1SQKA

Crystal structure of ciboulot in complex with skeletal actin
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
367
structure length
360
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The beta-Thymosin/WH2 Domain; Structural Basis for the Switch from Inhibition to Promotion of Actin Assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Structural protein/protein binding
molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
total genus 115
structure length 360
sequence length 367
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1sqkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1sqkA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1sqkA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1sqkA04
4I6MB 4CZEA 1ATSA 2E20A 3UKRB 1BG3A 2P9KB 4BR2A 4F9OA 3WXJA 2QWPA 1NWKA 2Q0UA 3D2EA 2QXLA 5JMVA 3LDNA 4H5NA 4ISEA 1Z05A 4XH5A 1U2VA 3R9PA 3W0LA 3KHYA 1JCFA 1BA0A 3D2EB 5KPRA 5LJWA 4JAXA 2E2QA 2V51B 5F2RA 3O1WA 4H0TB 3UKUB 2ASMA 3W3DA 1CZAN 1NGGA 5EOYA 3O5BA 4B1VA 1IG8A 2BTFA 2WUSA 4WQ5A 5FPMA 4YDUC 2CGLA 4EHTA 3U4LA 4QS8A 3C7NA 1T6DA 1QQOA 1QQMA 2FSJA 1NBWA 3JS6A 3U9ZA 4FWLA 1V4SA 4IJNA 3MCPA 1C0FA 3WXLA 3MN6A 2P9LB 3DXKA 1BWFO 3BF1A 4FPAA 3VENA 1TUYA 3CJ1A 3FGUA 4DB3A 2GEMA 2E8AA 2VYPA 4BR5A 4EHUA 5AQSA 4CBUA 2CGJA 3ZETB 1KAXA 2YHYA 4FOIA 4MO5A 4CZHA 3CQYA 4JHDA 2P9UA 4J8FA 3BP8A 1X3NA 2V7ZA 2YJEA 1T6CA 1BOTO 3GDQA 1HLUA 4H0YB 3A8YA 3FR0A 4JD2B 1WUAA 4CZIA 2Q1NA 5AFUA 3ENOA 3CJAA 2A41A 3O1BA 1ATNA 3VERA 3P4IA 1KAZA 1MA9B 3ID8A 2GTDA 3QICA 4CD1A 2GELA 1NGDA 4FWNA 3LDQA 3VEOA 2F9TA 3CQXA 3MK6A 4B1XB 3WT0A 3M6GA 3FE1A 3H6EA 3HI0A 3TU5A 3WQUA 1GLLO 2HOEA 4CJ7A 1OKJA 2D0PA 2KHOA 2AA4A 3LM2A 5EY4A 5AFUH 3UB5A 3WUHA 4BC3A 5KPTA 2E2OA 2NRHA 2Q36A 3HSCA 4XEIA 1QZ6A 1U2VB 3FZMA 3H46O 4BRIA 4M63C 4BC4A 4CZFA 3A0IX 5AQJA 3HM8A 2IVOA 5BPLA 5AQNA 4WQ5C 2I7NA 4C23A 5KQ8A 4BG8A 3WEEB 3MN9A 2A5XA 1R59O 3VF6A 1BDGA 4BC5A 3CERA 1H1VA 3CIPA 5E84A 5BRDA 3I8BA 1Q18A 4BRLA 4FSVA 1TYQB 4IJAA 4BRCA 2QWMA 3EL2A 2VWBA 1HUXA 2ASPA 5AQGA 2IVNA 1KXPA 3FZKA 3M3ZA 4H0OA 2YCHA 3CHWA 3CJBA 1P8ZA 3VEZA 3EKUA 3DXMA 1NGEA 3RSEA 2HF4A 3BEXA 1X3MA 5JICA 2W40A 5E26A 4LC9B 1JCGA 1TUUA 2D0OA 1NGCA 4JNEA 4M7YA 5ADXH 4I6MA 5FPNA 3RSEB 2I7PA 2A40A 2QWNA 3FLCO 3B8AX 1X9JA 4BR4A 3CJ9A 1QQNA 2E2NA 4IWVA 4O5FA 4K42A 3EZWA 4XH4A 4BVPA 4BRFA 3AY9A 5AQFA 2P9SB 1ZBSA 4XH1A 2P9IA 5AQZA 4RCHA 4CBXA 1RDWX 1NGBA 2P9KA 4FWPA 3O80A 3H1VX 5EXWA 2FSKA 4EFHA 3DWLA 2CH6A 3IFRA 3LL3A 3GG4A 2IVPA 3VF4A 3WEEA 1E4FT 3H3OB 4BREA 5AQLA 3ULEB 4DQ8A 3FZHA 3QBWA 5AQRA 3VEWA 3LM9A 4CZGA 1Z6RA 2E88A 3MMVA 1J6ZA 4IZ9A 3ZEUA 5AQQA 1HKBA 2QWLA 4B1ZA 4EAHD 3WXIA 2E1YA 4BC2A 3EO3A 3UE5A 2Q2RA 2A42A 4FWMA 4BR0A 5B8HA 2BUPA 4PKIA 4BGBA 2HF3A 2QM1A 4E1JA 4BQLA 4L3QA 4CD3A 4NO7A 4PKHA 5ADXA 4H0VB 1DKGD 3EN9A 4JHDB 3VPZA 3G25A 5AQOA 4WYBA 2FF3B 4MLEA 5AZIA 4FWQA 4DHYA 2P9PB 1WOQA 4BRHA 4EIAA 3AAQA 4RWTA 2YHXA 2D1KA 4RTFD 3D2FA 5I9EB 2E2PA 2NZTA 3IMXA 3MN5A 5F0XA 2A3ZA 1JCEA 5LY3A 1NGIA 3CJCA 2PAVA 2QWRA 4HTLA 4BRAA 3ENHA 1ATRA 3I33A 3VEVA 4A61A 2Q97A 3A5OC 3H3NO 3VOVA 5LJVA 4GY2B 4CZKA 1XUPO 4O8KA 4H03B 3C0BA 1BUPA 1ESVA 3BF3A 3L0QA 3HZ6A 4BRQA 1GLCG 2FSNA 2VCPA 3KVGA 4H5WA 1BO5O 1Y64A 1S22A 4FOEA 3EKSA 4ISFA 3O08A 3ZX3A 3IUCA 3A5MC 5BREA 3F9MA 2V7YA 3VETA 1YAGA 4FWKA 3FZLA 2FXUA 4BR7A 5AQMA 3HBTA 4B1WB 5AZIB 4NB4A 5AZJA 2P9LA 5AQPA 4DCHA 1KAYA 3GE1A 3HTVA 4H5TA 5EVZA 1SZ2A 3IDHA 3DAWA 1E4GT 4FWRA 2YI1A 4WQ4C 4A2AA 3C7NB 2F9WA 5BN9A 3R8EA 1T44A 1SQKA 5BRHA 3SMPA 4CZJA 4IXCA 3QDKA 1RGIA 3WQTA 2AP1A 5KPZA 3LDOA 3H45C 1MWMA 3DJCA 4FPBA 4FWOA 3U8XA 4BRNA 1NGJA 4CBWA 1ZXOA 1U6ZA 4CI6A 3WXKA 1D4XA 3QFPA 4FWSA 5AQIA 2P9NA 1EQYA 3ULEA 4JD2A 1HKCA 3KZBA 5FPDA 2QW9A 3QBXA 4MLHA 3O8MA 3QFUA 1C0GA 1QHAA 2UYTA 1S3XA 3CI5A 3CJ7A 3L4IA 3R6MA 1LOTB 2P9UB 2J4RA 1G99A 1XQSC 4K41A 3GOIA 4CZMA 2P9IB 1K8KA 4PL8A 3H1QA 1HKGA 5TKYA 5AZJB 4BVOA 2NLXA 5ELZA 2GWKA 2IIRA 4FO0A 4GNIA 4Y0WA 4B1YB 4AM6A 1XC3A 2FLOA 1RFQA 1NGFA 4WQ4A 1TYQA 1NGAA 3A5LC 1NLVA 4H0PA 5BPNA 3S41A 3MN7A 1DGKN 5F1XA 1NM1A 1YXQA 4IO8A 1NMDA 4B9QA 3VEXA 4BRGA 3ZEUB 2CH5A 4K25A 2ZWHA 2P9PA 2A6AA 3BUZB 4QS7A 3ATUA 5FPEA 3SMSA 5AQVA 2D4WA 2QWOA 3AAPA 3DXKB 1HPMA 2ZGZA 2CGKA 4AM7A 2EWSA 4BROA 4BRPA 3ZX2A 3GBTA 3OHRA 3SJHA 2GWJA 5JLFA 4BRMA 2Q31A 3DXMB 5AQUA 2P9SA 3QB0A 4YDUA 2W41A 1BU6O 2YJFA 4JN4A 5AQHA 4BQZA 3D2FB 5KQDA 4BG9A 1GLEG 3JXUA 1NGHA 1LCUA 1K8KB 2HMPA 4BRDA 3UKRA 3VGKA 5BPMA 4CZLA 5AQKA 3LDLA 4FL9A 3J8AA 4H5RA 5AQYA 4PL7A 2V52B 5BN8A 2QWQA 2Q0RA 3U9DA 3O6WA 2PBDA 2ITMA 2E1ZA 3ATVA 3L6QA 3UKUA 4KBOA 3VGLA 3M1FA 3SLCA 3A5NC 3VF2A 5AQXA 5BRFA 3QMLA 4BR9A 3VEYA 4ISGA 1HX1A 3MDQA 1GLDG 1MDUB 1SAZA 3SK3A 2ZF5O 3CETA 5AQWA 5AR0A 2FF6A 4A2BA 4B1UB 1GLFO 3FZFA 3VGMA 4K43A 1HJOA 4MO4A 3O4WA 2OANA 3LDPA 1ZC6A 1DEJA 1QZ5A 3VESA 1GLBG 2P9NB 4A62A 4QS9A 4H0XB 5CE3A 3TPQA 3ZETA 2GUPA 1YUWA 4Z94A 4H5VA 3GL1A 4BRKA 5JLHA 5AQTA 2ASOA 1GLJO 3FFKB 2DPNA 1GLAG 2ZGYA 5EX5A 4M7XA 5BR9A 1BA1A 4HWIA 3ZX0A 4PKGA 2YHWA 4BGAA 1YVNA 3D7EO 2H3GX 1MWKA 1V4TA 3AARA 1IJJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4I9LA 4CZEA 5JENA 2F8TA 3UKRB 2KZZA 4W5OA 4BR2A 3HL8A 4YY3K 1QSLA 3WXJA 1HQEA 2Q0UA 2QXLA 4AHTA 4C8KA 4IFYA 3NVKA 4KHQA 4ISEA 4Q0BA 1U2VA 3KHYA 1JCFA 2GUIA 3L3UA 5KPRA 4JAXA 3VA0A 1IH7A 4DV2K 2F8SA 4KH6A 3UKUB 1EX4A 3W3DA 4M3TA 3O5BA 4B1VA 4CJWA 3D45A 4JS5A 5CR4A 4BDYA 3TSUA 3TANA 3U4LA 1JKHA 1VSMA 4QS8A 3NVMA 2BGGA 1IG9A 3F73A 4CGIA 1NBWA 3U9ZA 4GV9A 1V4SA 5KTQA 3AVHA 3MEGA 3VQQA 3SJJA 4JEPA 1RT4A 4FPAA 1U45A 1TUYA 3THWA 4DG1A 4F2RA 2YV0X 3FGUA 2OPQA 1M90O 1QVFM 3V1OA 4EHUA 5C42A 4CBUA 1S5JA 5M1NA 3CQ8A 2CGJA 4IKFA 3AVIA 4DR4K 4JV5K 2O8BA 3CQYA 1XWLA 4CK2A 2O8FB 4JD2B 2YJEA 4H0YB 2HNYA 3MWTA 1VAZA 3ENOA 3CJAA 4OGEA 4ID5A 1KAZA 2UUAK 4FM0A 1IBLK 3WT0A 4CEFA 4DR7K 4DTXA 2ITGA 4O5BA 2HHXA 3T69A 4BC3A 5KPTA 3WUHA 3OYLA 2JWLA 1HNXK 3TAQA 3KD1E 3DRSA 3AGKA 3HSCA 1QZ6A 2ZE2A 3FZMA 3H46O 4ELVA 4BC4A 4CZFA 5AQJA 3S3MA 2IVOA 3E01A 4WQ5C 1RDBA 3QIPA 3MN9A 2A5XA 5TKWA 3VF6A 1VSIA 1XNRK 4JLHA 4LD0A 3QO9A 2Y1JA 3AVAA 2JLEA 2FC0A 4B9SA 3CCEN 4YFUA 4IJAA 4JI8K 1HUXA 2ASPA 1KXPA 3FZKA 5DM6L 3CJBA 2O8FA 4LF9K 4F4KA 3LAKA 3BEXA 3U3YA 5C25A 1X3MA 1YI2N 1QE1A 5ADXH 5FPNA 4FZYA 4WFNL 3FLCO 2PYJA 4RW7A 1RT6A 3CJ9A 4KKOA 2E2NA 1BQMA 2FBVA 3AY9A 3ZSYA 2C1IA 1IO2A 2YNHA 3QLHA 2P9KA 4CEDA 3AO2A 4FWPA 3H1VX 1WLJA 3CPEA 3O9QA 2Y1IA 2ZM6K 1RT5A 4EFHA 4HVJA 3DLLL 3DWLA 4BEBA 2CH6A 3LL3A 3SAFA 4IOAL 3H3OB 1XC9A 3FZHA 3QBWA 3TI0A 4HUEA 4FYDA 4FM1A 1VQ4N 4Z4CA 2Z1JA 1J6ZA 3R3LA 1NJIO 5AQQA 1HKBA 4IFEA 4A5AA 5CHIA 1XNQK 5M1QA 3DOLA 2WFBA 3UE5A 2Q2RA 2A42A 4FWMA 1UOCA 2QI2A 5B8HA 1HQUA 4O0JA 4YHHK 4KHUA 4PKIA 1QSSA 2HF3A 2HW3A 3THVA 1VSFA 4CD3A 1T8EA 5C2FA 3NHGA 3SBGA 2P5OA 2WBNA 4ZTFA 5AQOA 1TKZA 1NK4A 4FWQA 1OVQA 4DHYA 4I2QA 2P9PB 5HROA 2R7YA 4RWTA 1T3VA 3P5JA 1BISA 4DMNA 4JK9A 4DS5A 1NOZA 4LY7A 2W42A 4DSKA 1NGIA 3KLIA 3CJCA 2YNIA 3I33A 4HUGA 4H4MA 4BWMA 3KLFA 1KLNA 4JI0K 4CECA 4B3TK 1JXBA 1QHTA 4KHSA 2QXFA 4O8KA 3S5TA 3BF3A 3UIQA 3VQ9A 2G8WA 3TSQA 1QQCA 3DI6A 1BGXT 2VCPA 2NRRA 4H5WA 4E1MA 3TAMA 1Y64A 5CY4A 3KLEA 2YX6A 1HJRA 3ZX3A 4JKGA 3CCJN 1BIZA 3F9MA 3FZLA 4FLZA 3V81A 1WAJA 3VQDA 1X9WA 3HBTA 3AA2A 1UAXA 3E1YA 3I55N 3O9SA 2F4VK 2ZJRL 2P9LA 5AQPA 3KKSA 3K5MA 4DCHA 3HTVA 3QEIA 4H5TA 3HVRA 4CFAA 4NXNK 4B3RK 3DAWA 3OYFA 1RT7A 4A2AA 4FZZA 5BN9A 3R8EA 5A2QO 3LZIA 3LPUA 2YHAA 3SMPA 4CZJA 3CCSN 4NXMK 3G0ZA 3K57A 1VSDA 1S1WA 3QDKA 1JLFA 5KPZA 3LDOA 3KIOA 2Z1GA 1MWMA 3DJCA 5CZ2A 4FWOA 1YT3A 4FJMA 1ZBIA 4CI6A 3WXKA 2NRZA 3QFPA 3ULEA 1NJWA 4JD2A 4DFKA 5FPDA 3TAFA 1HYZA 1RT3A 3OYJA 1WSGA 1C0GA 4AF1A 2F7TA 4E1NA 3HOSA 5C12A 3GOIA 3NF7A 4CZMA 2P9IB 1HKGA 1ILYA 1DLOA 2HBJA 5ELZA 4IG0A 4GV6A 3CCLN 4O8UA 2FLOA 3O9RA 1NLVA 4JKBA 1VQ9N 2KQ2A 3ITHA 4DR2K 3PV8A 5JVGL 4IO8A 4CEZA 3CFPA 4B9QA 4BRGA 3ZEUB 1GOAA 1ASVA 4CHQA 3RR8A 4K25A 2C1GA 4IOXA 3T3FA 4KTWA 5FLXO 2XHBA 3V9WA 4PY5A 4AM7A 2EWSA 1LW2A 1VHXA 4O44A 1KRPA 2GWJA 3HK2A 4C8OA 4OGCA 1WN7A 5KRSA 2O8BB 4DV7K 3CD6N 4CJPA 4BECA 2YJFA 3IRXA 3CFRA 1RDAA 2B5JA 2QTDA 5KQDA 1A5WA 3DRPA 4BG9A 3AO3A 1LCUA 3SUPA 4W5RA 4XIUA 4FLWA 2HMPA 4CK1A 1W2BM 3OS0A 2VQFK 3CC7N 4X66K 2ZD1A 1TL3A 2G8FA 1NK0A 3ID6A 2Q0RA 3U9DA 4V19S 3LWMA 3G4SN 1WSJA 2E1ZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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