3KVGA

Crystal structure of the n-terminal domain of hsp70 (cgd2_20) from cryptosporidium parvum in complex with amppnp
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVWRNDTVDIVPNDQGNRTTPSYVAFTETERLIGDAAKNQVARNPENTVFDAKRLIGRKFDDQAVQSDMTHWPFKVVRGPKDKPIISVNYLGEKKEFHAEEISAMVLQKMKEISEAYLGRQIKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKKGTGERNVLIFDLGGGTFDVSLLTIEDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVEFCVQDFKRKNRGMDLTTNARALRRLRTQCERAKRTLSSSTQATIELDSLYEGIDYSVAISRARFEELCADYFRATLAPVEKVLKDAGMDKRSVHDVVLVGGSTRIPKVQALIQEFFNGKEPCKAINPDEAVAYGAAVQAAILNG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock 70 (HSP70) protein
publication title Crystal structure of the N-terminal domain of Hsp70 (cgd2_20) from Cryptosporidium parvum in complex with AMPPNP
rcsb
source organism Cryptosporidium parvum
total genus 124
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3kvgA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3kvgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3kvgA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3kvgA04
4O8KA 3QBWA 2P9UB 2PAVA 3VF4A 5LY3A 3LDNA 2QWNA 1YAGA 4Z94A 3QICA 3RSEB 4FOIA 5F1XA 4XH4A 2P9IB 4HWIA 4B1WB 5BPLA 4BR9A 3ZETA 4BQLA 4Y0WA 2YHYA 4FWLA 5JICA 4BGBA 1NMDA 1H1VA 2W41A 5AQLA 3DJCA 3O6WA 4A61A 3SK3A 2UYTA 2WUSA 1ATNA 2HMPA 3W3DA 1ESVA 4BC5A 4BRPA 2E2NA 4PKHA 3UKRA 3S41A 2E2OA 2V52B 5AZIB 4CZGA 4M7XA 4WQ5A 2VYPA 2E20A 3MDQA 3ZEUA 2FF6A 1YXQA 1KAYA 4BRFA 5F2RA 3MN6A 5BPNA 2VWBA 2KHOA 3DXKA 5AQRA 1YUWA 1QQOA 3QFUA 2E2PA 3ZETB 3WEEA 4FOEA 4NO7A 4B1UB 4FWPA 2QWLA 3BP8A 4H0YB 3VENA 4QS7A 3CERA 1GLFO 5E26A 1ZC6A 4ISEA 5AQUA 4A2AA 3BF1A 3L4IA 4IWVA 4EAHD 1E4GT 4FWRA 4WYBA 3H46O 1OKJA 3BUZB 5KPRA 5FPMA 5AQOA 3AY9A 1SQKA 4H0PA 4CZHA 5LJWA 1QZ5A 5AQJA 3JS6A 3UKRB 4BRMA 1X3MA 3CQXA 3A5LC 4WQ4A 3HI0A 3VEWA 1HKGA 5AZJB 2HOEA 3CI5A 3LDQA 5JMVA 5E84A 4GNIA 1X9JA 3BF3A 4BRGA 1LCUA 4B1YB 1HUXA 1TYQB 4WQ4C 3FE1A 3H1QA 3TPQA 2A42A 3WUHA 1NGIA 2Q1NA 5AQYA 1RFQA 1Z6RA 3VF6A 2AP1A 2D1KA 4BRIA 3C7NB 2D4WA 4C23A 3VEVA 2P9UA 3RSEA 1HJOA 1NGCA 3FLCO 2YHXA 2P9IA 4JHDB 3IDHA 3AARA 1QZ6A 3CJ1A 4RWTA 2ZGZA 3MCPA 1S22A 2FXUA 2D0PA 4IXCA 2GTDA 5AFUH 3O80A 3ATUA 3TU5A 4CZMA 4FWKA 1NGEA 4EIAA 3CQYA 3SLCA 5AQFA 4CZLA 4I6MB 4CI6A 4H5RA 4H5WA 3VERA 4AM6A 2OANA 2YI1A 5AQPA 5EX5A 2ZF5O 3VF2A 4BGAA 5AZIA 3L0QA 3EZWA 4H5TA 4BG8A 2E88A 1NWKA 3AAPA 4H0TB 2NLXA 1XQSC 2IVPA 1P8ZA 1V4TA 2Q2RA 3U8XA 2FSJA 3M1FA 5BN9A 3GG4A 1BU6O 4EHUA 4PL8A 1EQYA 1ZBSA 3EN9A 4FSVA 3VETA 3VOVA 3VEOA 5F0XA 1GLCG 5AQNA 4BVPA 2EWSA 4H03B 4H0OA 4GY2B 1BA1A 5AQZA 1HKBA 3EKUA 2FF3B 2I7NA 3ZX3A 2J4RA 3LM9A 4O5FA 2FSKA 3GE1A 2BTFA 1BA0A 3C0BA 2ITMA 3KVGA 2QWQA 3QMLA 2H3GX 4XH1A 3W0LA 4K41A 4FO0A 3CIPA 4YDUA 5AZJA 1MDUB 2VCPA 3A5OC 3WXKA 4M7YA 3ID8A 3ULEB 3VGLA 2AA4A 3O08A 1C0FA 3H3OB 3GDQA 1BDGA 1C0GA 1LOTB 3R9PA 1TYQA 4YDUC 1JCFA 5AQSA 4JAXA 1HKCA 1CZAN 5FPDA 4BG9A 3ENHA 4QS8A 1NGGA 1TUYA 1MA9B 5EVZA 2ASOA 2Q97A 4E1JA 3ZX2A 2YCHA 4FWMA 3C7NA 3GL1A 5BRHA 5JLHA 2P9SA 3D2EB 2A40A 1NGJA 2QXLA 1NBWA 4JHDA 1V4SA 5BRDA 3J8AA 4IZ9A 2GWKA 5KQDA 4BRQA 1GLDG 3AAQA 1U2VB 2GEMA 2YHWA 4DHYA 4MO5A 2E1ZA 3EO3A 2D0OA 4A2BA 3VEYA 2FLOA 4F9OA 3QFPA 4BRAA 3ATVA 2Q0RA 1G99A 4CZIA 1IJJA 2E1YA 5BPMA 4I6MA 3HBTA 1TUUA 3CJ9A 1ZXOA 3UB5A 2V7YA 3FGUA 3D7EO 4CZKA 4CD1A 3O8MA 4FPAA 4KBOA 2YJEA 2P9NB 4LC9B 4FL9A 4IJNA 1XUPO 5B8HA 3JXUA 3G25A 4BRHA 4JD2B 1BG3A 3H45C 2F9WA 2QWRA 2QM1A 5AQIA 4QS9A 3DXMB 2P9SB 1J6ZA 2HF4A 5FPNA 4ISGA 3LDOA 3U9DA 2CGKA 3LDPA 3MK6A 2GELA 1KXPA 1T6CA 4B1ZA 3VEZA 4K42A 2FSNA 4H0VB 4FWOA 3U4LA 3O4WA 1NGAA 4XH5A 3HTVA 5AQXA 1RGIA 1JCEA 1XC3A 3VGKA 4B9QA 4NB4A 3CETA 1QQMA 4H0XB 5KQ8A 2GUPA 3UKUB 1S3XA 3O5BA 1Z05A 3QDKA 1Q18A 4A62A 5AQKA 4CJ7A 1GLEG 5ADXA 1JCGA 3SMPA 4BROA 4BR5A 4DCHA 3ULEA 3FZMA 3I33A 4ISFA 4CBXA 2A41A 5KPTA 3CJAA 4EFHA 3MN9A 2QWPA 3IUCA 2DPNA 2P9LB 4K25A 4IJAA 4DB3A 3A0IX 2IIRA 5BN8A 5TKYA 3HM8A 1GLBG 3LM2A 3FZFA 2QWMA 3EKSA 3OHRA 3CHWA 1QQNA 1SZ2A 4RCHA 2QW9A 3D2EA 3H3NO 3A8YA 2ZGYA 4B1XB 3D2FB 3VPZA 2A3ZA 2IVNA 2P9KB 3B8AX 3P4IA 3MMVA 4JN4A 3F9MA 4AM7A 3M3ZA 3R6MA 4XEIA 1R59O 2P9PB 5AQHA 4BRLA 5ELZA 1Y64A 3I8BA 3FZLA 2E2QA 2CGLA 1U2VA 3R8EA 4BR7A 1NLVA 5AQWA 3HSCA 4PKGA 2YJFA 4CZFA 3CJ7A 4IO8A 2QWOA 4H5VA 1WUAA 1NGHA 2HF3A 1NM1A 2Q31A 4BRNA 1NGFA 1K8KB 2P9NA 5EXWA 3FFKB 5LJVA 3SMSA 1D4XA 4JD2A 1NGDA 1E4FT 3DXMA 2Q36A 3DAWA 3IFRA 3IMXA 1GLLO 5AFUA 3BEXA 3UE5A 1IG8A 1BWFO 3U9ZA 5I9EB 1DKGD 3H6EA 5CE3A 2Q0UA 4WQ5C 3LDLA 3QBXA 5BREA 4MO4A 3CJBA 3ENOA 4HTLA 5ADXH 1BOTO 3EL2A 1YVNA 2ZWHA 5AQVA 3A5MC 5FPEA 1BO5O 3A5NC 4PL7A 4M63C 1DEJA 4DQ8A 4BR2A 3WXJA 1T44A 1X3NA 3O1WA 2NRHA 4PKIA 5BRFA 3UKUA 4K43A 3VEXA 3WQUA 4FWQA 2BUPA 2F9TA 1U6ZA 2V51B 3VESA 3GOIA 4H5NA 4JNEA 4B1VA 3MN5A 4EHTA 1HX1A 2A5XA 5AQGA 2IVOA 4MLEA 3GBTA 2W40A 3HZ6A 4MLHA 1ATRA 2CGJA 2I7PA 2P9LA 3ZEUB 4FWSA 2NZTA 3QB0A 2V7ZA 5AR0A 4FWNA 5KPZA 2GWJA 3KHYA 3SJHA 3LL3A 3DXKB 4CZJA 2ASPA 3WEEB 3KZBA 1GLJO 3D2FA 1MWKA 2P9KA 5EOYA 4CBWA 3FZHA 2P9PA 1HPMA 5AQMA 4BR4A 1NGBA 1MWMA 4BC3A 3DWLA 4CBUA 3VGMA 3O1BA 1ATSA 1SAZA 1KAZA 1BUPA 5EY4A 5AQQA 5BR9A 2CH5A 1GLAG 3H1VX 4RTFD 4FPBA 3M6GA 4J8FA 4L3QA 4BRCA 3WXLA 5JLFA 4CZEA 1KAXA 4BRKA 1RDWX 1QHAA 3MN7A 1DGKN 1K8KA 2ASMA 3WXIA 4BC2A 5AQTA 4BRDA 4CD3A 1T6DA 3FZKA 3CJCA 4BREA 2A6AA 3L6QA 4BQZA 4BR0A 3ZX0A 3WT0A 2PBDA 3FR0A 3WQTA 2E8AA 4BVOA 2CH6A 1HLUA 4BC4A 1WOQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4O8KA 4GKKK 3QBWA 2PAVA 4UJ0A 2P51A 4CGJA 4FW1A 2QWNA 3J81O 4FOIA 3OYFA 1HJRA 4KB1A 4BQLA 4Y0WA 1KCFA 3CCSN 3FFIA 2YHYA 4M3YA 1DTQA 1K9MO 5GIPA 1OZZA 1J5OA 1DLOA 3L56A 1O1WA 3AA5X 3JAMO 5M1FA 4FJHA 1RT1A 5HRSA 4BRPA 3WNFA 2VG5A 3AGRA 4DR7K 4CEQA 3KLFA 4DR6K 3MDQA 4M42A 1TKZA 3N4QA 2XRIA 5F2RA 4BE0A 1OVYA 4MQ3A 5AQRA 3KOXA 1W9HA 2YNFA 3OYAA 1QQOA 3ZETB 4H0YB 4QS7A 4IOAL 3VQEA 3THWA 1XNQK 4HCCA 3CPWM 1U04A 4IG3A 4A2AA 3V81A 3BF1A 1TK0A 3S5TA 3ZT1A 2XY6A 2E0HA 2A1RA 2G8HA 5FPMA 4FZYA 4KAZA 3KK2A 3L4QA 4YORA 3UKRB 4JKGB 4BRMA 3CQXA 3VQPA 4FJMA 3P5JA 3HI0A 1HKGA 3WNHA 2HHSA 4O44A 3LDQA 5JMVA 3DI6A 1IKYA 1AHOA 3DM2A 3BF3A 4B1YB 4HTUA 1TYQB 3HOSA 3FE1A 3EE9A 2OTLN 1NGIA 1Z6RA 3VTHA 1SN1A 4FW2A 1Y97A 2G8FA 4DF8A 3VEVA 2P9UA 3LDSA 4DV7K 1NGCA 3FLCO 3OS2A 3CYGA 2GX9A 2Q3SA 3AARA 2YC1C 2LJ7A 1QZ6A 3CJ1A 3K5NA 2UXCK 4CERA 4UAEF 4ELTA 1I39A 2LY5A 3CCUN 3O80A 3ATUA 2A1SA 4B08A 3QEXA 4EP5A 3L3VA 1ASVA 4CI6A 3SUPA 3R1XA 4H5RA 1NKCA 4WFAL 4KHQA 1FKPA 2F8SA 1IKVA 4LF7K 2I5JA 3P31A 1RT6A 2XY7A 4JS5A 2KZMA 2I61A 3ZT3A 4BE7B 1YI2N 2HB5A 1C0UA 3C6AA 2BDPA 1K8BA 1P8ZA 4FJ8A 4JRPA 2FSJA 5BN9A 1VQPN 2X6SA 2C1GA 5J2MA 4FK0A 2UXDK 4W5TA 1EQYA 5M1PA 1ZBSA 4EP4A 4N47A 4DTRA 4IKFA 4F2SA 3TI0A 3QEPA 2LKBA 2EWSA 4H03B 1TAUA 4H4OA 4GY2B 3E7RL 3M8SA 3DLKA 3EKUA 2FF3B 1N36K 3I0SA 3VQQA 4F3OA 4DSKA 3L2VA 3V9UA 4CJKA 4YOXA 1WSIA 2O4IA 2RF2A 4YDUA 5AZJA 1YT3A 4JI0K 3ZSXA 3PX6A 3O9TA 3WXKA 4M7YA 2YIPA 3ID8A 3ULEB 1BI4B 4KHYA 4AH9A 3CCQN 2YIOA 3CFRA 4B3OA 2KTQA 1CZAN 5FPDA 2MBKA 1X9SA 1Q9YA 2ASOA 4C8NA 4FWMA 3C7NA 5KK4A 2P9SA 3D2EB 4O5BA 2HHVA 3J8AA 4IZ9A 3HPOA 1S1WA 3EY1A 4BRQA 4DHYA 1TGOA 3PSMA 1I3AA 2E1ZA 2GBZA 1G15A 4F9OA 3QFPA 4BRAA 5DMRA 3QIPA 4CJPA 5HP1A 4BECA 3VA3A 3ATVA 5C2FA 3SBTA 1YJ9N 5BPMA 4CCHA 4I6MA 2O8DB 1TUUA 2WBNA 3VA0A 4E1MA 3CJ9A 1ZYVA 3WXMB 1K6YA 3UB5A 2V7YA 3TAFA 4FPAA 3QNOA 3R3LA 2KW4A 3NF8A 3ZSOA 1XUPO 2NY8X 4BRHA 1JLGA 2KSKA 3H45C 2O8EA 1EP4A 2NUBA 4OJRA 4AEIA 4ISGA 3LDOA 3U9DA 2E3FA 1NK8A 1GPTA 1VSIA 4LF4K 5EU7A 3KLIA 3CCRN 1HNZK 4B1ZA 1Q9XA 4DU3A 3VEZA 4BWJA 4QCLA 1CHZA 4B8CA 2YHBA 3U4LA 3NDKA 1LV5A 5KRSA 5AQXA 2E2FA 4XJXA 3B6OA 3V9WA 3LP0A 2YNGA 1VSKA 4M3TA 3K5OA 5KGWA 2VY6A 1QSLA 3NMUA 3O5BA 4CW7B 1YITN 2HHWA 4CJ7A 3EEQA 5KGXA 1EETA 3SV3A 3S3MA 4KH4A 2KZZA 3HP6A 4CJSA 3OJUA 1SKRA 3OYGA 4ISFA 1WNSA 3LANA 3E1YA 5KPTA 4DTXA 1KC8O 1BCMA 3AVFA 1JL1A 4TSXA 2HVHA 1HNIA 1JZAA 2NRRA 2D0BA 4C1NI 1CZ9A 3A0IX 3OTOK 5BN8A 4M45A 3TR8A 1JLFA 2E6LA 3HM8A 3LM2A 3FZFA 4M3RA 2QWMA 3OHRA 3LWLA 1QQNA 3NFAA 3P1GA 2PFUA 2QW9A 1K73O 2MN5A 4BROA 3D2FB 4NCGA 3AVHA 3B8AX 1NK0A 3M3ZA 1R59O 4JKBA 5AQHA 2ZJPL 2B3CA 4J2DA 4BRLA 3AVCA 4U7BA 3E9PA 3I8BA 3G6EN 3FZLA 4CECA 5C10A 3WNGA 1NMNA 3S9HA 4DLGA 1XNRK 4V1DC 2VGNA 5AQWA 3T19A 3E9LA 3CJ7A 3AO2A 4IO8A 4J2BA 3V1QA 2OZSA 1DQ7A 5DM7L 3NAEA 1T0ZA 1NGFA 1K8KB 3EE8A 5EXWA 4CJVA 4K0KK 1D4XA 4I2PA 4JD2A 1T7AA 1E4FT 2LSNA 5FLXO 3ZYYX 3DXMA 3O3FA 2VG6A 4DUYK 4L8RB 1XHXA 1TAQA 5AFUA 1TVRA 3BEXA 3U9ZA 4DTOA 2HHXA 4M3ZA 1NJYA 4IOXA 5CE3A 1PX9A 2Q0UA 4DSLA 1O13A 4CF0A 1S9EA 3DRPA 4HTLA 2G8IA 4N56A 5ADXH 1BOTO 4K8ZA 2ZWHA 5AQVA 5FPEA 1BO5O 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4O8K A;  4GKK K;  3QBW A;  2PAV A;  4UJ0 A;  2P51 A;  4CGJ A;  4FW1 A;  2QWN A;  3J81 O;  4FOI A;  3OYF A;  1HJR A;  4KB1 A;  4BQL A;  4Y0W A;  1KCF A;  3CCS N;  3FFI A;  2YHY A;  4M3Y A;  1DTQ A;  1K9M O;  5GIP A;  1OZZ A;  1J5O A;  1DLO A;  3L56 A;  1O1W A;  3AA5 X;  3JAM O;  5M1F A;  4FJH A;  1RT1 A;  5HRS A;  4BRP A;  3WNF A;  2VG5 A;  3AGR A;  4DR7 K;  4CEQ A;  3KLF A;  4DR6 K;  3MDQ A;  4M42 A;  1TKZ A;  3N4Q A;  2XRI A;  5F2R A;  4BE0 A;  1OVY A;  4MQ3 A;  5AQR A;  3KOX A;  1W9H A;  2YNF A;  3OYA A;  1QQO A;  3ZET B;  4H0Y B;  4QS7 A;  4IOA L;  3VQE A;  3THW A;  1XNQ K;  4HCC A;  3CPW M;  1U04 A;  4IG3 A;  4A2A A;  3V81 A;  3BF1 A;  1TK0 A;  3S5T A;  3ZT1 A;  2XY6 A;  2E0H A;  2A1R A;  2G8H A;  5FPM A;  4FZY A;  4KAZ A;  3KK2 A;  3L4Q A;  4YOR A;  3UKR B;  4JKG B;  4BRM A;  3CQX A;  3VQP A;  4FJM A;  3P5J A;  3HI0 A;  1HKG A;  3WNH A;  2HHS A;  4O44 A;  3LDQ A;  5JMV A;  3DI6 A;  1IKY A;  1AHO A;  3DM2 A;  3BF3 A;  4B1Y B;  4HTU A;  1TYQ B;  3HOS A;  3FE1 A;  3EE9 A;  2OTL N;  1NGI A; 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