2CGJA

Crystal structure of l-rhamnulose kinase from escherichia coli in complex with l-fructose and adp.
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
479
structure length
479
Chain Sequence
TFRNCVAVDLGASSGRVMLARYERECRSLTLREIHRFNNGLHSQNGYVTWDVDSLESAIRLGLNKVCAAGIAIDSIGIDTWGVDFVLLDQQGQRVGLPVAYRDSRTNGLMAQAQQQLGKRDIYQRSGIQFLPFNTLYQLRALTEQQPELIPHIAHALLMPDYFSYRLTGKMNWEYTNATTTQLVNINSDDWDESLLAWSGANKAWFGRPTHPGNVIGHWICPQGNEIPVVAVASHDTASAVIASPLNGSRAAYLSSGTWSLMGFESQTPFTNDTALAANITNEGGAEGRYRVLKNIMGLWLLQRVLQERQINDLPALIAATQALPACRFIINPNDDRFINPDEMCSEIQAACREMAQPIPESDAELARCIFDSLALLYADVLHELAQLRGEDFSQLHIVGGGCQNTLLNQLCADACGIRVIAGPVEASTLGNIGIQLMTLDELNNVDDFRQVVSTTANLTTFTPNPDSEIAHYVALIHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords L-RHAMNULOSE KINASE
publication title Structure and Reaction Mechanism of L-Rhamnulose Kinase from Escherichia Coli.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Transferase
total genus 167
structure length 479
sequence length 479
ec nomenclature ec 2.7.1.5: Rhamnulokinase.
pdb deposition date 2006-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cgjA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cgjA02
3CJ1A 3UKUB 3MN6A 2P9KA 4RTFD 3QBXA 4CBWA 4BRMA 4IJNA 5EY4A 4CI6A 2AA4A 3TU5A 3EZWA 2P9PB 2HF4A 3LDOA 2E2QA 3M1FA 4BRDA 5AZJA 4CZMA 3FZMA 4CZFA 5AQGA 3UKRA 1BOTO 4FL9A 4F9OA 2CH6A 1YUWA 2QWQA 1MWMA 5EXWA 3VF6A 3AY9A 1D4XA 3A5LC 3VETA 5E26A 4AM7A 3C0BA 1HKBA 1JCEA 2D4WA 4XH1A 2E20A 2EWSA 3VEZA 5AZIA 3ZETB 3ENHA 3CJAA 4B1XB 3O08A 3ZEUB 3BUZB 1Z05A 2YHXA 3QFPA 4H0OA 4JD2B 4CZLA 3A5NC 3WXKA 1BWFO 4H0XB 3CIPA 4RWTA 5BRHA 3L6QA 1NGCA 3ENOA 2GEMA 2ZGZA 1ESVA 5KPZA 4I6MB 1IJJA 1HUXA 1JCGA 3VEXA 2WUSA 2V7YA 5FPNA 1CZAN 4MLHA 4WQ4C 3VEVA 3VF4A 2I7PA 1LCUA 3A8YA 5AQJA 4BC5A 3UKUA 4B1UB 3I8BA 2DPNA 1WUAA 3EN9A 3WXIA 2IIRA 2A42A 4PKIA 1RFQA 4PL8A 2P9PA 2FF6A 4A2BA 3BP8A 5TKYA 4WQ4A 4YDUC 5E84A 5BRFA 2CGKA 3SJHA 1MDUB 2GWKA 3ULEA 2IVNA 2P9KB 2AP1A 3LM9A 1U6ZA 1WOQA 3SMSA 3ZETA 2J4RA 5AQQA 4FWRA 5BR9A 4MLEA 4FWLA 1K8KB 4O8KA 3ZEUA 5JICA 4B1ZA 5BPLA 4M7XA 3SMPA 4JD2A 3WT0A 5AQXA 4BRQA 3FZLA 2V51B 1HX1A 3HM8A 5LJVA 3UKRB 2A41A 1KAYA 4YDUA 4BRIA 4FO0A 4I6MA 1OKJA 1GLBG 2V7ZA 3HBTA 3JXUA 2A5XA 5EX5A 3A5OC 3L0QA 2Q0RA 2A40A 1GLJO 4H5RA 4QS8A 2V52B 5F2RA 3U9DA 5AZIB 3SLCA 4EFHA 4NB4A 2E8AA 4ISFA 2ASPA 1C0GA 1NGJA 5FPDA 2VYPA 1XUPO 3VEYA 4O5FA 4BRAA 4CBUA 1NMDA 1YAGA 3AAQA 3LDQA 4HWIA 1SQKA 1GLFO 1Z6RA 3W0LA 3HI0A 4IXCA 3DXMA 4MO5A 2VCPA 1GLDG 1NGIA 2Q97A 4CZKA 4CZJA 1XQSC 2P9UA 1NGFA 3FZHA 4IWVA 1BO5O 4BRPA 2PBDA 3EKSA 3DXKB 4LC9B 4PL7A 3I33A 3QMLA 3H1QA 3F9MA 3MCPA 1MA9B 2BTFA 1NLVA 4A62A 3GE1A 2P9LB 5JLHA 4FWNA 2QWOA 2QWPA 4BRNA 1K8KA 4A2AA 4BRKA 3WEEB 3EO3A 3R6MA 4FPAA 4KBOA 2GTDA 1G99A 1HJOA 5AFUA 1MWKA 3CJ9A 2D1KA 4BRHA 3ULEB 5AFUH 3LDNA 5AQSA 4BC3A 3O80A 4H0VB 1S3XA 4FOIA 4WYBA 5AQKA 3WXLA 4CZEA 2FLOA 3IMXA 2YI1A 4EIAA 1HPMA 1TYQB 3MN5A 3WUHA 3CERA 2QWNA 2ITMA 4JHDB 4CJ7A 3M6GA 4BQZA 1KAXA 4K42A 4EHTA 2OANA 3C7NA 4FWOA 4MO4A 3QBWA 4BGAA 2NZTA 3O5BA 5BPNA 1QZ5A 3U8XA 4FWSA 3SK3A 4B1VA 1V4TA 1T6CA 3O8MA 4K43A 2E2NA 3MN7A 4EHUA 3ZX0A 5FPEA 3DXKA 2Q36A 2YHYA 4K41A 2NRHA 5AQTA 1E4FT 2BUPA 3EL2A 1HLUA 3KVGA 3R8EA 2ASMA 3VGKA 2P9LA 3H45C 4M7YA 4BQLA 4CBXA 4H0PA 1HKCA 3DXMB 1BU6O 4BREA 3WEEA 3GOIA 3G25A 3AARA 1TUYA 2KHOA 4FWQA 3U9ZA 3S41A 2P9UB 3CJCA 4B1WB 4H0YB 4DB3A 1RDWX 4GNIA 4DCHA 1KAZA 2Q2RA 3HSCA 4BRGA 3BF1A 4RCHA 3FFKB 3W3DA 2D0OA 4GY2B 5LY3A 4H5NA 2A6AA 2HMPA 4HTLA 1NGAA 3VOVA 2GUPA 4IO8A 5BN9A 1TYQA 3H46O 3RSEA 4JHDA 4WQ5C 3ATUA 1BA0A 1Q18A 5BPMA 1YVNA 3U4LA 1P8ZA 3MN9A 1T6DA 2E88A 1J6ZA 5AQNA 1E4GT 1U2VA 4BRCA 5ADXA 3TPQA 1QHAA 2ZWHA 1LOTB 1X3NA 3GBTA 3CQYA 5AQOA 5AR0A 1T44A 2QW9A 4FPBA 1X3MA 4WQ5A 3EKUA 2HF3A 1X9JA 5AQWA 3O4WA 3O6WA 3C7NB 3ZX2A 2IVOA 2VWBA 4QS7A 5AQVA 3LDPA 3AAPA 3CJ7A 3FLCO 3IDHA 1XC3A 3ZX3A 2ZF5O 3GG4A 1GLEG 5KQDA 4BR0A 5AQLA 1ATSA 4CD3A 2FSKA 5I9EB 5AQRA 4DHYA 2ASOA 1H1VA 3M3ZA 3R9PA 4B1YB 5EVZA 2D0PA 2CGJA 5F1XA 2YJEA 2CGLA 1ATRA 3CQXA 3H1VX 5AQYA 4BG9A 2Q1NA 4XH5A 4L3QA 1HKGA 3FZFA 2E2OA 3ID8A 1Y64A 3DWLA 5KQ8A 4CZHA 4DQ8A 3UB5A 1GLLO 2HOEA 2QWLA 3P4IA 4FWKA 3D2FB 1NGBA 2E1YA 3KHYA 5LJWA 4ISGA 3VGMA 1SAZA 5B8HA 1NBWA 3A5MC 3ATVA 1BG3A 3BEXA 3WQUA 3O1WA 4BGBA 1DEJA 5ELZA 5F0XA 4FWMA 1BDGA 2P9IB 1YXQA 3FR0A 4XEIA 2UYTA 1QQNA 1GLAG 3RSEB 4M63C 5JMVA 5CE3A 2P9NB 4K25A 4QS9A 3IFRA 3CETA 2CH5A 3HZ6A 4C23A 2E1ZA 4FSVA 3KZBA 2GELA 3JS6A 3D7EO 2FXUA 2QM1A 1U2VB 2F9WA 5BREA 1ZC6A 4BG8A 5AQFA 1QZ6A 4H0TB 1JCFA 2QXLA 5JLFA 5AQHA 5BRDA 4H5VA 2H3GX 4FOEA 3VESA 2P9SA 3VEOA 1DGKN 3QB0A 2GWJA 1TUUA 3D2EB 5AQZA 4CD1A 1NWKA 4Y0WA 5EOYA 3H6EA 1R59O 3LL3A 4IJAA 3FZKA 4BRFA 3D2FA 3OHRA 2QWMA 1NGDA 1QQOA 3BF3A 2E2PA 4BR5A 4BRLA 5BN8A 3CJBA 4PKHA 4BR4A 3VF2A 1S22A 1SZ2A 4Z94A 1DKGD 1BA1A 2NLXA 4CZIA 4H5TA 1C0FA 1IG8A 5AQMA 2Q0UA 3WXJA 1ZBSA 2P9IA 1QQMA 2I7NA 4A61A 2YHWA 3H3NO 4JN4A 1ATNA 2W40A 3CI5A 3FE1A 3MMVA 4XH4A 4BR7A 2P9NA 3L4IA 5KPRA 3DJCA 2PAVA 4J8FA 2F9TA 4NO7A 2IVPA 3A0IX 1NGGA 2A3ZA 3QDKA 5FPMA 4AM6A 2ZGYA 4BR9A 3FGUA 4H5WA 4BVPA 4IZ9A 1NGEA 1RGIA 3DAWA 4JNEA 3MDQA 4BVOA 3VERA 5AZJB 5ADXH 1ZXOA 3MK6A 4JAXA 1KXPA 3VGLA 4BROA 4EAHD 2FSJA 3O1BA 4H03B 3QFUA 3GL1A 1GLCG 3D2EA 2QWRA 3J8AA 3H3OB 1V4SA 4E1JA 4BC4A 3VEWA 2FF3B 4BR2A 3VPZA 2Q31A 3QICA 3VENA 3LM2A 4PKGA 4B9QA 4BC2A 3GDQA 3LDLA 4FWPA 4CZGA 2P9SB 4ISEA 1NM1A 5KPTA 1NGHA 1EQYA 3UE5A 5AQUA 2YJFA 3CHWA 2FSNA 3IUCA 3B8AX 1BUPA 3WQTA 2W41A 2YCHA 5AQPA 5AQIA 3HTVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LWEA 1NOZA 2EX3A 4DSFA 4ID1A 2P9KA 1IO2A 3EE9A 5SZTA 2HHWA 4BRMA 4CI6A 4W5TA 1VQNN 2O8BB 4CEEA 1S72N 3MX5A 3EZWA 3TSUA 2HF4A 3M1FA 5AZJA 4CZMA 1BQNA 4FL9A 2CH6A 2QWQA 4HCCA 4ELTA 5EXWA 3DM2A 4E7KA 3HM9A 1EKEA 1FXXA 3A5LC 1JCEA 1W9HA 1QTMA 2EWSA 4B1XB 5AZIA 4C8MA 3ZT4A 3ZEUB 2ZJRL 3BUZB 3WXKA 1TK0A 4NCBA 1U4BA 4M3YA 4B9SA 4LH5A 5BRHA 3TAPA 5KPZA 3SPZA 1CXUA 4DLEA 1IJJA 3VEXA 1NJZA 3DLKA 5FPNA 5HRNA 2HHTA 1K6YA 2ZJPL 2I7PA 3J80O 4N56A 5GAGP 1LCUA 5M1NA 5AQJA 4I9LA 1J54A 4HHTA 2DPNA 4AHTA 1UOCA 1WUAA 4B3TK 1VSJA 2KZZA 1HNVA 1J5OA 1RFQA 2FF6A 4A2BA 1O1WA 5TKYA 3ZSXA 4E7HA 1VSLA 4YDUC 5BRFA 3SV4A 4WFNL 5J2NA 3NFAA 3QEXA 4DKWA 2P9KB 1REVA 4K8ZA 3RMDA 5M1FA 4FWRA 4MLEA 4BDYA 4O8KA 4B1ZA 4JKEA 3QEPA 4DV0K 1RBTA 4JD2A 4FJ5A 5AQXA 4N76A 2V51B 1QQCA 3QIOA 3HM8A 3E9LA 4FO0A 4I6MA 1OKJA 4I9QA 4G1QA 4X64K 3V9ZA 1OVYA 4X66K 4E19A 5AZIB 2P5GA 3E1YA 1RILA 3SYZA 1NG9A 4CGIA 3PSFA 4AHSA 3NH0A 1XUPO 2HHXA 4N47A 4CJUA 3AAQA 4HWIA 5GAEP 3VQ9A 4PUOA 1W0HA 3HI0A 1QS4A 3I0RA 1GLDG 2O8CA 3PO5A 2YKNA 2I5JA 3RRHA 4CK1A 4JS4A 4IDKA 1NGFA 3EKSA 2YNGA 3I33A 1BI4A 1OH5A 1C1CA 2P9LB 4DTOA 1YVUA 2QWPA 3PX4A 1VRTA 1KVBA 1SKSA 1C0MA 1K8KA 1VQ8N 2DFEA 1CLQA 4KBOA 3QEVA 4F8RA 2NRVA 2FBYA 1RCHA 4RW7A 4FM2A 2D1KA 4BRHA 5T7BA 2QA4N 4AHRA 3LDNA 4DTMA 4E89A 1VSDA 5J2MA 1BQMA 4CHQA 1W7AA 3V1RA 1TYQB 3OYLA 3ASMA 4AHUA 4K42A 4EHTA 2OANA 3C7NA 2NZTA 4JKGA 4H4MA 3SUNA 5BPNA 2QKBA 3RR7A 2VG6A 4B1VA 4IG3A 5IWAK 3ZX0A 5KGXA 3QEIA 3K5MA 4FZXC 3H45C 3ITHA 3C6UA 2B4JA 3ZSVA 1HKCA 4HCBA 3GOIA 1WLJA 3G25A 1TUYA 3LWMA 1I94K 4AHCA 3K58A 4GVEA 3J7AP 1BL3A 3BY5A 5HRRA 1RDWX 1KVAA 4GNIA 4F4KA 3G6EN 4K8XA 3KD1E 4B9VA 4BRGA 1UA0A 3BF1A 1CZ9A 2D0OA 4L8RB 1JLBA 2HMPA 1RNHA 4DTSA 2GUPA 4DFJA 3NF8A 3TTCA 4BE2A 3LPTA 4JI6K 2HNYA 3AVFA 4OKJA 3PX0A 3ATUA 1Q18A 1JXEA 1NK0A 3QNNA 1VQ5N 2VGMA 5C12A 1P8ZA 3OY9A 1T6DA 2QXFA 1J6ZA 3TPQA 3WNEA 1LOTB 1X3NA 4FJIA 5CZ1A 4DTXA 2P1JA 3L2WA 4WQ5A 2HF3A 2OCEA 3R1XA 3O4WA 3C7NB 2IVOA 4CK3A 1HYSA 2YHAA 3AO5A 1XMQK 1Q9XA 3U6FA 2Y1JA 4FCYA 1XHXA 5IT9O 2NRWA 4YOWA 3GG4A 1RTHA 5KQDA 1ZYQA 3CCVN 1ATSA 4DHYA 5JVGL 1H1VA 3M3ZA 4B1YB 4B08A 1ZBHA 2YJEA 3H1VX 1ATRA 4JKAA 3TAEA 4XH5A 4L3QA 1RTDA 3PLAA 4PWDA 3F73A 4DF8A 2UU9K 4DQ8A 3UB5A 2HOEA 2QWLA 4KHQA 4CIGA 2G8VA 3P38A 3KHYA 4B3MK 4OKKA 3RVCA 4C8NA 4M41A 5B8HA 2QI2A 3WQUA 4BGBA 5F0XA 1BDGA 2P9IB 3VQ8A 3CCQN 4J2DA 3AO3A 2GV9A 4M63C 3ZSOA 2P9NB 4JI4K 4YOTA 2KZMA 1R0AA 4FK0A 3T69A 2GELA 2QKKA 1KQSM 3EYZA 1J5EK 5BREA 1ZC6A 1RTIA 4PQUA 4BG8A 2ZD1A 4C1NK 3ULDA 4GV3A 1VAZA 1JCFA 3PUFA 4LY7A 4H5VA 1E3MA 1CXQA 2KFNA 4CFCA 3VEOA 3TABA 1VSFA 3K57A 4IOXA 4FVUA 3OYKA 3SCXA 1TUUA 1VQPN 1R59O 4BRFA 2FC0A 1N36K 1VQLN 1YITN 1RTJA 4LF5K 2PYLA 1X1PA 2NRXA 3ZT0A 1TGOA 4BR4A 4OPJA 4IO9L 4DWIA 3O3HA 4F2SA 4Z94A 1RT4A 1BIZA 1JLFA 4W5OA 4CGJA 5D3GA 1VQ9N 1QQMA 2I7NA 1TV6A 3G10A 1Q7YO 3MMVA 3DJCA 3SV3A 2F9TA 4NO7A 5I42A 3A0IX 2A3ZA 3QDKA 4BR9A 2WTUA 3FGUA 3THYA 4KPYA 3VQCA 4JNEA 1U45A 3MDQA 3E9PA 4DLGA 3VERA 1BIUA 1WSFA 3D0PA 1NK7A 2FSJA 1TL1A 4DV2K 1GLCG 3HVTA 2QWRA 3H3OB 1V4SA 4WE1A 4DS4A 4JRQA 5DM6L 2NRZA 2Z1GA 2PZSA 1FW6A 3QICA 3VENA 1S1VA 2HHHK 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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