4NB4A

Pantothenamide-bound pantothenate kinase from staphylococcus aureus
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
267
structure length
265
Chain Sequence
MKVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIYKDTEPPIPGDLTAANFGHVLHHLDFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural characterization of a new N-substituted pantothenamide bound to pantothenate kinases from Klebsiella pneumoniae and Staphylococcus aureus.
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus
molecule tags Transferase
molecule keywords Type II pantothenate kinase
total genus 91
structure length 265
sequence length 267
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-10-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4nb4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4nb4A01
4FPAA 5LJWA 2FSNA 4C23A 3UKRA 5E84A 1GLCG 2YHWA 2ZWHA 5AZJA 4A2AA 3VEVA 4KBOA 5KPZA 4QS7A 1KAXA 1GLEG 4B1XB 1NGGA 3BUZB 1HPMA 4BRDA 4NB4A 1HLUA 4FWPA 3I33A 1BA1A 2CH6A 3IMXA 4BRIA 3ZX0A 2A3ZA 3R6MA 1BOTO 3DJCA 4DCHA 2P9IB 3FZLA 1JCGA 1DKGD 1TYQB 3L0QA 2YI1A 3WT0A 4H5NA 2UYTA 1IJJA 2W40A 3VEWA 4BRCA 1NGDA 3C7NB 3CQXA 3O5BA 3GBTA 4QS8A 3G25A 4FWSA 4H03B 3WUHA 2EWSA 3OHRA 4BRPA 5AZIA 3VF6A 3IDHA 4IJAA 2PBDA 1HKBA 3CJCA 3FZKA 3EKUA 1GLFO 3SJHA 3UE5A 5EY4A 2IIRA 1U2VA 3A8YA 4CBWA 3SK3A 3ULEB 4CI6A 4BR4A 1T6CA 2GTDA 3VF2A 1QQOA 4H0PA 3W0LA 3QDKA 2A5XA 3O8MA 1NLVA 4RWTA 3EKSA 3GDQA 1K8KA 1P8ZA 5FPMA 5AQJA 5AQFA 1GLAG 4BQZA 3ZX2A 4YDUC 1XUPO 2NLXA 1X3NA 2I7NA 1NBWA 5BRDA 2CGKA 3ID8A 4XH1A 4BVOA 3LDOA 3HSCA 5AQOA 5AQXA 2VWBA 3EN9A 3ZETA 3AY9A 4CZLA 1SAZA 4A61A 2IVOA 4BRGA 4MO4A 3HTVA 4M63C 1ATNA 3R8EA 4BR9A 3DAWA 4EFHA 1JCFA 5LY3A 3VEYA 3ZETB 2A41A 1ATRA 3MN7A 2HOEA 5BPLA 3FZFA 4MLHA 5AFUA 5AQQA 4CZFA 3VETA 3VGMA 2YJEA 1NGAA 3KVGA 3CI5A 1EQYA 3ENOA 3QBXA 1K8KB 2FSJA 5AZIB 3D7EO 4FWRA 1E4GT 2CGLA 1RGIA 4H0OA 3U9DA 1ATSA 1BA0A 1MWMA 1NWKA 3O1BA 3H1QA 1QZ5A 3LDPA 3KHYA 3MN6A 3WEEB 3QFPA 5AQMA 3R9PA 4EHUA 2BUPA 2OANA 3I8BA 1TYQA 5AQGA 1NMDA 2FXUA 5F0XA 3UB5A 3FR0A 3GOIA 1Y64A 1S3XA 3B8AX 4B1UB 4AM6A 3DWLA 2QXLA 4Z94A 2E2OA 4JNEA 4CBUA 3WQTA 2W41A 2HMPA 5EXWA 4BR2A 3GE1A 3VEOA 2CH5A 2VYPA 3QBWA 4GNIA 5ADXH 4FWNA 3L6QA 1C0FA 3U9ZA 3C7NA 5AQKA 3UKRB 3GG4A 1V4TA 4I6MA 4H5TA 4E1JA 4FO0A 5EX5A 2P9IA 3LDQA 3IUCA 5ELZA 3KZBA 1E4FT 4EAHD 4JHDB 3CJ7A 4H5RA 2P9UA 4PKHA 3CIPA 3UKUA 3LL3A 5F1XA 5FPNA 1KXPA 3ATUA 4YDUA 2KHOA 4MO5A 5AQPA 2P9NB 3SLCA 1C0GA 4H0VB 4EIAA 5AQUA 5LJVA 5JMVA 4ISFA 5BR9A 2E2PA 4J8FA 3WXLA 4AM7A 1GLDG 1NGEA 2NZTA 4BG9A 2QWOA 3EZWA 4K41A 3RSEB 4JAXA 3S41A 4BRFA 4CZKA 5FPEA 4FPBA 1ZBSA 2V7YA 2QM1A 4BC4A 4BR5A 3O6WA 4K42A 3TPQA 2P9LB 3F9MA 4BG8A 2NRHA 1NGFA 1BUPA 2V52B 4H0YB 1SZ2A 2ITMA 1GLLO 5TKYA 4FWLA 4CZIA 4H5WA 3VOVA 3VPZA 5KQ8A 2FSKA 5AR0A 4RTFD 1WUAA 3HBTA 5AQIA 5JLFA 3CJBA 3HI0A 5AQSA 3ZEUA 4CZMA 4CBXA 4BR0A 4PKIA 5AQVA 4CZJA 2FLOA 2J4RA 4JD2A 5KQDA 1X9JA 2ZF5O 1Q18A 1X3MA 1GLJO 3CJ9A 5AQNA 2GEMA 2E1YA 4F9OA 3ZEUB 4BRKA 3A5OC 3CHWA 3DXKB 2GUPA 3HM8A 5AQZA 3ENHA 4FWKA 3GL1A 4CJ7A 4B1VA 4K43A 4O5FA 2QW9A 4BREA 1LOTB 3LM2A 2QWLA 4B9QA 2P9SA 1JCEA 4FL9A 4QS9A 4DHYA 3O80A 4DQ8A 2P9PA 4FSVA 4IJNA 1H1VA 3WXJA 1YAGA 2E1ZA 3DXKA 4BGAA 4BQLA 2P9UB 3UKUB 4NO7A 5AQTA 4IXCA 4JHDA 3WEEA 3FFKB 2YHYA 3U4LA 5BPMA 2Q97A 1BDGA 5B8HA 3CERA 5E26A 5BPNA 2AP1A 3EL2A 2QWMA 1XQSC 1T6DA 2Q0RA 3M3ZA 1U6ZA 1ESVA 3J8AA 2P9KA 4I6MB 2H3GX 3H3OB 3VESA 3MK6A 4GY2B 2D1KA 3LDNA 2Q1NA 5BN9A 1YUWA 3H1VX 3VENA 3ZX3A 4PL8A 3C0BA 3U8XA 2YJFA 4BC5A 1T44A 1KAYA 3LDLA 1YXQA 4BRQA 2E20A 1HKGA 4K25A 3D2FB 1QQNA 4IO8A 4WQ5A 2QWNA 3MDQA 1V4SA 5BRHA 4BRAA 4A2BA 3QICA 3MMVA 2P9PB 2ZGYA 3CQYA 1D4XA 3WQUA 3RSEA 2QWQA 3O4WA 1IG8A 4BC2A 3P4IA 2IVPA 5EOYA 2D0PA 4FOIA 3AAPA 4PL7A 3M1FA 5AFUH 1MWKA 4IWVA 5KPTA 4M7YA 3W3DA 4BRLA 2P9KB 1DEJA 2Q36A 2VCPA 3O08A 1BU6O 1SQKA 2E2QA 4WQ4A 4BGBA 5JLHA 4JN4A 4WQ5C 3JS6A 1NGCA 2A40A 4CD3A 2ZGZA 1XC3A 1U2VB 4CZHA 2V7ZA 3L4IA 1NGBA 3VF4A 4B1YB 2QWRA 5AQYA 3A5LC 1OKJA 1Z6RA 4XEIA 4EHTA 4WYBA 1YVNA 1MA9B 3AAQA 3H46O 1QZ6A 4FWQA 5ADXA 4DB3A 1NGHA 2PAVA 3IFRA 5CE3A 1TUUA 4Y0WA 4FOEA 4B1WB 3H45C 4BRHA 1RFQA 4H0TB 4CD1A 2I7PA 5FPDA 3MN9A 5JICA 4PKGA 5AQHA 4XH4A 3M6GA 2ASMA 2HF4A 2YHXA 2GWKA 3VEZA 2F9TA 1NGJA 3A5NC 2Q2RA 2D0OA 2DPNA 4BC3A 1BO5O 1MDUB 1QQMA 3BP8A 3QMLA 1J6ZA 1S22A 5BN8A 3SMPA 1QHAA 4JD2B 3ULEA 3D2FA 1DGKN 1HJOA 3ATVA 3CETA 3FZHA 4ISGA 2P9SB 4FWOA 1G99A 4IZ9A 2P9NA 2FF6A 3WXIA 3VGKA 2IVNA 4L3QA 1BG3A 3A5MC 3MN5A 2GWJA 4BRNA 4BR7A 4CZGA 3DXMA 2D4WA 1ZXOA 3LM9A 2GELA 3CJ1A 1WOQA 4O8KA 3SMSA 4CZEA 4M7XA 4WQ4C 2ASOA 1NM1A 1TUYA 5AQWA 5I9EB 3O1WA 2P9LA 3A0IX 3AARA 2A42A 4BVPA 4XH5A 1R59O 2AA4A 3BEXA 5AQRA 3VEXA 4H5VA 2ASPA 2E8AA 3QFUA 5BREA 3EO3A 3D2EA 4A62A 1KAZA 4ISEA 2CGJA 2BTFA 3FLCO 5F2RA 3H6EA 3TU5A 2F9WA 3FGUA 1CZAN 4MLEA 3QB0A 1HX1A 4HWIA 3WXKA 4B1ZA 3MCPA 1LCUA 2HF3A 3VERA 3D2EB 2Q0UA 3HZ6A 2E2NA 5AZJB 4H0XB 2WUSA 2QWPA 2FF3B 1BWFO 1RDWX 4RCHA 3H3NO 2E88A 4HTLA 3BF1A 1Z05A 5EVZA 1HUXA 3CJAA 4FWMA 1GLBG 3VGLA 4BROA 4BRMA 1ZC6A 5KPRA 3DXMB 5AQLA 2V51B 5BRFA 3FE1A 2YCHA 1NGIA 2A6AA 3BF3A 3JXUA 3FZMA 2Q31A 1HKCA 4LC9B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HQUA 3UKRA 3TAPA 5E84A 1RT5A 2ZWHA 5KPZA 4PA1A 4B1XB 3ZSYA 1NGGA 1EXQA 2O8EA 4IG3A 3PSFA 1YF5L 4NB4A 3MWTA 4DS4A 5GIPA 4FJGA 4M3UA 2IC3A 3IMXA 4BRIA 2OA8A 4FLTA 1BOTO 4J2AA 3FZLA 3VA3A 3N4PA 1RILA 3T7ZA 2YI1A 3WT0A 3E9OA 3SUQA 4H5NA 2HHSA 1IJJA 2W40A 4CF8A 4DSIA 1S1XA 3CPWM 4R5PA 4QS8A 2EWSA 3C94A 1KD1O 2D0AA 4HUFA 4IJAA 4DSFA 3CJCA 1NKEA 4DV6K 2OPRA 5MLCQ 5FRMA 3SJHA 1Y97A 1L3SA 4AHSA 2HNDA 3ULEB 4CJFA 4DTOA 4NYFA 4OJRA 4BR4A 4DQIA 4DUYK 3RWUA 3AVKA 4H0PA 3OA9A 3QDKA 1FXXA 2A5XA 3AO5A 2IS3A 4B9NA 4RWTA 2OPQA 1K8KA 1EETA 3ZSWA 4JKEA 1NK0A 2XY5A 2NLXA 1NBWA 1BCMA 4BVOA 3HSCA 5AQOA 5AQXA 4DSLA 3AO3A 1J9AA 3SBTA 1SAZA 4FVUA 4C8OA 4LSLA 4DLEA 1WBBA 3F73A 4BR9A 1JLQA 4EFHA 1ASUA 4OVLA 3ZETB 3LZIA 1ATRA 3MN7A 1NJXA 4HUEA 4OKKA 3FZFA 4W5QA 1OH8A 4MLHA 2YNGA 5LMNK 3TSPA 4CZFA 4GV9A 4DTXA 1VQNN 3UIQA 3AVGA 3E1YA 2FSJA 4OPAA 5AZIB 3THXA 1U4BA 1VSDA 4H0OA 1BA0A 5DM7L 1MWMA 1ZYQA 3MN6A 1UA1A 5KRSA 3G71N 3LAKA 3DRPA 3I8BA 1TYQA 3J81O 1NMDA 3WNGA 4DTMA 1S3XA 2IAJA 3DWLA 4Z94A 3IKMA 5EXWA 1NK7A 3RVCA 3GE1A 3CCQN 1E3MA 5ADXH 4FWNA 1C0FA 3MEEA 2YNIA 4CEDA 4N5SA 2O8FB 4LF8K 5HOOA 1X1PA 4M41A 4JI7K 2P9IA 2UXCK 4FJIA 4EAHD 1N32K 3LP2A 4PKHA 3UKUA 3L3VA 4NCGA 1L5UA 4FJ5A 1IKXA 3ATUA 3PY8A 1HQEA 2KHOA 3KLGA 4EIAA 4M3YA 4BG9A 4HHTA 2QWOA 3EZWA 5TKWA 1GOAA 3SQ0A 2ZE2A 3RSEB 3NDKA 4JAXA 2HBJA 3LALA 1SL0A 1VK0A 3SV4A 1D9DA 1UWBA 3F9MA 3TTCA 1YHQN 1SS6A 2V52B 1RBVA 1SZ2A 1VAZA 4N41A 3OTOK 1GLLO 3AV9A 4DV7K 4B3RK 4Y1CA 1XNQK 5AR0A 4RTFD 4I7FA 4FLUA 1VQ7N 2G8VA 3M5RA 5AQIA 3OYMA 1TK5A 5JLFA 3TAEA 2HBMA 4CZMA 1BISA 1C6VA 1CLQA 4DSJA 4CJVA 4PKIA 5AQVA 1JJ2M 1Q81O 4I2QA 2J4RA 2FBYA 3J7YP 2QA4N 3ZSOA 3ULDA 1DTTA 3CJ9A 4GKJK 2GEMA 3P39A 2GV9A 4CEOA 3A5OC 3T19A 2KQ2A 2I5JA 4DSEA 1W7AA 4GV3A 4KO0A 3V9WA 2Z1IA 4IEIA 4JKDA 3R1XA 4DTNA 2HVHA 4IJNA 3DRSA 4BQLA 3MEGA 4FLZA 1ZBLA 4JI0K 4JHDA 4W5RA 3FFKB 4LFCK 4DKWA 1Q86O 5B8HA 3CERA 5CYQA 2A1SA 2AP1A 4Q5VA 4J2EA 3TR8A 3M3ZA 4OKJA 1ESVA 5KRTA 4N76A 2XRIA 2D1KA 2Q1NA 4YOXA 4CGHA 1YUWA 4NXMK 3K58A 4PL8A 3C0BA 3U8XA 1KRPA 1T44A 4MDAA 1Q7YO 1YXQA 3M8QA 3D6RA 1U45A 2E20A 4JKHA 1HKGA 3LWLA 3D2FB 1G15A 4E7KA 2KTQA 4JKAA 5JS1A 1V4SA 4ZTJA 5BRHA 1ZBHA 4BRAA 3CQYA 3RSEA 2QWQA 2KFNA 4DQQA 4EP5A 1IG8A 4BC2A 3P4IA 3NCIA 2OZSA 2IVPA 4KTWA 1XWLA 5EOYA 4FVMA 2XO7A 3AA3A 4JKGB 1DT9A 2RN2A 4PY5A 3CCEN 3O9SA 4M7YA 1RT2A 1VQMN 2IOCA 4Z4EA 1SQKA 4BGBA 1J53A 3C6HA 4E89A 4ELVA 1XC3A 4CJ4A 2VQEK 2V7ZA 3P31A 1RDCA 1YITN 4F2RA 1OKJA 1Z6RA 5M1KA 4EHTA 4WYBA 1YVNA 5ADXA 3SAGA 2R7YA 3O4NA 3V9XA 1NGHA 5CE3A 3OYCA 2E6LA 4B1WB 5KGXA 4YFUA 4CD1A 1LAWA 3VQQA 2HHVA 5FPDA 4CFAA 1EWRA 3VEZA 4BY9C 2F9TA 1NK4A 1NK5A 3MAQA 1QQMA 1J6ZA 3H08A 5BN8A 4CF0A 3AVHA 1QHAA 1VQKN 4FJLA 3U3YA 3FZHA 3O9RA 3MXJA 4ISGA 4RW8A 4FWOA 1G99A 1N36K 4N56A 3OYEA 3QEVA 3DLLL 4JEPA 4BDYA 4BRNA 4RW9A 1JKHA 3DXMA 3EEQA 3QNNA 5M1PA 4IOXA 4A5AA 4NXNK 1W2BM 5KI6A 3WNFA 1W0HA 1JLCA 5AQWA 4O44A 3O1WA 2P9LA 3A0IX 3SBGA 3RRGA 3TARA 3BEXA 1RBRA 3NH2A 4H5VA 4A57A 3HYFA 3QFUA 3CC7N 5BREA 3L4QA 4E1MA 4MLEA 3QB0A 2P5OA 1RDBA 3HP6A 2W6KA 4B1ZA 2ZJQL 4F2SA 3DRRA 3D2EB 1QE1A 3QIPA 3HZ6A 4H0XB 2QWPA 1WSGA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2YCH A;  1NGI A;  2A6A A;  3BF3 A;  3JXU A;  3FZM A;  2Q31 A;  1HKC A;  4LC9 B; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1HQU A;  3UKR A;  3TAP A;  5E84 A;  1RT5 A;  2ZWH A;  5KPZ A;  4PA1 A;  4B1X B;  3ZSY A;  1NGG A;  1EXQ A;  2O8E A;  4IG3 A;  3PSF A;  1YF5 L;  4NB4 A;  3MWT A;  4DS4 A;  5GIP A;  4FJG A;  4M3U A;  2IC3 A;  3IMX A;  4BRI A;  2OA8 A;  4FLT A;  1BOT O;  4J2A A;  3FZL A;  3VA3 A;  3N4P A;  1RIL A;  3T7Z A;  2YI1 A;  3WT0 A;  3E9O A;  3SUQ A;  4H5N A;  2HHS A;  1IJJ A;  2W40 A;  4CF8 A;  4DSI A;  1S1X A;  3CPW M;  4R5P A;  4QS8 A;  2EWS A;  3C94 A;  1KD1 O;  2D0A A;  4HUF A;  4IJA A;  4DSF A;  3CJC A;  1NKE A;  4DV6 K;  2OPR A;  5MLC Q;  5FRM A;  3SJH A;  1Y97 A;  1L3S A;  4AHS A;  2HND A;  3ULE B;  4CJF A;  4DTO A;  4NYF A;  4OJR A;  4BR4 A;  4DQI A;  4DUY K;  3RWU A;  3AVK A;  4H0P A;  3OA9 A;  3QDK A;  1FXX A;  2A5X A;  3AO5 A;  2IS3 A;  4B9N A;  4RWT A;  2OPQ A;  1K8K A;  1EET A;  3ZSW A;  4JKE A;  1NK0 A;  2XY5 A;  2NLX A;  1NBW A;  1BCM A;  4BVO A;  3HSC A;  5AQO A;  5AQX A;  4DSL A;  3AO3 A;  1J9A A;  3SBT A;  1SAZ A;  4FVU A;  4C8O A;  4LSL A;  4DLE A;  1WBB A;  3F73 A;  4BR9 A;  1JLQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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