1SQKA

Crystal structure of ciboulot in complex with skeletal actin
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
367
structure length
360
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein/protein binding
molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
publication title The beta-Thymosin/WH2 Domain; Structural Basis for the Switch from Inhibition to Promotion of Actin Assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 115
structure length 360
sequence length 367
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1sqkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1sqkA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1sqkA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1sqkA04
5ADXH 2YI1A 4H0YB 5BPNA 3MK6A 1BA1A 4M63C 3GBTA 2E2QA 1P8ZA 2E2NA 3LM2A 3C0BA 3O6WA 1ATRA 5AR0A 4QS9A 3ZX3A 5ADXA 2E20A 4CZGA 1U6ZA 3LM9A 2W41A 4BRAA 1NGGA 1OKJA 2J4RA 3GL1A 2Q0UA 3O08A 1X3NA 2KHOA 2YHWA 3LDQA 1BOTO 1IG8A 1CZAN 4BGAA 4EAHD 3DXKA 4B1UB 4NB4A 3CQXA 5FPDA 1KAYA 4J8FA 2F9TA 5EXWA 3WXJA 4BRGA 2P9IB 2PAVA 4YDUA 3I8BA 3M1FA 2P9SA 5AQJA 3TU5A 1MA9B 3FZLA 3LDPA 3FGUA 3U9ZA 3ULEA 2E2PA 5EX5A 2VWBA 5AFUH 1T6DA 4CD1A 3H6EA 3IDHA 3LL3A 1E4GT 3AAPA 3FR0A 3O1BA 1QQNA 1Y64A 2QWNA 4CZEA 2QWPA 3DWLA 2P9KB 4K25A 2ITMA 4GNIA 5AQNA 4Y0WA 4CJ7A 3IFRA 1IJJA 4MLEA 1NM1A 4BRPA 1GLEG 2GWJA 3VOVA 5JMVA 3OHRA 2YHYA 3AARA 2QWMA 3ENOA 1Z05A 3DJCA 1YXQA 2P9LB 4A61A 4IO8A 2GELA 4PKHA 2FXUA 3D2EA 4BC2A 4MLHA 4FPBA 5E26A 1C0GA 5FPMA 5FPEA 3EL2A 4L3QA 1E4FT 5AQPA 3FZMA 3WQTA 3D2EB 1DKGD 4B1VA 4H5WA 3ATUA 3WXKA 5BRFA 5BR9A 3A5LC 4RWTA 4FSVA 5ELZA 1S22A 1YVNA 4FPAA 5TKYA 4RCHA 5E84A 3ID8A 3CIPA 4BR9A 2CGKA 4FWQA 3MN5A 5B8HA 4CZFA 3A5MC 1TUYA 2GUPA 2NZTA 4LC9B 4CI6A 2QWLA 3BF1A 3SJHA 2IVOA 4HTLA 4B1YB 4BRKA 4MO4A 1GLBG 1H1VA 4FWLA 3I33A 4MO5A 5BPLA 2YJFA 2ZF5O 4CBXA 2BTFA 2Q0RA 3GDQA 5AZIB 3QMLA 3HZ6A 1XQSC 2FF6A 4H5TA 1KXPA 5AQIA 2E1YA 2ASOA 3LDLA 3EN9A 4H5RA 4K41A 3FLCO 5AQUA 3W3DA 4BRFA 3VF2A 5KPRA 1HUXA 1NWKA 1BO5O 4O8KA 5AQXA 3KHYA 2ZGZA 3WXLA 1HX1A 4ISGA 3WT0A 3G25A 3CI5A 3FZHA 3JS6A 2CH6A 4A2BA 4XH4A 5AQVA 3A0IX 4PL7A 3CERA 1K8KB 4NO7A 4BRMA 3VPZA 2P9PB 3BUZB 4F9OA 1YUWA 4FL9A 5EVZA 1X9JA 2P9IA 3O5BA 1V4SA 5BPMA 1JCGA 1HKBA 1U2VA 2W40A 3MDQA 4BRLA 3VEYA 2ZWHA 2UYTA 5BN9A 4BR7A 2AA4A 1ZXOA 5KQDA 4BC5A 4Z94A 3MN9A 2P9UB 3ZEUB 4AM6A 1NGIA 1U2VB 3L0QA 4H5NA 4XH5A 2CGLA 4BRIA 4C23A 2QXLA 4IWVA 5KPZA 1DEJA 1X3MA 2HF4A 4FO0A 5AQHA 4BRCA 2P9KA 2CGJA 2QWQA 2V51B 2V7ZA 3VEXA 4CBUA 3CJCA 5AQKA 4BG8A 4BVOA 4BQLA 3VENA 5LY3A 1XC3A 2HOEA 3FE1A 1WOQA 5F1XA 3B8AX 5AFUA 4CZIA 3VEOA 3QB0A 2VCPA 2P9LA 5F0XA 4ISFA 3VGMA 1D4XA 5I9EB 1LOTB 1NGCA 5BRHA 4JNEA 3H1VX 4CZKA 2VYPA 3VF4A 5CE3A 3FZKA 4BQZA 3ZETB 2A40A 3BF3A 2QM1A 3VF6A 1TUUA 3WEEB 2V52B 1QHAA 2OANA 5JLFA 1GLCG 1NGDA 5EOYA 4BGBA 2NRHA 2GEMA 5AQMA 1LCUA 4WQ4C 2I7NA 3MMVA 4DHYA 3H46O 4QS7A 1XUPO 2HF3A 3RSEB 1NGBA 2GTDA 3QFPA 4FWMA 2A3ZA 4IXCA 3ZX2A 3BEXA 5BRDA 4WYBA 1V4TA 2A41A 3GOIA 3D2FB 5AQGA 1MWKA 2F9WA 3H3NO 3ENHA 3M3ZA 3AAQA 2YHXA 1GLAG 5AQQA 4JHDA 1YAGA 4O5FA 3VETA 1GLJO 4JD2A 4CZLA 3VEVA 3QBWA 4WQ4A 2HMPA 3S41A 3ZX0A 5AQTA 4BRHA 5LJWA 1JCFA 3EZWA 1S3XA 4JHDB 4JD2B 3WXIA 3HTVA 5AZIA 2FSJA 1HKCA 3CQYA 3U9DA 4EHUA 4I6MA 3GG4A 4H0PA 4PKGA 1BWFO 2YCHA 3U8XA 4BREA 2D0OA 1G99A 3AY9A 3DAWA 1NGFA 4BROA 3CJ9A 4I6MB 5JLHA 3ATVA 3HSCA 4B1XB 3SK3A 2FSNA 1SZ2A 2I7PA 1BA0A 1JCEA 2YJEA 1HJOA 3BP8A 4H5VA 1HPMA 3UKRB 3SLCA 4M7YA 4GY2B 1QQMA 1ZBSA 1MWMA 4A2AA 4DQ8A 1R59O 1K8KA 2EWSA 2P9PA 5AZJA 3SMPA 1SAZA 4ISEA 3EKUA 3SMSA 2WUSA 4H03B 1RDWX 5EY4A 2GWKA 1TYQA 5AZJB 3IUCA 3MCPA 4FWKA 1RFQA 2IIRA 2P9UA 3EO3A 3ZEUA 2E88A 3UKUA 3O1WA 4E1JA 4FOIA 3MN7A 1ESVA 1QZ5A 5BN8A 4EHTA 1GLFO 1TYQB 4QS8A 3CJBA 1NGJA 1NMDA 3R9PA 3DXMA 4YDUC 3UKUB 1SQKA 2FF3B 2FSKA 2Q97A 1GLDG 4H0XB 3HI0A 3KVGA 1KAXA 1ZC6A 1RGIA 3QDKA 3DXMB 4BRQA 3F9MA 2CH5A 1T44A 2QWRA 1J6ZA 2BUPA 2IVNA 4B1ZA 1BG3A 4DCHA 2D4WA 4K43A 3LDOA 3A5OC 4FWPA 4CZHA 3R6MA 3WQUA 3L4IA 3P4IA 4B1WB 3DXKB 2ZGYA 1NBWA 5AQRA 4KBOA 3ZETA 4EIAA 3QBXA 2AP1A 2D0PA 1NGEA 3MN6A 3WEEA 2P9SB 2P9NA 1NGAA 3W0LA 4BR4A 3QICA 3VESA 3A8YA 3ULEB 4BRNA 3O8MA 3O4WA 1BUPA 3KZBA 3U4LA 2P9NB 5FPNA 3FFKB 2FLOA 4K42A 2IVPA 4FWNA 3RSEA 5JICA 1Z6RA 4JN4A 5AQYA 2NLXA 2Q2RA 1QZ6A 4XH1A 2H3GX 4CZMA 1MDUB 4CD3A 3D2FA 3EKSA 2D1KA 5BREA 4WQ5C 3R8EA 3UE5A 3HBTA 3D7EO 2V7YA 3H45C 2ASMA 3JXUA 5AQOA 5KPTA 1EQYA 5AQWA 5AQFA 2A5XA 3VGKA 5LJVA 3M6GA 3CJ1A 1HLUA 4XEIA 2A42A 3H1QA 1KAZA 2QW9A 4BRDA 4HWIA 2Q36A 4CZJA 3LDNA 4DB3A 4FWRA 4BR0A 3H3OB 3L6QA 4WQ5A 3VEZA 2E2OA 4BC4A 3GE1A 5AQLA 3VEWA 3C7NA 4RTFD 3O80A 4BG9A 1GLLO 4IJNA 1QQOA 4BR2A 3A5NC 1ATNA 3CJ7A 3CETA 2E8AA 3VGLA 4PL8A 3UKRA 3C7NB 2QWOA 5AQSA 4EFHA 4PKIA 1NLVA 2ASPA 4M7XA 4H0TB 2A6AA 3VERA 3FZFA 4FOEA 2E1ZA 4H0OA 3J8AA 4H0VB 4A62A 1NGHA 3HM8A 5F2RA 4B9QA 5KQ8A 4BR5A 3UB5A 2PBDA 1HKGA 1BU6O 4FWSA 5AQZA 3WUHA 1ATSA 1Q18A 4CBWA 2Q1NA 3QFUA 1WUAA 3IMXA 4IJAA 4FWOA 1BDGA 4AM7A 3TPQA 4BVPA 1DGKN 4IZ9A 4JAXA 3CHWA 1T6CA 2DPNA 1C0FA 2Q31A 3CJAA 4BC3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5ADXH 4RG8A 3LWMA 5BPNA 3MK6A 5MLCQ 1BQNA 4M63C 4CJSA 3OA9A 3QEPA 2G8KA 3C0BA 4FJ8A 4ID5A 4FZYA 3HVRA 2HBJA 4CJRA 4QS9A 3AVHA 4CEZA 4YOYA 1XMOK 4LF5K 2E20A 4M3TA 3KK3A 4BRAA 1OKJA 1VSFA 2J4RA 3I0RA 3O3FA 4EAHD 3B6OA 4B1UB 4DSEA 4I7FA 5EXWA 4ZHRA 4BRGA 4FYDA 1CXQA 2P9IB 3U3YA 2VG6A 3J80O 4FJIA 2P9SA 1S1WA 2ITGA 1T7PA 2YV0X 3K57A 3TU5A 3AVLA 3FZLA 3ULEA 2RF2A 2ZM6K 2VWBA 4H8KA 4CD1A 3CCSN 4JI8K 1SV5A 4DU4A 3IDHA 1NK4A 1E4GT 3AAPA 3FR0A 2A1RA 4KHYA 4JKHA 2QWNA 4CZEA 4E72A 1VHXA 1TK5A 4DFKA 4JK7A 1BI4B 1QVFM 2P5OA 1RT1A 1GLEG 4N5SA 3RVCA 3OHRA 2DTUA 3H08A 1NK7A 1QSLA 4OX9K 3NF7A 5M1PA 4B3SK 3NGIA 4JKBA 4PKHA 3ZT0A 4M41A 2FXUA 3LPUA 1J54A 4ILGB 4W5TA 3CCRN 4DUYK 5E26A 5FPMA 4CERA 1WSEA 3EL2A 4QAGA 3MX5A 4IBNA 5AQPA 4GKKK 5GAHP 4GV9A 4H5WA 4CK3A 1G15A 1YF5L 4B08A 2QTDA 4FVMA 4FM1A 1UA0A 3OS2A 2QI2A 3ZSVA 4CJUA 2ZQBA 4RW6A 1YVNA 2KQ2A 2DFEA 3QIOA 4RCHA 3ALYA 4NCGA 3NH1A 3E1YA 4ICLA 5K14A 5B8HA 2HB5A 1WNSA 4LC9B 2YKNA 1QTMA 1VRUA 3VTHA 4YOVA 1I3AA 1KVCA 1OVYA 4B1YB 4CESA 1JLGA 2G8HA 1GLBG 3I33A 2YJFA 2ZF5O 4A59A 3AVCA 2YNFA 3K5NA 1JJ2M 3QMLA 3HZ6A 2FF6A 4CGGA 4O55A 4C8NA 5C10A 4K41A 1VQMN 3S3OA 5HRPA 3DLGA 2QKBA 2VWKA 1VQ5N 1BO5O 4O8KA 3KHYA 1HRHA 2YNIA 4B9MA 2OA8A 3KLIA 2Z1GA 3MEGA 4PUOA 4FZXC 4KB1A 4DR2K 4B9TA 2CH6A 4KPYA 5AQVA 4KHNA 4DV7K 1K8KB 4BRMA 3KD5E 3P38A 4OVLA 1V4SA 3RMAA 2E6LA 2P5GA 4JLHA 4Z4GA 5KQDA 1K6YA 4BC5A 4Z94A 3S5TA 3ZEUB 4C8KA 4AM6A 3KKRA 2NRTA 3OYDA 3ZSWA 1L3TA 4CGJA 2YKMA 1N36K 5FRNA 2GV9A 4FJGA 1IKWA 4RW8A 1TKXA 2V51B 1M1KO 3VEXA 3KIOA 4BVOA 1WN7A 5JENA 4BE1A 1LWFA 3VA0A 3FE1A 3DLKA 4YOUA 4JV5K 5AFUA 3VEOA 3HO1A 2OPRA 1IG9A 4JKGB 2P9LA 1LW2A 5F0XA 4BY9C 1I39A 4CZKA 4JRQA 3QNOA 3CFRA 2OZMA 1REVA 1RT6A 3FZKA 1QS4A 1VSLA 2QM1A 4HHTA 1HNIA 3DOLA 4YHHK 4JS4A 5JLFA 3OBYA 1VSEA 5EOYA 4V19S 2NRHA 4CEOA 2D5RA 4I9LA 3LP3A 5GIPA 4B9VA 3SAHA 1M90O 3H46O 3MXIA 2DFFA 1B92A 3O9SA 4NXMK 3HPGA 1RT5A 4IKFA 3O9QA 2A41A 2HBKA 3T1YK 1MWKA 2F9WA 3ENHA 2O8CB 1GLAG 3TSQA 1ASVA 3TAFA 4X65K 2YNHA 3EZWA 4DR7K 4IEEA 4I2PA 4XJXA 3HTVA 1HKCA 4H0PA 3M8PA 4CGFA 5GAEP 4IFVA 1RBSA 1SL2A 5D3GA 1S9EA 5DM6L 4B3OA 4GW6A 1SZ2A 5TKWA 4CHZA 1JCEA 3BP8A 3SZ2A 3V1QA 1KLNA 3ZT4A 1QQMA 4NLCA 3PX6A 1RBVA 5M1OA 4LF4K 2GBZA 3J7ZO 1NOYA 1OVQA 3PIOL 5AZJA 2OPSA 4DR3K 4DSKA 3EKUA 4M42A 3SPZA 3SMSA 3AVAA 1RDWX 3HOSA 5CY4A 3O9RA 4A57A 3PX0A 3IUCA 4DSIA 1U49A 4K8XA 3UKUA 3O1WA 3TAPA 4M3YA 3AO1A 3V6DA 1HNVA 4KH4A 1E3MA 3CJBA 4BDYA 2W00A 2OPQA 3MXJA 3HM9A 3VQAA 1ASWA 2FSKA 5GAGP 4O5BA 1GLDG 4CHPA 1EETA 4H0XB 1QSYA 3KVGA 4CCHA 4AILC 3DXMB 2PFUA 3TAGA 2G8IA 4DSJA 4BRQA 3F9MA 3CYMA 3WNHA 4OKJA 2BDPA 1A5XA 4KHWA 2IVNA 3VTIA 3LALA 4DCHA 2D4WA 3LDOA 4HTUA 4FWPA 3R6MA 3WQUA 1RTIA 3TAQA 1NK6A 1VSHA 4LD0A 2RE2A 1SKRA 1NBWA 1CXUA 5AQRA 4M3XA 4EIAA 2AP1A 3CXCM 3DI6A 4JK8A 5SWMA 1RT2A 3EEQA 3AV9A 2HHWA 4CK2A 3O4WA 4CIFA 3S9HA 3RR7A 3NF9A 2IVPA 5CZ2A 3DM2A 1HQUA 4FM2A 2O8EB 1MDUB 4I2QA 4DR6K 3D2FA 4WQ5C 3UE5A 3HBTA 4L8RB 2EX3A 3H45C 2QA4N 4LSNA 4B8CA 5AQWA 3SV3A 4DS5A 1JL1A 2A5XA 3AVFA 3VGKA 1VSIA 4K8ZA 3M6GA 3NCIA 4XEIA 4CJ3A 1HNWK 4BDPA 3N4QA 3LDNA 3OBWA 4BR0A 3H3OB 3L6QA 5KTQA 4JI7K 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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