The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
70
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sequence length |
221
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structure length |
221
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Chain Sequence |
NVDFDSESPRKPEIQNEIVDLHNSLRRSVNPTASNMLRMEWYPEAADNAERWAYRCIESHSSYESRVIEGIKCGENIYMSPYPMKWTDIIHAWHDEYKDFKYGVGADPPNAVTGHYTQIVWYKSYRIGCAAAYCPSSPYSYFFVCQYCPAGNFIGKTATPYTSGTPCGDCPSDCDNGLCTNPCTRENKFTNCNTMVQQSSCQDNYMKTNCPASCFCQNKII
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of cysteine-rich secretory protein stecrisp reveals the cysteine-rich domain has a K+-channel inhibitor-like fold.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
cysteine-rich secretory protein
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| molecule tags |
Toxin
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| total genus |
70
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| structure length |
221
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| sequence length |
221
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-11-03 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00188 | CAP | Cysteine-rich secretory protein family |
| A | PF08562 | Crisp | Crisp |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Crisp domain | ||
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Pathogenesis-related Protein p14a | CAP |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3S6U A; 4D53 A; 4TPV A; 2DDA A; 4H0A A; 1XTA A; 3U3N C; 1RC9 A; 3U3L C; 1SMB A; 3Q2R A; 1CFE A; 4LY5 A; 5JYS A; 1U53 A; 2EPF A; 4G2U A; 1XX5 A; 4NUO A; 3S6V A; 3U3U C; 4NUN A; 3S6S A; 2DDB A; 4NUI A; 4P27 A; 4IFA A; 3NT8 A; 3Q2U A; 1QNX A; 2A05 A; 2VZN A; 3MZ8 A; 4NUK A; 2CQ7 A; 4AIW A; 1WVR A; 2GIZ A; 5ETE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1O57 A; 3RSN A; 4AC0 A; 3OYH A; 2DA4 A; 2FA5 A; 3JRE A; 3S3M A; 4AWX B; 1H89 C; 4LG3 A; 5CLS A; 1MMN A; 1ZGW A; 2RC4 A; 1VQ7 I; 1B8I B; 3G3Z A; 1USS A; 1HW1 A; 2IW5 A; 5GAH J; 1DU6 A; 5J40 A; 1V54 H; 3BG5 A; 1VQ6 I; 1E17 A; 3E6M A; 3CCR I; 2HZD A; 2K4J A; 1VQO I; 2W24 A; 5BOX A; 1R49 A; 4NBQ A; 4RGX A; 1WJE A; 2BXY A; 3R61 A; 5F08 A; 3SFZ A; 3CCS I; 4L9N A; 5K5Q A; 5EEA A; 3S1R J; 2JA5 J; 2NOG A; 1WGX A; 1BL0 A; 3MAJ A; 2K40 A; 4FCY A; 1MSE C; 3BG7 A; 2DXI A; 3ASN H; 2QSF X; 2PMH A; 2LH9 A; 3Q9S A; 4E7H A; 1J5Y A; 1YO5 C; 5F6F A; 3GZ5 A; 3OYK A; 2EBI A; 2L7F P; 3H35 A; 4KNY A; 3TDZ C; 5AIP A; 2AS5 F; 2O8K A; 5ICC A; 5IYD J; 2XPU A; 1FJL A; 1UMQ A; 5JR3 A; 1ODD A; 2VT2 A; 2WAE A; 4M74 A; 3R60 A; 1IRX A; 4CYC A; 3T0Y A; 2KT0 A; 4KDP A; 2YS9 A; 4Y33 A; 3CO7 C; 2F5D A; 2L4M A; 1O3Q A; 3H5A A; 1VFC A; 2UXX A; 4C3I J; 1I3Q J; 2F5F A; 4AVZ A; 3A4C A; 4OU0 A; 3ZQF A; 2M0M A; 2NS7 A; 2DT5 A; 5DCM B; 4NHJ A; 2R7X A; 5D4R A; 5KVR A; 3CUQ A; 5FB2 A; 1SFU A; 5DUK A; 2HWV A; 4BBS J; 2FOK A; 2VXZ A; 4F91 B; 3GFM A; 4A3E J; 2E5Z A; 1MBJ A; 1UCR A; 2JUC A; 1Z1D A; 1MBF A; 3TGN A; 3SDG A; 2A5Y B; 3IWZ A; 2E1M C; 5L3E A; 3X2Q H; 1IXS B; 2GQQ A; 3HOV J; 1NG6 A; 1Z6T A; 4LJZ F; 2Y31 A; 4M3F A; 4CGZ A; 2LLK A; 1PJR A; 2HKX A; 1I50 J; 3JSP A; 2MYS A; 1YYV A; 3BC8 A; 3CLQ A; 2ELJ A; 4XON A; 2IGN A; 2QCO A; 3S6S A; 3K1N A; 5IP9 J; 5JVG F; 3GZN B; 1OFC X; 1FOY A; 2A69 F; 2X51 A; 1LJ9 A; 3FBI B; 3ROU A; 4XRS G; 5LFA A; 1VF9 A; 1MGT A; 1HC8 A; 1J9I A; 3DPT A; 1T0F C; 2HU9 A; 2WB1 A; 3WHB A; 1XDU A; 2EIM H; 3TO9 A; 3GEZ A; 3M8J A; 1IRZ A; 1QNT A; 3C2H A; 2GXG A; 4MO7 A; 1FP2 A; 3PIO F; 1TBX A; 1W5S A; 3B02 A; 1N78 A; 2X6Y A; 3QAH A; 3CMY A; 3LSM A; 3LAJ A; 4H4K C; 3GF2 A; 2CU7 A; 3QYB A; 5J8F A; 2VC1 A; 2E1M B; 4WXH A; 3ZCO A; 2WC2 A; 3HPH A; 1R5G A; 1SEU A; 3CJT B; 4CCO A; 4B47 A; 2LOO A; 1QPM A; 2XF5 A; 4PJJ A; 4RAY A; 4CZC A; 5H20 A; 1ZG3 A; 3NRV A; 1I39 A; 1BOA A; 3LQR A; 4IHV A; 3T8R A; 5LD2 C; 2R93 J; 4CCJ A; 3HPG A; 1FIA A; 3C1D A; 3TOA A; 1KU9 A; 4BXU A; 2LYC A; 1WPK A; 2A3S A; 3E0J B; 4L0Z B; 3E5U A; 3ABU A; 3WTY C; 4IFA A; 4FE7 A; 1UHM A; 4BY7 J; 4PFO A; 3J7A O; 2DA5 A; 4NUB A; 2R7R A; 2ID3 A; 3ZRG A; 3FXO A; 1G3T A; 4XIC A; 1W36 D; 1TT5 B; 1RZ4 A; 5E1Z B; 1T98 A; 3S6U A; 1R1U A; 2M34 A; 4XLC A; 2FSW A; 4A0Y A; 3S8P A; 5FRM A; 3HOU J; 4A3C J; 4BE2 A; 4LK1 F; 1W36 C; 4CCL A; 4G9Y A; 5H2F C; 3L2Q A; 4PUS A; 4E7Z A; 1BJZ A; 3FIS A; 2CQX A; 4XKV A; 1VTN C; 5L3D A; 1F43 A; 3DV8 A; 1U8B A; 1G59 A; 1YIO A; 5F0F A; 5K7F A; 3I4N J; 3KP3 A; 3QP6 A; 2ZFU A; 3G1O A; 3NEU A; 2FOW A; 4FHT A; 1G2H A; 2P0W A; 2ZBK A; 3GFL A; 2WWY A; 2JSC A; 3F6V A; 3EET A; 3LWF A; 2K86 A; 4XLA A; 3L7W A; 2GA1 A; 3M4O J; 2EZK A; 4DYR A; 3F8C A; 3KPH A; 1N75 A; 1AOY A; 4EJO A; 1FOK A; 2DPD A; 3FK6 A; 5FKO A; 1XC5 A; 1LDJ A; 3LSR A; 2F5E A; 1O7L A; 5L3C A; 2Z1D A; 1SFK A; 2F5V A; 3BRO A; 1BIB A; 5A2Q K; 1Y6I A; 3SFI A; 2RRE A; 4HST A; 1EA3 A; 2XF6 A; 2X6X A; 3BCB A; 1A6Q A; 1EH7 A; 4BUP A; 2BY2 A; 5HDK A; 5ICE A; 2BBY A; 4KT6 A; 3F21 A; 1R7J A; 3TDU C; 3MKZ A; 2W25 A; 3QOE A; 3TKY A; 1R9T J; 4BQA A; 2EFO A; 2W7N A; 1HDP A; 4IQJ A; 2AQE A; 3NQO A; 3P7N A; 2CFO A; 2K5C A; 2DJI A; 2W57 A; 1YW7 A; 1RR8 C; 1UHS A; 3R6S A; 4B8X A; 2JZY A; 4LG0 A; 4C3H J; 3GZ6 A; 2E2H J; 2BOL A; 5JHU A; 2VIX A; 4BE1 A; 1QHG A; 2A07 F; 2ECB A; 2H1L A; 3IH4 A; 4D0P A; 5EF6 A; 2X6O A; 1B9M A; 1KU7 A; 2DTR A; 3E6D A; 2BVL A; 2Z2S B; 2W00 A; 2X6W A; 1T38 A; 3B6C A; 1AHD P; 3HRT A; 4LLL A; 4EJT A; 2LBF B; 2ETH A; 4E7J A; 4QWQ A; 4WK8 F; 1YFH A; 3KP5 A; 1U2W A; 3BG6 A; 4M6X A; 2XAH A; 3ZN1 A; 5DD4 A; 2MSY A; 4A3M J; 2DDB A; 4EM0 B; 5EGO B; 2R7V A; 2DK8 A; 4I01 A; 2LFB A; 2KIQ A; 2G7U A; 3RZD J; 1HOM A; 1PDN C; 2TCT A; 2K02 A; 3CCM I; 1OCP A; 1BR1 A; 2R4G A; 3KX2 A; 2G9W A; 2HXO A; 1TZL A; 2P7C B; 1XMX A; 2V6E A; 1SD7 A; 3FF5 A; 3ABL H; 1KGS A; 2Q2E B; 2ME6 A; 3CP8 A; 3Q3S A; 3BG9 A; 3CTA A; 3PO3 J; 4I09 A; 2LC2 A; 1IN4 A; 2V79 A; 4E7K A; 2LTP A; 3BCA A; 1OR7 C; 2EFW A; 3HB9 A; 3D5R C; 1T0F A; 4ZZD A; 5D5X B; 2L01 A; 1HW2 A; 1IZ1 A; 2NYX A; 3A1Y A; 4HNT A; 3KIO A; 1TWF J; 1XDS A; 1U5T C; 4G7H F; 4HF2 A; 1XB4 A; 4BJ6 C; 1X2M A; 2VB6 A; 4FET A; 3OMY A; 4YEL A; 1MDM B; 1A36 A; 3WTW C; 2Q1Z B; 4M3E A; 4AYB N; 1Y0N A; 3BZK A; 3BJA A; 3R4K A; 1LB2 A; 4I76 A; 3BZ6 A; 2EFQ A; 9ANT A; 2EIJ H; 4AUX A; 4B48 A; 4KT5 C; 3TL4 X; 4RBO A; 1D5V A; 5M5X J; 4BAC A; 4UVC A; 2RNJ A; 1MNM C; 1YS7 A; 3Q5F A; 4YFK F; 2FRH A; 1XD7 A; 3QPT A; 2DFE A; 3VB2 A; 3L2W A; 1P6R A; 2CQ7 A; 2DLL A; 4P96 A; 2DCE A; 3HHG A; 3DLL F; 4ENJ A; 5E8G A; 1SD6 A; 2LMD A; 4XK4 A; 5C44 J; 3P5J A; 3ZQQ A; 2M5W A; 5ED4 A; 4X6A J; 1D8K A; 3HSR A; 3MVP A; 3NAR A; 5D8K B; 4E4H A; 1UG0 A; 4ZYG A; 5IOZ A; 4A3J J; 1U5T B; 3CO6 C; 3I5U A; 2HQR A; 3SXY A; 4HDV A; 1LE8 B; 1GXQ A; 4IPA A; 3BWG A; 2DW4 A; 2ELH A; 2Z5U A; 1FYK A; 2HVR A; 3H3U A; 3FXR A; 1XSX A; 4WF2 A; 3W2W A; 3HOZ J; 2WY7 Q; 4BKX A; 4HQE A; 1SFE A; 5HS9 A; 1ZG1 A; 2Q8K A; 1R6R A; 5FLM J; 1UAA A; 2XIG A; 4G6D A; 5F04 A; 4X1E A; 4IL6 C; 3FWE A; 1EKE A; 1MD0 A; 2MAB A; 3HSE A; 1FMV A; 1X1D A; 3HL2 A; 2LP0 A; 3CCE I; 4FIS A; 1LVA A; 2ZJR F; 4F93 B; 2CV1 A; 4LLN A; 2O61 A; 4NC8 A; 1MNE A; 1FWZ A; 4H0E A; 4J19 A; 4EJV A; 2KIS A; 3JSO A; 2Y0S N; 2Y2Z A; 2IA0 A; 1SC7 A; 2K9M A; 5HDG A; 4DQ2 A; 1HDD C; 3HOT A; 1PUE E; 2XPW A; 1QPI A; 5IP6 A; 2JVG A; 2DJN A; 4LIU A; 5JYS A; 1QHH D; 2XB5 A; 4GXO A; 5EZH A; 2X1E A; 1X1A A; 3J7Z I; 5F27 A; 1JI8 A; 1SVO A; 2GM4 A; 3AL0 C; 2QLZ A; 2M45 A; 4A2U A; 1L0O C; 2BVM A; 2DYS H; 3Q2U A; 2LRD A; 1JT6 A; 2X1D A; 1XGN A; 2JSP A; 4XLE A; 4AIJ A; 3MZ8 A; 2ZXI A; 1Z21 A; 2W1O A; 2IAI A; 3V7S A; 4EEF G; 5EGO A; 2R5Y A; 2YX4 A; 1MJ9 A; 4IXA A; 1WJF A; 2EZI A; 4WXD A; 3CP2 A; 2STW A; 4ZDL A; 1IUF A; 3FM3 A; 4HX4 A; 4KIC A; 1IDY A; 2OPT A; 2VN2 A; 2IS6 A; 3LST A; 1W7P A; 3HG9 A; 3DPL C; 1X4P A; 2L9N A; 2DPU A; 3Q0W A; 1FBS A; 3HHH A; 1BI3 A; 2K4B A; 1B9N A; 2X4H A; 5CPR B; 1X58 A; 2Q2E A; 1STZ A; 1W5C C; 4MTD A; 1S3J A; 2LY2 A; 4GO1 A; 3AG1 H; 4I98 B; 3M1E A; 2FF4 A; 3WU1 B; 3ULQ B; 2Z33 A; 3W3C A; 2GXA A; 3AL0 B; 2VPL A; 1ZGJ A; 3ZPL A; 3SZG A; 2H94 A; 4JP0 A; 3ZMT A; 3OYJ A; 3HJE A; 2ZO4 A; 3B6A A; 2ZNY A; 1KQ0 A; 2VI6 A; 4HNV A; 2KJC A; 2MLK A; 2V7F A; 1U3E M; 3HGG A; 4GDF A; 1XCB A; 2DTZ A; 2I10 A; 2KRF A; 2LF8 A; 2WAD A; 4E7I A; 1KZH A; 1RES A; 1Z7L A; 4J00 A; 4HZF A; 1F5T A; 3V8K A; 3RQI A; 1K4T A; 2XC7 A; 4EAT A; 5CVJ A; 1SAN A; 1V5G A; 5K1Y A; 3RPU D; 3LSG A; 4XRM A; 4I0B A; 3C18 A; 3RTR A; 3S32 A; 1OCO H; 3ERE D; 4MIM A; 4PDK A; 3S93 A; 1Q1H A; 4L5E A; 1FC3 A; 4D9J A; 2X85 A; 3OYL A; 2NXN B; 5LRR A; 4CH7 A; 1WFX A; 1U6G A; 1OR7 A; 1EH8 A; 1A31 A; 5E1X A; 5CJ9 A; 2ECC A; 2YPR A; 2Z99 A; 2Y9Z A; 3QQA A; 1RIO H; 1ZRC A; 3TW7 A; 1U5T A; 4BY1 J; 2E7W A; 3WGI A; 5A2Q Z; 2XHK A; 4CYC B; 2EFP A; 3MMY B; 1TQM A; 3HM5 A; 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1WRJ A; 1ZN2 A; 2E35 A; 1T08 B; 2JA7 J; 1SMY F; 3K4C A; 1HA8 A; 1YW8 A; 2CW0 F; 3IKV A; 2QF7 A; 4C3J J; 1DUX C; 2DI3 A; 2KZG A; 4A0X A; 4RB1 A; 1K6Y A; 2QKL B; 1GUU A; 2VBY A; 1AKH A; 1XG1 A; 1S8N A; 2F4M B; 4A3L J; 1MSF C; 3R0J A; 1K79 A; 2PJP A; 1K7A A; 1OYW A; 4KA4 A; 1KU2 A; 4L9V A; 2W48 A; 3WU2 C; 2EIN H; 1TNT A; 3ZR8 X; 5C4X J; 1TTY A; 2GIZ A; 1RKW A; 5IYC J; 3FKJ A; 4MFE A; 2DMT A; 1IF1 A; 4OWR B; 4A6E A; 5ILV A; 1P4X A; 3GTQ J; 4A69 C; 1XTA A; 3FKI J; 3IP4 B; 2VKH A; 3VYT B; 1FBU A; 4KIF A; 1U53 A; 1KA8 A; 4XLH A; 4MFD A; 5BNG A; 1JKQ C; 1UHW A; 2QM3 A; 3K7A J; 3KP6 A; 4S05 A; 4HNU A; 3LSJ A; 4I6Z A; 1ENH A; 3EUA A; 3SDB A; 1RPW A; 2P81 A; 4KJZ A; 1I27 A; 2NS8 A; 3GFJ A; 1GHC A; 3ERM A; 2EZH A; 3ZQG A; 1YIT I; 4RM3 A; 3CCU I; 4HDU A; 2H8R A; 3KLN A; 4UVB A; 1ACI A; 3SEZ A; 5CQG A; 4PFP A; 5FKK A; 1FBQ A; 3D1N I; 2HR3 A; 2D5V A; 1J59 A; 3DTI A; 1MBE A; 3K10 A; 2NOJ B; 1GV5 A; 4IZZ A; 3I4M J; 3EDP A; 4XLP F; 2MGQ A; 1ZGA A; 3FXJ A; 1PYV A; 4RMN A; 2PX9 A; 1K4S A; 3EYY A; 4RLQ A; 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