2CGJA

Crystal structure of l-rhamnulose kinase from escherichia coli in complex with l-fructose and adp.
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
479
structure length
479
Chain Sequence
TFRNCVAVDLGASSGRVMLARYERECRSLTLREIHRFNNGLHSQNGYVTWDVDSLESAIRLGLNKVCAAGIAIDSIGIDTWGVDFVLLDQQGQRVGLPVAYRDSRTNGLMAQAQQQLGKRDIYQRSGIQFLPFNTLYQLRALTEQQPELIPHIAHALLMPDYFSYRLTGKMNWEYTNATTTQLVNINSDDWDESLLAWSGANKAWFGRPTHPGNVIGHWICPQGNEIPVVAVASHDTASAVIASPLNGSRAAYLSSGTWSLMGFESQTPFTNDTALAANITNEGGAEGRYRVLKNIMGLWLLQRVLQERQINDLPALIAATQALPACRFIINPNDDRFINPDEMCSEIQAACREMAQPIPESDAELARCIFDSLALLYADVLHELAQLRGEDFSQLHIVGGGCQNTLLNQLCADACGIRVIAGPVEASTLGNIGIQLMTLDELNNVDDFRQVVSTTANLTTFTPNPDSEIAHYVALIHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords L-RHAMNULOSE KINASE
publication title Structure and Reaction Mechanism of L-Rhamnulose Kinase from Escherichia Coli.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Transferase
total genus 167
structure length 479
sequence length 479
ec nomenclature ec 2.7.1.5: Rhamnulokinase.
pdb deposition date 2006-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cgjA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cgjA02
3EZWA 1Q18A 2A5XA 2D4WA 2GWKA 1ATRA 5KPZA 3HZ6A 4H0VB 5BR9A 1BA0A 4K41A 4BRIA 4EFHA 3RSEB 5JMVA 2E1ZA 4BRQA 1JCGA 3O08A 4BRLA 4QS7A 1SQKA 2WUSA 3W0LA 3WXKA 5AQUA 3U8XA 3ENOA 3JXUA 2AA4A 4PKIA 5B8HA 4FWRA 2P9KA 4BGBA 2P9SB 3O1BA 1NGEA 2QWOA 4JD2A 4BQZA 2P9KB 2QWQA 2QWLA 3LDNA 3VEXA 1EQYA 4FOEA 4K25A 3SJHA 2GEMA 3DXKB 1BG3A 1SZ2A 5I9EB 1R59O 1HUXA 3TU5A 3WXIA 3OHRA 4YDUC 4BVPA 3ZETB 4CZIA 4M7XA 4BRCA 3C0BA 2YJFA 4IWVA 4F9OA 4CZEA 5BPNA 4L3QA 1D4XA 3WEEB 3MN9A 4WQ4A 3W3DA 3VGMA 2EWSA 1QQOA 3VGKA 5AFUH 2Q36A 4PL8A 5EVZA 4A62A 3KVGA 1S3XA 5BRHA 3AY9A 2V52B 4K43A 4CZLA 3CQXA 2GUPA 3H46O 4BC3A 1WOQA 3CETA 3WQTA 4FPAA 5AQYA 2YCHA 1T6DA 4WQ4C 5AQRA 5BPMA 2P9UA 2A42A 3FLCO 2FXUA 1MDUB 4FWKA 5EXWA 1MA9B 3ATVA 1ZC6A 2J4RA 4BC2A 1BO5O 1IG8A 3QMLA 3LDPA 4B1VA 1K8KA 1BA1A 2PAVA 3O5BA 2A41A 5FPMA 4CZGA 4BR0A 1YUWA 2VWBA 1DGKN 2VYPA 1NGAA 4DB3A 3D2FA 1E4FT 3VENA 1BDGA 3R6MA 5E84A 2GWJA 4A2BA 5E26A 2OANA 4K42A 2V7ZA 3MCPA 5AQLA 3O6WA 1TUYA 1U2VB 1T44A 3GOIA 5BRFA 1S22A 1SAZA 4XH1A 3ZEUA 2P9NB 2DPNA 1TYQB 4CBXA 4FOIA 3ZEUB 4RCHA 1NGCA 4FWLA 1NWKA 2E2QA 3A8YA 3GG4A 5AQSA 1JCEA 1X3NA 1NGBA 1HX1A 3IMXA 3IUCA 5AQKA 1QZ6A 2BTFA 2CGKA 3EN9A 4XEIA 1Z6RA 5AQWA 3U4LA 3DWLA 5AQHA 1GLLO 2E2OA 5AQIA 5AQNA 4WYBA 4IZ9A 5BN9A 2QXLA 5ELZA 2ASOA 3CERA 5AQGA 3WQUA 3WXJA 4AM6A 1Z05A 1GLAG 1NGJA 3U9ZA 4BREA 4B1XB 4Z94A 1ZBSA 3QICA 3C7NB 3UKUA 4BRPA 5F1XA 3QBWA 1QQMA 2D0PA 3EL2A 3AARA 2GELA 3GE1A 2W41A 2Q1NA 3ULEA 2QM1A 4H5VA 3ZX2A 4BVOA 3VF2A 3CJBA 3VEWA 3O4WA 5AFUA 3DAWA 4LC9B 4XH5A 2FSNA 4BGAA 3HM8A 2KHOA 4KBOA 1C0GA 1GLEG 2CH5A 4DHYA 5AR0A 4JD2B 4BRGA 3TPQA 4B1WB 2IIRA 3FFKB 3BF1A 3A5MC 3VEYA 3L4IA 3MN6A 4CZFA 3VERA 2D1KA 4H5NA 5AQZA 5AZJA 4CD3A 1RGIA 2FF3B 2NZTA 4BR9A 1BUPA 3MDQA 1NGFA 2IVNA 4E1JA 5BRDA 1V4SA 2E2NA 3A5LC 3CJ9A 4H0XB 2FSKA 4CJ7A 2E20A 3O80A 5FPDA 5AZIA 2E2PA 4BR4A 1HJOA 5ADXA 1CZAN 2I7NA 3VOVA 3L0QA 4MLHA 3ZX0A 1KXPA 4ISGA 4H0YB 2A3ZA 4H5RA 5BPLA 3CJCA 2ZGZA 4FWNA 4WQ5A 3DXMA 2CGLA 1NM1A 1YAGA 3ZX3A 1IJJA 3UKRA 4FWSA 3DXMB 2P9UB 2ZF5O 1RDWX 2BUPA 1J6ZA 3H6EA 4QS8A 2H3GX 4CBUA 3CI5A 3MK6A 1XQSC 3VPZA 1HKGA 3BP8A 3FR0A 4BROA 4BRMA 3AAPA 5ADXH 2HOEA 2IVPA 2FLOA 5KQ8A 1K8KB 1NGIA 3GL1A 3VETA 4BR2A 3WT0A 3VEZA 3LM9A 2W40A 5AQTA 1HKCA 4EHTA 3KHYA 5F2RA 2Q2RA 2PBDA 3D2FB 4Y0WA 1KAYA 1QQNA 3FZKA 3M6GA 2FSJA 3H3NO 1QZ5A 4H5WA 2QWPA 3CJAA 1C0FA 3P4IA 1NBWA 5AQFA 2D0OA 3QDKA 3A5OC 2ZGYA 2ASMA 4GY2B 3WXLA 4PKHA 1NGGA 4ISFA 3SLCA 3LL3A 4H0PA 4IJAA 1GLJO 1NMDA 3BEXA 1GLDG 4BC5A 1X9JA 3G25A 3B8AX 3A5NC 4BG8A 1RFQA 1MWKA 1LOTB 3FZFA 4IJNA 1NGDA 2P9IA 3H1QA 3U9DA 1T6CA 4HWIA 3WUHA 3VGLA 4RTFD 4BRNA 4B1UB 2QWMA 3M3ZA 4EAHD 4NB4A 3FGUA 2P9PA 2QWRA 2A6AA 1LCUA 4J8FA 4BR7A 4EIAA 4CZHA 2VCPA 3HBTA 3LDQA 3UKUB 4BC4A 5EX5A 2E1YA 3UE5A 4BRFA 4BR5A 4BRDA 1H1VA 4A2AA 4M63C 1ATSA 4IO8A 5TKYA 1KAZA 4IXCA 3QFPA 4MO4A 4GNIA 4CI6A 3ULEB 2YI1A 2F9WA 4NO7A 1GLCG 1YVNA 2HF3A 3R8EA 2IVOA 2Q0RA 3EO3A 3F9MA 3L6QA 4FWPA 3RSEA 3SK3A 2QWNA 5AQXA 1QHAA 3GBTA 3EKSA 3IFRA 3AAQA 3HI0A 2V51B 3VF4A 4YDUA 2Q31A 3QB0A 4CZJA 5KPTA 1X3MA 2P9SA 1MWMA 4RWTA 1BU6O 5EY4A 5AZJB 4DCHA 3I33A 1ATNA 4O5FA 4BRHA 3MN5A 3DXKA 1DEJA 4FWMA 4ISEA 1NLVA 3HSCA 1V4TA 4H03B 3ID8A 2E8AA 2F9TA 4BQLA 4EHUA 4FPBA 3ZETA 3SMSA 5AZIB 1XUPO 2A40A 3R9PA 3SMPA 3A0IX 3BF3A 4FO0A 3LM2A 3WEEA 4H5TA 4PL7A 3QFUA 4JN4A 2ITMA 4FSVA 4AM7A 4XH4A 2GTDA 1GLBG 5FPNA 5AQVA 5BREA 1XC3A 3UKRB 2Q0UA 3H1VX 1G99A 4B1ZA 2ZWHA 2AP1A 2ASPA 1Y64A 5AQQA 3CHWA 4B1YB 3D2EA 4O8KA 2Q97A 3HTVA 5KPRA 3DJCA 3D2EB 4FWQA 3CIPA 1ESVA 4M7YA 4CD1A 3H45C 4WQ5C 4JNEA 1ZXOA 2CGJA 2I7PA 3H3OB 4C23A 3M1FA 3BUZB 5AQJA 5AQMA 1U6ZA 4QS9A 2P9LA 3O8MA 4I6MA 5AQPA 4BG9A 5KQDA 3FZMA 3VESA 1JCFA 2P9LB 1BOTO 5LY3A 4I6MB 1GLFO 3S41A 2YJEA 3FE1A 4BRAA 3LDOA 4FWOA 3J8AA 4MLEA 3I8BA 4B9QA 3KZBA 1BWFO 5JLHA 1E4GT 5LJWA 5AQOA 3MMVA 2YHWA 1U2VA 1KAXA 4HTLA 3UB5A 4CZMA 4H0TB 3O1WA 3QBXA 2UYTA 3EKUA 3VF6A 4BRKA 2P9NA 2HMPA 1P8ZA 3D7EO 1YXQA 1TYQA 3MN7A 5CE3A 4JHDA 3ENHA 5JICA 5EOYA 3CJ7A 3JS6A 4JHDB 3LDLA 3ATUA 3FZLA 2CH6A 2HF4A 3CJ1A 4H0OA 5F0XA 4MO5A 1DKGD 2P9IB 5FPEA 4PKGA 4CZKA 3VEOA 4A61A 2P9PB 2YHXA 3IDHA 1HPMA 5BN8A 3GDQA 2NLXA 2E88A 3CQYA 1HLUA 5LJVA 3VEVA 5JLFA 4DQ8A 2V7YA 2NRHA 4JAXA 3FZHA 2FF6A 1TUUA 1OKJA 1HKBA 2QW9A 4CBWA 2YHYA 4FL9A 1NGHA 3C7NA 1WUAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CJTA 4O5BA 1Q18A 2D4WA 2GWKA 4MDAA 3HZ6A 1EX4A 4H0VB 5BR9A 4K41A 4AHCA 5HROA 5JMVA 1S9EA 2XO7A 2E1ZA 4CFDA 4CHZA 5JS2A 4GV9A 3W0LA 2UXCK 4FVUA 4CJKA 2QEXN 4FJMA 3RMBA 3U8XA 1WBBA 4PKIA 1NJXA 2FBTA 4FWRA 2P9KA 3RTVA 3O1BA 1T3VA 4BQZA 3ZSVA 5GAEP 1VQ4N 4CCHA 2WFBA 3CM5A 1EQYA 3SJHA 4JS4A 1NK5A 1Z26A 1X9MA 2VQFK 1SZ2A 1R59O 1JLBA 3WXIA 4KH6A 4YDUC 4CJVA 4M7XA 4BRCA 5C0YA 3C0BA 5BPNA 1BIUA 3WEEB 2F4VK 3MN9A 1C1AA 3W3DA 5C42A 4FJNA 3CD6N 4JKGB 3CMAN 4E7IA 2Q36A 3BZCA 4O4GA 3OYHA 1A5XA 4DQIA 1IG9A 1SL0A 4JI1K 5BRHA 4CZLA 1YJ9N 1VQPN 3CQXA 4KREA 1NK0A 4ELUA 4FPAA 4JI4K 1U4BA 1YHQN 4GV3A 4DV0K 1T6DA 4NYNA 2FBVA 4B9NA 1WB9A 1YVUA 2W6KA 5T7BA 4OKEA 3LDPA 1K8KA 4JI5K 5FPMA 4BR0A 2JGUA 4JI3K 3Q7CA 1E4FT 3R6MA 1NU0A 1EP4A 4ID1A 3HK2A 2V7ZA 3MCPA 5AQLA 3O3HA 3GOIA 3FFIA 3TAMA 3HM9A 3S3MA 4KO0A 3ZEUA 1HMVA 4JKEA 4PWDA 5C12A 4K8XA 2QXFA 2DPNA 2VG7A 4FOIA 2XY8A 3ALYA 1A5WA 1NWKA 3GG4A 4M42A 2O8DA 1I39A 4WCEL 2VWJA 2HNYA 2Z1IA 3ISNC 1Z6RA 4N47A 3L8BA 5J2QA 2YKNA 2YHAA 1NK6A 3VQ5A 5AQNA 4OX9K 4JK8A 2ASOA 2FC0A 3CERA 3LZIA 4FCYA 4AM6A 1VQ5N 1Z05A 4B1XB 1LW0A 3DLHA 2O8EB 2XHBA 4LD0A 3L2WA 1WNSA 1HNIA 2HHUA 1DTTA 4AHUA 3L2UA 1J54A 3CYMA 4M3YA 2GELA 1TK0A 1J9AA 2W41A 2QM1A 3NVMA 4BVOA 3VF2A 4CF0A 4KB0A 4UY8O 4XH5A 3V1OA 1KVAA 3HM8A 4DSJA 2KHOA 1YF5L 1C1CA 3KK7A 2XY6A 1GLEG 3V1QA 1ASUA 4CJ3A 1HNWK 3LAKA 2RHKA 5DK5A 3MN6A 5TKWA 3AA5X 1HRHA 4FVMA 5AZJA 1RGIA 2FF3B 5GINA 1ASWA 5C15A 4FLZA 3S3NA 1RT7A 3MDQA 2FSKA 4BDZA 2XY7A 4DFPA 4K0KK 2E20A 3O80A 3OA9A 4KHWA 4GVEA 2E2PA 4DQRA 1HJOA 3AA4A 1J53A 4CJSA 3VOVA 2I7NA 3ZX0A 3G0ZA 4X66K 3DLLL 4DSFA 2HNDA 3CFRA 4ISGA 3LPUA 4H0YB 5BPLA 3QIPA 4CJQA 3DXMA 2OPPA 3P1GA 1YAGA 3ZSXA 1RDAA 1HNXK 1QQCA 2P9UB 1RDWX 2QK9A 1J6ZA 3H6EA 4QS8A 4FLYA 3MK6A 1W9HA 4CHPA 4CEZA 3VPZA 1HKGA 3BP8A 1KC8O 3AAPA 5FDLA 5ADXH 1NK8A 2HHVA 2HHTA 1NGIA 3SUPA 3WT0A 2QA4N 5AQTA 3KHYA 5GIPA 3OW2M 4Y0WA 3D2FB 3DLRA 3QEPA 1KAYA 2HHWA 2HHSA 1RDBA 3V1RA 3H3NO 4Y1DA 3KD1E 3NCIA 1YT3A 3CCEN 2QWPA 3P4IA 2EX3A 4TSXA 4YOWA 2D0OA 3HYFA 3O9QA 2ASMA 4PKHA 1NGGA 4ISFA 4CK1A 4IJAA 3NH1A 1NG9A 1NMDA 2HBLA 3KLFA 3V4IA 4BC5A 2YKMA 3G25A 4J2DA 3A5NC 3LDSA 3PLAA 1RFQA 4E89A 3QINA 1MWKA 1KLNA 3R1XA 4HWIA 4JKHA 4CEBA 4EAHD 1XHXA 3C95A 2BGGA 3NF8A 4PA1A 4CZHA 3AVMA 4JKCA 4EP4A 3LDQA 2RF2A 4FLWA 3S3OA 4C8MA 2HSTA 3UKUB 5EX5A 2E1YA 1ATSA 1YITN 4B9TA 5TKYA 1KAZA 4IXCA 4DMNA 3SQ4A 1FW6A 3MWTA 1RBSA 2Z1GA 3R8EA 2KTQA 1Z25A 4JKBA 3SPZA 1JLFA 1SUQA 2QWNA 1TAUA 1TL3A 2F7TA 3EKSA 5JVHL 4DR7K 1VRTA 3HI0A 2X6SA 2V51B 1TVRA 3CG7A 2P9SA 1VSHA 4RWTA 4JKAA 1BU6O 5EY4A 3VA0A 4AILC 4O5FA 4BRHA 2YNIA 1EKEA 4H03B 3CCQN 2E8AA 4BQLA 3DRSA 4FPBA 3T1AA 1CLQA 3AO1A 4C8LA 4JK9A 4FO0A 2QTDA 3LM2A 3ULDA 1CXQA 4BACA 4K8ZA 3QEXA 3QFUA 3KLGA 3C65A 3PY8A 2P1JA 1JLGA 3V9SA 3BDPA 1A5VA 3I56N 4JS5A 3THYA 3UKRB 1G99A 1YTAA 1CXUA 2ZWHA 4JRPA 3P39A 4JYAK 1XNQK 5HOOA 2PY5A 3CCSN 4B1YB 1RT4A 3AA3A 4LH4A 3NH2A 2Q97A 5KPRA 4KTWA 2HB5A 3DJCA 3D2EB 1F21A 4FWQA 4FYDA 3DRPA 3R3LA 3OJUA 4E3SA 3H45C 4JKFA 1ZXOA 1VQLN 3MCAB 4CIEA 4N76A 3D6RA 4C23A 3SBGA 3NF6A 4KHSA 3LP3A 4UQGA 3M8QA 3I55N 1HYVA 2ZJPL 3O8MA 2G8KA 4IKFA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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