2QWLA

Crystal structure of bovine hsc70 (1-394aa)in the adp state
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb
molecule tags Chaperone
source organism Bos taurus
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
total genus 128
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2qwlA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwlA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwlA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2qwlA04
4B1WB 2WUSA 3LDNA 3O5BA 2VYPA 3CJ9A 3M6GA 3BF3A 3U4LA 2YI1A 1J6ZA 3HZ6A 3WXJA 2NRHA 3DAWA 4EHTA 1BA1A 1NGDA 3LDLA 4BR4A 1BU6O 3G25A 1T44A 3WXIA 5BRHA 1ZC6A 2P9UA 3L0QA 3WQTA 2D0OA 3RSEA 3TU5A 3CETA 3GL1A 3CJAA 2A3ZA 1TYQA 3ULEB 1TUYA 1IG8A 1DGKN 3DXKA 3L4IA 1SAZA 1RDWX 3LM2A 3ATUA 5AQXA 4CD1A 5BN9A 3OHRA 4CD3A 2A6AA 3VOVA 3FZMA 1YUWA 5I9EB 4BRQA 3BF1A 1XC3A 1HJOA 5AQYA 5AQUA 1JCEA 4ISEA 3O08A 2D0PA 1QQOA 3A5MC 3GDQA 1K8KB 3DXMA 2QWLA 2VCPA 3GE1A 5KPTA 1NGEA 1SZ2A 5AQQA 4A2BA 5B8HA 5BN8A 4JD2B 5FPMA 1IJJA 2Q0RA 3LL3A 4IWVA 4A62A 4BRPA 1ZXOA 2H3GX 3FZHA 2E8AA 5AQWA 1HUXA 3ZX3A 2ITMA 1WOQA 5BPLA 3GG4A 1NLVA 4YDUA 3MN5A 1BO5O 5AQRA 2YCHA 4NB4A 2IVOA 2GTDA 1GLEG 5JLFA 4NO7A 4I6MB 3H46O 3CJ1A 1KAYA 5AQOA 5KQDA 4FWQA 3DJCA 4BC5A 5AZJA 1XQSC 2YJEA 2GEMA 2W41A 4QS7A 4BG8A 2VWBA 3WT0A 3VEZA 3ZX2A 4BRAA 3UKUB 3ZEUA 2P9LA 2KHOA 3IMXA 4AM7A 4RTFD 5JLHA 4BRGA 2I7PA 2ASOA 4MLEA 3FZKA 3EO3A 4BR2A 1JCGA 2IIRA 4CJ7A 4BQLA 1BUPA 3WEEB 5EVZA 2EWSA 2P9SB 3L6QA 2Q36A 4BRIA 4Z94A 4CZHA 3D2FA 4BR9A 2V7YA 3C7NB 4CZEA 4PL8A 3VENA 1GLLO 1NGGA 4BG9A 4BRFA 5AQIA 1MWMA 4BVPA 3W3DA 4LC9B 2GWKA 1XUPO 3SMSA 4O8KA 3KVGA 3AAPA 3VF2A 5AFUA 5ELZA 4DCHA 2A41A 2E1ZA 1GLJO 4MO5A 1NGJA 3P4IA 3M3ZA 3O80A 2AA4A 1NMDA 3RSEB 4BR5A 4E1JA 3F9MA 4H0TB 2CGKA 5EXWA 3A5LC 5F0XA 3VPZA 1YXQA 5AQPA 3DXKB 3I33A 1T6DA 4FSVA 2DPNA 4F9OA 2GUPA 4BRMA 2IVNA 1HKBA 1ZBSA 1YVNA 1E4FT 2YHWA 4BRCA 5AQGA 5E26A 4FL9A 4WQ5C 3AAQA 4JNEA 3GBTA 1C0FA 2HF3A 3H45C 2YJFA 4BRDA 3CJCA 4WQ5A 3EL2A 3CQYA 4QS8A 4JHDA 1QHAA 1T6CA 3U9DA 3R6MA 2A42A 1Z6RA 3CJBA 3D2EB 3U9ZA 3EKSA 5BRDA 1Z05A 3QB0A 2YHXA 2V52B 3UE5A 1KAZA 3M1FA 3DWLA 4ISFA 4ISGA 3FZFA 4B1UB 3MCPA 5AZIA 2PBDA 4FOIA 5AQNA 3LM9A 2QWPA 1C0GA 2HF4A 2I7NA 5FPDA 1RGIA 1X9JA 1MWKA 4CZGA 4GNIA 3IFRA 4BVOA 5EY4A 4M7YA 1S3XA 4GY2B 2F9WA 3FR0A 1BG3A 2GWJA 5AFUH 1HLUA 3J8AA 1KXPA 4CZMA 2P9KB 4O5FA 1GLCG 3VGMA 2IVPA 1NGFA 1SQKA 4MLHA 2P9IB 3MMVA 4WQ4C 3QMLA 5F1XA 4BC2A 3C0BA 4FWRA 4M7XA 3O6WA 4BC3A 3FE1A 3GOIA 4WQ4A 2FSNA 1GLAG 4FWPA 4K43A 3SK3A 3H1VX 4FWLA 4FWKA 3ENOA 3KHYA 3CJ7A 2E20A 3H1QA 3H6EA 3ULEA 4IJAA 3B8AX 2QWOA 2QWRA 3AARA 1NGAA 5JICA 1U6ZA 5TKYA 1EQYA 2BUPA 3FGUA 4BR7A 3MN7A 4CBUA 5KPRA 3QFUA 1BWFO 4BRHA 2CH6A 1HX1A 5KQ8A 2V7ZA 2UYTA 2AP1A 3IDHA 2QWNA 3QBXA 3UKRB 1X3MA 1ESVA 1K8KA 1GLFO 4FOEA 1U2VB 3QFPA 5AZJB 4B1YB 5CE3A 1OKJA 4JD2A 5AR0A 3MDQA 1BA0A 4CBWA 2A40A 4BRNA 1NGIA 1HKGA 2QWMA 2CGLA 4KBOA 2QXLA 2ASMA 2Q2RA 4EHUA 3VEXA 3QBWA 5AQZA 3FFKB 2D4WA 3VESA 1NGHA 1ATSA 4H5RA 1WUAA 2P9UB 3VERA 4FWNA 4JHDB 2ASPA 2E2NA 1QQMA 1BDGA 4FWMA 1TYQB 1HKCA 3MN6A 4RWTA 4I6MA 3VEWA 3VF6A 2CGJA 2P9PA 3UB5A 5FPNA 3VEYA 1ATRA 1CZAN 5AQTA 4CI6A 4H0VB 4XH5A 3A5OC 1H1VA 5AZIB 5ADXH 1R59O 5KPZA 4L3QA 1KAXA 2P9NA 4PKIA 2FLOA 2ZGYA 4PKHA 4H5VA 3UKUA 2NZTA 1DKGD 3I8BA 4CBXA 2BTFA 4C23A 3DXMB 2FSKA 5E84A 4B1XB 4K25A 4DHYA 4HTLA 3WEEA 4BR0A 2W40A 2CH5A 3ZX0A 4B9QA 4FPBA 3U8XA 5EX5A 4BC4A 3C7NA 1QZ5A 4CZLA 3IUCA 2FSJA 1LOTB 3HTVA 4PL7A 5AQMA 5LY3A 1D4XA 2E2PA 3FLCO 1RFQA 2E2OA 4FWOA 3BUZB 3ID8A 4H03B 4QS9A 3CHWA 2F9TA 1MA9B 1GLDG 2E1YA 2HOEA 2OANA 2QW9A 1X3NA 3LDQA 1NM1A 4BROA 5BR9A 3BP8A 2ZF5O 4K41A 4DQ8A 4IXCA 3W0LA 3O1BA 1HPMA 1ATNA 3KZBA 4XH4A 3QICA 3R9PA 1E4GT 4H0XB 4AM6A 4BQZA 3EKUA 4CZFA 4M63C 1MDUB 3ZEUB 2P9LB 3VEVA 4FPAA 2E88A 5AQFA 3HI0A 3ZETA 3ENHA 1P8ZA 1NGCA 5AQLA 4H5WA 3MN9A 2QWQA 3D7EO 4JAXA 2ZGZA 5ADXA 5EOYA 3D2FB 3O1WA 5AQKA 4CZIA 2PAVA 3TPQA 4CZJA 4H0OA 3VF4A 1BOTO 5LJWA 4XEIA 3O8MA 3EZWA 2FF3B 4IJNA 3HM8A 1DEJA 4IZ9A 5LJVA 1QQNA 3D2EA 2A5XA 5BRFA 4YDUC 4H5TA 1G99A 3HSCA 5AQSA 3R8EA 2V51B 4BRKA 3JS6A 4CZKA 1V4SA 2FXUA 2E2QA 4BREA 3WXKA 1NGBA 2P9PB 4FWSA 1Q18A 4BGBA 3A0IX 3CI5A 3CIPA 4H0YB 3CQXA 2Q0UA 5BREA 5AQVA 3H3NO 2P9NB 2HMPA 3WXLA 4EFHA 3A8YA 5JMVA 5FPEA 1NWKA 3LDOA 2Q31A 2Q97A 2YHYA 2P9KA 4B1VA 3WQUA 3HBTA 3AY9A 3JXUA 2ZWHA 2P9IA 4EAHD 4BRLA 4J8FA 1NBWA 3QDKA 3BEXA 5F2RA 1S22A 4MO4A 4FO0A 5AQJA 3A5NC 3FZLA 4HWIA 3SLCA 3VEOA 3VGKA 1V4TA 2Q1NA 3S41A 4DB3A 4K42A 4A61A 4BGAA 4H5NA 3CERA 3SMPA 3H3OB 3ATVA 4B1ZA 1GLBG 5BPMA 1YAGA 2NLXA 3MK6A 4EIAA 3EN9A 4JN4A 5AQHA 2FF6A 4WYBA 4Y0WA 3VETA 3VGLA 2D1KA 3O4WA 4IO8A 4XH1A 2P9SA 1TUUA 4PKGA 2GELA 4RCHA 2J4RA 1LCUA 3ZETB 3UKRA 1JCFA 3LDPA 5BPNA 1QZ6A 1U2VA 3WUHA 4A2AA 2QM1A 4H0PA 3SJHA 1Y64A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RW6A 4H4MA 2VYPA 3M6GA 1EETA 3SF4D 2NRHA 5I3UA 3WNHA 1BA1A 4DSFA 3AV9A 2HHQA 4TSXA 3CPWM 1T44A 3TABA 1W2BM 1EX4A 4FJIA 2KQ2A 4C8LA 3GL1A 4UQGA 3CJAA 1AYJA 3ZSXA 4DV5K 5C12A 1WMTA 3VQAA 3PSIA 1BQMA 3LM2A 4CCHA 4LF5K 1YTAA 3OHRA 3CC4N 2A6AA 4B9MA 5M1KA 2YHAA 4PWDA 1KCFA 3BF1A 3E9OA 1FXXA 5AQUA 1C55A 1HYVA 1NK4A 4MDBA 1YTUA 1S6PA 4FLUA 2JWKA 2QWLA 4FJXA 3C6HA 5KPTA 1I2UA 4JKAA 3OYNA 4IG3A 4N41A 3GKUA 3V81A 3L2VA 5C25A 3MX5A 3KOXA 3ZX3A 2DY4A 2ITMA 3L2QA 1RTDA 2BGGA 4JKGB 3EYZA 3S3NA 4DUZK 1JZBA 1KVBA 3LWLA 2WTUA 4JI2K 3LZJA 1KAYA 5AQOA 2VQEK 1OMYA 4CJ3A 2KZZA 4BG8A 1OZZA 4HTUA 3LP3A 1VNAA 3ZX2A 3UKUB 4J2DA 2OZSA 1JZAA 4RTFD 4KI4A 5KRTA 1RCHA 2ASOA 3FZKA 2P5GA 4CJ7A 4FXDA 5J2NA 2KYQA 2Q36A 4PL8A 3VENA 1GLLO 5KTQA 1NGGA 3S3OA 2A7TA 4BRFA 1TKXA 1HMVA 3SBTA 1KLNA 3W3DA 3F9KA 3RR8A 1XUPO 5AFUA 3AAPA 1N34K 3ZSZA 1TKZA 4C1NI 3H08A 3RTVA 4BACA 3VQ7A 2AA4A 3RWUA 1J5OA 2ZJRL 2CGKA 4E89A 4Q0BA 3E7RL 4L8RB 4O0JA 2YKNA 4OPHA 4JKDA 3NGZA 1T6DA 4KHNA 2NRVA 2O8FB 1HQEA 2UUCK 1C1AA 2YC1C 1HKBA 1YVUA 3K5NA 1JXEA 1YVNA 1E4FT 4BRCA 1PTXA 1EP4A 2HVIA 2B3CA 3CCEN 3NH0A 4U7BA 3CD6N 2UXDK 4G1QA 2HF3A 4BRDA 3CCRN 1TL3A 2YJFA 3LP2A 4I2QA 1ZVGA 2ATBA 4M45A 3EY1A 3SNNA 2D5RA 1T0ZA 2Q3SA 3MX2A 4QS8A 3QEIA 4JHDA 1T6CA 4UAEF 3R6MA 4IFEA 4CFDA 3QIPA 2A1RA 3KP0A 1U48A 2YHXA 2V52B 3RMCA 1KAZA 2B6AA 3DWLA 1ZYVA 3OYFA 3AO1A 3NFAA 4ISGA 1QSSA 1HJRA 2PBDA 1IH7A 2WOMA 2QWPA 2HF4A 3O9RA 5FPDA 2VG5A 3SI6A 1KVCA 4JKCA 3BY5A 5EY4A 3OYIA 4GY2B 2F9WA 1QS4A 3VQ4A 1BG3A 5JS2A 1VQ7N 1SN4A 1WBBA 3DM2A 1P0AA 4CGGA 3J8AA 1GLCG 3VGMA 1B9FA 4KHQA 3VQDA 2OPRA 3C0BA 4FWRA 3HJFA 4JRQA 4B08A 1IKXA 3SUQA 2N2QA 1C56A 1NH5A 1GLAG 3BZKA 4CGJA 4FWPA 3SK3A 2WC9A 2EX3A 4FWLA 3AO4A 3KHYA 2KZMA 4KH6A 3OS1A 3ULEA 4KHYA 4IJAA 3B8AX 4JKHA 2QWRA 3AARA 5JICA 5SWMA 4CJQA 1U6ZA 1EQYA 4MQ3A 4BR7A 4IDHA 3LPUA 1IO2A 2BE2A 3TTCA 1BWFO 1HYSA 1HX1A 4OKJA 2UYTA 1VRTA 4ILHA 1K8KA 1NK0A 4ELUA 2GV9A 4FOEA 3VTIA 3QFPA 5AZJB 1S6QA 3AGRA 3Q7CA 2VWKA 4FLTA 5AR0A 3DMJA 2PZSA 3U6FA 3MDQA 1BA0A 4KRFA 2G8HA 1NGIA 4BDPA 4KB1A 2QWMA 2RHKA 4KBOA 2ASMA 4FJNA 4JK7A 4O0IA 4EHUA 4M3XA 3HK2A 3PUFA 2LT8A 1VQLN 3D45A 1IKWA 1ATSA 4H5RA 2P9UB 4A5AA 4E1NA 2ASPA 2MZ0A 4CHQA 1BDGA 4KO0A 3KK1A 3LZIA 3CF5L 4DQQA 1BMRA 4I6MA 2FBXA 1ATRA 3V9WA 4CI6A 3KLEA 3THVA 4H0VB 4XH5A 1H1VA 3ZSVA 1LWEA 1W9HA 3TWHA 1VQNN 3CCLN 1R59O 2I61A 4YORA 2P9NA 2FLOA 2NZTA 4WFBL 3I8BA 1YJNN 2WFBA 2E3FA 4KHSA 4C23A 3DOKA 1XHZA 1TKDA 5E84A 2XHBA 4IEEA 3MXIA 3SAFA 3WEEA 2W40A 2CH5A 3ZX0A 4B9QA 2PY5A 2JWLA 2DTUA 3CPEA 4CZLA 3IUCA 3C6UA 3RMDA 2N66A 1LOTB 3HTVA 3HVTA 4CEDA 4DG1A 4PL7A 3J7YP 5AQMA 4AHTA 1RFQA 3ID8A 4QS9A 1L3VA 4MFBA 3AGKA 1RDDA 3SV3A 2BH1A 1NM1A 4BROA 3KJVA 2JDQD 4X62K 4DQ8A 1YI2N 1IBKK 1B3CA 1BRZA 3PX6A 3U3GA 1HPMA 4PUOA 4XH4A 1BQNA 5GIOA 1VSDA 1E4GT 1N4NA 3EKUA 4CZFA 4M63C 1ZFUA 3HL8A 1MDUB 1WN7A 2P9LB 4E72A 1BHLA 3PO5A 4W5NA 5AQFA 4DF4A 3SZ2A 3CMEN 2G8IA 3ENHA 3SV4A 4CHYA 3OY9A 5AQLA 4H5WA 2ZQBA 4DV6K 2KBHA 2NUBA 4FJLA 2IOCA 3C94A 4DQIA 4FZXC 2YKMA 4JI1K 3O8MA 4EZ6A 1DLOA 4HE7A 2FF3B 3KOWA 4DU3A 4IZ9A 5FRMA 4JLHA 3D2EA 1X9WA 1N8RO 4DQRA 4H5TA 1G99A 5C42A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4RW6 A;  4H4M A;  2VYP A;  3M6G A;  1EET A;  3SF4 D;  2NRH A;  5I3U A;  3WNH A;  1BA1 A;  4DSF A;  3AV9 A;  2HHQ A;  4TSX A;  3CPW M;  1T44 A;  3TAB A;  1W2B M;  1EX4 A;  4FJI A;  2KQ2 A;  4C8L A;  3GL1 A;  4UQG A;  3CJA A;  1AYJ A;  3ZSX A;  4DV5 K;  5C12 A;  1WMT A;  3VQA A;  3PSI A;  1BQM A;  3LM2 A;  4CCH A;  4LF5 K;  1YTA A;  3OHR A;  3CC4 N;  2A6A A;  4B9M A;  5M1K A;  2YHA A;  4PWD A;  1KCF A;  3BF1 A;  3E9O A;  1FXX A;  5AQU A;  1C55 A;  1HYV A;  1NK4 A;  4MDB A;  1YTU A;  1S6P A;  4FLU A;  2JWK A;  2QWL A;  4FJX A;  3C6H A;  5KPT A;  1I2U A;  4JKA A;  3OYN A;  4IG3 A;  4N41 A;  3GKU A;  3V81 A;  3L2V A;  5C25 A;  3MX5 A;  3KOX A;  3ZX3 A;  2DY4 A;  2ITM A;  3L2Q A;  1RTD A;  2BGG A;  4JKG B;  3EYZ A;  3S3N A;  4DUZ K;  1JZB A;  1KVB A;  3LWL A;  2WTU A;  4JI2 K;  3LZJ A;  1KAY A;  5AQO A;  2VQE K;  1OMY A;  4CJ3 A;  2KZZ A;  4BG8 A;  1OZZ A;  4HTU A;  3LP3 A;  1VNA A;  3ZX2 A;  3UKU B;  4J2D A;  2OZS A;  1JZA A;  4RTF D;  4KI4 A;  5KRT A;  1RCH A;  2ASO A;  3FZK A;  2P5G A;  4CJ7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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