4NB4A

Pantothenamide-bound pantothenate kinase from staphylococcus aureus
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
267
structure length
265
Chain Sequence
MKVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIYKDTEPPIPGDLTAANFGHVLHHLDFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Type II pantothenate kinase
publication title Structural characterization of a new N-substituted pantothenamide bound to pantothenate kinases from Klebsiella pneumoniae and Staphylococcus aureus.
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus
total genus 91
structure length 265
sequence length 267
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-10-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4nb4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4nb4A01
2GWKA 3L4IA 2A42A 4BC4A 4RWTA 5F0XA 3GBTA 4O5FA 5EVZA 4BC3A 4CZMA 5I9EB 4BR0A 4MLEA 3VF4A 4E1JA 3SJHA 1HUXA 3D7EO 5AZIA 1KAYA 2V52B 3EKUA 2NZTA 3L0QA 4IJNA 4H5NA 3JXUA 4RCHA 4BGAA 4B9QA 2V51B 4BRNA 3ATUA 1SZ2A 5AQNA 5AQTA 2Q2RA 3QICA 5AQXA 4FOEA 1ZXOA 4FWNA 4XH5A 3WXIA 1H1VA 4DCHA 4BRMA 3P4IA 5AQPA 2FF3B 3LDQA 2CGLA 4MO5A 4RTFD 4F9OA 1LOTB 3FZKA 2D0PA 3BUZB 1XQSC 3SK3A 1SQKA 3AAQA 3GDQA 3A5MC 3QMLA 2YHWA 3FGUA 2YJEA 1K8KB 4M63C 1KAXA 1JCGA 1QQNA 4EHUA 4CJ7A 1T44A 2Q36A 1NGAA 4H5TA 1SAZA 4O8KA 3MN9A 3O08A 5FPEA 1E4GT 4YDUA 4QS7A 4H5VA 3R6MA 3QBWA 3MCPA 2BTFA 1WOQA 3JS6A 3TPQA 3A8YA 2I7NA 2VYPA 2HF4A 1R59O 4FO0A 4WQ4C 4FWSA 2AP1A 4H0VB 1YXQA 5AZJB 4DQ8A 3CQXA 2ZGZA 4BRLA 2YCHA 5ADXA 3KHYA 3HI0A 3ENOA 1K8KA 3O80A 2P9KB 3H6EA 5AQLA 2E88A 4FPBA 3ENHA 1NMDA 2QXLA 1TYQB 3VEWA 1U6ZA 3VETA 1DGKN 1BA1A 5AQJA 1U2VB 2IVOA 3I33A 3QFPA 4FWOA 1DEJA 4K42A 4NO7A 4M7XA 1GLBG 1HKCA 4H03B 5AQSA 1NM1A 2IVPA 4BRQA 4H0TB 2J4RA 3VGKA 3HTVA 3O1BA 3D2EB 1LCUA 3C0BA 5AZJA 4BVOA 3VERA 1X9JA 5AQOA 4ISEA 3HM8A 3KZBA 1JCFA 4BRIA 1GLEG 3MN6A 1T6DA 3WQUA 2GUPA 3DWLA 1DKGD 2P9KA 3LL3A 5BPLA 1G99A 1IG8A 3WT0A 3O5BA 4H0OA 1TYQA 1YVNA 2FF6A 3CI5A 4AM6A 1NGJA 1C0GA 4FWKA 4GY2B 4IJAA 4WQ4A 1U2VA 3FFKB 5LJVA 2V7YA 3QBXA 4H0YB 2EWSA 3UKRB 2A5XA 4J8FA 2HMPA 3A5NC 4BROA 1ATSA 2ZF5O 4ISFA 4BR7A 3R8EA 4H0XB 3G25A 4WYBA 1Q18A 4CZLA 3IFRA 2CH6A 3OHRA 4K25A 3ULEB 1Y64A 1YAGA 3CJAA 5ADXH 3FE1A 1NGBA 3D2EA 3MN5A 5AQVA 4IZ9A 2ZGYA 3WQTA 4BC5A 1X3MA 1YUWA 3A5LC 3MDQA 1QZ6A 3ZX0A 4CD1A 3CERA 1NGGA 1P8ZA 1GLLO 3FR0A 1QZ5A 4BRPA 4FSVA 5AQZA 5FPNA 3H45C 5KPRA 4HWIA 4CZIA 4CZHA 1JCEA 1ATNA 4BG8A 1BO5O 4FWQA 3L6QA 2ASPA 4XH4A 3ULEA 3I8BA 4IO8A 5BN9A 4EAHD 3FLCO 3RSEB 1X3NA 5BN8A 2FXUA 4B1WB 4FWRA 1KAZA 3HBTA 4JAXA 1HPMA 3CHWA 2Q0UA 4BRKA 5BRFA 4GNIA 4H5RA 1V4SA 3DXKB 5AQIA 3ZEUB 1QQOA 4EFHA 1V4TA 1HJOA 3CJ1A 3AY9A 4CI6A 3QDKA 2D4WA 3O6WA 1HLUA 4JD2B 4XEIA 1NLVA 2P9LB 2VWBA 4B1UB 4DB3A 4K43A 2AA4A 2GWJA 3A0IX 5FPDA 2YJFA 1E4FT 2HF3A 1NBWA 3CJBA 3AARA 3ZETB 5LY3A 2YHYA 5AFUA 2ASMA 3EKSA 2NLXA 3RSEA 3IUCA 3U4LA 1MWMA 1D4XA 4CZJA 4BR5A 4FWPA 3VEYA 4BRGA 3GL1A 5E26A 4B1ZA 1NGHA 2QWQA 4B1XB 4BQZA 3R9PA 2E1YA 2E2QA 3DXKA 1BDGA 3ZEUA 4A2BA 2D0OA 5FPMA 5ELZA 1TUUA 4BVPA 3EN9A 3ATVA 1NWKA 5AQKA 4JD2A 2IIRA 2P9LA 4BREA 1HX1A 4PKGA 3VEXA 2HOEA 2GELA 2WUSA 2E8AA 3WXKA 2QWRA 3BF1A 5JMVA 3ZETA 2YI1A 5AQYA 4I6MB 1RDWX 3CQYA 3M6GA 3FZFA 3WXLA 3J8AA 4EHTA 2CGKA 4QS9A 2VCPA 4FWMA 4ISGA 4CBWA 2FLOA 1Z6RA 3QB0A 4BRDA 3DXMB 3W0LA 3VGMA 1ZBSA 3QFUA 3IMXA 4BQLA 1ESVA 4C23A 2QM1A 5KQ8A 3LDOA 4WQ5C 1MDUB 1ZC6A 3VF6A 4DHYA 2DPNA 1GLJO 5KPZA 1QQMA 2D1KA 3HSCA 5JICA 2QWNA 3MK6A 5AR0A 1ATRA 4QS8A 4L3QA 4BRFA 2E1ZA 4FL9A 1C0FA 2E20A 5LJWA 3EZWA 5JLFA 4JN4A 4BR9A 4I6MA 2P9NB 2KHOA 2Q31A 5TKYA 3FZMA 3GG4A 3O8MA 2F9WA 1XC3A 4EIAA 2GTDA 3VGLA 2A41A 2FSNA 1BG3A 4FPAA 4PL8A 4K41A 2OANA 3DXMA 3KVGA 2FSKA 4H0PA 3TU5A 1GLFO 3VEZA 2FSJA 2QWMA 5BPMA 4PL7A 2PBDA 3UKRA 5AQWA 3MN7A 4PKIA 3LDLA 5JLHA 3H1VX 1GLAG 5AQQA 3W3DA 3LM2A 3U8XA 1CZAN 2CH5A 3UKUB 1HKBA 3BF3A 4IWVA 4LC9B 1HKGA 3IDHA 4CD3A 4MO4A 3M3ZA 2IVNA 2P9NA 4PKHA 4WQ5A 4AM7A 4CZFA 5AQFA 3EO3A 1Z05A 3UE5A 2QWLA 5BREA 1T6CA 4MLHA 2W41A 2BUPA 1BUPA 3FZHA 1GLCG 4Y0WA 3DJCA 5B8HA 3A5OC 5F1XA 4B1VA 3WUHA 4BGBA 5EX5A 4A62A 1NGDA 4FWLA 3VPZA 3EL2A 3F9MA 5EY4A 2A6AA 3UB5A 3VENA 2ZWHA 2P9SB 3H1QA 3U9ZA 4BRHA 2UYTA 3UKUA 2P9IB 3H3OB 2W40A 2ASOA 3ID8A 4JHDB 4CBXA 4IXCA 5AQGA 2Q97A 1XUPO 5AQRA 2Q1NA 3GOIA 2V7ZA 4M7YA 5KPTA 5BRHA 1WUAA 3D2FB 2H3GX 2QW9A 4Z94A 4BR4A 4BR2A 5BPNA 2A40A 3SLCA 1EQYA 2QWPA 5AQUA 4H5WA 5KQDA 2P9PB 1NGIA 2E2PA 3LDPA 4HTLA 3ZX3A 3VEOA 3SMPA 2I7PA 3SMSA 3MMVA 2Q0RA 4XH1A 2CGJA 4A61A 3BEXA 2ITMA 4A2AA 5EOYA 4CZEA 1NGEA 3AAPA 3H46O 3HZ6A 3VF2A 1MWKA 3C7NB 3CJ9A 2P9SA 3WEEB 3VOVA 5EXWA 4B1YB 2GEMA 3ZX2A 1QHAA 1NGFA 2P9IA 4CBUA 1MA9B 4JHDA 2P9UB 1IJJA 5F2RA 4FOIA 3D2FA 2PAVA 3CJ7A 3FZLA 3DAWA 5AQHA 3WXJA 3CJCA 4JNEA 4BRCA 1BU6O 2P9PA 3LM9A 4BC2A 5CE3A 4NB4A 4BRAA 5AFUH 5AZIB 1J6ZA 4CZKA 4CZGA 2F9TA 1NGCA 1OKJA 3U9DA 1BA0A 2YHXA 4BG9A 3C7NA 3CIPA 3LDNA 3O1WA 5E84A 3WEEA 1RGIA 1S3XA 1TUYA 3GE1A 3O4WA 3B8AX 2E2OA 2E2NA 1KXPA 1GLDG 3BP8A 3VEVA 5BR9A 2P9UA 1BWFO 5AQMA 3H3NO 4KBOA 2QWOA 3VESA 1RFQA 5BRDA 3M1FA 1BOTO 4YDUC 1S22A 2NRHA 3CETA 3S41A 2A3ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O3HA 3L4IA 3L3VA 2A42A 3SYZA 4BC3A 2LSNA 3C94A 4B3OA 4E1JA 1FW6A 3AA3A 3QLHA 1RT3A 1KAYA 2V52B 4OPKA 3QEXA 2VG6A 4FJHA 2I5JA 3CFOA 3LPTA 3VQ7A 1ILYA 3QICA 4BDYA 2XHBA 1FKPA 1TKXA 3MX2A 3PX6A 1H1VA 5FROA 4DCHA 5HRPA 5JVHL 5AQPA 3LDQA 2CGLA 3P1GA 2EX3A 2KLAA 2Z1IA 4F9OA 1LOTB 4DQSA 3SV3A 2ZE2A 5M1KA 3AAQA 1U04A 2O8DB 2P5OA 1K8KB 2HW3A 3WNGA 4DV3K 1ZBUA 4KTWA 4EHUA 4IO9L 1YITN 4H5TA 3CFRA 4O8KA 3O08A 1J5OA 4YDUA 1ASUA 4JS4A 2OZSA 1WOQA 2WONA 4FO0A 1CXQA 1C0TA 4WQ4C 1HNZK 2AP1A 4JEPA 5M1QA 1VQ4N 3LZJA 4CIEA 2YCHA 2O8DA 5ADXA 3KHYA 4CERA 2ZM6K 1NKBA 1K8KA 5CZ2A 2P9KB 4KHNA 4FPBA 3ENHA 2QXLA 4IFEA 3VEWA 4EZ9A 2D0CA 4O0JA 4CJEA 1RBUA 1QQCA 3P39A 3QFPA 4FWOA 3ZSYA 4M7XA 2HHVA 1WSJA 1GLBG 4BE2A 1HKCA 1QE1A 1DTQA 4CEAA 3SBGA 4H03B 3J7AP 1NM1A 3VGKA 4Y1DA 3HTVA 3O1BA 3CCEN 4DQQA 4OLAA 3BGRA 4X65K 4ISEA 1LV5A 4F4KA 3MCAB 3MN6A 3WQUA 2IC3A 1K6YA 1DKGD 2P9KA 3LL3A 5BPLA 1G99A 3WT0A 4LH4A 3NMUA 3ZT4A 1NGJA 1C0GA 3OYMA 3K5LA 3SUPA 3LWMA 1VQPN 1D5AA 3QBXA 1L5UA 2EWSA 4KHWA 1L3UA 1XC9A 4C8LA 4CF1A 4JRQA 3S3MA 1VQNN 1VSKA 3AVJA 3SBTA 1LWFA 1HNIA 4CHOA 3DYAA 3SNNA 1RBSA 3SZ2A 4J2BA 4ELUA 3T1YK 1U4BA 4DR1K 1NK5A 1VSHA 3ZT2A 2NRTA 3DLGA 1NNEA 3DRPA 4DTMA 4X66K 1S1WA 3ULDA 4BRPA 2JGUA 1NJWA 1LAVA 1JLAA 4FSVA 3TABA 5AQZA 2Y1IA 4FJ7A 1S5JA 4CZIA 2OPRA 3NVMA 4BG8A 1BO5O 4DMNA 1BQMA 4DR2K 4FJJA 3QIOA 1JLGA 5BN9A 3FLCO 3RSEB 1X3NA 5BN8A 2FXUA 4A5AA 4FWRA 4X64K 1RDCA 1SKWA 2YHAA 3CHWA 3ID6A 4GNIA 2ZJRL 2IGIA 3AVGA 4I2PA 1V4SA 4EFHA 2GWJA 1KCFA 2PYJA 1YVUA 2YNHA 1K8AO 3CJBA 4KHPK 4DV5K 4OPAA 1NOYA 1KRPA 4KB1A 3O9TA 2OA8A 4NCBA 2ASMA 1TL3A 1SL0A 2NLXA 1RNHA 3RSEA 2KW4A 1D4XA 4H8KA 4YNQA 3NBPA 1RT2A 3J7YP 1T03A 1TAQA 3GL1A 4OJRA 2G8WA 4B1ZA 2QWQA 2NUBA 1NJYA 4JI8K 3U3GA 2D0OA 5C2FA 1NWKA 2IIRA 4OGCA 2UXCK 1J54A 3VEXA 3SPYA 2HOEA 3K5NA 1Q9XA 4OKEA 2IS3A 3M8PA 4CJ4A 3BF1A 3KD5E 4N47A 5JS1A 1DT9A 1N36K 2F8TA 3C6HA 4F3TA 2ZQBA 3SQ1A 4JK9A 2CGKA 1KQSM 2HVIA 4CBWA 2HHHK 5SWMA 1F21A 3QB0A 5CY4A 3V1RA 4BRDA 2G8HA 3VGMA 1ZBSA 1EXQA 1VQ8N 4R5PA 4JI4K 1Q82O 3VF6A 4DHYA 1ZC6A 3NGYA 3CCMN 4TSXA 1SKSA 2DPNA 1GLJO 2IAJA 4HUGA 3PSIA 4FM2A 4CHQA 4CF2A 3NDKA 1NJZA 1ATRA 2Z1GA 4L3QA 4QS8A 4FL9A 4CEDA 4C8KA 1Z25A 1C0FA 3P83D 4DF4A 4FJGA 5JLFA 4JN4A 4A5BA 3M8QA 4BR9A 4ZHRA 2P9NB 4O4GA 1RTJA 3GG4A 1VQON 1N5YA 1KVAA 1C1CA 2E6LA 4CFAA 3QNNA 2A41A 1BG3A 4FPAA 4PL8A 2F96A 4JKBA 1L3SA 4HCCA 4CEEA 3KTQA 3KVGA 3CC7N 2FSJA 3CPEA 4E7LA 3I56N 5HRRA 3PV8A 5AQWA 3G71N 5C2DA 4FZXC 5AQQA 3T69A 4IWVA 4GKKK 4CD3A 2P9NA 4AM7A 3PUFA 5AQFA 3EO3A 1HYZA 4FLWA 3SI6A 2BUPA 3QIPA 4LF9K 1BIZA 2YV0X 1GLCG 3WUHA 4BGBA 4A62A 2BH1A 3F9MA 1RT5A 4KHQA 1RTIA 2ZWHA 3WNEA 3DOLA 3CYMA 1K73O 5KRTA 4DTSA 4B8AB 4JHDB 3DRRA 1XUPO 3ZSOA 2KZMA 2H3GX 3VN5A 4BR4A 4CGDA 3OY9A 2RE2A 5GAHP 4FK0A 4DU1A 2P9PB 4NLBA 3ZX3A 1NK8A 2JWLA 4EP5A 2Q0RA 3BEXA 4YHHK 5KTQA 3HZ6A 5BR8K 3WEEB 3VOVA 2YKNA 4X62K 1EO1A 4JHDA 4CGGA 3CCVN 3SUNA 1HYSA 1IJJA 1VHXA 4H4OA 4E7HA 4DSKA 4CJPA 5C25A 2D0AA 3ZSVA 1B9DA 1RDUA 4C8NA 3DAWA 5AQHA 2P9PA 3AVNA 1HRHA 5HLFA 4QCLA 4KAZA 3RRGA 4NB4A 4CE9A 5AFUH 5AZIB 3TAGA 4FM0A 4CZGA 3VQQA 3TSQA 1OKJA 1T3VA 2G8KA 4KH5A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1EWR A;  3VGL A;  2FSN A;  4KHS A;  3TAQ A;  4A59 A;  2OAN A;  1OVY A;  3KJV A;  3TU5 A;  2FSK A;  3CCR N;  3CM6 A;  3AV9 A;  4CJU A;  2PBD A;  4FW1 A;  3UKR A;  3TI0 A;  3I0S A;  3LP3 A;  3ZLJ A;  1JLQ A;  4FLZ A;  3TR8 A;  3H1V X;  1GLA G;  4JKE A;  3L2U A;  1Q81 O;  2CH5 A;  3K9K A;  4O5B A;  3UKU B;  4FJ8 A;  3BF3 A;  1HKG A;  4PKH A;  4B3R K;  3BZC A;  3CXC M;  2QWL A;  5CR4 A;  3ZT0 A;  3ZSR A;  4OVL A;  4CJ3 A;  2GX9 A;  3M8R A;  3CFP A;  3MXI A;  4GV9 A;  3VQ8 A;  2W41 A;  1BUP A;  3RMB A;  3FZH A;  2HNY A;  1YHQ N;  1RBV A;  1HQU A;  2BAN A;  2BGG A;  1D8Y A;  4F2S A;  2VQE K;  1NGD A;  5J2Q A;  3EL2 A;  2QKK A;  4E1N A;  3VEN A;  2NNW A;  1BCO A;  4RW6 A;  2P9S B;  1S6P A;  2UYT A;  3UKU A;  1X9W A;  3F9K A;  4YY3 K;  4CBX A;  2Q97 A;  2HMI A;  2Q1N A;  3P31 A;  3RR8 A;  3OYD A;  2V7Z A;  1WUA A;  4YOV A;  4O44 A;  4JKF A;  3IKM A;  3SLC A;  3NFA A;  5AQU A;  3QEV A;  2E2P A;  3C6U A;  3LDP A;  3SMP A;  3SMS A;  4DR4 K;  4N5S A;  4FJL A;  1OH5 A;  3Q7B A;  4XH1 A;  5JS2 A;  2QI2 A;  3T1A A;  5EOY A;  3I8D A;  3OW2 M;  2HHT A;  2PYL A;  4CZE A;  4FJI A;  3AAP A;  3LAL A;  1G15 A;  4Z4C A;  3C7N B;  5C42 A;  3CJ9 A;  2P9S A;  3MAQ A;  4LFB K;  4B1Y B;  4IEI A;  3VQD A;  2XY5 A;  1NGF A;  2B4J A;  1QVF M;  2KFZ A;  1MA9 B;  2QA4 N;  3LDS A;  3RWU A;  1FK9 A;  3ZSQ A;  1YIJ N;  3OYB A;  4FOI A;  1VRU A;  1SV5 A;  4M3Z A;  4E1M A;  1VSF A;  4DG1 A;  1X9S A;  4CCH A;  3EE9 A;  3RMA A;  2E5L K;  3E66 A;  4CIG A;  1BU6 O;  4FLV A;  3LM9 A;  4FW2 A;  5CE3 A;  2BDP A;  4AH9 A;  4NCG A;  1J5E K;  1XI1 A;  4CZK A;  3I55 N;  4W5Q A;  4LF4 K;  3KIO A;  4KHY A;  1JLC A;  1LW0 A;  4DTN A;  3NGZ A;  1BA0 A;  3BY5 A;  3C7N A;  3LDN A;  2DFH A;  3E1Y A;  1S3X A;  4JK8 A;  3MXM A;  3O4W A;  2E2N A;  3F5T A;  1KXP A;  1GLD G;  3BP8 A;  3VEV A;  1BWF O;  4KBO A;  3ZCM A;  3VES A;  3SAH A;  3IRX A;  2QEX N;  4CGI A;  1BOT O;  1S22 A;  4RW4 A;  2A3Z A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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