2ASOA

Structure of rabbit actin in complex with sphinxolide b
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structures of microfilament destabilizing toxins bound to actin provide insight into toxin design and activity
pubmed doi rcsb
total genus 129
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asoA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2asoA03
1IJJA 3H6EA 2NLXA 2Q1NA 5AQMA 3WT0A 2VCPA 3O5BA 4FO0A 3MN9A 4FOEA 4H5VA 2W40A 2ITMA 3W3DA 4CZMA 1YXQA 3RSEB 3MCPA 2YJEA 3KHYA 4K43A 1NGGA 4FWNA 3MN5A 3QFPA 4RTFD 3R9PA 4B9QA 5F2RA 2P9LA 5AQTA 5AZIB 3ZEUB 3LDLA 5EVZA 4BGAA 4GY2B 3U9ZA 2CGKA 4H0VB 2E1ZA 3JS6A 1XC3A 2QWPA 1QQMA 3QB0A 1LCUA 5FPEA 4IJNA 5BPLA 1MWKA 3BF1A 2F9WA 3DXKA 3BUZB 3FZLA 4C23A 1HKGA 4BRNA 2P9UA 4XH1A 4JHDB 2I7NA 4BR5A 4I6MA 3O1WA 1WUAA 4H5TA 3W0LA 3CJ9A 3LDPA 3DWLA 5CE3A 4BR2A 4JD2A 3AAQA 4BRMA 4A2AA 2Q31A 3R8EA 4BC5A 2P9KA 2A3ZA 3FZMA 3CHWA 2WUSA 5AQJA 3CQXA 4FWSA 3VF2A 5AQKA 3EO3A 1U6ZA 4BRLA 2QXLA 5LJWA 2GEMA 3VGLA 4BC3A 4BRPA 5AQSA 3L6QA 3ZETA 3IFRA 4EHTA 4BG8A 1RFQA 2E88A 2P9LB 4BRHA 3C7NA 3M1FA 1SQKA 1HKCA 2BUPA 4BC4A 3UKUB 4FWOA 5LY3A 3QMLA 1NBWA 3O1BA 4FWKA 1ATSA 3VGMA 4BR4A 1BO5O 4CD1A 4AM7A 3DXKB 4H5NA 3A0IX 4JAXA 2P9UB 4CZHA 1EQYA 5AFUH 1GLCG 4O5FA 3UKRA 3O6WA 4I6MB 4IO8A 1Y64A 2GWJA 3IDHA 3O80A 3HM8A 3H3NO 2OANA 1DKGD 3L0QA 1BWFO 4JD2B 2I7PA 2QWMA 3WQUA 1NGEA 2YCHA 4GNIA 5AQIA 4CZGA 1JCGA 2A41A 1BA0A 2P9KB 4Z94A 5KQDA 3RSEA 4RWTA 5AQRA 3WEEA 4K25A 4K41A 5EXWA 2FSNA 4BRQA 1DEJA 3I8BA 2IVOA 1SZ2A 2A6AA 5JLFA 3ZEUA 1MWMA 4NB4A 3CETA 2E2NA 3ZETB 4B1UB 4BQLA 2UYTA 1NGHA 3H46O 3C7NB 4FOIA 2ZGYA 4MLEA 1NMDA 3C0BA 3SJHA 2E2OA 1K8KB 3VF4A 4CZEA 3DAWA 3CQYA 2YHXA 4H5RA 5AQXA 2ASPA 4BG9A 3VGKA 1NLVA 1Q18A 3H45C 1ZC6A 4WQ5C 3UKRB 3WXIA 3CJCA 3HSCA 1S3XA 3SK3A 1T6DA 4BQZA 5FPNA 4CZJA 5AR0A 4ISFA 3J8AA 3EN9A 2GWKA 4CJ7A 2QM1A 3WXLA 2PBDA 3GBTA 3WEEB 1YVNA 3VPZA 3EL2A 4NO7A 2FSJA 4WQ5A 5AQNA 4B1YB 4YDUC 2HMPA 4WQ4C 5AQFA 5AQOA 1NGBA 1NGCA 4CI6A 2AA4A 5F0XA 5KQ8A 5AQZA 5AQWA 1C0GA 2ZWHA 4L3QA 3A5NC 3U9DA 5KPTA 4HTLA 4DHYA 1U2VA 4JN4A 3UKUA 3U8XA 5I9EB 4EIAA 3FLCO 3D2FA 3MMVA 4M7YA 4M7XA 4YDUA 4WQ4A 1HPMA 2V52B 3QDKA 3DJCA 4EHUA 3O4WA 2FLOA 4BRAA 4DQ8A 3LM2A 2GUPA 2FF6A 1NGDA 4EAHD 3M3ZA 2QWNA 1OKJA 4F9OA 3L4IA 4PKIA 2IIRA 1DGKN 1X3MA 3A5LC 5AQQA 2YI1A 4O8KA 5BN9A 3FZFA 4IXCA 5AQVA 4RCHA 4B1ZA 3MN6A 4EFHA 5F1XA 3CI5A 3DXMA 1KAYA 2QWOA 3HI0A 3GE1A 3QBWA 4AM6A 3HTVA 4FL9A 1GLFO 3ATUA 1KAZA 2ASMA 2YJFA 2BTFA 1K8KA 3VEXA 1U2VB 4CZIA 3BEXA 1GLAG 4BRDA 1D4XA 5BRFA 1TYQA 3LDNA 4XEIA 3VEYA 3P4IA 2PAVA 5BPNA 2IVPA 3ZX3A 1RGIA 5ADXH 3D2FB 3H1QA 2P9IA 4FWPA 1V4TA 1RDWX 2HF3A 1HX1A 4PKHA 3FR0A 3CJAA 3FE1A 1E4FT 1IG8A 1SAZA 3QICA 2Q36A 1YUWA 2QW9A 4MO5A 5AFUA 2P9NB 1GLDG 2VWBA 4BC2A 4BREA 1QZ5A 3BF3A 4H0OA 3LDQA 1HJOA 2QWRA 1V4SA 3WQTA 5FPDA 2Q97A 3FZKA 3DXMB 4MLHA 2V7YA 2D0OA 4FPBA 4FSVA 3SLCA 3ATVA 1GLLO 1HUXA 3VENA 5AQYA 3CJBA 3A8YA 5AQHA 1BDGA 3WXKA 3UB5A 4MO4A 3B8AX 5BN8A 1TYQB 1BU6O 4XH4A 3AARA 3KZBA 2A5XA 5EOYA 1NGJA 3LM9A 4LC9B 5E84A 4A62A 3VEWA 3FFKB 4CBXA 3M6GA 2P9IB 1QQNA 1ZBSA 2CGJA 3VOVA 3ZX2A 5KPRA 2P9SB 1HKBA 2GELA 5AQLA 1LOTB 1CZAN 4PL7A 2E8AA 3H3OB 3HZ6A 1Z6RA 2FSKA 2H3GX 2QWLA 4BR9A 5AZJA 3VERA 4CD3A 2P9PB 2F9TA 5JMVA 3D7EO 4B1WB 1Z05A 4H5WA 2A42A 5ELZA 3VF6A 3SMSA 4IJAA 1JCFA 1QQOA 3MDQA 3EKSA 1C0FA 1QZ6A 2FXUA 4FWQA 4QS9A 2CGLA 2NRHA 3VEVA 4QS8A 1GLEG 3ID8A 5AQPA 4B1XB 4J8FA 2W41A 3TU5A 1BG3A 3EZWA 3R6MA 4BVPA 1NGAA 3BP8A 4FWRA 4PKGA 1BUPA 4H0YB 4CBUA 2E2QA 5JLHA 4H0XB 4IWVA 3ENHA 4CBWA 2QWQA 4WYBA 3IMXA 1E4GT 3IUCA 2IVNA 1X3NA 3GG4A 1JCEA 3OHRA 2P9NA 2E1YA 3GOIA 4Y0WA 5TKYA 3D2EB 4ISGA 3MN7A 4H0PA 3UE5A 3A5OC 4E1JA 2D4WA 3A5MC 3AAPA 3ULEA 5AZJB 1T6CA 3VEZA 3WUHA 3CERA 4CZKA 1WOQA 5BR9A 4A2BA 4HWIA 3JXUA 4ISEA 2CH6A 5LJVA 2HOEA 1NGFA 1XQSC 1BOTO 3GDQA 2FF3B 5AQUA 2VYPA 4BRKA 4BGBA 5EY4A 3QFUA 5BREA 4B1VA 1ATRA 3TPQA 4KBOA 3CIPA 4BR7A 1MDUB 4PL8A 4XH5A 5JICA 1T44A 2P9SA 4FWMA 5KPZA 2D1KA 2V51B 3I33A 3SMPA 1X9JA 3LL3A 5ADXA 1TUYA 3FZHA 1J6ZA 3G25A 1GLBG 3ENOA 2Q0RA 2D0PA 2KHOA 2V7ZA 3WXJA 1MA9B 2HF4A 3EKUA 3HBTA 1NM1A 3VEOA 1KAXA 2P9PA 3MK6A 2ASOA 3ULEB 3ZX0A 2YHYA 3FGUA 4A61A 4H03B 1P8ZA 3GL1A 4BR0A 5BPMA 4BRIA 1NGIA 1HLUA 2A40A 2ZGZA 4M63C 4QS7A 5BRDA 1QHAA 3H1VX 3QBXA 4BRFA 4BROA 3KVGA 1ATNA 4K42A 1BA1A 4DB3A 4BRGA 2ZF5O 3S41A 4JNEA 4FWLA 2Q2RA 5AZIA 4DCHA 2GTDA 4FPAA 4BRCA 5FPMA 1GLJO 2YHWA 1XUPO 4CZLA 2CH5A 3O08A 1ESVA 3AY9A 1S22A 3CJ7A 2EWSA 3D2EA 3U4LA 4CZFA 2Q0UA 5B8HA 1YAGA 3O8MA 1H1VA 2DPNA 1NWKA 5E26A 4JHDA 3LDOA 1R59O 2E2PA 1TUUA 5BRHA 2AP1A 4H0TB 5EX5A 5AQGA 3CJ1A 2J4RA 2NZTA 1ZXOA 4BVOA 2E20A 1G99A 1KXPA 4IZ9A 3VESA 3VETA 3F9MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LZJA 2NLXA 3AO5A 4CJ5A 1X9MA 4M3WA 3KK3A 3MXMA 4IOAL 1YXQA 3MCPA 3AVAA 4K43A 1UA1A 3K59A 3K9KA 4OGCA 3TAQA 4W5NA 1HJRA 5F2RA 3ZSYA 5AZIB 3LDLA 4LF6K 3DLKA 2Y1JA 3RR7A 4BGAA 4H0VB 2E1ZA 1EO1A 1QQMA 3PY8A 1LCUA 5BPLA 4WE1A 3KWIA 3M5RA 1TAUA 3BF1A 2F9WA 4YNQA 1HKGA 1L3UA 2I7NA 4BR5A 1EP4A 3AA5X 4O44A 3HJFA 4H5TA 3CJ9A 1EX4A 1TK0A 4FVUA 5CE3A 1L5UA 2XY5A 3OYGA 4B3SK 4A2AA 3R8EA 2F4VK 4BC5A 2P9KA 1EXQA 4RW7A 3ZSOA 1U4BA 3BZKA 4CGGA 2UXBK 4JI6K 1U6ZA 4LF4K 4YOWA 3KLHA 4IO9L 3JYTA 3L6QA 2LSNA 4EHTA 3NAEA 3SV3A 1ILYA 2ZD1A 1KTQA 1HKCA 4NXNK 3ISNC 4CF2A 4BDZA 4B3TK 4BC4A 1A5WA 3T69A 4FWKA 4YORA 4ICLA 1EQYA 1Z25A 1GLCG 4O5FA 1L3TA 4CEDA 3IDHA 3T1HK 3L2VA 3HM8A 3Q7BA 3BDPA 1QSLA 2YCHA 1BIZA 3NBPA 2P9KB 3SYZA 5KGWA 4Z94A 3RSEA 3TSUA 4K41A 2FSNA 3QINA 4FJ7A 4JK9A 3I8BA 1YHQN 1Z26A 4NB4A 3CETA 3HSTB 3CG7A 3O3HA 3QNNA 4B1UB 1TL1A 2NRVA 1NGHA 1RDAA 4FOIA 4DLEA 4CF8A 1NMDA 1JL1A 3SJHA 1K8KB 4CJQA 2QA4N 3DAWA 3L2WA 2DY4A 1MU2A 2YNGA 3NF7A 4DTNA 4BG9A 4XIUA 2YHAA 3H45C 1ZC6A 3WXIA 1NK0A 3HSCA 1S3XA 4GVMA 2VWJA 5SWMA 3RR8A 3G0ZA 4C1NI 1T6DA 4FJIA 4BQZA 1N5YA 2PYLA 2O8CA 3G4SN 2IDOA 2WBNA 4KRFA 3VPZA 4DQRA 3EEQA 4B1YB 2Z1JA 4WQ4C 5AQFA 1NGBA 2F8TA 4LF8K 5AQWA 1C0GA 4L3QA 3A5NC 3HOTA 4FM1A 4HTLA 1U2VA 4JN4A 3V6DA 3CXCM 3UKUA 4EZ9A 5I9EB 2G8UA 4EIAA 3QIPA 3VQ9A 3FLCO 4AHVA 4WFNL 4M7XA 3LPUA 4FYDA 3VQ7A 1B9DA 3O4WA 2FLOA 4CGIA 4DQ8A 5JS1A 3HVRA 3V9UA 3QEXA 1NKBA 1NGDA 3A2FA 2BE2A 2QWNA 1W0HA 1T8EA 4PKIA 2IIRA 1HNWK 3LALA 5C10A 1SL0A 1X3MA 2O8CB 4O55A 4O8KA 3FZFA 2Y1IA 3QO9A 4RCHA 3UIQA 3O9TA 2ZM6K 1KAYA 3VQ4A 4FM2A 4AHTA 3VQ5A 1HR0K 2YKMA 3S3OA 1GLFO 1Q8IA 1KAZA 4B9MA 2ASMA 2BTFA 1U2VB 3C65A 4V19S 4H8KA 1KFDA 4BWMA 2E6MA 1TKDA 1RGIA 5T7BA 3LP1A 4LF5K 1WSEA 2IAJA 4M45A 4RW4A 2DFEA 1V4TA 4B8AB 5KI6A 4JKBA 1RBTA 2OPQA 4WCEL 1O1WA 1IG8A 2UUCK 3F9KA 3ITHA 5AFUA 1YUWA 4K0KK 2P9NB 3OA9A 4RG8A 3ZLJA 1YF5L 1GLDG 1KSPA 2WOMA 4CJLA 4KB1A 1HYVA 4IG3A 1UAXA 4MLHA 3VQ6A 1KVBA 2OPRA 2V7YA 3ATVA 1GLLO 3AVMA 2JWKA 4HUEA 3BGRA 1Q81O 3A8YA 1VSJA 4KI6A 2F96A 1HQEA 4O0IA 1TKTA 1IBLK 4Z4CA 3VN5A 4OPKA 4XH4A 4M3XA 5LMNK 4DSEA 1TK5A 4LC9B 5E84A 2QTDA 3TAMA 3O4QA 4W5RA 5JS2A 1KLMA 3OYHA 1HKBA 1FK9A 1TL3A 1CZAN 4PL7A 4KHPK 4DMNA 3HZ6A 5GADP 4DTSA 4CERA 2A1RA 4LF9K 4HUGA 3WNFA 1REVA 1S5JA 4HHTA 3VERA 4CD3A 1K9MO 2F9TA 1IKYA 4H5WA 5JENA 2A42A 2VGMA 3VF6A 3EY1A 1RDCA 3WNHA 4IJAA 3SPYA 1X1PA 3EKSA 3VQDA 3PX6A 2G8IA 2OZMA 3AVCA 4CHNA 4DV6K 4FK2A 3LP3A 3ID8A 3CC4N 4B9SA 5GAEP 3BY5A 4KFBA 2W41A 3P5JA 3AA4A 4CBUA 2E2QA 4M42A 4CFAA 4CF9A 3ZT1A 4KI4A 2YV0X 3PSFA 3L4QA 1JCEA 4IDKA 5AJ3K 4E7JA 3DOLA 4Y0WA 4A5BA 3PLAA 3E01A 4LSLA 5J2PA 4DG1A 2IS3A 1T03A 1KLNA 4DV0K 3AAPA 3ULEA 1J53A 1ZBUA 1TGOA 2OTJN 3WNEA 3P38A 3CERA 1WOQA 4ISEA 2CH6A 2I5JA 4WFBL 4I9LA 1BOTO 2P5GA 3AO2A 1JLEA 1S1WA 4DR7K 3TSPA 1NKCA 4IBNA 4LF7K 1NJWA 4PL8A 3CMEN 4JK7A 4M41A 2RE2A 4BDPA 2HHHK 1S1XA 1NK8A 1T44A 4JV5K 1TK8A 3I33A 3SMPA 1X9JA 1QSYA 5ADXA 1TUYA 3OYNA 4CK3A 1WSHA 4B9LA 1Q9YA 5LL6Z 3ENOA 2Q0RA 3R3LA 1D9DA 3EKUA 2HBMA 4YY3K 1T05A 3IRXA 5CZ2A 1KAXA 1WN7A 3CCVN 2ASOA 3ULEB 1KD1O 2YHYA 3AO1A 3CD6N 4Z4EA 2IGIA 1J54A 3AVNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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