2ASOA

Structure of rabbit actin in complex with sphinxolide b
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structures of microfilament destabilizing toxins bound to actin provide insight into toxin design and activity
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 129
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asoA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2asoA03
1ZC6A 3CJ9A 2I7PA 1MWMA 2HMPA 3ENOA 2D4WA 4PL7A 2F9WA 1V4TA 2PAVA 4K25A 1MDUB 4IJNA 3L0QA 5KPZA 1H1VA 5AFUA 4K43A 4WQ4A 2QWPA 3O1WA 4JD2B 4MLHA 1HKBA 3CJ1A 4BRLA 1KAZA 5KQ8A 2FF3B 3F9MA 4EHTA 3H3OB 1HKGA 1NGAA 4MO5A 3GG4A 4BR5A 3WXJA 5ADXA 2H3GX 3IFRA 4FWOA 2HOEA 3QICA 4L3QA 4ISGA 3GOIA 3LM2A 4CJ7A 1NGFA 3ATVA 4YDUC 2A42A 3SK3A 3VESA 4BG8A 3HI0A 5AQMA 3SJHA 2E8AA 3VEWA 5AZIA 2P9PA 4FWNA 4H5RA 3GL1A 1JCFA 2IVPA 2GELA 5E84A 2Q0UA 3VGMA 2P9KB 1TYQB 1NGJA 5EOYA 1K8KA 2E1ZA 4BROA 1MWKA 2HF4A 4BGAA 1NGBA 2NLXA 1KXPA 2EWSA 3KHYA 5AQNA 1X3NA 5AQIA 3IUCA 4BGBA 5EVZA 5FPMA 2ZGYA 4H0OA 3R8EA 1GLJO 3ZETB 5AR0A 2J4RA 4LC9B 2ASOA 1U6ZA 2NRHA 4EIAA 5AFUH 2P9SA 1BUPA 4H03B 1MA9B 4PKGA 1ATNA 2CH6A 3QB0A 3DXKA 1T6DA 2QWQA 2V52B 3M1FA 4KBOA 4BRKA 4K42A 2ZGZA 1E4FT 3DWLA 5AQVA 4CZJA 3IMXA 1X9JA 1DEJA 1NGIA 3H1VX 4BRMA 4BRDA 5EX5A 1IG8A 2GUPA 1G99A 4B1XB 3IDHA 4H5TA 4A61A 3H45C 3WXKA 5BPMA 1XC3A 4H5WA 2YCHA 3SMSA 4H0TB 4BQZA 3H46O 3DXMA 2QWMA 1NLVA 1NMDA 4H0XB 3VEOA 4B1UB 3O1BA 1Z05A 4AM6A 4RWTA 2HF3A 3D2EA 3CHWA 5AQSA 4FPBA 4A62A 4DHYA 3VETA 3ZX2A 1HLUA 4MLEA 4EFHA 3U9ZA 1E4GT 2Q36A 3VOVA 5AQFA 1NGEA 4BRHA 5JICA 4BRFA 3HBTA 3BP8A 3UKUB 3U9DA 4B9QA 3WEEA 4BREA 4J8FA 1S3XA 3ZEUB 4QS7A 4FL9A 5BR9A 4AM7A 2YHXA 1NGHA 1WOQA 5AQWA 5AQXA 3A5OC 3EO3A 4XEIA 1HX1A 2P9UB 4JHDB 4I6MB 4H0VB 1JCGA 1RDWX 1QZ5A 1XQSC 2QWRA 3O5BA 4PKIA 4CZLA 5AQJA 3RSEB 2Q1NA 3BF3A 3DJCA 4NO7A 4CD3A 4O8KA 4BRPA 2W40A 2FF6A 2P9IA 3FLCO 5AQHA 4BR7A 2GEMA 2VYPA 2YJEA 1X3MA 4ISFA 4RTFD 4F9OA 4FWQA 2Q2RA 3C7NB 4FWKA 4B1ZA 1U2VB 5LY3A 1QQOA 2Q97A 4PL8A 5JLFA 2FSJA 4BR9A 1GLFO 4BC4A 2P9NB 2QWNA 4FSVA 2QM1A 3O80A 4FWRA 5BRHA 1V4SA 3VERA 3O8MA 3VF2A 5B8HA 1R59O 3KZBA 1P8ZA 1QQMA 3C0BA 3QBWA 3WT0A 1HJOA 2PBDA 3AAPA 2D0OA 3CJCA 1GLDG 5AQPA 1ZXOA 3FFKB 3MN7A 4BRAA 3A5MC 3FZKA 3DXKB 2QWOA 3AAQA 2VCPA 2F9TA 1TUYA 3GE1A 3M6GA 5BN9A 3A5NC 4BRNA 4JD2A 1BOTO 4BR2A 3CQYA 4B1WB 5AQKA 4FO0A 1Z6RA 3WQTA 1Y64A 4BRIA 3R9PA 4B1YB 1ATRA 5I9EB 3G25A 4FOEA 1SQKA 2ASMA 2P9LB 5AQGA 2OANA 2ZF5O 3VEYA 3D2FB 4JAXA 5JMVA 5LJVA 2FXUA 3DXMB 3HSCA 3H6EA 1BA0A 3CQXA 3ULEB 3VGKA 1QQNA 2E20A 3D2EB 5EXWA 4JNEA 3H3NO 5F2RA 4FWPA 4YDUA 2AA4A 2CGLA 1RFQA 2V7YA 2GTDA 3W0LA 1TYQA 2A6AA 5AQTA 3VF6A 4HWIA 5AZJB 4BRQA 1NGCA 3O4WA 5F1XA 2E2OA 3QBXA 3EZWA 3HM8A 3LM9A 4BC2A 1DGKN 1J6ZA 4FWMA 3S41A 3EKUA 3P4IA 2D1KA 2I7NA 5AQYA 3CIPA 3WUHA 3MCPA 3UKRB 3ATUA 3MDQA 4FWLA 3MK6A 3MN5A 1WUAA 3L6QA 3LDLA 2KHOA 3BUZB 3ZETA 1T44A 4HTLA 1XUPO 3M3ZA 4Z94A 1BU6O 2FSNA 1YAGA 3CJ7A 4WQ4C 4BR0A 4IJAA 5ELZA 1ZBSA 1YVNA 5AQOA 3TPQA 2ITMA 5AQUA 4H0YB 3FZLA 4DQ8A 1LOTB 5F0XA 3QFPA 4CD1A 3JXUA 4BC3A 3D7EO 1RGIA 4CBWA 3LL3A 5AQRA 3FZMA 5TKYA 3CJAA 3EN9A 1ATSA 4ISEA 1SZ2A 4K41A 4BQLA 5JLHA 2QWLA 5KQDA 3OHRA 5AQZA 3QFUA 3VEVA 1BA1A 3O6WA 3EKSA 1GLEG 1HKCA 4BRGA 3MN9A 3VF4A 4B1VA 1D4XA 4CBUA 4EHUA 4RCHA 3SLCA 4C23A 1BO5O 3AARA 5AZIB 1YUWA 2P9PB 2YHWA 4GY2B 5BRFA 5FPEA 2D0PA 3CETA 4M63C 3UKUA 3CERA 2QW9A 2A40A 3ZEUA 3ZX0A 3FR0A 1K8KB 3B8AX 1CZAN 2DPNA 1GLLO 4CBXA 1KAYA 3I8BA 3HZ6A 1HPMA 2NZTA 3BF1A 1EQYA 5BN8A 2CGJA 4H0PA 3FZHA 3EL2A 1T6CA 3A5LC 4PKHA 1GLAG 2P9UA 3CI5A 4JHDA 4I6MA 4CZFA 3J8AA 1NWKA 4WQ5A 2P9SB 3A0IX 2FLOA 3RSEA 5KPRA 3QMLA 3VEZA 1QZ6A 4IWVA 3ENHA 1Q18A 4O5FA 4BR4A 4FPAA 3LDPA 2GWJA 5E26A 3FGUA 3R6MA 2QXLA 1IJJA 3C7NA 4CZMA 1GLBG 3LDOA 1NM1A 2UYTA 2AP1A 2ZWHA 1C0FA 5BPNA 1OKJA 1NGGA 1U2VA 2VWBA 4IZ9A 3L4IA 2P9NA 2YHYA 2YI1A 3O08A 2V7ZA 3UB5A 2IVOA 4CZHA 1SAZA 5FPNA 3CJBA 4XH5A 5AQQA 2E1YA 2CGKA 4CZKA 1YXQA 2A41A 5AQLA 4GNIA 3FZFA 1HUXA 4XH4A 4QS8A 5BREA 1LCUA 2P9KA 3LDNA 5BRDA 3SMPA 2E2PA 1BG3A 3WEEB 2CH5A 4IO8A 1S22A 1KAXA 3MN6A 2BTFA 3QDKA 1TUUA 2IIRA 4JN4A 1NGDA 2V51B 4CZGA 5FPDA 3TU5A 4BVOA 5EY4A 2IVNA 4QS9A 4WYBA 3ZX3A 4A2BA 2E2QA 3KVGA 3AY9A 4BVPA 3U8XA 2P9LA 5ADXH 4BG9A 2FSKA 4CZEA 2BUPA 1ESVA 3D2FA 1C0GA 1GLCG 2WUSA 3MMVA 3H1QA 4IXCA 1DKGD 3ID8A 4H5VA 3U4LA 3ULEA 2YJFA 4BRCA 2P9IB 4CI6A 4CZIA 5BPLA 1JCEA 3I33A 4FWSA 3GBTA 3WXLA 3LDQA 4H5NA 2A5XA 3W3DA 2GWKA 3VGLA 2A3ZA 4A2AA 4XH1A 5KPTA 5CE3A 4M7XA 3VPZA 2W41A 3VENA 4MO4A 4DCHA 5AZJA 4BC5A 5LJWA 1QHAA 3JS6A 3WXIA 1BWFO 2E2NA 3UE5A 2Q0RA 3HTVA 3GDQA 3DAWA 3WQUA 2ASPA 3VEXA 4NB4A 4Y0WA 4E1JA 3FE1A 2Q31A 4WQ5C 3UKRA 4M7YA 4FOIA 1NBWA 1BDGA 2E88A 4EAHD 4DB3A 3BEXA 3A8YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5LMUK 3AVNA 3CJ9A 4I7FA 1B92A 2D4WA 3THYB 1VQMN 2GX9A 3K5LA 3SQ0A 1Q9YA 4K25A 4YNQA 1W97L 2WONA 4KHUA 1H1VA 3SQ2A 3EE8A 4E7HA 2QWPA 2FBTA 4QCLA 2Y1JA 2UUAK 4CW7B 1WB9A 4JI5K 3F9MA 4NYNA 1NGAA 4MO5A 3O9UA 3OYAA 3QNOA 1RDAA 3QICA 4CGGA 4L3QA 4ISGA 4CHOA 5KRTA 4CJ7A 3ATVA 1DLOA 2A42A 2WFBA 3SK3A 4YY3K 2FC0A 4EZ6A 1FKOA 5AZIA 1C6VA 3AVHA 4DR2K 4DR6K 2E5LK 1WSGA 3QEVA 2NUBA 1JCFA 2IVPA 2Q0UA 3O3FA 5C0YA 1NK6A 2JLEA 1TYQB 5EOYA 5A2QO 2KLAA 3HO1A 3J80O 2HF4A 2ZJRL 2RE2A 2HMIA 2NLXA 2ATQA 2DY4A 3THVA 5AQNA 1MU2A 3PIPL 3DLHA 1Y97A 2P1JA 4DQRA 4H0OA 3AVGA 1JKHA 4CJUA 4DTMA 1ASUA 2ASOA 5I3UA 3KTQA 4JI3K 2NRHA 5C12A 5AFUH 2P9SA 2HVIA 4AQYK 2YNHA 3D0PA 2O8EA 2QWQA 2ZGZA 5AQVA 4CZJA 3IMXA 4C8NA 1DEJA 4DR3K 3H1VX 3NF9A 4BRMA 4H4OA 1N33K 5HLFA 3VTIA 2GUIA 3CCLN 5EX5A 2GUPA 4B1XB 3IDHA 3U6FA 3ZT3A 1WSJA 3T1YK 4DV1K 3V1RA 2W6LA 3LP2A 2YCHA 4H0TB 4FCYA 3QETA 2QWMA 4OPAA 1NMDA 4H0XB 4IEEA 4B1UB 3O1BA 4AM6A 2HF3A 4PA1A 3I0RA 4C8KA 4FJMA 3ZX2A 4MLEA 2R7YA 3ZT4A 3OW2M 3BP8A 4M3UA 3WEEA 3DRRA 4J8FA 5BR9A 2YHXA 3OS0A 4ZHRA 2HHHK 3VQAA 3K9JA 1Q7YO 2OA8A 4JKGA 2OZSA 4XEIA 3OS2A 1YTUA 3QEWA 1RDWX 1QZ5A 4CK3A 4DF8A 4A5AA 2QWRA 5M1OA 4LF8K 4M3WA 4FLZA 3LWLA 3V1OA 2FF6A 4G1QA 1HYSA 4BR7A 1FK9A 1X3MA 4RTFD 4FWQA 4FZYA 2YHAA 3OYHA 3WXMB 4CGIA 5I42A 3LALA 4BE2A 1QSLA 4GVMA 1VQPN 5JLFA 1D8YA 4BC4A 3NFAA 1W2BM 1HQEA 3C65A 3ZSYA 3L2RA 3O80A 1GOBA 3SQ4A 4DWIA 3VQ5A 3VERA 1ZYQA 5KGWA 5JS2A 2VG5A 1CZ9A 3O8MA 1NKCA 3VF2A 4GW6A 5J2MA 1EWQA 5C42A 3KZBA 4W5NA 3ZT1A 1XHZA 1REVA 1VSHA 2PBDA 4HTUA 3KWGA 1SL0A 3JYTA 3H08A 1N36K 3BY5A 2HBMA 4FXDA 4FK4A 4DF4A 2QWOA 3ITHA 2HHQA 3V81A 3GE1A 3M6GA 1LV5A 3A5NC 4AHVA 3O4QA 1SUQA 3VA0A 4C8OA 1RBVA 1WN7A 3EZ5A 4DR1K 4B1WB 5FROA 4BACA 4CGHA 4QAGA 3J81O 4B1YB 4CJKA 3G25A 3MWTA 5AQGA 2VQFK 3VEYA 3D2FB 3CMEN 4FLTA 1BISA 3DOKA 5HL7L 1BA0A 3CQXA 3G6EN 1QQNA 1RT1A 5GINA 4JNEA 1WSEA 4JK9A 1OH7A 5F2RA 4FWPA 5JS1A 3K5OA 1X9SA 3TAEA 4FK0A 1EXQA 3Q7BA 2UXDK 4L8RB 4A57A 2CGLA 1RFQA 2GTDA 3QESA 3VF6A 2A6AA 4C1NI 4N47A 2DTUA 3AO5A 1NGCA 2OYQA 2E2OA 1BI4A 3QBXA 3R3LA 4Z4CA 4FJ7A 4FJ9A 3RMCA 1N6QA 1I94K 2D1KA 1CXUA 5AQYA 3WUHA 3M8RA 3C6TA 3ZETA 2KHOA 3BUZB 3TR8A 1T44A 4HTLA 4LFCK 2O8CB 3CQ8A 2P5OA 2G8UA 5KI6A 1TK5A 4CF0A 3CCQN 1HQUA 2HBJA 3M3ZA 3TAGA 1YVNA 2QEXN 4HUFA 2IDOA 4JEPA 2JWKA 5AQUA 4H0YB 5CYMA 4FW1A 3DRSA 4BC3A 1RGIA 3LL3A 1RT4A 5AQRA 5TKYA 3HXMA 3SPZA 1ATSA 3QO9A 4DQQA 2RN2A 2RPIA 1OH5A 4B3TK 5C15A 3QFUA 1ASVA 4K8ZA 2DFHA 1SKRA 3MN9A 3VF4A 3PSIA 1D4XA 4DR5K 2IS3A 3LDSA 1U4BA 1IG9A 5AZIB 1ZBUA 1YUWA 2YHWA 3DOLA 5BRFA 1QTMA 4AILC 5C2FA 3UKUA 4YOVA 4N56A 4AHUA 3ZEUA 3FR0A 4AHSA 3B8AX 1D9DA 3MXMA 3LZJA 2DPNA 4W5OA 1KAYA 3I8BA 3CM5A 1C1AA 1RT6A 1S6PA 4JKEA 3WNEA 3QERA 1FW6A 1T6CA 3IKMA 4NCGA 1GLAG 2P9UA 3CI5A 4C8MA 1YJ9N 2P9SB 1BGXT 4W5QA 2O8EB 4M3ZA 4IOXA 3VQCA 2KZZA 4IWVA 3CFRA 4O5FA 3CC2N 3B6PA 4FPAA 3FGUA 1IJJA 3TSQA 4CEEA 4CEZA 2UYTA 3MXIA 1S9EA 4DV7K 2ZWHA 4RG8A 1OKJA 3T1AA 5J2PA 1B9DA 4JKCA 2WBNA 1SL1A 4XJXA 4ELTA 1T03A 2P9NA 1NK4A 2YHYA 3VQBA 3O08A 2V7ZA 2IVOA 1SAZA 4DU1A 1NJZA 5FPNA 1BIZA 3CJBA 1BQMA 4XH5A 1Q86O 4Z4HA 4DTXA 2A41A 2BH1A 5AQLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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