The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
25
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sequence length |
79
|
structure length |
79
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Chain Sequence |
KIKNYQTAPFDSRFPNQNQTRNCWQNYLDFHRCEKAMTAKGGDVSVCEWYRRVYKSLCPISWVSTWDDRRAEGTFPGKI
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structures and physiological roles of 13 integral lipids of bovine heart cytochrome c oxidase
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Cytochrome c oxidase subunit 1
|
| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| total genus |
25
|
| structure length |
79
|
| sequence length |
79
|
| chains with identical sequence |
U
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-09-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| H | PF02297 | COX6B | Cytochrome oxidase c subunit VIb |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Cytochrome c oxidase, subunit VIb |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1OCR H; 3ABK H; 1V55 H; 2EIM H; 5B3S H; 3ASN H; 3ABM H; 5IY5 H; 2OCC H; 2Y69 H; 2DYS H; 1OCC H; 3X2Q H; 2EIL H; 2ZXW H; 2EIK H; 1V54 H; 2EIJ H; 5B1B H; 2DYR H; 3AG1 H; 3AG3 H; 3AG2 H; 2EIN H; 3ASO H; 3WG7 H; 3ABL H; 3AG4 H; 1OCO H; 5B1A H; 1OCZ H; #chains in the Genus database with same CATH topology 3M1C A; 2XAF A; 2X85 A; 3V42 A; 3ABM H; 3QOE A; 1GVJ A; 4PUS A; 3CCL I; 1F4K A; 2NAZ A; 1OMI A; 4N4O B; 2MLK A; 3SZG A; 4E7Z A; 3UR3 C; 3CO7 C; 3RSN A; 1ETX A; 3J7Z I; 4MQ9 F; 1K7A A; 1HF0 A; 3OYK A; 1U8R A; 2GXA A; 2HZD A; 2MSY A; 3ULQ B; 4RS8 A; 4L5I A; 1DDN A; 1KU2 A; 2Y2Z A; 5GPA A; 1HW2 A; 3S15 J; 3IWF A; 2CS3 A; 2EQR A; 3WGG A; 1UB9 A; 2VLA A; 1JTY A; 3BR6 A; 3MKW B; 2B7E A; 4HQM A; 1YJ9 I; 4E7S A; 4X6A J; 1O3Q A; 1KGS A; 4D7N A; 1HKT A; 3PUF A; 3VDX A; 1NTC A; 4DIQ A; 5JR3 A; 3WGI A; 1FSH A; 5M3F J; 1MMA A; 3KP3 A; 3OSF A; 2E71 A; 1XSV A; 2Y30 A; 2KIU A; 2UXN A; 4F92 B; 2IGM A; 1Y0U A; 3P5J A; 1Z6T A; 3TED A; 4KIT B; 5IP6 A; 2HWV A; 1PUF A; 4C3J J; 3WTX C; 3I56 I; 2WY8 Q; 1R49 A; 4CCL A; 2PMZ A; 2L4M A; 4RAF A; 5ICG A; 4KDP A; 3HOY J; 1N75 A; 1MBF A; 4M6Y A; 3HOU J; 3LA7 A; 4E4H A; 4PFP A; 3GEZ A; 1KON A; 3PIP F; 2ZJR F; 5ICE A; 2W7N A; 2IEK A; 1ZG1 A; 1XD7 A; 2P4W A; 4N4N B; 1B9M A; 2ZO4 A; 3MQ0 A; 4JP0 A; 2QKL B; 4QSH A; 1WJB A; 3OYC A; 1R5G A; 2XB5 A; 3QPL A; 2AXL A; 1Z1D A; 3DU5 A; 3R6S A; 4NHJ A; 1C0W A; 4BE1 A; 4XN0 A; 4IF4 A; 3FKI J; 2M87 A; 1R7J A; 2EV0 A; 4PCQ A; 2BXZ A; 1MSE C; 3LNQ A; 1D1B A; 2XF6 A; 3I64 A; 1S7A A; 2WY7 Q; 2Z99 A; 3F23 A; 3M3Y J; 1LE8 A; 2IP2 A; 3HKZ A; 4ZTF A; 4EV0 A; 3L9F A; 1V5E A; 4KIF A; 2H09 A; 2VKV A; 4Y7N J; 2N8G A; 3H5R A; 3JSO A; 3I3L A; 4AIJ A; 1YX3 A; 2Q2E A; 2PMH A; 2E36 A; 2LDU A; 2KFD A; 3CCM I; 2JK3 A; 3OS1 A; 3L2W A; 5F08 A; 5TGT A; 1MMG A; 5F0C A; 3DQV C; 2L7K A; 3F8C A; 2VBZ A; 4A0X A; 3QYF A; 4E7H A; 2GA2 A; 4ITV A; 2O0Y A; 3BPV A; 3BR5 A; 3MZY A; 4OIQ F; 3E6B A; 3HGG A; 1HA8 A; 2EFP A; 1IXC A; 1MBE A; 3I58 A; 1QVU A; 2DDB A; 2ZJ2 A; 2CYY A; 4Q47 A; 1SFO J; 3U1D A; 2VAS A; 4U0W A; 2MA3 A; 4WCG A; 4FCY A; 1ETK A; 4AID A; 1JKO C; 2QWW A; 1BBY A; 3CP2 A; 3SQN A; 1R36 A; 4MEX F; 2D2W A; 1MJ9 A; 2VXD A; 4G7O F; 3BZ6 A; 2OV7 A; 4ZJZ A; 1AA7 A; 2DI3 A; 3A0H C; 3OOP A; 5CVR A; 2FRH A; 6PAX A; 1JXS A; 3LSH A; 3F9K A; 4IHV A; 4HDU A; 2V9V A; 2Q1Z B; 3OYD A; 2D1H A; 3BR0 A; 2PJR B; 2E1M C; 2EB7 A; 2VOD A; 2XAH A; 2IRF G; 2UZK A; 4B1R A; 4CCK A; 5DD8 A; 1FZP B; 4R79 A; 1W36 D; 4HQE A; 1DPR A; 1K79 A; 3HDD A; 4DZP A; 1O3R A; 2DMU A; 1JI8 A; 4L0Y B; 1TBX A; 2CFO A; 4P1W A; 3BG9 A; 5J8C A; 2CQQ A; 4PFO A; 1RR7 A; 5M5W J; 2WV1 A; 1FTZ A; 4XRS G; 4IEJ A; 1WCM J; 5FKK A; 3BC8 A; 1RUO A; 1QVT A; 2XAQ A; 5ICF A; 2P7V B; 5JI6 A; 4WK8 F; 1G8X A; 3VSL A; 2IS4 A; 1TTY A; 1K83 J; 3IAS 2; 4ENM A; 1MBG A; 2R5Y B; 1GHC A; 3F22 A; 3F8B A; 3FM3 A; 5H6R A; 5HS8 A; 1W7P D; 2DMT A; 2GLO A; 2WC2 A; 3HOV J; 1E2X A; 3DEW A; 4GYG A; 4MGR A; 3VPR A; 3GTO J; 3QP5 A; 2BEO A; 2DOD A; 4BUP A; 4RM3 A; 3MCZ A; 1VQ6 I; 2GA1 A; 5DM7 F; 3LFU A; 1N78 A; 5JLX A; 5J1Y A; 2EBI A; 2VKE A; 5E3O A; 5BMZ A; 3K4N A; 2LSO A; 3D5L A; 3TO7 A; 3SZP A; 3IH2 A; 5FLX K; 3OY9 A; 1WI3 A; 1LVK A; 1UCR A; 2DN0 A; 2XKP A; 2R7T A; 2LTP A; 1EV7 A; 4LG0 B; 5KAI C; 1VQL I; 2LG4 A; 3VSK A; 4F91 B; 1X1A A; 2E2J J; 5J6X A; 1HC8 A; 1IDY A; 3BDD A; 2M7A A; 2O8X A; 4LGW A; 4CXF A; 2HTJ A; 1OCC H; 1ZGA A; 2O7O A; 2XDV A; 4CUG A; 4I6Z A; 2ZKZ A; 4CCJ A; 3BLY A; 1AHD P; 4KIS A; 2R5Z B; 2PLY A; 1K78 A; 1MBH A; 2FML A; 2MC3 A; 2F48 A; 5DS9 A; 1V3F A; 4XKB A; 3FIW A; 1FOX A; 1JKP C; 1N25 A; 1LKX A; 3QOD A; 2CQ7 A; 3LOC A; 5JHF A; 4A69 C; 5BS6 A; 2HFH A; 2I5U A; 1PJR A; 3JAM K; 4C2M J; 1BI1 A; 3CC7 I; 2XF7 A; 3OYL A; 1Z21 A; 4S0H B; 2XC7 A; 1BI3 A; 4XQF A; 2EIL H; 2GWR A; 4HX8 A; 3VYT B; 4LLL A; 1FNN A; 4IX7 A; 3CMA I; 4Q5S F; 5FB2 A; 3KP6 A; 1YTY A; 3GXO A; 3M4O J; 3IHU A; 2CV2 A; 1Z91 A; 1WH5 A; 1RZ4 A; 4MEY F; 4ZYD A; 2FBK A; 1EH8 A; 1Z3X A; 3SZT A; 2VC1 A; 3DFG A; 3J81 Z; 1VTN C; 2P81 A; 4O3M A; 3OWT A; 4F55 A; 4V19 K; 4NB5 A; 5E1Z B; 2TDX A; 3S32 A; 2XUB A; 5DD4 A; 4WXH A; 5C3E J; 4PSX A; 2DLL A; 3H9J A; 2PQ8 A; 4A0Z A; 3ERE D; 2YSR A; 4DBQ A; 1MD0 A; 5J40 A; 3KP2 A; 3MWM A; 1IRX A; 3H3Z A; 3WTY C; 2GXG A; 1R5H A; 4DBR A; 2IXS A; 4LJZ F; 2CGP A; 2VPR A; 4RB0 A; 2DFF A; 1U2W A; 2DOE A; 2FNP A; 5JHU A; 4PJN A; 2XVC A; 2R7W A; 5A2Q Z; 4RBO A; 2VQL A; 2QQA A; 3BPX A; 5AIP A; 4HNT A; 2G0E A; 1MW7 A; 1T33 A; 1ZGW A; 1HOM A; 3GUD A; 4C30 A; 1B8I B; 2BE5 F; 2EA4 A; 4NQW B; 1Z67 A; 4UUS B; 2K9N A; 4E7K A; 5IOZ A; 2P6T A; 1ETV A; 2A3S A; 2IPQ X; 4BY7 J; 5CJ9 A; 1YO5 C; 2ZSH B; 3LSK A; 5B1B H; 1WJ5 A; 3DPU A; 3JCU C; 4DYQ A; 4YFK F; 3OYB A; 3E5U A; 5ICC A; 3BJ6 A; 2L0K A; 2RV8 A; 3FZV A; 3FHN A; 5DDG A; 2E2H J; 3TL4 X; 1AU7 A; 2R7Q A; 4QPQ A; 2YS9 A; 5F0F A; 4XK4 A; 1LB2 A; 1U78 A; 2V6E A; 4BJ5 C; 4U7B A; 3E97 A; 4WWC A; 1OCZ H; 5C4X J; 3V8J A; 1JT0 A; 2Z5U A; 3BWG A; 1IN5 A; 1Q1V A; 2KKO A; 1Z7U A; 2QF7 A; 1GV2 A; 3Q5F A; 2WAQ A; 4EM1 A; 3SXY A; 3W6J B; 1R1T A; 5J8F A; 4BH9 A; 4J19 A; 2M30 A; 3HOW J; 1ZR4 A; 4NBQ A; 4BQA A; 1U8B A; 3BR3 A; 3CMY A; 3HTS B; 1MH4 A; 2JRT A; 4U0Y A; 1EJ9 A; 3RZO J; 1EKE A; 3K7A J; 4LD5 A; 4IRI A; 3CC2 I; 1JGG A; 4KA4 A; 4ZZL A; 5C44 J; 3ZN0 A; 3OYI A; 1J0R A; 4EM2 A; 3IV5 A; 2VC0 A; 3K10 A; 1G6N A; 2P5V A; 4RLF A; 1ZG3 A; 3H3U A; 5GAH J; 5FRO A; 5GPC A; 3EYI A; 4M3E A; 5EG0 A; 2XV4 S; 4P5O A; 1K4S A; 2FMY A; 1LDD A; 3DXJ F; 3GTG J; 1T98 A; 4A3I J; 1IV6 A; 1QHG A; 1Z0X A; 1ZGJ A; 4G6D A; 4IQ4 A; 3JRG A; 2Y75 A; 2ACJ A; 2LRD A; 3VOD A; 5IP7 J; 3AL0 B; 1IF1 A; 1VQ8 I; 2YPR A; 2XAS A; 5E18 F; 4TV7 A; 3WTU C; 3TP3 A; 4KIB A; 2KPM A; 3K70 D; 2Y31 A; 4IZZ A; 5DM6 F; 1T8I A; 2IGO A; 5LHH A; 3DWL E; 4XN3 A; 2MH9 A; 4HV5 A; 4Y3O A; 3NWT A; 4P96 A; 3RQI A; 1OCT C; 5F04 A; 2NS7 A; 1MMD A; 3DKW A; 2EIJ H; 2VBW A; 2IS6 A; 3E6D A; 2CUE A; 2R7V A; 1YIO A; 3WU2 C; 1WFX A; 2LKX A; 3GYH X; 3OIP A; 4A3B J; 3HPH A; 5L3G A; 2M34 A; 1G4D A; 2X9D A; 3CP8 A; 3CUQ C; 1OPC A; 1P9Q C; 1U5T C; 4BKX A; 4XKW A; 3GTK J; 1WH7 A; 1YFH A; 2DMN A; 1TW2 A; 4RLQ A; 4LIT A; 3W3C A; 5DEQ A; 3Q0V A; 2R93 J; 5FKN A; 1ZEL A; 3GCM A; 2D1V A; 3LFK A; 4YIF A; 3MZ8 A; 2UV1 A; 1VI0 A; 3A4C A; 3I5U A; 5LGU A; 4S04 A; 3GBG A; 1JHF A; 2JMW A; 2A07 F; 1LEA A; 3DKY A; 4AC0 A; 2QUF A; 3FHZ A; 1B72 B; 3CUQ A; 4LFU A; 5L3C A; 4LOC A; 4WX9 A; 2HXO A; 3DLA A; 4A12 A; 3LSP A; 5E17 F; 3ML6 A; 2HQ5 A; 4BAY A; 1S6L A; 1TP4 A; 3F8N A; 3BCA A; 3DTE A; 3I59 A; 1Z6R A; 1D0Y A; 4I76 A; 3H0D A; 1TWC J; 4C2T A; 2PBI A; 2V26 A; 4BHC A; 2M9H A; 3JTH A; 2BW3 B; 4AM3 A; 4O5V A; 3F21 A; 3S14 J; 1BL0 A; 4E6K G; 3A03 A; 2GOX B; 3T0Y A; 1QNT A; 3OYE A; 1BA5 A; 4M3D A; 1HSJ A; 5KAF C; 1OYI A; 1MGT A; 1SAU A; 3TW6 A; 5ILU A; 4IVN A; 2WB1 A; 4Y17 A; 2LBF B; 2XHK A; 1VQO I; 2O6G E; 3QRF F; 2NOJ B; 3CJN A; 1LEB A; 4ZDL A; 1ZRD A; 5H6Q A; 2LMD A; 4YII A; 4OIR F; 4M72 A; 5EYR A; 4Y13 A; 3PJR A; 3OIO A; 2HOS A; 5HVQ C; 2JWT A; 4AYB A; 1D5V A; 5EEH A; 5HDG A; 3V7C A; 5GAD J; 3IH4 A; 1FIP A; 3HXL A; 1UHS A; 2DW4 A; 2X0L A; 4BQO A; 5CLS A; 2AQF A; 3GFL A; 4KN7 X; 3QYE A; 4CCN A; 1BOB A; 4RA2 A; 1MDM B; 4ZTJ A; 1X1C A; 2RRE A; 1R6R A; 2JUG A; 2E34 A; 2FBI A; 2I10 A; 2ZC2 A; 1YIT I; 4IRH A; 1LFP A; 4HF0 A; 1MMS A; 3PNT A; 5BOX A; 3WG7 H; 2O8K A; 4BE0 A; 1VND A; 2DU9 A; 2Z3Y A; 2E1C A; 1IXR C; 3DV8 A; 2JQ7 A; 1ERD A; 2CSO A; 2OC6 A; 3FXM A; 3TO9 A; 1XTA A; 2X6W A; 2GAU A; 1Y1V J; 2PMZ N; 1TT0 A; 4EQQ A; 4HV6 A; 2BGC A; 3HSE A; 2L9S A; 4A6D A; 2HKX A; 3CCU I; 2M4K A; 1OIS A; 4XSX F; 2VB6 A; 1R58 A; 4N9H A; 3FK6 A; 2FBH A; 1NG6 A; 4RAG A; 2K27 A; 4G8X A; 3OL3 A; 3WE3 A; 1G3S A; 1TNS A; 2MW8 A; 3H35 A; 1HCR A; 1I27 A; 2PFB A; 2ZJQ F; 2V4J C; 1TWG J; 2DPD A; 1KYZ A; 4PJ0 C; 2VOP A; 1IN8 A; 2M2E A; 5CVJ A; 3K1M A; 2MD0 A; 3TDU C; 1YX5 A; 2V1D A; 3IRQ A; 1I6H J; 2BHZ A; 4UV8 A; 1GDT A; 1Z05 A; 4QLC U; 2DT6 A; 4MLO A; 4P9F A; 2KJC A; 2H8W A; 3BZK A; 1T38 A; 2KIM A; 3ZGK A; 1ZH5 A; 1MBJ A; 3TQN A; 2OTL I; 2QQ9 A; 4BEH B; 4ENN A; 1HQC A; 2GOM A; 2RGV A; 3K4L A; 2BY1 A; 5FFX A; 4D0P A; 2QGU A; 4AIK A; 2NRA C; 1BJA A; 4B47 A; 2RVC A; 2G9W A; 4F3Q A; 5EGO A; 3J80 K; 4RDU A; 1IRZ A; 3KEY A; 4IRG A; 1IZ1 A; 2XRN A; 4IHT A; 1LDJ A; 2EK5 A; 2VJI A; 1J59 A; 1M1E B; 4UUV A; 3KZI C; 5ILS A; 2EIM H; 3PFI A; 1PUE E; 4U87 A; 2HOE A; 3E6M A; 4HEA 2; 3R0J A; 3R0A A; 3SHF A; 4OAZ A; 3BG6 A; 4BE2 A; 4JOM A; 1Y6I A; 4Q48 A; 2EV5 A; 3HSR A; 4ON0 A; 2R7O A; 2DT5 A; 3AAF A; 1PVE A; 4OAY A; 1IRG A; 2K4B A; 1FYK A; 4EJT A; 2CMP A; 3GTL J; 1FSE A; 1J75 A; 4DGW B; 3ZMU A; 4GFB A; 2OBP A; 2DMQ A; 2KRH A; 4AVZ A; 3ABL H; 4NC6 A; 2HEO A; 1K6O A; 1XSD A; 2CV1 A; 3PM1 A; 3GFI A; 4XIC A; 4YEJ A; 3G1M A; 2HTS A; 3J7A Y; 1I1S A; 2X51 A; 4XL9 A; 4D5F A; 1VF9 A; 5E3M A; 3IAM 2; 3J7A O; 1TWH J; 5E3L A; 2MAB A; 5DCM A; 3BG5 A; 2RKH A; 5FRN A; 3QU3 A; 3IL2 A; 3DLL F; 1APL C; 3ZPL A; 2W84 A; 2A5W A; 2A05 A; 4OMY A; 1ETY A; 1W0U A; 1SD7 A; 3KEQ A; 5E20 A; 5D6E A; 4UUT A; 1WRJ A; 1SC7 A; 4S05 A; 1W7P B; 2EZH A; 3MD2 A; 2V79 A; 3CD6 I; 4NC7 A; 1UG0 A; 4CZC A; 4XRS A; 4BQN A; 4DW6 A; 2YX4 A; 2R4G A; 3HBL A; 3KYD B; 3Q0W A; 4BXF A; 3G6E I; 4LLG F; 4A3M J; 3F72 A; 3ZCO A; 4A5M A; 2X6O A; 4ETS A; 2ESN A; 1FPQ A; 4QIW N; 1O3T A; 2KZV A; 2EZI A; 4R1H A; 1MJB A; 2DAO A; 2DA3 A; 4CYC B; 4DYR A; 3F8F A; 3LSI A; 4WXC A; 4B44 A; 1YG2 A; 3CLO A; 5FD6 A; 4AUX A; 4ENJ A; 2H6B A; 1KA8 A; 3MKZ A; 3A01 A; 3GTM J; 3WTS C; 1SFK A; 4ZDP A; 3JRA A; 2R5Y A; 3OMY A; 3ZQH A; 3HUG B; 2XGE A; 4FX4 A; 1BI2 A; 1TL8 A; 1DUX C; 1K6Y A; 3ZMT A; 1GVD A; 3ABU A; 2Y69 H; 4UV9 A; 4KT6 A; 4UB8 C; 3I4N J; 1U6G A; 1BC7 C; 2JPB A; 1OLT A; 3RPU A; 1IN4 A; 3ZMZ A; 4XNF A; 2E1N A; 1FEX A; 1YQA A; 3RI4 A; 2XIG A; 4Y52 J; 2OTJ I; 3DPT A; 1WJC A; 2F5C A; 3ECO A; 2CW7 A; 3M1E A; 4HAM A; 1QRY A; 2RQQ A; 2QYO A; 2HU9 A; 5LEJ A; 4ESF A; 3K4K A; 4KYW A; 3RJP A; 1IN7 A; 2HKO A; 3JSP A; 3BY6 A; 5K7Z A; 3BCB A; 3HZJ A; 4I98 B; 1TQM A; 3I53 A; 1KYW A; 1L0O C; 3HB9 A; 4QWQ A; 2A6H F; 2V1N A; 2OCC H; 3FBI B; 1LDK B; 2Z33 A; 2XGX A; 3DEU A; 4UVC A; 2O9L A; 1VZ0 A; 4M3F A; 1ZRF A; 5D4S A; 1TNT A; 2GBY A; 3PSF A; 5FRM A; 5CVI A; 1VQM I; 2HNH A; 2ID6 A; 2EZL A; 3ASO H; 2EPF A; 1AKH B; 2P0W A; 2EWN A; 4LG3 A; 2R5Z A; 4A93 J; 3GTJ J; 1FP2 A; 5L3E A; 4M9Z A; 4EJW A; 5CQG A; 3ABK H; 2F5E A; 5FKM A; 3TW7 A; 2B63 J; 3GVA A; 2EV6 A; 2LC2 A; 1RKT A; 5J1R A; 1Z77 A; 2HDD A; 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