1ASV | Genus

Total Genus 49

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	49
sequence length	146
structure length	145
Chain Sequence	GLGPLQIWQTDFTLEPRMAPRSWLAVTVDTASSAIVVTQHGRVTSVAAQHHWATAIAVLGRPKAIKTDNGSFTSKSTREWLARWGIAHTTGIPGNSQGQAMVERANRLLKDKIRVLAEGDGFMKRIPTSKQGELLAKAMYALNHF

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__400874619638771__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__400874619638771__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/1ASV/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__400874619638771__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"400874619638771","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/1ASV/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__400874619638771__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

Viewer cachePut cache://localLOAD_/file/5cfabf001ee69d252bad9968/pdb.gz

Viewer cachePut https://genus.fuw.edu.pl/file/5cfabf001ee69d252bad9968/pdb.gz

FileManager.getAtomSetCollectionFromFile(/file/5cfabf001ee69d252bad9968/pdb.gz)

loadScript /static/js/j2s/core/corezip.z.js

The Resolver thinks Pdb

loadScript /static/js/j2s/core/corebio.z.js

Time for openFile(/file/5cfabf001ee69d252bad9968/pdb.gz): 463 ms

reading 145 atoms

ModelSet: haveSymmetry:false haveUnitcells:false haveFractionalCoord:false

1 model in this collection. Use getProperty "modelInfo" or getProperty "auxiliaryInfo" to inspect them.

Default Van der Waals type for model set to Jmol

145 atoms created

ModelSet: autobonding; use autobond=false to not generate bonds automatically

Time for creating model: 20 ms

Adding embedded #jmolscript: select ({0:144});backbone only;select *;

platformSpeed = 8

cartoonsFancy = true

sheetSmoothing = 1.0

traceAlpha = true

loadScript /static/js/j2s/core/corescriptcmd.z.js

specularPower = 9

ambientPercent = 20

antialiasDisplay = true

Script completed

Jmol script terminated

loadScript /static/js/j2s/J/g3d/HermiteRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/renderbio/BioMeshRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/render/MeshRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/shape/Mesh.js

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Dna integration
source organism	Avian sarcoma virus
publication title	High-resolution structure of the catalytic domain of avian sarcoma virus integrase. pubmed doi rcsb
molecule keywords	AVIAN SARCOMA VIRUS INTEGRASE
total genus	49
structure length	145
sequence length	146
ec nomenclature	ec 2.7.7.49: RNA-directed DNA polymerase.
pdb deposition date	1995-08-25

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00665	rve	Integrase core domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.420.10	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H	1asvA00

1BISA 4LH5A 2YNFA 2NUBA 3JYTA 2FBTA 4KTQA 4CJ5A 2HNYA 3LPTA 1HYVA 3ISNC 4CK1A 3V81A 2Z1JA 4J2EA 3LANA 4AHCA 3QLHA 1GOCA 4CEBA 3K59A 4C8LA 3B6OA 4FJ7A 1RT6A 3KK1A 1EXQA 3OYFA 3K57A 3NCIA 3DRPA 3WNHA 1KLMA 2G8WA 4KB1A 2HHVA 1U45A 1VSHA 1RT3A 4AHUA 2VG6A 3OYGA 3EY1A 2PYJA 3MAQA 3QEVA 5CYMA 4DSFA 3PV8A 2G8VA 3VN5A 2QKBA 1LW2A 4C8MA 1FKOA 2Y1IA 4LH4A 3VQ7A 3ZT0A 4M3UA 3ULDA 4DU3A 1TK8A 1Z25A 2IC3A 2D5RA 1WSEA 4RW4A 1L3UA 1XHXA 4O4GA 2E6LA 1J9AA 2ETJA 3HPHA 4OLAA 3ZCMA 4FK4A 2FBXA 3FFIA 5SWMA 1HYSA 1N5YA 4DTMA 4Z4EA 4N47A 3DM2A 1UA0A 4CHZA 2VG5A 1S9GA 3RR7A 4H8KA 4J2DA 1WSIA 4DTRA 4HVJA 1NKEA 2R7YA 3SPYA 1WSGA 2YKNA 3KLGA 4DFJA 3I8DA 1BQMA 1QS4A 5FRMA 2OA8A 3V6DA 3LP1A 3MXIA 1TK5A 1RNHA 4CCHA 1U04A 4DSLA 5D3GA 4KO0A 3G0ZA 4CJWA 3V9WA 2HHSA 1EKEA 4B9UA 4KI4A 3U3YA 2Z1GA 2OPSA 5JS2A 2ITGA 4FZYA 4NCAA 1UOCA 1RTHA 4W5OA 2KW4A 2PYLA 5CYQA 1L3SA 4NYFA 4CIGA 3CFOA 4CEDA 2BGGA 1CXUA 1DTQA 4M3WA 3I0RA 3HVRA 1S1WA 1HQUA 1RT7A 3MEDA 3O3FA 1U47A 1ZBLA 4CFCA 4CFBA 1Q9YA 1SL1A 2IOCA 4NYNA 1Q9XA 2YV0X 4FJ8A 2DTUA 3U3GA 3NDKA 3DI6A 3AO2A 3V1RA 3PO5A 1SKWA 3SPZA 1KSPA 4DTSA 1U48A 4E1NA 5HRNA 1YTAA 3NGZA 3OYKA 3K58A 3H08A 3IAYA 3NE6A 4DLEA 4WE1A 4IG3A 4CF8A 2X6SA 2HHWA 1KTQA 3LPUA 2G8FA 3KD1E 1ZBHA 3TAPA 1C0UA 3SUNA 3AO3A 4ZTFA 1RBRA 4E0DA 1IKYA 1WLJA 4DQRA 3LDSA 2P1JA 1REVA 2RPIA 4CGGA 4F4KA 2DFEA 4DTPA 1DTTA 1K6YA 3V9UA 4DTNA 2FC0A 1JLCA 5DMRA 1R0AA 4FZZA 4CK2A 1IO2A 4PA1A 3OYDA 2XRIA 1JKHA 4FJ5A 4CE9A 3ZT1A 3V9XA 4DTXA 3DOLA 1YTUA 4N5SA 1HNVA 1BCMA 1VSMA 1XWLA 2VG7A 4OVLA 4E7LA 4W5TA 2WONA 3VQ8A 4H4OA 4I9LA 1C0TA 3VQQA 1JXBA 3K5NA 2IGIA 3O3GA 3V9SA 1F21A 4O44A 3ZSRA 3SCXA 1L5UA 1JL2A 4C8NA 3L2UA 1SKSA 4ELTA 3MECA 3WNGA 1LW0A 3MEEA 3OYJA 1BQNA 3HK2A 4CHNA 3K2PA 4DFKA 2HHQA 4W5NA 4C8KA 4BDZA 1VRUA 4KV8A 3F73A 4DQIA 3VQ6A 4IFYA 3ZSQA 1ASUA 3DOKA 3TANA 1NKBA 4CF0A 3C6TA 4PUOA 4B08A 1LWFA 1FKPA 4CHQA 1U49A 4OKKA 3LWLA 1S6PA 4N41A 4B9MA 4CJSA 1TKTA 2B6AA 2P5OA 2XY5A 3KLIA 3ZT3A 3P1GA 1J54A 3L2RA 3SJJA 3NGIA 4OGCA 2G8UA 1WSJA 3CG7A 4ZTJA 3RRGA 3M8PA 3TI0A 4W5QA 1JL1A 2BANA 4ZHRA 3OS0A 3PX4A 3PUFA 1Q8IA 4FLXA 1GOAA 3THVA 2HW3A 2AJQA 1ASVA 3D45A 4CIEA 3RMDA 3V4IA 4IKFA 3DMJA 2O4GA 1XI1A 3AVIA 3V1OA 3O4QA 3VQCA 4EP5A 4J2BA 1ZBIA 4CGDA 4AHSA 1EETA 3NGYA 3OJSA 5J2NA 4IFVA 1RDDA 3QEWA 1NK5A 1JLFA 3SQ4A 4NCGA 4OPJA 1SL0A 4FJHA 5C42A 3VA0A 3NF6A 1HYZA 3AVHA 2W42A 1X9MA 2HHTA 4AH9A 1TKZA 4CECA 3L2WA 2XY7A 4DQPA 3ZSXA 1NKCA 4M3RA 3KKSA 1EX4A 4OLBA 1KVCA 2XO7A 1WSFA 2Z1IA 3NHGA 1WNSA 2YHAA 4Z4HA 4B9LA 4ELUA 3NH1A 5J2MA 1QSYA 3LP0A 1JLQA 2D0CA 3OY9A 1VSDA 3M8QA 4CJKA 3OVNA 1NK8A 4CF1A 4CFDA 3NF7A 3QO9A 3BDPA 4KKOA 4Z4CA 4F2RA 4AHTA 1VSIA 1BL3A 5KRTA 4FK2A 4FJ9A 1SV5A 3C6UA 4E89A 3C95A 4JS4A 4HCCA 4W5RA 3VA3A 4EP4A 4O0IA 1TKXA 3QINA 4H4MA 2OPQA 4JLHA 1IKXA 4N76A 3AA2A 1BIUA 4YFUA 3OJUA 3NF8A 4FVMA 2YKMA 4RW6A 4OPKA 3LWMA 1NOYA 4M45A 4PQUA 1JLGA 1FK9A 4CJPA 4RG8A 1T7PA 4DMNA 4RW8A 1KCFA 4CEAA 4O5BA 3T19A 3HPOA 3RTVA 3DLHA 4CGFA 4B9SA 4IDKA 4I2PA 5T7BA 1QSSA 3PY8A 4MQ3A 1JLBA 3QIOA 1RBSA 4CEQA 5J1EA 2FBYA 1HNIA 3AVLA 1G15A 2ZE2A 1O1WA 4IG0A 3QETA 2QKKA 2HHUA 1J53A 1JXEA 3IS9A 4OGEA 1CXQA 3TARA 4QCLA 4QAGA 3AA4A 1X9SA 4DSIA 1JLAA 2Z1HA 3ZSWA 1TAUA 3AO1A 1LWCA 3EYZA 2O4IA 1I3AA 4B9TA 1MU2A 1BGXT 1ZBUA 1S6QA 2EHGA 1BI4A 3L2QA 2PY5A 1B9FA 3LAMA 3K5MA 3DRRA 4JRQA 3TAGA 1TKDA 2KTQA 3AVJA 4BACA 1IH7A 3ZT4A 4CJTA 3CM5A 1NK6A 1LAWA 3TR8A 3E01A 5K14A 4CJEA 4HUEA 4DLGA 3QNOA 4BDPA 5KI6A 3HM9A 1KRPA 4Z4GA 2IDOA 5KTQA 3VQ9A 5HBMA 2HMIA 1LWEA 2IAJA 4FLYA 4MFBA 1ITGA 4FYDA 5HRPA 1T05A 1KFDA 3LP3A 1QHTA 2D0BA 4OJRA 3HPGA 4DSEA 4E7KA 4FJXA 4FJIA 4HUGA 3O3HA 4M3ZA 3A2FA 2RN2A 4M41A 3T3FA 3NH0A 4IBNA 1A5WA 2GUIA 3OS2A 1HJRA 2IS3A 4FW2A 4BE2A 5HRSA 5CZ1A 4FM0A 4FJKA 1NOZA 4FLZA 2BDPA 4I9QA 1RCHA 3DLGA 3TWHA 1CZ9A 1YT3A 4CGJA 5I42A 4M3XA 3VQAA 4R5PA 4FCYA 4CJQA 1LV5A 3OYBA 3HT3A 4KHWA 1X1PA 3C94A 1S1VA 3QEXA 4CGIA 4KB0A 1RDBA 3MEGA 5J2PA 3HO1A 3NH2A 2P5GA 1KVAA 1T03A 1ZBFA 1IG9A 2HVIA 4K8XA 1IKWA 3M8SA 4KHYA 3PO4A 4GVMA 3KLHA 4FXDA 3DLEA 3P83D 1U4BA 4CJLA 5JS1A 4E3SA 3QEPA 1VSLA 1C0MA 1VSJA 1XC9A 1KFSA 3VQBA 4ELVA 3ASMA 5C25A 4LD0A 2HNDA 4J2AA 1VSEA 3SZ2A 3VQDA 3AA3A 3L8BA 2E6MA 4OKJA 3RR8A 1D5AA 4BE1A 3AVAA 2KQ2A 4ICLA 4AHRA 4Z0UA 3ZT2A 1BI4B 4GMJB 2A1RA 2G8HA 4DF8A 4KHQA 3ZSZA 1WAJA 4DTOA 1HMVA 4NCBA 2G8IA 3SUQA 4LSNA 4JRPA 4JS5A 3V1QA 3SUPA 4F3TA 2YNHA 4DS4A 4FLUA 3QEIA 5HLFA 4EZ9A 3AO5A 3BGRA 1NJWA 2X78A 2X74A 4FJNA 4CHPA 3NF9A 4GW6A 3CQ8A 2JLEA 3ZSOA 2BE2A 1SUQA 1ZYQA 5C24A 3MXMA 2ZQBA 1RT5A 3RMBA 1B9DA 1NK9A 1WAFA 2OPRA 3UIQA 1J5OA 4FK0A 1TL1A 2A1SA 3CM6A 3HVTA 4BE0A 5KRSA 3LZJA 5SZTA 4XIUA 2DFHA 4KI6A 1WSHA 3IRXA 3AVMA 3HP6A 4YNQA 2G8KA 1RTJA 3K5OA 2ZD1A 3RMAA 3KK3A 4UQGA 1VSFA 3OYAA 5HRRA 4CIFA 3KTQA 3KKRA 3F9KA 4O55A 2RF2A 2F96A 4Y1CA 2F8SA 3JSMA 3SYZA 4B8CA 3SNNA 1N6QA 1GOBA 1HRHA 3DRSA 2XY6A 1NK7A 4DSKA 2KZMA 3NAEA 4DTJA 3KJVA 4I7FA 1HQEA 4G1QA 1ASWA 3G10A 2OZSA 1FXXA 3B6PA 4DU4A 3HJFA 3RMCA 4KFBA 4B8AB 4CJRA 4AHVA 4CEZA 4E7HA 1L3VA 3QERA 2EX3A 3SQ0A 4M42A 2YHBA 4BWMA 4FJMA 4FM1A 4Q0BA 4FW1A 5KGWA 1A5XA 4CHOA 1UA1A 1S1XA 3LALA 3I0SA 3ZSVA 3S3NA 4FJGA 3L3VA 2XY8A 4CERA 4ID5A 1QSLA 2F8TA 2HB5A 1NJXA 5E41A 3LAKA 4DS5A 1DLOA 1TVRA 4KTWA 3AVFA 3SV3A 4CJ4A 4DG1A 4FZXC 2HVHA 1VSKA 1UWBA 2DFFA 1RTIA 4DFPA 2KZZA 1B92A 1BIZA 3HL8A 4FJLA 3O4NA 1QQCA 3OYIA 4DSJA 3L2VA 1TAQA 3SQ2A 1YVUA 2B5JA 3M8RA 3AVKA 2ATQA 3AO4A 3SQ1A 5J2QA 1C6VA 3OYMA 4KHSA 4CJ3A 1S5JA 1TV6A 3DLKA 1TGOA 3HSTB 4F2SA 4CF9A 4HHTA 4CJUA 3NBPA 1SKRA 4M3YA 4E19A 4E7JA 1D8YA 1C1CA 5FDLA 3KIOA 3TAFA 1Y97A 5DK5A 3D0PA 5HP1A 3K5LA 1LAVA 3T1AA 4DWIA 2XHBA 3S3OA 5HROA 4F3OA 3AA5X 1TL3A 3U6FA 2WOMA 2OPPA 4E1MA 4BDYA 3QESA 4FLWA 1NK0A 1QE1A 1RDAA 1IKVA 1QTMA 2Q3SA 1T8EA 3S9HA 2LSNA 3L3UA 3ZSYA 2HHXA 3AVNA 4F8RA 3TABA 4O0JA 1HPZA 3RRHA 4CEOA 4CEEA 1RILA 1D9FA 3TAMA 3CFPA 1RBUA 4BWJA 5I3UA 1X9WA 4PWDA 2DY4A 3HXMA 4CEFA 3WNEA 3SUOA 2B4JA 4Q5VA 1NK4A 3RWUA 3SV4A 4CJVA 4FLTA 3TAQA 1S1UA 2PZSA 4C8OA 4KRFA 4I2QA 2QK9A 2QXFA 1RT4A 1RTDA 5FROA 4QOZB 1RDCA 3OYHA 5EU7A 1VRTA 4AILC 1SL2A 5FRNA 3EZ5A 3AVBA 4OKEA 2GBZA 3ITHA 4CHYA 3VQEA 3DYAA 4PY5A 2VWJA 1EP4A 4CF2A 4EZ6A 3DLRA 3HP9A 3OYCA 1NJZA 4FJJA 3OYEA 1CLQA 1CZBA 3OYLA 4FLVA 3LZIA 2OZMA 1C1BA 1A5VA 4Z4IA 3OYNA 3P5JA 3CFRA 3MXJA 4TSXA 1KVBA 1KLNA 2KFZA 3S3MA 2YNIA 5CZ2A 1RT1A 3SI6A 3CYMA 3VQPA 4HCBA 3KLFA 4B9VA 4M3TA 1I39A 4CFAA 5KGXA 5CY4A 3AVGA 1RBVA 4B3OA 3LP2A 4Y1DA 2X6NA 4DQSA 1D9DA 1WN7A 4FM2A 2JGUA 2E4LA 4KPYA 2D0AA 4HTUA 4E7IA 3AV9A 1RBTA 4CJFA 1NJYA 2HNZA 1UAXA 3KK2A 1L3TA 4KHNA 1JLEA 3PX6A 4KHUA 4DQQA 1S1TA 4LY7A 3KLEA 3OS1A 1BHLA 2P51A 4CESA 3QIPA 2Y1JA 3VQ5A 1RT2A 2FBVA 4L8RB 2RKIA 1W9HA 2GV9A 4HUFA 3PX0A 4KAZA 4KREA 4K8ZA 2VWKA 4KTZA 3IG1A 3WNFA 4DTUA 1TK0A 3DLBA 3KD5E 4DU1A 3VQ4A 4DF4A 4RW7A 3TAEA 2I5JA 1W0HA 1BCOA 3HYFA 4LSLA 4CK3A 4ID1A 3AVCA 4CGHA 3QNNA 2OYQA 4N56A 2YNGA 1S9EA 4DFMA 1XHZA 4RW9A 1Z26A 4Z4FA 2KFNA 1VK0A 3NFAA 4B9NA 3ALYA 1C1AA 3V9ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

4LH5A 4BC5A 1VQLN 2NUBA 4KTQA 4IO9L 2Z1JA 4FWKA 3KVGA 4CEBA 3B6OA 4FJ7A 1RT6A 3NCIA 3DRPA 1U45A 4BR0A 1VSHA 1T44A 4B3SK 2VG6A 1JCEA 2WC9A 4CZMA 1LW2A 2Y1IA 4YOWA 3ZT0A 3A5LC 4DU3A 1WSEA 2D4WA 4K25A 3J81O 1XHXA 1N8RO 2E2QA 4O4GA 4LF5K 2QEXN 2O8CA 4FK4A 2FBXA 3FFIA 5GADP 3DM2A 4CHZA 3RR7A 4DTRA 4HVJA 3KLGA 1QS4A 3H1QA 3SMPA 3EKSA 2OA8A 3V6DA 3MXIA 1TUUA 4IWVA 4DSLA 4KO0A 3CCRN 4JKCA 3H46O 1Q18A 1YIJN 1UOCA 5CYQA 2P9KA 2BGGA 3VEWA 1HQUA 1U47A 1ZBLA 4CFCA 1Q9XA 4FJ8A 3ENOA 1SKWA 3SPZA 3MCPA 4E1NA 5HRNA 3K58A 3H08A 3CC7N 3HZ6A 2WTUA 1VQ8N 1ZBHA 3SUNA 3AO3A 1WLJA 2NRWA 3LDSA 2P1JA 1VQMN 5KPTA 4JI0K 4WFNL 1JLCA 5M1QA 5BRHA 4FZZA 1IO2A 4PA1A 4DR5K 1BOTO 4CE9A 2V52B 1HNVA 1VSMA 4W5TA 1EWRA 1JXBA 4FPAA 4O44A 3ZEUA 4BREA 4YDUC 4ELTA 4ISFA 3L4QA 3AGRA 3R6MA 1OH7A 4CHNA 3K2PA 4DFKA 4KV8A 4QS9A 3VQ6A 5AZJA 3DOKA 3TANA 4CF0A 3CMEN 3C6TA 5CR4A 3LWLA 1S6PA 4N41A 4B9MA 4CJSA 4DR3K 2XY5A 3KLIA 3L2RA 4BC3A 1JJ2M 4CD3A 1JL1A 4ZHRA 2O8BA 1NGAA 4GV3A 3E9OA 2QWQA 4PKGA 4U67L 3FZFA 4FWMA 2AJQA 3RMDA 4CIEA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3KLF A;  4B9V A;  4M3T A;  1I39 A;  4CFA A;  5KGX A;  5CY4 A;  3AVG A;  1RBV A;  4B3O A;  3LP2 A;  4Y1D A;  2X6N A;  4DQS A;  1D9D A;  1WN7 A;  4FM2 A;  2JGU A;  2E4L A;  4KPY A;  2D0A A;  4HTU A;  4E7I A;  3AV9 A;  1RBT A;  4CJF A;  1NJY A;  2HNZ A;  1UAX A;  3KK2 A;  1L3T A;  4KHN A;  1JLE A;  3PX6 A;  4KHU A;  4DQQ A;  1S1T A;  4LY7 A;  3KLE A;  3OS1 A;  1BHL A;  2P51 A;  4CES A;  3QIP A;  2Y1J A;  3VQ5 A;  1RT2 A;  2FBV A;  4L8R B;  2RKI A;  1W9H A;  2GV9 A;  4HUF A;  3PX0 A;  4KAZ A;  4KRE A;  4K8Z A;  2VWK A;  4KTZ A;  3IG1 A;  3WNF A;  4DTU A;  1TK0 A;  3DLB A;  3KD5 E;  4DU1 A;  3VQ4 A;  4DF4 A;  4RW7 A;  3TAE A;  2I5J A;  1W0H A;  1BCO A;  3HYF A;  4LSL A;  4CK3 A;  4ID1 A;  3AVC A;  4CGH A;  3QNN A;  2OYQ A;  4N56 A;  2YNG A;  1S9E A;  4DFM A;  1XHZ A;  4RW9 A;  1Z26 A;  4Z4F A;  2KFN A;  1VK0 A;  3NFA A;  4B9N A;  3ALY A;  1C1A A;  3V9Z A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4LH5 A;  4BC5 A;  1VQL N;  2NUB A;  4KTQ A;  4IO9 L;  2Z1J A;  4FWK A;  3KVG A;  4CEB A;  3B6O A;  4FJ7 A;  1RT6 A;  3NCI A;  3DRP A;  1U45 A;  4BR0 A;  1VSH A;  1T44 A;  4B3S K;  2VG6 A;  1JCE A;  2WC9 A;  4CZM A;  1LW2 A;  2Y1I A;  4YOW A;  3ZT0 A;  3A5L C;  4DU3 A;  1WSE A;  2D4W A;  4K25 A;  3J81 O;  1XHX A;  1N8R O;  2E2Q A;  4O4G A;  4LF5 K;  2QEX N;  2O8C A;  4FK4 A;  2FBX A;  3FFI A;  5GAD P;  3DM2 A;  4CHZ A;  3RR7 A;  4DTR A;  4HVJ A;  3KLG A;  1QS4 A;  3H1Q A;  3SMP A;  3EKS A;  2OA8 A;  3V6D A;  3MXI A;  1TUU A;  4IWV A;  4DSL A;  4KO0 A;  3CCR N;  4JKC A;  3H46 O;  1Q18 A;  1YIJ N;  1UOC A;  5CYQ A;  2P9K A;  2BGG A;  3VEW A;  1HQU A;  1U47 A;  1ZBL A;  4CFC A;  1Q9X A;  4FJ8 A;  3ENO A;  1SKW A;  3SPZ A;  3MCP A;  4E1N A;  5HRN A;  3K58 A;  3H08 A;  3CC7 N;  3HZ6 A;  2WTU A;  1VQ8 N;  1ZBH A;  3SUN A;  3AO3 A;  1WLJ A;  2NRW A;  3LDS A;  2P1J A;  1VQM N;  5KPT A;  4JI0 K;  4WFN L;  1JLC A;  5M1Q A;  5BRH A;  4FZZ A;  1IO2 A;  4PA1 A;  4DR5 K;  1BOT O;  4CE9 A;  2V52 B;  1HNV A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1ASVA

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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