The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
85
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structure length |
85
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Chain Sequence |
GSSGSSGDREREQHKREEAIQNFKALLSDMVRSSDVSWSDTRRTLRKDHRWESGSLLEREEKEKLFNEHIEALTKKKRESGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the fourth FF domain of human transcription factor CA150
rcsb |
| molecule keywords |
Transcription elongation regulator 1
|
| molecule tags |
Transcription
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
18
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| structure length |
85
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| sequence length |
85
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01846 | FF | FF domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | FF domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KIQ A; 2KFD A; 1UZC A; 2KIS A; 2LKS A; 4FQG A; 2CQN A; 2DOD A; 2L9V A; 2E71 A; 2DOF A; 2B7E A; 2K85 A; 2JUC A; 2DOE A; 2KZG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2EIK H; 4NC6 A; 3S32 A; 2XHK A; 1JXS A; 4GRI A; 4IHS A; 2F2E A; 4CYC B; 3F23 A; 1ZAO A; 2Y75 A; 5L3B A; 3MEX A; 3BR0 A; 4LK1 F; 1KZH A; 2J5P A; 3LWF A; 3Q9V A; 3FXU A; 2DT6 A; 2IA2 A; 4ESF A; 1OCC H; 2BY2 A; 4PZJ A; 3BC8 A; 1Z1D A; 4RA2 A; 3OYJ A; 1R71 A; 1T38 A; 2HQR A; 1V4R A; 2FBK A; 1K6Y A; 5E3M A; 4KDP A; 3AG2 H; 2BXZ A; 2LLK A; 3CES A; 4BYY A; 1PUF A; 1S7O A; 1HST A; 5LEJ A; 3HJE A; 2DOE A; 3OWT A; 5FRM A; 4M3F A; 2XUB A; 1OQY A; 3LSJ A; 4J19 A; 2F5F A; 3I3L A; 1HC8 A; 3MKY B; 1I3A A; 2DFE A; 3BG5 A; 1I27 A; 3I64 A; 3WTY C; 3HRS A; 2JN6 A; 1DP3 A; 2RNG A; 4XLA A; 3W6K B; 2NVT J; 1FMW A; 2DTR A; 2BV6 A; 2WAF A; 3S2W A; 2QBY A; 3ZMT A; 1YIJ I; 5DD8 A; 4LIV A; 2HOT A; 1WZ2 A; 1Y1V J; 1HF0 A; 3E5U A; 1D5Y A; 1VQ5 I; 3ULQ B; 5EGO B; 3GEZ A; 3MVP A; 1HDP A; 3ZQG A; 3GTP J; 2DA2 A; 4XLF A; 4YII A; 1RES A; 3GTG J; 4GYI A; 5DEQ A; 3ZQH A; 2KZV A; 3PUF A; 1SMY F; 3LA3 A; 4WXH A; 3CC7 I; 2FE3 A; 2XPW A; 3J80 K; 3J7Y J; 2B9S A; 3HSR A; 1WJF A; 2Q0O A; 1BJA A; 2R7R A; 2HYJ A; 4AYB A; 1RR7 A; 1I1G A; 3L2C A; 4QIW N; 4RAY A; 2R5Y B; 2CW0 F; 5CQE A; 1FTZ A; 1LUJ B; 2VI6 A; 4JBA A; 2X1E A; 4CCO A; 4CCN A; 2RN7 A; 1K4S A; 2QUF A; 2F4O B; 3F0C A; 1QHG A; 3BTL A; 1ETQ A; 3CCE I; 2E5N A; 1P4W A; 2DAO A; 4N9I A; 3RKQ A; 4LFU A; 4PCQ A; 1GVJ A; 1XS9 A; 3ZOB A; 2KIQ A; 2DPD A; 4UXN A; 2ELH A; 4CCK A; 4QWQ A; 2M87 A; 1G2H A; 3EPZ A; 2OF7 A; 1EA3 A; 1QHH D; 2HXI A; 5IYB J; 1XGN A; 3MKW B; 2CW8 A; 2XB0 X; 1OCT C; 2D5V A; 3P9K A; 3QAH A; 2GZW A; 1MMS A; 3F8B A; 1STZ A; 2O8K A; 3I4N J; 4PJL A; 4BHB A; 4LG0 A; 2BY3 A; 2CQ7 A; 4M9Z A; 2O3F A; 2JRM A; 4E7K A; 4HZF A; 2GM4 A; 3HSE A; 3ISP A; 1BA5 A; 2W48 A; 1JKP C; 5FLV A; 1DDN A; 4FX0 A; 1X3U A; 1RIO H; 2EFN A; 3J7A O; 3SDG A; 5C44 J; 1G59 A; 4L9T A; 4R79 A; 1KGS A; 1TQI A; 3U21 A; 1G8X A; 2AHQ A; 2M8E A; 4NB5 A; 3BJ6 A; 1UFM A; 5LHH A; 2ZXJ A; 3FKJ A; 1RKT A; 4ENM A; 2LBF A; 4JP0 A; 1QPI A; 1I1S A; 3HTU A; 3BY6 A; 1FT9 A; 1ZN2 A; 1RC9 A; 5J6X A; 2V9V A; 2X6W A; 3CCR I; 2ACJ A; 4GGG A; 2A6T A; 4M6X A; 4LJZ F; 4XON A; 1LB2 A; 5JHU A; 1RNL A; 2JSP A; 5IPA A; 3I56 I; 1ZRE A; 3ABK H; 4N0B A; 4UUS B; 4RS8 A; 5FD5 A; 1PVE A; 4HF2 A; 3SZG A; 2M30 A; 2L7F P; 4P1W A; 4XL9 A; 2ADU A; 2HDW A; 2JA6 J; 4EEF G; 4UNO A; 4WXC A; 4XNF A; 4KT6 A; 5J1U A; 1GT0 C; 1NH3 A; 3F8N A; 1WHU A; 2I5U A; 1GXQ A; 2V1D A; 2F4I A; 2EV5 A; 4I2O A; 1OCZ H; 1IC8 A; 3I71 A; 3A01 B; 5IOZ A; 4RGU A; 4RB3 C; 3RKW A; 5K5Q A; 1GV5 A; 1VQ7 I; 5HOD A; 2E7W A; 3KEQ A; 5GTH C; 2EIM H; 1HXD A; 3HPH A; 1DU6 A; 3BTJ A; 3DU6 A; 2LFB A; 4D5F A; 3DBR B; 4H4K C; 4JX6 A; 2D1H A; 2ZME C; 1BJZ A; 1YIO A; 5B1A H; 3A4C A; 5EJC A; 3DQV C; 1SMT A; 4HLX A; 3WG7 H; 1ZRF A; 4BS9 A; 1NHA A; 1GDT A; 3QOE A; 2HYF A; 3FXK A; 3OL4 A; 4HSR A; 1SAU A; 4HA8 A; 4UB6 C; 3EET A; 4MGR A; 4XOP A; 3I58 A; 4ZDL A; 4HRI A; 4M9X A; 3K4N A; 3OR1 C; 3O6B B; 2L9R A; 3S1Q J; 2QA4 I; 1K6O A; 4EV0 A; 3JRE A; 2KIU A; 5IOY A; 3KCC A; 1D8J A; 5E3N A; 3S1N J; 4C2U A; 3SXY A; 2QVO A; 3OYL A; 2R7X A; 2DDA A; 5M5W J; 2KRH A; 2V9P A; 2HTS A; 1IRZ A; 3FMS A; 1UAA A; 3H3U A; 4II2 A; 3FHN A; 4Y33 A; 3RQ4 A; 2OA4 A; 3K4K A; 4A5N A; 4CSW A; 1OR7 C; 3ZGK A; 5J3L A; 1B59 A; 3K4M A; 1DGW Y; 2RC4 A; 2M9H A; 4CZZ A; 3HOU J; 3B02 A; 1MIJ A; 1VI0 A; 5M3M J; 2BOL A; 1U5T A; 1QVU A; 3F6V A; 1PUE E; 4L9V A; 1TTY A; 3SFI A; 4HQE A; 5E1X A; 4RB0 A; 2P7V B; 3DF8 A; 3U2R A; 4D1Q A; 2VC0 A; 3LNQ A; 3ECH A; 3KP6 A; 3NQO A; 4BAY A; 4KT5 C; 4CO8 A; 2WY8 Q; 2QCO A; 3MZY A; 1P7J A; 1TLH B; 3TGN A; 5H6R A; 1IF1 A; 1IN5 A; 3IH2 A; 3IRQ A; 3F8F A; 2LSO A; 4L9N A; 3TO6 A; 2L2O A; 4IHT A; 2PMZ N; 1KQ8 A; 1WRJ A; 3GTO J; 2NVU B; 4E7L A; 1R9T J; 1U9N A; 1KYZ A; 3BTI A; 2FJ1 A; 3JRA A; 2K9N A; 5CYV A; 1CGP A; 2LK2 A; 4I6Z A; 5DDG A; 5CVI A; 1A31 A; 4PSX A; 4M9S A; 3ESW B; 4FQG A; 4EQQ A; 2G7H A; 2HNH A; 1ZH5 A; 2QYO A; 1BI2 A; 1G3S A; 3LFU A; 3H0D A; 2M5W A; 2L02 A; 1D0Y A; 2GA1 A; 3L2V A; 2DFF A; 1Z21 A; 3DKW A; 1W5T A; 3TBI A; 5DM6 F; 2X48 A; 4NC8 A; 2QQB A; 2EZI A; 2Q2E B; 2JA7 J; 2CUF A; 1JTX A; 3JRH A; 3ASN H; 4CYC A; 1C0W A; 1IRG A; 3CCY A; 5AON A; 3DWL E; 3HOT A; 2STW A; 5IT9 K; 1HDD C; 4P9F A; 3OMY A; 4EJV A; 5B5E C; 5IP9 J; 3P9I A; 3E5X A; 4PJM A; 1NTC A; 2A61 A; 4MTD A; 3H36 A; 5LLQ A; 4HDU A; 4HNV A; 2R5Z B; 2FXA A; 3ZQI A; 1O3T A; 3JRF A; 5KAF C; 4PSW A; 5HLT A; 4DYC A; 3GFJ A; 4FT8 A; 2CO5 A; 1N75 A; 3K1M A; 2FQ4 A; 3ZQF A; 1JJ8 C; 4IRG A; 2IVM A; 4PJ0 C; 3D1N I; 5FKK A; 5JI6 A; 2AO9 A; 2F5C A; 1Y56 A; 2NRA C; 4LIT A; 2XV4 S; 4M3D A; 3VYS B; 1XGM A; 2VPR A; 5LHG A; 3MFK A; 2EA4 A; 3HYI A; 2M1B A; 2HDC A; 1ZHF A; 2DMQ A; 4G6D A; 3BRO A; 1LJ9 A; 3H5R A; 3FDY A; 4U0W A; 5TGT A; 4C3J J; 2JRT A; 4BBR J; 4RLF A; 2JVH A; 3V42 A; 2IA1 A; 3TO7 A; 2DXI A; 5DUK A; 3WU1 B; 2CH0 A; 4XRF A; 1W7P B; 1IXR C; 1EJ9 A; 2M7B A; 4B3A A; 4P55 A; 4UVC A; 4ANJ A; 2K02 A; 2ESN A; 1Z77 A; 4I02 A; 3F3X A; 2HWV A; 4IEJ A; 1X1C A; 2ISY A; 3Q9S A; 3QPL A; 3HRU A; 1LDK B; 4V2F A; 1ZRD A; 4D9J A; 1FBS A; 4RGS A; 4U7D A; 2ZSH B; 2X9D A; 3NAR A; 4LIU A; 2W4S A; 5F08 A; 1J2X A; 3PO3 J; 2NAZ A; 2YU3 A; 3LSH A; 3FZV A; 4A6D A; 3HOW J; 3KLN A; 4A0X A; 5EF6 A; 3CJQ B; 1RRJ A; 1OCP A; 2DPU A; 3V7C A; 3CCL I; 2L7K A; 5F64 A; 1L3L A; 2E60 A; 5E1W A; 4WX9 A; 4D7N A; 3BCB A; 3HOX J; 1F43 A; 4E7H A; 1UHW A; 3ZP5 A; 3H5N A; 4CUG A; 2BVM A; 4NDL A; 2EZL A; 3ZQ7 A; 1G3W A; 3ZQQ A; 4CYD A; 1WJC A; 3EQL F; 1Z7L A; 1EF4 A; 2V7F A; 2VBY A; 3E6C C; 4N9H A; 2HOA A; 1QPM A; 3L7W A; 1CF7 A; 3LSP A; 2IEK A; 1USS A; 5HS7 A; 2K85 A; 2VLA A; 2LY1 A; 1EKE A; 2EZK A; 2HU9 A; 2E35 A; 5EYR A; 4ZTJ A; 2LF8 A; 2P5L C; 2VQL A; 2LRD A; 2YU9 J; 4BUP A; 4LG0 B; 1VQP I; 1JUP A; 4B3X A; 1AWC A; 3REO A; 4UHT A; 2JUG A; 1GXP A; 3DPU A; 3HEF A; 2BHY A; 3HHG A; 4NBQ A; 4A3J J; 2EIN H; 2ZFU A; 3DFG A; 2BY0 A; 2V9K A; 3S2H J; 3LL7 A; 4UUS A; 1MW7 A; 4O5V A; 2PI0 A; 3KPH A; 4TV7 A; 3WHC A; 4HV5 A; 2NXN B; 1FBU A; 1TQP A; 2EJR A; 3M8F A; 5ICE A; 2O5R A; 2VXD A; 2LBF B; 2CJJ A; 4C2T A; 4GDF A; 2ZSI B; 3CDL A; 2OU2 A; 2E2H J; 3OOP A; 4X6A J; 5M3F J; 2Y2Z A; 4EJU A; 3JAM K; 3FIW A; 1JGS A; 2DJN A; 1IZ1 A; 2ZKZ A; 3BT9 A; 4CZC A; 1YO5 C; 1BW5 A; 4Q5S F; 3DKX A; 2HEO A; 4N4O B; 1X1D A; 1JKQ C; 2G7U A; 1KYW A; 4ZDP A; 1YS6 A; 5FKL A; 3OYF A; 4IHW A; 1SFO J; 3WTU C; 2RV8 A; 3OSG A; 1V55 H; 2CFO A; 2DFI A; 2KLO A; 4DYQ A; 4MIM A; 3JRG A; 4BEH B; 2DCE A; 1TNT A; 1A5J A; 4XKW A; 2M2E A; 3FM3 A; 5F1R A; 1G6N A; 2CS3 A; 2R0Q C; 1FTT A; 4LMY A; 3JCU C; 1Q1V A; 3HOY J; 2WBM A; 3GUD A; 4PK4 A; 2ECB A; 4DBQ A; 4R1H A; 4WWC A; 3CO7 C; 2NVQ J; 2FD5 A; 2Y48 A; 1GV2 A; 2P6T A; 1Z91 A; 1JGG A; 2DBB A; 1UZC A; 1K83 J; 5HLG A; 3CJN A; 4M74 A; 1WQ2 A; 2JA2 A; 3ERM A; 3J7Z I; 2H6C A; 3FK7 A; 3R0J A; 3KP5 A; 3FBI B; 2K9L A; 3OL3 A; 2MYS A; 1YIT I; 4GFB A; 2XF5 A; 5J1Y A; 2KDO A; 2EK5 A; 5EEH A; 3ABL H; 1K61 A; 1BIB A; 2Z33 A; 1VQ6 I; 1D1C A; 1Z67 A; 4BQQ A; 1AU7 A; 3MZ8 A; 2DO7 A; 4I0B A; 4WXD A; 3FMQ A; 2EFW A; 2VQG A; 1OYY A; 1TW2 A; 1S3J A; 3HUG B; 3IKT A; 5FFZ A; 2HZT A; 5LRS A; 1MSE C; 3C1D A; 1LDD A; 1BOB A; 2E71 A; 2LG4 A; 5BPI A; 4YFN F; 1ZQ3 P; 1WJB A; 2GIZ A; 5J8C A; 1CQT A; 2MD5 A; 5A2Q Z; 3AG1 H; 4AIH A; 1LQ1 A; 1A6I A; 4KIG A; 2WB1 A; 3MWM A; 3RZD J; 4HX8 A; 2JSC A; 3MCZ A; 1VFC A; 3M8E A; 1EH6 A; 2E5Z A; 1RZ4 A; 3CF2 A; 4GO1 A; 2CWE A; 4ZYG A; 1ZLK A; 5C4X J; 3EUK L; 3KE2 A; 1B8I B; 2IGN A; 2JVG A; 1YQA A; 2ME6 A; 2KQR A; 1EV7 A; 3H9Q A; 3OIQ A; 1TWH J; 3TOA A; 3G4S I; 1FYK A; 3MN2 A; 2MGQ A; 3DTK A; 4XOR A; 4RDU A; 1R36 A; 1SFK A; 2TCT A; 4I76 A; 1RR8 C; 4FE7 A; 1HA8 A; 4HEA 2; 2DK5 A; 2PBI A; 4OU0 A; 3K4L A; 3HBL A; 4XKC A; 1UB9 A; 1ZLJ A; 2I10 A; 4YEJ A; 1U78 A; 2GQQ A; 3K10 A; 3QPT A; 3A1Y A; 3L09 A; 3MKZ A; 3GLL A; 2HPM A; 4IKF A; 3JTG A; 1N78 A; 3FIS A; 4P9U A; 1ETK A; 1YW7 A; 2H8W A; 1Y8Q B; 5TRD A; 3SYT A; 2V6E A; 3M07 A; 1MBH A; 4A3E J; 2AS5 F; 2WAE A; 4L9J A; 5C3E J; 3WU0 A; 3JSP A; 3VB2 A; 3IHU A; 3QYE A; 3HM5 A; 3V8J A; 1U5T C; 1Z6T A; 2QQ8 A; 1YHQ I; 3S16 J; 3PFY A; 4YIF A; 1FP2 A; 2P5K A; 2QEN A; 1X4P A; 4Y3O A; 2AXL A; 3B6C A; 1FX7 A; 4GXO A; 1LKX A; 1O3Q A; 1FOW A; 4AUX A; 1TC3 C; 4U0V A; 1MND A; 1HW2 A; 4OMY A; 4JK1 X; 3HIF A; 5KAI C; 2EFO A; 5HS9 A; 4LLL A; 4KN7 X; 3WE2 A; 1D0X A; 4XBF A; 4BJ6 C; 2IXS A; 2VBZ A; 2JT1 A; 3GCM A; 2UUZ A; 4U7B A; 1Y39 A; 1O7L A; 1T95 A; 2VC1 A; 2R5Z A; 2ID6 A; 3ZMS A; 4RB2 C; 1X58 A; 1TT0 A; 2P7C B; 3UKG A; 3LMM A; 5C4J J; 2VKV A; 3KZZ A; 3Q0W A; 1Z3X A; 4Z2Y A; 4LLG F; 2FEZ A; 2H6B A; 3MZH A; 3LA7 A; 2UV1 A; 3L9F A; 4DZP A; 4ON0 A; 2KT0 A; 4HPQ A; 4M6V A; 1DGR M; 3T8T A; 3CO6 C; 3ONQ A; 4HBL A; 4MEX F; 2EFQ A; 2LTP A; 4EGY A; 3DXJ F; 2E2J J; 2CYY A; 1K79 A; 1ZTR A; 1JT0 A; 1X2M A; 3EYY A; 1FZP B; 2RNJ A; 5L3E A; 2KZG A; 1XCB A; 4LG3 A; 2JWT A; 1HBX G; 4AIK A; 2KRC A; 1IN7 A; 5D4S A; 2CUZ A; 4MFD A; 2CW7 A; 2CQX A; 4A3M J; 5KCM A; 2HKO A; 1U0J A; 1W7P A; 2QWW A; 5CVR A; 2OQG A; 1YW8 A; 5D8K B; 1XMX A; 4U87 A; 1IO2 A; 5E3O A; 3RDI A; 5D5W B; 3KP3 A; 4XLN F; 4AD9 A; 1U8B A; 3PIO F; 4A3G J; 2Y0S N; 1ITY A; 2DFH A; 4UUV A; 3CCM I; 3TW7 A; 3A03 A; 4XMY A; 1MMN A; 2HS5 A; 1FY7 A; 2EV0 A; 3OOU A; 5LGU A; 1F9N A; 3BWG A; 3J81 Z; 3CDH A; 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