3KVGA

Crystal structure of the n-terminal domain of hsp70 (cgd2_20) from cryptosporidium parvum in complex with amppnp
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
b'GPAIGIDLGTTYSCVGVWRNDTVDIVPNDQGNRTTPSYVAFTETERLIGDAAKNQVARNPENTVFDAKRLIGRKFDDQAVQSDMTHWPFKVVRGPKDKPIISVNYLGEKKEFHAEEISAMVLQKMKEISEAYLGRQIKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKKGTGERNVLIFDLGGGTFDVSLLTIEDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVEFCVQDFKRKNRGMDLTTNARALRRLRTQCERAKRTLSSSTQATIELDSLYEGIDYSVAISRARFEELCADYFRATLAPVEKVLKDAGMDKRSVHDVVLVGGSTRIPKVQALIQEFFNGKEPCKAINPDEAVAYGAAVQAAILNG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock 70 (HSP70) protein
publication title Crystal structure of the N-terminal domain of Hsp70 (cgd2_20) from Cryptosporidium parvum in complex with AMPPNP
rcsb
source organism Cryptosporidium parvum
molecule tags Chaperone
total genus 124
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3kvgA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3kvgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3kvgA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3kvgA04
2YHWA 3ZX2A 3CJ7A 1BU6O 4H0TB 4BRCA 1BUPA 3CQXA 5KQDA 2WUSA 5AQGA 1DEJA 4CZIA 3CETA 2YJEA 4EIAA 3A5NC 5BREA 3KHYA 3LL3A 3DWLA 2GEMA 1K8KA 5EX5A 4PKIA 1KAXA 3GL1A 2VWBA 2YI1A 2P9KA 1NMDA 5AQTA 4IZ9A 3VF4A 4B1VA 4FSVA 2P9UB 3LDOA 2CH6A 3D2FB 4BGAA 5E84A 5FPEA 2E2PA 2P9PB 2J4RA 4FWRA 2Q97A 2HOEA 1WUAA 3M6GA 1MWKA 2HF4A 3R6MA 5LJWA 4CZHA 3DXMB 2HMPA 4FWPA 4HTLA 3AAQA 3A0IX 4BC5A 2A40A 3SMSA 3HSCA 5AQZA 3ULEB 4JNEA 3OHRA 4XEIA 3MN5A 4GY2B 4CD3A 3VETA 3HM8A 2QWLA 4AM7A 5AQMA 2E88A 3U4LA 1ATNA 1BWFO 1C0FA 1QZ6A 3VEOA 2IVNA 4A61A 3O6WA 4H0XB 5F1XA 5CE3A 4CZGA 4QS7A 3FFKB 2NRHA 3H1VX 3WXLA 1IJJA 4CZMA 2FSKA 2IIRA 3SMPA 2P9LB 3U9DA 4JHDA 4B1ZA 5EOYA 4FPAA 4O5FA 3VGMA 2E2OA 5AZJB 3FZMA 3KZBA 2YHXA 2ZF5O 3H6EA 4KBOA 1NGHA 2A42A 3BUZB 3JS6A 3WXJA 4BROA 2F9WA 1Z05A 3KVGA 4FO0A 2E1ZA 3O4WA 1U2VB 4BRAA 1Q18A 4RTFD 1NBWA 1T44A 5EXWA 2ASMA 4BRLA 3L6QA 1QQNA 1RFQA 4DB3A 2F9TA 1P8ZA 4GNIA 2PAVA 4H5WA 2I7PA 3MK6A 3QDKA 5JMVA 3O80A 3MN9A 3A5MC 4FOIA 2D0OA 4DQ8A 4MLEA 2QWNA 1RDWX 4BVPA 2Q0UA 3DJCA 4H0OA 2FF3B 1R59O 4BR9A 3BF3A 2D0PA 3G25A 3VEYA 4M63C 5AQQA 4IJAA 1XUPO 5JLFA 3M1FA 3RSEB 1U6ZA 3TPQA 1SQKA 5TKYA 1NGIA 4JAXA 3MDQA 3MCPA 1XQSC 3FLCO 5KPRA 1DGKN 3DAWA 1Z6RA 1QZ5A 3QBXA 2V7ZA 3FGUA 5BPNA 5KPZA 1MA9B 2A41A 3TU5A 1HKCA 2A3ZA 4WQ5A 3VEXA 5JLHA 5AQSA 1BG3A 5B8HA 1KAZA 2DPNA 4XH4A 3HZ6A 3I33A 1KXPA 2HF3A 1YVNA 4I6MA 3ZX3A 4BRNA 3O1BA 3HI0A 4BG8A 5AQXA 4CZKA 3GOIA 4EHTA 1H1VA 4BR2A 2Q36A 5AQRA 3UKUA 1NGBA 3C7NA 2GTDA 5BRFA 4QS9A 3D2EB 2V51B 4L3QA 1NGFA 3VF2A 3FE1A 1GLBG 4H5TA 3VF6A 3FZHA 2QM1A 4MO4A 3VOVA 4JD2B 2P9NB 3CJAA 4PKGA 1HLUA 3S41A 1NGJA 5ADXA 2QW9A 1JCFA 2FF6A 4M7XA 4EFHA 5BN9A 4WQ5C 3ATUA 1BA0A 1YUWA 5AQLA 4K25A 3UE5A 3A8YA 2QWOA 3L0QA 3ZEUB 2Q31A 3IFRA 5BPLA 1OKJA 2YHYA 3CJCA 3WEEA 4A2AA 4Y0WA 3VERA 1HKBA 2V52B 5AQVA 2P9IB 4DHYA 1HJOA 1KAYA 4BRDA 3FZKA 1V4SA 1C0GA 1QQOA 1SZ2A 2H3GX 3CJ9A 1GLAG 3DXMA 3BEXA 2CGLA 1ZXOA 2ASOA 3O5BA 3HTVA 3IDHA 2GWJA 5EY4A 3FZFA 1LOTB 4BR7A 4O8KA 4PL7A 2IVOA 1JCEA 4BC4A 1TYQB 4CI6A 3EZWA 5AQHA 3R9PA 2IVPA 3LDLA 4FWMA 4BRGA 3VGKA 1NGDA 3GDQA 2E20A 5AQYA 4YDUA 1V4TA 4J8FA 2PBDA 5FPDA 2ZGZA 3H45C 4BRKA 1G99A 4PL8A 3B8AX 3WQUA 5BR9A 3QBWA 4ISEA 4CBUA 5BRDA 5JICA 5AZJA 4FL9A 1MDUB 4IJNA 4LC9B 4BRQA 2E2NA 4BC3A 4PKHA 4K43A 3SJHA 4WQ4A 1TUYA 3ENOA 5EVZA 5BN8A 3ID8A 2Q0RA 4IO8A 1IG8A 4H0PA 1LCUA 4CZJA 2OANA 1ATSA 4RWTA 3UKRB 2P9SA 3R8EA 4IXCA 5ADXH 1ZC6A 3IMXA 1J6ZA 4H0VB 3EL2A 4H5NA 2E8AA 3ZETA 4BRIA 5AQIA 1SAZA 4BRHA 4FWKA 1ATRA 1XC3A 2Q2RA 2VCPA 4YDUC 3WXKA 3QB0A 1X3NA 2A6AA 4MLHA 4BRMA 3GE1A 3JXUA 4M7YA 2YCHA 4MO5A 4BG9A 2NLXA 4BREA 1X9JA 3AAPA 3RSEA 1HKGA 4BR0A 1TUUA 2FLOA 3LDPA 3EO3A 5LJVA 3O08A 1WOQA 4CJ7A 5BPMA 5AZIB 3I8BA 3O8MA 4WQ4C 1GLFO 4B1UB 4AM6A 1NGAA 3ZX0A 5AR0A 1GLDG 3WXIA 3W3DA 1BDGA 3WT0A 4BRFA 4H03B 5AFUA 3DXKA 3MN6A 1YAGA 5FPMA 4DCHA 4XH5A 4K41A 4BGBA 2NZTA 4K42A 5BRHA 1QQMA 3LDQA 2ITMA 3VEVA 4I6MB 5AQFA 3MMVA 3QMLA 4JD2A 1CZAN 1ZBSA 2QWRA 4HWIA 2P9NA 4H5RA 3A5OC 3O1WA 5AQJA 1BO5O 2CGJA 3H3OB 1NLVA 2E2QA 3CIPA 1JCGA 4FWQA 2D4WA 1T6CA 2P9UA 3CJ1A 3D2FA 1GLJO 4B9QA 4ISGA 2CH5A 3VEZA 1K8KB 2I7NA 2V7YA 3HBTA 3ZEUA 4BQZA 1NGCA 3LM2A 2P9PA 2KHOA 2P9KB 1DKGD 3L4IA 2VYPA 2ZWHA 1S22A 3FZLA 4EAHD 2D1KA 4BR4A 2FXUA 1YXQA 2P9IA 5F0XA 3FR0A 2W41A 4H0YB 3ULEA 3H1QA 5AQNA 5AQUA 3WEEB 4FOEA 4A62A 4FWLA 4E1JA 4FWNA 3P4IA 1HPMA 4BVOA 3CHWA 2E1YA 1QHAA 4BR5A 3LDNA 3W0LA 4CZLA 1TYQA 3GG4A 3A5LC 5E26A 3VEWA 5I9EB 4RCHA 3M3ZA 1BOTO 1RGIA 2QXLA 1X3MA 3J8AA 5F2RA 1GLLO 2QWMA 2P9LA 3U9ZA 3WQTA 1BA1A 1GLCG 3CERA 4WYBA 2ASPA 3ENHA 1HUXA 4NB4A 3QFPA 3ATVA 2QWQA 5AFUH 2QWPA 2Q1NA 1E4FT 5ELZA 4JHDB 1EQYA 5FPNA 1U2VA 4XH1A 3WUHA 5LY3A 4H5VA 4C23A 2GELA 3SK3A 3VGLA 2BUPA 2FSNA 2W40A 4QS8A 3GBTA 2GUPA 4FWSA 1GLEG 1S3XA 4CD1A 1NGGA 2EWSA 5KPTA 3UKRA 4BRPA 4A2BA 2AA4A 3CI5A 1NGEA 2A5XA 5AQOA 5AQWA 3C0BA 2FSJA 4FWOA 1T6DA 3MN7A 3EKSA 4BQLA 5AQPA 3QICA 2P9SB 3SLCA 3CQYA 1E4GT 3VESA 4CZEA 4NO7A 3F9MA 3ZETB 4EHUA 3H3NO 4CBXA 3QFUA 4CBWA 3D7EO 1D4XA 4Z94A 2AP1A 3BF1A 3BP8A 5AZIA 4IWVA 2ZGYA 3AY9A 1NWKA 3EN9A 4B1YB 1NM1A 3LM9A 2UYTA 1ESVA 4ISFA 4CZFA 2BTFA 2YJFA 4FPBA 4B1XB 4B1WB 3EKUA 1MWMA 5KQ8A 3H46O 3D2EA 3VPZA 3UB5A 4F9OA 1Y64A 3AARA 3IUCA 3VENA 1HX1A 2CGKA 4JN4A 2GWKA 3U8XA 3UKUB 3CJBA 4BC2A 3DXKB 3C7NB 5AQKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YHWA 1SL2A 3ZX2A 5CZ1A 1BU6O 2HB5A 1B9DA 4BRCA 1BUPA 4CZIA 3L2VA 3CETA 4EIAA 1X9MA 3P39A 1JXEA 1HQUA 4V19S 3HO1A 3BGRA 3R1XA 5BREA 3LL3A 2P5OA 2GEMA 2Q3SA 4FJKA 5EX5A 1KAXA 5J2QA 3P38A 3AVFA 1VSFA 3VF4A 4IZ9A 2QXFA 3BZKA 4B9VA 2BRZA 4H8KA 1WNSA 3LDOA 3VQDA 1EKEA 2OTJN 4CF8A 1ZVEA 1RBTA 3AVCA 3C65A 2Q97A 3M6GA 2R7YA 2HF4A 3OYDA 1U45A 1HRHA 3CCQN 3JSMA 3AAQA 4BC5A 2A40A 1ZVGA 1BQMA 4JKEA 1VAZA 1C55A 1RTJA 1B9FA 1I39A 2YEOA 4E7JA 4CD3A 3VETA 3HM8A 1JLGA 5J1EA 4GW6A 1GPTA 1KV0A 1BWFO 4KFBA 4M45A 3CCVN 3V1RA 3OYEA 4CJFA 4DR3K 2QTDA 3O6WA 3WNGA 1HR0K 4LSNA 1J5OA 4CZMA 2FSKA 3VQEA 5DM6L 3TAQA 2F8SA 3SMPA 4EP4A 4O5FA 4DV1K 3OW2M 3AVIA 4DTJA 1HNVA 2ZF5O 4DR5K 1P00A 4KBOA 4PWDA 1S1TA 1NGHA 1DTTA 2F9WA 3NE6A 3KVGA 4FO0A 3VQ9A 1IH7A 1Q18A 3C94A 3NDKA 4AAZA 1RFQA 2G8UA 4E7LA 5J2NA 1OH6A 2RHKA 4IG3A 2PAVA 1ZBUA 5JMVA 3MN9A 2OZSA 1CZBA 4DQ8A 3RMCA 4N41A 3QETA 2QWNA 1RDWX 4KHQA 2Q0UA 1RBUA 1R59O 4FZZA 3D6RA 3TAFA 3MEGA 3VEYA 4BE2A 4CJUA 4YY3K 1I6GA 5JLFA 3N4PA 3RSEB 1U6ZA 1OMYA 1CN2A 3SF4D 1NGIA 4YOXA 1VHXA 1XQSC 4DQIA 4OKKA 3NVKA 1QZ5A 3QBXA 2V7ZA 4Y1CA 5KPZA 1MA9B 3LZIA 1RDDA 4BE7B 1L3TA 3DI6A 4AEIA 1RNHA 1KAZA 5SZTA 1SL1A 1ZBFA 3AGKA 4CGHA 4CIGA 3I33A 1KXPA 2DFEA 4CJ5A 2Z1JA 4N56A 5J2MA 4DSKA 4BG8A 2MBKA 2GTDA 4FVMA 4QS9A 3D2EB 2V51B 1HMVA 1JKZA 4B9NA 2G8KA 1NGFA 5HROA 3FE1A 4ILJA 4CEFA 2OZMA 1Q86O 3FZHA 4CEQA 2QM1A 1XI1A 4JD2B 4IDHA 4PKGA 1NGJA 1JCFA 1XHXA 5LMUK 4Z4EA 2FBYA 2HVIA 4M7XA 4ID1A 4IFEA 2VWKA 1Z26A 3QERA 4WQ5C 4DSLA 1BA0A 3R2VA 5HOOA 1X9WA 3UE5A 1SKRA 1QSYA 2QWOA 3ZEUB 3QLHA 1Y97A 2ATQA 5BPLA 1OKJA 4JS4A 2YHAA 3WEEA 4A2AA 3TSUA 4ZTFA 4ZHRA 3MCAB 4I2QA 4IKFA 3RVCA 1HKBA 2UUAK 4AB0A 4BRDA 1C0GA 1SZ2A 3OVNA 2H3GX 5HL7L 1GLAG 2F7TA 3BEXA 4AQYK 5GIPA 4M42A 2KFZA 2HNZA 1NK9A 1JLQA 3IDHA 4W5RA 2IC3A 4FJGA 4PL7A 2IVOA 4FLVA 1RT3A 4A59A 4CI6A 4Z4HA 1VQPN 3TAPA 4F2SA 2YBRC 5AQHA 3OA9A 4KHPK 1J54A 3AO3A 4X62K 1NGDA 4F8RA 4M41A 4HUEA 1LQIA 5EU7A 1G99A 4H4MA 3ZT2A 4CF0A 3V9SA 3RMDA 4RW6A 3TSPA 2HBLA 4OPHA 4ISEA 5BRDA 1TL3A 4HUGA 1AYJA 2YKNA 4OO1J 2O4IA 1SN1A 1LAVA 4BY9C 1REVA 1W9HA 2QI2A 4FLTA 4NXMK 2W00A 3L2UA 2Q0RA 4IO8A 4BWJA 1LCUA 1FW6A 4CZJA 2YKMA 3PX0A 3V9ZA 3R8EA 4IXCA 3TTCA 1UGLA 4H0VB 4H5NA 1LWEA 1N36K 2E8AA 4CK3A 1J5EK 3ZETA 4BRIA 4LF7K 4KTWA 5FRNA 1SAZA 4YDUC 1W2BM 3M8QA 1VQMN 3E7UX 3QB0A 4B9MA 1X3NA 4MLHA 4BRMA 3GE1A 2SN3A 2LN8A 3SI6A 2NLXA 4BREA 4DTSA 1TK0A 2ASCA 4OPAA 1NKEA 5BPMA 3TAGA 2X78A 4E7IA 1VQKN 4LH5A 4UJ0A 3PUFA 4J2BA 1WT7A 3SBTA 2HHSA 1IBKK 4CIFA 1KFSA 3HM9A 3W3DA 3KLHA 1A5XA 1BDGA 4H03B 2LJMA 5AFUA 2WOMA 3MN6A 3T69A 1YAGA 1ASVA 3G4SN 1D9FA 4BGBA 4YOVA 2MZ0A 1U49A 1YIJN 4LFCK 1QQMA 3LDQA 5AQFA 4CF9A 2ETJA 4ID5A 3QMLA 4BACA 1CZAN 2P9NA 3PO4A 2XRIA 4H5RA 3OYJA 3A5OC 3NF6A 4RW9A 3CCMN 3VN5A 1N32K 1JLAA 2CGJA 1T05A 4B3RK 4FWQA 2D4WA 4R5PA 3LZJA 4OJRA 4HE7A 2AJQA 3M8PA 3VEZA 3CCRN 4B08A 2KHOA 5I3UA 3KWIA 3L4IA 1NOZA 1S22A 3MEDA 4BR4A 1OZZA 1D5AA 2B3CA 5BR8K 4HUFA 4BE0A 3CCLN 3DM2A 3E01A 3C6TA 5F0XA 3FR0A 5AQNA 3PX6A 4X64K 4FJLA 3QI7A 4DR7K 3CMEN 3ULDA 4BVOA 3THWB 3CG7A 1BIZA 1R0AA 3L8BA 5HP1A 4GMJB 3ZT3A 5E26A 3OY9A 3M3ZA 3HP9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2YHW A;  1SL2 A;  3ZX2 A;  5CZ1 A;  1BU6 O;  2HB5 A;  1B9D A;  4BRC A;  1BUP A;  4CZI A;  3L2V A;  3CET A;  4EIA A;  1X9M A;  3P39 A;  1JXE A;  1HQU A;  4V19 S;  3HO1 A;  3BGR A;  3R1X A;  5BRE A;  3LL3 A;  2P5O A;  2GEM A;  2Q3S A;  4FJK A;  5EX5 A;  1KAX A;  5J2Q A;  3P38 A;  3AVF A;  1VSF A;  3VF4 A;  4IZ9 A;  2QXF A;  3BZK A;  4B9V A;  2BRZ A;  4H8K A;  1WNS A;  3LDO A;  3VQD A;  1EKE A;  2OTJ N;  4CF8 A;  1ZVE A;  1RBT A;  3AVC A;  3C65 A;  2Q97 A;  3M6G A;  2R7Y A;  2HF4 A;  3OYD A;  1U45 A;  1HRH A;  3CCQ N;  3JSM A;  3AAQ A;  4BC5 A;  2A40 A;  1ZVG A;  1BQM A;  4JKE A;  1VAZ A;  1C55 A;  1RTJ A;  1B9F A;  1I39 A;  2YEO A;  4E7J A;  4CD3 A;  3VET A;  3HM8 A;  1JLG A;  5J1E A;  4GW6 A;  1GPT A;  1KV0 A;  1BWF O;  4KFB A;  4M45 A;  3CCV N;  3V1R A;  3OYE A;  4CJF A;  4DR3 K;  2QTD A;  3O6W A;  3WNG A;  1HR0 K;  4LSN A;  1J5O A;  4CZM A;  2FSK A;  3VQE A;  5DM6 L;  3TAQ A;  2F8S A;  3SMP A;  4EP4 A;  4O5F A;  4DV1 K;  3OW2 M;  3AVI A;  4DTJ A;  1HNV A;  2ZF5 O;  4DR5 K;  1P00 A;  4KBO A; 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