2CH6A

Crystal structure of human n-acetylglucosamine kinase in complex with adp and glucose
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
343
structure length
343
Chain Sequence
AAIYGGVEGGGTRSEVLLVSEDGKILAEADGLSTNHWLIGTDKCVERINEMVNRAKRKAGVDPLVPLRSLGLSLSGGDQEDAGRILIEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDGGVVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFHYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHIVAVLPEIDPVLFQGKIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFLLALTQGREIQAQNFFSSFTLMKLRHSSALGGASLGARHIGHLLPMDYSANAIAFYSYTFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structures of Human N-Acetylglucosamine Kinase in Two Complexes with N-Acetylglucosamine and with Adp/Glucose: Insights Into Substrate Specificity and Regulation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE KINASE
total genus 98
structure length 343
sequence length 343
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.59: N-acetylglucosamine kinase.
pdb deposition date 2006-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ch6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ch6A02
5ADXA 3HM8A 4XH4A 1MA9B 1HUXA 3HI0A 4WQ5C 2QM1A 1WUAA 1YAGA 3GE1A 2ZGYA 2WUSA 5BREA 4O5FA 4A61A 5TKYA 3FZLA 4RWTA 3ZETB 2FSNA 2QWQA 2E88A 3FZFA 2FF3B 4FWNA 2E1YA 3B8AX 5EX5A 3SMPA 1DGKN 4FWOA 3WEEB 4L3QA 5FPMA 3WXLA 3VEVA 4B9QA 4JD2B 1C0FA 1ATSA 4EHUA 2AP1A 3SMSA 4BRLA 2BTFA 4BQLA 2NLXA 3QMLA 4FSVA 4BG9A 3CJAA 3EN9A 3U9DA 1V4SA 4CZHA 4BGBA 3H45C 2QWRA 4K25A 4BVOA 2UYTA 3ENHA 4HWIA 2E1ZA 2ASPA 4CZGA 2VCPA 3JXUA 4H0VB 4BRGA 2YJFA 4E1JA 3WXIA 3CIPA 3DAWA 2P9IA 1D4XA 1WOQA 3MK6A 3DXMA 4DHYA 3VEWA 2ASOA 3WUHA 1NBWA 2E8AA 5AQQA 1E4FT 2P9NA 4BRKA 3FGUA 4H5NA 5BR9A 4A2AA 5EOYA 2QWOA 5AQXA 2IVPA 5ADXH 2QW9A 5KPRA 3VGMA 1Z05A 3A8YA 3EKSA 3VEXA 3H1QA 4QS8A 3VESA 4BC4A 3A0IX 4M7YA 5I9EB 3U4LA 3O4WA 1HKGA 5KPZA 4A62A 2P9IB 3CQXA 3DXMB 1SQKA 4CJ7A 4FL9A 5F2RA 4FWMA 5F0XA 4B1VA 2YI1A 1RGIA 1TYQA 2CGLA 4FPAA 5BN9A 3M6GA 2P9NB 1E4GT 4LC9B 3VEZA 1J6ZA 3BP8A 2Q36A 3LM9A 4DB3A 3VF2A 3GL1A 3AAQA 1BA1A 4BR0A 5KPTA 2EWSA 4M7XA 4BRNA 5KQ8A 2Q0UA 3R8EA 3O5BA 1SAZA 3ATUA 4CZKA 3L0QA 1Q18A 3O1WA 3LDNA 1NGEA 1NMDA 5AQPA 5EXWA 5BPMA 1JCEA 5B8HA 2YHYA 1TYQB 3BEXA 4GNIA 5AQOA 2GUPA 4ISGA 2FLOA 4IWVA 2Q97A 3D2EA 4WQ5A 3EO3A 1R59O 2Q0RA 5E26A 3UE5A 3CETA 2P9LA 1LOTB 2HF4A 1NGGA 3JS6A 4B1UB 4CI6A 4DCHA 3IMXA 3VGKA 2GTDA 4MO4A 1BU6O 1T44A 2V52B 4BVPA 4HTLA 4FWLA 3UKUA 1KXPA 2IIRA 3WXKA 5JLFA 5LY3A 3LL3A 4B1YB 2H3GX 3H3NO 3J8AA 5AZIA 3A5NC 2F9TA 3KVGA 5CE3A 3VF4A 2AA4A 2QWNA 2D1KA 3SK3A 1QQOA 3D2EB 3R9PA 1TUUA 3MN9A 2VWBA 2BUPA 2CGKA 4ISFA 3DJCA 5AQJA 2ITMA 3W0LA 4FOEA 2E2QA 2P9LB 1BDGA 2HMPA 3H46O 3QFUA 4BQZA 3O80A 2V7YA 3LDQA 3GOIA 3D2FA 3ULEA 3ENOA 5AQTA 3O8MA 3UKUB 4EIAA 1HJOA 3C0BA 4B1XB 1HPMA 4H0XB 2E20A 1HX1A 1Z6RA 4FPBA 3EZWA 5AZIB 4BRHA 4FOIA 4JN4A 3ZX2A 1DKGD 3FZHA 3LDOA 4NO7A 3FE1A 3MN7A 4H0TB 5AQRA 4BRQA 3GG4A 3BF3A 3EKUA 4BR2A 5FPEA 1C0GA 1NGIA 4WYBA 4H0YB 4B1ZA 4NB4A 5AQFA 1MWKA 1GLJO 3D2FB 2F9WA 3ULEB 3VEYA 1YUWA 1BA0A 1Y64A 1GLDG 4WQ4A 2Q1NA 4JNEA 4BRAA 3IDHA 1IJJA 1NGAA 3I8BA 1T6DA 5AQSA 3VERA 4BR5A 5BPNA 2KHOA 4B1WB 1NGDA 3QBXA 4KBOA 2Q2RA 4BRPA 4CZFA 2VYPA 4Y0WA 2E2NA 1GLCG 1KAXA 2E2PA 1BWFO 3HSCA 1RDWX 3QFPA 3GBTA 1CZAN 2QWPA 2CH6A 1GLBG 1ESVA 2E2OA 3HZ6A 4WQ4C 3CQYA 4BRCA 3C7NA 5AQZA 2YJEA 2A40A 3FFKB 4IZ9A 4BG8A 2A41A 4C23A 1U2VA 1QZ6A 1BG3A 3QBWA 3QICA 1GLEG 2V7ZA 3CI5A 3VENA 4H5RA 4BR4A 1GLAG 2V51B 3H3OB 1X3NA 4PKGA 4BC5A 3DXKA 4H0OA 3F9MA 4CBXA 1S3XA 4PKHA 2GWKA 3FLCO 2YCHA 3MDQA 3UKRA 1DEJA 5AQKA 3CJCA 3P4IA 3VEOA 1NGFA 2Q31A 4PL8A 4XH5A 5AFUA 3C7NB 3U9ZA 4K41A 3U8XA 3WT0A 4AM6A 3BF1A 4BR7A 4CD1A 3CJBA 2A42A 1U2VB 4ISEA 4IJAA 5E84A 1G99A 4H5WA 4CZMA 4FWSA 4CZLA 5F1XA 4BROA 3VF6A 1K8KA 1EQYA 2HF3A 3KHYA 4M63C 1NGCA 3DXKB 1YVNA 1T6CA 4H5VA 4BGAA 2I7NA 3G25A 3LDPA 3UKRB 5AQNA 5FPNA 5JICA 2GEMA 4FWPA 5AR0A 3R6MA 3QB0A 1HLUA 1QZ5A 1NGBA 2A6AA 3IFRA 3SLCA 2A3ZA 1NGJA 2FSJA 1JCFA 4FWQA 4RTFD 3WQTA 1KAZA 5JLHA 1YXQA 5LJWA 4BRDA 3AARA 1K8KB 5AQUA 3O1BA 1H1VA 4YDUA 5EVZA 2QWMA 2FXUA 5BN8A 1LCUA 3VPZA 3AY9A 3ZX3A 5ELZA 1ATNA 3CHWA 2P9SA 4QS7A 3ID8A 4JHDA 3IUCA 1IG8A 3MMVA 3HTVA 1BUPA 3TU5A 5AQIA 4CZIA 3UB5A 3RSEA 3EL2A 5BRDA 4XEIA 1NM1A 2YHWA 4XH1A 4H5TA 3VGLA 5KQDA 4FWKA 1HKCA 2IVOA 5AQVA 2FSKA 4YDUC 5AFUH 3S41A 3W3DA 3H1VX 4A2BA 2P9PA 3MN5A 2DPNA 3VETA 3A5MC 3I33A 2PBDA 1BOTO 1GLLO 4J8FA 1KAYA 4AM7A 1X9JA 5AQMA 2P9SB 2ZGZA 1XUPO 4CBUA 3BUZB 4JHDB 1QHAA 4BC2A 3ATVA 3FZKA 4BRFA 3RSEB 1MWMA 5BPLA 4H03B 4F9OA 1U6ZA 2FF6A 2NZTA 1BO5O 3VOVA 3HBTA 1NGHA 1JCGA 4BRIA 2P9PB 2QWLA 4EHTA 4EFHA 2P9KA 4K43A 5AQLA 3QDKA 2D0PA 4CZJA 2PAVA 3M3ZA 2CH5A 4MLEA 4MLHA 2P9UA 4H0PA 4O8KA 5EY4A 5LJVA 1RFQA 2CGJA 1SZ2A 4GY2B 4MO5A 1X3MA 3WXJA 4PL7A 1V4TA 4Z94A 4CBWA 4I6MA 2HOEA 2P9KB 2D4WA 1ZXOA 4IO8A 3L4IA 1XC3A 1QQNA 5FPDA 3WQUA 3DWLA 2ZF5O 2W40A 3H6EA 2J4RA 5BRHA 4IJNA 2P9UB 4IXCA 2ASMA 3ZEUA 4PKIA 2W41A 4RCHA 3MCPA 3CJ9A 1MDUB 1GLFO 2IVNA 3TPQA 5AZJA 1NWKA 1ZBSA 3M1FA 1OKJA 3CJ7A 4I6MB 4BC3A 3A5LC 3LDLA 2A5XA 4CD3A 3CERA 4QS9A 2I7PA 1ZC6A 5AQWA 2OANA 3ZEUB 4K42A 2ZWHA 3MN6A 4JAXA 3D7EO 5AZJB 1S22A 3ZX0A 5BRFA 1TUYA 4BR9A 2D0OA 3L6QA 1XQSC 1QQMA 4FWRA 5AQYA 3O6WA 4FO0A 4EAHD 2GELA 3GDQA 3FR0A 3O08A 1NLVA 3KZBA 3OHRA 1HKBA 5AQHA 4DQ8A 5AQGA 3ZETA 4CZEA 1ATRA 2NRHA 1P8ZA 3LM2A 3CJ1A 4BRMA 2QXLA 3A5OC 3FZMA 3WEEA 2GWJA 2YHXA 4BREA 3SJHA 5JMVA 4JD2A 3AAPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O9SA 4WQ5C 3HI0A 1U45A 1I39A 1VSHA 3M8RA 4JI6K 1Q81O 1RDAA 4B08A 4M3TA 2HSTA 2HHSA 4CECA 4DUZK 2ZQBA 1SL0A 2UU9K 3ENBA 3CCQN 4KI4A 2E88A 2FF3B 1D8YA 3B8AX 4CK2A 4PQUA 3U6FA 1NJIO 4DTRA 5FPMA 1B9FA 3VEVA 3OYFA 4EHUA 3F9KA 4BQLA 4BG9A 3F73A 2OCEA 4GW6A 3H45C 2A1RA 2UYTA 1BHLA 5DM6L 5J2PA 3TSPA 4YOUA 1HNZK 3JXUA 2DFHA 3WXIA 1YIJN 4MDBA 4W5OA 2VWKA 4DTPA 3THYA 2WTUA 2XY8A 1QSSA 1NBWA 2E8AA 3VQQA 3LP0A 4BRKA 1HNVA 3FGUA 4DV1K 4H5NA 3DM2A 1VSIA 2BANA 3PSIA 5EOYA 5ADXH 4DU4A 4LF8K 5KPRA 1U4BA 1Z05A 3EKSA 3NGIA 2E4LA 3AV9A 4CJFA 3ZT4A 3A0IX 4M7YA 3OTOK 3CC4N 5H1SQ 3P1GA 4F2RA 1HKGA 1CLQA 1BQMA 4FJGA 4CJ7A 4FL9A 3AVMA 2OTJN 5C10A 5EU7A 5C15A 3AVAA 2W6LA 1J6ZA 4MFBA 3O3HA 4RW8A 3L8BA 1N8RO 4M7XA 1HRHA 2Q0UA 2B5JA 4DTUA 3OS2A 3B6PA 4CGDA 2RN2A 1JKHA 1NGEA 2RF2A 4YOYA 1NMDA 5JS1A 4F8RA 2YHYA 5I3UA 4KH4A 5AQOA 2GUPA 4EZ9A 1U49A 2OZSA 3KWIA 2FLOA 5FRMA 2Q97A 3EO3A 5J2NA 3AA5X 5HBMA 1LOTB 1NGGA 3HOSA 4CI6A 4DCHA 1J53A 1VSMA 2ZD1A 3IMXA 2X74A 4IKFA 3VGKA 4MO4A 5HP1A 1T44A 4BVPA 1WNSA 1KXPA 2IIRA 4DMNA 3L2UA 3AA4A 4BE2A 4FM1A 3AVBA 4B1YB 2H3GX 3H3NO 4PHTX 4WE1A 4DV6K 1L3TA 5CE3A 1Z25A 2AA4A 3SK3A 3DRRA 3MN9A 3EZ5A 3W0LA 5AQJA 4BDYA 4JI1K 1BDGA 1KRPA 3LANA 3S3MA 3EE8A 3O80A 1J5EK 4CE9A 4CIGA 3ULEA 2KZMA 2P1JA 3LWLA 5AQTA 3HXMA 4EIAA 3C0BA 4B1XB 2QTDA 4J2EA 3UIQA 1Z6RA 3HJFA 3OYJA 2FC0A 3NGZA 1VHXA 3D0PA 3D45A 3LDOA 4CJEA 4WCEL 2XY6A 3CD6N 3BZKA 3AO2A 1WBDA 1GLJO 4B3RK 4AHTA 1VQ5N 1VQPN 1GLDG 1C0MA 1T6DA 3VERA 1NGDA 3CCSN 1WSEA 3KIOA 4GKKK 4FLXA 1BWFO 4ELUA 1W9HA 1GLBG 4W5QA 2OZMA 5J1EA 1RT4A 3HZ6A 5JVHL 1NMNA 1L3UA 2O4GA 4KHSA 2OPPA 1W97L 2XY5A 2FBTA 2PYJA 2A41A 4BY9C 3RWUA 1IO2A 3QBWA 4FXDA 1GLEG 1N5YA 5HOOA 1S9GA 5E41A 1VSJA 1C0UA 4PKGA 4DQQA 1LW2A 1NG9A 3FLCO 3G0ZA 1DEJA 3N4QA 4NYNA 2F8TA 3KLEA 1TKTA 4PL8A 4XH5A 5AFUA 3C7NB 4LF7K 4CJ5A 4WFNL 1NOYA 2FBYA 1C0TA 4NXNK 4CZMA 2A42A 1NK5A 4PA1A 3AVKA 1RTHA 3TANA 3CMAN 3T69A 1GOBA 5CZ1A 2OA8A 1DTTA 1S72N 5D3GA 1VSKA 1T7PA 1EETA 1IBLK 1Q8IA 2ATQA 5JICA 2GEMA 4FWPA 4AHSA 4FM2A 3CCEN 1M90O 1HLUA 1WSHA 3SLCA 2A3ZA 1NGJA 1WSJA 3P31A 5JLHA 5LJWA 4BRDA 1H1VA 4YDUA 3AGRA 2QWMA 4Y1CA 3ZX3A 3AY9A 3RMAA 4DSLA 4E1MA 3CHWA 4QS7A 3IUCA 4FZYA 3K59A 1BUPA 4KFBA 4IDKA 1S5JA 3WNHA 2PY5A 3AVFA 2G8IA 2NNWA 3ZT1A 3QO9A 5AQVA 2FSKA 3S41A 3W3DA 4WFAL 3H1VX 4KHWA 3MN5A 2DPNA 4I9QA 3I33A 1BOTO 4J8FA 5JS2A 4AM7A 3THXB 1X9JA 3A2FA 1XUPO 2HHTA 3ITHA 4JHDB 4BC2A 1RTJA 3WXMB 3B6OA 4DSFA 1JXEA 3RSEB 4H03B 1B9DA 3DLHA 1U6ZA 2FF6A 5FROA 5AJ3K 3HBTA 1VRUA 1NGHA 4DU1A 1P90A 1W2BM 3OYIA 2DFEA 2HHWA 1RTDA 4EFHA 4M3RA 1KTQA 1LAWA 2KW4A 3L2WA 2DY4A 3TWHA 4I2PA 1YHQN 2CH5A 3OA9A 3KK3A 4DF4A 1NK7A 4C8NA 3K5MA 3V9WA 1N33K 1YVUA 5LJVA 3DLEA 1SZ2A 1T3VA 4MO5A 4FK2A 1X3MA 3O9RA 1V4TA 4Z94A 4CBWA 2HOEA 3SV4A 4JKHA 4RW6A 3SQ4A 2OTLN 2UUBK 3K9KA 3ZSZA 1XMQK 1HNXK 1JL1A 4CF0A 3KK2A 4EP5A 4BWMA 2P9UB 4X64K 3ZEUA 2W41A 5AZJA 1JLAA 1WAJA 4M41A 4JKGB 1ZBSA 3MX5A 3DI6A 3SCXA 3V9UA 4CGJA 4JRPA 4DSEA 4YFUA 1I94K 3OYBA 4ZTJA 4I6MB 3AO3A 4BC3A 4DFJA 1E3MA 4V19S 3LDLA 1S1WA 2O8DB 5HROA 3U3YA 2I7PA 1UAXA 4K42A 1QVFM 4CJ3A 4M3UA 4JI3K 2O8CA 4JAXA 4FYDA 3NVKA 4BR9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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