2CGJA

Crystal structure of l-rhamnulose kinase from escherichia coli in complex with l-fructose and adp.
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
479
structure length
479
Chain Sequence
TFRNCVAVDLGASSGRVMLARYERECRSLTLREIHRFNNGLHSQNGYVTWDVDSLESAIRLGLNKVCAAGIAIDSIGIDTWGVDFVLLDQQGQRVGLPVAYRDSRTNGLMAQAQQQLGKRDIYQRSGIQFLPFNTLYQLRALTEQQPELIPHIAHALLMPDYFSYRLTGKMNWEYTNATTTQLVNINSDDWDESLLAWSGANKAWFGRPTHPGNVIGHWICPQGNEIPVVAVASHDTASAVIASPLNGSRAAYLSSGTWSLMGFESQTPFTNDTALAANITNEGGAEGRYRVLKNIMGLWLLQRVLQERQINDLPALIAATQALPACRFIINPNDDRFINPDEMCSEIQAACREMAQPIPESDAELARCIFDSLALLYADVLHELAQLRGEDFSQLHIVGGGCQNTLLNQLCADACGIRVIAGPVEASTLGNIGIQLMTLDELNNVDDFRQVVSTTANLTTFTPNPDSEIAHYVALIHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords L-RHAMNULOSE KINASE
publication title Structure and Reaction Mechanism of L-Rhamnulose Kinase from Escherichia Coli.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 167
structure length 479
sequence length 479
ec nomenclature ec 2.7.1.5: Rhamnulokinase.
pdb deposition date 2006-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cgjA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cgjA02
2IVPA 2HF3A 3EKSA 3R6MA 1Z05A 4I6MA 1MA9B 3H46O 5EY4A 1BA0A 3A5OC 3FZMA 3D7EO 1K8KA 4BREA 3WEEB 5AQMA 4JD2B 2J4RA 3A0IX 4BQLA 1C0GA 1MWMA 5AQQA 3VEOA 5AZJA 1BOTO 1HUXA 2Q2RA 3C7NB 3VEXA 3A5LC 3C0BA 3CJ1A 2ASOA 1KAZA 4BGAA 5E84A 5AQUA 2A40A 1NGAA 3RSEA 1SAZA 3ZEUB 1T6DA 3ULEB 2E2OA 3FGUA 5AZJB 4FWMA 2YHYA 2FF3B 4EHUA 3VGMA 3CJCA 5AQRA 3EL2A 5EOYA 3RSEB 4BG9A 3BEXA 3WT0A 5AQTA 2YJFA 2V51B 1X3NA 3CQXA 3KZBA 1H1VA 4PL7A 2I7PA 1HLUA 2CH5A 1ZXOA 5AR0A 3R8EA 3FE1A 1YUWA 4A61A 2ZWHA 2NLXA 1HKGA 4CZGA 3ENHA 2GUPA 4H03B 2F9TA 4J8FA 3VGLA 5AQOA 1GLDG 4RTFD 4PKGA 4IZ9A 1R59O 3FFKB 2E88A 3WXLA 3DXMA 2P9NA 1J6ZA 2P9PB 2YI1A 3MMVA 3VEZA 2CGKA 4BRFA 4YDUC 5BN9A 4BG8A 5JMVA 5AZIB 3M3ZA 3SK3A 4H0TB 2FSKA 2V7ZA 3VGKA 4JNEA 3W3DA 1ATRA 3D2FB 1HPMA 2IIRA 2P9IB 3HSCA 3B8AX 3GE1A 3LDOA 3CJ7A 4BC5A 4IXCA 4K42A 4IWVA 2W41A 3EN9A 4WQ4A 1U6ZA 2E2NA 2D1KA 3L6QA 3A5MC 2GTDA 5BRDA 3U9DA 1QQNA 2YHWA 2E20A 3WXJA 1BUPA 3GG4A 1NGFA 3CJ9A 4FWOA 1Q18A 4B1XB 4CZJA 5KPRA 4FWQA 3SMSA 2F9WA 1T44A 5B8HA 4GNIA 4BR4A 2V7YA 1NGIA 5AQSA 1SZ2A 3LM9A 3TU5A 5JICA 5BR9A 1BO5O 4MO4A 2YJEA 3VF6A 2GWJA 2HOEA 5AQXA 3BF3A 3VERA 1QQOA 3FZFA 3MDQA 1SQKA 2QM1A 1QZ5A 2VCPA 4FL9A 3M1FA 1NBWA 5AQYA 4H0YB 4XH4A 3ENOA 3BUZB 3GOIA 3F9MA 3IDHA 4MO5A 4BVPA 3CERA 3D2EA 3O08A 4CBWA 1C0FA 4AM7A 3CHWA 3LM2A 3UKRB 1MDUB 4WQ4C 1S3XA 5AQZA 3ID8A 2P9SA 4CZIA 1P8ZA 3QBXA 3SJHA 1LCUA 3HTVA 4EHTA 4XH5A 1G99A 2ZF5O 2P9KA 4BC2A 4B1YB 3O4WA 1ATNA 4YDUA 4CD1A 4CBXA 4I6MB 3JS6A 4O8KA 1D4XA 1HKBA 2CH6A 4A62A 2Q0UA 1EQYA 1IG8A 4WQ5A 1HKCA 2IVOA 5BRHA 1LOTB 1GLEG 1K8KB 4MLHA 5AQKA 4QS8A 5F0XA 1GLAG 3ZX3A 2NRHA 3QICA 2QXLA 5ADXA 2ITMA 5F1XA 5ELZA 4L3QA 4QS9A 3VPZA 3L4IA 3VESA 1QHAA 3QB0A 4PKIA 1KAYA 3ATVA 2GELA 2NZTA 1X9JA 5BPMA 3IFRA 4FOIA 5EVZA 4PL8A 4A2AA 4H0PA 1X3MA 4WYBA 3AAPA 4H5RA 2D0OA 3WXIA 4BRMA 3A5NC 2CGJA 3LL3A 5FPMA 3VF2A 4PKHA 2QWMA 2ASMA 4ISFA 4FWKA 1XQSC 2Q0RA 2E8AA 3FZHA 3O80A 4BRIA 1NGBA 1GLJO 3BF1A 4BR5A 4CZFA 2WUSA 1WUAA 4BRPA 2HF4A 1Z6RA 4WQ5C 5CE3A 1E4FT 3DXMB 2P9NB 1NGGA 3MCPA 4JAXA 3CJBA 3G25A 4BRQA 4K25A 2E2QA 1E4GT 5EX5A 2QWOA 1GLLO 3JXUA 3LDLA 4B1UB 2Q31A 2D0PA 5AQHA 4BRCA 1NGDA 2BTFA 4KBOA 1TUYA 1ESVA 1TYQA 3QMLA 5KPZA 3CQYA 5TKYA 4BR2A 1OKJA 3O6WA 2P9LA 3GDQA 1JCFA 4JN4A 1WOQA 5LJVA 4EAHD 5AQPA 4BRLA 3H1VX 4DQ8A 3OHRA 4FPAA 1RFQA 4BRHA 4CJ7A 3MN5A 2QWRA 3HI0A 4M7YA 4CBUA 3KHYA 3S41A 4FSVA 1BDGA 1V4TA 4CI6A 5EXWA 5AQFA 1GLCG 4NO7A 3CETA 2UYTA 3UKUA 4IO8A 1KXPA 4BRAA 4CZEA 5JLFA 1JCEA 3CIPA 4ISEA 3GL1A 4JHDA 2BUPA 4RCHA 2V52B 4Y0WA 4XEIA 1NMDA 3ZETA 2AA4A 3WQUA 2GWKA 5KQ8A 4BR0A 3QBWA 3DWLA 2P9UA 4BRKA 2FLOA 4FWPA 2E1YA 1ZBSA 5E26A 3KVGA 1ATSA 4FO0A 5FPNA 1IJJA 3ZETB 4CZMA 3QFUA 1T6CA 3FR0A 3U4LA 1RDWX 3SMPA 3BP8A 2Q1NA 3D2EB 1XC3A 3O1BA 3EO3A 1U2VA 2H3GX 2P9UB 4CZHA 2KHOA 3H3OB 1NM1A 4B1ZA 4BRNA 2A6AA 3LDPA 2A41A 2W40A 5LY3A 3HM8A 2P9SB 4BVOA 2IVNA 3WUHA 3MK6A 3ATUA 3MN7A 4BQZA 3DAWA 3VEWA 1U2VB 3EKUA 3O5BA 2P9KB 3WEEA 1S22A 4M63C 4GY2B 4JD2A 1MWKA 3AY9A 4HWIA 1YVNA 3WXKA 2YHXA 3I33A 2DPNA 3C7NA 3DJCA 5AFUH 1TUUA 3H45C 4H5NA 4B9QA 2A5XA 2VYPA 3I8BA 4E1JA 1KAXA 2QWPA 4AM6A 5JLHA 4FWSA 3TPQA 4FWLA 1XUPO 3P4IA 4DCHA 3ZEUA 4DHYA 4H0OA 3ULEA 2HMPA 1RGIA 1DEJA 2ZGYA 2OANA 2VWBA 4M7XA 4FWNA 5AQLA 4H5WA 1NGJA 3IMXA 4BC4A 4H0XB 5AQIA 3U8XA 3H3NO 2E1ZA 4IJAA 3GBTA 4C23A 3W0LA 4FWRA 3VEYA 3FLCO 2I7NA 3QDKA 4BROA 1NGEA 4EIAA 4F9OA 3VOVA 2QWLA 2PBDA 4HTLA 3VF4A 3SLCA 5BN8A 1JCGA 2E2PA 2FXUA 3MN9A 1BG3A 4H0VB 4O5FA 2QWNA 2P9PA 4B1WB 3AARA 3LDNA 2A42A 4H5TA 2ASPA 2PAVA 3M6GA 5AZIA 3IUCA 1YXQA 4MLEA 3VENA 5F2RA 4B1VA 3H6EA 5ADXH 3D2FA 1QZ6A 2FSNA 4RWTA 3FZKA 2P9IA 3R9PA 3WQTA 4LC9B 5AQJA 1NWKA 5AQVA 5AQNA 3U9ZA 3UE5A 5BRFA 5LJWA 2QW9A 2FSJA 1CZAN 3ZX0A 1NGCA 4CZKA 4EFHA 1TYQB 4BRGA 4FOEA 5AQGA 4BGBA 2ZGZA 3HBTA 3CI5A 2P9LB 4NB4A 4ISGA 3A8YA 4QS7A 2AP1A 1YAGA 3H1QA 2FF6A 3L0QA 1DKGD 4BR9A 2EWSA 3FZLA 3HZ6A 3VETA 4BC3A 5FPDA 2Q97A 2D4WA 3LDQA 4A2BA 4BR7A 1BU6O 4Z94A 5FPEA 2A3ZA 3VEVA 4CD3A 1BWFO 4K41A 1GLBG 4H5VA 1BA1A 5BPLA 3UKUB 1HJOA 1ZC6A 4JHDB 3O8MA 5AFUA 5BREA 1GLFO 3EZWA 4FPBA 3ZX2A 1V4SA 3DXKA 3MN6A 2GEMA 5AQWA 2Q36A 3J8AA 1QQMA 2QWQA 5KPTA 5KQDA 3UB5A 3UKRA 3CJAA 1NGHA 2YCHA 4K43A 4BRDA 1Y64A 4XH1A 5I9EB 3DXKB 4CZLA 1HX1A 2CGLA 4IJNA 5BPNA 1DGKN 1NLVA 4DB3A 3QFPA 3AAQA 3O1WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DRSA 2QK9A 2HF3A 3R6MA 1ZBFA 2RE2A 3OVNA 1NOZA 2O8CA 3MECA 3H46O 4DU4A 1T03A 1NU0A 3ISNC 3PO5A 4KB1A 3A5OC 5DM6L 4DLGA 3D7EO 4OLBA 1J53A 5AQMA 4JD2B 3A0IX 2YNIA 4X65K 1LV5A 4BE1A 4AHTA 1M1KO 3MX2A 2F96A 3C7NB 1B92A 1I94K 4JI8K 5E84A 3RSEA 1SAZA 5CY4A 5AZJB 1EETA 4YOYA 5AQRA 3EL2A 3J7AP 3BEXA 3OBWA 2NRXA 1QVGM 2YJFA 4YOXA 3E66A 4GVMA 1S9EA 4ZTJA 4FVUA 3OYDA 4FLTA 3V9XA 3HJFA 4DR1K 3FE1A 1K73O 4HCBA 4A61A 2OA8A 4OPKA 3QEPA 4C1NK 3OYFA 2GUPA 1WSGA 3CXCM 2O8FA 2F9TA 2HNDA 1A5XA 1VRUA 3SV3A 5DMRA 2E88A 4LF7K 3DRPA 1C1CA 3VQAA 1SS6A 1J5EK 5AZIB 4E7JA 5FDLA 1ATRA 3D2FB 2GX9A 3LZJA 3SV4A 5C15A 2P9IB 1RDBA 3HSCA 3B8AX 4TSXA 1XWLA 4KREA 4DQRA 4CFBA 4WFBL 1RT6A 4DSEA 3AVBA 4DSFA 1MU2A 5BRDA 2YHWA 1C6VA 3WXJA 4DS5A 5HRNA 5JS1A 5M1FA 3SUNA 2F9WA 1T8EA 4GNIA 4BR4A 1NGIA 5AQSA 4ILGB 1VQ7N 1J54A 4KPYA 4KI6A 4HUEA 2VCPA 3L3VA 4W5TA 4LSNA 4H0YB 4DTRA 3GOIA 4FW1A 4CGFA 3CERA 3D6RA 1C0FA 1TL1A 3LM2A 4CHYA 3AVMA 4E1NA 1S3XA 2YX6A 4KAZA 3QBXA 3ZSWA 3G71N 3MX5A 3AA4A 1G99A 2ZF5O 5C25A 4LH5A 1W97L 3HP6A 5J2NA 4YDUA 4CD1A 4CERA 3C65A 3CD6N 4A62A 2CH6A 4CF1A 4CJKA 3HPGA 3NGZA 1KCFA 1Q9YA 1VQ5N 1ASUA 1HKCA 2IVOA 4PY5A 3G6EN 1GLEG 4B8AB 3K58A 4E7IA 3CCUN 3Q7BA 2NRHA 4YY3K 3WNHA 4CJEA 3SCXA 5ELZA 3M8RA 3VA0A 4CIEA 3VPZA 1QHAA 2PY5A 4A5AA 4JKCA 4CHQA 2KZZA 4JI5K 3E9OA 3MXJA 3ATVA 1S1XA 4FOIA 4CGHA 2HW3A 1X3MA 1N8RO 2XHBA 4CHNA 3BGRA 3A5NC 3LL3A 1X9MA 1UWBA 1WB9A 1EWQA 1QTMA 2ASMA 4JKGA 3C94A 4FWKA 1XQSC 3PSIA 3V9UA 2ZJRL 2E8AA 4ELVA 4K8ZA 1ASWA 3RMAA 4FZZA 2O8DA 1NGGA 2P9NB 3DXMB 1YVUA 2RKIA 3T1AA 4JAXA 4GKKK 2BANA 3SAHA 4O0JA 4M3UA 1NGDA 4DR3K 2BTFA 2ZE2A 3QNNA 3DLGA 1U49A 1FXXA 1WLJA 1NMNA 1OKJA 2F4VK 4HCCA 2P9LA 1WSEA 1JCFA 1WOQA 1Z25A 4JKEA 3JYTA 3OHRA 3K57A 3NH1A 4CJ7A 1JL1A 5HRSA 4CBUA 4A59A 1XHZA 1BDGA 5I3UA 2W6LA 5AQFA 3THWA 3CETA 2UYTA 3OW2M 1VSEA 3C6TA 3AA2A 3MWTA 3CC4N 4IO8A 4IOCL 1KXPA 2HBMA 4CZEA 5JLFA 4FJ8A 1HYVA 3DYAA 4JHDA 1S1WA 4XEIA 1TGOA 4CJLA 3VQPA 1NK5A 1VQ4N 3AVHA 2D5RA 3AVAA 4CK1A 2P9UA 4AH9A 4PQUA 2FLOA 4FWPA 5K14A 3KWIA 4CZMA 1OH7A 4OKJA 3U4LA 3SMPA 5MLCQ 3THXB 1N33K 3D2EB 2WBNA 1NKEA 4WFAL 1FW6A 1QE1A 2X74A 3AO1A 3S9HA 2Z1JA 4EP4A 4E7HA 5LY3A 3HM8A 2BH1A 3ATUA 3L2QA 3B6OA 3O5BA 3NF6A 1CZ9A 1MWKA 5AFUH 1TUUA 3H45C 4B9QA 1WSHA 3I8BA 1VAZA 4AM6A 1W2BM 4FWSA 4CK3A 2B5JA 3ZSRA 4FK4A 3QIOA 3MWPA 4H0OA 4R79A 3ULEA 4IEIA 1T05A 3HM9A 1IKVA 3LAMA 2OANA 4M7XA 4KV8A 3WNFA 3KK3A 5AQLA 3WNEA 1TAUA 4FK2A 1RDAA 1TK5A 2G8VA 4DFMA 4FWRA 3VEYA 3FLCO 5BR8K 3K5LA 2I7NA 3QDKA 1NGEA 1WN7A 2HHXA 1XNQK 1OVQA 1TL3A 4N76A 2QEXN 4K0KK 5GIOA 5J1EA 3OYLA 5BN8A 3ZT1A 3I0RA 4KHWA 1JCGA 3CFOA 3WNGA 5FLXO 1QSYA 4H0VB 3KKSA 4O5FA 2QWNA 2QA4N 3AARA 4H5TA 2ASPA 1VQ6N 3VENA 5GAGP 3RMBA 3TI0A 3NH2A 1Q7YO 3C6AA 3C6HA 3FZKA 4HUFA 3V6DA 3TSQA 5AQJA 1JXEA 3LALA 1K8AO 4LSLA 5AQNA 2HNZA 3UE5A 5BRFA 2I5JA 4FJ5A 2HNYA 4KB0A 4CZKA 4GV9A 3F2KA 1ZBIA 5J2QA 3NMUA 1RBUA 2ZGZA 4BGBA 2G8WA 2DY4A 4DV5K 1OH5A 4XIUA 4ISGA 1N34K 3OY9A 2E4LA 3CM6A 1RT7A 3OJSA 3VETA 3G4SN 4DTPA 1BL3A 5GINA 1EO1A 3DLEA 2D4WA 4HUGA 4OPJA 3KD5E 1LWCA 1LW2A 4MDBA 3P5JA 3ALYA 4UQGA 1HJOA 4LF6K 1N36K 3O8MA 2O4GA 1EKEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2JWL A;  1KSP A;  2QW9 A;  3AVG A;  3SQ1 A;  4EFH A;  1ZBL A;  1WSJ A;  1JLE A;  3TTF A;  4BRG A;  3DLB A;  4FOE A;  4ZTF A;  3KLE A;  1NJX A;  3CI5 A;  4NB4 A;  1ZYQ A;  1JLG A;  4DFP A;  2FBX A;  4LY7 A;  3SBG A;  3RR7 A;  1DKG D;  3QO9 A;  3T3F A;  2YHA A;  2XY8 A;  1RIL A;  4KH4 A;  2W6K A;  3LDQ A;  4A2B A;  2QI2 A;  4MDA A;  4BR7 A;  4DQI A;  1HNV A;  1BU6 O;  3HP9 A;  2NRV A;  3VEV A;  1DT9 A;  1BWF O;  4IBN A;  2JWK A;  3CCL N;  4K41 A;  4CJV A;  3MEE A;  4H5V A;  5BPL A;  4CEF A;  4NCA A;  4CEO A;  2IDO A;  4BDZ A;  3VQ7 A;  5KTQ A;  4FPB A;  1VQL N;  2HBK A;  3MED A;  4OGC A;  3DXK A;  3MN6 A;  4JK8 A;  4JI6 K;  3L3U A;  1UA0 A;  5KPT A;  5KQD A;  2YNG A;  1IBK K;  5A2Q O;  1RTD A;  3CJA A;  3VQ8 A;  3K5N A;  1FJG K;  2YCH A;  3O9T A;  2W42 A;  4W5N A;  4FM2 A;  4XH1 A;  1HX1 A;  2CGL A;  2EHG A;  3KKR A;  4Z4I A;  4IDK A;  3QFP A;  3L8B A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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