4NB4A

Pantothenamide-bound pantothenate kinase from staphylococcus aureus
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
267
structure length
265
Chain Sequence
MKVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIYKDTEPPIPGDLTAANFGHVLHHLDFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural characterization of a new N-substituted pantothenamide bound to pantothenate kinases from Klebsiella pneumoniae and Staphylococcus aureus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Type II pantothenate kinase
molecule tags Transferase
source organism Staphylococcus aureus
total genus 91
structure length 265
sequence length 267
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-10-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4nb4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4nb4A01
5AQKA 1QHAA 2YCHA 4M7YA 4BRPA 1BO5O 2QWPA 3H3NO 3KVGA 5LJVA 2HOEA 4EHTA 3C0BA 3A0IX 2A5XA 3FLCO 4WQ4A 4K25A 1IJJA 1KAXA 2F9WA 5AQSA 4EIAA 3MN6A 4MLHA 3BP8A 5AZJB 4C23A 5BREA 3EKUA 4B1WB 2Q97A 3D2EA 4FSVA 4CZIA 2Q1NA 3QMLA 2FF6A 3VPZA 3D2FB 4BR4A 2BUPA 3VF6A 1MA9B 3CJCA 5BR9A 3S41A 4BRIA 3L4IA 2P9NA 4BRQA 5AQXA 3BF1A 3O1WA 1R59O 5BN8A 4XH5A 1BG3A 2A42A 4BR0A 5AQFA 4HTLA 2HMPA 3ZX2A 3GL1A 3R9PA 4L3QA 5BPLA 1K8KB 3VETA 3CJ9A 5KPTA 3LM9A 4CZEA 3WXJA 5ADXH 2D0OA 4K42A 1YUWA 4PKHA 2QWQA 2V52B 2Q36A 3A5NC 5E26A 4B1ZA 3M6GA 4H03B 4B1UB 2GUPA 2J4RA 4BR9A 4YDUA 2YHXA 2GEMA 1E4FT 2HF4A 2QWLA 3EZWA 4CZKA 3LDPA 1TYQA 1Z6RA 3DWLA 1YVNA 4AM6A 4B9QA 2VWBA 4O8KA 4EAHD 3AAPA 2P9UA 3UKRB 4BQZA 4H0VB 3D2EB 4ISGA 2Q0RA 1Q18A 1BA0A 5BPMA 4MO5A 3ZEUA 1ESVA 1HKCA 4CZLA 5BRFA 3MCPA 1J6ZA 3J8AA 3GDQA 3D7EO 3HTVA 1CZAN 1GLCG 4FWOA 4Z94A 2FSKA 3VOVA 1Y64A 3R8EA 2ASOA 2H3GX 1NGCA 3LDLA 3FE1A 1MDUB 2E1ZA 3OHRA 1EQYA 2A40A 5CE3A 5AQTA 2HF3A 3IFRA 4YDUC 3KHYA 3ENHA 1ATSA 2V7YA 4K41A 4BRGA 5AQNA 3C7NA 3FR0A 1KAYA 3U9DA 3VENA 3MN7A 4IO8A 4XH1A 5AQVA 1YXQA 4CZGA 3RSEB 3GE1A 4FOIA 3SMPA 4Y0WA 4JHDB 3A5LC 3JXUA 3W3DA 1C0GA 4B1YB 3CI5A 4H0TB 3FZLA 2P9UB 3EKSA 2P9SA 3FGUA 3M3ZA 3MN9A 3R6MA 4FWSA 1ZXOA 5KQDA 1GLJO 4CZFA 4BRHA 2V51B 4PL7A 3ZEUB 1KAZA 2YJEA 3DXMB 4JD2B 5FPEA 3GOIA 3LL3A 4BR2A 5E84A 4H5RA 3U4LA 4EFHA 4BROA 4EHUA 4FPBA 4IJAA 4BREA 1C0FA 3WUHA 2I7PA 1QQMA 4FWNA 5LY3A 5EVZA 3A5MC 4FO0A 1RDWX 3O80A 1GLAG 4BC3A 4DCHA 5JMVA 1ATNA 4J8FA 4H5TA 3SLCA 4H0XB 3ZETA 3O6WA 3H3OB 5I9EB 1BDGA 2P9KA 1V4SA 2E20A 2QM1A 4JN4A 1TUYA 5ELZA 3U9ZA 1MWMA 3UE5A 3P4IA 1ATRA 4BRNA 5TKYA 1RGIA 1E4GT 2P9PB 5AQMA 5KPRA 2I7NA 3MN5A 1HKBA 2P9IA 3VEOA 4BVPA 3DXKA 2FF3B 4WQ4C 1G99A 3DJCA 2V7ZA 1NMDA 2ASPA 3WQTA 1NGIA 5KQ8A 3CQYA 4RTFD 2NRHA 2Q31A 1T6CA 5F1XA 4A61A 1GLBG 1T44A 4A2BA 4FWKA 4AM7A 1NGFA 1GLEG 3ENOA 5AZIA 1QZ6A 4CBUA 1X3NA 3WQUA 1BUPA 3CIPA 2PBDA 1WUAA 5BN9A 4FWMA 3VEXA 2A6AA 1NLVA 2QWRA 3QDKA 4CJ7A 5AQWA 1H1VA 4BQLA 3O08A 4IXCA 4BRDA 2P9KB 3QBWA 5ADXA 2IIRA 1BWFO 2CH6A 2P9NB 1LCUA 2ZGYA 4GY2B 4BR7A 3O1BA 2CGJA 3VERA 4QS8A 2NLXA 2ITMA 5AQLA 1QQNA 1NGJA 1BOTO 3VESA 3IMXA 3LDOA 3FZKA 2QW9A 4M63C 3QFPA 3O4WA 4LC9B 3WT0A 3WXLA 1P8ZA 1NGEA 3VEZA 3VEWA 1QQOA 4GNIA 3SMSA 2ZGZA 4KBOA 4JAXA 2P9IB 1BA1A 4CD3A 5AZJA 5AFUH 4CZHA 2KHOA 1NGAA 4XH4A 2YHYA 1WOQA 4FWRA 2YJFA 2CH5A 2D0PA 3D2FA 2GTDA 4PKGA 1NWKA 4NO7A 3HSCA 1TYQB 1OKJA 2ZWHA 1XUPO 2YHWA 5AZIB 2D4WA 2A3ZA 5AQYA 5JICA 3VF4A 3BUZB 5F2RA 3M1FA 3WXIA 1HJOA 4BC5A 2FSNA 1S22A 4B1XB 2AA4A 4QS9A 4H5NA 3EO3A 3BF3A 3LDQA 4BRCA 5AQJA 4BG9A 1NGHA 4QS7A 3CJBA 5BRHA 2E2PA 4BRLA 2WUSA 3DAWA 5AQHA 2GWJA 3VGKA 4BRAA 1NGBA 2FXUA 4CBXA 4IZ9A 3ATUA 4DHYA 2E88A 5AQOA 2PAVA 4BC4A 3UKUA 1DKGD 1TUUA 1HX1A 2UYTA 3ZX0A 4BC2A 4RWTA 2CGLA 3QFUA 2D1KA 3A5OC 1NGGA 4H0OA 2GELA 2QWNA 3CETA 4F9OA 3W0LA 3ZX3A 2ZF5O 3B8AX 2YI1A 2E2NA 5AR0A 4IWVA 3GG4A 3FFKB 3C7NB 4DB3A 1XQSC 2FLOA 3IDHA 3UKRA 5JLFA 2Q0UA 3VF2A 1KXPA 3CJ1A 4E1JA 4A62A 4RCHA 1Z05A 4MO4A 4H5WA 1NGDA 3FZFA 4FWQA 4PL8A 3IUCA 4CZJA 2QXLA 1GLDG 3U8XA 1YAGA 3CJAA 1JCGA 1BU6O 4ISEA 2P9SB 3FZMA 3L0QA 3WEEA 4BG8A 2OANA 3LDNA 3TPQA 4BGAA 4BGBA 2E2QA 4PKIA 4BRFA 4H0PA 5FPMA 2F9TA 1ZC6A 3CQXA 3MMVA 4I6MA 3CJ7A 3AAQA 1U2VA 3H6EA 5LJWA 5B8HA 3H45C 3L6QA 3MK6A 2ASMA 1ZBSA 4BVOA 2E2OA 1S3XA 2W40A 3UB5A 1JCFA 4BRKA 1GLLO 3SK3A 4FOEA 4CZMA 4JNEA 1JCEA 2E8AA 3O8MA 4M7XA 2W41A 1HUXA 5BRDA 3HBTA 3UKUB 3QBXA 3ULEA 5F0XA 3RSEA 3VEYA 5AQRA 3ZETB 3VGLA 4ISFA 5KPZA 5EXWA 4JHDA 1SAZA 4BR5A 3GBTA 5AQIA 5FPDA 3AARA 4DQ8A 2BTFA 2P9LA 4CBWA 5JLHA 3LM2A 3JS6A 1LOTB 1HKGA 4CI6A 1NBWA 3TU5A 4A2AA 3VEVA 5EX5A 3O5BA 2GWKA 5AQPA 3DXMA 4JD2A 4K43A 5BPNA 3CERA 3A8YA 1SQKA 2A41A 4IJNA 4WQ5A 4FWLA 5AQGA 2IVNA 1MWKA 2QWMA 1GLFO 1X9JA 3DXKB 1IG8A 3BEXA 3QB0A 3G25A 3WEEB 4FWPA 4H0YB 4B1VA 3I8BA 3F9MA 1V4TA 2NZTA 1NM1A 2E1YA 3H1VX 1HLUA 3EN9A 4BRMA 3WXKA 5EOYA 2Q2RA 5EY4A 4I6MB 1U2VB 4CD1A 2IVOA 1QZ5A 3AY9A 1D4XA 2IVPA 3KZBA 3H1QA 2AP1A 1X3MA 3ATVA 4NB4A 5FPNA 1RFQA 5AQUA 4XEIA 3HZ6A 4H5VA 3SJHA 4HWIA 3ULEB 1U6ZA 2P9PA 4WYBA 5AQZA 3ID8A 2QWOA 1SZ2A 3HM8A 5AFUA 2VCPA 4MLEA 3HI0A 2CGKA 1K8KA 3VGMA 1XC3A 5AQQA 1HPMA 4FL9A 1DGKN 4WQ5C 3FZHA 1DEJA 3CHWA 1T6DA 2P9LB 3H46O 3MDQA 3I33A 2EWSA 2VYPA 2FSJA 2DPNA 4FPAA 3QICA 4O5FA 3EL2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O4GA 4YOUA 2YKMA 4OPAA 3H3NO 3KVGA 5LJVA 2HHTA 4FK2A 2A5XA 1A5WA 1LW2A 5BREA 1EETA 3SV3A 1HPZA 1BHLA 1BQMA 1JLFA 2HVIA 2P5OA 2Q97A 3EZ5A 1VQKN 4CZIA 1RCHA 2Q1NA 3QMLA 3TABA 3RVCA 1KFDA 4BR4A 3VF6A 1IBKK 3ZT3A 1EO1A 3M8PA 4Q5VA 3LANA 4BRIA 5CHIA 3TAMA 2WONA 1R59O 4XH5A 3C65A 4KHSA 5AQFA 5FROA 4HTLA 1CLQA 2HMPA 1JLQA 4I9LA 2BDPA 4CF0A 4OJRA 3ZCMA 1IBMK 2DY4A 4K42A 2FC0A 2Q36A 3ZSXA 5E26A 4AHCA 3U6FA 4B1UB 2J4RA 4BR9A 3I0SA 2YHXA 2HF4A 3IKMA 4OKEA 3LDPA 4JI2K 3NH1A 2HHVA 3AGKA 1Q86O 3NDKA 4EZ6A 4B9QA 1VQ8N 4EAHD 4CFCA 3AAPA 3D2EB 5GIPA 2DTUA 3ALYA 4M3ZA 1QVFM 4FM0A 5E41A 3ZEUA 1HNXK 4B3SK 1VQON 1HKCA 3I0RA 4DTXA 1BCOA 5CZ2A 1J6ZA 4AF1A 5J2NA 4FYDA 3PLAA 4FLWA 1QE1A 4W5QA 3HTVA 1BISA 1RBUA 4KAZA 3CCJN 4NYFA 4Z94A 3VOVA 3MX5A 4O4GA 1QSLA 2ASOA 5GAEP 3SQ0A 5SZTA 2HMIA 3VQ7A 3OHRA 4DSJA 2A40A 2HF3A 3O3HA 4YDUC 1C1CA 4FJ8A 1ATSA 4K41A 1VQ5N 4IO9L 3U9DA 1X9WA 3VENA 1KAYA 5M1QA 2G8UA 4XH1A 5AQVA 5KGWA 3V6DA 1BL3A 3L2RA 4CK3A 3DLKA 4B1YB 1ZBLA 4A5BA 3QEXA 2KW4A 4H0TB 3EKSA 1YJWN 2Q3SA 1VQ7N 3MX2A 4BRHA 2V51B 4PL7A 4E89A 3MEGA 5C42A 3DXMB 1B9DA 4LF9K 4G1QA 3NHGA 4CHQA 3CCEN 4LF7K 4KH5A 4NXMK 4FPBA 1ZBHA 4BREA 4EP5A 3I55N 3SV4A 4O8UA 5EVZA 5LY3A 3OYDA 3O80A 4BC3A 3EY1A 4FK0A 3R1XA 4H5TA 4H0XB 1TK5A 3H3OB 3G6EN 2XRIA 4OGCA 3V9WA 1BDGA 2P9KA 2QXFA 1VSFA 4CGHA 2G8FA 1BI4A 1S1TA 5ELZA 3U9ZA 3SQ4A 4BWMA 5IWAK 3B6OA 4KTWA 4AHSA 1WSHA 3U3YA 3RRGA 3OJUA 1RGIA 1S1UA 1I39A 2YKNA 2I7NA 3MN5A 3M8RA 4KREA 3SUQA 4BVPA 3VQPA 4WQ4C 1NMDA 5KQ8A 3AVBA 5HOOA 1NK7A 4CEFA 5MLCQ 3DRPA 3L3VA 3AA5X 3DM2A 4CJ4A 4H4OA 1VQ9N 3ENOA 1TVRA 4C8OA 4CBUA 1X3NA 3BGRA 1BUPA 3AVIA 5DMRA 2D5RA 4ZHRA 3E9LA 5M1KA 3SI6A 3PSIA 1XI1A 2A6AA 4N56A 1SKRA 1N33K 1NLVA 2ZJPL 4NYNA 5AQWA 2B4JA 2VQFK 3HVRA 1QSSA 4BRDA 1RTJA 3F5TA 3QBWA 4JEPA 5ADXA 2QA4N 2P9NB 2ZGYA 4N5SA 1W7AA 2P5GA 1L3TA 2PYLA 4GY2B 4BR7A 2CGJA 3NVKA 3T1YK 4CEZA 3ZSOA 3HM9A 2NLXA 4CJVA 1NGJA 4AILC 3IMXA 4M63C 3MAQA 3BZKA 4KB1A 1JLAA 1W0HA 1P8ZA 3P38A 3VEWA 3VQ6A 4MQ3A 1W2BM 4X66K 3M8SA 2ZJQL 3SPZA 2YJFA 2D0PA 3HL8A 4O5BA 4C1NK 3SZ2A 3QIPA 1HNVA 3T1HK 3NGYA 2HHQA 3HSCA 2ZWHA 3AVNA 3T3FA 3QESA 3QEWA 3QINA 2YHWA 5AZIB 4DTPA 4OX9K 5JICA 1JKHA 4DR5K 1U49A 3TR8A 3C6UA 1YTUA 3K5OA 3ZSWA 4LF4K 1D8YA 1C0MA 2LSNA 4CJPA 3M1FA 4BC5A 2AA4A 1NOYA 3O3GA 3LDQA 4BRCA 3F2KA 4DR1K 2HB5A 4DTOA 1HYZA 2WUSA 4Z4FA 1NGBA 2FXUA 1VSLA 4A59A 3PIPL 4HUFA 1HNZK 1VAZA 1RTDA 2EX3A 4DHYA 3DLHA 2E88A 3LWLA 4BC4A 2KFNA 2UYTA 1ZBFA 3J7ZO 4LF6K 4JI1K 3QETA 3A5OC 2Z1HA 1RDUA 1F21A 4H0OA 1VSKA 2GUIA 4ID5A 4HUEA 1Q9YA 4OLAA 2PYJA 4CEDA 4DB3A 3TARA 1VQLN 3IDHA 3UKRA 2NRXA 4WFBL 1NK6A 1KXPA 1HMVA 3E01A 4A62A 4KRFA 1EWQA 1Z05A 4MO4A 4LF8K 2ZJRL 1LAWA 3K9KA 2O8EA 4CZJA 3TI0A 3PSFA 3HT3A 4DTNA 1BU6O 3RMCA 2P9SB 3WEEA 1KRPA 4Z4IA 3TPQA 3M8QA 4BGAA 2E2QA 1CXQA 1R0AA 3PX6A 5HRNA 3LALA 4OVLA 3ASMA 1ZC6A 3MMVA 3P39A 3F9KA 3CJ7A 3AAQA 2XY7A 1U2VA 1XC9A 4B9MA 5B8HA 3VTHA 1ZBSA 3DMJA 2W40A 3NMUA 1JCFA 1OVQA 4KHUA 5EU7A 2QK9A 4FVUA 4PQUA 5BRDA 5C2FA 3QEPA 3UKUB 5F0XA 3RSEA 3LZJA 3VEYA 3QO9A 5AQRA 3ZETB 1M1KO 4WFAL 2ATQA 1NU0A 1ASUA 1S5JA 4JK9A 5EXWA 2XY6A 3OYKA 5CY4A 3HPGA 5FPDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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