2ASOA

Structure of rabbit actin in complex with sphinxolide b
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structures of microfilament destabilizing toxins bound to actin provide insight into toxin design and activity
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 129
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asoA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2asoA03
4CZHA 4H0OA 2BUPA 3AAPA 1HJOA 4MLEA 1C0FA 4BGBA 3BUZB 3LDNA 4CZEA 3KVGA 1GLJO 5ELZA 4EAHD 2GEMA 3VGLA 3ENOA 5I9EB 3D7EO 4IXCA 3H1VX 4BR2A 3C0BA 2CH6A 3WXKA 3JXUA 3WQTA 3FFKB 4BR4A 4IZ9A 1ATNA 1HLUA 4O5FA 3S41A 4B9QA 3CJ7A 1QHAA 3WXIA 2J4RA 1HX1A 4DB3A 4CZJA 3H45C 1TYQA 1BA0A 3AARA 4BC2A 4CBUA 2P9UB 3DXKA 2ASOA 5AQTA 5BPLA 2QM1A 4K41A 2W41A 3G25A 1WUAA 3A5LC 4BRGA 3DXKB 3A5MC 4BRHA 4ISEA 4WYBA 4Z94A 1Z05A 4J8FA 3LDQA 4H0VB 3VEXA 4BVOA 2P9NA 3VPZA 3O08A 3O1BA 4H5TA 2NLXA 4EFHA 2ZGZA 3WEEA 1BDGA 1MWKA 2VCPA 3QBXA 4CD1A 2YHYA 4BRAA 5BN8A 3WEEB 1Y64A 4BRNA 3R6MA 3I33A 4DQ8A 2H3GX 4FWMA 2I7PA 2YJEA 5AQVA 5AR0A 1BOTO 3SMSA 1GLDG 1CZAN 4BROA 3H3OB 1ZXOA 3H46O 3VF2A 4QS9A 3LL3A 4MLHA 4CI6A 1BWFO 4NB4A 4F9OA 4H5VA 3B8AX 3EL2A 2HF3A 4FWRA 4BR9A 4A2BA 5B8HA 4FWNA 1V4TA 2Q2RA 3U4LA 3F9MA 4CBWA 2P9KB 2A6AA 5BPNA 2FF6A 2UYTA 4BVPA 4NO7A 3U9ZA 3VOVA 2Q97A 4GY2B 2I7NA 4H5WA 4BRPA 3AAQA 4EHUA 2FSJA 3FZLA 5FPDA 2P9PA 1GLLO 2ZGYA 1Z6RA 3WUHA 2GUPA 1HKGA 4H0YB 3M1FA 4IJAA 3VESA 2P9PB 2P9IA 3GDQA 1RDWX 2GTDA 2ZF5O 4K43A 3CJ1A 3CQXA 2F9TA 4WQ4C 2QWQA 2OANA 1ZC6A 4K42A 4CZKA 5BPMA 1U2VB 1ATSA 4JHDB 3U9DA 4IJNA 4BR0A 1KAYA 1E4FT 2W40A 3AY9A 3WQUA 3I8BA 3L0QA 2D4WA 3FZFA 4FWOA 3SLCA 2HF4A 1QZ6A 5AQSA 4JD2A 5AZIB 3ZX3A 2ASMA 3IFRA 4WQ4A 4BRMA 2E1ZA 2QWMA 3ATVA 3LM2A 3ZETA 2YCHA 3CIPA 3M3ZA 3CJ9A 2CGJA 1ZBSA 1NBWA 2ZWHA 1QQNA 4CZLA 4BRFA 3ENHA 4FOEA 4HTLA 3LM9A 3ZX0A 4IWVA 1MA9B 3VEOA 3H1QA 5AQNA 1T6CA 3ULEA 5AQYA 1NGEA 4H5NA 4BREA 2V7ZA 3IMXA 3CJAA 3O80A 4BRCA 5JICA 4MO5A 1QQMA 4B1XB 1GLBG 1NWKA 2YHWA 2YJFA 2GWJA 2P9LA 2QXLA 2CGKA 1JCEA 3DXMA 3C7NA 5EXWA 5AQZA 1P8ZA 5BR9A 4B1YB 3ZEUA 2F9WA 5LJVA 4H0PA 3BF3A 2E2PA 1S3XA 3DXMB 5AZJA 2E2OA 5BRDA 1KXPA 3TU5A 3A5NC 1XC3A 4B1UB 1LCUA 2E2QA 3VEYA 2WUSA 3LDOA 3ATUA 2A3ZA 4H03B 4DHYA 4BQLA 3GE1A 1TYQB 1YUWA 3VENA 3FZMA 1NGGA 3GOIA 3WXLA 1OKJA 2V7YA 3D2EA 1HUXA 3EZWA 5BRHA 5KQDA 3O6WA 3VETA 2P9NB 2NZTA 3CETA 3VEWA 2PAVA 4MO4A 3R8EA 1X3NA 4CBXA 2E1YA 4EHTA 4JNEA 3BEXA 4AM6A 1QZ5A 5JLHA 5AQIA 3FR0A 3D2FA 5F1XA 3FLCO 2D1KA 4CJ7A 4E1JA 1R59O 1JCFA 3VF6A 3BF1A 1V4SA 4PL7A 3A5OC 5E84A 3RSEA 3D2FB 4BG9A 1TUUA 1G99A 3SK3A 2VYPA 2QWOA 1T44A 1DGKN 4LC9B 2FSKA 3VF4A 4BGAA 3VEVA 3QDKA 4BC4A 4BRKA 4FOIA 2VWBA 1HPMA 3TPQA 1RGIA 1LOTB 5TKYA 2V52B 2IVPA 4H5RA 1BUPA 1MWMA 2A5XA 3UKUA 3SMPA 5KPZA 2QWPA 3FZHA 3EO3A 5FPNA 3VERA 2HOEA 1Q18A 5EY4A 2Q1NA 2D0OA 4RTFD 2EWSA 5KPTA 5JMVA 1K8KA 3SJHA 2CGLA 5FPMA 1HKBA 4BRDA 3IUCA 4M7XA 3UB5A 3CQYA 3L6QA 4BRQA 1E4GT 2P9IB 1GLEG 2NRHA 3H6EA 3MN5A 4FO0A 4FWKA 1SQKA 4QS8A 5AQWA 4FWPA 5LJWA 4BRLA 3MMVA 4PL8A 2E8AA 3WT0A 5EOYA 3UKRA 4FPBA 1GLFO 2QWLA 3QFPA 4JD2B 4H0TB 2V51B 3FE1A 3ZETB 5JLFA 1DEJA 1SAZA 4YDUC 3HI0A 5EVZA 3HTVA 4FPAA 4FWQA 5CE3A 1NMDA 4PKHA 2CH5A 4BQZA 2E88A 3O8MA 1EQYA 1TUYA 4JAXA 3OHRA 3LDLA 4B1ZA 3H3NO 4K25A 2DPNA 4A62A 4YDUA 5KQ8A 3ULEB 2YHXA 1JCGA 5AQRA 1T6DA 5BN9A 3HZ6A 3QB0A 5ADXA 5LY3A 1RFQA 2Q36A 3EKSA 1X9JA 1KAZA 5ADXH 1BU6O 2P9LB 3L4IA 4A2AA 2P9SA 1ESVA 3UE5A 4KBOA 3C7NB 3IDHA 3QFUA 1IJJA 3CJBA 1GLCG 3ZEUB 2A42A 4I6MA 1NGHA 4JN4A 1YVNA 2QW9A 2P9SB 1MDUB 5AQKA 5AZJB 1NGCA 3A8YA 1XUPO 5AQGA 3VEZA 4CZMA 2QWNA 4O8KA 1J6ZA 4RWTA 4I6MB 4FL9A 3FZKA 3A0IX 5AQXA 2P9UA 3DJCA 2E2NA 3VGKA 3GBTA 1BG3A 3O4WA 4BR7A 2PBDA 4CD3A 2KHOA 1YAGA 3D2EB 1YXQA 5AQMA 3R9PA 5AQPA 3DWLA 1S22A 3WXJA 2A40A 3QBWA 2ASPA 4HWIA 4L3QA 5E26A 2Q0RA 3MN6A 1NM1A 4WQ5C 2IVNA 4Y0WA 4PKIA 1NLVA 3KZBA 2Q31A 2GWKA 1C0GA 2GELA 4PKGA 1U6ZA 1IG8A 4BR5A 5FPEA 3GL1A 4WQ5A 4QS7A 5AQJA 4CZFA 3MN9A 3RSEB 4A61A 3O1WA 1BO5O 4DCHA 4ISGA 3W0LA 2AA4A 1D4XA 5F2RA 3HM8A 3MDQA 3MK6A 4H0XB 3W3DA 1NGBA 1GLAG 4XH1A 3CI5A 1H1VA 2P9KA 3U8XA 1SZ2A 4C23A 1WOQA 5BRFA 3UKUB 1DKGD 4ISFA 5AQQA 3EN9A 4BC5A 2IIRA 5BREA 4XH4A 3QMLA 5AQLA 5AFUA 2D0PA 3DAWA 1K8KB 2FF3B 2FSNA 3HBTA 1HKCA 5AFUH 2BTFA 4EIAA 3CJCA 4B1WB 3CHWA 3MCPA 4FWLA 5EX5A 3J8AA 5AQFA 4FSVA 1QQOA 4CZGA 1U2VA 3LDPA 4FWSA 4JHDA 3FGUA 1ATRA 2FXUA 3KHYA 1NGJA 4GNIA 1XQSC 2FLOA 2IVOA 3ZX2A 3UKRB 3JS6A 1NGDA 5AQOA 1NGFA 4B1VA 4CZIA 1X3MA 5AZIA 4BC3A 2QWRA 5F0XA 3GG4A 2E20A 4RCHA 3O5BA 5AQUA 2ITMA 3ID8A 4M7YA 3QICA 2YI1A 4BRIA 3MN7A 3BP8A 4XH5A 3EKUA 3M6GA 5KPRA 1NGAA 4BG8A 2AP1A 2Q0UA 4IO8A 4AM7A 3VGMA 4M63C 1BA1A 5AQHA 2HMPA 3HSCA 3P4IA 3CERA 4XEIA 1KAXA 1NGIA 2A41A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HYVA 4CGFA 2QK9A 2UXDK 1F21A 4HVJA 1EXQA 4ILJA 4FJ8A 3OYEA 3V9WA 1B92A 1GLJO 5ELZA 4EAHD 2GEMA 3CFPA 3VGLA 4AH9A 4AHUA 4DQIA 3ZT3A 3JSMA 3T3FA 1L5UA 3WXKA 2DY4A 2VG5A 3WQTA 2I5JA 4UY8O 4BR4A 1HNWK 4IZ9A 1ATNA 1K6YA 3IS9A 3S41A 3NFAA 2VG7A 3V1OA 4M3YA 1HX1A 2WFBA 4A59A 4O4GA 4CBUA 1SL1A 5BPLA 2ASOA 1HNVA 4WFNL 4K41A 2W41A 1U4BA 1LV5A 3G25A 4DU3A 3SQ0A 4BRGA 4BRHA 3HM9A 2P1JA 2Q3SA 3LDQA 4H0VB 1C0TA 4GV3A 1KFSA 2ZGZA 3AA3A 1MWKA 1EETA 1WSGA 2VCPA 3PLAA 2YHYA 4BRAA 1JLEA 3I8DA 1Y64A 1VQKN 4BRNA 3AVHA 3I33A 2H3GX 3QEXA 5AQVA 5AR0A 3QEWA 1HNIA 1WB9A 3Q7CA 3OW2M 4YOTA 2OTLN 5SZTA 1GLDG 1QHTA 1S9GA 3K0SA 4M3XA 4OLBA 3H3OB 1ZXOA 4MFBA 1RTIA 4M3UA 5FDLA 4FVMA 4MLHA 4NB4A 3HPOA 4JI0K 3C95A 1T7PA 4BR9A 1GOBA 4FWNA 3L8BA 1NJXA 1VAZA 2P9KB 5KTQA 4QOZB 3MEGA 3OTOK 1U49A 3U9ZA 4H5WA 3LP0A 2HHVA 4O44A 3C94A 4FW1A 4EHUA 3FZLA 2W42A 3AVAA 4ELUA 3MCAB 3K2PA 1GLLO 1KRPA 2ZGYA 3WUHA 1IG9A 2GUPA 1D5AA 1VSKA 4H0YB 3OA9A 3MECA 4DS4A 2P9PB 3CJ1A 3CQXA 4CZKA 2AJQA 3EE9A 4CE9A 4IJNA 1KAYA 1JLGA 2W40A 1CXQA 4M45A 4FWOA 3SLCA 5AZIB 2ASMA 3BZKA 2ZE2A 2FBVA 3NGIA 3LZIA 2E1ZA 2YKNA 4Z4FA 3PX4A 3CIPA 4Y1CA 4NXNK 4ELVA 3CJ9A 1Q7YO 4CJ4A 3THWB 4DR7K 3ENHA 3E9LA 3ZX0A 3LM9A 3QINA 4LF7K 4IWVA 2A1RA 4MQ3A 2BE2A 3ENBA 3H1QA 3THYB 1T6CA 5AQYA 2V7ZA 3O80A 4IG0A 2X74A 3LP1A 3SBTA 1GLBG 1ASWA 1BCOA 2YHWA 4NCGA 2O8FA 4FLVA 2P9LA 3CD6N 2CGKA 1JCEA 3C7NA 3K5LA 3T1AA 1A5WA 5LJVA 1KVAA 3OS0A 3MWPA 2E2PA 1RBUA 4CHQA 2XHBA 1MU2A 3OJUA 1XI1A 3SYZA 3A5NC 1LCUA 4DHYA 3LDOA 3LWLA 3ATUA 2A3ZA 4LY7A 3GE1A 1NK8A 1OH8A 1TYQB 3NDKA 2O8EA 1YUWA 1QQCA 1NKEA 4CF8A 3NMUA 1RDAA 3EYZA 4DQQA 3TARA 1J5EK 1HUXA 4YFUA 3VETA 4B3RK 4DV3K 3VQAA 1YITN 3R8EA 2O8BB 3AVJA 1IKYA 3FFIA 1LWEA 2D0BA 2OPPA 1CZ9A 5EU7A 3SZ2A 2D1KA 4CJ7A 3QO9A 2RPIA 3A5OC 3RSEA 1G99A 2NRRA 1EP4A 4DSEA 3ZSQA 3KWIA 3THXA 1T44A 2O8DB 3TAMA 4BGAA 2HBMA 3G0ZA 5LMUK 4JYAK 1N8RO 3SMPA 3VQEA 1ZBFA 3ASMA 3I56N 1D9FA 3HP9A 2KQ2A 4B3SK 1S6PA 5KPTA 3SJHA 1R0AA 1TVRA 2HHIA 3IUCA 4M7XA 3CQYA 4DUYK 1E4GT 3AVLA 2NRHA 4CJTA 2XY5A 1IBLK 4FJIA 3K5MA 4PUOA 4B3MK 4AF1A 4O0IA 5M1FA 4A5BA 3EE8A 1S6QA 2NRTA 3CC2N 3E1YA 4Q5VA 2FC0A 4JD2B 3NH0A 1HQEA 5C24A 4IO9L 5JLFA 1SS6A 1Q9XA 4Z4IA 5EVZA 2KZZA 1HMVA 2C1GA 4OLAA 5CE3A 3TSQA 3HT3A 4FJNA 4CESA 1TUYA 4JAXA 4DFKA 5FRMA 2X78A 4K25A 2Z1IA 1OH6A 5C42A 2P5GA 3ULEB 4CF1A 2PYJA 3HZ6A 3QB0A 1XHZA 5LY3A 4KPYA 1SKRA 1X9JA 1Y97A 2EX3A 3DRPA 4ILHA 4A2AA 3UE5A 4AHCA 3CJBA 3OYGA 1NGHA 2QW9A 3TSPA 1MDUB 3P38A 5AZJB 4CZMA 4FJ9A 4CK1A 1TAQA 4EP5A 1YJ9N 3OS2A 1Q8IA 4FJKA 1VSEA 3GBTA 1CXUA 3O4WA 5M1OA 3SCXA 2PBDA 4CD3A 2KHOA 5DM6L 1BI4A 3WNGA 3O9QA 3R9PA 3U3GA 5AQPA 1WBDA 1TAUA 4CFBA 3KLFA 2G8IA 1ZBIA 3WXJA 2A1SA 4JKHA 3QBWA 4X64K 2ASPA 4JKCA 5I3UA 4WQ5C 4B8AB 2DFFA 3OBWA 3AA4A 1G15A 3T7ZA 4FM2A 2PZSA 1O13A 5HRNA 3KK3A 3SI6A 1C0GA 2HBKA 5I42A 1U6ZA 1T3VA 4BR5A 4CERA 5FPEA 2UUCK 4CEFA 3O1WA 1BL3A 1BO5O 1KQSM 3NGZA 3W0LA 4IFVA 2G8FA 4CJRA 3V4IA 4CJUA 4JI1K 4BECA 3VA0A 4EZ9A 3MK6A 5M1QA 4DV5K 4YNQA 2QTDA 3O3HA 2F8SA 2HHSA 2P9KA 3CXCM 3L2QA 4OKKA 1TKXA 1SZ2A 3UKUB 4CJ5A 2HHTA 4CK3A 5BREA 5AFUA 3QMLA 5AQLA 2HNZA 1M1KO 2D0PA 3DAWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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