A; 4K2E A; 2GBY A; 3I59 B; 1ACI A; 1WJA A; 5C4J J; 2BVL A; 2ELH A; 2FXA A; 4DNC A; 1O7L A; 3DWL E; 1U5T C; 3L9F A; 3J81 Z; 1YHQ I; 2MC4 A; 3LFK A; 4QSH A; 3ZRG A; 3HC7 A; 3I59 A; 3MZ8 A; 4BEH B; 4UVC A; 4I2O A; 5FD5 A; 1MH4 A; 3K10 A; 2ZME B; 3RKW A; 3QOE A; 4NB5 A; 4NUB A; 4HQM A; 4C2T A; 1PVE A; 3JRC A; 5HDK A; 1AHD P; 4HRI A; 1K7A A; 1R1T A; 1BR2 A; 4BEH A; 2MSY A; 3BJO A; 2DW4 A; 4W1U A; 2ZME A; 5LGT A; 4UXN A; 4F55 A; 3W6V A; 3HHH A; 4LB6 B; 3RKQ A; 2VOP A; 2KIQ A; 2M1B A; 1R5H A; 2I10 A; 2FQ4 A; 4Q47 A; 2Y69 H; 1MBE A; 2D5V A; 1JT6 A; 3RIR A; 3GLL A; 3EUH A; 1FX7 A; 2LR8 A; 5FKK A; 3VOD A; 4ABZ A; 1JT0 A; 5FFZ A; 1YQA A; 4LK1 F; 2DJN A; 1Q1V A; 2WAQ A; 4ZC3 A; 4BE0 A; 1MNM C; 4M3E A; 3H3V K; 3PQJ A; 1OR7 C; 1I6X A; 1EF4 A; 1AU7 A; 1FIP A; 1MMA A; 2L2O A; 3ULQ B; 2COM A; 2NS0 A; 5IY5 H; 5C4X J; 3BQY A; 3EUK L; 1QZY A; 4KYW A; 5BOX A; 2XF6 A; 2OZU A; 2NRA C; 2HPI A; 2MGQ A; 3EQL F; 2RV8 A; 2YX4 A; 5LLQ A; 4IHW A; 4KIC A; 1YI2 I; 4C3I J; 3RDI A; 3BG9 A; 3OYB A; 4JP0 A; 4IKF A; 2XSJ C; 1FOX A; 2LY2 A; 2EFN A; 5B5E C; 1XX5 A; 2OZ6 A; 4OWR B; 3OR2 C; 3OY9 A; 1FP2 A; 1DDN A; 3HRT A; 1RUO A; 3LA2 A; 3ZGK A; 2KRF A; 1CF7 B; 3FXO A; 2HQN A; 4H4K C; 2XF5 A; 2TCT A; 4CCK A; 1I1G A; 3OMY A; 2AXT C; 3GYH X; 1LVK A; 1YIO A; 3NRV A; 4A6E A; 2JSC A; 2XRN A; 4IZZ A; 1VI0 A; 1QBJ A; 3TW6 A; 4C2M J; 4G7H F; 1CGP A; 2E1C A; 3S93 A; 3CF2 A; 4M6Y A; 3ONQ A; 3D5S C; 1XSX A; 2RRE A; 4LIT A; 1CF7 A; 5HLI A; 4PSX A; 3DBL B; 2KHM A; 2LMD A; 4JX6 A; 2CV2 A; 2I8D A; 2L9V A; 4HX8 A; 1XGN A; 3PNV A; 1XC5 A; 5D5X B; 3L2C A; 4OIQ F; 2QVO A; 1UCR A; 3WU2 C; 3V4G A; 3S16 J; 3R0A A; 3TDZ C; 2HXO A; 1JKR C; 1FTZ A; 2VT3 A; 3DLL F; 3LSP A; 3OOU A; 2YU3 A; 3N4M A; 4HV5 A; 3DFG A; 2LY9 A; 1W36 D; 3MKW B; 5EEA A; 2WAE A; 3DTI A; 3GBG A; 2HI3 A; 5TGT A; 1U9O A; 3G1M A; 1NTC A; 2MD0 A; 4J19 A; 2A68 F; 2JSP A; 2EV5 A; 2V9K A; 5FGM A; 3HYI A; 2OC6 A; 4KNY A; 1ZRD A; 2R7R A; 4ENN A; 1TZL A; 1Z3X A; 2ID6 A; 2LVS A; 1Z91 A; 3JRI A; 5BMZ A; 5DUK A; 1GXQ A; 4AYB N; 3L09 A; 3P9K A; 4ASN A; 4EGY A; 2CMP A; 1SAX A; 4ENM A; 1TP4 A; 1LJ9 A; 2HS5 A; 2E1M B; 2CV0 A; 1A04 A; 4D5F A; 1I6H J; 3F3X A; 1ETV A; 1O3R A; 4FE4 A; 3ZMT A; 3HPG A; 1YO5 C; 3T1B A; 3ZXS A; 1POG A; 1H89 C; 2GIZ A; 3COA C; 5GPC A; 3OS1 A; 3AL0 C; 2CQK A; 4XRS G; 4ZDO A; 2LF8 A; 2BHZ A; 3GXO A; 1VQ8 I; 3A0B C; 1Z6R A; 2JA6 J; 4A0Z A; 4A6D A; 3G3Z A; 3E5U A; 1UB9 A; 1UAA A; 1TBX A; 3DBH B; 3QPT A; 1B9M A; 4CA0 A; 2K5C A; 2CW0 F; 3K4K A; 2EH3 A; 4HX7 A; 4OAY A; 3TW7 A; 3K2Z A; 1B4A A; 1WI9 A; 2D1V A; 1XGO A; 1XGM A; 2OPT A; 4OU0 A; 2IP2 A; 4YFN F; 1F9N A; 2L9N A; 2HNH A; 2CWE A; 1QPM A; 1D1C A; 2XGX A; 3NWT A; 4RGU A; 3HOX J; 2VOD A; 2ZJ2 A; 2QZ8 A; 1W5S A; 2R7D A; 4W97 A; 2EA4 A; 3KP6 A; 1MZB A; 1XMA A; 4PDK A; 1XPX A; 2DMP A; 3PJR A; 1R4N B; 2LRE A; 3OYN A; 1SFO J; 1M1E B; 3E97 A; 3F0C A; 3RQ4 A; 4LOC A; 1R6R A; 5L3F A; 1X3U A; 2FML A; 3KP4 A; 5F0C A; 3I56 I; 2Q1Z B; 4KFC A; 4NHJ A; 4O6J A; 2H94 A; 1TL8 A; 2R7X A; 1LDD A; 5F27 A; 4B44 A; 5M5X J; 1KU3 A; 3T8R A; 2RVC A; 2EV0 A; 3OL3 A; 1PDN C; 4XID A; 3PO2 J; 3FXR A; 2R7V A; 2JZY A; 4AD9 A; 4G6D A; 3M9A A; 5DTD A; 1TT0 A; 2JUC A; 3CUQ C; 5D5V B; 3Q0V A; 2V6C A; 3E6C C; 4QPO A; 2HOA A; 4EAT A; 3C2H A; 4S04 A; 2CH0 A; 3LSM A; 4FQG A; 3MAJ A; 2A61 A; 3LSJ A; 4LLN A; 2KP6 A; 3PSI A; 2OJE D; 3GWZ A; 3MCZ A; 1YS7 A; 1WH5 A; 3V7R A; 3I4M J; 5FRM A; 4MHG A; 4DYQ A; 3HOT A; 2W82 A; 1FT9 A; 2XB5 A; 4RB0 A; 3GW2 A; 1R4M B; 4AC0 A; 4UY8 I; 3DBR B; 3LA7 A; 5HVQ C; 1UHW A; 5FLX Z; 1TQP A; 2ETH A; 1SFU A; 4CYD A; 4D1Q A; 1S72 I; 3MWM A; 3ZPL A; 1H9T A; 2OF7 A; 4N0B A; 2K9S A; 4UV8 A; 5LEK A; 1TT5 B; 1A36 A; 1MMS A; 5K1Y A; 2VJJ A; 4YII A; 5BNG A; 4HNV A; 4NQW B; 3WTU C; 5E1Z B; 2IS4 A; 2LKS A; 3OYG A; 3OYK A; 1EJ9 A; 2QCO A; 1OFC X; 2A6H F; 1J5Y A; 1EH6 A; 1U8B A; 4YFK F; 2X6W A; 2NS7 A; 5CKT A; 3VWB A; 2F5D A; 3TO9 A; 5DD8 A; 3JSO A; 3ZMZ A; 1ZG1 A; 4NQW A; 4LLL A; 5FB2 A; 1Y6I A; 2K9L A; 5EDN A; 3FIS A; 3A02 A; 3K9T A; 1G59 A; 1ETQ A; 1H88 C; 2HYF A; 2NYX A; 2FJ1 A; 4BJT A; 1Y0N A; 5DYM A; 1IUF A; 4P1W A; 5GAE J; 3CJR B; 5J4Y A; 2ZFW A; 2ZJQ F; 1S9H A; 5J40 A; 5DCM B; 2G0E A; 2ICW G; 4C2U A; 5KAI C; 5HLG A; 4BS9 A; 2H09 A; 4O3M A; 1OKR A; 2WV1 A; 4CCM A; 3JRE A; 1Y1W J; 1EH7 A; 2RDP A; 1RNL A; 2DT7 B; 5L3E A; 5DCM A; 2Q0O A; 2WY8 Q; 3F8B A; 3RSN A; 2FA5 A; 1IRF A; 2DK8 A; 4A5N A; 1FBQ A; 4M9Z A; 3E6B A; 3CF5 F; 1BI3 A; 3GX4 X; 3DP7 A; 1E3H A; 5JLW A; 3A03 A; 3HOW J; 2QQ9 A; 2IBD A; 3B6A A; 4UHT A; 1IF1 A; 3OYJ A; 1KU2 A; 2P0W A; 1FJL A; 2DI3 A; 2VQG A; 2B63 J; 1YS6 A; 1SMT A; 2KFD A; 3ZCO A; 1YE9 A; 3HJE A; 1Z21 A; 3BR0 A; 2F5C A; 2DOE A; 2V1X A; 2STW A; 1YJN I; 3L2V A; 2CO5 A; 2R7U A; 1O3S A; 3RYR A; 2DA4 A; 5B1B H; 3ZMV A; 2LP0 A; 2AO9 A; 3ESW B; 1R58 A; 1F1Z A; 2KRH A; 2Z9O A; 2KIS A; 3HPH A; 2FEZ A; 2HQ5 A; 4IQ4 A; 3AKZ A; 4JX4 A; 1U2W A; 4LJZ F; 4FAS D; 1UFM A; 2Y9Y A; 1ETW A; 1T95 A; 1SFE A; 2UWM A; 5L3C A; 5AIP A; 1YOV B; 5FFX A; 4ZZD A; 2VJI A; 4I0A A; 2IAI A; 2FD5 A; 3I4P A; 1A6Q A; 1K4S A; 1JTY A; 1S29 A; 3ERM A; 2K9M A; 2BY3 A; 2KIF A; 4CZC A; 4XOT A; 4OIP F; 2FOK A; 3FBI B; 1XMK A; 2K9Q A; 4C3H J; 1W36 C; 3PSF A; 3ZOB A; 2ISZ A; 4M9S A; 3AG2 H; 2H1L A; 3HOV J; 2K4J A; 3KYD B; 3S3O A; 3CDH A; 2EZL A; 4OIO F; 2IXS A; 1TNS A; 3H3U A; 4GYG A; 2V79 A; 3K4N A; 5FKO A; 2Y0S A; 5LBQ A; 2XIG A; 2LRD A; 3GFL A; 2YX7 A; 4EVI A; 1IC8 A; 4MEX F; 3WGG A; 2DN0 A; 4JQF A; 5IT9 K; 4BDY A; 4Y13 A; 2MW8 A; 5JHU A; 2IVM A; 2QGU A; 5L3G A; 1K83 J; 4OIR F; 1S7O A; 2DT5 A; 4HA8 A; 2L7K A; 3CJN A; 1JHF A; 4OAZ A; 4LMY A; 3IV5 A; 2YS9 A; 3U21 A; 4HNU A; 3PUB A; 1J59 A; 3K4B A; 3IAS 2; 1DGR M; 4BQN A; 1H0M A; 5HLH A; 3BWG A; 3HBL A; 4BAC A; 2QKM B; 2VKD A; 3BTC A; 2VUM J; 3UR3 C; 2VBY A; 3BTL A; 1MMN A; 4A3J J; 4H0E A; 4UV9 A; 5IP7 J; 3HEF A; 3N97 A; 2PLY A; 3DPT A; 3SJM A; 1R00 A; 4A69 C; 4KIF A; 3WTX C; 2VBX A; 3KEO A; 1S7A A; 4HBL A; 3LL7 A; 3BG6 A; 1WSU A; 1P7I A; 1PP8 F; 1TQI A; 3CDL A; 3I64 A; 3SFI A; 5JR3 A; 4YIR X; 1VFC A; 1RI7 A; 2DA6 A; 3KZZ A; 2EZK A; 3OOP A; 5CVU A; 2P81 A; 4JBA A; 3ZR8 X; 3CZ6 A; 2R5Z A; 3MFK A; 1EA3 A; 4QPQ A; 1SC7 A; 1YLF A; 2D1H A; 2DQL A; 4FT8 A; 1ZEL A; 1CQT A; 4KIB A; 5GAG J; 3SQN A; 4IHY A; 1YFH A; 2VOO A; 3FK7 A; 4M3G A; 1GV2 A; 3I54 A; 4MTE A; 3DKW A; 4KMF A; 2V1N A; 1IJW C; 4Y17 A; 2OBP A; 1JGS A; 1WJD A; 2EIM H; 3H92 A; 3H9J A; 3F6V A; 5DM6 F; 1IDZ A; 2OQR A; 1ENH A; 5ILS A; 4AM3 A; 5E20 A; 4BKX A; 1J9I A; 3GTG J; 4BQO A; 2JA7 J; 5E3L A; 1MBF A; 2EJR A; 1P9Q C; 2Z5U A; 2LLK A; 2M7B A; 5D5U B; 2PI0 A; 2K3P A; 3FF5 A; 4ZH4 F; 4DBR A; 2H8W A; 4BAY A; 2DMT A; 4L0Y B; 1V4R A; 2CFO A; 1FYM A; 2XRL A; 4I09 A; 5EEH A; 4AVZ A; 5HOO A; 1SMY F; 3HOU J; 4L9N A; 4KN7 X; 3BR1 A; 2JA8 J; 3I3L A; 3WE2 A; 3J81 K; 2HDD A; 4KJZ A; 2EFW A; 4NBQ A; 4CSW A; 5EGO B; 4Y33 A; 1F4K A; 3BLY A; 3GME A; 1GVD A; 5HS7 A; 1TW2 A; 2G7H A; 1ZRE A; 1P4W A; 3VYS B; 3NAU A; 3DEE A; 1Y0U A; 1USS A; 2Y30 A; 3VSL A; 4MFE A; 4Y4R A; 5F0F A; 3S2D J; 4L5J A; 1FBU A; 5EGO A; 2E1N A; 2O5R A; 4CHU A; 2KJB A; 4HDU A; 3JSP A; 3TED A; 4KIT B; 2E2I J; 2NAZ A; 3OIO A; 2DMN A; 3H1C A; 4YEJ A; 3S8P A; 3BZK A; 1FYK A; 1VZ0 A; 4II3 A; 1UG0 A; 1FZP B; 3FHN A; 3I71 A; 4HF2 A; 1HOM A; 1WKM A; 1KZH A; 3M1E A; 2ESN A; 5DCF A; 1RPW A; 4GGG A; 1N77 A; 1VQN I; 2WAD A; 2BXY A; 3HOY J; 3BTI A; 3J7A Y; 4MQV A; 2NNY A; 1A6I A; 3PIO F; 4RGX A; 3QU3 A; 1W1W E; 4IJA A; 2DA7 A; 3GZ6 A; 2XGD A; 2DFF A; 5BS6 A; 4F91 B; 3WU1 B; 4N9I A; 2JTV A; 3D5L A; 3J80 Z; 4ZYD A; 1NG6 A; 1D0X A; 2O03 A; 1EKE A; 4XRS A; 2VPR A; 1J0R A; 1HCR A; 1APL C; 1A31 A; 4RM3 A; 4L0Z B; 2GOM A; 2CRG A; 1IO2 A; 2VL8 A; 3Q9S A; 4L9T A; 3WG9 A; 5E3M A; 2VB6 A; 2PEX A; 1I3A A; 4GYI A; 4HW0 A; 5BQT A; 5B3S H; 5GP9 A; 5KAF C; 4EQQ A; 2DMU A; 2M0M A; 2XAG A; 2FNP A; 2VON A; 1GVJ A; 1K61 A; 4E7S A; 3S32 A; 1FY7 A; 3CP2 A; 4PZJ A; 5FRO A; 2E36 A; 1WPK A; 3IAM 2; 2MLG A; 3BR2 A; 1LDJ A; 2EWN A; 3T5X A; 4B8X A; 1D0Z A; 1X2M A; 2ESH A; 1WWX A; 4RGR A; 4A3D J; 2BXZ A; 4L9V A; 4DOZ A; 4FET A; 2DA1 A; 5H2F C; 1RKW A; 5K5R A; 3CUO A; 5J47 A; 3HUG B; 4ESB A; 1R71 A; 4N4O B; 1AOY A; 3S1Q J; 1ZGA A; 4I01 A; 3TDU C; 1XN7 A; 4LIU A; 2DU9 A; 2DDA A; 3K0L A; 3OYD A; 2LY1 A; 1N78 A; 2CSO A; 1MGT A; 2X51 A; 4G6T B; 1TTY A; 5EZG A; 1ITY A; 3C2G A; 3HUG A; 1OCC H; 1D5V A; 2M3A A; 2CGP A; 2M7A A; 2WB1 N; 2VC0 A; 2JRT A; 4WF2 A; 3KP3 A; 4QWQ A; 1HKQ A; 3BCB A; 3IWZ A; 3K2A A; 3E1S A; 1FC3 A; 4QIW N; 2VLA A; 1BA5 A; 2HZD A; 2O8X A; 2QEX I; 4F7Z A; 3G73 A; 1JGG A; 4A5M A; 1BW6 A; 3FKJ A; 1QHH D; 2JJ7 A; 2CW7 A; 4WCG A; 4E6K G; 4XMY A; 4HV6 A; 2EIL H; 3M8E A; 2BOL A; 2VIX A; 3KZY A; 3T0Y A; 2R7W A; 5GAH J; 4U7B A; 2R3S A; 4A0X A; 4BXF A; 5H6R A; 2X48 A; 1BI0 A; 4XKV A; 2WA0 A; 1OCO H; 3VYT B; 5E18 F; 1ZAR A; 3ZQG A; 3CCU I; 2IGK A; 3ABK H; 2BVM A; 3JW4 A; 3LNQ A; 1WZ2 A; 3F8N A; 2FRH A; 2BW3 B; 2XAJ A; 1XTA A; 1GHC A; 2DA3 A; 1BOB A; 1B1B A; 1A35 A; 3CLQ A; 4HQE A; 1D8J A; 2E2J J; 3M3Y J; 5B66 C; 1PJR A; 4XON A; 2XGC A; 3B73 A; 1SVL A; 1G3S A; 3OIP A; 5EEG A; 4ZDL A; 1T8I A; 1J2X A; 1D1B A; 3WHB A; 4M74 A; 3JRB A; 3JRF A; 3L7W A; 2BW3 A; 4RM2 A; 3PFY A; 3EET A; 1XDU A; 2BE5 F; 3FXK A; 3DLA A; 3E0J B; 4G94 A; 1MW7 A; 2OA4 A; 4IEJ A; 2FQ3 A; 2A69 F; 1S7E A; 2DAO A; 3MN2 A; 9ANT A; 3DU6 A; 3QRF F; 2MH2 A; 4XLH A; 3L2R A; 3F8M A; 4U0V A; 5FKL A; 3SYT A; 2DA5 A; 4B4C A; 3KEQ A; 3HG9 A; 4PGH A; 4FX0 A; 1Z7L A; 3X2Q H; 1JKP C; 2ELJ A; 1RET A; 3KCC A; 4JX5 A; 2F5F A; 3BQZ A; 2BEO A; 3DTE A; 1T38 A; 2LDU A; 4A2U A; 1XSD A; 1HDD C; 3WE3 A; 2XAH A; 2K40 A; 5DV5 A; 2H6B A; 3KE2 A; 5DM7 F; 4Y3O A; 2FNA A; 1HSJ A; 2PX9 A; 5ILU A; 2O61 A; 1Z7U A; 1MND A; 2BYV E; 5E1X A; 4GDF A; 2DFE A; 1HXD A; 4EM0 B; 4QLC U; 4HSR A; 1V5F A; 2WTE A; 5FLX K; 2LOO A; 1DP7 P; 1YX5 A; 5TRD A; 1ZYR F; 3MKY B; 3DXJ F; 4DW6 A; 3K70 D; 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