The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
85
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structure length |
85
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Chain Sequence |
GSSGSSGDREREQHKREEAIQNFKALLSDMVRSSDVSWSDTRRTLRKDHRWESGSLLEREEKEKLFNEHIEALTKKKRESGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the fourth FF domain of human transcription factor CA150
rcsb |
| molecule tags |
Transcription
|
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
Transcription elongation regulator 1
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| total genus |
18
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| structure length |
85
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| sequence length |
85
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01846 | FF | FF domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | FF domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KZG A; 1UZC A; 2JUC A; 2CQN A; 2KFD A; 2E71 A; 2KIQ A; 2DOE A; 2LKS A; 2DOF A; 2L9V A; 2DOD A; 2B7E A; 2K85 A; 2KIS A; 4FQG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4C3I J; 2CW7 A; 2PMH A; 2K02 A; 2MC4 A; 4E7I A; 2VB6 A; 2VT3 A; 4AWX B; 4GCV A; 5ICC A; 5LEK A; 2JSP A; 5D5V B; 3CCQ I; 4ESB A; 3D5L A; 3VYU B; 1MBK A; 5M5W J; 1IXS B; 3OMY A; 2KDZ A; 2L2O A; 1D1B A; 2VJI A; 3J7Z I; 3KYL A; 3RJP A; 3J81 K; 4A3E J; 2EA4 A; 3QPT A; 4OAZ A; 1JJ8 C; 3HGG A; 3HTS B; 1H8A C; 5JFR A; 5B3S H; 1LNW A; 4Y13 A; 2DOF A; 5J1Y A; 1TW2 A; 4BS9 A; 2R93 J; 2STW A; 4BNC A; 4MFD A; 1GLN A; 1P7J A; 3IWZ A; 2KP6 A; 3D0S A; 4M3G A; 3KEY A; 4DJA A; 2L0K A; 2KJB A; 2R5Y B; 2K27 A; 4DYC A; 4NB5 A; 1G3S A; 3ERM A; 5M3M J; 4C2U A; 3HOV J; 4BJ6 C; 3AL0 C; 4WXH A; 1BOB A; 1UHM A; 2QQB A; 4RMN A; 3CJR B; 1IRF A; 3OV8 A; 1ZTR A; 2FQ3 A; 3RCO A; 3E97 A; 1B72 A; 1O3R A; 2X6Y A; 3K1P A; 3PFI A; 4HW0 A; 5FLX Z; 2KIQ A; 4G7Z F; 1MMG A; 3LSK A; 5H6Q A; 3GTM J; 3FMS A; 1NK2 P; 3FK7 A; 3ZQ7 A; 2DFI A; 1UG2 A; 1J7K A; 2KPM A; 2DA1 A; 4MHG A; 4C30 A; 2YR2 A; 2BY1 A; 3CDI A; 1JHF A; 3Q3S A; 4X0G A; 1K6O A; 1TNS A; 3IUO A; 1HA8 A; 3JTG A; 4AVP A; 4HPQ A; 3IHU A; 3U1K A; 4KT6 A; 4HYE A; 2X48 A; 1OCT C; 4XMY A; 4BJT A; 1F43 A; 2K9Q A; 1NG7 A; 3H36 A; 1ODD A; 4P9U A; 4NHJ A; 1YE9 A; 2HXO A; 4BAC A; 3PO3 J; 2Y0M A; 2V4J C; 3HOS A; 2E1N A; 4IRH A; 4G9Y A; 2FMY A; 4CIC A; 2DA2 A; 3CCR I; 3EUH A; 3WGH A; 3O8G A; 2ESN A; 2VKV A; 4XQF A; 2NS7 A; 2WY8 Q; 2QUF A; 2OF7 A; 3W3C A; 5E8G A; 2XGC A; 2P5V A; 1J5Y A; 1O4X A; 2COM A; 4E70 A; 1YLF A; 3Q0W A; 5EEG A; 3HPH A; 5LBQ A; 2DLL A; 1X58 A; 4NC7 A; 3GTL J; 2ID6 A; 4ZYE A; 1JKP C; 2EIM H; 2ID3 A; 5J47 A; 2HU9 A; 3W6J B; 4AYB N; 2IA2 A; 3BTL A; 5ERI A; 4BGD A; 3FBI B; 4F3Q A; 4P5O A; 2K9S A; 3M8J A; 2O6G E; 5FLX K; 3HDD A; 4MNU A; 3BTI A; 4MGR A; 1AKH B; 1NHA A; 3BR1 A; 5EZH A; 4ZH4 F; 2VKH A; 2GBY A; 5EZG A; 5GTH C; 2QA4 I; 1VQ8 I; 4IKF A; 2DJN A; 2HQR A; 3KP6 A; 1WSU A; 3KZI C; 3PUB A; 2GA2 A; 1K83 J; 2XRN A; 4Y17 A; 3HOZ J; 3W6K B; 3ZMD A; 4F91 B; 2XAQ A; 2VKE A; 1YIO A; 1Y0N A; 3ABM H; 3RQ4 A; 4H0E A; 4ZTJ A; 3S15 J; 5JLX A; 4FTH A; 5J8F A; 4CO8 A; 4I2O A; 2L7M P; 1V4R A; 1YG2 A; 3IKT A; 4A6E A; 2NVY J; 4F52 A; 2D45 A; 1UAA A; 3BJ6 A; 1N78 A; 3SJM A; 2NNN A; 3G1L A; 1FMV A; 1P4A A; 2HOE A; 4FAS D; 5FFZ A; 1BI2 A; 1O3Q A; 3NQO A; 1QHH D; 1RR7 A; 1P4X A; 3LFK A; 1T39 A; 4UVA A; 4NBQ A; 2LY2 A; 4IHS A; 3K7A J; 3HPG A; 2DQL A; 1Y39 A; 2L7K A; 4RGX A; 4BXX J; 2CV0 A; 2FEZ A; 3JRF A; 2GOX B; 3GBG A; 2XGD A; 3OIO A; 3M1E A; 1FLI A; 4HAM A; 4IZZ A; 3RTR A; 5CPR B; 5HS9 A; 3IC7 A; 1ZAR A; 2EZK A; 2Y75 A; 1KU3 A; 3MEX A; 3CCU I; 5K5R A; 1IXC A; 4L0Z B; 1S8N A; 2P6T A; 2JA6 J; 1DPU A; 1MD0 A; 1KQ0 A; 4P9F A; 4G6D A; 1JHH A; 4XSX F; 2E19 A; 3CDL A; 2FD5 A; 4IRI A; 2TDX A; 3BWG A; 4HG2 A; 4B3A A; 1YRN A; 3Q0V A; 4DYQ A; 2HXI A; 3VWB A; 2XRL A; 3V8J A; 3HL2 A; 1YFH A; 1IZ1 A; 3BTJ A; 3K0L A; 2V1U A; 1ZR4 A; 2XF6 A; 3OL4 A; 1LVK A; 4YG2 F; 3CCE I; 2IS1 A; 2J5O A; 1IV8 A; 3DXJ F; 2V6E A; 4BHB A; 1ZEL A; 5JI6 A; 5JVT A; 2L01 A; 2IAI A; 3O3K A; 1FOW A; 2IGO A; 1FIP A; 2DTR A; 3BG6 A; 1RZ4 A; 1H9G A; 2K40 A; 2E1C A; 1TQP A; 3RQI A; 1LVA A; 1POG A; 3FK6 A; 2VKD A; 1Z7U A; 4CYC A; 4CH7 A; 1OIS A; 2VQL A; 1B6A A; 4EJO A; 5FO5 A; 4OU0 A; 2LTP A; 3GLX A; 1FX7 A; 1AA7 A; 5BPD A; 2BYV E; 1ORK A; 1QQI A; 2KL4 A; 3FM3 A; 2NNY A; 1T38 A; 2FUG 2; 3FMR A; 4LG0 B; 5DUI A; 5BOX A; 1JKQ C; 4PJL A; 3I5U A; 4XLA A; 1UB9 A; 2RNJ A; 3BT9 A; 2JA5 J; 3DEW A; 5GAH J; 1WRJ A; 2EZL A; 4YII A; 4A3J J; 2DFF A; 3CC2 I; 5EEH A; 1XX5 A; 1RKW A; 4CCM A; 3OR1 C; 3TW7 A; 1WJE A; 3N97 A; 2E35 A; 5HDN A; 1IRZ A; 2DU9 A; 2ISY A; 2MH2 A; 3B02 A; 1GT0 C; 3GTK J; 4E7H A; 1P9Q C; 3PFY A; 4AYB A; 2LSO A; 1SFX A; 2QSH X; 5GTI C; 2KIS A; 4EJV A; 1JT0 A; 2CRG A; 1HKQ A; 3C7J A; 2CUZ A; 4BHC A; 2HYJ A; 1YHQ I; 4U0W A; 2CWE A; 4YEL A; 1CQT A; 1G3W A; 1UHW A; 3C18 A; 1HF0 A; 2JVG A; 2HDW A; 3L2R A; 4HX7 A; 3CD6 I; 2DOA A; 2H6C A; 3JCU C; 3MQ0 A; 1R22 A; 2CUF A; 3F9K A; 2KZV A; 1FYM A; 1WJ5 A; 1MDM A; 5J1U A; 2B63 J; 2ME0 A; 2CU7 A; 2QKL B; 3CP8 A; 1WCM J; 3BCB A; 3TL4 X; 1S7E A; 3FM5 A; 4XBF A; 1SAX A; 5IP6 A; 3SQN A; 4A3C J; 1IDZ A; 2E60 A; 3H3V K; 2DDA A; 3L00 A; 4P96 A; 1JGS A; 1QNT A; 5E1X A; 4LIV A; 3LSR A; 2K7L A; 3JRG A; 1U78 A; 3F22 A; 1JT6 A; 3WU1 B; 4F7Z A; 5E8I A; 4JK1 X; 1TWF J; 3FIW A; 4KMF A; 4V2F A; 2R7V A; 1YS6 A; 1ZG3 A; 1AKH A; 2R92 J; 2MH9 A; 3HUG B; 4HQM A; 2X4H A; 4LK0 F; 2W57 A; 5F64 A; 1ZGA A; 4RB0 A; 3O8H A; 4J19 A; 1D0Z A; 1G8X A; 2PG4 A; 2VJ5 A; 2DPU A; 2O8K A; 1EA3 A; 1TQM A; 3CMM A; 3H0D A; 2KT0 A; 4XLP F; 2GXB A; 4XRF A; 4OAY A; 1WH7 A; 1USS A; 1FMW A; 2RQQ A; 2X1D A; 2COB A; 4MTE A; 4BQQ A; 1FIA A; 2RQP A; 3HG9 A; 2FOW A; 2KIF A; 1A04 A; 2VXD A; 3S17 J; 2L9N A; 2IS2 A; 2QGU A; 1DGW Y; 3ZQL A; 2VAS A; 1A31 A; 5C44 J; 1UST A; 5IP7 J; 4PFO A; 3W2W A; 4IHT A; 4ZYD A; 2EFQ A; 3HXL A; 3KIO A; 1Z7L A; 1JTX A; 3WE2 A; 2VOO A; 1I5Z A; 1RET A; 3N4M A; 1TTY A; 1I6X A; 4L5J A; 1JXS A; 4AU7 A; 4M9S A; 2MC3 A; 4NNJ A; 5CKT A; 1WQ2 A; 2VBX A; 1U8B A; 5AIP A; 1HLV A; 1LEB A; 4XL9 A; 2JUC A; 4FE4 A; 2A69 F; 3BJO A; 1FWZ A; 2MW8 A; 5GAG J; 1BI1 A; 4FX0 A; 4MIM A; 3CCS I; 5IYB J; 3K2A A; 4I0B A; 4FCY A; 1NK3 P; 2IT0 A; 4TV7 A; 3OS1 A; 3A03 A; 5E3M A; 1YJW I; 2DAO A; 1X1B A; 2QF7 A; 3I4N J; 2E1M C; 3BG9 A; 3K69 A; 2ZSH B; 2LBF B; 3SFI A; 3T0Y A; 2UV1 A; 3MD2 A; 1PVE A; 2W00 A; 1XCV A; 3KP2 A; 2M8E A; 1MGT A; 3PIP F; 2ZBK A; 1U9N A; 1MND A; 3HOY J; 2BEO A; 3FIS A; 4BQN A; 3EYY A; 1U8R A; 2XV4 S; 3SFZ A; 2MLG A; 1Y56 A; 3DKX A; 2KHM A; 3A02 A; 4HA8 A; 5F0H A; 2F4O B; 5LGN A; 2LDU A; 3MN2 A; 2KMU A; 1V5F A; 2DT7 B; 4HX4 A; 5DYM A; 3BC8 A; 1UHS A; 1K79 A; 3R61 A; 3K4B A; 2BY2 A; 3ABL H; 2X9D A; 2XKO A; 5HOO A; 1YQA A; 1IG7 A; 1OPC A; 1YX5 A; 3QPS A; 1HSJ A; 2R7T A; 5FD6 A; 5B66 C; 2GM4 A; 1UG0 A; 1R49 A; 1WJB A; 5L3B A; 1LFB A; 3FDY A; 3LA7 A; 4DBQ A; 2H6B A; 3HKZ N; 4II2 A; 2F5C A; 2UXN A; 1R9T J; 1XDU A; 2P6S A; 2GOM A; 5L3G A; 4CCO A; 2HZT A; 4FX4 A; 1YIT I; 1E3P A; 1V3F A; 1T2K A; 4L5E A; 1FEX A; 4M71 A; 3F72 A; 4XON A; 2A68 F; 1O3T A; 2VON A; 5E1Z B; 2ZJ2 A; 4KIT B; 2ZNZ A; 1O7F A; 1MBJ A; 2JK3 A; 2V1X A; 3OYN A; 4PDK A; 4XLC A; 4EGY A; 2IP2 A; 4D9J A; 3OWT A; 3Q9V A; 2ECC A; 2A61 A; 4L9T A; 3S1N J; 2GAU A; 5D4R A; 2E5Z A; 3T1B A; 2X6W A; 3OYH A; 1VQ9 I; 1OCZ H; 2DTZ A; 3GXO A; 3TED A; 2V7F A; 5F04 A; 3WGI A; 4M6Y A; 4XKV A; 1SVL A; 2OD5 A; 2WB1 N; 3KP7 A; 3PIO F; 2XPV A; 2C6Y A; 4GFB A; 2R7U A; 4IHW A; 3CC4 I; 4V19 K; 2X1E A; 2LY9 A; 4XSZ F; 1ITY A; 3FF5 A; 4ZZL A; 3W2V A; 4FT8 A; 1P2F A; 5HNH A; 5E17 F; 2LLK A; 2B9S A; 3T5X A; 1WI9 A; 4Q4Z F; 1OKR A; 2V79 A; 4UVC A; 3LL7 A; 1ZRD A; 4RA2 A; 3LQR A; 3CF2 A; 1TBX A; 3RPU D; 2AXL A; 1TWA J; 1D0X A; 3OSG A; 3K6G A; 1W7P D; 2OPT A; 1V5E A; 2EB7 A; 3LMM A; 5FLM J; 2EV5 A; 3HHH A; 5CVJ A; 5LEJ A; 3DKY A; 4M3F A; 1BI3 A; 3KLN A; 3WTW C; 1CF7 B; 2FBK A; 4PFP A; 1Z0X A; 3GTQ J; 1VQ5 I; 3RKY A; 1XCB A; 3BZ6 A; 3GVA A; 3TMO A; 2GLO A; 1S7A A; 5FKK A; 1X2N A; 2FE3 A; 3S14 J; 2XB5 A; 5BPI A; 3NWT A; 1ETX A; 2ZME A; 4HDU A; 4U0Y A; 3VYS B; 1FC3 A; 3LA3 A; 5B1A H; 1VQM I; 1PUF B; 2HVQ A; 4IL6 C; 2VC1 A; 2LVS A; 1QA6 A; 4AIJ A; 4KIB A; 2OTJ I; 3M3Y J; 2JUG A; 3DP7 A; 3FHN A; 4AVZ A; 4MFE A; 4M9Z A; 3BCA A; 5ILS A; 1VQK I; 4N9I A; 1G4D A; 1ZLJ A; 2OQG A; 2V26 A; 1ZG5 A; 4CCL A; 3RSN A; 3T8R A; 2VE9 A; 2RV8 A; 5JHU A; 3BR5 A; 4HLX A; 4CCK A; 2R0Q C; 4WXC A; 1EJ9 A; 4M9X A; 2ESH A; 4C2T A; 3E0J B; 1H89 C; 2UZK A; 4IOA F; 2L9V A; 2JJ7 A; 1MSE C; 3KYC B; 3FXO A; 3K4C A; 5GAE J; 1A36 A; 3HKZ A; 1W5T A; 3TO6 A; 5L3F A; 1QU3 A; 1ETK A; 2HZD A; 2LRD A; 5EYR A; 2JA7 J; 4A5N A; 4IEJ A; 2FA5 A; 4JQF A; 3QQA A; 3RKX A; 3ISP A; 2KRH A; 4C3J J; 4B44 A; 1OCC H; 2EIJ H; 4O5V A; 3MCZ A; 1MW7 A; 3CUQ A; 1FY7 A; 3C1D A; 3ZMV A; 5IYC J; 4HF1 A; 2HI3 A; 1HXD A; 1MMN A; 1T08 B; 4P1W A; 3QP6 A; 3KP4 A; 5FFX A; 3M4O J; 3E5X A; 3HRS A; 3KX2 A; 1YW8 A; 2VPR A; 2XDV A; 1XSX A; 5DUK A; 1R1T A; 1UEL B; 2GXG A; 5H6R A; 4E7K A; 3C2G A; 5FRN A; 3AL0 B; 1D0Y A; 5F1J A; 4LG3 A; 2O3F A; 2EZH A; 3DPU A; 3ONQ A; 2WB1 A; 5H2F C; 4IF4 A; 1F36 A; 3RPQ A; 4UHT A; 3BTC A; 3GO5 A; 2PJR B; 4I99 C; 3G2B A; 3BG3 A; 3TO7 A; 3UR3 C; 3WHC A; 2HVS A; 3RPU A; 3G1O A; 4BEH B; 3RYP A; 3JSO A; 1U5T A; 3G3Z A; 4NDL A; 2B0L A; 5E79 C; 2L5Q A; 3T8T A; 5J40 A; 2R7O A; 1W7P A; 5M5Y J; 3OYM A; 3S3O A; 4N0B A; 4KN4 X; 4Y4R A; 4C3H J; 3GFL A; 2MSY A; 3QOP A; 1JKR C; 1P7I A; 4BUP A; 5GAD J; 4KDP A; 2ELH A; 3FKJ A; 1UMQ A; 3SZG A; 1R1V A; 3K70 C; 1Y8R B; 5IY5 H; 2P7V B; 2R4G A; 1VQL I; 2LK2 A; 2Z33 A; 3K4K A; 2I5U A; 4I01 A; 1TNT A; 3OOU A; 1Z6R A; 2ZXJ A; 1GVD A; 3CF5 F; 2NVX J; 3BR2 A; 1KQ8 A; 4IHX A; 3MKY B; 3FHZ A; 3GFI A; 2WAD A; 3FXJ A; 1IN6 A; 3I59 A; 3OSF A; 3Q9S A; 2ZXH A; 3LAP A; 4BBR J; 4R79 A; 3ZMT A; 1JUP A; 2KRC A; 3AG3 H; 4CDG A; 3QPL A; 1T6S A; 1VQ4 I; 3F3X A; 3MKL A; 2DBB A; 1LE8 B; 3TQN A; 1XGN A; 4KIG A; 4A5M A; 4QPQ A; 3I56 I; 3TBI A; 1XN7 A; 2EIL H; 3GTJ J; 2ZB9 A; 2QBY A; 2HTS A; 1X1C A; 3ZMZ A; 2MD5 A; 2ZXI A; 2ZKZ A; 2HR3 A; 4W97 A; 4WCG A; 1HDP A; 1LJ9 A; 2PMU A; 2EK5 A; 2V9P A; 2IS6 A; 2R7F A; 4L9V A; 4AIK A; 4BHP A; 1KZH A; 2CV1 A; 1TW3 A; 3H92 A; 2VI6 A; 3KEQ A; 3SDG A; 4AUX A; 2R7Z J; 2DI3 A; 5DV5 A; 4XRM A; 4B8X A; 3KPH A; 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