The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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sequence length |
217
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structure length |
217
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Chain Sequence |
TQRTFPGCTIRNTPSEPIHCIVWAKYLFNQLFGEEDADQEVSPDRADPEAAWEPTEAEARARASNEDGDIKRISTKEWAKSTGYDPVKLFTKLFKDDIRYLLTMDKLWRKRKPPVPLDWAEVQSQGEETNASDQQNEPQLGLKDQQVLDVKSYARLFSKSIETLRVHLAEKGDGAELIWDKDDPSAMDFVTSAANLRMHIFSMNMKSRFDIKSMAGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
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| publication title |
The intrinsic affinity between E2 and the Cys domain of E1 in ubiquitin-like modifications.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
SUMO-activating enzyme subunit 2
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| total genus |
62
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| structure length |
217
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| sequence length |
217
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| ec nomenclature |
ec
6.3.2.-: |
| pdb deposition date | 2007-05-14 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Ubiquitin activating enzymes (Uba3). Chain: B, domain 2 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1TT5 B; 3DBL B; 3DBR B; 3GZN B; 2PX9 A; 1YOV B; 3KYD B; 2NVU B; 1R4N B; 1R4M B; 1Y8R B; 3KYC B; 3DBH B; 1Y8Q B; #chains in the Genus database with same CATH topology 3ERM A; 1POG A; 3HGG A; 5FRM A; 3BOQ A; 2EZL A; 2YU9 J; 4ETS A; 3NEU A; 3E6D A; 3K6G A; 2QBY B; 2BVM A; 2HFH A; 2DI3 A; 1KU2 A; 2ZCW A; 3H3V K; 3VB2 A; 5EYR A; 3LMM A; 3PSI A; 4Q5S F; 3VYT B; 3D5S C; 3KP4 A; 2Y9Z A; 5F08 A; 2CYY A; 4G6Q A; 1A5J A; 2K27 A; 2K4J A; 3RPU D; 2EV6 A; 4X1E A; 2GIV A; 1O3Q A; 2WAQ A; 4ZDP A; 2M3A A; 4A69 C; 2EK5 A; 1MND A; 3C2H A; 2GAU A; 4LIU A; 3OSF A; 1VTN C; 4LLG F; 3AG1 H; 3OYN A; 1XB4 A; 1WJ5 A; 2H8W A; 3H3U A; 1D5V A; 2RN7 A; 3BT9 A; 2DCE A; 3OIP A; 4CCL A; 1U5T B; 4LK1 F; 1BBY A; 4BHC A; 4CA0 A; 4E6K G; 2LFB A; 1O57 A; 3BPV A; 4FX4 A; 2FD5 A; 3KLN A; 4U7B A; 2J5P A; 2PFB A; 4RB0 A; 4A5N A; 2L9V A; 2CRG A; 3CJN A; 4M3B A; 2R5Y B; 1ZH5 A; 2EIK H; 3BZ6 A; 1AU7 A; 4MQ9 F; 1LB2 A; 3JTG A; 3ABK H; 3PQJ A; 3FMQ A; 1ZN2 A; 4HX8 A; 2KLO A; 3W3C A; 3E7L A; 5E3L A; 3S8P A; 4BHP A; 5E18 F; 3CUQ B; 3OY9 A; 3HOT A; 2ME6 A; 1TP4 A; 1Z21 A; 3TP0 A; 2L9N A; 2Z99 A; 2K7L A; 2ZXH A; 1ODD A; 2DOA A; 3FDY A; 4HX4 A; 4IQ4 A; 2CQ7 A; 1MD0 A; 5CQG A; 1ZAR A; 4JP0 A; 2A5Y B; 4A2U A; 4IKF A; 1XG1 A; 5AON A; 1J0R A; 3JR9 A; 3CCS I; 3GFL A; 4ZTJ A; 1MBE A; 1HBX G; 1UCR A; 2WB1 A; 2X4H A; 3BG7 A; 4ENK A; 2DA5 A; 5HDK A; 3WHC A; 3GLL A; 3BG6 A; 1YQA A; 3TOB A; 4QIW N; 3PSF A; 1B9M A; 1V5F A; 4YEJ A; 2F4O B; 3KEO A; 1QZZ A; 2R4G A; 4BGD A; 2L01 A; 1MBH A; 3IKT A; 1KU3 A; 2A68 F; 3KP2 A; 4LFU A; 1UB9 A; 5KHD A; 1IN5 A; 2GOM A; 2HXO A; 1O3T A; 1R7J A; 3CP8 A; 5EZG A; 3L2C A; 2NYX A; 2VJ5 A; 4XNF A; 2LF7 A; 2MG4 A; 4FQG A; 2L7F P; 2XB5 A; 1E3O C; 4IPA A; 1Y1V J; 1W0T A; 5HLT A; 3HIF A; 1N25 A; 2X1C A; 4PCQ A; 3KEY A; 4A6E A; 1YRN A; 2BY2 A; 4MHG A; 1HW5 A; 2VN2 A; 2EIJ H; 4HLY A; 4IRI A; 4HF1 A; 2KHM A; 3U21 A; 2W00 A; 5EEA A; 4EQQ A; 3PUF A; 4UUS B; 3FKJ A; 1MMG A; 2RKH A; 2MGQ A; 2CW8 A; 3OYI A; 2HOA A; 2H27 A; 1BR2 A; 1OCZ H; 2LY2 A; 1N75 A; 5J8C A; 1IUY A; 5JVG F; 4AVZ A; 1HST A; 5LGN A; 2HVS A; 1CGP A; 2NS8 A; 4LIV A; 5E20 A; 4A0X A; 2HVQ A; 3P9I A; 2D2W A; 1FIP A; 1OYI A; 1FP2 A; 1MSF C; 3W6K B; 5D5V B; 3CCV I; 1QGP A; 3CP2 A; 5KCM A; 4UY8 I; 5M3M J; 3S16 J; 1EH6 A; 3RKX A; 3REO A; 1LUJ B; 1SD5 A; 5DM7 F; 5FLX Z; 2ME0 A; 3WG7 H; 3KYL A; 5JLW A; 2MA3 A; 4HLX A; 4KNY A; 2O61 A; 3CDI A; 3U9G A; 3HSF A; 4JX4 A; 1T56 A; 2D1H A; 3HRM A; 4OAZ A; 2E2H J; 4EMS A; 2FA5 A; 4UVA A; 3S2D J; 1S29 A; 1AOY A; 4HYE A; 5E79 C; 2LKS A; 3EUK L; 2A3S A; 2L7M P; 2JSC A; 1J09 A; 5IYB J; 4WXH A; 5DUI A; 3ESW B; 2G0E A; 2QBY A; 2COB A; 3CDH A; 1IRG A; 5EG0 B; 2WAQ N; 4C3J J; 3W2W A; 2R92 J; 3GTG J; 1U3E M; 1T95 A; 1TNT A; 3V42 A; 4E7L A; 3I55 I; 3E6B A; 1MIJ A; 1ORK A; 2KP6 A; 1TNS A; 2R5Z A; 4E7I A; 3OYA A; 2V9P A; 1KON A; 1T33 A; 5M3F J; 1LDD A; 4XON A; 2XAG A; 2QZ8 A; 2HOT A; 4V19 K; 1U5T A; 1WQ2 A; 4A3M J; 2B63 J; 2R7X A; 4UVB A; 2NRA C; 1XMK A; 2JA2 A; 2V1N A; 2JPC A; 1Q1V A; 3TMO A; 3TO9 A; 2R5Y A; 2ZKZ A; 4ZZD A; 4CYC B; 2F5C A; 1IV8 A; 3FXL A; 3LAJ A; 1IW7 F; 1XD7 A; 1E3H A; 1LE8 B; 4L9J A; 1MGT A; 3CUQ A; 2NXN B; 1Q1H A; 1BL0 A; 1I1S A; 2DK8 A; 1PJR A; 1R9T J; 3QYE A; 1ON1 A; 2CQN A; 4LLN A; 4BEH B; 1V55 H; 1ETO A; 5DCM B; 1SFK A; 2QEX I; 3GW2 A; 1RRJ A; 2WB1 N; 3COA C; 2VQG A; 4ZYA A; 3S15 J; 1DGR M; 3FX3 A; 1SFE A; 2I10 A; 2XGD A; 1KYW A; 5C3E J; 1HSJ A; 4IHY A; 3L2U A; 2ID6 A; 4KIB A; 3L2V A; 3ZQG A; 1KGS A; 2MLG A; 2QEN A; 1D5Y A; 4KIS A; 2OV7 A; 3FBI B; 3IC7 A; 4CO8 A; 5F0F A; 3CCY A; 2I5U A; 3QYB A; 4LJZ F; 5FKL A; 1Z7U A; 3SYT A; 2EH3 A; 2W48 A; 2A6H F; 2FOW A; 2LY9 A; 1UHS A; 3E5X A; 2BYV E; 1YW8 A; 1BI2 A; 1QVU A; 3BZC A; 2A07 F; 2P8T A; 1FP1 D; 2DDB A; 2UV1 A; 2BBY A; 4QWQ A; 2K9Q A; 2ZME C; 4XK4 A; 2DTZ A; 2HQ5 A; 2JRT A; 2KFD A; 3EDP A; 5J4Y A; 1Z67 A; 3DV8 A; 1BW6 A; 1NH3 A; 4KN7 X; 3FIW A; 3RDI A; 4I02 A; 4D0P A; 4A3J J; 2CUJ A; 4EEF G; 3H36 A; 1G3T A; 2CJJ A; 5BOX A; 1ACI A; 4PK4 A; 1FOK A; 2VBX A; 2CGP A; 4UNO A; 1FX7 A; 1JGG A; 2LG4 A; 4HAM A; 3BC8 A; 5DS9 A; 3E0J B; 1R23 A; 4HV6 A; 1OCC H; 4HOB A; 1E2X A; 1BOB A; 4HQM A; 4ZTF A; 1MNE A; 4XRS G; 2IS6 A; 5F0C A; 3A0B C; 5ICE A; 2KRH A; 1AKH B; 4F55 A; 1IZ1 A; 4E7S A; 3G1O A; 1G2H A; 1XC5 A; 2R7F A; 1X3W B; 5CJ9 A; 2CUE A; 4M3G A; 2H1L A; 3KX2 A; 4S04 A; 1W7P B; 2Q0O A; 2F48 A; 3OYB A; 2R7R A; 3DPL C; 4L5I A; 1G3Y A; 1IV6 A; 1XSD A; 3ZQC A; 1Y6I A; 2M45 A; 4M9X A; 1MH4 A; 2P6S A; 2Y30 A; 2OCE A; 3I5U A; 3MVP A; 1S6L A; 2ESN A; 4IX7 A; 2ZSH B; 3QPT A; 1U5T C; 1WH5 A; 4RB3 C; 3S3M A; 4EM2 A; 2QLZ A; 1R4M B; 5KAF C; 4XBF A; 2FNA A; 9ANT A; 1P7J A; 1FMW A; 2E5N A; 1APL C; 1OYY A; 2F5D A; 1R5I D; 5LRS A; 2PBI A; 2Y31 A; 2Z5U A; 1S7O A; 4AU7 A; 2A5W A; 1QNT A; 1SFO J; 2W84 A; 3JRF A; 4A3E J; 2FQ4 A; 2OC6 A; 4R79 A; 4LIT A; 3S1Q J; 1I6X A; 1A35 A; 4PJN A; 3CUQ C; 4EAT A; 5EG0 A; 1G3W A; 3PQK A; 1QZY A; 2V6C A; 5IP9 J; 2DYR H; 3WGH A; 4RDU A; 1R1U A; 2M0M A; 1QA6 A; 2JMW A; 3BJO A; 3K7A J; 1TWG J; 4C2M J; 3HYI A; 4HBL A; 4E7K A; 2KIS A; 1S7E A; 2CUZ A; 2XPW A; 3ASN H; 2ZNZ A; 1OR7 A; 4JQF A; 1LVK A; 2E1N A; 2IP2 A; 2Z1D A; 2ZXW H; 3WOD F; 3CME I; 2R7V A; 3LAP A; 3GFI A; 1QBJ A; 3HGY A; 4LK0 F; 1YFH A; 1A6I A; 5FKK A; 4KN4 X; 1IDZ A; 3OYE A; 2AXT C; 3HSR A; 1ZTR A; 1Y0U A; 4UB8 C; 4EM0 B; 3HOS A; 5FJ8 J; 2NOJ B; 4KA4 A; 4CYC A; 3S1N J; 2PMH A; 4UB6 C; 2EBI A; 4YRV A; 1D8K A; 2L54 A; 1ZQ3 P; 1BJA A; 3CCE I; 1RIO H; 3ZQI A; 2VOO A; 3J7A O; 3E1S A; 1LE8 A; 5KVR A; 3UR3 C; 4G8X A; 2BHY A; 5FKN A; 3JAM K; 1FNN A; 2OPT A; 3KZZ A; 3DFG A; 3HRS A; 4PJL A; 4EGZ A; 4CCJ A; 4BEH A; 3KLO A; 5DCM A; 2XPV A; 1WKM A; 4B09 A; 2GIZ A; 1RZ4 A; 5E17 F; 3TW6 A; 2D1V A; 3G1M A; 2VON A; 3BWG A; 4ENM A; 4PFP A; 1I3A A; 2EA4 A; 3OSG A; 3LFU A; 1HDP A; 3DWL E; 1W5T A; 3DPU A; 4J19 A; 3GTQ J; 5FRN A; 1U0J A; 2WY8 Q; 2DTR A; 5FD5 A; 3JW4 A; 5FLX K; 4ZJZ A; 5D5X B; 1X1A A; 5DUK A; 3IWF A; 1EA3 A; 4M74 A; 4IQJ A; 1RI7 A; 4I01 A; 5GAE J; 1HW1 A; 2FSW A; 2Z33 A; 2E2I J; 3DPT A; 2KRF A; 5L3C A; 1FMV A; 5C44 J; 2QVO A; 3FXQ A; 5KAI C; 4ZYD A; 2LNB A; 2LH9 A; 2K9M A; 2VC1 A; 4YIF A; 3OIQ A; 3T5X A; 3C7J A; 3HL2 A; 2O03 A; 5IOY A; 4XKB A; 1YX3 A; 3H1C A; 5DEQ A; 2L02 A; 3BTI A; 4MLO A; 2MH2 A; 2FE3 A; 4A5M A; 1MBJ A; 2KDO A; 2Y75 A; 3W2V A; 1MMN A; 4S05 A; 2DPU A; 3HKZ A; 2H09 A; 1L0O C; 5K1Y A; 3LSG A; 1KU9 A; 2AO9 A; 1H9T A; 5HS9 A; 2CW0 F; 2B9S A; 1MMS A; 4KT5 C; 3LA2 A; 1ETV A; 4DW6 A; 4RB2 C; 3OR1 C; 1TQM A; 1IN4 A; 1TWF J; 2FXA A; 3GME A; 4L9T A; 3PJR A; 2HS5 A; 4UV8 A; 3PO3 J; 2LKX A; 5EEG A; 2HU9 A; 3OL4 A; 2LR8 A; 5D6F A; 3GFM A; 2HNH A; 4B3A A; 2ADU A; 2GWR A; 3E5Q A; 3NWS A; 1AKH A; 1T2K A; 2CQK A; 2YS9 A; 2KIF A; 2ESH A; 1FBU A; 3H3Z A; 3VEP A; 1X2M A; 4DQ2 A; 4IHX A; 2QA4 I; 1MJ9 A; 4EJT A; 2F4M B; 4NC8 A; 1ZRE A; 3JCU C; 1OCT C; 1MJB A; 3BP8 A; 5CVR A; 2XKO A; 2TCT A; 3JRG A; 3EET A; 3I54 A; 4NDL A; 2QQA A; 1MBF A; 3IH2 A; 1VQ9 I; 2M87 A; 4XSX F; 2DA4 A; 1OR7 C; 4PJ0 C; 2AQF A; 2HWV A; 2M8G X; 5BMZ A; 1FOY A; 2WY7 Q; 3IKV A; 3WGG A; 4BHB A; 1R4N B; 4BE1 A; 5K5O A; 3HOW J; 5D6E A; 2LKP A; 1G4D A; 2LMD A; 2KZV A; 3LA7 A; 1UZC A; 5J40 A; 4G7H F; 2DOD A; 2XAJ A; 1LVA A; 2WAD A; 3S1R J; 3QP5 A; 3ZRG A; 4WXC A; 1OKR A; 2HDD A; 4S0H B; 2DPD A; 1DU6 A; 5KK1 A; 3I4N J; 3H5N A; 1SVM A; 1S8N A; 1TWA J; 2M7A A; 2X85 A; 4U87 A; 2A6E F; 4JX5 A; 3S2H J; 3CCU I; 2L3D A; 3I0T A; 3JRI A; 2ELH A; 1X4O A; 1VQ8 I; 3PM1 A; 1FLI A; 3VOD A; 1SAU A; 3RYR A; 2XF7 A; 4EGY A; 2V6E A; 3HOV J; 2CO5 A; 4BY1 J; 3OWT A; 1KZH A; 2P0W A; 4JX6 A; 2Y48 A; 2YX4 A; 2G9W A; 1F36 A; 5M5X J; 1R6R A; 2P7V B; 1SD7 A; 1R00 A; 1OCO H; 3MQ0 A; 2XPU A; 4GYG A; 2NVX J; 3BY6 A; 1XGM A; 3K0L A; 2BY0 A; 4A3F J; 5HNF A; 2OZU A; 3HG9 A; 5L3B A; 2VE8 A; 2VBZ A; 3ERE D; 3FHN A; 4FE7 A; 2ZXJ A; 5KNL A; 2QWW A; 4YFN F; 1R36 A; 2F5E A; 1Z05 A; 2V1D A; 4Y17 A; 4BJ5 C; 2VQH A; 4D5C A; 5D8L B; 5LHH A; 5K5R A; 2NVT J; 2A6T A; 4IXA A; 1M1E B; 4ENN A; 4XMY A; 1ZRC A; 4P9F A; 3HXL A; 1ZG5 A; 2B0L A; 5FKM A; 2L9S A; 5TIS C; 1LNW A; 1TW3 A; 2GQQ A; 3SFZ A; 3QU3 A; 4IHS A; 1PP8 F; 3WTV C; 3OOU A; 3HRU A; 5E8G A; 1X19 A; 3M8J A; 2Y69 H; 3CQZ J; 4IOC F; 1KA8 A; 2WTE A; 4EJW A; 1RPW A; 1P4X A; 1HDD C; 3K4K A; 3E3V A; 3VWB A; 3RSN A; 4C30 A; 5LEK A; 4A12 A; 3D5L A; 1P6R A; 3E5U A; 5JHU A; 4IL6 C; 3T1B A; 3O8H A; 3DKX A; 3K1M A; 3LQQ A; 4M71 A; 4A3G J; 1QVT A; 3Q9V A; 2OUM A; 1V3F A; 2A61 A; 5E3M A; 2VKH A; 1HLV A; 2VQC A; 1VQN I; 3QPS A; 5JFR A; 1KQ8 A; 2EFN A; 3HKZ N; 4IRG A; 5IT9 K; 2KJC A; 3FXR A; 4B47 A; 4GGG A; 5ICG A; 1P4A A; 2MH9 A; 1OQY A; 5L3E A; 5J8F A; 1FSE A; 1HKQ A; 2DW4 A; 1CQT A; 3ONQ A; 3HPG A; 3S93 A; 5JHF A; 4H4K C; 2OU2 A; 2BOL A; 5HNH A; 3V7R A; 1QHG A; 2CUF A; 1YHQ I; 4HF2 A; 3K10 A; 2FBK A; 1ETY A; 4LG3 A; 3WE2 A; 3ASO H; 2TRT A; 4G9Y A; 2WAE A; 5CVU A; 2KJB A; 1O3R A; 5AIP A; 4KMF A; 3P9C A; 2OQG A; 4KDP A; 3HTU A; 2X1D A; 4U7D A; 3BJA A; 2V9V A; 4DBQ A; 3JRB A; 1IN6 A; 4N4O B; 1LDK B; 1U78 A; 1JT6 A; 2PG4 A; 1YIT I; 3RKW A; 2R5Z B; 2LY1 A; 3K70 C; 5FKO A; 4FHT A; 3C2B A; 3EUH C; 3ZP5 A; 2CSO A; 2MYS A; 5HLH A; 3RKQ A; 2XRN A; 1KQ0 A; 1LDJ A; 4XIC A; 5GTI C; 5E8I A; 2LOO A; 2DFE A; 2ZB9 A; 4C2U A; 5J1U A; 2ZJ2 A; 4BXF A; 2VJ4 A; 3F8C A; 2DBB A; 1BJZ A; 1EJ9 A; 2XRL A; 4ON0 A; 2JSP A; 5JVT A; 1YTY A; 1W4M A; 3F6O A; 2WAF A; 4KFC A; 3GX4 X; 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