2CH6A

Crystal structure of human n-acetylglucosamine kinase in complex with adp and glucose
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
343
structure length
343
Chain Sequence
AAIYGGVEGGGTRSEVLLVSEDGKILAEADGLSTNHWLIGTDKCVERINEMVNRAKRKAGVDPLVPLRSLGLSLSGGDQEDAGRILIEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDGGVVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFHYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHIVAVLPEIDPVLFQGKIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFLLALTQGREIQAQNFFSSFTLMKLRHSSALGGASLGARHIGHLLPMDYSANAIAFYSYTFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE KINASE
publication title Structures of Human N-Acetylglucosamine Kinase in Two Complexes with N-Acetylglucosamine and with Adp/Glucose: Insights Into Substrate Specificity and Regulation.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 98
structure length 343
sequence length 343
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.59: N-acetylglucosamine kinase.
pdb deposition date 2006-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ch6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ch6A02
4C23A 2P9NB 4BRMA 3RSEB 1G99A 4B1ZA 4BRKA 3C0BA 4CZLA 5FPMA 1U2VB 3AAPA 2ZWHA 5F0XA 3BEXA 4CI6A 5AQYA 5EOYA 4HWIA 4I6MB 3ENOA 3WUHA 3MN5A 3DWLA 5AQUA 3C7NA 3GBTA 2QW9A 2E88A 2OANA 3CQXA 3VETA 3QBWA 3VF6A 2GWJA 3VENA 4BR7A 4E1JA 3SMSA 1Q18A 1OKJA 3GDQA 3O4WA 3DXKA 4CD3A 4QS9A 3LL3A 3QB0A 4FL9A 1V4TA 3IMXA 2D0PA 1WUAA 3U8XA 1R59O 4PKIA 1Y64A 2FF6A 3CI5A 4MO4A 2KHOA 3P4IA 1NMDA 1Z6RA 2FSNA 1KAYA 1WOQA 4JAXA 2F9TA 2P9SA 1ZBSA 2QXLA 2PBDA 2E2QA 3H1VX 3FR0A 3VESA 3SLCA 4FWQA 1X9JA 3JXUA 4L3QA 1QZ5A 4FWSA 1ESVA 2ASMA 5AQMA 3U9DA 5FPNA 4YDUA 4FWKA 2ZGYA 1HLUA 1GLLO 4CZMA 5ADXH 4B9QA 5AZJB 2CH6A 2IIRA 3LDQA 4WYBA 3ZEUA 4EFHA 3HSCA 5KQ8A 1LOTB 2NRHA 4H0PA 3WEEA 3WXKA 4EAHD 1MWMA 5AQNA 4FWLA 2A40A 2ZGZA 4BC4A 3EL2A 4JN4A 1U6ZA 5AQVA 3BUZB 4NB4A 3EZWA 1IJJA 4NO7A 4BVOA 4MLHA 3UKUB 2GTDA 3WXJA 1E4FT 3CERA 5AQPA 2E20A 3IFRA 2I7PA 3DAWA 4WQ5A 3VF4A 4QS8A 4CZGA 3H3OB 1X3NA 3MK6A 2P9UA 5AR0A 2HF4A 3QDKA 3A5OC 4EHUA 2W41A 5AQSA 1X3MA 2HMPA 4BRDA 2FLOA 1GLCG 4DB3A 2GELA 3LDPA 4B1XB 4CJ7A 1SAZA 4BRCA 4BR2A 3KVGA 3R6MA 3HZ6A 2P9NA 3FZHA 3ZETB 4K42A 2QWPA 3RSEA 1TYQA 3D2EB 3MN7A 2BTFA 4BR0A 1YXQA 1BA0A 4CZIA 1CZAN 1RGIA 3CETA 3H3NO 2YJFA 5BPMA 1NGHA 5E84A 1C0GA 4BR9A 5AQFA 5AQXA 4I6MA 2E1YA 3VEYA 5AZIA 2Q97A 3D7EO 2I7NA 1TUUA 3DXMA 1NGCA 2ASOA 3HM8A 2H3GX 1KAXA 3FZKA 4JNEA 3MN6A 3I33A 5EY4A 5AQKA 2IVPA 3U4LA 2YCHA 5F2RA 3CJ7A 2BUPA 3BF1A 4XH4A 3VEOA 4PL8A 4CZEA 4ISEA 3VF2A 2P9IA 2ZF5O 5AQHA 5FPDA 2E8AA 4BQZA 1H1VA 3ENHA 5BREA 1JCGA 3WQUA 3MCPA 4JD2B 3CQYA 3D2FB 5ELZA 2PAVA 3QFPA 3F9MA 2CGJA 2YI1A 3O1WA 3ULEA 1YVNA 4BREA 3ZX3A 3LDOA 2UYTA 3QFUA 1NBWA 5BRHA 3CIPA 4BVPA 5BN9A 1BUPA 2QWRA 4H5TA 2EWSA 4B1WB 4H5NA 3VPZA 4A2AA 2ASPA 2IVOA 3JS6A 2A6AA 4H5RA 3EKSA 4JHDB 4WQ4A 3LM2A 4BRIA 4IWVA 5AZJA 2V51B 1NGBA 3MN9A 4FOIA 2D0OA 5BRFA 3TPQA 4K43A 2GUPA 3O5BA 2P9LA 3W0LA 1YAGA 3ID8A 4BGBA 2AP1A 5AQWA 3CHWA 1D4XA 4FSVA 4DQ8A 3UKRA 1TUYA 4CBWA 3OHRA 4RCHA 3H46O 1HUXA 4DCHA 3ATVA 1HX1A 2CGKA 3AY9A 2E2OA 3L6QA 1YUWA 4BRQA 5KPTA 2QM1A 4WQ4C 1HKGA 2P9PB 3C7NB 3VEWA 2QWMA 5KPZA 4CZFA 3A5NC 1ZC6A 2A5XA 4BRNA 1K8KA 4H5VA 3CJAA 4BG9A 3WXLA 3VEVA 5AFUH 4AM6A 4KBOA 1IG8A 4GY2B 1V4SA 4BC2A 5BN8A 3DXKB 1NGJA 3S41A 1ATRA 4B1VA 3VEXA 3ZETA 4H0YB 1EQYA 2A41A 4O5FA 3D2EA 4YDUC 3DJCA 3O6WA 4Y0WA 4F9OA 4BRLA 5JLHA 3IUCA 1QZ6A 3M3ZA 2QWOA 4BGAA 5AQGA 3VOVA 2FSKA 3FLCO 5JMVA 3ATUA 3GG4A 4K25A 3MMVA 1LCUA 4PKHA 3KHYA 5F1XA 3LM9A 2YHYA 1HKCA 3CJ1A 5ADXA 2Q36A 1NGAA 3TU5A 3HBTA 3CJBA 4MLEA 4XH5A 1U2VA 4WQ5C 2VCPA 2Q0RA 1MDUB 2NZTA 3HTVA 3ZEUB 4FO0A 1HJOA 3GE1A 2E1ZA 3WEEB 5EXWA 1GLJO 2FXUA 2HF3A 5EX5A 1SQKA 4CBUA 4FWNA 4FPAA 2YHWA 2CH5A 3BP8A 1KAZA 3CJ9A 5I9EB 3SMPA 1BWFO 4BRPA 1SZ2A 3M1FA 4LC9B 4HTLA 2GWKA 4BG8A 1E4GT 1JCEA 3A8YA 2IVNA 5LJVA 4XEIA 1P8ZA 2W40A 2P9KB 5AQOA 3LDLA 3EKUA 1GLBG 2P9UB 1NM1A 4JHDA 4QS7A 3L0QA 3WXIA 4FWOA 2D4WA 3H45C 2E2PA 1BU6O 4BR4A 1RFQA 3FZFA 5TKYA 4H0XB 2AA4A 3QICA 4CZJA 4O8KA 1TYQB 2FSJA 4H0OA 1NGDA 4FPBA 2YJEA 1BOTO 3UE5A 5AQQA 5BR9A 3LDNA 4ISFA 2V52B 3I8BA 3U9ZA 2WUSA 1QHAA 3VERA 4BC3A 4AM7A 4BROA 1XUPO 4DHYA 4CD1A 5KPRA 4A62A 5AZIB 4BRHA 1NGEA 4FOEA 2P9PA 3DXMB 4IXCA 3MDQA 3AAQA 3GL1A 3A0IX 4CBXA 5EVZA 1QQMA 2J4RA 3FZMA 5JICA 3WQTA 3A5LC 3ZX0A 4RTFD 1QQOA 3SJHA 2Q0UA 5AQTA 2P9IB 5AQZA 1T6CA 4BRGA 3SK3A 5FPEA 3IDHA 4BC5A 1NGFA 2ITMA 5AQLA 1GLEG 2Q1NA 2Q2RA 2QWNA 3UKUA 2YHXA 3G25A 3ULEB 4H0TB 5B8HA 1T6DA 4B1YB 3AARA 3VGMA 4PKGA 3VGKA 1DKGD 4EHTA 3HI0A 1S3XA 4H5WA 1XQSC 4CZHA 3W3DA 2Q31A 4M7XA 2V7ZA 2DPNA 3J8AA 3VGLA 1KXPA 5KQDA 5JLFA 4XH1A 4A2BA 2P9SB 5BRDA 2P9LB 3FE1A 1NLVA 1BA1A 3EO3A 1NGGA 1NWKA 4BRFA 4IO8A 3GOIA 1ZXOA 3UB5A 4M7YA 3UKRB 1DGKN 2NLXA 3CJCA 4IJAA 3FZLA 2QWQA 1GLAG 5E26A 4BR5A 3R9PA 1T44A 4K41A 3O1BA 3L4IA 1GLFO 3QBXA 3VEZA 1XC3A 4B1UB 1C0FA 2P9KA 2A3ZA 3O08A 5BPNA 1Z05A 3KZBA 1GLDG 1MA9B 4JD2A 1K8KB 4MO5A 5AFUA 3D2FA 4Z94A 1BG3A 1ATSA 2F9WA 4FWRA 5LJWA 3BF3A 4FWPA 2D1KA 4A61A 1RDWX 3H1QA 5AQJA 4BQLA 1BDGA 3FFKB 3A5MC 4IJNA 3WT0A 2GEMA 3M6GA 1NGIA 2A42A 4ISGA 2QWLA 4CZKA 3O8MA 5AQIA 2E2NA 4EIAA 5BPLA 2VWBA 2CGLA 2VYPA 5LY3A 3ZX2A 2V7YA 1BO5O 4H0VB 4FWMA 1JCFA 2FF3B 1ATNA 3QMLA 4PL7A 4RWTA 3B8AX 4BRAA 4J8FA 1J6ZA 4M63C 4IZ9A 4H03B 1HKBA 1QQNA 1S22A 2HOEA 3H6EA 1MWKA 1HPMA 3FGUA 3O80A 3EN9A 1DEJA 5AQRA 4GNIA 5CE3A 3R8EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1K6YA 1KTQA 1ASVA 2NRVA 4MDAA 3RSEB 1RT1A 4JI6K 3TAQA 3C0BA 3NVKA 4J2BA 3O9QA 3KWIA 4FK0A 2ZWHA 1GOAA 5F0XA 3C6UA 4CHQA 1RBUA 1ITGA 2O8EA 3VQDA 3ZSVA 4DFKA 1KLMA 3WUHA 1TKTA 5AQUA 3TSUA 3IKMA 3GBTA 4Z4CA 4FJJA 2WONA 2GWJA 3SV4A 3F73A 4CF8A 3VENA 5TKWA 4CIGA 4DV3K 4N47A 4FLZA 2I5JA 3V4IA 3OYDA 1O1WA 5JS2A 3IMXA 2DTUA 3OA9A 3H08A 3CYMA 3HYFA 4LSNA 1VSJA 3G6EN 1NK7A 3P4IA 1NMDA 3RMBA 1Z6RA 4OPJA 3F5TA 4JAXA 4CJ3A 4DG1A 4PA1A 2QXLA 1BCMA 2E2QA 1LWEA 3DYAA 3H1VX 4E3SA 5AJ3K 3L4QA 3ITHA 3SLCA 1ZBFA 4FWSA 1KFDA 1ESVA 1J5OA 3G71N 1N6QA 3U9DA 2W6KA 4YDUA 1UWBA 1L3VA 1TL1A 1GLLO 1OVQA 5ADXH 4JK7A 1SKSA 2P51A 5AZJB 1KC8O 3DRSA 4N76A 2CH6A 4WYBA 1GOBA 3ZEUA 4QAGA 3AVBA 2NRHA 4K8XA 1HJRA 3WXKA 4KI6A 1MWMA 2PYLA 4FWLA 3VN5A 3EL2A 3VA0A 4LY7A 3L3UA 3EZWA 1EWQA 3UKUB 1RT5A 2B4JA 3C95A 4DQPA 3CERA 3DAWA 4Z4IA 4I2PA 4QCLA 2OCEA 1ZBHA 4J2AA 5AR0A 1VQ5N 3TAGA 4CJUA 4EHUA 2YNIA 1Q86O 5HL7L 4AHSA 2HMPA 4KRFA 3CCSN 4BRCA 4NLBA 3KVGA 3R6MA 2P9NA 5MLCQ 3CCEN 1U49A 1YXQA 2G8WA 1BA0A 1CZAN 1RGIA 3CETA 3H3NO 5BPMA 3T1HK 2QEXN 4BY9C 1NU0A 2ZE2A 3QERA 4GKKK 3BDPA 3SZ2A 1TUUA 2AJQA 3V9UA 3EYZA 3FZKA 4JNEA 3MN6A 5EY4A 3LZIA 2YCHA 3OYAA 3BF1A 3VEOA 4CIFA 1FKOA 4PL8A 4CZEA 2D0BA 5AQHA 1DTQA 5FPDA 1JLFA 4BQZA 3AO1A 4JI5K 1JCGA 3QEIA 3CQYA 2HBJA 5ELZA 3T3FA 3CM5A 4CEFA 3LWMA 4DTPA 1IBMK 4B9MA 2CGJA 2YI1A 3ZT4A 4DTMA 3O3FA 3MEDA 4PQUA 3VTHA 3O9UA 3JAMO 5HBMA 5D3GA 2UYTA 3QFUA 4C8NA 1QTMA 3BZCA 4B08A 1LW2A 5BRHA 3OBYA 2OPQA 3THWA 4M42A 4BVPA 3M8QA 4DV5K 3K5MA 2YNGA 3CD6N 3VPZA 4JHDB 4Z0UA 3NH2A 3D6RA 4IWVA 2HNYA 2F8TA 3TPQA 3O5BA 2P9LA 1YAGA 3ID8A 5AQWA 3CHWA 1K8AO 4FSVA 1T05A 1KVBA 4DCHA 5A2QO 3ATVA 1HX1A 3C6AA 1VSMA 2O8EB 4WFBL 4BRQA 5KPTA 1C0MA 2P9PB 3VEWA 2GV9A 3NVMA 3LAMA 1QE1A 1NJIO 4BRNA 4H5VA 4NYFA 4PY5A 3SUQA 4AM6A 3NGZA 1WBDA 4GY2B 3TAFA 3AVAA 3WNFA 3VEXA 3MCAB 3VQAA 5FLXO 2A41A 1Z26A 4JS4A 3HOSA 3DJCA 3DI6A 4DF8A 3C6TA 1KFSA 3SAGA 1SKWA 2QTDA 5C0YA 4G1QA 3VQQA 1Q9YA 3E9LA 3VQ7A 5JMVA 3ATUA 1B9FA 1RTHA 4B9UA 3K57A 3DM2A 3CJ1A 3PX0A 4E1MA 3ULDA 3P1GA 4U67L 2Q36A 1T3VA 1U2VA 4WQ5C 2KFNA 1N33K 3CF5L 3ZEUB 1UOCA 1HJOA 2FC0A 3THXB 4KI4A 2YHWA 4Q0BA 3RMDA 3SMPA 3TTDA 4CEAA 1SUQA 3E01A 4HTLA 1WB9A 4DV6K 4FLXA 4JS5A 4CJRA 3TTCA 4A5BA 1EX4A 1KQSM 2QK9A 3JYTA 1RILA 1NM1A 1K73O 3CC7N 4O44A 3H45C 3KIOA 2HHTA 4EP4A 1RTJA 3SI6A 2AA4A 3QICA 4AH9A 3QIOA 3NGIA 2YJEA 4DTSA 4NXNK 5BR9A 4M45A 4OO1J 4C8MA 2HHVA 2WUSA 1QHAA 4BROA 4DHYA 4CD1A 1NGEA 2IGIA 3AVKA 2A1SA 1SKRA 2UXDK 5JVHL 5EVZA 4LD0A 2J4RA 2KW4A 3FZMA 3OS0A 4CF2A 1BHLA 3WQTA 1NK8A 3SJHA 2Q0UA 5AQTA 1NK4A 5FPEA 3I0SA 2Q1NA 2QWNA 2Q2RA 4AILC 4DSEA 1W0HA 3ZSYA 5HOOA 4CF9A 1YTUA 3VA3A 4BWMA 2F96A 1FXXA 2O8CB 1RBVA 4KHWA 4IG0A 1S6QA 1NJYA 1S1VA 2KQ2A 3W3DA 4JV5K 4M7XA 2V7ZA 4IEIA 5JLFA 1W7AA 3TWHA 1Q9XA 4ELUA 2NNWA 2GBZA 2P9LB 1NLVA 3HP9A 2E6MA 1ZYQA 3EZ5A 5KGXA 1VSLA 3SJJA 3LPTA 5LL6Z 1T44A 1RBTA 3ZSRA 1IBKK 1ZBIA 1XC3A 2KLAA 2P9KA 2A3ZA 1Z05A 3KZBA 3QINA 2BE2A 5AFUA 3D2FA 4Z94A 1BG3A 1BDGA 3OYKA 5M1FA 1NOZA 2HSTA 5K14A 3O8MA 3AO3A 4AF1A 4EIAA 5CHIA 3QNNA 1N32K 4KHNA 1LAVA 2VWBA 5GADP 4H0VB 1JCFA 3QMLA 3V6DA 3R3LA 1I3AA 4J8FA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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