4NB4A

Pantothenamide-bound pantothenate kinase from staphylococcus aureus
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
267
structure length
265
Chain Sequence
b'MKVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIYKDTEPPIPGDLTAANFGHVLHHLDFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Type II pantothenate kinase
publication title Structural characterization of a new N-substituted pantothenamide bound to pantothenate kinases from Klebsiella pneumoniae and Staphylococcus aureus.
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus
molecule tags Transferase
total genus 91
structure length 265
sequence length 267
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-10-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4nb4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4nb4A01
1S3XA 3VGKA 3DXKB 5LJVA 1X3NA 4MLHA 4BRPA 1P8ZA 4CZMA 5AFUA 4PL7A 2YI1A 3H46O 1NGJA 5AQQA 2A41A 2F9WA 1GLCG 3IDHA 4WYBA 3DXKA 3VPZA 2E2QA 3A5MC 4BRCA 5AQYA 2ZGZA 5F2RA 4Y0WA 3KVGA 4BREA 4DB3A 4BRFA 4JD2B 4JN4A 2GEMA 3FE1A 1HKGA 3J8AA 3O1BA 4NB4A 4BR4A 1V4SA 4CD1A 1MWKA 3L6QA 4BC5A 1KAXA 2P9KB 4C23A 4EIAA 1EQYA 2HMPA 5AQHA 2WUSA 2QWLA 2F9TA 2P9SB 3SMPA 2QWPA 5AQZA 1NGFA 3LM2A 2P9KA 4BC3A 4MO5A 1KAYA 2E88A 3CQYA 3FGUA 2IVOA 1J6ZA 3D7EO 2P9SA 3QMLA 4CBWA 2A3ZA 2P9PB 3WXKA 1NBWA 3MN6A 4M63C 4H5VA 5AQSA 3P4IA 2CGKA 4BRMA 3TPQA 3VGMA 5AQVA 4CZLA 3CJ9A 3ID8A 4AM7A 3WQUA 3VETA 5ELZA 3UB5A 1U2VB 2DPNA 4L3QA 3D2FB 3U4LA 1QZ6A 4XEIA 2Q1NA 3H3OB 1KXPA 2ASOA 4BGBA 3O1WA 3GOIA 4XH1A 3DAWA 3VEOA 3WXIA 3MN9A 4K43A 4BC2A 1U2VA 3D2FA 3GG4A 4H03B 3VGLA 3FR0A 4JAXA 4K41A 5AQFA 4BRAA 5AZJB 3CJAA 3WEEB 4BROA 3CIPA 3HTVA 1X3MA 4QS7A 2P9NB 3ZX0A 4FWPA 3VERA 4XH4A 5AZJA 3WEEA 4IO8A 3WXLA 1QHAA 2P9IB 4BQZA 2P9UA 4FWSA 2P9NA 3ENHA 2A6AA 4BGAA 3UE5A 4CZFA 2NRHA 4YDUA 3VEXA 3A5LC 2ZWHA 4Z94A 2YJEA 5AQGA 3U9DA 3VF4A 5BPLA 3R9PA 2P9IA 2VWBA 2Q97A 1X9JA 4FWOA 1XUPO 2FXUA 3D2EB 3O8MA 2D4WA 3GBTA 3JXUA 4PKIA 5BN9A 1GLDG 5JLHA 4BRNA 3F9MA 1NLVA 2P9LA 1XQSC 3D2EA 3H6EA 4IJNA 3SK3A 3FFKB 2HOEA 3G25A 3HBTA 1HKCA 3ZX3A 2Q31A 3H1QA 4M7YA 2E1YA 1GLJO 3HI0A 5AFUH 2Q0UA 2E1ZA 1C0FA 3QFUA 4J8FA 4PKGA 3ENOA 1Q18A 1GLBG 4CD3A 2HF3A 2VYPA 3ATVA 4H0OA 4BRLA 5JMVA 3B8AX 5AQXA 1D4XA 2V7ZA 4LC9B 5AQWA 1BDGA 3AY9A 1IG8A 1U6ZA 1ATRA 5BRFA 2PBDA 5F1XA 2NLXA 3H3NO 2QW9A 1RFQA 3S41A 1ESVA 4CBUA 5BRHA 3A5NC 3A0IX 1NGBA 2YHXA 2KHOA 2H3GX 3JS6A 2FLOA 4ISGA 3O6WA 1BA1A 3MMVA 4F9OA 3VEYA 3MN5A 1JCGA 4K42A 3SMSA 1GLFO 3FZHA 5EX5A 4H0XB 3FZKA 5KPZA 2FSNA 3FLCO 4XH5A 1WUAA 3A5OC 4O5FA 4MLEA 1LCUA 1JCEA 3EO3A 4BVOA 2BUPA 4BRIA 5KPRA 3QDKA 3QFPA 1HUXA 1YUWA 5EOYA 3U8XA 4EAHD 3UKUB 4B1WB 4CZEA 3VEZA 3GL1A 5EY4A 2QWRA 2YJFA 1C0GA 1XC3A 2A40A 3AARA 3SJHA 3ZEUB 2UYTA 4AM6A 1QZ5A 3L4IA 3O80A 1HX1A 5JLFA 3HM8A 3IFRA 2W40A 4BR9A 3UKUA 4H0PA 5AR0A 2IVPA 4FWNA 4I6MB 1GLAG 3ZEUA 1NMDA 3R8EA 3VEWA 1BU6O 2AP1A 5AZIB 3WT0A 4BRGA 4H0TB 2V51B 3VEVA 1BUPA 4BRQA 2QWMA 5AQUA 3AAPA 4I6MA 3WQTA 3H45C 4EHTA 5KQ8A 2FSKA 2CH5A 5AZIA 2P9UB 3EL2A 1NGIA 3M1FA 3DJCA 1DKGD 4GNIA 3LDOA 3LL3A 4ISEA 1K8KB 4EFHA 3W0LA 4IZ9A 5E26A 5FPEA 3ZETB 4M7XA 3LDQA 2YHWA 3HSCA 4FO0A 3C0BA 5ADXH 4WQ4C 2BTFA 3A8YA 5LJWA 1K8KA 4ISFA 2I7NA 3EKSA 4RTFD 1HLUA 1CZAN 3IMXA 3ZETA 1HPMA 5EVZA 2E2NA 2P9LB 4A2AA 1HKBA 1Z6RA 4FOEA 2ASPA 4BR5A 3C7NB 1TYQB 2Q36A 3M3ZA 2CGJA 5JICA 3WXJA 3I33A 2D0OA 3CJ7A 3FZLA 2V52B 2YHYA 5FPNA 2VCPA 2GUPA 4MO4A 3C7NA 1TUYA 1TYQA 4CZGA 4BG8A 4B1UB 3L0QA 4FWRA 5AQRA 4H5RA 5E84A 5AQOA 2E8AA 4A62A 2QWNA 5AQNA 2Q2RA 4WQ5C 3LDNA 1MWMA 5AQTA 4FWMA 2I7PA 4KBOA 1YAGA 3H1VX 4BR7A 4CI6A 1T44A 1BWFO 3AAQA 1GLEG 2IVNA 1Y64A 4BRDA 1NWKA 3RSEB 3WUHA 1BO5O 3ATUA 3O5BA 2YCHA 1RDWX 5LY3A 4CZJA 3KZBA 3LDPA 4PL8A 2D0PA 4EHUA 3RSEA 2FSJA 4H5NA 3QBWA 5AQIA 2ITMA 2A5XA 3GDQA 4HWIA 4B1ZA 3MCPA 1G99A 2J4RA 1NGGA 3LM9A 3UKRB 5AQJA 4B1YB 3U9ZA 3VESA 5FPDA 3GE1A 1MDUB 1KAZA 3O08A 4CBXA 4BQLA 1T6CA 4DQ8A 4B9QA 1ZBSA 4BG9A 3MN7A 3QB0A 3UKRA 1QQMA 4IWVA 3VOVA 1ATSA 3TU5A 1YVNA 4BR2A 3LDLA 3MK6A 4JD2A 2GTDA 2Q0RA 1E4FT 5BR9A 5TKYA 1LOTB 3ZX2A 4HTLA 1ATNA 1TUUA 2E20A 3O4WA 4BVPA 1ZC6A 1NGAA 1SQKA 2FF6A 2E2OA 2QM1A 2CH6A 3SLCA 2IIRA 1MA9B 3VF2A 1DEJA 3R6MA 3VF6A 1NM1A 2A42A 4K25A 2V7YA 1SAZA 4BRHA 2ZF5O 2W41A 1R59O 1WOQA 2ZGYA 4FPBA 4CZHA 1S22A 1BG3A 4H0VB 3IUCA 1SZ2A 3BEXA 3EN9A 3CETA 2QWQA 4H5WA 3VENA 1QQNA 3BP8A 4IXCA 4JHDB 5FPMA 2P9PA 4RCHA 3HZ6A 5AQMA 3BUZB 4B1VA 1T6DA 1NGDA 4QS8A 4O8KA 3CI5A 3DWLA 3FZFA 4FWLA 4B1XB 2AA4A 4JHDA 4FSVA 1DGKN 3I8BA 3FZMA 5BPNA 2GWJA 4FWKA 1H1VA 2EWSA 1YXQA 5KQDA 1E4GT 5B8HA 5KPTA 4E1JA 4CJ7A 1IJJA 1RGIA 4FL9A 3CERA 2QWOA 4FPAA 4FWQA 4CZIA 4H5TA 5AQPA 2D1KA 5EXWA 4IJAA 3DXMB 4WQ4A 4BR0A 5F0XA 4A61A 3EZWA 5CE3A 4H0YB 5BN8A 5AQLA 2FF3B 1NGEA 2QXLA 3BF3A 3CQXA 4DHYA 5AQKA 2NZTA 3ULEB 1HJOA 3DXMA 1NGHA 4YDUC 4CZKA 1Z05A 4RWTA 5BPMA 4NO7A 3CJBA 3QBXA 1NGCA 4A2BA 1BA0A 3M6GA 4BC4A 1OKJA 3ULEA 2GELA 2ASMA 2CGLA 1GLLO 1QQOA 4FOIA 5ADXA 5I9EB 2HF4A 3CHWA 4JNEA 1BOTO 4BRKA 4GY2B 3W3DA 4QS9A 5BRDA 2GWKA 3CJ1A 2OANA 4WQ5A 1JCFA 3QICA 4PKHA 5BREA 3BF1A 2E2PA 3EKUA 1ZXOA 4DCHA 3CJCA 3KHYA 3MDQA 1V4TA 2PAVA 3OHRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OBYA 4ILJA 1X3NA 4J2BA 1P8ZA 3ZT4A 1SUQA 5AQQA 2ZM6K 2A41A 2F9WA 4X66K 3KLEA 4KHSA 4JKGA 4NCAA 4WYBA 2QK9A 2E2QA 1WNSA 2IC3A 3OYEA 4GVEA 2PY5A 4JI7K 4KH5A 5KRTA 2GEMA 4NYFA 5M1OA 2O8FA 3K57A 4BR4A 1IBLK 4CD1A 1ZBFA 1KVBA 2WFBA 2P9KB 3SNNA 3HOTA 4RW6A 1EQYA 3LZIA 3CCJN 2HMPA 1Q7YO 4C8LA 3NF7A 2F9TA 3SMPA 4WFBL 1NGFA 3T69A 4FJMA 4BACA 4E1MA 2E88A 3FGUA 2XY5A 1CLQA 4FJLA 4JS5A 2P9SA 4CBWA 2ZJQL 3H08A 4Q5VA 3IKMA 1Z25A 3CCQN 1NOYA 3ALYA 5AQVA 5IWAK 4CZLA 3KKRA 5ELZA 3U4LA 1QZ6A 1TV6A 1WLJA 4BGBA 4DV7K 3DAWA 4CJFA 3MN9A 2ZJPL 3D2FA 4GVMA 4FLYA 4KHQA 4H03B 2NNWA 3FR0A 4JAXA 3RRGA 3OVNA 4BRAA 3CJAA 4BROA 3HTVA 1VQ6N 2NRRA 4E89A 1X3MA 2RE2A 4OKKA 3HVTA 4FWPA 3OYIA 3PLAA 4IO8A 1EO1A 1XI1A 1NJYA 4ELVA 4FXDA 1QHAA 4J2EA 2P9NA 3ENHA 3TSPA 4BGAA 1VRTA 2RHKA 3O4NA 3P39A 3RVCA 4E7LA 4BDPA 4YDUA 2F8SA 1JXBA 4DUYK 1S5JA 5AQGA 3VF4A 1K73O 2P9IA 2VWBA 3HRGA 5M1KA 3VA3A 4CFBA 1RTJA 3D2EB 4C8OA 2YKNA 1QVFM 2D4WA 3AVAA 2E4LA 4OPKA 4I9LA 5BN9A 1JXEA 4DU3A 3E9OA 5JLHA 1RBUA 3NFAA 1NK8A 3SUQA 3CQ8A 3FFKB 2HOEA 4CHNA 3ZT3A 1HKCA 4DS5A 5C10A 1GOAA 4M7YA 1B9FA 3M8PA 2E1ZA 3C95A 4PKGA 5J2NA 3QERA 3PX0A 2VYPA 3ATVA 4H0OA 4E19A 2UUBK 1BDGA 3SI6A 4CE9A 1ATRA 4KO0A 4G9ZA 1L3TA 5BRFA 2O8DB 3IG1A 2PBDA 5F1XA 4CEEA 3LP3A 1IKYA 2QW9A 4CIFA 3S41A 5JVGL 2UU9K 3TABA 4IOCL 1VAZA 5C15A 4CHZA 2KHOA 1NK9A 1HYVA 5EU7A 1ASUA 4LF9K 4ISGA 3MWTA 3O9TA 3C6AA 1BA1A 4F9OA 1BCOA 3MN5A 1GLFO 2WONA 3VTHA 3TWHA 4YFUA 4H0XB 4JI1K 3FZKA 3ZSOA 1HRHA 4KPYA 4XH5A 1WUAA 3A5OC 2ZD1A 2BE2A 2HVHA 4JRQA 3U6FA 4FLVA 3F5TA 3NH2A 4F8RA 1OH7A 4N41A 4KTWA 1C0GA 3DYAA 3AARA 3EZ5A 3L4IA 5JLFA 1JJ2M 2YNGA 1EP4A 3KJVA 2VG5A 3UKUA 4CJSA 4CF1A 3PX4A 3AO4A 3ZEUA 3R8EA 3VEWA 3TARA 1HNZK 3OYGA 3CMEN 1JLBA 1S9EA 4LF6K 3QEXA 5C2DA 1OH5A 1WSHA 2HNYA 3ZSVA 2HHSA 1DKGD 4GNIA 3RMBA 2B5JA 1MU2A 1K8KB 4EFHA 1WBBA 3I0RA 4YOWA 3ZETB 4DLGA 4KHUA 3CM6A 2HHVA 1S1WA 2JWKA 4EP5A 4CJRA 5ADXH 4X62K 4DS4A 4IO9L 4ISFA 3EKSA 1HLUA 1CZAN 2IDOA 3CMAN 5C0YA 1HPMA 1EWRA 4JLHA 5DM7L 3HO1A 4LFBK 4DQSA 1DTTA 2E2NA 1KFSA 1HKBA 1Z6RA 2ASPA 4C1NI 5HRPA 4LF4K 3WXJA 3I33A 3CJ7A 4B9NA 3E1YA 3UIQA 1X9SA 1RBTA 4MO4A 3C7NA 1TUYA 1IKXA 1YITN 3JAMO 1CZ9A 3MX5A 5SZTA 4FWRA 5AQRA 3SZ2A 1C1CA 2E8AA 3TAMA 1JLAA 4A62A 3EYZA 5AQNA 1RDDA 3A2FA 1MWMA 3RMAA 4A5BA 4RW9A 3PIOL 4KREA 4DTJA 5CZ1A 3V81A 1BWFO 3AAQA 4DV5K 2IVNA 4H8KA 3RSEB 3OYCA 2UXBK 1JLCA 1KTQA 4W5TA 1TVRA 4KKOA 3K5NA 1IBKK 4OPHA 3WNGA 4B3TK 2QA4N 1RDWX 3LALA 3KLGA 4CZJA 2RPIA 4DV6K 3KLIA 4Z4EA 4EHUA 2FSJA 3O3GA 4FK2A 3WNEA 3LANA 1VSJA 3K0SA 4B1ZA 4Y1CA 5AQJA 4B1YB 3U9ZA 1YTAA 1ZBHA 3DOKA 3PUFA 4B9UA 1WSEA 3O08A 3HSTB 3L8BA 4BQLA 4DQ8A 4DV3K 4IWVA 1ATSA 2Y1JA 4M41A 4BR2A 4JD2A 4DV4K 4DTMA 1XC9A 3ZT2A 4F3OA 2O8EB 3SUPA 1VRUA 2YV0X 1LOTB 2DFHA 4HTLA 3ZX2A 4HUEA 4JV5K 5J2MA 3L3UA 2O8CA 3K9KA 1LV5A 5D3GA 3VF2A 1HNVA 2X6NA 1I94K 4B9VA 3VF6A 1BISA 1XMQK 3PO4A 2ZF5O 3SUOA 1R59O 1WOQA 2IGIA 5KTQA 4E7HA 4Z4HA 1A5XA 1EKEA 5M1QA 1SZ2A 1C1AA 4IG3A 3V9WA 1QQNA 2P9PA 4LFCK 4RCHA 5AQMA 2YNFA 3BUZB 1T3VA 2KFNA 3CC4N 3OYAA 1VQ5N 4O8KA 4BE2A 3CI5A 3G71N 3FZFA 3JYTA 4CESA 2AA4A 1S1VA 3P38A 3DRSA 5FRMA 3KK3A 4JI4K 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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