3KVGA

Crystal structure of the n-terminal domain of hsp70 (cgd2_20) from cryptosporidium parvum in complex with amppnp
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVWRNDTVDIVPNDQGNRTTPSYVAFTETERLIGDAAKNQVARNPENTVFDAKRLIGRKFDDQAVQSDMTHWPFKVVRGPKDKPIISVNYLGEKKEFHAEEISAMVLQKMKEISEAYLGRQIKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKKGTGERNVLIFDLGGGTFDVSLLTIEDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVEFCVQDFKRKNRGMDLTTNARALRRLRTQCERAKRTLSSSTQATIELDSLYEGIDYSVAISRARFEELCADYFRATLAPVEKVLKDAGMDKRSVHDVVLVGGSTRIPKVQALIQEFFNGKEPCKAINPDEAVAYGAAVQAAILNG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
source organism Cryptosporidium parvum
publication title Crystal structure of the N-terminal domain of Hsp70 (cgd2_20) from Cryptosporidium parvum in complex with AMPPNP
rcsb
molecule keywords Heat shock 70 (HSP70) protein
total genus 124
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3kvgA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3kvgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3kvgA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3kvgA04
2YJEA 1RDWX 5EX5A 3HBTA 4FPAA 5AQZA 2ITMA 4WQ5C 3U9ZA 2GUPA 3DWLA 1NGJA 3HZ6A 3CJ9A 1ZBSA 3EKUA 1NWKA 3AARA 1ZC6A 1BA0A 5EY4A 4Z94A 1ATSA 3VETA 2V7ZA 1GLDG 1X9JA 2EWSA 4IZ9A 1NGEA 2ASOA 2Q31A 1K8KA 3H3NO 3O1BA 3VOVA 3WXIA 2HF4A 5AQLA 3ZX0A 1JCEA 2FXUA 3WXKA 2ZF5O 1YAGA 1S22A 2FSJA 1YXQA 4FOIA 2F9TA 2QXLA 4JHDB 1G99A 3QFPA 1P8ZA 2BUPA 2DPNA 3IMXA 5BRHA 4BGAA 1DEJA 2D1KA 1NGDA 1QQOA 1IJJA 2V51B 2GTDA 4NO7A 4XH4A 2FF3B 1J6ZA 3H1QA 2NRHA 3CJAA 3M1FA 3HSCA 3CETA 3VENA 3O4WA 3ATUA 5BREA 3VGMA 2P9PB 3U9DA 2VYPA 2E8AA 3CJBA 4WQ5A 5JLFA 3EZWA 4A2AA 3O08A 3A0IX 1EQYA 4BREA 4H0TB 1TYQB 3D7EO 3ZX2A 3ZETA 4C23A 2P9LA 4CZGA 5AQQA 5AQSA 3QDKA 2D0OA 2CH5A 2P9NA 3MMVA 2NLXA 4JN4A 4MLHA 2KHOA 3KVGA 3W3DA 3WQUA 2E2NA 2ZWHA 5AQMA 4JD2B 4JNEA 5BPLA 1U6ZA 2QWRA 4FWSA 3IDHA 3O8MA 5BPMA 2AP1A 1DGKN 3ZEUA 5AQIA 2Q0RA 3VEWA 2HOEA 3ENOA 3VPZA 2A3ZA 2P9KA 4ISEA 4EHTA 3QB0A 3CQXA 3DAWA 2CGLA 4A61A 3UKRB 3ULEA 2Q2RA 3FZMA 4QS8A 2CGJA 3D2EA 3WEEB 2IVOA 1QZ6A 1HKBA 1E4FT 4M7XA 3LDPA 3HTVA 4CZJA 1NM1A 2QWPA 2FLOA 2Q0UA 3GE1A 3VESA 4HTLA 1OKJA 1SQKA 5CE3A 1RFQA 4BRDA 3TPQA 3EKSA 3IUCA 1ATRA 5KPZA 3SMPA 2PAVA 1DKGD 5ELZA 3JS6A 1SAZA 1JCFA 3BEXA 3DXMA 3A5NC 2QWQA 3F9MA 2VCPA 4MO5A 3MDQA 1CZAN 3FGUA 3QFUA 2V52B 4H0OA 4BC3A 5LJWA 5AQHA 4WQ4C 4BRQA 2IVNA 3GL1A 2P9SB 3WXLA 4FSVA 2ASMA 5AQWA 5AQOA 1X3MA 2YI1A 4PKGA 4FWPA 3HM8A 1U2VB 3CJ1A 1KAZA 3D2FB 1IG8A 1T6CA 4A62A 5ADXA 3WUHA 1BUPA 4NB4A 1C0FA 2ZGYA 4BR7A 2H3GX 3VEOA 1GLBG 3VEYA 2E2OA 4FWQA 4B1WB 2A42A 4CZLA 4DCHA 3MK6A 3O1WA 3UKUB 1GLJO 1QHAA 3CIPA 4F9OA 1YUWA 2YJFA 4DB3A 1HJOA 4CJ7A 1HKCA 1X3NA 4RCHA 4CZHA 5LJVA 2I7NA 4XH5A 3UB5A 1QQNA 2P9UB 4I6MB 3KZBA 4PL8A 4BVPA 3ZX3A 4BRAA 5AFUA 3TU5A 4CZIA 2HF3A 4PKIA 4BRCA 4IJAA 3O5BA 2UYTA 3SMSA 1HX1A 5BPNA 1JCGA 3LM2A 4WYBA 3MCPA 4IO8A 5BN9A 1V4SA 1GLEG 3FZFA 2E2PA 3QICA 1HLUA 4PL7A 5E26A 2A6AA 1GLCG 4B1VA 2GWJA 3VGLA 4H0VB 3MN7A 4WQ4A 4EAHD 3P4IA 3WQTA 3CHWA 1NGAA 4RWTA 5TKYA 1MA9B 3GOIA 3DJCA 4BRFA 4B9QA 4BG8A 5B8HA 4BR4A 3LL3A 4M63C 2FSNA 3GG4A 1T44A 1HPMA 5AZIA 3M3ZA 2YHWA 1E4GT 3U4LA 1T6DA 2YCHA 3EO3A 3BF3A 2CH6A 2F9WA 3AY9A 1Z6RA 3RSEB 2IIRA 1RGIA 3SLCA 4B1XB 3VEZA 5ADXH 3L0QA 1HKGA 3BF1A 5EOYA 2QM1A 4EIAA 2YHXA 4H0PA 4K41A 5AQTA 4M7YA 2P9IA 3C7NA 4GY2B 1BU6O 1QQMA 1MWMA 3H45C 5JICA 4H5VA 4DQ8A 3AAQA 5FPMA 2FSKA 5KPRA 3CERA 4H5WA 3U8XA 1GLAG 4MLEA 2E20A 3MN5A 4CBXA 4BRMA 4CI6A 4CZFA 5F2RA 3I8BA 4BQLA 2Q97A 4AM6A 2QWMA 3ID8A 4EHUA 3H1VX 5AFUH 1SZ2A 4LC9B 1K8KB 2A40A 2Q1NA 4FWNA 4K42A 1D4XA 1GLLO 5FPNA 3A8YA 1BA1A 2Q36A 5AQVA 3A5OC 4BRPA 1GLFO 3CJ7A 2ZGZA 4K43A 4H5TA 4IJNA 3VF4A 3I33A 3J8AA 1NGHA 3WXJA 4FWRA 4H0XB 3VGKA 3LDOA 4H0YB 5KQDA 1TYQA 5AZJA 3WT0A 3VF2A 4B1UB 4H5NA 4BR5A 2E88A 3H6EA 3JXUA 3BUZB 2QWOA 2V7YA 4MO4A 5AQKA 2E1YA 3DXKA 4J8FA 4JD2A 4FWMA 3EN9A 1NLVA 4CD3A 2AA4A 1XQSC 2NZTA 3CQYA 2A5XA 5AQPA 2D4WA 2W40A 1R59O 3R6MA 4BRHA 4XEIA 3MN9A 3LDLA 3UKRA 3KHYA 1QZ5A 3VERA 3ZETB 3WEEA 2P9LB 1ZXOA 1KAXA 5BN8A 2P9NB 4KBOA 3QBXA 2ASPA 5AZIB 5AQGA 3FZHA 4IWVA 3C0BA 4H03B 3FR0A 2GWKA 3AAPA 3ZEUB 4BRNA 2J4RA 3ATVA 3QMLA 3IFRA 4CZKA 2P9KB 1NGBA 1NGCA 4BVOA 4BGBA 5JMVA 4K25A 1LOTB 3R8EA 3A5MC 3ULEB 3CJCA 5JLHA 4H5RA 3D2EB 2P9IB 3C7NB 4CD1A 1NMDA 3CI5A 3GDQA 1C0GA 3ENHA 5F1XA 3VEXA 1YVNA 1TUUA 4CBWA 2WUSA 3H46O 3SK3A 3VEVA 2HMPA 2I7PA 3W0LA 3FFKB 4BRGA 1WOQA 5KPTA 1NGIA 1H1VA 4FPBA 4BRLA 5FPDA 1MWKA 5KQ8A 4B1ZA 2P9SA 4BQZA 4BC5A 2FF6A 4YDUC 3H3OB 1U2VA 4FWOA 3FE1A 1WUAA 2VWBA 2QW9A 3D2FA 2QWNA 2E1ZA 3DXMB 5AQYA 4JAXA 5FPEA 3L4IA 4FWLA 3S41A 5F0XA 1V4TA 1ATNA 1XC3A 4BC4A 2GELA 4QS9A 5AZJB 4FL9A 3UKUA 2W41A 1BO5O 4E1JA 4FOEA 2BTFA 3LDNA 1KAYA 1S3XA 4GNIA 3DXKB 1BG3A 3FLCO 1TUYA 4A2BA 4HWIA 3B8AX 4ISFA 5BRDA 1BWFO 2P9UA 4I6MA 4ISGA 1Q18A 1KXPA 4JHDA 4BC2A 2OANA 3M6GA 3OHRA 2E2QA 3L6QA 1LCUA 4XH1A 3G25A 1HUXA 5EVZA 3FZLA 4BRKA 4BR2A 4CZMA 5I9EB 1BDGA 4DHYA 1BOTO 4EFHA 2GEMA 5EXWA 4BR9A 3UE5A 4CBUA 4AM7A 4QS7A 5E84A 4BROA 5BRFA 4IXCA 3QBWA 4Y0WA 3O6WA 3SJHA 5AQRA 4BRIA 4O8KA 3MN6A 2P9PA 3LDQA 2A41A 3EL2A 1NGFA 2QWLA 5AQNA 2CGKA 1ESVA 3VF6A 3A5LC 4BG9A 4B1YB 4YDUA 5AQFA 3R9PA 1NBWA 3BP8A 3GBTA 3LM9A 1Z05A 4CZEA 1Y64A 1NGGA 5AR0A 5BR9A 4RTFD 2PBDA 4BR0A 5AQXA 2D0PA 2YHYA 3O80A 4FWKA 1MDUB 4FO0A 3RSEA 3FZKA 2IVPA 4PKHA 4O5FA 3HI0A 5AQUA 4L3QA 5LY3A 1XUPO 5AQJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HBTA 3AO1A 5AQZA 3U9ZA 3ZSXA 2GUPA 1JLBA 5I42A 3IS9A 1BISA 3CJ9A 2N69A 5K14A 1FKOA 4DMNA 2R7YA 3EKUA 4DQSA 1NK0A 1U47A 4Z94A 3VETA 1TL1A 1IKXA 1X9JA 2E6LA 2EWSA 3DYAA 2D0AA 1HMVA 4CW7B 1REVA 4FJLA 1J5EK 3SAGA 1KRPA 4BACA 5AQLA 1C1BA 1QQCA 1JCEA 3V1RA 4GW6A 3PIPL 5IT9O 3ITHA 5C2DA 4CJKA 3LZIA 4DQPA 4CGGA 2FSJA 3T19A 1YXQA 4FOIA 3HOTA 4XIUA 3V9WA 4CHZA 1JLFA 3TSUA 2F9TA 1I2UA 2QXLA 1L3SA 3DRSA 1P8ZA 1K8BA 2YHBA 3IMXA 5BRHA 4B9NA 1L3UA 1I6FA 2GTDA 5FRNA 1T7BA 2FF3B 1C1AA 2GBZA 4B08A 3NVKA 3HP6A 4CJ5A 2E3FA 4E7JA 4XJXA 1S1VA 3VQ5A 1LAVA 2HBMA 4CF8A 2YNFA 3H08A 3VGMA 2GUIA 5GIOA 3OS0A 2VYPA 4IDKA 3KKSA 3MX2A 3THVA 3SNNA 4FK2A 4BY9C 3K5LA 4CIEA 1KFSA 3A0IX 4HUGA 2DTUA 4UAFE 5LMNK 2O8FA 2D0OA 2MN5A 3MMVA 4CFBA 2Q3SA 2ZWHA 3MWPA 2B5JA 5BPLA 4BWMA 2QWRA 2G8IA 3IDHA 5BPMA 1KC8O 1DGKN 4NYFA 1BL3A 5HRSA 4HVJA 3VPZA 3TAEA 3AO3A 2P9KA 4AHUA 2JWKA 2XY6A 3UKRB 1TKXA 3FZMA 5TKWA 4FYDA 2CGJA 4B8AB 4IOCL 2IVOA 3CCQN 3SQ4A 1DT9A 2BANA 1IBLK 1HKBA 4IBNA 3LDPA 4YORA 3VQQA 1NM1A 4C8NA 2QWPA 4L8RB 3E7RL 2Q0UA 4FJHA 5JS2A 3NDKA 3M8SA 4OO1J 3VESA 3NF7A 4HTLA 1YTUA 3OVNA 3S9HA 2A7TA 1EXQA 4IFYA 2NRXA 3PSIA 4BRDA 3TPQA 1K6YA 3LPTA 5KPZA 4KI4A 5CY4A 2D5RA 4K8XA 1ZYVA 4Z4CA 1T7AA 2HBJA 2LSNA 4BDPA 3BEXA 3DXMA 5J2PA 3LANA 2F96A 3OYJA 1QVFM 1ZBLA 3SF4D 3AVKA 3THWA 3S3MA 1CZAN 4CECA 5H1SQ 3BZCA 4H0OA 5LJWA 4E72A 4BRQA 2IVNA 3SUQA 1JKHA 3WXLA 5GINA 5AQWA 5AQOA 1X3MA 2YI1A 4LF9K 1ZBHA 4FWPA 3CYGA 3HM8A 4A59A 3CJ1A 3RVCA 3D2FB 4AF1A 4JI8K 3CCEN 3DLEA 4AHCA 4A62A 5ADXA 4FZZA 1BUPA 4NB4A 3NAEA 2ATQA 1W2BM 3FFIA 3DOLA 1BIZA 1VSMA 2A42A 3O1WA 2HNZA 3T1AA 3AVNA 3BK3C 5C10A 3ZCMA 4BE0A 4DB3A 1TAQA 2HHUA 2XRIA 1X3NA 3O9QA 4I2QA 3T1YK 2I7NA 3S3OA 2JLEA 4DSFA 1YVUA 2OA8A 3U3GA 5AFUA 2YNHA 1ZFUA 2Y1IA 3DLGA 4IJAA 1LQIA 1DTQA 2HB5A 1HX1A 1JCGA 2NUBA 1Q86O 3KK7A 4OLAA 1V4SA 1GLEG 2WONA 1HLUA 4V1DC 2E4LA 2IS3A 4B1VA 2IAJA 4CIGA 3MN7A 3TAQA 3THXB 3AVCA 5TKYA 3UIQA 3NH0A 5B8HA 4O5BA 4YOWA 2KBJA 4KFBA 4ZTJA 2FSNA 1A5WA 1WB9A 1TVRA 5AZIA 1SL2A 3M3ZA 3OYGA 4R5PA 3U4LA 1T6DA 4A57A 2KSKA 4FW2A 3OYHA 3BF3A 2CH6A 3K5MA 4DR2K 1S1WA 3OTOK 4DFJA 2WFBA 4DG1A 3ZSOA 5ADXH 4HHFA 3BF1A 2KZMA 4ICLA 2YHXA 4CJ4A 3THYB 4M7YA 4LSLA 4CEDA 4DWIA 3K2PA 4HCBA 5KPRA 2VY6A 4B9MA 1BMRA 4KPYA 4MLEA 2E20A 1T3VA 4BRMA 5F2RA 1NOYA 2QWMA 1VQ9N 3H1VX 5AFUH 3LPUA 4DV4K 3VQDA 4J2EA 3OYCA 2A40A 2QK9A 5FPNA 4U7BA 4AILC 2Q36A 1CXUA 3IRXA 2IC3A 1J53A 4FM2A 3HT3A 3JAMO 4IJNA 4DR6K 5GADP 4KV8A 1WBDA 4DTSA 3P1GA 1EETA 5HRNA 2N2RA 1RT2A 1T05A 4H0XB 4CF1A 3LDOA 1FH3A 1RBTA 4O44A 3DLKA 4H0YB 5KQDA 4OX9K 4B9SA 3WT0A 4N56A 2QKBA 4AB0A 2DFEA 3J80O 3H6EA 3BUZB 2QWOA 4CVNE 4MO4A 2YX6A 5AQKA 3DXKA 3NH2A 4FWMA 1NLVA 4FK4A 4WFNL 3KWGA 4DU3A 1TKTA 3HXMA 5AQPA 4MQ3A 2D4WA 2W40A 1R59O 4BRHA 4XEIA 1NK4A 3MN9A 2HHWA 3KHYA 3MCAB 3WEEA 4OPAA 5BN8A 2ASPA 5AQGA 3ASMA 2KBKA 2PFUA 3KOWA 1LWFA 3M5RA 2Z1IA 3AAPA 3ZEUB 3PSMA 4YY3K 1GPSA 3KLGA 2J4RA 1SKRA 3QMLA 3IFRA 4CZKA 4KO0A 1NGBA 4LF4K 4V19S 4BGBA 1XWLA 1HQUA 3CJCA 4DQRA 3D2EB 4CD1A 3GDQA 1WAFA 4FJJA 1TUUA 2WBNA 3LP1A 3RMDA 3LAKA 1YHQN 3K57A 3VEVA 3VQPA 4GVMA 2X78A 1H1VA 4ZTFA 3I56N 1EO1A 5KQ8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3HBT A;  3AO1 A;  5AQZ A;  3U9Z A;  3ZSX A;  2GUP A;  1JLB A;  5I42 A;  3IS9 A;  1BIS A;  3CJ9 A;  2N69 A;  5K14 A;  1FKO A;  4DMN A;  2R7Y A;  3EKU A;  4DQS A;  1NK0 A;  1U47 A;  4Z94 A;  3VET A;  1TL1 A;  1IKX A;  1X9J A;  2E6L A;  2EWS A;  3DYA A;  2D0A A;  1HMV A;  4CW7 B;  1REV A;  4FJL A;  1J5E K;  3SAG A;  1KRP A;  4BAC A;  5AQL A;  1C1B A;  1QQC A;  1JCE A;  3V1R A;  4GW6 A;  3PIP L;  5IT9 O;  3ITH A;  5C2D A;  4CJK A;  3LZI A;  4DQP A;  4CGG A;  2FSJ A;  3T19 A;  1YXQ A;  4FOI A;  3HOT A;  4XIU A;  3V9W A;  4CHZ A;  1JLF A;  3TSU A;  2F9T A;  1I2U A;  2QXL A;  1L3S A;  3DRS A;  1P8Z A;  1K8B A;  2YHB A;  3IMX A;  5BRH A;  4B9N A;  1L3U A;  1I6F A;  2GTD A;  5FRN A;  1T7B A;  2FF3 B;  1C1A A;  2GBZ A;  4B08 A;  3NVK A;  3HP6 A;  4CJ5 A;  2E3F A;  4E7J A;  4XJX A;  1S1V A;  3VQ5 A;  1LAV A;  2HBM A;  4CF8 A;  2YNF A;  3H08 A;  3VGM A;  2GUI A;  5GIO A;  3OS0 A;  2VYP A;  4IDK A;  3KKS A;  3MX2 A;  3THV A;  3SNN A;  4FK2 A;  4BY9 C;  3K5L A;  4CIE A;  1KFS A;  3A0I X;  4HUG A;  2DTU A; 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