1SQKA

Crystal structure of ciboulot in complex with skeletal actin
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
367
structure length
360
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
publication title The beta-Thymosin/WH2 Domain; Structural Basis for the Switch from Inhibition to Promotion of Actin Assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Structural protein/protein binding
total genus 115
structure length 360
sequence length 367
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1sqkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1sqkA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1sqkA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1sqkA04
1GLFO 4JNEA 5B8HA 1QZ5A 3CJBA 3A0IX 4BRIA 2NZTA 3H6EA 5KPZA 3VOVA 4BRHA 1WOQA 3EN9A 4EHUA 4H0YB 4IZ9A 3BP8A 5F0XA 1HUXA 2A40A 2GUPA 3LDQA 1X9JA 4CZLA 4L3QA 2Q0RA 1X3NA 1Z05A 4RTFD 4WQ4C 1HJOA 2V51B 3D7EO 5AFUH 4WQ4A 3H3NO 3JS6A 3QBWA 2IVNA 5FPDA 2P9SA 3A8YA 3VPZA 2FSNA 3W0LA 3BEXA 4A2AA 1DGKN 3QFUA 1U6ZA 2E2PA 2GELA 3U9DA 3O08A 3ULEB 1NMDA 3KZBA 4CD1A 3AAQA 1ATRA 4IJNA 1BA1A 1NGIA 2W41A 4DQ8A 4BRKA 2V52B 1RFQA 1G99A 2A6AA 4JD2B 4PKHA 5BN9A 5AQZA 1LOTB 4Y0WA 4B9QA 1BO5O 3UB5A 4J8FA 2UYTA 4B1ZA 4I6MB 2VWBA 3GOIA 5FPNA 4ISEA 1V4SA 1H1VA 2YJEA 4MLEA 5AQXA 1GLDG 2ZF5O 1QQOA 1YUWA 3KHYA 1U2VB 1HX1A 4EAHD 4M63C 2P9KB 5AQMA 2CGJA 1SAZA 2ZGYA 4H0OA 3ZX3A 3ULEA 2Q31A 3D2EB 3LDOA 4BQLA 3DXKB 4CI6A 3VEWA 1ZBSA 4BGBA 4MO4A 3VEYA 4E1JA 4K42A 5AQKA 3O5BA 1MWKA 3F9MA 4JD2A 3LDPA 3BF3A 3VF4A 2GTDA 3TU5A 3VF6A 1CZAN 3WXKA 5BPMA 3CETA 4I6MA 1WUAA 4MO5A 4FPAA 1RDWX 3O80A 3MN9A 5AQTA 4BC3A 1BDGA 1D4XA 1EQYA 1KAXA 4FWPA 1JCGA 1GLJO 3WEEB 3QMLA 4JAXA 4M7XA 2Q1NA 3D2EA 1E4GT 4FWSA 2FF6A 3SLCA 5AFUA 1C0GA 4BRLA 1KAYA 3LM9A 5LY3A 4BR7A 3ZEUB 2NLXA 4O8KA 1KAZA 2DPNA 3L6QA 4FWKA 1NLVA 1X3MA 4BG9A 2QWLA 4C23A 2FLOA 3QBXA 3CQYA 1DKGD 1MDUB 2CGKA 1NGBA 3WXLA 4FWLA 4WYBA 3UKUB 4A61A 2E1YA 1QQNA 2P9LB 3LDLA 4JHDB 4DHYA 1ATNA 3WEEA 4FSVA 5AQNA 3CQXA 3R9PA 4AM6A 1HKGA 2OANA 5ELZA 3WQTA 4BGAA 3FLCO 3O6WA 3W3DA 4CBUA 2YHYA 1NWKA 3I33A 4K43A 3SMSA 1HKBA 3R6MA 4M7YA 4B1UB 3CJ1A 2YJFA 4CBXA 4GY2B 2A41A 2AA4A 2P9UB 3M6GA 4BRQA 5EXWA 1BUPA 3UKUA 2P9LA 5AZJB 2QXLA 1NGEA 4JHDA 1DEJA 1E4FT 2QWMA 3QFPA 2FSKA 4A2BA 5AQWA 2Q2RA 5CE3A 4BVPA 4WQ5C 3AARA 3VEVA 4WQ5A 1TYQB 3U8XA 5EOYA 3VEXA 3H1VX 4B1XB 4B1WB 2Q36A 3H3OB 2Q0UA 3CJCA 2W40A 2QWRA 5KQ8A 2P9UA 2P9IB 2VYPA 4BREA 2PBDA 1T44A 4BR2A 3M3ZA 4BR9A 5AZJA 4RWTA 1HPMA 2F9TA 3MN6A 2YHXA 2BTFA 1NGCA 3P4IA 2CH5A 2D0PA 3L0QA 3UE5A 3H1QA 5AQSA 1TYQA 4CD3A 5FPMA 1MA9B 3MN5A 2E2NA 4RCHA 3UKRB 1ESVA 3A5NC 3O4WA 4FWNA 3WXJA 4BQZA 3FZHA 4FL9A 5BRHA 3BUZB 2P9IA 4ISGA 4Z94A 1S22A 4BR5A 3ZETB 3C7NB 4EIAA 4PKGA 2HOEA 1GLAG 1ZC6A 4CZHA 5KPRA 4IJAA 5BN8A 1YAGA 3GG4A 1IJJA 3UKRA 4BRGA 4PKIA 4B1YB 5E84A 3DWLA 5E26A 1SZ2A 3HZ6A 1XUPO 4K41A 1MWMA 1QHAA 3VEOA 3HSCA 5EY4A 4ISFA 2P9PB 4H5RA 1Q18A 1GLBG 4XEIA 3ZETA 4FWMA 1R59O 2NRHA 3C7NA 3WT0A 3IDHA 3TPQA 2FSJA 4QS9A 3CJAA 4H5TA 5AQPA 4A62A 2CGLA 5AQQA 3C0BA 3ZX0A 4CZFA 5BRDA 2E2OA 3FGUA 3VENA 2BUPA 2D1KA 2ASOA 5AQRA 3KVGA 4BRMA 4H5VA 3VESA 3U9ZA 2A5XA 5AQYA 4DB3A 1JCEA 4CZJA 4EFHA 1YVNA 1TUUA 5AQJA 5ADXH 1NBWA 5BR9A 3D2FB 1IG8A 3MK6A 3QICA 2QWOA 1BWFO 3A5LC 2P9PA 4PL7A 3ENHA 2ZWHA 3O8MA 4KBOA 1GLLO 4FWOA 4QS8A 2YCHA 1YXQA 4FPBA 1ATSA 4F9OA 2GWJA 1BOTO 4NO7A 3HI0A 4O5FA 4BRPA 3FZLA 5AQIA 3I8BA 2ZGZA 4FWRA 4H0PA 2F9WA 1BU6O 4QS7A 4LC9B 4HWIA 3CJ9A 4FOEA 3FZKA 4BROA 5BPNA 4XH5A 2Q97A 3IUCA 3FR0A 1KXPA 4EHTA 5BPLA 1Z6RA 3RSEB 4MLHA 3IMXA 3VGKA 3CHWA 3EKSA 5JMVA 3D2FA 4BG8A 2ASPA 2VCPA 3EO3A 3EZWA 4H03B 2ASMA 2QWQA 4NB4A 4BRAA 3J8AA 3WXIA 5AQUA 4CZGA 3MCPA 2IIRA 3AY9A 3MDQA 3SK3A 3IFRA 5TKYA 3WQUA 2AP1A 3FFKB 1NGFA 3FZFA 4BC4A 5AQHA 3S41A 4CZKA 5KQDA 3GL1A 2QWPA 3O1WA 4BRCA 3RSEA 3GBTA 2EWSA 2WUSA 2PAVA 2HF4A 3DJCA 4HTLA 1J6ZA 2KHOA 1HKCA 1QZ6A 1LCUA 1NGGA 3A5OC 1S3XA 2FXUA 5KPTA 2E1ZA 4B1VA 1NGAA 1Y64A 4CJ7A 1C0FA 5LJVA 5AQVA 4FOIA 3MN7A 5ADXA 3ATUA 1BG3A 2E20A 1TUYA 5AZIB 3VERA 1GLEG 1NM1A 3ID8A 4K25A 2D4WA 2QWNA 1T6CA 1XC3A 3LM2A 4JN4A 3QDKA 2HMPA 3U4LA 1JCFA 2YHWA 2I7NA 2QW9A 3B8AX 5EVZA 4XH4A 1GLCG 4BC2A 5AQLA 3CERA 2P9NB 3H46O 3EL2A 1XQSC 5AQGA 1BA0A 4BC5A 1NGDA 1P8ZA 1V4TA 4XH1A 5AZIA 3GDQA 3CI5A 3ATVA 4GNIA 4BR4A 2IVPA 5AQFA 4CZEA 5JICA 1NGHA 3JXUA 3CJ7A 4BVOA 1RGIA 3VEZA 4BR0A 2D0OA 3QB0A 2GWKA 3G25A 3ZX2A 2J4RA 4FWQA 3LL3A 5BRFA 3FE1A 1ZXOA 2I7PA 2V7YA 4BRDA 5LJWA 4BRNA 4CBWA 3R8EA 4CZMA 3VGMA 2E2QA 3VF2A 1U2VA 2P9NA 2P9KA 3L4IA 2IVOA 3CIPA 4IWVA 3DAWA 3HBTA 3OHRA 3HTVA 2H3GX 3SMPA 4H0VB 3DXKA 3ENOA 2V7ZA 4CZIA 5F2RA 5BREA 3WUHA 4IXCA 4BRFA 1SQKA 2A42A 1K8KB 3H45C 1OKJA 5AR0A 5EX5A 3MMVA 1HLUA 3DXMB 2CH6A 2QM1A 3M1FA 2ITMA 3AAPA 3HM8A 2FF3B 3LDNA 5AQOA 3EKUA 2GEMA 4H0TB 4IO8A 1T6DA 4H5WA 5FPEA 2E88A 5F1XA 3VGLA 4H0XB 3SJHA 3BF1A 4YDUC 3GE1A 3A5MC 4FO0A 4PL8A 2YI1A 4YDUA 2E8AA 5JLHA 3VETA 4AM7A 1K8KA 3ZEUA 1QQMA 2HF3A 2P9SB 4DCHA 3O1BA 4H5NA 3DXMA 5I9EB 1NGJA 3FZMA 2A3ZA 5JLFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DTXA 1RBTA 5M1PA 3T7ZA 1RDDA 4BRIA 1RTHA 4DV6K 1WOQA 4H0YB 1QE1A 3DLGA 4IZ9A 3BDPA 3CMAN 2A40A 3KTQA 4CEDA 2GUPA 4B8AB 4CZLA 5JVGL 4WQ4C 3D7EO 3O9TA 2LSNA 3W0LA 4A2AA 4FJHA 4HTUA 3MAQA 2FBTA 3NCIA 3E66A 4CJKA 3O08A 3ULEB 4CD1A 2W00A 3AAQA 5GAHP 1ATRA 2DFEA 1UA1A 4PKHA 5BN9A 4B9QA 3HXMA 4J8FA 1NU0A 2R7YA 3QEPA 3NF9A 3VTIA 4I6MB 2VWBA 1D9FA 3ULDA 3V1RA 3AVFA 5AQXA 4R79A 1GLDG 2ZF5O 2VWJA 3L3UA 4BDZA 3THWA 4LH5A 4M63C 2P9KB 4CESA 1C1BA 4DQQA 3D2EB 3KLEA 4O0JA 4BGBA 4MO4A 1JXEA 3PV8A 3VEYA 5AQKA 3KLHA 3LPTA 4B08A 2Q3SA 4CHNA 4KB0A 3WXKA 1YI2N 3DM2A 3TWHA 1RDWX 4CGDA 4JKGB 1ZBHA 3SNNA 1TL3A 4BC3A 1D4XA 4GW6A 2D0AA 1JCGA 1JLQA 4N5SA 1TGOA 4JAXA 4JKHA 3CCEN 2YKNA 1E4GT 4FWSA 2FF6A 1C0GA 4BRLA 1KAYA 1VSKA 4UQGA 4DR6K 3K58A 4BR7A 3VQAA 2NLXA 3AVAA 3ZSXA 4UY8O 1BIZA 3VQ7A 4FWKA 4IFEA 1NLVA 1G15A 1YJWN 4OX9K 3K2PA 4FWLA 1KQSM 1ASUA 5JENA 4WFAL 3TARA 3DLBA 3LDLA 3Q7BA 4FCYA 4CF0A 4BE0A 4DHYA 4W5TA 3ZSYA 3CQXA 3R9PA 3DI6A 1EO1A 1C0MA 1U45A 1OH6A 2OANA 5ELZA 3FLCO 2YV0X 3ISNC 4ILGB 1BQMA 3W3DA 4CBUA 4PA1A 3TTCA 4X62K 4CF2A 3JSMA 4B1UB 1VSLA 2W42A 4CJQA 1QSLA 2P9UB 5J1EA 1W9HA 1M90O 4M42A 2P5GA 1RILA 1VSMA 4H4MA 5AZJB 3DRRA 2QXLA 4J2BA 1FXXA 1JLCA 1QHTA 4JHDA 1T8EA 4E72A 1DEJA 4FLWA 4DR2K 2QWMA 5M1QA 1SV5A 3RMAA 1OH5A 5EOYA 4CHQA 1NJIO 3MWTA 3AA3A 1Z25A 3E9OA 4B1XB 2Q0UA 2YHAA 1YF5L 2QK9A 4AHVA 1A5VA 5HROA 1S9GA 2O8EA 1NJXA 4IBNA 4OJRA 3VQQA 3CQ8A 3MN6A 3SPYA 2OA8A 1QVFM 2BTFA 1IKWA 1NGCA 3SPZA 1TYQA 3CFPA 4FK2A 3V9ZA 4CEOA 3SI6A 3CFOA 4CHYA 3JYTA 5SWMA 1ESVA 4FWNA 4BQZA 4DSFA 3FZHA 4YHHK 4RG8A 4E3SA 2O8DB 4Z94A 1Q9YA 3DOKA 1N32K 3C7NB 4E7HA 2HOEA 1GLAG 2RHKA 1ZC6A 4CJEA 3TAEA 5KPRA 3SAFA 3MXIA 3O9RA 1KVCA 3ID6A 4CE9A 4BDPA 2O8BA 3E9LA 3SZ2A 3GG4A 3UKRA 3AO2A 3TAGA 4BRGA 1X9MA 3DWLA 1SZ2A 3HZ6A 2YNHA 4K41A 1MWMA 1LAVA 3ZT2A 3HSCA 3I0SA 1IO2A 3NH0A 3LALA 4FM0A 2P9PB 1GLBG 3DLKA 3RRHA 4KHWA 3WT0A 4CFDA 5KGXA 3TPQA 4QS9A 4H5TA 2QI2A 3NDKA 5AQQA 5BRDA 3NGYA 1CLQA 2E2OA 3FGUA 3F2KA 4B8CA 1KCFA 3U9ZA 3NVKA 3AVCA 2FBXA 2BDPA 4DB3A 4GVMA 4EFHA 5BR9A 5ADXH 2NRZA 3D2FB 3MK6A 2QWOA 3QIPA 3A5LC 1VQ6N 5HL7L 2ZWHA 4F3OA 3QLHA 1KLMA 4JI2K 1HNZK 2YCHA 1YXQA 4NO7A 4BRPA 4O5FA 1W0HA 5AQIA 1EKEA 4FWRA 4QS7A 4EZ9A 3ZLJA 4HWIA 3VN5A 3QEIA 5BPNA 1JLAA 2VGMA 5BPLA 1VQ5N 3CHWA 4CCHA 1VSHA 4H03B 2ASMA 3HP6A 2WOMA 4QOZB 4C1NK 3OA9A 4NB4A 4BRAA 1ITGA 3N4QA 3MCPA 1YJNN 3S5TA 2X6NA 3SK3A 4KHUA 1C0TA 1NGFA 4L8RB 3L8BA 4CZKA 3T69A 5KQDA 3GL1A 2P1JA 3OYIA 3SJJA 3EE9A 4GKJK 2HBMA 5HRRA 3RSEA 2EWSA 1ZBUA 3V9UA 1RT4A 4A57A 1DLOA 1QZ6A 2XY6A 4B1VA 4F2RA 1A5XA 5LJVA 3PX0A 1GOBA 4W5QA 3S3MA 2EHGA 1BG3A 3P5JA 4AHUA 4OGEA 3HPHA 3VERA 1NM1A 2UU9K 4CGJA 1HMVA 1N33K 1JL1A 1IH7A 1JLEA 4WE1A 1JXBA 3OYKA 5T7BA 2G8FA 3QDKA 1WAFA 2HMPA 3U4LA 4ELUA 1JCFA 4AHTA 2YHWA 2I7NA 3B8AX 4PQUA 4JKEA 3QEWA 3OVNA 2P9NB 4NYNA 3VQEA 4CEBA 3H46O 3THYA 3EL2A 1XQSC 4LH4A 4DWIA 3EEQA 1RDUA 3GDQA 4C1NI 1BI4B 2RPIA 2KFZA 2HW3A 1I3AA 3EZ5A 1KRPA 1NGHA 3KWIA 1NJWA 3VEZA 2IGIA 2OYQA 3G25A 3D6RA 4CFCA 4OKKA 4CK2A 2V7YA 1TKDA 5C15A 4CBWA 3EY1A 4FLTA 2E2QA 2Z1GA 1HNIA 2P9KA 3L4IA 4FZZA 3CIPA 3NF7A 4GVEA 3OHRA 3HBTA 2KLAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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