3KVGA

Crystal structure of the n-terminal domain of hsp70 (cgd2_20) from cryptosporidium parvum in complex with amppnp
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVWRNDTVDIVPNDQGNRTTPSYVAFTETERLIGDAAKNQVARNPENTVFDAKRLIGRKFDDQAVQSDMTHWPFKVVRGPKDKPIISVNYLGEKKEFHAEEISAMVLQKMKEISEAYLGRQIKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKKGTGERNVLIFDLGGGTFDVSLLTIEDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVEFCVQDFKRKNRGMDLTTNARALRRLRTQCERAKRTLSSSTQATIELDSLYEGIDYSVAISRARFEELCADYFRATLAPVEKVLKDAGMDKRSVHDVVLVGGSTRIPKVQALIQEFFNGKEPCKAINPDEAVAYGAAVQAAILNG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock 70 (HSP70) protein
publication title Crystal structure of the N-terminal domain of Hsp70 (cgd2_20) from Cryptosporidium parvum in complex with AMPPNP
rcsb
source organism Cryptosporidium parvum
molecule tags Chaperone
total genus 124
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3kvgA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3kvgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3kvgA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3kvgA04
3WXJA 4JD2B 3ULEA 4CD3A 4JN4A 3FR0A 3UKRB 3BF3A 4FWLA 4FWPA 3MN7A 3R8EA 2QM1A 2V52B 3EKUA 3RSEA 2QWOA 2HOEA 1NGEA 3A5LC 4FO0A 4EHUA 3HBTA 4BG9A 1U2VB 2P9IB 2AP1A 4ISEA 4BR5A 2E88A 4FWRA 3D2FA 1HX1A 3BEXA 1HKBA 4EIAA 2VYPA 4BG8A 4BRGA 4BVPA 3MDQA 1OKJA 4H03B 3LDOA 1MWMA 4FL9A 2P9UB 3EKSA 4K43A 4BQZA 3H6EA 2GELA 1NGBA 5FPMA 2UYTA 1C0FA 3GG4A 3SMSA 4BRAA 3EL2A 2BTFA 4XH1A 5AQJA 3EO3A 2P9PB 3KHYA 3M3ZA 5AQKA 1QQMA 2D0PA 1X3MA 3CJ9A 4I6MA 2YHYA 4BRLA 5AQNA 1R59O 3A5OC 1QQOA 2Q1NA 2IIRA 1XC3A 3AAPA 5BPLA 4B1WB 4RWTA 5FPDA 1E4FT 5AQMA 4O8KA 1BOTO 1RFQA 2I7NA 5AQWA 1NMDA 2ZGZA 3MK6A 4BGAA 4C23A 2FF3B 2P9NB 5AZIA 4M7XA 3DXKB 3TPQA 4BRKA 1RGIA 3MN9A 3L4IA 4H5RA 1K8KB 1U2VA 3O1BA 4A61A 4CZJA 1YXQA 3ZX2A 2J4RA 1JCEA 4K42A 3ULEB 1KAXA 3J8AA 2ZGYA 4A2BA 3GBTA 3GE1A 1NGFA 1DGKN 5BRHA 1HKGA 5BPNA 3HM8A 5KPTA 4FPAA 2VWBA 4B1UB 3RSEB 1GLFO 1GLCG 4WYBA 3D2EA 1D4XA 5TKYA 3ATVA 4JHDB 2YJEA 5BN8A 4EFHA 4CZGA 4K41A 4BC4A 4DB3A 4HWIA 4PKHA 3ZX3A 3VERA 3D2FB 2YHXA 5JICA 5JLFA 2A3ZA 1V4SA 1T6CA 1Z6RA 2IVNA 5I9EB 1NGHA 4H0YB 1E4GT 4PKIA 3QFPA 3UE5A 1ZXOA 1DEJA 3ZEUA 4FWNA 3G25A 3QBWA 4H5NA 4WQ5A 3KVGA 5AQXA 5JLHA 1GLLO 4CBXA 5EVZA 2E2NA 1S22A 1WUAA 1SQKA 4A62A 3FLCO 3O80A 3MN5A 3AY9A 3JS6A 2FLOA 4NO7A 3QICA 1EQYA 4M63C 1K8KA 5AQGA 3ENHA 3WT0A 2Q97A 1ZBSA 3B8AX 4Z94A 4Y0WA 4CD1A 2GWJA 2F9WA 3VETA 2P9LA 3M6GA 3WQUA 5EY4A 2Q0RA 5JMVA 3EN9A 2QXLA 2FF6A 5KQDA 4XEIA 5AZIB 1YVNA 4BRNA 2P9KA 1NGIA 3VEVA 3FE1A 4E1JA 3VEYA 5AFUH 2V7ZA 1WOQA 4K25A 4JHDA 4B1XB 3VGMA 4B1VA 4BRDA 1G99A 1NGGA 1U6ZA 2HF4A 4MLEA 3U9ZA 2Q31A 3BUZB 4XH4A 5AQLA 3WXLA 2D4WA 3BP8A 4IXCA 2CH6A 4FPBA 3U9DA 1HJOA 1IJJA 3HI0A 4B1YB 3WEEA 5AZJA 4WQ4A 3D2EB 3FZFA 4BREA 1TUUA 3ENOA 3HTVA 3LM2A 4LC9B 2W40A 4CZIA 5AFUA 2E8AA 5AQRA 3WXKA 4B9QA 4QS8A 3CJ7A 4BC3A 3M1FA 2CH5A 3TU5A 5AQOA 1NGAA 4IZ9A 3ZEUB 4FSVA 4BQLA 3VEOA 3DJCA 3LM9A 1KAZA 2PAVA 4B1ZA 4BRFA 3O6WA 1QHAA 2DPNA 3FZLA 3DXMA 4FWSA 1SZ2A 3C7NA 1SAZA 1Q18A 3CHWA 3DAWA 1MWKA 2HMPA 4KBOA 5AQUA 2E1YA 1ATSA 1BA1A 2D1KA 2ASPA 1MA9B 1HUXA 2WUSA 3QBXA 4YDUA 3IMXA 3O8MA 2CGKA 3CQYA 4M7YA 2GWKA 2V7YA 2QWQA 2A5XA 3OHRA 4IJAA 2P9SA 4H5WA 2A6AA 2P9LB 1V4TA 2YI1A 3VF6A 4BR4A 1NLVA 3QB0A 1GLJO 4QS9A 3A5NC 5F0XA 4CBWA 1HLUA 3I8BA 2Q36A 4RCHA 4CZEA 2P9KB 3ZETA 3U8XA 4F9OA 3CJAA 1ATNA 3F9MA 1GLEG 3P4IA 4FOIA 1BUPA 1CZAN 1XUPO 3LDLA 3C0BA 2FSJA 5LY3A 4BR0A 4CBUA 1QQNA 4BRHA 4JNEA 2W41A 2VCPA 3FFKB 4ISGA 1Y64A 4WQ5C 4PKGA 3QDKA 3WEEB 5E84A 5AZJB 2E2PA 1C0GA 5FPEA 1X9JA 3GOIA 3S41A 1YUWA 5AQFA 3O4WA 5CE3A 2YCHA 2Q0UA 2KHOA 3IDHA 3FZMA 1JCFA 2FSNA 3ZX0A 3QFUA 3MCPA 3UKUA 2QWNA 2V51B 3HSCA 5EX5A 4HTLA 3A0IX 4CI6A 3DXMB 2I7PA 3C7NB 2GUPA 2NZTA 2Q2RA 3WQTA 1Z05A 1HKCA 2BUPA 4FWMA 4FWOA 4FOEA 2IVOA 2H3GX 2F9TA 4JAXA 3W3DA 4RTFD 4DQ8A 3MN6A 4DCHA 3LDQA 1T6DA 3CERA 1NBWA 4MLHA 4PL8A 3FGUA 5AQPA 3AAQA 3VENA 1QZ6A 2ASOA 2P9SB 1TYQA 2AA4A 3VGKA 4MO4A 2OANA 3GL1A 4CZHA 3AARA 3KZBA 2ZWHA 2GEMA 5AQVA 2E1ZA 3ATUA 3ID8A 4WQ4C 3DWLA 5KQ8A 4H5VA 2A42A 2HF3A 3R6MA 3ZETB 3WUHA 5ADXH 5BN9A 4GNIA 3W0LA 4CZLA 3H1QA 1RDWX 1S3XA 4QS7A 4BR7A 4XH5A 4BC5A 4H5TA 4BRCA 3WXIA 5AQQA 5ELZA 3H3NO 1BG3A 4ISFA 5F1XA 3VPZA 3VEXA 1J6ZA 5KPZA 4BRIA 1JCGA 1X3NA 3FZHA 5B8HA 5ADXA 5AR0A 2ASMA 4H0TB 3IUCA 3D7EO 1KXPA 2FSKA 3VESA 5FPNA 1QZ5A 4H0OA 4YDUC 1BA0A 2YHWA 4GY2B 3UKUB 3QMLA 4BR2A 3HZ6A 5AQSA 3FZKA 4AM6A 1XQSC 3SMPA 3H1VX 1BWFO 3VEWA 5AQIA 1BDGA 5BRDA 3A8YA 2NLXA 4CZKA 1NWKA 2EWSA 3CETA 3CJ1A 2QW9A 4JD2A 1ESVA 3UKRA 4BVOA 3EZWA 2PBDA 2YJFA 3JXUA 3CJCA 4H0PA 4NB4A 2NRHA 1NM1A 4AM7A 1NGDA 4BRPA 5BR9A 1MDUB 2A41A 2CGJA 3H3OB 4EHTA 4H0XB 1LOTB 1GLDG 2QWRA 2P9IA 3H45C 3LL3A 2E2QA 2QWLA 5AQTA 5BPMA 1TYQB 4BR9A 1LCUA 3I33A 3CQXA 3CIPA 4J8FA 4BRMA 1HPMA 4BROA 3SJHA 3A5MC 4MO5A 5AQHA 4FWKA 3O5BA 1IG8A 3BF1A 3MMVA 3O08A 3IFRA 4CZFA 2IVPA 5E26A 3VF2A 2CGLA 5LJWA 4CJ7A 4BRQA 5F2RA 2P9UA 5AQZA 1BO5O 5EXWA 4IJNA 1YAGA 1ATRA 3O1WA 2GTDA 2D0OA 4H0VB 2P9PA 4L3QA 3L6QA 3SK3A 1BU6O 1ZC6A 2A40A 5BRFA 4BGBA 3VF4A 1NGJA 2ITMA 2E20A 1KAYA 3CI5A 5AQYA 3UB5A 3VOVA 4CZMA 1TUYA 3VGLA 4IWVA 1GLAG 3U4LA 1T44A 3H46O 2FXUA 5EOYA 3R9PA 1NGCA 2QWPA 3GDQA 1P8ZA 4BC2A 4EAHD 3CJBA 5LJVA 2E2OA 4DHYA 2P9NA 1DKGD 2QWMA 1GLBG 3DXKA 4IO8A 3VEZA 4I6MB 1H1VA 3L0QA 2ZF5O 4PL7A 4O5FA 5BREA 4FWQA 3LDPA 4A2AA 3LDNA 5KPRA 3SLCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TTCA 3ULEA 1N34K 1PE4A 3FR0A 4WFAL 3BF3A 1LW2A 4FWLA 4FWPA 1RDAA 1J54A 3NH1A 1Z26A 1D8YA 3AA2A 2HB5A 2O8FA 4YOXA 3VQEA 3HBTA 1U2VB 1HQEA 4HE7A 1WLJA 2P9IB 4WFBL 4IOAL 4CIGA 2QK9A 1DT9A 3KLFA 2AP1A 1RDUA 1SV5A 4ISEA 1ZBIA 4B8CA 4FWRA 3O3HA 4IFEA 2NY8X 2F7TA 2Z1IA 3BEXA 4FJKA 2NNWA 1SS6A 3L3UA 1HKBA 3PLAA 1JZAA 4BRGA 2UUCK 2C1GA 1T05A 4FK0A 3OYBA 1EXQA 4KB0A 3EKSA 3AVLA 3H6EA 3SMSA 4BRAA 4B3RK 3QEPA 1LQHA 5AQJA 1J5OA 5AQKA 3CJ9A 2IAJA 4KHUA 4OPHA 3A5OC 3DLKA 1QQOA 1XC3A 4B1WB 3AVNA 3HK2A 4RWTA 5FPDA 1RILA 1QSSA 4M3XA 1ASUA 1XNRK 4GV9A 4E1MA 2I7NA 5AQWA 5GAGP 2ZGZA 3CPEA 3AA3A 2FF3B 3LP0A 3AVFA 3DXKB 2A7TA 5JVGL 3CFOA 2I61A 1RGIA 3O1BA 1C1CA 3HL8A 3ZX2A 1RT2A 2J4RA 1JCEA 3K9JA 3MEGA 2EHGA 4ILHA 3ULEB 1KAXA 3J8AA 2ZGYA 4DR5K 3QEVA 4JKEA 3GBTA 3V9WA 5BRHA 3HM8A 4EP5A 2XO7A 3CC4N 1OMYA 3QEXA 2O8FB 4CFDA 2UXBK 1D4XA 2ZD1A 4BACA 4JHDB 1FH3A 1HYZA 3ZX3A 4RW4A 4NXNK 2YHXA 5JLFA 2SN3A 3K9KA 3OJUA 2IVNA 4PKIA 4CJ3A 4FWNA 3QBWA 4DFJA 3WNGA 1SKSA 1NJIO 5EVZA 1DLOA 3ITHA 5I42A 4HUEA 4I2QA 2IDOA 2AJQA 1ZFUA 4KHPK 3O80A 4B9VA 4JS4A 3G4SN 3CCJN 1IKVA 3JS6A 2RHKA 3QIPA 1Q9XA 1K8KA 3OYFA 2YBRC 4GV6A 4OGEA 4CD1A 2GWJA 2F9WA 2KLAA 4N5SA 3MAQA 1UA0A 2YKNA 2UU9K 4IFYA 5EY4A 2Q0RA 2HVIA 2KYQA 2X6SA 3NGIA 3EN9A 5KQDA 3AO4A 4C8NA 1B9DA 1SNBA 3PY8A 4BRNA 2P9KA 5C15A 1NGIA 4JYAK 1NK5A 4M42A 2V7ZA 4B1VA 4CGHA 1Z25A 4EZ9A 3I56N 1SKRA 2WFBA 1Y97A 2LN8A 4FPBA 1FK9A 1YF5L 1IJJA 1A5XA 2OPPA 2WBNA 2OA8A 1SUQA 3BZCA 1U48A 4FVMA 2YIPA 4BREA 3CMAN 4M3YA 1VHXA 3P39A 5AFUA 1KSPA 3ASMA 3J80O 2KSKA 4CGDA 4KHWA 2YNGA 3M1FA 4JKHA 4KHYA 3P31A 4RW7A 1HNIA 4GKKK 2XY8A 1FW6A 3K5LA 1VSEA 3C95A 3G10A 4BE7B 3DXMA 3C7NA 5JENA 1SAZA 1T03A 4CJPA 5AQUA 3OVNA 3SQ2A 2E1YA 3TWHA 4IOCL 1WSHA 1TAUA 1VQ5N 5CYQA 4E7IA 1NK4A 4M3UA 3IMXA 2V7YA 1Q81O 3PX6A 4WE1A 2A5XA 4IJAA 4O44A 3VQQA 2P9SA 4H5WA 2OYQA 4Q0BA 1NNEA 4J2AA 1JJ2M 1NLVA 1LQQA 1BGXT 4QS9A 1W97L 3A5NC 4FJ9A 4CBWA 5C24A 4CZEA 2P9KB 1U4BA 1BMRA 1ATNA 3F9MA 5CZ1A 3P4IA 2HBKA 1JLAA 1ZYVA 4RG8A 2MZ0A 4CK2A 4IOXA 4JNEA 4Z0UA 3C6HA 1SL1A 2PYJA 1RT7A 3LWMA 1YI2N 5FPEA 3E9OA 2XRIA 3CC7N 1YUWA 1U47A 5AQFA 4IG3A 4OPKA 1VQ9N 1NK7A 4DR2K 2YCHA 2Q0UA 5H1SQ 3IDHA 3ZT2A 3QLHA 3SV4A 4J2DA 3RMCA 3K57A 3FZMA 1U04A 2LI7A 4KH4A 2HHUA 2O8EB 3ZSRA 3L2RA 4CJSA 3MCPA 3UKUA 2QWNA 1UWBA 2B6AA 2B4JA 1TKZA 3RVCA 3DXMB 3C7NB 3NF9A 5M1FA 3WQTA 3ZSOA 4OKEA 1WMTA 3QESA 3VQ6A 2H3GX 3T19A 2C1IA 1VNAA 4DCHA 1DJTA 1G15A 1WSGA 3AGRA 2FBVA 4FJLA 3T7ZA 4Y1CA 3DRPA 2P9SB 1TYQA 2AA4A 3VGKA 1JL1A 2OANA 2YILA 3DYAA 4JRQA 2ZWHA 3S3MA 1VQNN 2E3FA 2E1ZA 3I55N 1VSLA 5BN9A 4IG0A 4OLBA 4E1NA 2GL1A 3F5TA 3E7UX 3THWA 2HSTA 4BC5A 2JWKA 4BRCA 4AHVA 5ELZA 4ZTJA 1P0AA 2LY5A 3F9KA 4CEDA 1S1TA 4M3ZA 1JCGA 1XNQK 2VWJA 2NRVA 1N33K 2LJ7A 4C1NK 3IKMA 3UKUB 3NH0A 4IEIA 4N56A 3KK1A 3VEWA 5SZTA 3HOTA 4AEIA 1NWKA 4AHTA 4W5OA 1TGOA 3QI7A 3CETA 4ID5A 1EO1A 2QW9A 4Z4GA 4DV5K 2YHAA 3P5JA 1HNZK 5GADP 2XY6A 4DV1K 1NJWA 3DRSA 2PBDA 1I39A 2YJFA 3JXUA 3CJCA 4DQSA 4H0PA 2NRHA 1NM1A 4AM7A 3OYNA 5HP1A 1LOTB 5AQTA 1TYQB 4B9TA 1LCUA 3I33A 4FJJA 3CIPA 1VSIA 4J8FA 4BRMA 4JS5A 4BROA 3SJHA 3A5MC 4LSLA 5AJ3K 4MO5A 1EP4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3TTC A;  3ULE A;  1N34 K;  1PE4 A;  3FR0 A;  4WFA L;  3BF3 A;  1LW2 A;  4FWL A;  4FWP A;  1RDA A;  1J54 A;  3NH1 A;  1Z26 A;  1D8Y A;  3AA2 A;  2HB5 A;  2O8F A;  4YOX A;  3VQE A;  3HBT A;  1U2V B;  1HQE A;  4HE7 A;  1WLJ A;  2P9I B;  4WFB L;  4IOA L;  4CIG A;  2QK9 A;  1DT9 A;  3KLF A;  2AP1 A;  1RDU A;  1SV5 A;  4ISE A;  1ZBI A;  4B8C A;  4FWR A;  3O3H A;  4IFE A;  2NY8 X;  2F7T A;  2Z1I A;  3BEX A;  4FJK A;  2NNW A;  1SS6 A;  3L3U A;  1HKB A;  3PLA A;  1JZA A;  4BRG A;  2UUC K;  2C1G A;  1T05 A;  4FK0 A;  3OYB A;  1EXQ A;  4KB0 A;  3EKS A;  3AVL A;  3H6E A;  3SMS A;  4BRA A;  4B3R K;  3QEP A;  1LQH A;  5AQJ A;  1J5O A;  5AQK A;  3CJ9 A;  2IAJ A;  4KHU A;  4OPH A;  3A5O C;  3DLK A;  1QQO A;  1XC3 A;  4B1W B;  3AVN A;  3HK2 A;  4RWT A;  5FPD A;  1RIL A;  1QSS A;  4M3X A;  1ASU A;  1XNR K;  4GV9 A;  4E1M A;  2I7N A;  5AQW A;  5GAG P;  2ZGZ A;  3CPE A;  3AA3 A;  2FF3 B;  3LP0 A;  3AVF A;  3DXK B;  2A7T A;  5JVG L;  3CFO A;  2I61 A;  1RGI A;  3O1B A;  1C1C A;  3HL8 A;  3ZX2 A;  1RT2 A;  2J4R A; 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