2ASOA

Structure of rabbit actin in complex with sphinxolide b
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
publication title Structures of microfilament destabilizing toxins bound to actin provide insight into toxin design and activity
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 129
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asoA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2asoA03
4WQ5A 2UYTA 3AARA 3D2FB 3ATUA 5JMVA 3KZBA 2HF3A 4FWNA 2QM1A 5BRHA 1X3MA 4H5NA 3IUCA 4XEIA 2KHOA 4BGBA 4C23A 5KPZA 3UKRA 3WEEB 2P9LB 3ZX3A 3TU5A 3GBTA 2IVOA 3L0QA 2FSJA 2YI1A 1G99A 3HZ6A 5AZJB 4I6MA 4B1ZA 2HOEA 4AM6A 4JAXA 3WXIA 4BRGA 4B1XB 1HUXA 3VERA 5JICA 3LM9A 4PKGA 1YAGA 1U2VA 2CH6A 3FLCO 4A62A 1HKGA 2QWLA 1IJJA 1SQKA 1D4XA 3EN9A 1QZ5A 4CBXA 3DXMB 3R9PA 5BPLA 3LL3A 3MN5A 4MLHA 5AQYA 3VEVA 3MN9A 2ASMA 1TYQB 3WT0A 4MLEA 5BRDA 4BVPA 3VESA 1MA9B 2BTFA 3MN6A 4BROA 5AQTA 1Z05A 2IVPA 3QICA 1ATNA 3H1VX 1TUYA 4IWVA 5EVZA 1S22A 2D4WA 2J4RA 4BRAA 5AQRA 4YDUC 4H0VB 3CJCA 4JD2A 1ZC6A 2P9NA 5AQPA 4FWRA 3VOVA 4BRHA 3HI0A 4M7XA 3H6EA 3MMVA 3ULEA 4CZGA 1RFQA 2P9UA 1E4GT 1NGHA 3VGLA 3HTVA 4KBOA 1U6ZA 3FZMA 2F9WA 4FOEA 4QS9A 2PAVA 2HF4A 1GLFO 1MWKA 5AQUA 2QWNA 4B1WB 5BN9A 4CZJA 2Q36A 3KHYA 3FZLA 3U9ZA 1TUUA 2BUPA 3BEXA 3ID8A 5BRFA 3B8AX 3ZETA 2P9SB 1Q18A 1MDUB 3FZKA 4BRKA 4B1UB 1NBWA 3DXKA 2P9IA 3WXJA 5KQ8A 5AQFA 3FGUA 1BOTO 3QFPA 5AQVA 4CBUA 3UB5A 1HPMA 4ISFA 3D2EA 3C0BA 1NGIA 3CQXA 1C0GA 3IMXA 4BG9A 3H46O 4EHTA 4BRPA 4QS7A 4BR4A 1QZ6A 3IDHA 3LDLA 1NGAA 4A2BA 5AZIB 1NGEA 3I8BA 4XH4A 4RCHA 4A61A 1NLVA 1NMDA 2D0PA 3AY9A 1K8KB 4FWPA 4FPAA 4CD3A 1JCGA 4JN4A 2VYPA 1RGIA 1BA1A 4WQ4A 3O1WA 5FPNA 3BUZB 3R8EA 2GELA 2YHWA 4FSVA 2A40A 4EIAA 3FFKB 1S3XA 3VEWA 4BG8A 2ASOA 4H0TB 1BUPA 3SK3A 4QS8A 2Q0UA 4BR9A 3VPZA 3RSEB 2P9KB 4BC3A 3GDQA 4RWTA 1H1VA 4FWLA 4GNIA 3ZEUB 2E2OA 2Q2RA 1KAXA 5FPMA 4O5FA 1NWKA 5E84A 4K25A 3MN7A 5KQDA 4EAHD 5AQHA 3UKUB 4CZMA 2V52B 2W41A 1P8ZA 1R59O 3LM2A 4IJNA 2QWOA 1HX1A 2V51B 4JHDB 3KVGA 5EXWA 2FLOA 1GLCG 2E2QA 4WQ4C 2E8AA 3F9MA 4BR7A 2CH5A 2ZWHA 1KXPA 3EL2A 2E1ZA 4H5RA 4BRFA 3CERA 5FPDA 3A5NC 3H3NO 3QB0A 4BRMA 3GG4A 4BRDA 1BO5O 1NGCA 5AFUA 3GE1A 5AQMA 3M1FA 4AM7A 1XC3A 3QBXA 4FWMA 4WQ5C 5AQIA 3VEXA 4MO4A 1C0FA 1E4FT 4F9OA 5AQSA 2AP1A 2QW9A 4J8FA 3CIPA 3D2FA 2A5XA 3AAPA 5AQGA 3G25A 2E20A 5FPEA 4BRQA 1T44A 3MK6A 3H3OB 5LJVA 3WXLA 4IXCA 1MWMA 4EFHA 4FWOA 3WUHA 4BGAA 2GWKA 4CZKA 3CJ1A 3O1BA 2IIRA 3FZFA 3A8YA 4FPBA 3WEEA 2ZGYA 1RDWX 3ENHA 3LDQA 2PBDA 2P9LA 3M6GA 3M3ZA 5JLFA 1QQOA 5JLHA 2EWSA 5AZJA 1NM1A 1KAZA 2AA4A 2GWJA 3QBWA 1JCEA 2E2NA 4BQLA 3CI5A 1GLDG 2YJEA 2FSKA 4H0YB 2VWBA 3A0IX 4H5VA 3HSCA 3DWLA 1XUPO 4FWSA 4H5WA 5ADXH 3DXMA 4WYBA 1Z6RA 4Y0WA 2D1KA 3AAQA 3CHWA 4BR0A 5EX5A 1TYQA 4E1JA 1LOTB 2Q31A 1HKCA 3VEOA 5KPTA 2GEMA 1V4SA 3ZX2A 2P9PB 3U8XA 3VF4A 4NO7A 3VEYA 3TPQA 1ESVA 3C7NB 4BRLA 4B1VA 3LDOA 4BC2A 3O4WA 4B9QA 2D0OA 5AR0A 1BDGA 3U9DA 5LJWA 4HTLA 3CJ9A 4BQZA 4FOIA 1NGJA 3VF6A 4FWQA 2CGKA 2DPNA 4BRIA 5BR9A 3VETA 1Y64A 1ZXOA 4PKIA 1OKJA 4RTFD 1NGGA 3W0LA 4CZHA 4K42A 2P9SA 1YXQA 2FF3B 3R6MA 3EKSA 1HJOA 3O80A 4H0PA 3J8AA 5AQOA 3WQUA 5AQKA 3QFUA 1WOQA 3UKRB 4M63C 4FWKA 1GLLO 2NRHA 5EOYA 5AQLA 4CZFA 3SMPA 3LDPA 5ELZA 3CJAA 4ISGA 4I6MB 1J6ZA 4IJAA 1XQSC 3GOIA 2A42A 2E88A 3D7EO 5AQZA 4DQ8A 3EKUA 5AQNA 2FSNA 3SJHA 3A5LC 1U2VB 2HMPA 3I33A 2A6AA 3U4LA 2W40A 5AZIA 3JS6A 5AQXA 1GLJO 3A5OC 5EY4A 3VEZA 3BF3A 2H3GX 4H0XB 5I9EB 3FR0A 1BU6O 1K8KA 1CZAN 4BVOA 4EHUA 1QQNA 2E1YA 2IVNA 3O8MA 4K43A 1DGKN 3VF2A 4PL8A 4FL9A 4BR5A 2WUSA 3H1QA 1WUAA 3CQYA 1SAZA 3O08A 3CJBA 1NGFA 2P9KA 4GY2B 3RSEA 4JD2B 2P9NB 4Z94A 3ENOA 3HBTA 3ZEUA 3CETA 4YDUA 1IG8A 2ASPA 3H45C 3ULEB 2P9UB 2A3ZA 1QQMA 3OHRA 4CZIA 5F2RA 3SMSA 5TKYA 3HM8A 3S41A 2E2PA 3UKUA 4BRNA 3L4IA 4PL7A 1HKBA 2VCPA 3ATVA 3W3DA 4JHDA 3P4IA 5AQWA 1YVNA 3WQTA 4O8KA 5E26A 2CGJA 2QWPA 5LY3A 3ZETB 2F9TA 5AFUH 3EZWA 5F0XA 3DXKB 4IO8A 3GL1A 2P9IB 3MDQA 3IFRA 3CJ7A 1SZ2A 3O5BA 1GLAG 4H5TA 1YUWA 4DCHA 4DHYA 1GLEG 5BREA 5ADXA 2ZGZA 3D2EB 2YCHA 5BN8A 4BREA 2QXLA 2FXUA 4LC9B 4M7YA 1V4TA 2V7YA 3L6QA 5AQQA 3VENA 2Q0RA 1DEJA 4CBWA 5KPRA 1KAYA 1HLUA 4MO5A 3QDKA 4B1YB 2A41A 1X3NA 5BPMA 3FZHA 1ZBSA 4CI6A 3UE5A 3QMLA 1JCFA 3MCPA 2GUPA 1NGBA 2Q97A 2I7NA 2FF6A 2ITMA 4BRCA 2YHXA 1DKGD 2YJFA 5CE3A 4K41A 3VGKA 4CZEA 1T6CA 2QWMA 4JNEA 1X9JA 4L3QA 1NGDA 4CZLA 2V7ZA 3EO3A 4ISEA 1ATRA 5B8HA 2OANA 4XH5A 2NZTA 4BC5A 4CJ7A 1EQYA 1LCUA 3O6WA 4IZ9A 4CD1A 3BP8A 2YHYA 2NLXA 3FE1A 4XH1A 3A5MC 1T6DA 3WXKA 3BF1A 3JXUA 2P9PA 5BPNA 1BA0A 2QWRA 4PKHA 2I7PA 2CGLA 3C7NA 3ZX0A 4NB4A 1ATSA 3SLCA 2Q1NA 3DJCA 4H0OA 4FO0A 4A2AA 3DAWA 4HWIA 2GTDA 1BWFO 5F1XA 1GLBG 1BG3A 4H03B 3VGMA 4BR2A 2QWQA 1QHAA 2ZF5O 3LDNA 5AQJA 4DB3A 4BC4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1Q82O 3D2FB 5H1SQ 1T03A 3TR8A 5JMVA 3KZBA 4WF9L 3T7ZA 4KRFA 3O9RA 4BWMA 4GW6A 4XEIA 4JKFA 3E66A 1T7PA 4DTMA 4DG1A 3F73A 3J7YP 3P39A 4C23A 4H4MA 3T1HK 5HL7L 4Y1CA 2W6KA 5AZJB 4ELTA 2P5GA 2OPSA 3ULDA 4DLEA 4W5TA 3O9UA 4BE7B 1P90A 4JAXA 4DV1K 4CE9A 4WE1A 2D5RA 3WNFA 4B1XB 3P5JA 1UAXA 4LF5K 1SQKA 3WNGA 4K8ZA 3DXMB 4MLHA 3E01A 5BRDA 1TYQB 2YHBA 4BVPA 1L3UA 4FW2A 5HLFA 4B3OA 3EE9A 4B9MA 2FBYA 1QSYA 2IVPA 5EVZA 1NKEA 2J4RA 3ZT4A 3R3LA 4BRAA 1NJZA 3JAMO 3CJCA 4JD2A 2P9NA 1WSIA 3VOVA 3ZT0A 3H6EA 5HRNA 3ULEA 5CY4A 1RFQA 3CPWM 3HTVA 4EZ9A 4FOEA 1Q9XA 2PAVA 1GLFO 3V1OA 4KO0A 2QWNA 3K5OA 4CEOA 4Y1DA 3FZLA 4CK1A 3U9ZA 2GX9A 1TUUA 3BEXA 5BRFA 2KLAA 2Z1IA 4IOCL 3FZKA 3K5LA 1VAZA 2GBZA 4UQGA 4V19S 2HHTA 3OYFA 4FVUA 1VSIA 2KTQA 1HYVA 4N56A 1YHQN 3PX0A 2XHBA 4OPJA 3CCLN 1C0GA 4C1NI 4BG9A 1C0MA 4EHTA 4DU1A 1QZ6A 1NGAA 1JL1A 1NG9A 3CFOA 1JLGA 5AZIB 4A2BA 1NGEA 1KSPA 4JI3K 1NLVA 2PYLA 1A5XA 3AY9A 1J5OA 1IKWA 4CD3A 1JCGA 4WQ4A 2VYPA 1BA1A 4KH5A 1RTIA 5FLXO 3WNEA 4WFAL 2NUBA 4KH6A 3E9PA 3BZCA 3VPZA 3RSEB 4CHPA 5FPMA 4B9NA 4K25A 3KIOA 3MN7A 5KQDA 3LWLA 2OTJN 4EAHD 3UKUB 1YJWN 1NMNA 4R79A 2XY8A 4FJNA 4IJNA 2V51B 3NF8A 4CGDA 3V9WA 2LSNA 3ZLJA 3KLIA 4B9SA 4CF1A 2E2QA 3ZSRA 3JSMA 3QESA 1XMOK 4FJJA 5DMRA 3HK2A 3B6PA 3EL2A 3PY8A 1EKEA 3RR8A 1LWEA 2QKBA 3H3NO 3PIOL 4ID5A 2HHWA 3CCJN 3NAEA 4F3OA 4NXNK 1LW2A 3T19A 5TKWA 4M3RA 4FCYA 4FWMA 4WQ5C 3SAGA 4E89A 3VEXA 2VGNA 4F9OA 1E4FT 3HP6A 3HJFA 5AQSA 4B3SK 4J8FA 1QVGM 5AQGA 2E20A 3CYGA 4FJLA 4ELVA 5HROA 4EFHA 4EP4A 5HRPA 3HT3A 1KLNA 4Q0BA 2O8EA 1KFSA 4JRPA 3DMJA 1SUQA 4CZKA 3CJ1A 2IIRA 3FZFA 3LP2A 3A8YA 4FPBA 3WEEA 2B6AA 2ZGYA 3AO5A 3M6GA 4AILC 1KAZA 2GWJA 3QBWA 2NRZA 1FW6A 3NMUA 1TKZA 2D0CA 3K9KA 2YJEA 3ISNC 1R0AA 1A5VA 3F9KA 5GINA 4LSLA 4FWSA 1VQLN 4CGHA 4WYBA 2D1KA 3LPUA 5CZ1A 3LWMA 4BR0A 4KB0A 3DOKA 1HKCA 3SUNA 5C0YA 1C6VA 5HRSA 4K0KK 3ZX2A 1E3MA 4W5NA 1B9FA 4DQIA 1YJ9N 1ILYA 3ZSWA 4B1VA 3O4WA 4RW4A 5LJWA 3MWTA 4HTLA 1CZ9A 3LAMA 2OPPA 4FOIA 4CF9A 1EXQA 2RF2A 2ZJQL 1RT7A 4JRQA 4JK8A 4FJMA 1HNVA 2DPNA 4BRIA 3QETA 1WSHA 3NGZA 3W0LA 1ASUA 4CZHA 1B9DA 2P9SA 4FM0A 2RE2A 3R6MA 3MWPA 1HJOA 3J8AA 5AQOA 2HSTA 1RTJA 1WB9A 3QFUA 1DTQA 2QA4N 4M63C 4OX9K 1GLLO 5AQLA 3SMPA 3LDPA 5ELZA 4TSXA 2IOCA 4CHNA 2PZSA 4DQQA 1J54A 3NGIA 1RDCA 3NVMA 5M1PA 4Q5VA 4OVLA 3ZSQA 3RR7A 2A6AA 4JI7K 2W40A 1OH6A 1XMQK 2D0AA 3JS6A 1GLJO 4BDZA 5I9EB 1T8EA 4XJXA 4JI2K 4Z4IA 2UUAK 1Z26A 4KHYA 3EYZA 3HXMA 1UA0A 3O8MA 1DGKN 3VMFB 4PL8A 5LL6Z 1VSHA 4FL9A 4BR5A 2WUSA 4I9QA 1WUAA 4C8MA 1SAZA 3O08A 2HNYA 1I39A 4JD2B 2P9NB 4CGGA 3HBTA 3ULEB 3BDPA 4JK9A 4CHOA 1QSSA 2A3ZA 3KLGA 5F2RA 3THYA 2WFBA 2E2PA 4O8UA 4ZHRA 4FJHA 3OA9A 1CZBA 4DSEA 5GAGP 3AVHA 3V9ZA 1XWLA 4DV6K 4JHDA 5AQWA 4CHYA 3NBPA 3THWA 1NJXA 2YKNA 2F9TA 3EZWA 3VA0A 5F0XA 3I8DA 4B3MK 1UOCA 2O8CA 1C1BA 3GL1A 4IO8A 4IO9L 3MDQA 4M3ZA 4EP5A 1YUWA 3VQ6A 3CFPA 5J2PA 1GLEG 3T1AA 3PV8A 2VG6A 3NGYA 5BREA 4M3WA 3OS0A 4BREA 5IWAK 2HVHA 3TWHA 1YTUA 4LC9B 3P38A 5CR4A 3VENA 4OPAA 5KPRA 4HUFA 1KAYA 5I3UA 1RTHA 4A57A 1XNRK 1ZBUA 5BPMA 3FZHA 2A1RA 1J9AA 4AF1A 3UE5A 4B3TK 4CIFA 2GUPA 1DTTA 2Q97A 2JWKA 4AHSA 2ITMA 4F2RA 3E1YA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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