5BN9A

Crystal structure of adp bound human hsp70 nbd mutant r272k.
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 127
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bn9A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bn9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bn9A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bn9A04
4BGAA 5FPMA 2E1YA 3A8YA 2GWJA 4LC9B 4A61A 5BR9A 1NGCA 4YDUC 5AQNA 1BA1A 3D2FA 4XH5A 1NGBA 3BP8A 2F9TA 3RSEB 1H1VA 3FGUA 4M7XA 3LDNA 3FZFA 2CGJA 3VPZA 4WQ4A 2GTDA 3S41A 3VGMA 4H5TA 1DEJA 2P9IB 4EFHA 1K8KA 5FPEA 4BRMA 5BREA 3MN7A 3WXLA 1HLUA 2V7YA 2A41A 3H46O 5ELZA 3U9ZA 5EY4A 2VYPA 3I8BA 4YDUA 4FL9A 4WQ5C 1GLCG 4BREA 3VERA 1BU6O 1ESVA 4BR0A 2E2OA 4JHDB 2QWPA 3DAWA 4B1ZA 3CJ1A 4PKGA 3SK3A 3U9DA 4MLEA 5BRFA 4BG8A 3WT0A 4IZ9A 3FZMA 3J8AA 2FXUA 2E2NA 3QBWA 3O4WA 1ATRA 5AR0A 2P9LA 4ISEA 4BRPA 4EHTA 3ZX0A 4O5FA 3EZWA 4WQ5A 5TKYA 3LL3A 3UKUA 1BO5O 1MWKA 4B1WB 5E84A 2QW9A 3ZETA 3JS6A 1XUPO 4CZFA 1IG8A 3VESA 4BR7A 2P9NA 4FWLA 1K8KB 5AZIB 2Q1NA 2KHOA 3O8MA 3VETA 3CJ7A 3HI0A 3VGLA 3FLCO 4BROA 1GLFO 4FO0A 4JAXA 2E1ZA 3QB0A 4BR9A 1U2VB 2HOEA 2V52B 4BQLA 2ASMA 2P9SB 3L6QA 1U6ZA 1KAYA 4PKIA 2A6AA 2A3ZA 4FPAA 4CZJA 5KQDA 4BRHA 1X3NA 3GBTA 2ASOA 3VGKA 2AP1A 3LDOA 3ID8A 3M6GA 1TYQA 4BRCA 4BVOA 3LDQA 4FWNA 2P9LB 1WOQA 4CZKA 1GLBG 5KPRA 3HM8A 3WQTA 4NB4A 3CJ9A 4H5RA 3ZETB 3ATUA 5AQPA 1Z6RA 3KHYA 4BRLA 4WYBA 3VF6A 2H3GX 4FSVA 2D0PA 2P9NB 4DB3A 1NGFA 1OKJA 5AQYA 4MO5A 5AQRA 2GELA 2IVPA 2QWMA 4CJ7A 5LJVA 3L0QA 2CGKA 2HF4A 1T6CA 3MN6A 3CI5A 1SAZA 3C7NB 5JICA 2FLOA 2YCHA 4CBUA 1QZ5A 5BN8A 4I6MA 5AQOA 2FSNA 2ZGZA 4B1UB 4JHDA 4FWPA 1MWMA 3R8EA 2FSJA 3EL2A 3EN9A 1BG3A 3VEWA 3O5BA 4CBWA 3A5OC 3FZLA 4BRAA 2E2QA 2P9KA 1C0FA 2ZWHA 4BVPA 4GNIA 4CI6A 2CH5A 2NRHA 4H5VA 1NM1A 4BRIA 2FF3B 4C23A 5AQHA 4IXCA 4B1YB 4BRQA 1HJOA 1NGGA 2VWBA 3SMSA 4FWKA 4A2BA 1NGDA 1YUWA 1RDWX 5AZIA 4B9QA 3L4IA 1YVNA 3UKRB 3U4LA 2QWLA 3G25A 4I6MB 5KPTA 2GWKA 2W41A 3BUZB 4BRDA 1U2VA 4DQ8A 2CGLA 5CE3A 2D1KA 4H0OA 3O1WA 2P9SA 1D4XA 1E4FT 1BUPA 1LCUA 2YI1A 3P4IA 3ZX3A 3O80A 3O6WA 2D4WA 3QFPA 4A2AA 4QS9A 2P9KB 1X3MA 3BEXA 3A5NC 4XH4A 1JCEA 4H0YB 3DXMA 4H03B 4FWQA 4BR2A 4H5WA 3R9PA 3DXKB 4FOEA 4A62A 5ADXA 5AQWA 2VCPA 1HKGA 4CZEA 4F9OA 1NWKA 2Q2RA 3EKSA 3ZEUA 2E8AA 3F9MA 5BN9A 4BRGA 5F0XA 5BRHA 1J6ZA 3DJCA 2IVOA 3A5MC 3H1VX 1HX1A 1GLJO 1V4SA 2AA4A 5JMVA 4RWTA 4XEIA 3FZKA 3EO3A 2HMPA 3VF2A 3OHRA 3C7NA 5I9EB 1BOTO 3WXIA 4BQZA 3VEXA 4NO7A 3QMLA 3CETA 1KXPA 3IDHA 4HTLA 5JLFA 4B1VA 3EKUA 1P8ZA 3MN5A 4CBXA 3LM9A 3TU5A 3DXMB 5AQLA 1NMDA 1NGAA 3QDKA 3H1QA 3O1BA 5AFUH 4DHYA 1QQMA 1GLDG 2Q31A 5KQ8A 3QBXA 1GLAG 3WXKA 3MMVA 1E4GT 3WUHA 3ZEUB 4CZGA 3BF3A 4E1JA 3JXUA 3QFUA 2EWSA 2UYTA 2ITMA 2V7ZA 4IWVA 1DGKN 3UB5A 5EOYA 5JLHA 5EVZA 4K25A 1QHAA 1Y64A 5EXWA 3AARA 3A0IX 5AFUA 3UKRA 1Z05A 2QWNA 3I33A 1HUXA 1RGIA 4RCHA 2DPNA 3H3NO 5LJWA 4H0XB 2CH6A 3GOIA 2IVNA 5AQQA 1NGEA 3U8XA 3SLCA 3M1FA 1NLVA 2Q0UA 1SZ2A 3QICA 4AM7A 3IMXA 3ATVA 3WXJA 4M63C 2ZGYA 1XC3A 4BG9A 4CD1A 3AAPA 3M3ZA 2BTFA 4IJNA 2D0OA 4K43A 3VENA 4BC2A 1MA9B 2E88A 4XH1A 2YHYA 4ISFA 3DXKA 3MN9A 4PKHA 4FOIA 1BWFO 4RTFD 3ULEA 5LY3A 5KPZA 1BDGA 5AQMA 4MO4A 4AM6A 2P9UB 1QQNA 4CZIA 2PAVA 1RFQA 3MCPA 2QWOA 4JNEA 4ISGA 3VEOA 3VEVA 4Y0WA 1SQKA 3CQXA 5BPLA 3HTVA 3GG4A 3KZBA 3CIPA 3UE5A 4K41A 2A40A 4FPBA 4FWOA 5AQKA 2A42A 3H45C 1KAZA 3AAQA 4BC5A 3LM2A 5ADXH 3MDQA 4O8KA 2Q97A 3C0BA 2BUPA 1LOTB 3GE1A 1GLLO 5AQTA 4FWSA 4BRFA 3B8AX 3VEYA 3AY9A 2YJFA 4H0TB 3H6EA 1CZAN 4PL8A 2QXLA 2NLXA 1YXQA 5F1XA 2ZF5O 3IFRA 3O08A 4PL7A 3CJBA 1ATNA 4Z94A 4K42A 4BR5A 1ZBSA 5FPNA 3VEZA 5EX5A 4DCHA 3CQYA 3ZX2A 1NGJA 4GY2B 4IJAA 1TUYA 2HF3A 3FFKB 2P9PB 1G99A 1QZ6A 3ULEB 4BRNA 3LDPA 1S3XA 1TUUA 1YAGA 4QS8A 4FWMA 1NGHA 5F2RA 2ASPA 1NBWA 3HBTA 5AQJA 2GUPA 3CJCA 5AQVA 3ENHA 4M7YA 3SJHA 3WEEA 2YHWA 1ZC6A 4CZHA 2OANA 2W40A 3VOVA 5AZJA 2YJEA 3FZHA 2IIRA 2QM1A 3D2FB 3GDQA 3D2EA 5AQUA 1HPMA 1X9JA 4IO8A 2A5XA 5B8HA 3DWLA 3CHWA 1JCGA 2PBDA 2FSKA 3A5LC 3R6MA 4BC3A 2QWRA 4BR4A 5BRDA 4H0PA 3BF1A 3HZ6A 3IUCA 3D7EO 3HSCA 1HKBA 2Q0RA 3H3OB 1V4TA 2I7PA 4FWRA 4MLHA 3FR0A 3CJAA 1MDUB 4H0VB 4JD2A 2P9UA 3WEEB 5AQZA 4J8FA 5AQFA 1ZXOA 1HKCA 1T44A 1XQSC 1S22A 5AZJB 1QQOA 3UKUB 3D2EB 3TPQA 1C0GA 2F9WA 2YHXA 4BC4A 2E20A 4EAHD 5AQSA 1DKGD 1JCFA 2E2PA 2I7NA 3RSEA 1NGIA 3LDLA 4KBOA 1R59O 3ENOA 5AQXA 4EIAA 5AQIA 5FPDA 4H5NA 2P9IA 1IJJA 5E26A 4JN4A 2GEMA 5BPNA 1T6DA 4BRKA 4BGBA 3SMPA 5BPMA 3FE1A 2QWQA 2V51B 2P9PA 1KAXA 4L3QA 3VF4A 4B1XB 3CERA 3W0LA 2J4RA 2WUSA 4CD3A 4JD2B 1Q18A 3KVGA 1GLEG 4QS7A 3WQUA 3MK6A 2FF6A 1WUAA 1TYQB 1BA0A 2Q36A 4CZMA 4HWIA 4WQ4C 3GL1A 1EQYA 2NZTA 4EHUA 5AQGA 3W3DA 1ATSA 4CZLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ZBLA 3EY1A 2OTLN 3LALA 4A61A 1HMVA 1WMTA 1I39A 4CJFA 5BR9A 4JK8A 1JKHA 3D2FA 1NGBA 3BP8A 4KTWA 4DWIA 3LDNA 4DR6K 3F5TA 4I7FA 3S41A 3T3FA 1P00A 3TABA 4OPHA 1K8KA 3VQDA 4UY8O 2HHVA 2V7YA 2A41A 5ELZA 4J2DA 3U9ZA 4CEEA 3QEIA 2E3GA 4FL9A 4BR0A 1BU6O 3OYCA 2HHHK 2QWPA 4BY9C 3AGRA 4MLEA 1L3UA 5HOOA 5DMRA 1SKWA 3KIOA 3FZMA 3DRPA 4RW7A 3O4WA 1TGOA 2HBLA 3MWTA 4B9LA 2KSKA 4O5FA 1XWLA 3IRXA 2O4GA 1BO5O 1N33K 2QW9A 1YJWN 3EE8A 1CXUA 4CZFA 1RDAA 1WAFA 4BR7A 1BCMA 4JI4K 3OYBA 4FWLA 4V1DC 3O8MA 4M3TA 1DQ7A 4FO0A 4CGFA 2WC9A 4JKHA 4BR9A 1U2VB 5IWAK 3P39A 4DR3K 3KTQA 1L5UA 4BQLA 1TKZA 3RTVA 2P9SB 1NG9A 1BK8A 3CCLN 4PKIA 1A5VA 2HHWA 2O8CB 4FPAA 3AVBA 2Y1IA 1HR0K 3LDSA 4AQYK 2ASOA 2FBVA 5DM7L 5HROA 1TYQA 3AVIA 3MXMA 3RR7A 3LDQA 3CM6A 1QE1A 1NK7A 1IKYA 1VNBA 3H08A 1DT9A 1VSMA 3ZLJA 3THXB 5KPRA 3J7ZO 4O0IA 1HJRA 3KHYA 4WYBA 5C0YA 2O8FB 1JZBA 4B3MK 3AO4A 3TSUA 4KHYA 4CJUA 1UA0A 3V81A 3EE9A 5J1EA 4JK7A 5AQYA 3E9LA 2HHQA 4N76A 1I3AA 1CZBA 1KVCA 3DLGA 2QXFA 2XO7A 2C1IA 1S1VA 2CGKA 2HF4A 3QO9A 1VNAA 1Q81O 4CBUA 1CN2A 5CZ1A 4RW6A 1C1AA 2FSNA 1J54A 3J80O 4CHPA 4FWPA 1ZFUA 2YILA 1BG3A 2ZJQL 3QIPA 2HHIA 4B9TA 1YJNN 1B7DA 4BRAA 1T3VA 1TL3A 1C0FA 1NJZA 4H5VA 1NM1A 5FRMA 1ILYA 2P1JA 5AQHA 3SV4A 4B1YB 3WXMB 3VMFB 3MX5A 3I0SA 3NF6A 4GV3A 2IS3A 2DFEA 4X66K 4DUYK 4DV0K 1NGDA 1YUWA 5GAHP 4Z4GA 1VQNN 4FJKA 3G25A 4I6MB 4BRDA 1IBMK 1U2VA 4DQ8A 2D1KA 1T8EA 2OZMA 2P9SA 3NAEA 4GVMA 2O8CA 1BUPA 4NYNA 3HT3A 3P4IA 3DLEA 2XY8A 3CCMN 3KKSA 2HBKA 1UA1A 3TARA 1Q8IA 2D4WA 4QS9A 1X3MA 4XH4A 3OYFA 2OCEA 2WOMA 3DXMA 4H03B 4OPAA 4BR2A 4E0DA 3QLHA 3DXKB 3THXA 3TAFA 3QETA 4N41A 3ENBA 5JS2A 1L3SA 1B9FA 3F9MA 3T69A 5HRNA 4QAGA 3BDPA 2UXDK 2IVOA 3A5MC 3H1VX 1EXQA 1GLJO 1V4SA 2GMOA 5JMVA 4M3XA 1XNRK 4H4MA 1FW6A 3CPEA 5EU7A 1DTQA 1N36K 1B92A 2YNHA 3QEWA 4CESA 1K8AO 4O55A 3ZT1A 4BQZA 3HYFA 3TAMA 4DG1A 4IOCL 1KXPA 4K8XA 4B1VA 4FZXC 4NXNK 2EX3A 4GV6A 3EKUA 1POIA 3M8RA 3MN5A 2JWLA 4I2QA 3LM9A 2E3FA 4OVLA 1KVBA 1OVQA 1U47A 3CXCM 3QBXA 1GLAG 4J2BA 2FBTA 4KB1A 5A2QO 4IEIA 3QFUA 3LWLA 4UJ0A 4CJ3A 4QCLA 1EX4A 3DI6A 3CFPA 3UB5A 4WCEL 4WFNL 3CCVN 4C8OA 4FYDA 3VQEA 5M1QA 3ASMA 1VSEA 3AA2A 1RT6A 1ZBFA 3A0IX 5AFUA 2QTDA 3AVHA 3CFOA 4KKOA 4RCHA 3O3HA 4YOVA 1TK8A 1G15A 1Q82O 3GOIA 1D5AA 1C0MA 2QI2A 1PE4A 1SS6A 5DK5A 3HSTB 4M63C 3TSPA 3NF9A 1VRTA 4BG9A 2BRZA 2D0OA 1WNSA 1YTAA 3LAMA 4RG8A 3SQ1A 3DXKA 2OZSA 3ZSOA 2LY6A 1RT2A 4FOIA 2KTQA 4DSIA 4AM6A 4C8NA 4BECA 3MCPA 3VEOA 4ISGA 3CQXA 3GG4A 3CIPA 2A40A 1RTDA 5AQKA 2A42A 1VQ9N 3H45C 1XC9A 1NK5A 4BC5A 3RMAA 4LF5K 4O8KA 3C0BA 4I2PA 4H8KA 2BUPA 3GE1A 4KHNA 2E0HA 4CEZA 3K9KA 1QSLA 2I61A 4JI3K 1IKWA 4H0TB 1CZAN 4PL8A 3NCIA 5F1XA 5KRTA 4K8ZA 3CJBA 2HNDA 4BACA 1RT7A 4DS4A 3O9UA 4K42A 1OZZA 4FLVA 1ZBSA 5FPNA 1S1XA 2GBZA 3O9SA 1SEGA 2I5JA 3C6HA 3DLKA 2P9PB 4IEEA 4FLUA 2X6NA 3LDPA 3OYJA 3WNFA 2W6LA 4DU4A 1NGHA 2ASPA 1NBWA 5KTQA 5AQJA 4M7YA 3WEEA 3OJSA 3CC2N 2OANA 4KTQA 2JLEA 4CGHA 4AHSA 2QEXN 2RKIA 3M8PA 3FZHA 1RBUA 3V4IA 4W5NA 1XI1A 5AQUA 2KKZA 1EP4A 1L3VA 3AA3A 1RT5A 4DR1K 3DWLA 1TKXA 3OYNA 3KLIA 5M1PA 4BDZA 4KO0A 4BC3A 4BR4A 2LR3A 5BRDA 3TTFA 4OPKA 4KV8A 5TKWA 3AO5A 4FJNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1ZBL A;  3EY1 A;  2OTL N;  3LAL A;  4A61 A;  1HMV A;  1WMT A;  1I39 A;  4CJF A;  5BR9 A;  4JK8 A;  1JKH A;  3D2F A;  1NGB A;  3BP8 A;  4KTW A;  4DWI A;  3LDN A;  4DR6 K;  3F5T A;  4I7F A;  3S41 A;  3T3F A;  1P00 A;  3TAB A;  4OPH A;  1K8K A;  3VQD A;  4UY8 O;  2HHV A;  2V7Y A;  2A41 A;  5ELZ A;  4J2D A;  3U9Z A;  4CEE A;  3QEI A;  2E3G A;  4FL9 A;  4BR0 A;  1BU6 O;  3OYC A;  2HHH K;  2QWP A;  4BY9 C;  3AGR A;  4MLE A;  1L3U A;  5HOO A;  5DMR A;  1SKW A;  3KIO A;  3FZM A;  3DRP A;  4RW7 A;  3O4W A;  1TGO A;  2HBL A;  3MWT A;  4B9L A;  2KSK A;  4O5F A;  1XWL A;  3IRX A;  2O4G A;  1BO5 O;  1N33 K;  2QW9 A;  1YJW N;  3EE8 A;  1CXU A;  4CZF A;  1RDA A;  1WAF A;  4BR7 A;  1BCM A;  4JI4 K;  3OYB A;  4FWL A;  4V1D C;  3O8M A;  4M3T A;  1DQ7 A;  4FO0 A;  4CGF A;  2WC9 A;  4JKH A;  4BR9 A;  1U2V B;  5IWA K;  3P39 A;  4DR3 K;  3KTQ A;  1L5U A;  4BQL A;  1TKZ A;  3RTV A;  2P9S B;  1NG9 A;  1BK8 A;  3CCL N;  4PKI A;  1A5V A;  2HHW A;  2O8C B;  4FPA A;  3AVB A;  2Y1I A;  1HR0 K;  3LDS A;  4AQY K;  2ASO A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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