2F9WA

Structure of the type iii coaa from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
249
structure length
249
Chain Sequence
SMILELDCGNSLIKWRVIEGAARSVAGGLAESDDALVEQLTSQQALPVRACRLVSVRSEQETSQLVARLEQLFPVSALVASSGKQLAGVRNGYLDYQRLGLDRWLALVAAHHLAKKACLVIDLGTAVTSDLVAADGVHLGGYICPGMTLMRSQLRTHTRRIRYDDAEARRALASLQPGQATAEAVERGCLLMLRGFVREQYAMACELLGPDCEIFLTGGDAELVRDELAGARIMPDLVFVGLALACPIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Prokaryotic Type II and Type III Pantothenate Kinases: The Same Monomer Fold Creates Dimers with Distinct Catalytic Properties.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule keywords Pantothenate Kinase
total genus 70
structure length 249
sequence length 249
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2005-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2f9wA01
3.30.420.490 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2f9wA02
2GWKA 3VEYA 1XQSC 1T6CA 1IG8A 3G25A 2F9WA 4FWQA 4B1VA 3HM8A 3DWLA 3GL1A 4L3QA 3MN7A 2NLXA 4M7XA 2FSKA 3EL2A 1SQKA 3D2FB 3U8XA 3LL3A 2P9SB 2QWRA 3CQXA 3VF2A 2P9IB 1TUYA 4JD2A 3O4WA 1NGHA 5AQWA 4XH1A 4BQLA 4EFHA 4JHDA 4WQ5A 3C7NB 3ATUA 2I7NA 2P9KA 3EKUA 3H3OB 3GOIA 3ENOA 1BO5O 5KQDA 5AFUA 4CBXA 3L6QA 3QDKA 2D1KA 4BC3A 4BG8A 2YJEA 1GLBG 3SMPA 4EHTA 5KPZA 4H0VB 5AZJB 2J4RA 5AR0A 1YXQA 1NLVA 2E20A 2QWPA 2VYPA 4BRDA 2A40A 4FWPA 4BG9A 4CI6A 1Q18A 3CIPA 1QQNA 3J8AA 3GDQA 3I8BA 3O1BA 3SK3A 3H3NO 5AQRA 3O8MA 1GLDG 3VGKA 2IVOA 4J8FA 3CQYA 3SLCA 4EHUA 3U9DA 3FR0A 4E1JA 1GLFO 2YJFA 3FE1A 4IJNA 3GE1A 2VCPA 3HI0A 1CZAN 5AQLA 4A2AA 2P9LA 2GUPA 3M6GA 4CBWA 1Z05A 2GWJA 4JD2B 4XH5A 3AAPA 1G99A 4FO0A 4FPAA 5LJWA 3QBWA 1EQYA 3FZFA 4MLHA 2NZTA 1NBWA 1SZ2A 3H45C 4JHDB 5AQGA 5AQUA 1S22A 3ENHA 1V4SA 3AARA 2FF3B 4K42A 2FF6A 4M63C 3A5MC 3UE5A 3LDLA 4B1YB 2F9TA 5B8HA 4DB3A 4BRGA 1ATRA 3D2FA 4ISEA 2CH5A 2OANA 4RTFD 2QM1A 4PL7A 4BC4A 2D4WA 1HJOA 2D0PA 2E2QA 1BA1A 2YHXA 3VEZA 3UKRA 3WXJA 4Z94A 4IZ9A 4AM7A 5E84A 3FZKA 3H46O 5AQMA 4HWIA 1NWKA 4BR9A 1KAXA 5AQYA 2Q97A 3CERA 3DAWA 2IIRA 3HSCA 4MLEA 5FPDA 5EX5A 1GLLO 5KPRA 1H1VA 2GEMA 1KAYA 3VESA 2A41A 2W41A 3AAQA 4FSVA 3CETA 5LJVA 2KHOA 2P9LB 4CZGA 3A5NC 4DHYA 3LDQA 2E8AA 1YAGA 1BUPA 2GTDA 1V4TA 1HKGA 3FZLA 1NGDA 5AQKA 3GBTA 1XC3A 2Q31A 4H0YB 3LM9A 3P4IA 3BF1A 3H1QA 4LC9B 3QBXA 4CBUA 5BRDA 3CHWA 2VWBA 3ZEUB 4K25A 2QWOA 4BVOA 2D0OA 2HOEA 1OKJA 2YCHA 4BRQA 3LDOA 3FFKB 1WUAA 4BRNA 4BQZA 1BA0A 3QMLA 4EAHD 2DPNA 1XUPO 3MN5A 4MO4A 4XH4A 3LM2A 3UKRB 4BRIA 5BRHA 5AQVA 5AQFA 2ZGZA 1X3NA 4K41A 4CZKA 5F1XA 1KAZA 5ADXA 1BU6O 1T6DA 2WUSA 4H5NA 3VEVA 3MK6A 3D2EB 2H3GX 3WQTA 3SJHA 2PAVA 3MCPA 3CJCA 3FZHA 4H03B 4H0XB 4RCHA 3A0IX 4BR2A 3R6MA 2A3ZA 2P9UB 3VEWA 2PBDA 3O80A 1P8ZA 1DGKN 4XEIA 2NRHA 3VEXA 3UKUB 4BRMA 2ASPA 4HTLA 2E2PA 3EN9A 3MMVA 1J6ZA 3VENA 4BROA 3BUZB 4AM6A 4IXCA 3H1VX 3A8YA 4GY2B 1BWFO 1C0FA 1X9JA 1YVNA 1C0GA 4FWNA 4JNEA 4BVPA 3S41A 4GNIA 5TKYA 3EKSA 3EO3A 3HBTA 4Y0WA 4KBOA 3KZBA 2FSJA 3WUHA 4BR4A 1NGJA 5ELZA 4H5RA 3VOVA 4CJ7A 2V7ZA 4F9OA 4CZFA 5BPMA 5CE3A 1U6ZA 1RFQA 4FWMA 3WEEB 3ULEA 2E1ZA 4H5WA 4NB4A 3A5OC 1D4XA 5EY4A 2QW9A 3A5LC 3CI5A 4CZMA 3ZEUA 5FPNA 4BRLA 1HX1A 4NO7A 3IMXA 4PKIA 4BC5A 4CZLA 3IDHA 4EIAA 1GLCG 3CJBA 4BGAA 1R59O 1BDGA 3QICA 2E2NA 2AP1A 3KHYA 5AQOA 2I7PA 4CZHA 2YHYA 4I6MA 4BRFA 1TYQA 4FPBA 2YI1A 4PKGA 3QFUA 5AQJA 3ZETA 3RSEA 3KVGA 3O08A 1LCUA 3D2EA 1BOTO 3AY9A 4YDUC 1E4FT 4B1XB 4IWVA 3U9ZA 2ASMA 3W0LA 3VGMA 2P9NA 1JCEA 1ESVA 3O6WA 1GLJO 1MA9B 4BGBA 3UB5A 2P9UA 1QZ6A 5ADXH 2IVPA 5EVZA 3U4LA 3O1WA 2A5XA 2FLOA 1WOQA 5AFUH 1JCFA 3UKUA 3I33A 4ISGA 1JCGA 4B1WB 3DXKA 3DXMA 3ULEB 4MO5A 5BREA 5FPMA 1BG3A 1LOTB 4DCHA 3TU5A 2AA4A 4H0TB 3O5BA 2ASOA 4CD1A 2ITMA 5F2RA 3CJAA 3FZMA 4WQ4C 2V51B 5AQNA 3MN6A 3SMSA 2W40A 2BTFA 2HF3A 1NGAA 1HLUA 3VPZA 2ZGYA 1Y64A 1ZBSA 2ZWHA 3LDPA 3OHRA 4I6MB 3WEEA 3VETA 2V7YA 3CJ7A 3D7EO 1QQMA 4BREA 1TYQB 2CGKA 3ZETB 2BUPA 1YUWA 3MDQA 3RSEB 2Q1NA 5AQHA 4B1ZA 2YHWA 3CJ9A 4BC2A 5FPEA 5KQ8A 1MDUB 3IUCA 3DJCA 4DQ8A 4FWRA 3WXLA 2P9NB 4JN4A 5AQQA 2Q0RA 3IFRA 1NM1A 4WQ5C 3H6EA 3MN9A 4H5VA 5AQTA 1SAZA 4B1UB 2E2OA 5AQIA 3BEXA 1NGEA 5AQPA 3BP8A 4IJAA 4A62A 1TUUA 4CZJA 4FWOA 5AZIA 2A42A 1NMDA 3ZX0A 1K8KA 3L0QA 3DXKB 3DXMB 1NGIA 5F0XA 1DKGD 4M7YA 3LDNA 4O8KA 4QS9A 3WXIA 1T44A 5EOYA 3GG4A 2Q0UA 4FOIA 3R8EA 3ZX2A 3FGUA 3ATVA 4BR0A 2FXUA 3ZX3A 3B8AX 1NGGA 1NGBA 2Q36A 2GELA 3TPQA 3C0BA 1Z6RA 4A61A 4CD3A 2A6AA 4WYBA 4ISFA 5AQXA 1QQOA 3M1FA 1HKCA 2CGJA 5I9EB 1RGIA 4O5FA 4BR5A 4C23A 1ATSA 2P9PB 2V52B 4BRHA 1E4GT 1HKBA 3FLCO 1MWKA 4PL8A 3HTVA 3L4IA 3EZWA 1U2VA 5AQSA 3QFPA 5BPNA 4RWTA 4BRKA 1GLEG 2HMPA 3F9MA 5E26A 4BRAA 3HZ6A 5JLFA 3R9PA 2IVNA 2QXLA 2HF4A 5JICA 1QZ5A 4FWSA 4H5TA 2QWQA 5AZIB 3WT0A 2P9KB 1K8KB 5JLHA 1HPMA 1RDWX 3VF4A 1NGCA 1KXPA 3VERA 5EXWA 3ID8A 1GLAG 2UYTA 4QS7A 4IO8A 2QWNA 2CH6A 2FSNA 2P9SA 4BRPA 3VEOA 3VF6A 4FWLA 4YDUA 2P9IA 4CZIA 3M3ZA 5AQZA 4BRCA 2QWMA 2E88A 4H0PA 1ZC6A 1S3XA 3C7NA 2QWLA 4BR7A 5KPTA 4JAXA 1IJJA 2E1YA 1DEJA 5BRFA 3CJ1A 4K43A 4CZEA 3JXUA 5BPLA 1ZXOA 1HUXA 3WQUA 3WXKA 4H0OA 1QHAA 4PKHA 5BR9A 2ZF5O 5BN8A 4FL9A 2EWSA 5AZJA 1U2VB 3JS6A 2CGLA 3BF3A 4A2BA 4FWKA 5BN9A 4QS8A 3W3DA 2Q2RA 1MWMA 4WQ4A 1NGFA 4B9QA 3QB0A 1ATNA 4FOEA 5JMVA 2P9PA 5LY3A 1X3MA 3VGLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3G25A 1T6CA 3OYLA 1NOYA 1B9FA 3K0SA 4MQ3A 2DFFA 1W97L 1SUQA 3GL1A 1W2BM 2NLXA 1TKDA 3ZSWA 3I56N 2P9SB 3HJFA 3O4WA 5KGXA 2UXCK 4WQ5A 2HBKA 4CERA 2KW4A 4FJGA 2ZD1A 1I94K 3H3OB 3GOIA 4PA1A 3HM9A 5AFUA 4MFBA 3L6QA 4KFBA 5C42A 3NE6A 1VQ7N 4DR1K 4BG8A 5KPZA 4JRPA 3QERA 4BY9C 3Q7BA 4H0VB 3PLAA 2J4RA 1D8YA 3AVMA 1VQON 1YJWN 5SWMA 1IO2A 1QQNA 1UWBA 3DMJA 3VQDA 3I8BA 4DV6K 4DFKA 3L8BA 1L3TA 3DLBA 1JLBA 3DLGA 5AQRA 4DR3K 2QTDA 4I2PA 4FLXA 2YNIA 5M1FA 2RF2A 1GLFO 4IJNA 3NF8A 4DR5K 3HI0A 3HYFA 2WONA 1W7AA 1IBLK 2GWJA 5LJWA 3G6EN 3FZFA 1W0HA 1NBWA 5AQGA 3PX6A 4B1YB 3PSIA 5B8HA 4CE9A 3PO5A 4XIUA 4BDZA 2ITGA 3TABA 1YVUA 4RTFD 3S9HA 5HLFA 1RT5A 2UXDK 1NJYA 3K5NA 1VSFA 3OYDA 4FM0A 3ZSYA 3HSCA 4LH4A 4IFVA 4CJWA 2YKMA 4KB0A 3OA9A 3VQPA 5KPRA 2KTQA 3OYNA 3VESA 4CK1A 3V9XA 4FSVA 1BL3A 4KH6A 1YIJN 4DHYA 1T3VA 4WCEL 1OH6A 3MEGA 1BUPA 2GTDA 3LP0A 1V4TA 3CFPA 2R7YA 3OYCA 4HCCA 1XC3A 2Q31A 5HRRA 3CCRN 1D9DA 4CIFA 3CCLN 4CBUA 2X78A 3CHWA 4IKFA 1K6YA 1S6QA 3QLHA 1NOZA 4DS4A 1BQNA 2QWOA 3LDSA 1VSEA 4BRQA 3KIOA 3LDOA 3PUFA 4AHSA 4FXDA 1HMVA 4BRNA 3QMLA 4LFAK 4EAHD 3OYMA 5EU7A 4DF8A 1HNWK 2O8DA 1RTHA 4Z4HA 4KREA 4MO4A 3AO2A 3NF9A 3UKRB 5AQVA 4CZKA 4TSXA 1KAZA 5F1XA 4DQSA 3OBYA 1KD1O 4H5NA 1VSJA 4C1NK 2H3GX 3SAGA 1IKWA 4A57A 4B08A 2P51A 3MCPA 4H0XB 3TTCA 4RCHA 4JYAK 1RT7A 4W5TA 2OPRA 3I8DA 3R6MA 2A3ZA 1X1PA 2PBDA 4ID5A 1KCFA 3K9JA 3EE8A 1P8ZA 2X74A 4IG0A 1O1WA 2XO7A 1VHXA 4HTLA 1S5JA 1HNXK 4BROA 4KV8A 4AM6A 3LALA 4GY2B 1IH7A 1C0FA 3QESA 1S1TA 3RWUA 4FWNA 4N56A 4K8ZA 4GNIA 3EKSA 3DRPA 4KTWA 3NCIA 4CCHA 3ASMA 4N47A 4Y0WA 2FSJA 3VOVA 3K57A 5CE3A 3K5MA 2IC3A 1U6ZA 1XHXA 2OPQA 4KHPK 4LF5K 1RT1A 3TR8A 1OVYA 4HUEA 5HRNA 2QI2A 4BRLA 3IMXA 1GLCG 1BDGA 5KRTA 1HPZA 3AA2A 2A1RA 4FPBA 2UUCK 5CZ2A 3HPGA 3JYTA 3OS1A 3RMBA 2VGMA 3T1HK 4DR7K 3D2EA 4Q0BA 3AY9A 4NXMK 1E4FT 4CFAA 3VN5A 2X6SA 2NRTA 3U9ZA 1TL3A 1B9DA 1WSHA 3O4QA 3SCXA 1Z25A 1JCEA 4DTPA 4C8KA 1ESVA 4IBNA 3THWA 4F2RA 1YJNN 2HW3A 4C1NI 4E1NA 3UB5A 3OTOK 3L2QA 1C1CA 5EVZA 2RHKA 3U4LA 3OS0A 1RNHA 3TAEA 1QSSA 1J53A 3I33A 1RDDA 3M5RA 1ZBLA 3CPEA 3IAYA 4ILJA 3ZSVA 2HHTA 4ISGA 4B1WB 3LP3A 3DXKA 1TKZA 3LANA 3VQ5A 3J7ZO 1EO1A 5BREA 4M41A 3HRGA 1EX4A 2AJQA 1MU2A 1NJIO 4H0TB 4H8KA 5JVGL 4IFYA 2O8FA 1C6VA 5AQNA 3SMSA 2W40A 1RBTA 3ENBA 1YT3A 4WFBL 4CJVA 1OVQA 3CYMA 4I6MB 3WEEA 2KLAA 1VSLA 3D7EO 4X65K 3SZ2A 4BREA 4DR2K 1L5UA 2YHWA 4CGJA 4KPYA 1VQPN 4NLBA 4DV0K 3IUCA 1JLEA 4DQ8A 3KWGA 4HVJA 3RMAA 5AQQA 1RDBA 4CHQA 3IFRA 3L3VA 4WQ5C 3H6EA 2G8UA 4ILHA 1SAZA 3QO9A 5I42A 1NGEA 2DFEA 3OYJA 5AQPA 3BP8A 4IJAA 4IDKA 3ZX0A 1K8KA 4RG8A 3P38A 1DTQA 2YNHA 1T44A 1FXXA 2IGIA 1Q81O 3PX0A 4YY3K 4BR0A 2VWJA 1NGBA 3NF7A 4QCLA 1VQ8N 1I39A 3G71N 3C0BA 1Z6RA 4A61A 4DFJA 2UUBK 1RDCA 4CFDA 5MLCQ 3T7ZA 1ITGA 4FLWA 1IBMK 3OVNA 3T3FA 2BDPA 2V52B 2IDOA 1WNSA 2QKKA 4PL8A 4AHCA 3EZWA 2WFBA 5AQSA 1FW6A 5GAGP 4FJXA 4GVMA 3MWPA 4E7JA 1NJZA 4CJUA 1C1BA 1X9SA 1K9MO 1S6PA 1U48A 1ASUA 1T7PA 2D0CA 3CG7A 2IVNA 2W6LA 3SAHA 4DV2K 3TSPA 3V1QA 5JICA 3AO5A 4FWSA 4H5TA 1ZBIA 1X9WA 4DQIA 2BH1A 4CIGA 1KTQA 1C0MA 1HPMA 4DQPA 4LH5A 3VERA 1KXPA 4Z4EA 1NKBA 5J2QA 3EYZA 4IOCL 4FVUA 3CFRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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