The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
82
|
structure length |
82
|
Chain Sequence |
GSSGSSGARERAIVPLEARMKQFKDMLLERGVSAFSTWEKELHKIVFDPRYLLLNPKERKQVFDQYVKTRAEEERRSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the first FF domain of human transcription factor CA150
rcsb |
| molecule tags |
Transcription
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
Transcription elongation regulator 1
|
| total genus |
20
|
| structure length |
82
|
| sequence length |
82
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01846 | FF | FF domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | FF domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KZG A; 2K85 A; 2DOF A; 2E71 A; 2DOE A; 2KFD A; 2CQN A; 2KIS A; 2LKS A; 2KIQ A; 2B7E A; 2JUC A; 2L9V A; 2DOD A; 1UZC A; 4FQG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1XSV A; 1Q1H A; 3ZQ7 A; 2IRF G; 1MDM B; 3OIQ A; 3WTX C; 1VI0 A; 1FT9 A; 4UUS B; 1TP4 A; 3TO6 A; 3BRO A; 1GDT A; 5CQG A; 2NYX A; 1YOV B; 3D5S C; 3TW7 A; 1LEB A; 3DKY A; 2G9W A; 1F43 A; 4RA2 A; 1EH7 A; 2GOM A; 3GTM J; 3OWT A; 2X6X A; 3CJT B; 2F5F A; 2BW3 A; 3JRA A; 5EEA A; 3I59 A; 4XR6 A; 2DI3 A; 4DOZ A; 3PIO F; 3Q9V A; 2K9L A; 2E5Z A; 3BQY A; 4L5I A; 2L7Z A; 3D1N I; 2DFI A; 2RN7 A; 3FXR A; 3SXY A; 5C44 J; 2HGC A; 3OYH A; 1LEA A; 4KMU X; 4A6E A; 4KIG A; 1KQ0 A; 4RAZ A; 4YRV A; 4ENK A; 5IYC J; 4OIQ F; 4JX6 A; 4A3K J; 2ZCW A; 2W4S A; 1AWC A; 1BIB A; 3WTV C; 2X6O A; 3CTA A; 3KE2 A; 4U88 A; 3UNG C; 4B09 A; 3F8F A; 1SFU A; 2OTJ I; 4JP0 A; 5FKO A; 1A36 A; 2Y31 A; 3C1D A; 5KVR A; 1R1T A; 1SVL A; 3BQZ A; 3ECH A; 5K7F A; 1BC7 C; 4HRI A; 3F9K A; 3CF5 F; 4QPQ A; 3U1D A; 2QGU A; 2RQQ A; 3KX2 A; 4GXO A; 1K79 A; 3GTP J; 1J2X A; 2V7F A; 3HHG A; 5M3F J; 4J00 A; 3GZ6 A; 5E8G A; 3ZQL A; 3HUG B; 2A6H F; 1IDY A; 1TQP A; 4CCK A; 4G7O F; 1MKM A; 3B6C A; 2WAQ A; 4AD9 A; 3WTU C; 1ZG1 A; 2CQX A; 4ZH4 F; 1VQL I; 1L3L A; 1MJA A; 2JA2 A; 4FX0 A; 4II3 A; 3RTR A; 2I5U A; 3KFW X; 1UG0 A; 2K9Q A; 3KEY A; 4XLC A; 2IGK A; 1RUO A; 4LK1 F; 4HF2 A; 3DEU A; 2VJ4 A; 3F6O A; 3NEU A; 1OLT A; 2BZT A; 2COB A; 5LBQ A; 5LEK A; 1IXS B; 5CVU A; 1GVJ A; 3HOW J; 2LY9 A; 3E6D A; 3K6G A; 5JLW A; 3ERE D; 3MZH A; 3IP4 B; 3L2Q A; 2A61 A; 4D9J A; 3A02 A; 3ABM H; 1Y56 A; 2B9S A; 1XX5 A; 2Q0O A; 1MBF A; 3BR6 A; 3OR2 C; 4CSW A; 5HDN A; 3VYS B; 4JX4 A; 3A01 A; 4RAG A; 4Q5S F; 3OMY A; 4CYD A; 1JUM A; 1GT0 C; 3OYJ A; 4PCQ A; 2E2H J; 2Q2E B; 2ISZ A; 3S14 J; 1ZHF A; 3R4K A; 4FX4 A; 2UV1 A; 3BTJ A; 3BJA A; 4A93 J; 3MMY B; 2XUB A; 5FD6 A; 2HWV A; 1EF4 A; 4XK4 A; 5J8C A; 3WTY C; 3HTS B; 3G1M A; 3HBL A; 5F1J A; 3IH2 A; 3HRS A; 3A0B C; 4RGU A; 3GW2 A; 1R7J A; 3JSO A; 1T6S A; 4FE4 A; 3COA C; 1VQ7 I; 2FMY A; 4HQM A; 4D5F A; 3LSR A; 4ZDP A; 4RM2 A; 2A5W A; 2LY1 A; 4KIB A; 4IX7 A; 3EYI A; 1G6N A; 2EB7 A; 2KRC A; 3ESW B; 1OYW A; 1NH3 A; 1Z05 A; 4A3L J; 3CZ6 A; 2R5Y A; 3OOU A; 4NDL A; 1HF0 A; 3GTQ J; 1D1A A; 2FML A; 1LE8 A; 4KFC A; 3K70 D; 2GIZ A; 2X0L A; 3CCL I; 2LYC A; 3GME A; 1ZGJ A; 2DMT A; 3VYT B; 1ZQ3 P; 2KJC A; 2VBZ A; 2DDA A; 5HS8 A; 1DUX C; 1KU3 A; 4MHG A; 3O2P E; 1Y1V J; 3M1C A; 2KL4 A; 1IUY A; 1UG2 A; 2K9S A; 4O3M A; 1VTN C; 3IL2 A; 2F5D A; 2WC2 A; 3LSK A; 2QSH X; 1YRN A; 2VC0 A; 3DKW A; 2M4K A; 4BQO A; 1TW2 A; 4OMY A; 2JRT A; 2R7V A; 2LKP A; 1VZ0 A; 4C3I J; 2CQ7 A; 1O3S A; 1VQ8 I; 3ASO H; 5C3E J; 3BC8 A; 2DAO A; 2XB0 X; 3PSF A; 1JT0 A; 3CUQ C; 1SMY F; 4CO8 A; 4QLC U; 3T8R A; 1HXD A; 3I64 A; 4KN7 X; 1E2X A; 1ON1 A; 3L9F A; 4J01 A; 2HDC A; 2O7O A; 4XKB A; 3FXO A; 1ZLK A; 1PP7 U; 1YJ9 I; 2RGV A; 2XRN A; 2H6C A; 3MCZ A; 1BR1 A; 3FXU A; 2V6C A; 2BVM A; 3V8L A; 1LB2 A; 4A3D J; 3E5X A; 3I71 A; 4PGH A; 2CW0 F; 1K4S A; 4BXF A; 5FD5 A; 1T38 A; 3K2A A; 2D45 A; 1JGS A; 1EA3 A; 2GQQ A; 4B3A A; 4CA0 A; 1YIO A; 1SC7 A; 3WU2 C; 1XGN A; 1R22 A; 3F21 A; 2DA5 A; 2WAQ N; 3HRT A; 3OIP A; 2H6B A; 1ZAR A; 1F5T A; 1UJ8 A; 4FIS A; 2PJR A; 3H9J A; 1H8A C; 1ENH A; 3MWM A; 2BGC A; 3GCM A; 2XAJ A; 3CCV I; 3CO7 C; 3WGH A; 3G3Z A; 4I2O A; 2MLG A; 5BPI A; 1X2M A; 4CCJ A; 1YJW I; 2V1X A; 1ZN2 A; 4M71 A; 4CXF A; 4ITV A; 1E17 A; 2NXN B; 1BI2 A; 3M8J A; 3V42 A; 3I4M J; 5IT3 A; 2W25 A; 2PEX A; 4EJU A; 4CCN A; 3S93 A; 4IHV A; 3J7A Y; 1N78 A; 4LLN A; 1YG2 A; 4IPA A; 4JQF A; 1SVO A; 3C2H A; 2QKM B; 4HBL A; 4IOA F; 2BEO A; 5LGT A; 1HBX G; 4IEJ A; 1MH3 A; 3GTO J; 2LFB A; 1D8J A; 2Y2Z A; 2ZXJ A; 1MMG A; 3NRV A; 3AKZ A; 3CP2 A; 5D8L B; 3TP3 A; 5L3D A; 2DFF A; 3BR1 A; 1HLV A; 2CFO A; 3IHU A; 3GX4 X; 2MGQ A; 2PLY A; 1TWC J; 2V26 A; 3HDD A; 4D7N A; 5IT9 Z; 4A3B J; 1A31 A; 2L0K A; 4LFU A; 4QTR A; 1B4A A; 1WJA A; 3VYU B; 1B72 A; 5CVI A; 3A1Y A; 4IJA A; 5J8F A; 1ZYR F; 1ZK8 A; 2P5L C; 2PN6 A; 1Y1W J; 3M8E A; 3H0D A; 1J5Y A; 1ZKG A; 2Z16 A; 4UVC A; 4PZJ A; 2BW3 B; 1QA6 A; 3I59 B; 2XGD A; 2HQ5 A; 4IF4 A; 5GPA A; 3W3C A; 2DYS H; 2DOF A; 2DLL A; 2XAQ A; 3HZJ A; 3JRE A; 4ON0 A; 1R23 A; 1O7L A; 2KIQ A; 3TBI A; 5M5Y J; 4KIF A; 1ZR4 A; 4AWX B; 4XQF A; 3W2V A; 2CUZ A; 4LIV A; 2AQE A; 2VKV A; 3JRI A; 3M8F A; 2HTJ A; 3JTG A; 2XAH A; 4HX4 A; 1NTC A; 5LEJ A; 5FLX K; 5GAE J; 5KAF C; 1JI8 A; 2O9L A; 4E4H A; 2ZXH A; 4M3G A; 1WH5 A; 4LB6 B; 3DP7 A; 1S8N A; 3AG2 H; 4L0Z B; 2L4M A; 4YFX F; 4M3D A; 2DOD A; 5L3G A; 3LST A; 2DXI A; 5HS9 A; 2VT3 A; 1R1V A; 1KZH A; 2MH2 A; 3P9K A; 5CVV A; 2DA2 A; 1R4N B; 2X4H A; 5FKM A; 1YIJ I; 1T0F C; 4XOP A; 1T2K A; 2ZSI B; 4KT5 C; 1O3Q A; 2M1B A; 3QAH A; 1SD4 A; 3U9G A; 2KPM A; 4V2G A; 3OYA A; 3OYD A; 1I3A A; 4H0E A; 2PMZ N; 2R92 J; 4M9X A; 1XTA A; 1S72 I; 2B0L A; 4I99 C; 4GGG A; 2MLK A; 5FFX A; 1ZG5 A; 4NBQ A; 3TL4 X; 5IP6 A; 2M4G A; 3RKW A; 1OYI A; 4D5C A; 1SAU A; 1HW5 A; 4RMN A; 4CCL A; 4AU7 A; 2JA8 J; 2KFD A; 2UZK A; 1FOK A; 2L7M P; 1FMV A; 2ESH A; 3U2R A; 4M6V A; 1W1W E; 1DDN A; 3PO2 J; 1OMI A; 3OYE A; 4RGX A; 4I02 A; 4WX9 A; 2QKL B; 4PSW A; 4UVB A; 1YQA A; 3T0Y A; 2P6S A; 1YS6 A; 2NS0 A; 2FX0 A; 1WJD A; 3D0S A; 3GF2 A; 1QHH D; 2DTZ A; 4Y4R A; 1UHW A; 5BMZ A; 2DPD A; 3FIS A; 1VFC A; 3TDU C; 4WWC A; 2FD5 A; 2UXX A; 1QQI A; 3VOD A; 1BIA A; 2JVH A; 2QSG X; 3KET A; 4JX5 A; 3MD2 A; 2EQR A; 3A01 B; 3BG5 A; 4ENM A; 4JYK A; 3IRQ A; 1ETW A; 4KIT B; 2R0Q C; 4HEA 2; 4ZC3 A; 4IL6 C; 2CW8 A; 3QOD A; 3MKY B; 3DEW A; 1JKO C; 2DFE A; 2Y75 A; 4Y7N J; 2KRF A; 5FRM A; 3GO5 A; 4WXH A; 2Z5U A; 3OYB A; 3DF8 A; 2JSP A; 1X19 A; 1JKP C; 1POG A; 1DGW Y; 1OCR H; 2HI3 A; 3BG7 A; 2IS6 A; 2ZNY A; 1LQ1 A; 2E19 A; 4L18 B; 2LBF A; 4GRI A; 1VQM I; 4FQG A; 2M2E A; 2IJL A; 4RB1 A; 1REP C; 4MQV A; 3ABU A; 4B44 A; 4HV6 A; 4DZJ A; 3HEF A; 2AXL A; 3KZY A; 2EIJ H; 1V5G A; 5DV5 A; 4ZZD A; 4RS8 A; 1SAX A; 3BR0 A; 3F6V A; 2MBF A; 2W1O A; 1RRJ A; 2R5Y B; 1R71 A; 2WAE A; 4HF1 A; 2A69 F; 2NVT J; 1R36 A; 3NAR A; 1LE8 B; 2QEN A; 4KJZ A; 2KDZ A; 1IG7 A; 2LVS A; 2B63 J; 3LQQ A; 1RZ4 A; 3FK7 A; 1JTX A; 2FA5 A; 4R8H A; 2EV0 A; 2HR3 A; 5E8I A; 3OYN A; 2HOA A; 4IO9 F; 1YRN B; 3TO7 A; 2XAS A; 3ZMV A; 2WY8 Q; 3MN2 A; 3VWB A; 1XN7 A; 3HG9 A; 2WV0 A; 1U3E M; 2YR2 A; 2BBY A; 3E6M A; 4DYR A; 1OPC A; 1ETX A; 2I8D A; 1O4X A; 2OZU A; 1OCP A; 4UNO A; 4Z6Y A; 3BZ6 A; 5LHG A; 1MMD A; 3CF2 A; 1RC9 A; 1MBJ A; 2FXA A; 2ZXI A; 2GA2 A; 2HZT A; 4G7Z F; 4UY8 I; 3MVP A; 4KT6 A; 1LNW A; 2QBY A; 4GCV A; 2O3F A; 2FE3 A; 1Z3Y A; 1MD0 A; 2E1O A; 1MZB A; 5M5X J; 4HV5 A; 2XF5 A; 3QWL A; 3J7Z I; 1S9H A; 3TED A; 3GTK J; 1U5T A; 1ZAO A; 3Q0W A; 3J80 K; 1YX3 A; 4BYY A; 3LFU A; 3BG9 A; 3MKZ A; 3NWT A; 2XF7 A; 3DBL B; 2ZO4 A; 2JA5 J; 3HB9 A; 3LMM A; 3HOV J; 4C2U A; 3ZMS A; 1XGO A; 4PJL A; 1K78 A; 1OJL A; 4YEL A; 1I6X A; 1MNE A; 2DU9 A; 4L9N A; 4UV8 A; 3VSK A; 1W0T A; 4E7Z A; 2PJR B; 4IXA A; 2JTV A; 3T5X A; 1IW7 F; 2A3S A; 2KRH A; 3SDG A; 3CLO A; 4BL0 B; 2HQN A; 1F4K A; 3SHF A; 4F91 B; 3FZV A; 1MMS A; 2J5O A; 1R00 A; 1TQM A; 2OQG A; 3EUH C; 2FJ1 A; 5GAD J; 1R5G A; 1U8B A; 1B9M A; 3T1B A; 2IPQ X; 5DYM A; 1MNM C; 2QQ9 A; 4CGZ A; 3J81 Z; 1YJN I; 1TC3 C; 3KP6 A; 1OIS A; 5GAG J; 5DCM A; 5FGM A; 2XIG A; 4UB8 C; 2VKE A; 4PJN A; 2CH0 A; 1TT5 B; 4OMZ A; 1TL8 A; 2QQ8 A; 3PM1 A; 1FMW A; 4B4C A; 3EDP A; 2KHM A; 1SD5 A; 3K1N A; 4N0B A; 1YX5 A; 4FCY A; 1Z6R A; 3RIR A; 1T33 A; 2R7Q A; 3OSF A; 3K0L A; 3ZXS A; 1X1A A; 1RES A; 3ABL H; 3HSR A; 2M7B A; 2DMN A; 3FKJ A; 3OY9 A; 3IKT A; 1TTY A; 1T56 A; 1K83 J; 4YG2 F; 3A2K A; 2XAG A; 2R7X A; 1X1D A; 2AQF A; 2HQR A; 1B72 B; 5ICC A; 5J4V A; 2IP2 A; 3FM3 A; 2KZG A; 1P9Q C; 4Q47 A; 5E17 F; 4ESF A; 3PNY A; 4W97 A; 2A07 F; 3WTZ A; 3T8T A; 5FJ8 J; 4MFE A; 1AKH A; 1E3H A; 5LHI A; 3S2H J; 5ICF A; 4HG2 A; 2BV6 A; 3W2A A; 2VL8 A; 2EFQ A; 4N9I A; 3DBH B; 1H9G A; 1Q1V A; 2K40 A; 4P9F A; 1YO5 C; 1ZH5 A; 3RQ4 A; 5D5U B; 4EMS A; 1Y0N A; 1ULY A; 1G3Y A; 4XKV A; 2P81 A; 2EPF A; 3X2Q H; 3WGI A; 4BAY A; 3S15 J; 1XGS A; 2TCT A; 2ZNZ A; 3FDY A; 3OS2 A; 2O61 A; 3I58 A; 4EM1 A; 2CMP A; 5EEH A; 2F4O B; 1VQN I; 2LTP A; 1XSD A; 3RKQ A; 2K5C A; 2VBW A; 1G3W A; 5CVJ A; 4HF0 A; 2OAZ A; 3JRC A; 4XNF A; 1ETQ A; 5J47 A; 2B7E A; 3GYH X; 3AG3 H; 3SFZ A; 4CZZ A; 4IRH A; 2VQH A; 4A5M A; 1LUJ B; 4PFP A; 1I3Q J; 2VPR A; 1FP1 D; 4I0A A; 3E5U A; 3DXJ F; 3HOZ J; 3QPT A; 4C2M J; 4A0X A; 3QOE A; 4JK1 X; 2XRO A; 3OR1 C; 3EUK L; 2J5P A; 3SEZ A; 5HVQ C; 3OSG A; 4EJW A; 3MFK A; 5AON A; 2RV8 A; 3CCS I; 4V19 K; 2XKP A; 3CCQ I; 1MMA A; 1KU2 A; 4E7I A; 1UMQ A; 2M87 A; 1BM9 A; 2VOD A; 3S3M A; 1FNN A; 1FBU A; 2IS2 A; 2KP6 A; 4GYI A; 2LKX A; 1FLI A; 2IS4 A; 2ZJ2 A; 1W7P D; 1P7I A; 5D6E A; 1BBY A; 2XVC A; 3BY6 A; 4A0Z A; 4BHC A; 3LSJ A; 4G6D A; 3ZMD A; 2F4M B; 1LVA A; 2Z99 A; 3I5U A; 4I6Z A; 2VON A; 1NHA A; 1FTT A; 1Y6I A; 2L9R A; 2W00 A; 4P1W A; 1SD6 A; 1TWF J; 3RYP A; 2DMP A; 4WCG A; 2NAZ A; 1S5L C; 4UB6 C; 5CJ9 A; 4K2E A; 3VYR B; 5HLH A; 2F48 A; 2M34 A; 4ABZ A; 2NVX J; 3G4S I; 4MEX F; 3LAP A; 5CPR B; 2L9N A; 1X2N A; 2LRD A; 3EYY A; 2O5R A; 3VDX A; 3AFH A; 2XGE A; 2K4B A; 1F36 A; 3D5L A; 4NNJ A; 1QO0 D; 4AYB N; 3L1P A; 3VFZ A; 2TDX A; 4XBF A; 2CWE A; 2PMU A; 3ZQG A; 1TQI A; 2LBF B; 3FXJ A; 1V5E A; 1VND A; 2M0M A; 1X3Z B; 3OOP A; 1VQ5 I; 5F6F A; 3H3Z A; 3MZ8 A; 3IV5 A; 1K6Y A; 4AIH A; 5B66 C; 1YHQ I; 4E7J A; 4U0W A; 2ZFW A; 4G8X A; 4XID A; 2LDU A; 2COM A; 2OZ6 A; 3C2G A; 1ACI A; 4LLL A; 5L3B A; 1JTY A; 4XN3 A; 2CU7 A; 3LSI A; 1ZGW A; 2YX7 A; 1Z7U A; 4EEF G; 1TW3 A; 3CC7 I; 2E1M C; 4RAF A; 5D8K B; 3CDL A; 4PUS A; 5H6R A; 3JRG A; 3BTC A; 3IRR A; 2TRT A; 2ZJQ F; 1KU7 A; 4I7H A; 5ICG A; 1W36 D; 1Z67 A; 1IN6 A; 1Z1D A; 1C0W A; 3HJE A; 5ILV A; 3G1L A; 3PQK A; 5DS9 A; 1TLH B; 5FKK A; 5AIP A; 1BL0 A; 2K7L A; 3FKI J; 4QSH A; 3NAU A; 1BI0 A; 1P7J A; 2X1D A; 3H36 A; 2HDW A; 4MO7 A; 4U0V A; 3ZQF A; 2QBY B; 2LD5 A; 2A5Y B; 2KIM A; 1BR2 A; 3WTT C; 2ADU A; 4B48 A; 2QYO A; 5LRR A; 4MQ9 F; 1U5T B; 3L09 A; 4UUT A; 3L2V A; 3ZMT A; 2LP0 A; 2E36 A; 2QZ8 A; 2R7F A; 4KDP A; 3HYI A; 2RVC A; 4BDY A; 3W2W A; 4KA4 A; 3C3W A; 4C3J J; 2PMH A; 2HYF A; 9ANT A; 1K78 B; 3VSL A; 5TIS C; 3H3U A; 4BAC A; 3BT9 A; 4IRI A; 3HHH A; 5L3F A; 1E3O C; 2CUJ A; 4F7Z A; 3FK6 A; 3R60 A; 5EDN A; 4LB5 A; 2R3S A; 3Q9S A; 3I9V 2; 1I5Z A; 2EZK A; 4OU0 A; 3CMA I; 4IOC F; 1CQT A; 2HVR A; 2FUG 2; 2LC2 A; 2FRH A; 5IP9 J; 1MBH A; 3KEO A; 1HW1 A; 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