The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
55
|
structure length |
55
|
Chain Sequence |
SIGLTVEDLLSLRQVVSGNPEALAPLLENISARYPQLREHIMANPEVFVSMLLEA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural and mutational studies on the importance of oligosaccharide binding for the activity of yeast PNGase.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Hydrolase
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| molecule keywords |
Peptide-N(4)-(N-acetyl-beta-glucosaminyl)asparagine amidase
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| total genus |
19
|
| structure length |
55
|
| sequence length |
55
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-10-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | XPC-binding domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1PVE A; 1OQY A; 1X3Z B; 3ESW B; 4YIR X; 2QSG X; 2F4M B; 1TP4 A; 2QSF X; 1QZE A; 2F4O B; 2QSH X; 1X3W B; #chains in the Genus database with same CATH topology 3CQZ J; 1SVL A; 1O3Q A; 4EJT A; 1LVK A; 5LRS A; 1X58 A; 2E2J J; 3ZQL A; 3LSH A; 5GAG J; 1YRN B; 3GLL A; 2WY7 Q; 1BI2 A; 1T95 A; 2YS9 A; 1LE8 B; 1S8N A; 4CO8 A; 3IL2 A; 3RZO J; 1O3S A; 2HDW A; 1LNW A; 4HW0 A; 1W7P A; 2QQA A; 3PUB A; 4I01 A; 2WV0 A; 5J8F A; 4A2U A; 4TV7 A; 2LRD A; 3R0A A; 2ZFU A; 5FKM A; 1GLN A; 4M3B A; 4IHT A; 2YR2 A; 3DPT A; 3BG3 A; 3MZ8 A; 4WXC A; 4UXN A; 5HNF A; 2AXL A; 2A3S A; 2QKM B; 1Z3X A; 3LQR A; 4LLL A; 1RUO A; 4MQV A; 1KQ9 A; 1GXP A; 1PP8 F; 2WY8 Q; 5DCM B; 4U0W A; 5FD5 A; 3RYP A; 4GGG A; 2COB A; 1H88 C; 3WHC A; 5DM6 F; 3FDY A; 3ASO H; 3GFL A; 1BR1 A; 1R7J A; 2IGK A; 1YS6 A; 1R5H A; 2CV0 A; 4B1R A; 2NS0 A; 3GYH X; 2V7F A; 3WTX C; 3HTS B; 1VQK I; 1MJB A; 1BR4 A; 2M45 A; 2R7W A; 4S0H B; 2OF7 A; 2KQR A; 1R36 A; 1VZ0 A; 3COA C; 3Q0U A; 2R7U A; 2ESN A; 2M1B A; 4BY1 J; 3P7N A; 4XLN F; 2XUB A; 2HOT A; 3K10 A; 1X1A A; 2HKX A; 4LK1 F; 4OU0 A; 2QKL B; 1WJB A; 3KP6 A; 1XS9 A; 2RQQ A; 2LF8 A; 4EAT A; 2VT3 A; 2IEK A; 3G3Z A; 3ZMD A; 3L9F A; 1BIA A; 2DQL A; 1PJR A; 3H9J A; 1ZR2 A; 5TRD A; 4MGR A; 4U7B A; 3DCF A; 1KA8 A; 5F64 A; 2Y2Z A; 1YW9 A; 1QZZ A; 1W5C C; 2DDA A; 3F6V A; 3NAR A; 2YU9 J; 1HKS A; 3D5S C; 4UVA A; 3E5Q A; 2W85 A; 4D7N A; 4IOA F; 2ECC A; 2LBF B; 1OJL A; 1U5T C; 2BYV E; 2R93 J; 2VJ5 A; 2D1H A; 3H3U A; 3U21 A; 4ZZD A; 5JVG F; 3I56 I; 4BS9 A; 2FEZ A; 4OMY A; 4A3F J; 2XRO A; 2MA3 A; 4ZTJ A; 4F52 A; 3OR2 C; 3GEZ A; 3T8R A; 2GZW A; 3FXJ A; 4XN3 A; 1RES A; 1EV7 A; 1JJ8 C; 3LOC A; 5IYC J; 4BBS J; 4QLC U; 1ORK A; 1QU3 A; 3QYB A; 3KP3 A; 3HOU J; 3ECH A; 3GFM A; 4HNV A; 3BR0 A; 4AIK A; 4IKF A; 4CUG A; 2DT7 B; 3HOW J; 2IVM A; 5FKO A; 4GYI A; 5HDN A; 2L0K A; 5D6F A; 2AXT C; 2VBZ A; 4RDU A; 2V1U A; 4EM1 A; 2O7O A; 4DZP A; 1FC3 A; 4ANJ A; 3MZY A; 1LPQ A; 3IH3 A; 6PAX A; 1ZG1 A; 2E1O A; 3WOD F; 1IRG A; 2L5Q A; 4BE1 A; 4RLF A; 2E71 A; 2LY9 A; 1G3Y A; 4XRM A; 2NNN A; 1EH8 A; 2XRL A; 4XL9 A; 4ZYD A; 2OJE D; 4F7Z A; 3A01 B; 5K1Y A; 2XGD A; 3OS1 A; 1WJF A; 2QEX I; 2ZXH A; 3A4C A; 1UJ8 A; 4Y13 A; 2V26 A; 4KT6 A; 5C44 J; 3PNV A; 4HG2 A; 3ROU A; 3F21 A; 3Q0V A; 5JI6 A; 1BI3 A; 2P4W A; 2D45 A; 1XDS A; 3G71 I; 4FHT A; 3DLL F; 2GIZ A; 1DGR M; 5HDG A; 1YTY A; 4QIW N; 3OYC A; 1RI7 A; 3GFJ A; 4KMF A; 4XKW A; 2UWM A; 3R60 A; 4NUB A; 4Z6Y A; 3M3Y J; 1IC8 A; 1B72 B; 2GIV A; 1QNT A; 1FY7 A; 4H4K C; 4I99 C; 1JE8 A; 1UG0 A; 2OD5 A; 4IVN A; 4L0Y B; 3BZC A; 2CQK A; 2DA1 A; 5CYV A; 3FMS A; 5D8L B; 4HV6 A; 4XLC A; 3QU3 A; 2K40 A; 3ISP A; 2PN6 A; 2FRH A; 2KDO A; 1MZB A; 1XG1 A; 1HDD C; 4A3J J; 2K02 A; 2VJ4 A; 2KT0 A; 2GXA A; 3KP5 A; 2FE3 A; 1AKH A; 3FXO A; 1HXD A; 1BOA A; 2W4S A; 5F1J A; 1A35 A; 1KU2 A; 1VQ9 I; 1SD5 A; 4R8H A; 4XKV A; 3QOE A; 5JVT A; 4V2G A; 2CS3 A; 2IS1 A; 1Z6R A; 2LK2 A; 3KIO A; 3CJR B; 2R7R A; 3IH2 A; 3S1N J; 4M9X A; 1H9G A; 1ZYR F; 4FQG A; 3OYE A; 2WAE A; 3AAF A; 4QPO A; 3HOZ J; 2I10 A; 3NWT A; 1UCR A; 2DYR H; 4A3E J; 4M72 A; 2F4I A; 1IDY A; 1I6X A; 1E3P A; 1AWC A; 4CCL A; 3G1M A; 2FXA A; 3SXY A; 2VKE A; 1OLT A; 2V9K A; 1W7P D; 2XPV A; 1Z1D A; 3H3V K; 3VDX A; 5B1B H; 1B9N A; 2DOF A; 1D5Y A; 2DA3 A; 4JP0 A; 3JSO A; 2Q2E B; 4NB5 A; 3TO7 A; 3WE2 A; 5J4V A; 4OIQ F; 1U9O A; 1XGS A; 2W24 A; 2EJR A; 2I8D A; 2XGE A; 2QCO A; 3HIF A; 1HW2 A; 5GTH C; 3CC2 I; 2A07 F; 2CGP A; 1SD6 A; 2A5W A; 3E1S A; 4CHU A; 3PUF A; 4NC8 A; 2M0C A; 4HDU A; 1X4P A; 2OUM A; 4PUS A; 2VB6 A; 1ZLJ A; 3WTZ A; 5GPA A; 3HOX J; 2LVS A; 2WC2 A; 3CO6 C; 2JJ7 A; 4A5M A; 4HAM A; 4BAY A; 1PYV A; 4CYD A; 2Z2S B; 2KJB A; 1C0W A; 5HOD A; 2UZK A; 1HQC A; 4LK0 F; 4HF2 A; 1S7E A; 2HXI A; 4JX5 A; 2KRF A; 3ABM H; 1E17 A; 3V42 A; 3MZH A; 5LD2 C; 1OCZ H; 2VT2 A; 3K69 A; 2BE5 F; 3I3L A; 1Y56 A; 3I64 A; 4AWX B; 1YJN I; 2C6Y A; 1UAA A; 2DMQ A; 1BM9 A; 3C7J A; 2VKV A; 4PFP A; 1YRN A; 2IA0 A; 2VBY A; 1T0F A; 5HLG A; 1LE8 A; 5D5W B; 4YIR X; 3GME A; 4NQW B; 4ENM A; 4N4N B; 5JHU A; 4Y52 J; 1JUS A; 2BW3 B; 2HDC A; 5ILS A; 3LQQ A; 3KX2 A; 3QPT A; 1R58 A; 4RMN A; 5K7F A; 4A0Z A; 2RDP A; 1TW2 A; 4JYK A; 1S29 A; 2JMW A; 3MQ0 A; 3EUK L; 5FB2 A; 2HOE A; 3S1Q J; 3DU6 A; 4JX4 A; 3CUQ B; 4HNU A; 5D4R A; 5GAH J; 1TWC J; 2ZSI B; 1KQ8 A; 1YX5 A; 3QYE A; 5BMZ A; 4XK4 A; 3KLN A; 2DOA A; 2DN0 A; 3QP5 A; 1PUF B; 5DCM A; 4HPQ A; 1JUM A; 1YW8 A; 4O5V A; 3I59 A; 5JLX A; 2M7B A; 3IV5 A; 2O61 A; 1K83 J; 4E7S A; 1DU0 A; 4NDL A; 2BV6 A; 1FBS A; 4XSZ F; 3B02 A; 3QPL A; 1JKQ C; 1Y6I A; 1QZY A; 1W5T A; 4ZDL A; 3JRE A; 2JPB A; 1YI2 I; 2ZXJ A; 3ONQ A; 2DA7 A; 3AL0 B; 5J3L A; 2GAU A; 4B4C A; 1ZQ3 P; 2MG4 A; 2HYF A; 3BR5 A; 1JTY A; 3FXR A; 1LFU P; 3PIO F; 4PCQ A; 3C2H A; 3GTQ J; 1FT9 A; 4C3H J; 1MNM C; 3HRT A; 4DJA A; 4XON A; 3BLY A; 2QSF X; 4A3I J; 3HUG B; 5CVU A; 3KE2 A; 3F8M A; 3HKZ A; 1FNN A; 4OOI A; 4BE2 A; 1W7P B; 3LSG A; 5H2F C; 3TGN A; 3BP8 A; 1UHS A; 1QQI A; 2MH2 A; 1JUP A; 3K9T A; 2NVU B; 4ENK A; 4QPQ A; 5DUI A; 5CVI A; 4WCG A; 2WAQ A; 4UB8 C; 1YIJ I; 2XAH A; 1I5Z A; 5CPR B; 3OOU A; 1KZH A; 3JSP A; 2VKH A; 2A69 F; 3V7S A; 2PJR B; 2V6C A; 2O8K A; 4YEJ A; 2M87 A; 4KYW A; 2GA2 A; 3LL7 A; 1A04 A; 1X19 A; 4JBA A; 5M3M J; 1Z05 A; 1HST A; 4BU2 A; 1X1C A; 3CME I; 2ZJP F; 3GTP J; 2Z1D A; 1A6I A; 1N77 A; 3AG1 H; 2PQ8 A; 3TO6 A; 3E6M A; 4ITV A; 2O6G E; 1MJA A; 1WCM J; 4R79 A; 1YQA A; 3BCB A; 2QEN A; 4MO7 A; 4BHC A; 1ETQ A; 2H27 A; 2Z3Y A; 3F3X A; 2GA1 A; 2VON A; 4Y17 A; 2V9V A; 2G0E A; 3CLO A; 2KIS A; 3DEU A; 5E1Z B; 2EH3 A; 1FX7 A; 3MWM A; 3OYN A; 1WJE A; 2XF6 A; 3N05 A; 3OL4 A; 3TDU C; 3PFY A; 4IX7 A; 2R7O A; 2QWW A; 3WG7 H; 2Z33 A; 4IHY A; 4EMS A; 1J5Y A; 1GUU A; 4G9Y A; 2W84 A; 4MHG A; 4CCO A; 2K7L A; 4RAG A; 3LAJ A; 1HKQ A; 3RJP A; 5FKN A; 2NS7 A; 2UXN A; 4HZF A; 2Y75 A; 2VOO A; 5F0F A; 1OYY A; 4FT8 A; 1QBJ A; 4F91 B; 4DNC A; 4BEH B; 4XLH A; 1FWZ A; 3LSP A; 2PBI A; 3TOB A; 3QWL A; 1M1E B; 4O3M A; 1XTA A; 3BRO A; 5CJ9 A; 3F22 A; 1BR2 A; 2KHM A; 3SZP A; 5KNL A; 3GTO J; 2A5Y B; 3MKY B; 3O6B B; 3CC4 I; 1EA3 A; 5FRM A; 4HA8 A; 3E0J B; 3M8F A; 1MMA A; 4H0E A; 1D8K A; 3HOT A; 3FXU A; 1IW7 F; 4E7H A; 5C4X J; 1SAU A; 2K27 A; 4B47 A; 2EFO A; 3LMM A; 2WB1 A; 5E1X A; 4HOB A; 3PO3 J; 1J09 A; 1TWF J; 2LH9 A; 2HYG D; 3PM1 A; 2E5Z A; 1TTY A; 1MH3 A; 1XC5 A; 2KLO A; 2G7H A; 3PNT A; 4AUX A; 1MSF C; 3CC7 I; 2PMU A; 1HCR A; 1J59 A; 1R22 A; 2XSJ C; 1QVU A; 2JA8 J; 3GZ6 A; 4RM2 A; 3U2R A; 1QHG A; 4XRS G; 2P6S A; 2K3F A; 1BN5 A; 2DMN A; 4II2 A; 1LFB A; 4Y33 A; 2D5V A; 1P4W A; 4DBQ A; 4Y3O A; 4Y15 A; 4A5N A; 1VTN C; 4UV9 A; 4NHJ A; 2KPM A; 4UB6 C; 1KGS A; 3Q5F A; 2GXB A; 4XQF A; 1T0F C; 3D5L A; 4GO1 A; 2K9L A; 3GTK J; 3BG7 A; 4B8X A; 3DV8 A; 1I3A A; 3DKX A; 2IGO A; 3RYR A; 1Z77 A; 4BYY A; 2ZXW H; 1DP3 A; 1VQN I; 5LFA A; 1P4X A; 1XPX A; 2DT6 A; 3FBI B; 1X2M A; 3CCM I; 3MVP A; 3VOE A; 3I54 A; 3DU5 A; 2M8E A; 5B1A H; 1WHU A; 3JAM K; 3N4M A; 3O8G A; 5E17 F; 4FCY A; 4L9V A; 2EIL H; 3OYF A; 2E60 A; 1T56 A; 2KRH A; 3IUO A; 2L7F P; 2X1C A; 1DU6 A; 3L2C A; 3R6S A; 2QZ8 A; 1G3T A; 2KKO A; 2IW5 A; 2DOE A; 3ZMU A; 5DDG A; 4KA4 A; 4AM3 A; 1TNT A; 2E35 A; 2LR8 A; 2WTE A; 5GAE J; 4ZYG A; 2P5K A; 1W0U A; 2Q0O A; 1W36 C; 4FX4 A; 1VQ8 I; 2BHZ A; 3CLQ A; 2CW7 A; 1R23 A; 4NC6 A; 4LMY A; 3CCJ I; 2Y0S A; 3I4P A; 3CCL I; 5EEG A; 1PUE E; 1ZHF A; 5DD4 A; 1ZN2 A; 5E18 F; 4FET A; 1FMV A; 1W36 D; 3FHN A; 2R0Q C; 1VQM I; 1X3W B; 4M74 A; 1LFP A; 2DO7 A; 3E6B A; 2ZME B; 3S16 J; 2P8T A; 2XVC A; 2MFZ A; 5EGO B; 3HPH A; 1SEU A; 1YLF A; 1WH5 A; 2XAU A; 3BG9 A; 4LB6 B; 4XRF A; 4NQW A; 2ME0 A; 3B6C A; 5EEH A; 2FMY A; 5F0H A; 2EFN A; 2HQN A; 4AC0 A; 1XDU A; 1FTZ A; 2UUZ A; 2DU9 A; 3W6J B; 1WI9 A; 1D0Z A; 4IEJ A; 1MH4 A; 2DMU A; 4BDZ A; 3EQL F; 3P9I A; 2NNY A; 5E20 A; 2HZT A; 2MAB A; 5DTD A; 1LJ9 A; 2HVS A; 1WZ2 A; 1JT0 A; 4BQO A; 3PNY A; 1FYK A; 4HST A; 3SJM A; 2Q8K A; 3A03 A; 3CUQ A; 1Y1V J; 1VF9 A; 4XR6 A; 5LGT A; 1H9T A; 4KIS A; 1BA5 A; 2QA4 I; 2M2E A; 4K2E A; 2FNA A; 1G6N A; 4GCV A; 2WAF A; 3CCR I; 5E79 C; 1PUF A; 2ISZ A; 4NNJ A; 4BKX A; 3H36 A; 4LB5 A; 2VPR A; 1OR7 A; 3H92 A; 3RSN A; 2H6B A; 4EQQ A; 2CO5 A; 4G7Z F; 2BHY A; 2OA4 A; 1IN4 A; 4A6E A; 5D5X B; 3A02 A; 2EFP A; 3M7G A; 3K70 C; 2H8R A; 2ZSH B; 2XSD C; 1NG6 A; 1OMI A; 3ABK H; 2FNP A; 3KEY A; 2LLK A; 3ZRG A; 1H89 C; 2HOS A; 3UKG A; 3HUG A; 1NK3 P; 1OIS A; 3PSF A; 5GP9 A; 2RKH A; 2FML A; 2V1N A; 2V79 A; 5F27 A; 1K79 A; 4G6D A; 4E7J A; 1EH6 A; 2H09 A; 2DFI A; 5J8C A; 1IN7 A; 2RNG A; 4WF2 A; 2L9N A; 2KP6 A; 3GO5 A; 4KIT B; 3K70 D; 1HOM A; 1TW3 A; 2NS8 A; 1IXR C; 2DA2 A; 2QGU A; 3F0C A; 2HVQ A; 3M9A A; 5HS8 A; 4XKB A; 4MFE A; 2Y0M A; 1GVJ A; 2BY2 A; 1V54 H; 2XGC A; 3RZD J; 2P7V B; 2LKS A; 5FRO A; 3L00 A; 2VI6 A; 5CLS A; 5IP9 J; 5DUK A; 3F8B A; 1U8B A; 2PJR A; 1RPW A; 4MTE A; 4CCM A; 3R0J A; 3QP6 A; 4B43 A; 5M5W J; 4X6A J; 1O7L A; 3BQY A; 2IP2 A; 4AYB A; 3BOQ A; 3I59 B; 4AID A; 2X1E A; 2JPC A; 4Q4Z F; 2FSW A; 3KLO A; 4PJM A; 2XAJ A; 5FGM A; 2YPR A; 3VSL A; 5K5O A; 1FSE A; 1X1B A; 4EJV A; 5LHG A; 4ZTF A; 1JT6 A; 3J81 K; 2A61 A; 3DXJ F; 3CJQ B; 2Y48 A; 4YFX F; 3K4C A; 4B09 A; 3BWG A; 4W97 A; 3WTS C; 1IAW A; 1SD7 A; 2NRA C; 2IS6 A; 1Y8R B; 2PJP A; 2FA5 A; 1XSX A; 3VFZ A; 1LDJ A; 1V4R A; 3GFI A; 2R5Z B; 3BY6 A; 2QSG X; 1V55 H; 3S3O A; 3OYM A; 3J80 K; 2OBP A; 3F72 A; 1FP1 D; 1XGN A; 3S3M A; 1FTT A; 3MFK A; 3NRV A; 1HSJ A; 2ECB A; 1T8I A; 4HSR A; 1ZAO A; 2X0L A; 5E3L A; 1TT5 B; 4MQ9 F; 1LVA A; 4PGH A; 2EA2 A; 4XNF A; 5L3E A; 1EJ9 A; 2MYS A; 5DCF A; 2XHK A; 2OPT A; 1OKR A; 3DF8 A; 1D1B A; 5AIP A; 3FIS A; 4BEH A; 5M5Y J; 1RKW A; 3J7A O; 4MLO A; 4WWC A; 5AON A; 3GTM J; 4N0B A; 5EF6 A; 2F5V A; 3WGH A; 2YUS A; 4M3G A; 1NTC A; 1BBY A; 3BJO A; 1QVT A; 5ICG A; 3RPU A; 2VUM J; 5E8G A; 1S9H A; 5HLH A; 3JRF A; 1S7A A; 1P7J A; 5LGU A; 3SFZ A; 3HEF A; 2CYY A; 5M5X J; 1QA6 A; 3AFH A; 2MGQ A; 3G2B A; 3M8J A; 3S32 A; 1K61 A; 3CMA I; 4BQA A; 2DMP A; 3BC8 A; 3CP2 A; 1A31 A; 1T38 A; 3MKZ A; 2P0W A; 3P9C A; 3I71 A; 3QPH A; 3KEO A; 3WE3 A; 3KYC B; 1WH7 A; 2FBK A; 3S15 J; 3MEX A; 1LDD A; 2EZH A; 4CGZ A; 4A3K J; 2KRC A; 3DEE A; 1ETY A; 3FWE A; 4WXH A; 3IAM 2; 3UNG C; 5DS9 A; 1MW7 A; 2ETH A; 5GTI C; 2EBI A; 1ZRD A; 2QLZ A; 2HPM A; 1UHW A; 3GWZ A; 3PL8 A; 2RV8 A; 4UUV A; 2E7X A; 3EUH A; 2OV7 A; 4BUP A; 2PLY A; 3CES A; 4RGS A; 4OIN F; 1TL8 A; 3U1K A; 4YG2 F; 1VND A; 2E36 A; 2PX9 A; 1P6R A; 4ASN A; 4BH9 A; 1KYW A; 2M9H A; 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