2CH6A

Crystal structure of human n-acetylglucosamine kinase in complex with adp and glucose
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
343
structure length
343
Chain Sequence
AAIYGGVEGGGTRSEVLLVSEDGKILAEADGLSTNHWLIGTDKCVERINEMVNRAKRKAGVDPLVPLRSLGLSLSGGDQEDAGRILIEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDGGVVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFHYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHIVAVLPEIDPVLFQGKIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFLLALTQGREIQAQNFFSSFTLMKLRHSSALGGASLGARHIGHLLPMDYSANAIAFYSYTFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE KINASE
publication title Structures of Human N-Acetylglucosamine Kinase in Two Complexes with N-Acetylglucosamine and with Adp/Glucose: Insights Into Substrate Specificity and Regulation.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 98
structure length 343
sequence length 343
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.59: N-acetylglucosamine kinase.
pdb deposition date 2006-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ch6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ch6A02
4FWNA 1YXQA 1Z6RA 1IG8A 2VYPA 1BUPA 2HF3A 2P9IA 2FXUA 1NGBA 1DKGD 2A3ZA 2UYTA 1KAZA 3VOVA 2E20A 5I9EB 1HLUA 2YHWA 2HOEA 3QMLA 5AQHA 1WUAA 5AQLA 3QBXA 4H5VA 4A2AA 2V7YA 5F1XA 3BP8A 2DPNA 4BRNA 5FPNA 3FZKA 3CJ9A 4IJAA 4DCHA 2IVPA 2F9TA 3HBTA 3U8XA 1SQKA 3RSEA 3HZ6A 4IZ9A 3TPQA 4BRPA 1Z05A 1KAYA 3IFRA 3J8AA 2P9NA 3BUZB 3O08A 3S41A 1GLLO 1BDGA 3LL3A 2IIRA 4CBUA 2FSKA 4BC5A 4BC2A 3DXKB 2VCPA 1CZAN 3LDNA 1X3NA 3VGKA 3H3NO 4HWIA 3UKUB 5KQDA 3VEYA 2GTDA 5AQYA 3GE1A 3LDPA 3MK6A 4JHDA 4FWPA 4HTLA 2HMPA 1QQOA 3MDQA 2YI1A 1YVNA 1MWKA 5BN8A 3IUCA 3CQYA 3JXUA 4Y0WA 5LY3A 1K8KB 1U6ZA 5AQZA 1X9JA 2GELA 4BGAA 4DQ8A 5EVZA 3SK3A 4EHUA 4H5RA 3ID8A 2FSJA 2FLOA 2I7PA 1NGCA 4K25A 1ZXOA 5BREA 3VERA 2A40A 2P9SB 5AQOA 3CIPA 3CJBA 4JD2A 4BREA 4PKIA 4FWLA 1ATRA 3ZX0A 5CE3A 2E2PA 1ZC6A 4A2BA 4B1WB 1OKJA 2Q97A 1NBWA 3VEOA 4CBXA 3P4IA 2P9PA 3M1FA 4H5TA 4IWVA 3H46O 1QQMA 3VF6A 4CZKA 1G99A 4JN4A 4NB4A 1TUUA 3ULEA 4CZGA 3VPZA 1NGAA 3DWLA 3LM2A 1TYQB 4BRDA 2FF3B 3QFUA 3VGLA 4WQ5C 1NGHA 4YDUC 2F9WA 1QQNA 3IDHA 5E26A 3D2FA 2ASPA 4WQ4C 2ZF5O 3QICA 3KHYA 1GLDG 2NZTA 3BEXA 3AARA 4IXCA 3DAWA 5KPRA 3U4LA 4CBWA 4FOIA 1ATNA 4FOEA 4RTFD 5BPNA 2FSNA 3TU5A 1TUYA 4BR4A 3L0QA 3D2EB 3HM8A 4FPBA 3EZWA 1D4XA 3HI0A 2E1YA 1NGIA 5AQTA 3HSCA 4BRKA 1GLFO 4CZMA 3VEVA 1JCEA 3VEWA 5AQRA 4MLHA 4BRIA 5B8HA 1BO5O 1IJJA 3FZMA 3C7NB 4K41A 3FE1A 4K43A 4FSVA 2BTFA 2QXLA 5AFUH 4H0OA 3A5LC 3O80A 3VESA 2CH6A 2A6AA 2CGJA 2D0PA 5KPZA 4FWKA 1QZ5A 4J8FA 2I7NA 2ITMA 4RWTA 5BPLA 3MN7A 3CI5A 4H0VB 3W0LA 4RCHA 3AY9A 3UB5A 4EFHA 2A5XA 5AQPA 4MO4A 4BVPA 4GY2B 4XH1A 5JLHA 5BRHA 4L3QA 5AQJA 2YHXA 3U9ZA 4B1UB 4PL8A 3BF3A 3M3ZA 3QB0A 3SMSA 3CJAA 3FZHA 1GLBG 2P9UA 2HF4A 3WEEA 1KXPA 5FPMA 2QW9A 4FPAA 2PAVA 3O1BA 4XH4A 4AM7A 5ADXH 3EL2A 3ZEUA 3EN9A 4CI6A 1DGKN 4XEIA 3ZETA 3WXJA 3VENA 3ATUA 4I6MB 4M7XA 3GL1A 1HUXA 3ENOA 2D1KA 2Q2RA 3U9DA 1QHAA 3SLCA 4CD1A 5AQIA 1RFQA 3GDQA 3L6QA 5EY4A 3A5OC 5AQQA 2Q36A 3H1VX 4H5WA 4BQLA 4PKHA 1U2VB 2QWPA 4FWRA 4BR9A 3I8BA 3DXMB 1BWFO 3R9PA 3F9MA 3HTVA 3R6MA 2YJFA 1WOQA 3C0BA 2P9IB 2IVNA 4FO0A 1GLAG 4BG9A 2KHOA 2NRHA 1NGJA 3KVGA 2ZGZA 2CGKA 1BG3A 4BRCA 5AZJA 2EWSA 4ISEA 1HJOA 5AQGA 1ATSA 4EIAA 2E2OA 2E2NA 5AQMA 2P9LA 4FWMA 4H0TB 4BROA 1HX1A 2D0OA 4LC9B 4BGBA 5BPMA 1NGFA 3L4IA 1NMDA 3A0IX 3CERA 3RSEB 4KBOA 3VF4A 3WXIA 2P9NB 4IO8A 5AQFA 2ZGYA 4BR2A 4WQ5A 1YUWA 4YDUA 3CETA 4QS7A 1C0FA 1BU6O 4WQ4A 5LJVA 2CGLA 1HPMA 4BR7A 3LDOA 5TKYA 2GWJA 3AAQA 2QM1A 1GLJO 2YJEA 4BRMA 4JNEA 4FWOA 1RGIA 1HKGA 5F2RA 1X3MA 2Q1NA 1GLEG 4CZJA 4BC4A 5F0XA 1QZ6A 2YHYA 5E84A 4BRLA 4H5NA 4JHDB 3ZEUB 1S3XA 1KAXA 3ENHA 4JAXA 2GEMA 3QFPA 4BRAA 3QDKA 4H0XB 3H6EA 3DXKA 5JLFA 4NO7A 4H03B 1H1VA 2W40A 5AFUA 3ATVA 3EO3A 3MN6A 3UKUA 3WT0A 4BR5A 1JCFA 3JS6A 2E2QA 2A42A 3CHWA 1BOTO 4BC3A 4EHTA 4JD2B 3EKUA 4FL9A 2H3GX 1MDUB 1YAGA 3GBTA 2GWKA 4PKGA 1LOTB 1T44A 4PL7A 1XQSC 5AQXA 1XUPO 4MO5A 1RDWX 1K8KA 2Q0RA 2YCHA 4K42A 2P9PB 4BRGA 2WUSA 3GG4A 3W3DA 3UKRA 3H3OB 4QS8A 5AQKA 3B8AX 4XH5A 2P9SA 5JICA 3ULEB 5AQVA 2Q31A 5ADXA 3WXKA 5AQWA 5LJWA 4FWSA 3VETA 4B1ZA 2ASMA 3VEZA 3FGUA 3D2FB 5BR9A 3AAPA 2V51B 4IJNA 1XC3A 3KZBA 3WXLA 5KPTA 5FPEA 2D4WA 4BG8A 4CZHA 2VWBA 5BN9A 2J4RA 2Q0UA 1NLVA 2ZWHA 3O6WA 3LDLA 3FFKB 4F9OA 5KQ8A 1TYQA 3D7EO 3ZX2A 5AQSA 3VEXA 1NWKA 3GOIA 5AZIA 4BQZA 2P9KA 4O8KA 3UE5A 3CJ1A 4B1VA 4EAHD 5BRDA 1Q18A 3VF2A 2OANA 1DEJA 1MWMA 3IMXA 1SZ2A 3O8MA 1NGGA 2AP1A 1NM1A 1T6DA 4AM6A 4BRHA 2IVOA 3CQXA 4DB3A 4BR0A 1J6ZA 2E1ZA 2QWOA 4B1XB 3D2EA 5JMVA 3FLCO 3CJCA 1S22A 3SMPA 3WQUA 4BRQA 4M63C 1E4GT 2ASOA 2NLXA 5EXWA 3FZLA 4CZEA 3SJHA 3UKRB 4H0YB 3I33A 1GLCG 4CZFA 3A5NC 3LM9A 3ZX3A 4CZIA 3MN9A 3MCPA 1SAZA 5EX5A 1LCUA 4CD3A 1NGEA 2QWQA 1Y64A 3C7NA 3QBWA 4QS9A 4C23A 1HKBA 1V4SA 2P9UB 3FR0A 3WEEB 3OHRA 2GUPA 2FF6A 4E1JA 2QWNA 3FZFA 1E4FT 3H1QA 3O5BA 3A8YA 1ESVA 2BUPA 4A61A 5FPDA 1ZBSA 3O4WA 2W41A 1MA9B 2V52B 3ZETB 1T6CA 3CJ7A 4ISGA 4B9QA 3BF1A 2V7ZA 3R8EA 4GNIA 5EOYA 5AQNA 2PBDA 4MLEA 4BVOA 4WYBA 2CH5A 5AZIB 4B1YB 4CZLA 2P9KB 4CJ7A 1BA1A 2AA4A 2E88A 3G25A 3MMVA 5ELZA 4ISFA 4Z94A 4DHYA 3DJCA 4H0PA 1JCGA 3WQTA 4FWQA 1P8ZA 1NGDA 3EKSA 4BRFA 1BA0A 1V4TA 4M7YA 4I6MA 5AZJB 1C0GA 4A62A 3VGMA 5AQUA 1EQYA 3A5MC 3M6GA 1HKCA 5AR0A 2P9LB 3LDQA 3MN5A 5BRFA 2QWMA 2E8AA 2A41A 1R59O 1U2VA 2QWLA 2QWRA 3O1WA 3WUHA 3DXMA 3H45C 4O5FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YXQA 3BDPA 1BUPA 2HF3A 1VRUA 2FXUA 1NGBA 4TSXA 5E41A 3WNFA 3VA0A 3QMLA 5AQHA 1VRTA 2F96A 4CW7B 3WXMB 3D0PA 3KD1E 1QHTA 3QBXA 4H5VA 3L2UA 3E9PA 3J7ZO 5F1XA 4KAZA 1VQNN 5FPNA 5H1SQ 4LD0A 4DG1A 5BR8K 1P90A 1SQKA 3RSEA 3HZ6A 4IZ9A 1Z05A 3O08A 1GLLO 4JK8A 3KD5E 4C8OA 3U6FA 4OPHA 5GAHP 3D45A 4CERA 3LDNA 3VGKA 4ILHA 4CJ3A 2F8SA 4CFAA 5MLCQ 3E1YA 4CEBA 3OYAA 4YOTA 3VQPA 4HTLA 1K9MO 3MDQA 4Z4GA 1MWKA 3IUCA 3CQYA 3JXUA 3AO4A 3IKMA 3QETA 2O4GA 3SAGA 5EVZA 1VQON 4H5RA 4DTSA 4YHHK 2KQ2A 2F8TA 2FLOA 4K25A 5C10A 1Q7YO 4FLYA 1U4BA 4RW4A 4BREA 2DY4A 5C2DA 3HL8A 4ID1A 3VQBA 2VQFK 3MXIA 1RDDA 4DV0K 1OH6A 4B1WB 3PSFA 2KTQA 1RBTA 4CBXA 3N4QA 2O8EB 4H4OA 2PYLA 1SV5A 2GUIA 5LMNK 3VPZA 3DWLA 1Q86O 3LM2A 4YFUA 1EO1A 1Q81O 3QFUA 3NBPA 3T1AA 1U04A 2F9WA 3CPWM 4PQUA 1WLJA 1BIUA 2ZF5O 1YJWN 3QIPA 3QICA 2NZTA 3VQCA 4Q5VA 3TSQA 3HT3A 2YX6A 1ZYQA 2HVIA 2W6KA 3K0SA 4RTFD 1O1WA 5BPNA 4M3ZA 4NXMK 3NE6A 2XY6A 1NKCA 1TUYA 4BR4A 1NK4A 2O8BA 3C95A 3HM8A 2PZSA 3EZWA 1NGIA 5AQTA 4RW7A 1JCEA 1L3VA 5CHIA 5B8HA 3AA3A 4CIGA 4DTNA 4OVLA 3FZMA 3C7NB 2GBZA 4K41A 2FBYA 3K59A 2BTFA 4CF9A 5AFUH 3NH2A 3CCQN 3LPTA 3MX5A 4H0OA 3DRPA 1HR0K 3SYZA 2E4LA 4RW9A 4Z4CA 2I7NA 3OYDA 3MN7A 3OS0A 5GAEP 3CM5A 1I39A 2A5XA 4DU1A 3AVGA 2G8HA 5AQJA 3PX4A 1N36K 4B1UB 3M3ZA 1VSDA 4CEOA 1YF5L 2HF4A 2P9UA 5JS2A 3NVKA 3RVCA 2KFZA 4PUOA 3AGRA 3WNHA 2DFFA 1JL1A 4AM7A 4B9LA 3ZEUA 3EN9A 2UXDK 4XEIA 3WXJA 3F73A 3HP6A 3HVTA 3DLEA 3ENOA 3U9DA 1JKHA 2DFHA 3L6QA 5EY4A 3A5OC 3LWMA 2NRXA 2Q36A 4BQLA 4FWRA 3DXMB 4FYDA 2YJFA 4MDBA 3KK1A 1ZBHA 4DR4K 3JYTA 3EZ5A 1NGJA 3AA2A 2ZGZA 1BIZA 2G8UA 3P1GA 5C25A 4YOUA 4B8AB 3LAMA 5T7BA 1HX1A 4WE1A 4LC9B 4DFKA 1NGFA 3HK2A 2O8CB 4E3SA 1N5YA 4BR2A 1QSYA 2VG7A 2G8WA 3OYLA 1BU6O 3PO5A 3LDOA 2QM1A 1SUQA 4BRMA 4KO0A 1RBRA 1W0HA 4OKEA 1RGIA 1HKGA 3TTFA 1KD1O 3AVJA 4AF1A 4FW1A 5FROA 3O3FA 3DLGA 4DFMA 3THWA 4O4GA 4F2SA 3AA4A 1T3VA 3NGIA 1QZ6A 4AHCA 4BRLA 4JI3K 3C6TA 3MCAB 5C42A 2B6AA 4BRAA 1TK0A 4CEDA 1SL0A 4CJSA 3QDKA 3K5NA 1WN7A 4NLCA 1ZBIA 4CGIA 3J7YP 4H03B 1H1VA 5KGXA 4H4MA 3MN6A 3O3HA 4CEAA 2E6MA 3PUFA 4FJMA 2E2QA 1FW6A 3PY8A 1BOTO 1RDCA 3AVHA 1S5JA 1M1KO 4FL9A 4Z0UA 4NYNA 3VA3A 4E89A 5M1KA 1OH8A 1MDUB 4RG8A 1T44A 4KTQA 5HRRA 2KZMA 3MEGA 2P9PB 4DV5K 1RTDA 4OGCA 4QS8A 1WSJA 1OH7A 3B8AX 3OJUA 4DUZK 4B9MA 1C1BA 3UIQA 4DSLA 3ULEB 4W5QA 3TAQA 1S6PA 3AVNA 2ZM6K 3VEZA 3PIOL 3D2FB 3AAPA 2V51B 1XC9A 3N4PA 4IJNA 3K9JA 1WNSA 5FPEA 2ETJA 3OYNA 2O8EA 4L8RB 4DQRA 1XMOK 5K14A 3P38A 4BG8A 2VWBA 5BN9A 2Q0UA 4DS4A 2WONA 1RNHA 4J2EA 4E19A 4DTPA 3VEXA 1NWKA 4CF0A 3SQ1A 2QKKA 4BDPA 3VQEA 4BQZA 2P9KA 2E6LA 3CJ1A 3T19A 1B92A 5BRDA 2FBTA 1ILYA 4J2BA 3ZYYX 3E9OA 3RMDA 2JGUA 1Q9YA 3VMFB 2OANA 3ZSQA 5GADP 1MWMA 3IMXA 3QEPA 1T6DA 1E3MA 1WB9A 4AM6A 2NRTA 4BRHA 4FM0A 4DTOA 4DF4A 4CJVA 1BCMA 4BR0A 2QWOA 3CF5L 3HXMA 5J2NA 3C6HA 3WQUA 3EYZA 3QNNA 4LF7K 2HHSA 2ASOA 5EXWA 3SJHA 3UKRB 2A1SA 3PV8A 1JXBA 1IBMK 1GLCG 4GV6A 1D9DA 3QESA 4CD3A 3C7NA 4CIEA 4C23A 1NK8A 4M3UA 1QSSA 4LF8K 4OX9K 1HKBA 3VQ9A 1V4SA 4M45A 3RR7A 3WEEB 3SNNA 4DR2K 4CFCA 4PY5A 2GUPA 4E1JA 1ASWA 3VQAA 1E4FT 1U49A 3NMUA 2PFUA 4F3OA 1ESVA 4A61A 3QO9A 1ZBSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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