5BN9A

Crystal structure of adp bound human hsp70 nbd mutant r272k.
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
total genus 127
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bn9A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bn9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bn9A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bn9A04
4FWSA 5AZJB 3VEZA 1MDUB 1GLCG 1HX1A 1U6ZA 3M3ZA 1BWFO 2BTFA 3GE1A 3VOVA 1BOTO 4C23A 2NZTA 4RCHA 2GEMA 3QDKA 4BR0A 5AQQA 3LDPA 3MCPA 2P9SA 3QICA 3QMLA 3WUHA 3CJ9A 3WXIA 2GWKA 2YCHA 3OHRA 3QFPA 5EXWA 2P9SB 3MN5A 2CH5A 2E2OA 3W0LA 5AZIB 3FZFA 3J8AA 2Q36A 4QS8A 4MLEA 3S41A 2V7YA 5BRFA 5AQPA 1NGAA 5BN8A 3IFRA 1MA9B 2CGKA 1GLBG 1ATRA 4XH5A 1QZ6A 2W40A 5FPEA 4CZKA 2KHOA 2YHYA 4H5VA 1LCUA 4B1WB 3MK6A 1NGIA 5KQ8A 4A2AA 2GTDA 5AQLA 1GLAG 2E1ZA 2VWBA 3MN7A 4RWTA 5CE3A 5TKYA 3WQUA 2NLXA 3AARA 3GG4A 2P9NB 4B1ZA 4BRKA 4DCHA 2CH6A 5FPDA 4CI6A 3VEWA 3WQTA 4DHYA 1E4FT 3GOIA 1T44A 4FWNA 4H03B 2P9PA 4E1JA 5AQOA 1Z6RA 4JD2B 2WUSA 3VF2A 4EFHA 3CJ1A 1ZXOA 2GELA 5AQFA 3EO3A 4RTFD 3U9ZA 2GWJA 3WEEB 2QXLA 2YJEA 4BGAA 5AQHA 1Y64A 4JHDB 1U2VA 4F9OA 4DQ8A 5AQMA 4M63C 4A2BA 3U4LA 3VESA 3LDQA 1JCFA 2VCPA 1T6DA 4FSVA 2YHXA 4EIAA 3WT0A 3WXKA 2FSNA 3CIPA 4H0VB 3FZHA 5E84A 3R6MA 4HTLA 3BEXA 3O1BA 3ZX0A 2HF4A 4QS9A 2ASOA 4IJAA 1NMDA 1QQOA 2F9WA 3DXMB 5E26A 5BRHA 5AQZA 1HJOA 1MWKA 2P9IB 3W3DA 3O80A 4O5FA 3CQXA 3CQYA 1QZ5A 4CZJA 5JLFA 5LY3A 3JXUA 2FSJA 2P9UB 3SK3A 1DKGD 2ZGYA 4H0TB 4FWRA 1JCGA 4GY2B 1LOTB 2YHWA 4BGBA 3KHYA 3JS6A 2EWSA 3MN6A 4BQZA 4HWIA 1TYQB 1BO5O 4J8FA 3D2EA 2YI1A 1T6CA 2A6AA 2FSKA 1TUYA 3ID8A 2VYPA 5JLHA 3I8BA 4XH4A 4GNIA 1SAZA 3P4IA 5I9EB 1ATNA 1RGIA 4YDUC 4FO0A 3VF6A 4CBXA 2QWLA 3VEOA 1NGBA 2ZF5O 3MDQA 5BPLA 5AQJA 4Z94A 3QFUA 5EX5A 1ESVA 2QWRA 5AQKA 2E8AA 5AQVA 2V52B 4IZ9A 5F1XA 1GLFO 3UKRA 3O6WA 3VENA 4BG8A 3AY9A 3BF3A 4MO4A 4BRHA 2E2PA 1GLDG 4LC9B 3VPZA 4BC5A 4KBOA 1Z05A 1S22A 3D2FA 3M6GA 5AQIA 1J6ZA 5KPRA 3FZKA 4PKIA 3EL2A 3ZETB 4AM6A 3TU5A 3QBXA 1XQSC 3R9PA 1X3NA 1NGEA 2BUPA 4DB3A 1RFQA 4BREA 3H3OB 4B1XB 2CGLA 2YJFA 5AQRA 3CJBA 5AQSA 1ZBSA 3HM8A 5JICA 2D1KA 5AQXA 3SMPA 4CJ7A 1NBWA 1K8KA 2A41A 3FFKB 1C0GA 4H0XB 3ULEA 1SQKA 4BVPA 3L4IA 4XH1A 5AQWA 4PL8A 1HKGA 3O8MA 4PKGA 2F9TA 3G25A 2Q1NA 4CD1A 3ULEB 1KAXA 3KVGA 4NO7A 3VGLA 2Q2RA 3HI0A 3C0BA 3MN9A 4XEIA 2QWPA 2QM1A 3AAQA 4K42A 3ENOA 4BR9A 3O08A 4FWPA 3RSEA 4ISGA 1BDGA 1NGHA 1NWKA 4L3QA 4NB4A 1YUWA 3VEYA 1GLEG 3C7NA 5AQTA 5AR0A 3A8YA 4QS7A 3FZLA 1HUXA 4O8KA 4MLHA 4IXCA 2P9PB 4Y0WA 2HMPA 3CHWA 4CZHA 1YXQA 3O5BA 1XUPO 5BRDA 4B1YB 2QW9A 1BU6O 5BPNA 4WQ5A 4B9QA 1QQMA 3CI5A 3D7EO 1U2VB 2P9KA 4K41A 3U9DA 1QHAA 3BF1A 3HSCA 3A5OC 5AQUA 3H6EA 1IG8A 3H1VX 3LM9A 2V7ZA 5AFUH 1GLLO 4BRQA 5BR9A 3IMXA 1MWMA 1BA1A 2QWNA 3ZEUA 3AAPA 2E20A 3F9MA 2PBDA 5JMVA 1YAGA 2IVPA 4JN4A 3QBWA 1BUPA 3B8AX 1NGFA 3DWLA 1NLVA 4BC3A 1IJJA 5F2RA 4H5RA 3UKUA 4I6MA 3A5MC 4CZLA 5LJVA 3O4WA 2P9LA 3LM2A 4CZMA 3VETA 2E88A 4BRIA 4CZIA 5AQYA 3D2EB 2A3ZA 4FOEA 2Q31A 4BR4A 2HOEA 3M1FA 4BR2A 2QWOA 4WQ4A 1NGGA 2IIRA 4BROA 1HLUA 5EY4A 4IO8A 4FWOA 4FPAA 2QWQA 4CD3A 5B8HA 5ADXH 2FF6A 3I33A 2H3GX 3UKRB 1X9JA 4BC4A 4K43A 2ZWHA 3D2FB 5AZJA 3EKUA 3A5LC 4FWMA 3L6QA 3GDQA 3HZ6A 3GBTA 3ZX3A 3H3NO 4FWKA 4BVOA 3H46O 5FPMA 2V51B 3A5NC 4M7YA 3ATUA 1RDWX 1WOQA 2IVOA 4K25A 3VGMA 3VEXA 4BG9A 4EHTA 3CJAA 4H5NA 3KZBA 4JNEA 2DPNA 2E1YA 3LDNA 4PL7A 5F0XA 4FOIA 3WXJA 4B1UB 3R8EA 2QWMA 5AZIA 3SJHA 3VEVA 1NGJA 3ZX2A 3O1WA 3CETA 3DXKA 1K8KB 4BQLA 2D0PA 2W41A 2A40A 1S3XA 3CJCA 3EN9A 2AP1A 5EVZA 1C0FA 3VERA 4H0YB 3H45C 4MO5A 4BRGA 3FGUA 3DXKB 4BRAA 1H1VA 1HKBA 1D4XA 2D0OA 2GUPA 1GLJO 3BUZB 1WUAA 4A61A 2A42A 3ENHA 1HPMA 4ISEA 1BG3A 2AA4A 3SLCA 1R59O 3GL1A 1QQNA 2HF3A 3HTVA 4B1VA 5KPZA 3FLCO 3WXLA 5BPMA 2Q97A 1OKJA 2IVNA 2PAVA 3ATVA 4M7XA 2P9NA 1V4TA 1V4SA 3RSEB 3EZWA 4BC2A 1BA0A 1XC3A 4CBUA 3C7NB 3FE1A 4H0OA 4JD2A 4H5WA 1ATSA 1P8ZA 5FPNA 4PKHA 3WEEA 2A5XA 2E2QA 4JHDA 1NM1A 4CBWA 2I7NA 4BRCA 2ITMA 4BRNA 2ASMA 1CZAN 5BN9A 2UYTA 1SZ2A 3CERA 3H1QA 4BRFA 4EAHD 1HKCA 4A62A 4BRDA 4WYBA 2ASPA 4CZEA 2E2NA 2P9KB 1DEJA 4ISFA 4FL9A 3LDLA 3BP8A 5EOYA 2NRHA 1X3MA 4WQ5C 3L0QA 3A0IX 3ZEUB 2D4WA 3DXMA 3SMSA 1ZC6A 5AFUA 1TUUA 2P9IA 3FR0A 3LL3A 3DAWA 3LDOA 5LJWA 4CZGA 2P9UA 4AM7A 5AQNA 2FF3B 2FLOA 3FZMA 3CJ7A 4YDUA 3UKUB 4I6MB 3VF4A 2FXUA 1TYQA 3DJCA 4BRLA 1G99A 2CGJA 5BREA 2P9LB 4BR7A 3UB5A 4FWLA 3U8XA 1KXPA 2J4RA 5KQDA 4BRPA 4FPBA 1E4GT 1NGDA 4IWVA 5AQGA 4BR5A 1YVNA 2Q0RA 3HBTA 1JCEA 3MMVA 2OANA 4H5TA 3VGKA 5KPTA 1KAYA 3QB0A 1EQYA 5ELZA 1KAZA 3UE5A 2I7PA 2ZGZA 4EHUA 1DGKN 3TPQA 1NGCA 3IUCA 4IJNA 4WQ4C 1Q18A 4CZFA 4H0PA 3IDHA 4JAXA 4BRMA 4FWQA 3ZETA 5ADXA 2Q0UA 3EKSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FLTA 1YHQN 4B9UA 4B8AB 4C23A 2NZTA 3SZ2A 2GEMA 1FH3A 4W5TA 3VQPA 2P9SA 2OPPA 4ILJA 3QMLA 2VY6A 4E0DA 3VQ5A 4ZTJA 3CJ9A 3WXIA 1M1KO 2GWKA 3CC2N 1BIUA 1C1AA 5GAEP 1C56A 1ZVEA 1RCHA 5HRRA 2Y1IA 3MN5A 3THWB 3BZCA 1YT3A 3VQ6A 3W0LA 4JI5K 5AZIB 4QAGA 4PHTX 4QS8A 2OZMA 4RW6A 4CJ5A 2V7YA 1SL2A 5BRFA 1N5YA 1A5WA 4DR6K 3N4PA 1MA9B 1NU0A 3AA2A 3MAQA 2CGKA 3OYGA 4LFAK 1QZ6A 3T1AA 2BE2A 4CZKA 2KHOA 3PX4A 4JKDA 4WFAL 1EWRA 1TK8A 4GVMA 5KQ8A 4B9MA 1VAZA 2QXFA 2UUCK 1HPZA 1D9FA 3ZYYX 2VQFK 4H4MA 1L5UA 3DLGA 3I0SA 4OPKA 3VEWA 4C1NK 4DHYA 2MN5A 4BDYA 2R7YA 3C6TA 3DLKA 2GWJA 3WEEB 2QXLA 2VWJA 3RR7A 4BGAA 5AQHA 5C42A 1W7AA 1VSJA 4F9OA 1WSGA 5AQMA 3U4LA 2P5OA 4A5BA 3LDQA 1JCFA 1T6DA 4FSVA 1JZBA 5FROA 1NOYA 1T0ZA 4DTUA 2HHIA 2HHVA 3KC6A 4DSJA 3R6MA 4DQPA 1DQ7A 4KRFA 1I2UA 1NMDA 4F8RA 3DXMB 4GW6A 3PY8A 2KSKA 1HJOA 3K59A 3W3DA 3CQXA 1QZ5A 3QNOA 3SAFA 5LY3A 4DQIA 4KV8A 2FSJA 4DR1K 1DKGD 4OX9K 4FWRA 1JCGA 1VQKN 4CIEA 1LOTB 3LPUA 3OYLA 4BGBA 2HVIA 2NRVA 4BQZA 3D2EA 2VYPA 4XH4A 3P4IA 4A59A 4E3SA 2YNIA 3OYNA 4BWJA 3KHWA 2QWLA 2JWLA 4DV5K 3S3OA 1EXQA 1FW6A 4KTQA 4BEBA 4Z94A 3QFUA 5EX5A 5AQVA 4IZ9A 3L2UA 1GLFO 3CC7N 1TKXA 4BRHA 4BDPA 1LWCA 1S22A 3WNEA 1NKCA 3OS1A 3D2FA 3QEWA 1BL3A 1J6ZA 5KK4A 1RBTA 1AYJA 4BWMA 1B7DA 3VMFB 4KREA 5I3UA 4C8NA 5J2MA 3BK3C 5EU7A 4AM6A 4KHPK 1XQSC 1BQNA 3ZT2A 3AVKA 4A57A 4DB3A 1RFQA 3G71N 4OPAA 2YBRC 3O9QA 2RE2A 3P83D 4K8ZA 3AO3A 1BCOA 3DM2A 5AQRA 4UJ0A 3OYBA 1ZBSA 1L3SA 4IBNA 4DMNA 2D1KA 4FM1A 3M8QA 5AJ3K 4XIUA 2UUBK 1C0GA 1TVRA 1T7PA 3V9UA 2NRZA 1SQKA 4BVPA 1UWBA 5AQWA 3O8MA 1LWEA 3G25A 4OPHA 1KAXA 3VGLA 2Q2RA 3O9RA 4JK7A 1XMQK 2YEOA 5GADP 2HB5A 4XEIA 4WE1A 2E3FA 2QWPA 4DU3A 4BACA 4DFMA 3O08A 4JKHA 5K14A 4IFVA 2P1JA 4ISGA 1BDGA 1NWKA 4CEOA 5AQTA 4MQ3A 1QE1A 4QS7A 2FBTA 1GOBA 4CGFA 3RMDA 1B9FA 3ZSZA 2G8HA 1GOAA 1HYSA 2HMPA 3CHWA 1YTUA 1Y97A 5I42A 4FW1A 4GV3A 3C6AA 1VSFA 2HNDA 5BPNA 3NH2A 1RDDA 1YTAA 2Y1JA 3CI5A 3D7EO 1U2VB 3HJFA 4RW9A 1PTXA 1QHAA 1IG8A 3H1VX 3S9HA 3RRGA 2N2QA 4JI2K 1XC9A 4CJRA 2NY8X 2Z1HA 3ZT3A 2PBDA 3M8RA 1KV0A 3QBWA 3DWLA 1GOCA 3V9ZA 4AB0A 4IOAL 1S72N 4CHZA 1KSPA 4I9LA 4JRQA 4PA1A 1S6PA 4I6MA 3VQ7A 4EP4A 3TSPA 5T7BA 1BQMA 2OTJN 5TKWA 1RDBA 1XNRK 3THYA 2P9LA 3U3YA 1BIZA 1VNAA 3L2RA 3SF4D 5AQYA 2A3ZA 3SAHA 3QIPA 1M90O 4O0IA 4NCAA 1HNZK 3HPOA 5M1FA 3K2PA 1YJNN 4C8OA 2HOEA 1LWFA 1NGGA 3AA3A 3DLBA 4B8CA 4IO8A 3E7UX 4FWOA 3LP0A 4CK1A 3LP1A 1HNXK 5B8HA 2WTUA 4ILHA 2FF6A 2H3GX 2NUBA 4OO1J 2LI7A 4JKFA 4BC4A 3V4IA 2UUAK 4K43A 2F8TA 4NLCA 3TTFA 3B6OA 3S5TA 4UAFE 4OKKA 3HZ6A 4HTUA 3ZX3A 5CHIA 2ZQBA 4IEIA 2IGIA 4LD0A 3A5NC 2YV0X 3VEXA 3VGMA 2IVOA 1S9EA 4YOUA 4BG9A 1K8BA 1SS6A 1ASUA 1JXCA 4JNEA 5GIOA 5HROA 1TL3A 3L8BA 3THWA 3VEVA 5AZIA 3ZX2A 3O1WA 2GMOA 5LMUK 1K8KB 2D0PA 2N66A 2W41A 3NCIA 4DTMA 1S3XA 1UGLA 5EVZA 4JS5A 1VQ6N 3H45C 3SUOA 4M3TA 4MO5A 1VSHA 4TSXA 4IFYA 1TKDA 2A42A 2F8SA 2LSNA 4IEEA 3ENHA 4DSKA 4DFJA 2AA4A 1R59O 2JLEA 3HTVA 3DRPA 1N33K 4CFAA 2ASCA 3WXLA 5BPMA 2FBVA 4NYFA 1J5OA 4N41A 4IO9L 4KHNA 1V4SA 2B5JA 3EZWA 2JGUA 1T7EA 3QERA 1XC3A 4F3TA 3FE1A 4CEBA 1IV0A 1ATSA 1VHXA 5FPNA 1NE5A 3WEEA 4DS4A 1RT5A 4CF2A 2YHAA 1XI1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4FLT A;  1YHQ N;  4B9U A;  4B8A B;  4C23 A;  2NZT A;  3SZ2 A;  2GEM A;  1FH3 A;  4W5T A;  3VQP A;  2P9S A;  2OPP A;  4ILJ A;  3QML A;  2VY6 A;  4E0D A;  3VQ5 A;  4ZTJ A;  3CJ9 A;  3WXI A;  1M1K O;  2GWK A;  3CC2 N;  1BIU A;  1C1A A;  5GAE P;  1C56 A;  1ZVE A;  1RCH A;  5HRR A;  2Y1I A;  3MN5 A;  3THW B;  3BZC A;  1YT3 A;  3VQ6 A;  3W0L A;  4JI5 K;  5AZI B;  4QAG A;  4PHT X;  4QS8 A;  2OZM A;  4RW6 A;  4CJ5 A;  2V7Y A;  1SL2 A;  5BRF A;  1N5Y A;  1A5W A;  4DR6 K;  3N4P A;  1MA9 B;  1NU0 A;  3AA2 A;  3MAQ A;  2CGK A;  3OYG A;  4LFA K;  1QZ6 A;  3T1A A;  2BE2 A;  4CZK A;  2KHO A;  3PX4 A;  4JKD A;  4WFA L;  1EWR A;  1TK8 A;  4GVM A;  5KQ8 A;  4B9M A;  1VAZ A;  2QXF A;  2UUC K;  1HPZ A;  1D9F A;  3ZYY X;  2VQF K;  4H4M A;  1L5U A;  3DLG A;  3I0S A;  4OPK A;  3VEW A;  4C1N K;  4DHY A;  2MN5 A;  4BDY A;  2R7Y A;  3C6T A;  3DLK A;  2GWJ A;  3WEE B;  2QXL A;  2VWJ A;  3RR7 A;  4BGA A;  5AQH A;  5C42 A;  1W7A A;  1VSJ A;  4F9O A;  1WSG A;  5AQM A;  3U4L A;  2P5O A;  4A5B A;  3LDQ A;  1JCF A;  1T6D A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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