2CGJA

Crystal structure of l-rhamnulose kinase from escherichia coli in complex with l-fructose and adp.
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
479
structure length
479
Chain Sequence
TFRNCVAVDLGASSGRVMLARYERECRSLTLREIHRFNNGLHSQNGYVTWDVDSLESAIRLGLNKVCAAGIAIDSIGIDTWGVDFVLLDQQGQRVGLPVAYRDSRTNGLMAQAQQQLGKRDIYQRSGIQFLPFNTLYQLRALTEQQPELIPHIAHALLMPDYFSYRLTGKMNWEYTNATTTQLVNINSDDWDESLLAWSGANKAWFGRPTHPGNVIGHWICPQGNEIPVVAVASHDTASAVIASPLNGSRAAYLSSGTWSLMGFESQTPFTNDTALAANITNEGGAEGRYRVLKNIMGLWLLQRVLQERQINDLPALIAATQALPACRFIINPNDDRFINPDEMCSEIQAACREMAQPIPESDAELARCIFDSLALLYADVLHELAQLRGEDFSQLHIVGGGCQNTLLNQLCADACGIRVIAGPVEASTLGNIGIQLMTLDELNNVDDFRQVVSTTANLTTFTPNPDSEIAHYVALIHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Escherichia coli
publication title Structure and Reaction Mechanism of L-Rhamnulose Kinase from Escherichia Coli.
pubmed doi rcsb
molecule keywords L-RHAMNULOSE KINASE
total genus 167
structure length 479
sequence length 479
ec nomenclature ec 2.7.1.5: Rhamnulokinase.
pdb deposition date 2006-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cgjA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cgjA02
1XUPO 2Q0UA 2V51B 2I7PA 5EY4A 5AQQA 5AQOA 4A2AA 3C7NA 3ULEA 4K42A 4BRDA 1MA9B 1QZ6A 2HF3A 3DAWA 5AZIB 4B1XB 1SAZA 3IMXA 3UB5A 5TKYA 4IZ9A 4EHTA 3HZ6A 3BEXA 1WOQA 4ISGA 4BRNA 3O4WA 1X3NA 3LL3A 4M63C 4MLEA 3RSEA 2P9LA 2FXUA 1K8KA 3SK3A 2ZGZA 2YCHA 2W40A 3HTVA 3VENA 2A40A 3AAPA 1DKGD 2P9PA 3G25A 4NB4A 4DB3A 1NGEA 3VF2A 3VEWA 4RCHA 4WYBA 1Z05A 4BRIA 1NGAA 4WQ4A 1HKGA 1BA0A 4BRFA 2Q31A 2A42A 4FWKA 4BR5A 3D2FB 3TPQA 4CZJA 5AZIA 3AAQA 2ASOA 3IDHA 3VERA 3EN9A 2IVOA 3H6EA 2QWPA 1E4FT 3QDKA 5AQLA 1GLLO 4BQLA 3A8YA 1U2VB 3EL2A 3L4IA 5E84A 2EWSA 1KXPA 3ID8A 4H03B 3DXMA 3FZFA 2YI1A 3QBXA 3A5LC 2QWMA 2FF6A 4CZMA 1NGFA 1BG3A 3WXKA 3LDPA 5AZJB 4Z94A 1G99A 2QM1A 3QMLA 1SZ2A 3AARA 5ADXH 3I33A 3HM8A 3DXKB 2P9NB 4B1VA 4QS9A 3EZWA 4CD1A 3D2FA 2AA4A 3H1VX 2PAVA 4CZFA 4BGAA 5BREA 4M7YA 5AQNA 1NBWA 1LOTB 4H5VA 4H0PA 1X9JA 1GLAG 2ZGYA 3WEEB 3I8BA 3LDNA 1Z6RA 4BC2A 1U2VA 1MDUB 4JAXA 4AM6A 2AP1A 4L3QA 1QQMA 3CERA 1KAYA 4XH1A 4BR7A 2GELA 2E2OA 1GLBG 4M7XA 4BRMA 3GDQA 2VYPA 1Y64A 4BGBA 3M1FA 1X3MA 5AZJA 3FZLA 2P9IA 2E1ZA 1NGGA 3DXKA 2D0OA 3WQUA 1BDGA 3FE1A 1ZXOA 4A62A 1NGCA 2P9NA 4CZIA 3MCPA 2VWBA 4E1JA 3ZX3A 1T6CA 1HKBA 4MLHA 3WXJA 3DJCA 3VF4A 2GUPA 3A5MC 4CZHA 4C23A 4I6MB 3JS6A 3CIPA 3QICA 1T6DA 1HLUA 3WEEA 5AR0A 1TYQB 3LDLA 4H5NA 2CGLA 3SMPA 3VGKA 4GY2B 3ZX2A 4FWMA 4JN4A 4KBOA 2CGJA 5JMVA 4FWLA 4WQ5C 1YAGA 1TUYA 3BP8A 3FZKA 3LDOA 1IJJA 3R6MA 3IFRA 4BRAA 4DCHA 1U6ZA 1V4TA 2QWRA 4BG8A 5BR9A 5F2RA 3VEXA 2E2NA 4QS8A 3U9ZA 3FGUA 1RDWX 2E1YA 4H0YB 4B1YB 3LDQA 5AQVA 2UYTA 4FWPA 2QXLA 5KQDA 2IIRA 5BRFA 5I9EB 3VEOA 2VCPA 4I6MA 3VEYA 3MN9A 3DXMB 3FLCO 4IO8A 1ZC6A 4IXCA 1TYQA 4PKGA 2ASPA 1RGIA 5BRDA 3ATVA 4H5RA 4ISEA 1NGIA 2FSJA 4CZGA 1BA1A 3AY9A 5AQYA 3HSCA 4BQZA 3CJ9A 4JNEA 3D7EO 3ZX0A 4FOIA 3VF6A 3L0QA 1ATRA 3VEVA 1OKJA 4PL7A 5LJVA 3GG4A 2CH5A 4CBUA 5EX5A 5EXWA 4H5WA 4CZLA 4JHDB 4NO7A 3MN7A 4K41A 1MWKA 2A6AA 4IJAA 1V4SA 3IUCA 4BR2A 3CI5A 3HBTA 4BVPA 5BPNA 1GLJO 1NGJA 2DPNA 3A5OC 2A3ZA 2CH6A 3J8AA 3U4LA 3BF3A 4B1ZA 1MWMA 2IVNA 2NZTA 1HJOA 3CQYA 3GE1A 1XQSC 2V7YA 5FPMA 3FZHA 2NLXA 5AQGA 3FFKB 2P9IB 2WUSA 3WUHA 5AFUA 4BC4A 2FSKA 4GNIA 4HTLA 2A41A 3H1QA 4FPBA 3VETA 1BWFO 4CI6A 1R59O 1XC3A 5ELZA 3VPZA 5JLHA 4O8KA 5AQJA 1IG8A 4EAHD 3ENHA 3CHWA 3GBTA 3O80A 1GLCG 4B1WB 4JHDA 1NGBA 5E26A 1EQYA 2IVPA 3MMVA 4WQ5A 2YHWA 1BOTO 1QQOA 2GTDA 4DHYA 4H0OA 3H46O 3UE5A 3O1WA 5FPEA 3P4IA 3UKRA 4CBWA 2Q0RA 4BR4A 3O8MA 1S3XA 2GWJA 4K25A 5F0XA 4BR9A 3O08A 5KPZA 5AQFA 3FZMA 4JD2B 3W0LA 4H0TB 4BRKA 3H3OB 1Q18A 4FL9A 1TUUA 2E2QA 2D4WA 3HI0A 4EFHA 1NGDA 3VESA 1QZ5A 2ZF5O 3ZETB 4B1UB 3CJ1A 4MO4A 3VOVA 1S22A 1JCEA 1ATNA 3MDQA 4A2BA 1ATSA 1KAXA 1QHAA 3U8XA 5FPDA 3D2EB 2Q2RA 3MN6A 4BRLA 5BPMA 1CZAN 3EKSA 3EKUA 2HF4A 3FR0A 4BRQA 5AQUA 4CZKA 3ENOA 3H3NO 4PL8A 4JD2A 1HX1A 3CQXA 4Y0WA 2E88A 2Q1NA 4FWNA 3OHRA 3QBWA 2HMPA 3JXUA 3KZBA 4BRHA 1SQKA 3W3DA 3EO3A 4YDUC 5JICA 2YHXA 1T44A 2A5XA 2E2PA 4ISFA 1NMDA 1E4GT 3U9DA 3ZETA 2PBDA 3F9MA 1HKCA 1H1VA 2ZWHA 4CD3A 3CJ7A 2P9KB 4FOEA 3SJHA 3UKUB 3C0BA 2P9UB 5AQRA 5AQKA 4PKHA 3D2EA 4XH4A 5BPLA 3KHYA 5ADXA 1HUXA 1QQNA 5AQSA 3WQTA 3WXIA 5AQPA 2D1KA 5AQHA 5AQMA 1C0GA 4PKIA 2ITMA 4FO0A 2GEMA 2NRHA 3MN5A 3R9PA 5KPRA 1DEJA 4EIAA 3M3ZA 5LJWA 3BUZB 3LM9A 3ZEUB 3L6QA 1J6ZA 1HPMA 3GOIA 3M6GA 4IJNA 1GLDG 4XEIA 5EVZA 2GWKA 4BG9A 4H5TA 2E8AA 3CJAA 5AQZA 5AQIA 3R8EA 3ATUA 4H0VB 2QWOA 4HWIA 1NLVA 4EHUA 2V7ZA 2YJFA 3O1BA 5AQTA 4BVOA 4FWSA 3UKRB 2P9KA 3UKUA 2P9UA 4BC5A 2I7NA 2QW9A 4BC3A 2V52B 1BU6O 5KPTA 1ESVA 2QWNA 5FPNA 3WXLA 5JLFA 1NWKA 4F9OA 3MK6A 4QS7A 2CGKA 2ASMA 1C0FA 1GLEG 3GL1A 3VGLA 1NGHA 3O5BA 3QB0A 4CZEA 2BUPA 4FPAA 4FWOA 3B8AX 3QFPA 1DGKN 4FWRA 2Q97A 1NM1A 4RWTA 4FWQA 3ZEUA 5BRHA 2BTFA 2KHOA 4K43A 3TU5A 4A61A 3WT0A 2P9SB 1YVNA 2FF3B 4J8FA 4IWVA 3BF1A 3LM2A 5KQ8A 4H0XB 3VGMA 4O5FA 4FSVA 2J4RA 2E20A 1GLFO 2YJEA 1P8ZA 4BREA 4WQ4C 4MO5A 1KAZA 4BRPA 2F9WA 3VEZA 3SLCA 2FLOA 2OANA 3S41A 5BN9A 3KVGA 4XH5A 4YDUA 5AQXA 4DQ8A 2YHYA 1JCFA 3A5NC 1BO5O 3QFUA 1WUAA 1RFQA 4RTFD 2QWQA 5EOYA 4CBXA 5BN8A 1ZBSA 3C7NB 3CJBA 3ULEB 4BROA 2H3GX 2QWLA 5F1XA 3O6WA 2P9SA 3A0IX 1BUPA 5AFUH 3CETA 2W41A 5B8HA 4BR0A 5AQWA 4BRCA 3SMSA 4AM7A 2FSNA 4CJ7A 1LCUA 2HOEA 3RSEB 2D0PA 1YXQA 2F9TA 2P9LB 3H45C 4B9QA 1K8KB 1JCGA 3CJCA 1YUWA 2Q36A 4BRGA 3DWLA 1D4XA 2P9PB 5LY3A 5CE3A 4LC9B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Q0UA 1YJNN 2I7PA 4CEOA 3G4SN 5AQOA 4KB1A 2G8VA 1N32K 1XHXA 3WNHA 4LF6K 4B08A 4KKOA 4B1XB 3P83D 4YHHK 3UB5A 3IMXA 1KLNA 3SNNA 3F5TA 3VQ4A 1W97L 4LF8K 1KRPA 3OS1A 3O4WA 1GOBA 4M63C 2P9LA 4IFYA 3TSPA 3SK3A 2B5JA 4DG1A 2O8CB 2A40A 3AAPA 1HNXK 1DKGD 2P9PA 3MEGA 4IO9L 4DB3A 1A5VA 3VF2A 3VEWA 4BRIA 1NGAA 4CJQA 4WQ4A 4ELTA 1NMNA 1TVRA 3THWA 3VQCA 1OVYA 4BDPA 2NUBA 3CPEA 1JJ2M 2A42A 5GAEP 4FWKA 4BR5A 3D2FB 3O3GA 4JI7K 3AA3A 1A5WA 2ASOA 4MQ3A 3IDHA 2BH1A 3EN9A 4WCEL 4UQGA 3EL2A 3F73A 4B8AB 4FYDA 5MLCQ 3FZFA 2KZMA 1HPZA 3UIQA 3T19A 3RRGA 3A5LC 2FF6A 3IRXA 4FK4A 4Z4GA 5HRNA 3WXKA 3NCIA 3LDPA 1RBVA 3D6RA 4EZ6A 4WFNL 4Z94A 3ZSWA 3AARA 3LP3A 4FJHA 3I33A 3PX0A 3TARA 3DXKB 4PQUA 3SBTA 1T7PA 3ZSYA 4B1VA 4QS9A 2PAVA 3CC7N 3OYAA 2OA8A 3P1GA 4BGAA 3SUQA 4DV2K 5AQNA 1LOTB 4H5VA 1I3AA 3QNNA 2Y1JA 1IKXA 3O9RA 3C65A 4XH1A 4M7XA 1GLBG 4EP4A 4BRMA 3HP6A 4E7JA 1Y64A 3VQ9A 1X3MA 3NAEA 2QA4N 4Z4EA 3RMAA 1NGGA 1UA1A 1WSIA 2VWJA 5KRSA 1TAQA 3ZSXA 2P9NA 1L5UA 2HHTA 3EYZA 3ZX3A 1T6CA 2UUAK 4ID1A 4LFBK 1HKBA 1U04A 3VF4A 3OBYA 2NRRA 4DV3K 4C23A 2UXBK 3QEVA 3C6UA 3LWMA 1T6DA 2HHWA 1OVQA 5AR0A 3LDLA 4H5NA 3O9QA 4B9UA 4DTXA 3KWIA 4Y1CA 1N5YA 4JN4A 4OPHA 2CGJA 4WQ5C 3KK1A 5AJ3K 1HJRA 3IFRA 3QERA 1Q9XA 1U6ZA 1MU2A 3NHGA 2QWRA 4BG8A 3RWUA 5BR9A 3VEXA 2E2NA 3S3MA 4QS8A 5CZ2A 4CF2A 1RDWX 3BY5A 3OA9A 4C1NI 4B1YB 3NGIA 4NLBA 3LDQA 4DMNA 2UYTA 4I2PA 4U67L 5JS1A 1N34K 2QXLA 5BRFA 3B6PA 1KVAA 5I9EB 4I6MA 3NE6A 1CXUA 1I39A 2IOCA 4IO8A 4PKGA 1RGIA 5BRDA 1TK0A 1BL3A 4CEBA 2X74A 3NMUA 3ATVA 2B4JA 2IAJA 4NYFA 4CZGA 1BA1A 4DF8A 3HSCA 4M45A 4DSLA 3HXMA 3E9OA 4DTUA 4BE0A 2PFUA 3K5LA 3CCEN 1NK0A 4BDZA 1BIZA 3VMFB 3GG4A 3V9WA 4HUFA 2NNWA 3ULDA 4CJEA 1HYSA 1RTJA 4H5WA 4CJSA 3T1HK 2ZD1A 4O0JA 2UUBK 2A6AA 3SQ2A 4BR2A 4J2EA 5BPNA 3SPYA 1GLJO 4DTMA 2DPNA 2CH6A 3J8AA 3BF3A 4B1ZA 2IVNA 3K57A 3FZHA 2NLXA 4OGEA 2WUSA 3WUHA 4DQIA 1EETA 4HTLA 3CCRN 4ELUA 4KH5A 3H1QA 5I42A 1B92A 4I7FA 4EAHD 4JK8A 1KC8O 1T8EA 3O80A 4QAGA 1VRUA 3HPGA 4PA1A 5IWAK 1SL2A 2YHWA 4DV6K 4DHYA 3BDPA 2W6KA 2OTJN 2HHHK 4PY5A 4CFBA 2OZMA 3P4IA 3IG1A 4CBWA 3QIOA 5HL7L 2Q0RA 4BR4A 2ZJRL 1VAZA 3O8MA 3VQPA 1JLQA 1VSKA 4CJ4A 4BR9A 5AQFA 3FZMA 1QVGM 1Q9YA 4B3SK 3PV8A 4BRKA 5J2PA 3AA2A 1Q18A 4LF4K 2E2QA 2D4WA 3HI0A 2RE2A 3J7YP 1S9EA 1M90O 3TAQA 4MO4A 1IV0A 3G0ZA 3WXMB 2VG6A 4CHYA 4CFDA 1RBTA 4FJIA 2ATQA 4HVJA 4GVMA 5KRTA 4KH4A 3AVNA 4AHCA 3EKUA 3FR0A 1BHLA 3ENOA 4W5RA 1YI2N 3H3NO 4PL8A 1RILA 1VSDA 4AQYK 1VRTA 3CQXA 4Y0WA 2D0BA 3KLEA 2HMPA 3OYHA 1U45A 1EP4A 3W3DA 4YDUC 5JICA 1RT2A 1NJZA 1NK7A 2HBMA 3SCXA 3M8QA 4CF9A 3F9MA 4CD3A 4IDKA 3SJHA 3C0BA 3C6TA 4C8MA 4WE1A 4XH4A 5CYQA 3KHYA 2WTUA 3HM9A 3CCMN 1S1VA 5SZTA 3CMAN 5AQHA 4PKIA 3VA3A 1GOAA 4AILC 3PUFA 1QQCA 4EIAA 4IFVA 3V4IA 3JSMA 5LJWA 3ZEUB 4IJNA 1W7AA 3OY9A 2GWKA 3D45A 3R8EA 2E8AA 5AQIA 1JLFA 1HYZA 4CIEA 4HWIA 4GW6A 4CFAA 2V7ZA 3DLRA 3T7ZA 4M3RA 3UKUA 2P9UA 4E89A 2V52B 1WAJA 2KKZA 3B6OA 2A1SA 2UUCK 3TR8A 1ESVA 3AVAA 4U7BA 2YKNA 1NWKA 2G8KA 3CC4N 4FJLA 1U48A 1RTIA 2HHUA 1C0FA 3THXB 3QB0A 4CZEA 3E9PA 4FWOA 3B8AX 1NKCA 3KLFA 1IBLK 4RWTA 4FWQA 2BTFA 1UAXA 3TU5A 4A61A 3WT0A 5M1KA 2PYLA 4CFCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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