4NB4A

Pantothenamide-bound pantothenate kinase from staphylococcus aureus
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
267
structure length
265
Chain Sequence
MKVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIYKDTEPPIPGDLTAANFGHVLHHLDFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Type II pantothenate kinase
publication title Structural characterization of a new N-substituted pantothenamide bound to pantothenate kinases from Klebsiella pneumoniae and Staphylococcus aureus.
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus
molecule tags Transferase
total genus 91
structure length 265
sequence length 267
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-10-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4nb4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4nb4A01
1NGJA 2YCHA 2WUSA 3QBXA 1XUPO 3ULEB 3A5OC 1NWKA 2IVPA 3MN5A 4CBWA 1DEJA 1YUWA 2Q2RA 2QWLA 4IWVA 4YDUA 2ZF5O 3UKUA 2QW9A 5FPNA 1NBWA 2ASOA 4FWQA 4B1VA 4FPAA 2F9WA 3ZEUB 3VEXA 1KAZA 3TU5A 1BOTO 1BA0A 3FZLA 2FSNA 3IDHA 4BR4A 2P9UB 2YI1A 3VGKA 4CZIA 5BRHA 4CZFA 1BUPA 3CQXA 3LL3A 2ZWHA 4I6MA 4BR5A 3D2EA 3HTVA 4BR2A 2UYTA 4BVPA 4A61A 3FR0A 5KQ8A 4H0OA 1SQKA 3L6QA 3CJ9A 5AQFA 3SJHA 2V51B 3CIPA 4IZ9A 3LDNA 5ADXH 1NGGA 4QS7A 3DWLA 3WT0A 2CGJA 3O5BA 5BR9A 3A5NC 3BUZB 3MDQA 4PKIA 1BO5O 1OKJA 3R8EA 3L0QA 5AQKA 2W40A 2J4RA 2ZGZA 4H0YB 3QICA 4B1WB 1NGAA 2FXUA 1X3NA 5TKYA 3ZETB 2PAVA 5EX5A 4DCHA 1Y64A 3U8XA 4JD2B 1YVNA 5AQWA 2NRHA 3D2FB 3VF2A 3MN7A 3FZMA 4F9OA 2AP1A 4H5NA 1MDUB 4L3QA 5LJWA 2VYPA 2GUPA 5AZJA 3DXKA 4B1UB 1IJJA 3VF4A 5AQUA 4BRLA 4JHDB 2GEMA 4QS9A 2PBDA 4NB4A 1TUUA 3CETA 3CQYA 3IMXA 2ITMA 4B9QA 3AARA 3H6EA 3VEZA 4BR7A 1RFQA 1TYQB 5F2RA 4BC3A 2W41A 4JNEA 3G25A 2GELA 4GNIA 4CBXA 3ZX2A 5BN8A 3VEVA 1V4TA 3CJBA 3WXLA 3O6WA 1ZC6A 3VEYA 4H0XB 4CZLA 2P9NB 3EO3A 4J8FA 3VENA 2P9KB 3P4IA 1G99A 1SZ2A 2AA4A 4HWIA 1X3MA 3A5MC 4AM6A 2Q0UA 2YJFA 3VETA 1T6CA 4EIAA 3IFRA 4H0TB 3U4LA 4BRAA 3EN9A 5BPLA 1HKGA 2YHYA 4O5FA 2QWRA 1Q18A 3VPZA 3IUCA 4WQ5A 2CH5A 4EHUA 3O8MA 2E2OA 4BRIA 2EWSA 1D4XA 3LM9A 1S3XA 1NM1A 3AAQA 3CJCA 3O1WA 3O80A 1HKBA 3ATVA 3GE1A 3B8AX 1YAGA 4AM7A 1C0GA 4RTFD 2P9LB 3O4WA 1NGIA 3UKUB 3BF3A 2YHXA 1KAXA 1U2VA 3JXUA 5AZIA 4DB3A 2D0PA 1QQNA 2E2PA 2I7PA 4EHTA 1NGCA 4RWTA 1K8KA 3SMSA 4Z94A 4FOEA 1GLLO 5BPMA 1HPMA 4FO0A 4M63C 5ELZA 2HF4A 2E8AA 3HI0A 3VEWA 3WXJA 1ATSA 4BC5A 2E2QA 3HM8A 3A0IX 3GBTA 4BG9A 3UKRA 3VGMA 3LDQA 2I7NA 3FE1A 4BGAA 2E1YA 2QWPA 1HUXA 1H1VA 4XH1A 4I6MB 4PKGA 2QWQA 5AQQA 4M7XA 3D2EB 3QMLA 3TPQA 4B1ZA 3S41A 4DHYA 4RCHA 3I8BA 1JCFA 2E20A 3ATUA 3LDPA 3U9ZA 4PL7A 2IVNA 3VESA 5FPEA 1QZ6A 4BRFA 1QHAA 4FOIA 3C7NA 5EVZA 1JCGA 3MN6A 5BREA 3UE5A 2Q97A 2QWOA 1LOTB 2FSKA 2D4WA 5AFUH 1E4GT 1NGBA 3LDOA 4BVOA 3VF6A 5AQRA 5FPDA 1GLJO 4CZKA 3W3DA 1ZXOA 1R59O 4FPBA 2OANA 2VWBA 5KQDA 1YXQA 5F1XA 2GTDA 4B1XB 4GY2B 3WEEA 5BPNA 2D1KA 3F9MA 3H1VX 3VERA 3CJ7A 4CZMA 3QBWA 3J8AA 5AZJB 5JICA 3DXKB 2BTFA 5EOYA 3DXMB 1BWFO 5B8HA 4WYBA 3D7EO 3OHRA 1KXPA 1J6ZA 2E88A 3KVGA 1KAYA 3R9PA 4MLHA 5E26A 4ISEA 4H5TA 4FWSA 3HZ6A 3GL1A 4BG8A 2HOEA 2CH6A 3M1FA 2FSJA 1CZAN 4WQ4C 1MA9B 3DJCA 4K42A 1WUAA 2P9SA 3M3ZA 3RSEA 3HSCA 5AQMA 5KPRA 2Q0RA 2FLOA 2Q31A 3BP8A 2P9IA 3AY9A 4CZEA 3ENHA 5JMVA 3HBTA 5FPMA 3U9DA 4CZHA 1C0FA 2H3GX 2YHWA 3GG4A 4H5WA 1BDGA 3EL2A 1RDWX 2A3ZA 2NZTA 1T6DA 3ZX0A 4BR9A 4BRHA 2HMPA 5BRDA 3MK6A 5JLHA 1BG3A 2A42A 4YDUC 1MWMA 4IJAA 2GWKA 2A41A 4BGBA 3H3OB 4BRCA 5AQNA 1U2VB 4FWNA 5AZIB 4A2AA 3WQUA 3CJAA 4BRDA 1K8KB 4QS8A 3H45C 4CJ7A 5CE3A 2BUPA 5JLFA 2F9TA 3M6GA 2A6AA 1QQOA 2FF3B 4CD1A 4FWLA 4BRKA 1S22A 4FWMA 4BRQA 3QFPA 3UKRB 2P9PA 1U6ZA 3DAWA 2ASPA 5F0XA 5ADXA 2V52B 4CD3A 4ISFA 3LM2A 3VEOA 4CI6A 3CERA 5EY4A 3KHYA 2VCPA 2V7YA 3MMVA 1T44A 4K43A 3FZFA 3W0LA 2A40A 5AQLA 4BC2A 5LY3A 4BRMA 3AAPA 3WUHA 1E4FT 3QFUA 3SK3A 3C7NB 1HLUA 3VOVA 1NGFA 4XH5A 4HTLA 4K25A 4XEIA 4C23A 2FF6A 3SLCA 2E2NA 4BR0A 4BREA 3A5LC 2P9LA 5AQSA 4K41A 3C0BA 4CBUA 4IO8A 4IXCA 5AQGA 1GLDG 5BN9A 4BRNA 1GLBG 4PKHA 4A2BA 5KPZA 1DKGD 4MO5A 3ULEA 1SAZA 5AQTA 4IJNA 4PL8A 1ESVA 3BEXA 4MLEA 3CJ1A 5AQZA 3WEEB 1GLCG 3MCPA 3A8YA 3ENOA 4MO4A 3WQTA 3UB5A 3ZEUA 4FWKA 5AQJA 3ID8A 4BRPA 4H5RA 4B1YB 2QXLA 4H5VA 3JS6A 1JCEA 4M7YA 3R6MA 1XQSC 2P9UA 4EFHA 2CGLA 1BA1A 3I33A 1HKCA 3O1BA 5AQVA 4BRGA 2P9SB 3RSEB 3ZX3A 4DQ8A 4Y0WA 4CZJA 2ZGYA 4FWOA 2P9IB 5AQIA 2Q36A 4BQLA 1Z05A 2QWMA 4FSVA 3BF1A 5AQXA 3FGUA 1MWKA 4WQ5C 2DPNA 1GLFO 2GWJA 2YJEA 4KBOA 1ZBSA 1IG8A 3L4IA 4JAXA 5AQOA 3SMPA 4XH4A 4ISGA 2NLXA 5KPTA 4EAHD 4LC9B 4H0PA 4CZGA 2KHOA 2QM1A 1TUYA 3EKUA 4H03B 3ZETA 1GLAG 3DXMA 4JD2A 4JN4A 1WOQA 4A62A 1V4SA 3D2FA 2ASMA 3KZBA 3FLCO 5AQPA 3FFKB 5AR0A 5AQHA 3MN9A 4BQZA 3H3NO 3LDLA 3GDQA 4NO7A 3CHWA 4BC4A 3WXIA 1P8ZA 1ATRA 4JHDA 1NGDA 4E1JA 1NLVA 3QDKA 4H0VB 1QZ5A 1RGIA 2IIRA 5AQYA 1NGHA 1LCUA 3O08A 4BROA 2A5XA 1TYQA 3QB0A 3GOIA 2P9PB 1XC3A 5BRFA 5LJVA 2E1ZA 4O8KA 2CGKA 2P9NA 1X9JA 3FZHA 4WQ4A 3H46O 3CI5A 2P9KA 2Q1NA 5I9EB 2D0OA 2IVOA 3VGLA 2QWNA 3EKSA 2V7ZA 5AFUA 1QQMA 4FWRA 1HX1A 5E84A 1NGEA 3EZWA 1NMDA 1ATNA 1BU6O 1Z6RA 4FWPA 1DGKN 1GLEG 3FZKA 1EQYA 4FL9A 3WXKA 2HF3A 5EXWA 1HJOA 3H1QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PIPL 3OS2A 1KTQA 4E3SA 1NGJA 2YCHA 5A2QO 1D9DA 3QBXA 3WXMB 1XUPO 4DQIA 1SUQA 3UKUA 1LAVA 4JS4A 4DUYK 3C6HA 4ELUA 3ZEUB 1IH7A 1KAZA 3CM6A 2F8SA 3FZLA 5TKWA 1UA0A 2FSNA 2GX9A 4CZIA 2WOMA 4JKBA 3ZT3A 4F4KA 3C6TA 2QKBA 4NXNK 3K59A 1KQSM 3HL8A 3AGRA 1WSIA 1KRPA 1FW6A 4BVPA 2F96A 2YKNA 4B9TA 1U04A 4KHUA 1ZYQA 4H0OA 3L6QA 3VTHA 4DV2K 3V9UA 1TKDA 4JI1K 4Q5VA 3CIPA 3I55N 4Y1CA 4QS7A 3ULDA 3DWLA 1QVFM 2CGJA 3OYEA 3CMAN 2QA4N 4DFPA 1OKJA 3PIOL 3V9SA 1VQ7N 5AQKA 5GAGP 4FZYA 3CG7A 4GV9A 2J4RA 1CZ9A 2IC3A 4DSJA 1NGAA 1VSMA 4LF4K 4B3SK 3ZETB 3KLGA 4JI7K 1Y64A 4JD2B 4OGEA 2NRHA 2EHGA 2UU9K 5GADP 1HNWK 4FJJA 4F9OA 3CD6N 2AP1A 1J53A 4L3QA 3AGKA 3KK1A 4LFCK 1IJJA 4BRLA 4JHDB 4QS9A 2QTDA 3IMXA 3SBGA 4KH5A 5IWAK 3AARA 3H6EA 3VEZA 1M90O 5F2RA 4BC3A 2W41A 3ZT0A 1VSIA 4JNEA 1VAZA 3G25A 5J1EA 2HB5A 3ENBA 5BN8A 3BY5A 2Q3SA 4EP5A 3G6EN 3O6WA 4H0XB 3EO3A 1BIUA 3VENA 4HUEA 2E4LA 5KTQA 4HWIA 2O8CB 4G9ZA 1T6CA 2YHAA 4CFDA 3IAYA 2OPQA 4H0TB 3U4LA 4AF1A 5BPLA 4IG3A 2YHYA 1T3VA 3ZSOA 4DSLA 1W9HA 5M1QA 1C0MA 3IUCA 1XNRK 4WQ5A 2GUIA 3KLIA 1LV5A 3DM2A 3LM9A 3KK3A 1KSPA 1NM1A 4A5BA 1IO2A 3CJCA 2FBTA 4KAZA 4DF8A 4CJFA 4CJTA 3VQAA 2BE2A 3QIOA 1VQNN 4CCHA 2KZZA 2RF2A 3UKUB 3TWHA 1QQNA 4CIGA 4DSKA 4PQUA 3CCVN 4DSIA 1SL0A 3VQQA 3MXMA 4Z94A 4JI0K 4LFAK 4FM0A 5BPMA 3SUQA 2HF4A 3VEWA 1ATSA 4NXMK 3CPWM 3HM8A 4DR5K 3NVMA 2OA8A 3GBTA 1J9AA 2G8UA 3UKRA 3LDQA 1E3MA 2E1YA 3KWIA 4OPJA 1YITN 5DM6L 5C10A 5GINA 4JKDA 1VSFA 3LP1A 3SPYA 4JKEA 3HPGA 4H8KA 3I8BA 2IVNA 3VESA 4DLEA 2YNHA 1ZBIA 1QZ6A 1S1WA 4FOIA 1FKOA 4OPHA 4WE1A 3S3MA 5EU7A 4RG8A 2Q97A 4F2SA 2QWOA 2FSKA 4CJPA 4FZXC 4NYNA 4OKEA 1GLJO 4CZKA 3OYHA 2HHWA 2O8EA 1SS6A 2FBVA 5KQDA 4B1XB 2Y1IA 1RT5A 4JK7A 3OYBA 4LSLA 2HHTA 3H1VX 3SYZA 4CZMA 3QBWA 4DV1K 3AO3A 4AHUA 2G8IA 5M1NA 4UQGA 4YOVA 1Q82O 3DXMB 1YHQN 3PUFA 5B8HA 3DLKA 4ELVA 3R9PA 3I0RA 4H5TA 2JWKA 4BG8A 2HOEA 3KLHA 2ZJPL 1MA9B 2DFFA 4M3YA 1HNVA 4E89A 4NCAA 3NBPA 4YHHK 5FLXO 4CZEA 3ENHA 5JMVA 3NVKA 3U9DA 1REVA 5AJ3K 1C1CA 2JLEA 1HRHA 3AVLA 4BY9C 1X9SA 1KVBA 1RBVA 3HJFA 1RTHA 5GAEP 4B9UA 4BRHA 3SV3A 3MK6A 4E19A 2HBLA 3AVKA 3LAKA 3V1QA 3O9SA 4CF2A 2YX6A 2BDPA 4YDUC 4IJAA 2A41A 4J2DA 4CGFA 2YNIA 3TAMA 4JYAK 1NG9A 4BRCA 3VN5A 5AQNA 1RDBA 3V1RA 4QS8A 3NF6A 3SJJA 4GKKK 3M6GA 4CGGA 2NRZA 2P1JA 1QQOA 3WNHA 4KRFA 1S22A 3MWTA 3UKRB 2P9PA 2NRWA 1U6ZA 3DAWA 3SQ1A 4W5OA 3HPHA 3S9HA 5JS2A 3QERA 1L5UA 3NFAA 1NJWA 3CCRN 3PV8A 4M3XA 4DV5K 5KGXA 1LW2A 1WSJA 4KH4A 4FCYA 4CIFA 4CI6A 2BH1A 1B9FA 3CERA 4OJRA 5EY4A 3VA0A 1C1BA 4DV6K 4DTXA 3AA5X 1Q86O 3MMVA 2OPPA 3W0LA 1JLGA 4CF9A 4BC2A 1RDCA 4BRMA 4KI4A 2HHVA 4A57A 1E4FT 3QFUA 4K25A 1HJRA 5C12A 3UIQA 2E2NA 3SAHA 4IEEA 1A5VA 2P9LA 4K41A 4MDAA 4CBUA 4IO8A 1KD1O 4OGCA 3J7ZO 3OYDA 2O8EB 5KPZA 1RCHA 5AQTA 1Q81O 4CEAA 4BE1A 1VQMN 4H4MA 4DKWA 3A8YA 1S6QA 3P38A 4CJ5A 1I3AA 4MO4A 2VG7A 4KB1A 2B5JA 3WQTA 3TTCA 3T69A 2IDOA 3ZYYX 4H5RA 3K5NA 3HM9A 4FK4A 3JS6A 2VQEK 3R6MA 4H4OA 4YOXA 3J7YP 1QSYA 2E5LK 4CFAA 2Z1HA 2CGLA 4Z4GA 2X6NA 1BA1A 1HKCA 3DYAA 4JI6K 3JAMO 4N5SA 2OTJN 3O1BA 5AQVA 3CC7N 3ZX3A 3E9OA 4Y0WA 4CZJA 2ATQA 3AVIA 4B3TK 1YVUA 3AVAA 4JEPA 2HHHK 2Q36A 1JLCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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