1NGH | Genus

Total Genus 125

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	125
sequence length	378
structure length	378
Chain Sequence	GPAVGINLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule keywords	HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
publication title	Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment. pubmed rcsb
source organism	Bos taurus
molecule tags	Hydrolase(acting on acid anhydrides)
total genus	125
structure length	378
sequence length	378
ec nomenclature	ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date	1994-05-17

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.30.30	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Defensin A-like	Defensin A-like	1nghA02
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1nghA01
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1nghA03
3.90.640.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Actin; Chain A, domain 4	Actin; Chain A, domain 4	1nghA04

3R8EA 5I9EB 2P9KB 3QB0A 5AQWA 3O1BA 1D4XA 4BRDA 3QMLA 4JHDB 5AQOA 1BA0A 1ZBSA 2FSJA 3CJCA 4BR7A 1HX1A 3RSEB 2QWNA 4BC2A 4IO8A 4BGAA 1KXPA 5FPMA 1SZ2A 3ENOA 3QICA 5B8HA 2CH6A 1X9JA 4WQ5C 4JAXA 1QHAA 4K42A 3ENHA 5AZIB 3DXKA 3WEEB 1NGCA 1BU6O 3WXJA 3H46O 4BRPA 3VGMA 3CJAA 3ATVA 2FXUA 3M6GA 3B8AX 4B9QA 3O5BA 3MN5A 5AQXA 1GLDG 2F9WA 2ZF5O 5AZJB 4FPAA 1ZXOA 3FZMA 3CQYA 2D0OA 4CZGA 4FO0A 1U2VB 2BUPA 2QWRA 1JCEA 1G99A 1X3NA 1RGIA 3QFPA 2Q0RA 2ITMA 5LJWA 1DEJA 4EFHA 2E1YA 3JXUA 3H45C 4MO5A 3MN7A 4FWSA 4CD3A 4PKHA 4ISGA 1NGAA 4MO4A 1ATSA 3M1FA 5JLHA 5F1XA 3HZ6A 1E4GT 3FZHA 3IFRA 4PL7A 3KHYA 3VEVA 3CHWA 5AQPA 1LOTB 4M7XA 5AQIA 4XH1A 3U4LA 2Q0UA 4BRMA 2W40A 3VGKA 3F9MA 4BRGA 5AQZA 1NM1A 2V7YA 4K25A 4BQLA 1DKGD 3M3ZA 4B1ZA 1MWKA 3EKUA 4WQ4C 3L4IA 4DB3A 4DCHA 3KZBA 4B1YB 1P8ZA 4CZKA 2E2OA 3FZFA 4NB4A 3BEXA 5AQJA 3IDHA 4FWPA 2NZTA 2VCPA 4JD2B 4JNEA 4JHDA 4H0PA 4MLEA 4H5VA 3LDOA 5AQFA 2D0PA 2P9PB 5KPTA 3RSEA 4E1JA 1SAZA 5AQYA 1Z05A 2YJEA 4F9OA 3GE1A 3EL2A 4LC9B 3FLCO 4RWTA 3J8AA 2ZGYA 2FLOA 2P9LB 3LM9A 1E4FT 3S41A 1YXQA 3AAQA 4CI6A 2VWBA 5AQRA 2I7PA 5AZIA 3WEEA 3EZWA 4ISEA 1S3XA 1BA1A 4Z94A 5ADXH 1U6ZA 4YDUC 1NGFA 2QWMA 2GEMA 5EOYA 2YJFA 1BG3A 2Q97A 1MDUB 2QW9A 5BRDA 1U2VA 3LDPA 4EAHD 5E84A 3A5LC 3CJ1A 3G25A 4GY2B 4AM6A 5BPNA 3A0IX 4BG8A 3ULEB 4DHYA 4CBXA 1BO5O 4RCHA 1QQNA 1LCUA 3A5MC 4JN4A 4BRHA 2P9UB 1R59O 2IVNA 1JCGA 3DXMB 1YUWA 3HBTA 1NLVA 5BN8A 1T44A 5JICA 3CJ9A 3VPZA 4PKGA 5BN9A 3UKRB 4K41A 3W3DA 3VOVA 4EHUA 2PAVA 2E2PA 3UE5A 5AQGA 1KAYA 1HKGA 5AQMA 2WUSA 4M63C 3H3OB 5KQDA 3CIPA 3O6WA 2FSNA 3L6QA 5AQNA 4HTLA 4L3QA 4CBWA 2YHXA 4BR2A 2CGKA 3DWLA 4C23A 3GOIA 2H3GX 5KPRA 2YCHA 3VEWA 3QBWA 2A42A 5AFUH 3VF4A 1TYQB 1GLJO 2GELA 1EQYA 1HPMA 1MWMA 3A5OC 1WUAA 2BTFA 1NGGA 2Q2RA 4WQ5A 4BRQA 4BVPA 4JD2A 3H6EA 3LL3A 2FSKA 3EN9A 2W41A 3ZX3A 2P9PA 2D4WA 3UKUB 3O8MA 3H3NO 3O08A 4BRAA 3MCPA 4HWIA 2P9IB 2YI1A 3I33A 2E88A 1J6ZA 3LDQA 1NGEA 1GLAG 2VYPA 3BUZB 3ZEUB 2QM1A 4BR0A 2KHOA 5BREA 4M7YA 4BC3A 1QZ5A 3C7NB 4J8FA 4IJAA 2A6AA 1YVNA 3HSCA 3MDQA 4FSVA 3GG4A 2A40A 2P9NB 3IMXA 5BR9A 3D2FB 4CZFA 3WUHA 1XUPO 1QZ6A 4BC5A 4XEIA 4BVOA 2NLXA 1Y64A 2PBDA 4CZLA 4BQZA 4CD1A 3AAPA 3ULEA 3VF2A 2IIRA 2ASPA 3D7EO 3HM8A 2CH5A 3ZETB 3VF6A 3MK6A 2YHYA 4I6MB 3DJCA 3FZKA 3VEYA 2E20A 1V4TA 2D1KA 2P9KA 5FPNA 4WQ4A 3O1WA 4A61A 1CZAN 3WXIA 2HMPA 3VESA 2Q31A 4A2AA 1ATRA 4O5FA 1HUXA 3QFUA 1H1VA 4FWLA 1T6DA 1IJJA 2DPNA 5AQVA 3C0BA 5EXWA 3SLCA 1Q18A 2QWPA 4QS9A 3ATUA 4AM7A 3FZLA 1JCFA 5LY3A 1GLEG 1TYQA 3LDLA 3R9PA 4CJ7A 4CZHA 1DGKN 2P9SB 4B1VA 4KBOA 1C0FA 5AZJA 3ZX0A 5AQLA 4H0XB 5KPZA 3O80A 4H0OA 2E1ZA 1NGJA 2YHWA 1C0GA 1ZC6A 3A5NC 3GBTA 4MLHA 1NBWA 2HF3A 4FPBA 5F2RA 3LDNA 4CZEA 5TKYA 2P9IA 5LJVA 1GLCG 2J4RA 3HI0A 4IWVA 3R6MA 3ZEUA 4BROA 4DQ8A 4BRFA 3KVGA 5EVZA 2V7ZA 4BGBA 2E2QA 2IVPA 3FE1A 3C7NA 5AR0A 2F9TA 3SK3A 4EHTA 3VEXA 1BOTO 2P9NA 1BDGA 2E2NA 3BF1A 1NWKA 4FOEA 4FWRA 1MA9B 1HLUA 5BPLA 4IJNA 1SQKA 4H5TA 2GUPA 3CI5A 3VEOA 3U8XA 5ELZA 5KQ8A 2ZGZA 1OKJA 5AQUA 4B1UB 3WT0A 3ZETA 1QQMA 3ZX2A 2Q36A 4H5RA 4I6MA 1NGBA 4BR4A 2A41A 3D2EB 4PL8A 4QS8A 3U9DA 4QS7A 2NRHA 4BREA 1GLBG 4EIAA 3ID8A 4H5NA 1NMDA 3O4WA 2GWJA 1NGIA 3WXLA 3VEZA 2GWKA 2V51B 3BP8A 4FWMA 2P9LA 1NGDA 5AQHA 2IVOA 1K8KB 1RDWX 3CETA 4XH5A 4H0YB 4H0VB 1T6CA 3W0LA 5BRFA 2EWSA 1XC3A 5AQQA 1YAGA 4WYBA 1QQOA 3VERA 3L0QA 4A62A 2Q1NA 3LM2A 1TUUA 4IXCA 3JS6A 3TPQA 5F0XA 1X3MA 4BRLA 2CGJA 1BUPA 2P9SA 4ISFA 1XQSC 1IG8A 3H1QA 3EKSA 3DAWA 3SMSA 2A3ZA 4BR9A 4IZ9A 2QWQA 3QBXA 2ASMA 4FWKA 3UB5A 3VENA 3GL1A 1HKBA 5ADXA 2P9UA 1S22A 1BWFO 3DXMA 1TUYA 2E8AA 5BPMA 3GDQA 3VGLA 1KAXA 1ATNA 5FPDA 3FFKB 3VETA 3UKRA 4CZIA 3CERA 4H03B 1GLFO 2QWOA 4CBUA 4B1XB 5EY4A 3I8BA 2A5XA 3DXKB 5AQTA 2OANA 4O8KA 4RTFD 3CQXA 3WXKA 4BRIA 3FR0A 2GTDA 4BRNA 2FF6A 5CE3A 4PKIA 1GLLO 2HF4A 3EO3A 5JMVA 4K43A 2AA4A 4Y0WA 5AQKA 5FPEA 1ESVA 4FWNA 3WQUA 4BR5A 5AQSA 1Z6RA 2ASOA 2UYTA 1NGHA 5JLFA 1RFQA 4BRCA 2CGLA 4GNIA 2V52B 3SMPA 4BG9A 3TU5A 4FOIA 4H0TB 3FGUA 3H1VX 3A8YA 3BF3A 5E26A 3CJ7A 3D2EA 2QXLA 3IUCA 1WOQA 3MN6A 3MN9A 3CJBA 4FL9A 4FWOA 2AP1A 4YDUA 1HJOA 3UKUA 4FWQA 1HKCA 4A2BA 1KAZA 3QDKA 3HTVA 2HOEA 4H5WA 1V4SA 5BRHA 4CZMA 4NO7A 5AFUA 3MMVA 4BC4A 2I7NA 5EX5A 1K8KA 4BRKA 3AY9A 4CZJA 4XH4A 2QWLA 3P4IA 3WQTA 3D2FA 4B1WB 3OHRA 3U9ZA 3SJHA 2FF3B 2ZWHA 3AARA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

4Z0UA 2XY8A 2KZZA 5AQWA 1D4XA 4FJ7A 2R7YA 3MXJA 3LP3A 1HNIA 3CJCA 3CC2N 4BR7A 1HX1A 1KXPA 2W00A 1Q9XA 5FPMA 3S3MA 2LT8A 2CH6A 4ILHA 1X9JA 4JAXA 3K0SA 4K42A 3WEEB 1BU6O 3MCAB 3AVFA 1T0ZA 3DRSA 3L3VA 4KH4A 1WAFA 5C10A 2B4JA 4B3OA 4O5BA 1Z25A 2ZF5O 2UUCK 1POIA 1WSJA 1J5EK 3CQYA 2ZJQL 4IOXA 4KH6A 4FO0A 3OYKA 1WAJA 3C6HA 3P5JA 4CJPA 1RT1A 3U3YA 1U45A 2IOCA 1WBDA 1OVYA 2ITMA 5LJWA 4ILGB 3H45C 3NVKA 3PY8A 3OYNA 1NGAA 1ATSA 4FJIA 4MDAA 2RE2A 3IFRA 3ZSOA 3KHYA 1WSHA 3DYAA 4GMJB 4XH1A 4BRMA 2Q0UA 4CGDA 5KRSA 2V7YA 4K25A 4FM1A 3M3ZA 2OZMA 3F9KA 3HL8A 4DCHA 1IO2A 4Z4HA 4B1YB 2G8FA 4Z4GA 1CZ9A 3RWUA 4CEDA 3RR8A 3FZFA 3R2VA 3BEXA 5AQJA 3DLKA 4E19A 1OH5A 4DSFA 2D5RA 3D6RA 4DV6K 2HBKA 2KTQA 4H0PA 3KD1E 1RILA 2D0PA 3OBWA 2VG5A 3B6OA 3RSEA 4UY8O 3OS0A 3CYGA 4RWTA 3J8AA 1NNEA 2OPQA 4E1MA 3MEEA 4AHUA 2QK9A 2HW3A 4EP4A 1X1PA 1S3XA 1TAQA 3CCEN 2K35A 3T69A 4YDUC 4K8ZA 4JKGB 4PA1A 3OVNA 3QEVA 1YITN 4JI6K 3UIQA 1ZBIA 1XNRK 2Q97A 4ELTA 2VGNA 4KKOA 3B6PA 3HT3A 5M1QA 1HNXK 5E84A 3VN5A 5BR8K 4J2DA 4AM6A 5BPNA 2JWKA 3A0IX 3ULEB 4CBXA 4O55A 1J5OA 4IG3A 1R59O 2IVNA 1JCGA 4AF1A 1JL2A 1IH7A 3J7YP 4YOTA 3OYEA 5BN8A 1T44A 3VPZA 4PKGA 4KYPA 5BN9A 4DFMA 4FLXA 4K41A 3OYLA 4NYFA 3VOVA 3QEWA 3HP9A 3E01A 4DTMA 4M63C 2OPPA 1I6FA 3O6WA 3VTHA 4MDBA 1VQON 1YHQN 1VNBA 3L6QA 1WBBA 5AQNA 4CJLA 4HTLA 1HNWK 4C8LA 4M3UA 2CGKA 1FK9A 4JI4K 4C23A 2O4GA 4BWMA 3GOIA 2H3GX 1T7EA 3QBWA 1T8EA 3R3LA 2GELA 3P31A 4EP5A 2UXBK 1QS4A 4K8XA 4BRQA 1NGGA 4WQ5A 3T3FA 3WNHA 3DMJA 3H6EA 1ASUA 4IG0A 3OS2A 1RBRA 2W41A 4B8AB 2P9PA 2KFNA 4BE7B 4C1NK 4BRAA 3NGIA 3KLEA 5CY0A 3WNGA 4HWIA 3SJJA 4FJHA 2OCEA 3QINA 3I33A 3THWB 1IBKK 3LDQA 4IOCL 4CHOA 3ZEUB 4M3WA 2HNZA 2QM1A 2P5OA 1QTMA 4LSLA 1F21A 4E7KA 1D5AA 1IKWA 2Z1HA 4KI6A 3MDQA 1TK0A 4FSVA 3GG4A 3P1GA 2P9NB 4YORA 3WUHA 4BVOA 4CEZA 4M3RA 1Y64A 3QETA 4JI3K 4JI7K 3KP1A 3VQ6A 4DR6K 1JLQA 3HM8A 1Q9YA 3ZETB 4GW6A 1B92A 2OPSA 3MK6A 4I6MB 1NKCA 3NGYA 1HYSA 2N2RA 2UXDK 5FPNA 4OGCA 4WQ4A 2DFEA 3WXIA 3MAQA 2BANA 4KHYA 1OVQA 4UAEF 2Q31A 4A2AA 4DTXA 1HUXA 1JKHA 4CHZA 4ILJA 3L2RA 2RN2A 3QEPA 5EXWA 1BI4A 3ISNC 1LWFA 4QS9A 1D8YA 2ASCA 1SN1A 4AM7A 3T1AA 1KTQA 3HM9A 4XJXA 1ZYVA 4OLBA 4LH5A 1Z26A 3LDLA 3R9PA 1KCFA 2KGQA 5AZJA 4B1VA 4CF9A 2E5LK 3VA0A 4FJ9A 4WFBL 2BH1A 4H0OA 4FJNA 4FK2A 4JK9A 1NGJA 3BZCA 4CEOA 3SAHA 3GBTA 3NAEA 4BACA 4FPBA 3KOXA 3CCVN 1BIUA 3OS1A 1P0AA 2J4RA 1RT7A 3R6MA 4FW2A 2E6MA 4LFCK 1S6PA 4ID1A 5EVZA 2V7ZA 2HNYA 3C95A 4E72A 2KQ2A 3C7NA 2WONA 5AR0A 2QI2A 3JAMO 1OMYA 4RW8A 3MWTA 3VEXA 4B9MA 1BOTO 4CHYA 1BDGA 1S1VA 4B3SK 2KYQA 4GKJK 2X6SA 3ZSZA 3TTFA 4X65K 3AO4A 3OYIA 2NRVA 5KQ8A 1NK7A 3CXCM 3M5RA 4IFVA 5HOOA 1NKBA 2HVIA 5KI6A 4FW1A 4F4KA 4B1UB 2D0BA 2Q36A 1QVGM 1NGBA 4QS7A 1BCGA 1JXEA 5JENA 3E9OA 3L4QA 2F96A 4EIAA 4H5NA 2GWJA 1NGIA 3VEZA 4CHNA 4FWMA 1NGDA 4JKBA 3V1RA 1DTTA 3P83D 4DR5K 3DOKA 4XH5A 4B3TK 2AJQA 5BRFA 3J7ZO 2ZM6K 1XC3A 4M41A 3LZJA 2P1JA 4DF4A 4CEFA 1TUUA 3OYCA 3TPQA 2E3GA 4BRLA 2P9SA 4ISFA 3ITHA 1DT9A 3H1QA 3MXMA 1L5UA 4BR9A 3QBXA 2GX9A 1S5JA 2YX6A 1ZYWA 2G8WA 1HKBA 5ADXA 5GADP 2P9UA 3IAYA 2QA4N 2P5GA 4BEBA 3VGLA 5C42A 3M8SA 4M3XA 1S1WA 3QI7A 3UKRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4Z0U A;  2XY8 A;  2KZZ A;  5AQW A;  1D4X A;  4FJ7 A;  2R7Y A;  3MXJ A;  3LP3 A;  1HNI A;  3CJC A;  3CC2 N;  4BR7 A;  1HX1 A;  1KXP A;  2W00 A;  1Q9X A;  5FPM A;  3S3M A;  2LT8 A;  2CH6 A;  4ILH A;  1X9J A;  4JAX A;  3K0S A;  4K42 A;  3WEE B;  1BU6 O;  3MCA B;  3AVF A;  1T0Z A;  3DRS A;  3L3V A;  4KH4 A;  1WAF A;  5C10 A;  2B4J A;  4B3O A;  4O5B A;  1Z25 A;  2ZF5 O;  2UUC K;  1POI A;  1WSJ A;  1J5E K;  3CQY A;  2ZJQ L;  4IOX A;  4KH6 A;  4FO0 A;  3OYK A;  1WAJ A;  3C6H A;  3P5J A;  4CJP A;  1RT1 A;  3U3Y A;  1U45 A;  2IOC A;  1WBD A;  1OVY A;  2ITM A;  5LJW A;  4ILG B;  3H45 C;  3NVK A;  3PY8 A;  3OYN A;  1NGA A;  1ATS A;  4FJI A;  4MDA A;  2RE2 A;  3IFR A;  3ZSO A;  3KHY A;  1WSH A;  3DYA A;  4GMJ B;  4XH1 A;  4BRM A;  2Q0U A;  4CGD A;  5KRS A;  2V7Y A;  4K25 A;  4FM1 A;  3M3Z A;  2OZM A;  3F9K A;  3HL8 A;  4DCH A;  1IO2 A;  4Z4H A;  4B1Y B;  2G8F A;  4Z4G A;  1CZ9 A;  3RWU A;  4CED A;  3RR8 A;  3FZF A;  3R2V A;  3BEX A;  5AQJ A;  3DLK A;  4E19 A;  1OH5 A;  4DSF A;  2D5R A;  3D6R A;  4DV6 K; 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1NGHA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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