3KVGA

Crystal structure of the n-terminal domain of hsp70 (cgd2_20) from cryptosporidium parvum in complex with amppnp
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVWRNDTVDIVPNDQGNRTTPSYVAFTETERLIGDAAKNQVARNPENTVFDAKRLIGRKFDDQAVQSDMTHWPFKVVRGPKDKPIISVNYLGEKKEFHAEEISAMVLQKMKEISEAYLGRQIKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKKGTGERNVLIFDLGGGTFDVSLLTIEDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVEFCVQDFKRKNRGMDLTTNARALRRLRTQCERAKRTLSSSTQATIELDSLYEGIDYSVAISRARFEELCADYFRATLAPVEKVLKDAGMDKRSVHDVVLVGGSTRIPKVQALIQEFFNGKEPCKAINPDEAVAYGAAVQAAILNG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock 70 (HSP70) protein
publication title Crystal structure of the N-terminal domain of Hsp70 (cgd2_20) from Cryptosporidium parvum in complex with AMPPNP
rcsb
source organism Cryptosporidium parvum
molecule tags Chaperone
total genus 124
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3kvgA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3kvgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3kvgA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3kvgA04
4CZEA 1YUWA 4DB3A 3HM8A 5AQIA 3U8XA 4QS8A 3WEEB 3HZ6A 1BA0A 4FL9A 4JAXA 2ZGZA 4O5FA 4BR2A 2P9SA 4FO0A 4BGAA 4NB4A 4FSVA 4M63C 4FWOA 2D4WA 2YHWA 1QHAA 4H0VB 3EO3A 1ATNA 2IVOA 3I8BA 1ATRA 2FF6A 5AQQA 2Q97A 5AQPA 1ESVA 1HX1A 1TYQA 4BRQA 4IJAA 4CZIA 2VYPA 4QS7A 4CZHA 5AZIB 2QWOA 4FWNA 3FZLA 1GLCG 1T6CA 4YDUC 2QXLA 2AA4A 3FFKB 4PKIA 1IJJA 1ATSA 4H0PA 3H45C 1BWFO 4CZLA 3QDKA 4C23A 2YJEA 4BRPA 3WXKA 2QWQA 1P8ZA 1NGFA 3ATUA 4BRLA 1K8KB 1BO5O 4EHTA 5EX5A 1SZ2A 2NRHA 3VF4A 5AQZA 3F9MA 2HF4A 3ZEUA 3EKUA 3MK6A 1NGEA 2E2QA 3L6QA 3VEWA 4BC3A 4BRFA 3MDQA 4IWVA 3VGKA 4BR9A 3FR0A 3QFUA 4RCHA 5AQKA 2E8AA 2D1KA 5KQ8A 2KHOA 1D4XA 1S3XA 3ZETA 2FSNA 3ZETB 3M3ZA 1RFQA 2FXUA 3LDNA 4CZMA 3DWLA 4IJNA 1MA9B 3IUCA 5AQTA 1XUPO 4HWIA 2GUPA 4H0XB 1KXPA 3KHYA 4B1UB 4CZKA 4JD2B 5I9EB 1T44A 3B8AX 1LCUA 3LL3A 1DKGD 3DJCA 3CJ7A 3CJCA 2NLXA 4BRHA 2FSKA 4CBXA 2PBDA 4PKGA 5AQNA 2A42A 2FSJA 1C0FA 3H3OB 4H5RA 2GTDA 2CGKA 4J8FA 2ZGYA 3ENHA 4K43A 2F9WA 4BQLA 2PAVA 3G25A 5ADXA 4MO4A 3J8AA 4WYBA 3HSCA 1QQMA 1YVNA 2Q31A 2CGJA 5AQVA 2IVPA 2P9IB 4BRKA 1U6ZA 4CI6A 3LDPA 3KZBA 3W3DA 3ID8A 4H5WA 1QZ6A 3FZKA 1LOTB 2IIRA 2P9NA 3O5BA 4A2BA 3VOVA 3CETA 1XC3A 3I33A 5AQJA 1GLJO 3CQXA 4GNIA 2E1ZA 5AZJA 3L0QA 1GLDG 3WUHA 4B1WB 2J4RA 1TUYA 3ZX0A 2HF3A 2H3GX 4AM7A 2Q0UA 4FPAA 5AQHA 3ULEA 1U2VA 4FWKA 4K25A 3WEEA 3ULEB 1U2VB 5JICA 3MN9A 1E4GT 3LDLA 4FPBA 3ENOA 3D2FB 1NMDA 4B1YB 2Q0RA 4BVOA 2EWSA 1GLBG 2QW9A 4E1JA 3JS6A 5F0XA 5FPDA 3O80A 1JCFA 4FOEA 4WQ4A 2E1YA 3EN9A 5LY3A 5AR0A 5EVZA 3BF1A 3A8YA 4IO8A 2ZWHA 3GDQA 3BP8A 4PKHA 4CBWA 4FWQA 3WXJA 5AZIA 3CJ1A 1RDWX 4CZFA 1NM1A 4IZ9A 2P9PB 1Z05A 4FWSA 3OHRA 4XH1A 3EL2A 3MCPA 3CQYA 1DEJA 2YJFA 2OANA 4BRGA 3QBXA 5JLHA 5JLFA 2I7NA 1ZXOA 1K8KA 2A40A 3DXKA 4L3QA 5ADXH 2QM1A 3DXKB 1NGAA 4M7YA 3VESA 4BGBA 4CBUA 3HTVA 4ISEA 3KVGA 3VEYA 5B8HA 5EXWA 2E88A 5BPNA 2P9UB 3O1WA 3GE1A 5E84A 3VGLA 4BC5A 1BA1A 1QQOA 3QMLA 4BR4A 3L4IA 1C0GA 2HOEA 4BG8A 3FE1A 4CJ7A 2P9LB 3CJ9A 2ASOA 3FLCO 5ELZA 3FZFA 2CH6A 4BR5A 2GEMA 3D2EB 1KAXA 3C7NB 1NWKA 4PL7A 2ASMA 4EFHA 4BRMA 1KAYA 5KPZA 4BC2A 4JD2A 1HKBA 4BVPA 4MO5A 5AQSA 3RSEB 3P4IA 5FPEA 2FF3B 2ITMA 1BOTO 1BU6O 2YHYA 2V51B 3UE5A 3FZHA 4WQ4C 4CZGA 5CE3A 3AAQA 1WOQA 2F9TA 2DPNA 1S22A 3BUZB 2IVNA 4K42A 3UKRA 5LJVA 2D0OA 1HLUA 3WXIA 4FWRA 1QZ5A 4M7XA 3UKRB 5AFUH 4I6MB 5AQRA 4CD1A 4DQ8A 4H0YB 1V4TA 5BPLA 3JXUA 1MDUB 4H0OA 1NGIA 4A61A 2P9IA 4H5TA 2A41A 4BRCA 3H6EA 3H1QA 3SLCA 3DXMB 3A5LC 5EOYA 3MN5A 1MWKA 3VEZA 2P9KB 2QWMA 1HUXA 3VEOA 1KAZA 3LDOA 1HKGA 5BRFA 3R6MA 3U4LA 2YI1A 5AQWA 3BEXA 1E4FT 5F1XA 4Y0WA 5FPMA 1GLEG 4B1XB 3UKUB 3VF2A 3VENA 4A62A 1X3NA 1T6DA 3AARA 3QICA 1QQNA 2BTFA 2V7ZA 2D0PA 4BR7A 4F9OA 3VETA 3A5MC 4ISGA 3A0IX 4WQ5A 1J6ZA 4H03B 5BN8A 3D2FA 1TUUA 3LDQA 2Q2RA 1NGGA 2E2NA 2NZTA 3H1VX 4LC9B 3VGMA 3AAPA 3O8MA 3SMPA 3EZWA 4CD3A 4IXCA 5KPTA 4MLHA 4QS9A 3WQTA 3IDHA 4JHDB 1H1VA 4K41A 2VWBA 2QWLA 4H5VA 4EIAA 1CZAN 3WQUA 5AFUA 3QB0A 3D7EO 5AQMA 5AQGA 4BROA 2QWRA 4FWLA 4BRNA 1OKJA 5AQLA 1IG8A 2P9PA 2P9SB 3H3NO 1GLFO 2HMPA 4EHUA 3QFPA 3TU5A 3SK3A 2QWNA 4GY2B 3UB5A 3VEVA 5BRDA 2A3ZA 3A5NC 5JMVA 3AY9A 3LM9A 1TYQB 1NBWA 4FOIA 5E26A 3ZX2A 3IFRA 4XH5A 3U9DA 4BG9A 1SAZA 3IMXA 2FLOA 1NGJA 2P9UA 3GL1A 4BREA 2YHXA 3MN6A 1NGBA 4JNEA 2AP1A 1BG3A 4BQZA 5FPNA 4HTLA 1Y64A 3ZX3A 2GWKA 2P9LA 1X9JA 3MN7A 3O4WA 5AQUA 2GELA 3WXLA 2E2PA 3D2EA 3C7NA 2V52B 3R8EA 5BPMA 1JCEA 4BC4A 1Z6RA 4AM6A 2Q36A 4H5NA 1NGCA 3CERA 3CIPA 4WQ5C 3SJHA 1HKCA 1WUAA 2WUSA 3ZEUB 4B1ZA 5BREA 2GWJA 4XEIA 4O8KA 5KPRA 2VCPA 4CZJA 1V4SA 3RSEA 1BDGA 3LM2A 3EKSA 3FZMA 1EQYA 3DAWA 3O6WA 2E20A 2Q1NA 4MLEA 4EAHD 3TPQA 2CH5A 2YCHA 3M6GA 1ZBSA 1GLAG 1RGIA 5AQFA 3GG4A 2W41A 4XH4A 1NGDA 1Q18A 1YAGA 3CHWA 5TKYA 1DGKN 4I6MA 5AQOA 1HPMA 1X3MA 3CI5A 3VERA 2A6AA 2V7YA 1NLVA 4B1VA 4H0TB 1JCGA 5KQDA 2ASPA 2A5XA 1HJOA 5BR9A 1NGHA 4JN4A 4BR0A 3S41A 3MMVA 1BUPA 5BN9A 3DXMA 3R9PA 4Z94A 2QWPA 1XQSC 2ZF5O 3O08A 3QBWA 2P9KA 3A5OC 3C0BA 4YDUA 5AQXA 4FWPA 1G99A 1GLLO 5AQYA 4B9QA 4KBOA 1MWMA 4RWTA 2BUPA 3HI0A 3UKUA 1R59O 2I7PA 2UYTA 3HBTA 3FGUA 4PL8A 3H46O 4NO7A 4BRAA 3WT0A 5EY4A 3GOIA 4FWMA 3M1FA 3O1BA 4A2AA 2P9NB 3BF3A 3U9ZA 4ISFA 4DHYA 2W40A 3SMSA 3CJAA 3GBTA 2CGLA 2E2OA 3VF6A 5BRHA 4BRIA 5F2RA 4DCHA 5AZJB 4JHDA 1SQKA 3VEXA 1YXQA 5LJWA 4RTFD 3ATVA 3W0LA 3CJBA 3VPZA 4BRDA 1ZC6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DTQA 4CZEA 3EZ5A 3DMJA 4DB3A 1JLEA 4E7KA 1SNBA 3ZYYX 1NOYA 1JZBA 1U4BA 2ZJRL 3HZ6A 1BA0A 4FL9A 5KRTA 1YJ9N 4BR2A 1E3MA 5HP1A 3ISNC 2YHWA 1SN1A 1QHAA 2VY6A 3QINA 3D6RA 2KBKA 4H0VB 2XO7A 3PLAA 2VGNA 2FF6A 2F4VK 3AGKA 1ESVA 1TYQA 4M3RA 1S5JA 1VRUA 4IJAA 4A57A 3AVJA 2VYPA 4QS7A 4CHZA 1SKRA 2G8WA 4NCAA 2I61A 3FZLA 1C55A 4Z4EA 2YNHA 3E7RL 3NF6A 3DLGA 3V4IA 2WC9A 3TTFA 4DV3K 3S3OA 4DS4A 2E5LK 4PKIA 4CGHA 4ID5A 3SUOA 2IS3A 1HJRA 4CZLA 3KLGA 1IKXA 4GKJK 2YJEA 3SCXA 1N8RO 4DS5A 3WXKA 1KVBA 1P8ZA 4BRLA 1K8KB 1BO5O 1NG9A 5EX5A 4Z4CA 1WSHA 4HUFA 5FROA 3VF4A 5M1FA 3ZEUA 1BK8A 2HF4A 3EKUA 1ZYWA 1NGEA 3VQQA 4CFCA 1EWQA 3VEWA 4GKKK 4BRFA 4IWVA 3VGKA 4M3TA 3HVRA 3S3NA 1RT7A 3F2KA 4M41A 5AQKA 2E8AA 2D1KA 5KQ8A 2KHOA 1C0MA 4IDKA 3VA0A 2FSNA 1EP4A 3I55N 3ZETB 1F21A 1WSFA 3DRRA 3L2RA 4CW7B 4CGFA 1RBRA 4LH5A 4B9SA 3NGYA 4FJKA 2LR3A 4DTMA 4KTZA 5AQTA 4CEBA 3OYIA 2LJ7A 4J2AA 1T44A 3SAGA 3EY1A 3CC2N 2UXCK 3C6AA 3KK3A 3CJ7A 4QOZB 2G8KA 2PBDA 3CW4A 1NJYA 2ITGA 1A5VA 3O9SA 4A5BA 1VQPN 1L4VA 5J2NA 3J8AA 1QQMA 1YVNA 3C6HA 1NU0A 2P9IB 4NXNK 1IBLK 3KWIA 5I42A 2HNZA 3ZT4A 3KZBA 3LWLA 3W3DA 3V1OA 4H5WA 1QZ6A 1RT2A 4JK7A 2KKZA 5M1KA 1WAFA 4KPYA 2YC1C 2P9NA 1OZZA 4CIGA 4FJHA 2Q3SA 3CETA 2C1GA 1WSJA 2HHHK 1QQCA 4GNIA 3CFRA 4O5BA 3L56A 4JKEA 1GLDG 1RTDA 1KCFA 1VQKN 3KD5E 5C2DA 1R0AA 3KP1A 3VQ9A 4FPAA 4B08A 1JJ2M 2A7TA 4FWKA 3WEEA 4OO1J 3ZT3A 4DF8A 3LDLA 1WT7A 4B1YB 2Q0RA 1NH5A 4DTRA 3JS6A 3VQDA 5EVZA 2HBMA 1RTHA 3KOWA 3THYB 4CJKA 3F5TA 3ITHA 1S9EA 2ASCA 5AZIA 3CJ1A 5FDLA 1RDWX 1XMOK 3R2VA 4LF7K 2JDQD 1CXUA 1VQ5N 5LMNK 5HLFA 1VQ6N 3QIOA 2LJMA 4XH1A 1U45A 1BMRA 2IC3A 1KVAA 2YJFA 3QBXA 4E7JA 3RMDA 4DLGA 2BH1A 4JI3K 1RTJA 3VESA 4CBUA 4ISEA 3KVGA 4TSXA 4C8NA 1RILA 5B8HA 3DLLL 4F4KA 2P9UB 4BEBA 3VGLA 1TVRA 4PA1A 3KTQA 4KAZA 4AH9A 3L4IA 4BG8A 3FE1A 3OYFA 1BRZA 2P9LB 3CJ9A 5EU7A 3VTHA 2E6MA 3KP0A 4BR5A 4YY3K 4YOWA 3CM5A 3C7NB 1NWKA 2ASMA 4CEOA 3MCAB 4AHCA 3OS2A 5HRNA 1KAYA 2ETJA 4JD2A 4DFMA 3E7UX 3OYDA 4BVPA 4FK2A 1BI4B 5AQSA 1RDBA 4CIFA 5FPEA 2FF3B 2YHBA 4FVUA 1BU6O 3DLBA 2YHYA 1TL1A 1JLAA 1RBTA 3UE5A 4E0DA 4CZGA 2MN5A 5KI6A 1MR4A 2DPNA 2OPRA 3PSIA 4FM2A 3UKRA 2D0OA 4OKEA 4FWRA 4M7XA 4RW4A 3VQ8A 1RT4A 4OGCA 1OH8A 4I2PA 3U3YA 3K5NA 5BPLA 4JI4K 1MDUB 4YOYA 1I2VA 2WTUA 4N56A 4DUZK 4H8KA 1SL0A 4DTJA 2SN3A 1BCMA 3A5LC 2KJAA 4DSEA 2GMOA 2PY5A 2Y1IA 1HKGA 2LKBA 3U4LA 2YI1A 3D45A 2F8SA 5CY4A 4HTUA 5FLXO 3OYMA 5F1XA 5FPMA 1VQLN 1GLEG 3VENA 1X3NA 1T6DA 3TAGA 1TGOA 2V7ZA 3ZT0A 4F9OA 1LQIA 3A5MC 3D2FA 3HJFA 1VRTA 3VGMA 2EHGA 4B9UA 2WONA 1IKWA 3AAPA 4CJRA 3EZWA 5CYQA 1U04A 5KPTA 4RW8A 4QS9A 3V6DA 1NRBA 1GPSA 5T7BA 2VWBA 3CC4N 4H5VA 2F7TA 3C6TA 1CZAN 3PO5A 3WQUA 3WNHA 1YF5L 4AEIA 1POIA 4CCHA 4FWLA 1DT9A 3PUFA 4NLCA 3ZSQA 4BRNA 3R1XA 1OKJA 5AQLA 2P9SB 5C42A 4NCBA 1CN2A 3SK3A 1U47A 5C15A 1VHXA 3UB5A 1VK0A 2UXBK 2YIOA 5JMVA 3CQ8A 3AY9A 4BY9C 3LM9A 4FOIA 5E26A 1ZC6A 3OY9A 1IBMK 4BREA 4CEDA 4RW7A 4JNEA 2UUBK 3IAYA 1OVYA 1S72N 2HNDA 3HXMA 4FJLA 2DY4A 4WFAL 4HCCA 1X9JA 1WWNA 2K35A 3WXLA 3D2EA 1QSSA 1Z6RA 1FKOA 4H5NA 2HHSA 3CIPA 3HO1A 1HKCA 1WUAA 2WUSA 1BCOA 2NRRA 4Y1DA 2VCPA 4NXMK 4CZJA 4FM0A 1V4SA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1DTQ A;  4CZE A;  3EZ5 A;  3DMJ A;  4DB3 A;  1JLE A;  4E7K A;  1SNB A;  3ZYY X;  1NOY A;  1JZB A;  1U4B A;  2ZJR L;  3HZ6 A;  1BA0 A;  4FL9 A;  5KRT A;  1YJ9 N;  4BR2 A;  1E3M A;  5HP1 A;  3ISN C;  2YHW A;  1SN1 A;  1QHA A;  2VY6 A;  3QIN A;  3D6R A;  2KBK A;  4H0V B;  2XO7 A;  3PLA A;  2VGN A;  2FF6 A;  2F4V K;  3AGK A;  1ESV A;  1TYQ A;  4M3R A;  1S5J A;  1VRU A;  4IJA A;  4A57 A;  3AVJ A;  2VYP A;  4QS7 A;  4CHZ A;  1SKR A;  2G8W A;  4NCA A;  2I61 A;  3FZL A;  1C55 A;  4Z4E A;  2YNH A;  3E7R L;  3NF6 A;  3DLG A;  3V4I A;  2WC9 A;  3TTF A;  4DV3 K;  3S3O A;  4DS4 A;  2E5L K;  4PKI A;  4CGH A;  4ID5 A;  3SUO A;  2IS3 A;  1HJR A;  4CZL A;  3KLG A;  1IKX A;  4GKJ K;  2YJE A;  3SCX A;  1N8R O;  4DS5 A;  3WXK A;  1KVB A;  1P8Z A;  4BRL A;  1K8K B;  1BO5 O;  1NG9 A;  5EX5 A;  4Z4C A;  1WSH A;  4HUF A;  5FRO A;  3VF4 A;  5M1F A;  3ZEU A;  1BK8 A;  2HF4 A;  3EKU A;  1ZYW A;  1NGE A;  3VQQ A;  4CFC A;  1EWQ A;  3VEW A;  4GKK K;  4BRF A;  4IWV A;  3VGK A;  4M3T A;  3HVR A;  3S3N A;  1RT7 A;  3F2K A; 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