1SQKA

Crystal structure of ciboulot in complex with skeletal actin
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
367
structure length
360
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
publication title The beta-Thymosin/WH2 Domain; Structural Basis for the Switch from Inhibition to Promotion of Actin Assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Structural protein/protein binding
total genus 115
structure length 360
sequence length 367
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1sqkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1sqkA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1sqkA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1sqkA04
2D0OA 2QM1A 4CD3A 3FLCO 3M1FA 1IJJA 5AQGA 4BRLA 2FF3B 2ASPA 3CJAA 2A41A 4MO5A 1KAYA 3C7NB 2QW9A 3WEEA 4H03B 1TYQA 3IFRA 2Q0UA 4BG9A 1ESVA 2D1KA 1BWFO 5BPMA 3CHWA 5AQMA 2Q97A 4B1ZA 4AM6A 4B9QA 5F0XA 3J8AA 1HPMA 1U6ZA 4BRNA 1DEJA 4BR9A 2P9IB 5AQTA 4EHTA 4BREA 4FWMA 3CJCA 2FLOA 3VGMA 1NWKA 1V4TA 2QWPA 1NGCA 3C0BA 4XH5A 1K8KB 1SZ2A 1ZXOA 4ISEA 4HTLA 3QFUA 2E1YA 3H6EA 1YXQA 2YHWA 4BR7A 5JMVA 2GUPA 2IVNA 3LDQA 4JNEA 2Q2RA 3MN7A 4K42A 4JN4A 2AP1A 3KZBA 3BUZB 3QB0A 5JLHA 4PKIA 2HMPA 1Z6RA 3BF3A 3I8BA 4C23A 5I9EB 2UYTA 3ZX0A 4HWIA 3H1VX 3VETA 2CH6A 4B1UB 4A2AA 4A62A 4Z94A 4IXCA 4J8FA 5FPNA 4ISFA 4KBOA 2VCPA 5F2RA 2GEMA 5TKYA 4CZKA 1E4FT 3EKUA 4EHUA 5AQYA 2NRHA 4A61A 3ENHA 4MLHA 1ATNA 4WQ4A 3VGLA 2H3GX 3LDLA 2ZGZA 5AQRA 2DPNA 4PL8A 1IG8A 1NGHA 4H5RA 3ULEA 1G99A 2GELA 2P9LB 1HKGA 5AFUA 2HOEA 3WXIA 3AY9A 4CZLA 2IVPA 3CJ7A 3MK6A 3LDOA 5AZIB 2P9UA 3O08A 1HX1A 2FXUA 2QWRA 2QWQA 2F9TA 2ZF5O 5KPZA 4YDUC 3H3OB 3WEEB 1TYQB 4H5NA 1ZC6A 3U9ZA 3O80A 3VPZA 3UKRA 1C0FA 4B1YB 4CZEA 2E2NA 3A5LC 2ASOA 4MO4A 5BN9A 4H0VB 3R6MA 2V52B 2NLXA 3VF2A 1BDGA 3HM8A 4I6MA 5JICA 1GLEG 4CZHA 4JHDA 2ASMA 5AQPA 5BRFA 4CZGA 3U4LA 4XH1A 2E1ZA 3AAQA 5ADXH 1QQOA 3QBWA 4RWTA 2E88A 3VENA 4FWSA 2GWJA 3LM9A 4CBUA 3LDPA 1KXPA 5AQJA 3MMVA 1DGKN 3SMPA 2P9SA 1NMDA 1GLFO 2QWMA 4BRIA 1T6DA 1XQSC 1YAGA 2P9NA 1GLLO 1HJOA 4F9OA 2YI1A 1XUPO 1T44A 4JAXA 4FOIA 5BREA 2CH5A 4BRDA 1H1VA 3CETA 3GE1A 3VEZA 1D4XA 2FSKA 2V7ZA 2Q0RA 4IO8A 3I33A 5AQVA 3VF4A 4B1WB 4CI6A 1MDUB 3GBTA 4JD2A 2CGKA 3QFPA 4L3QA 4BRAA 3CJBA 3AARA 4FWQA 3R9PA 4DHYA 3ULEB 4FPBA 1WOQA 2QXLA 5AQXA 4DQ8A 1OKJA 5AFUH 4WQ4C 5AQKA 4K41A 3D7EO 3SLCA 5JLFA 4M7YA 1BG3A 1NGDA 2GTDA 4FWRA 4GNIA 3JS6A 4BR0A 4WQ5A 3S41A 3SMSA 2PAVA 3U9DA 1NGGA 1MA9B 1LCUA 3UKRB 2YHYA 5AQHA 5KQ8A 1ZBSA 4CJ7A 1S3XA 3SJHA 3VF6A 3O5BA 4BRPA 1NLVA 2YCHA 4I6MB 3TU5A 1V4SA 4M63C 3JXUA 5B8HA 1QQNA 1S22A 5BPLA 4JHDB 3IMXA 1BO5O 1KAZA 3EO3A 1SAZA 3R8EA 5FPEA 1NGBA 3ATUA 5AQOA 3UE5A 3VERA 3VGKA 4BRKA 3QMLA 5CE3A 4BC2A 5FPDA 3D2EA 1YUWA 1U2VB 4CZFA 3QICA 1Z05A 3IDHA 5LY3A 3CIPA 3DAWA 5AQNA 2D0PA 4BR5A 4XEIA 3BEXA 3H3NO 4H0TB 3O6WA 1GLBG 5AQSA 4FWPA 4GY2B 3F9MA 3GL1A 3G25A 5EY4A 3W0LA 3OHRA 4BRHA 4FOEA 3DXKA 4BVOA 2P9SB 4M7XA 3GDQA 4NO7A 1BU6O 4BC3A 2F9WA 1E4GT 1GLJO 2VYPA 4H5TA 3VEWA 1HKCA 4BROA 2FSNA 4FSVA 3O4WA 5AQLA 5EVZA 2AA4A 3W3DA 5EXWA 5FPMA 4FWLA 3ZEUA 5AQQA 5AQUA 3ID8A 1BA0A 3FGUA 3ZETA 2HF4A 2VWBA 2E8AA 4BGAA 4JD2B 1HUXA 2Q36A 2E2QA 3M3ZA 2P9IA 1RDWX 1EQYA 3MN9A 5KPTA 2P9PA 2E20A 3CQYA 3EN9A 1NM1A 2QWNA 4FL9A 4O5FA 1QZ5A 5F1XA 4WYBA 2J4RA 3EZWA 4FWNA 3A5MC 4H0YB 4K25A 4EIAA 3CI5A 5BPNA 3VEOA 3P4IA 4BG8A 3FZKA 5E26A 3EL2A 3QBXA 3VESA 2GWKA 1ATRA 1HKBA 3A0IX 3H45C 4AM7A 2CGJA 1JCGA 1KAXA 4EAHD 4WQ5C 2V7YA 3VEXA 2W40A 3WQTA 3O1WA 5AQZA 2P9KA 1BOTO 3FZHA 3D2EB 3SK3A 1BA1A 3WUHA 5BRDA 4H0OA 1QZ6A 2P9LA 4ISGA 3UKUA 3CJ1A 4CZIA 1NBWA 4CD1A 2QWLA 4IJNA 3FE1A 3MCPA 5KPRA 1BUPA 3WQUA 3DXKB 1DKGD 4Y0WA 2HF3A 2YHXA 4A2BA 2E2PA 1Q18A 2P9UB 4BRGA 2NZTA 2IVOA 4RCHA 4IJAA 3AAPA 3FR0A 1QQMA 3FFKB 3ZEUB 3WXJA 3VEYA 4CZMA 3DXMA 3DWLA 3ATVA 3HTVA 3ZETB 1ATSA 4BRQA 3WT0A 3GG4A 4IZ9A 3U8XA 4PKGA 3LL3A 1YVNA 3UB5A 2D4WA 4BQZA 4BC5A 1J6ZA 4BRCA 2P9PB 3D2FA 4H5WA 5AQWA 4BC4A 5ADXA 3VOVA 1LOTB 4RTFD 4BQLA 4FWKA 4B1XB 1P8ZA 2YJFA 3KHYA 3O1BA 1NGIA 3TPQA 1MWMA 2EWSA 3RSEA 3M6GA 5AZJA 2A40A 2QWOA 4CBWA 4BR4A 5LJVA 1CZAN 2W41A 1QHAA 3BP8A 4LC9B 3FZFA 5AQFA 3MN5A 3FZLA 4CZJA 1JCFA 2ZGYA 2P9NB 2V51B 3O8MA 2A5XA 4CBXA 5BN8A 3C7NA 2FSJA 4FPAA 3L6QA 2P9KB 3CERA 4QS7A 1NGAA 2A42A 3DJCA 3IUCA 1T6CA 3ZX2A 1MWKA 4DB3A 4QS9A 3QDKA 1Y64A 2ZWHA 4O8KA 3WXKA 5EX5A 3ENOA 5AR0A 3UKUB 4BR2A 3FZMA 5KQDA 3B8AX 4MLEA 2WUSA 4BRMA 4BVPA 4K43A 1WUAA 3LM2A 1K8KA 1TUYA 3EKSA 1XC3A 2YJEA 3GOIA 3HBTA 2FF6A 1RFQA 3A5NC 3CJ9A 3L0QA 1SQKA 4IWVA 5E84A 3L4IA 3LDNA 5LJWA 3HSCA 4DCHA 4QS8A 2A3ZA 2KHOA 2I7PA 3H1QA 3A5OC 2I7NA 3DXMB 4EFHA 4FWOA 3KVGA 4H0PA 3BF1A 1NGJA 3VEVA 4H0XB 4NB4A 1RGIA 4B1VA 1X3MA 2Q1NA 2PBDA 3HZ6A 1X3NA 2Q31A 2A6AA 3HI0A 1NGEA 3D2FB 4XH4A 1X9JA 5BRHA 1GLAG 1HLUA 1U2VA 4PL7A 4BGBA 5EOYA 1GLCG 1JCEA 4FO0A 3ZX3A 1NGFA 2IIRA 3H46O 2BUPA 4E1JA 1R59O 2OANA 2E2OA 3MN6A 5AQIA 2BTFA 1GLDG 5BR9A 4PKHA 5AZJB 3RSEB 2CGLA 3CQXA 4YDUA 3WXLA 1C0GA 4BRFA 1TUUA 4H5VA 5ELZA 5AZIA 2ITMA 3MDQA 3A8YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SUPA 3CFPA 1IJJA 3CC7N 4BRLA 4FM2A 3OYKA 2GX9A 2FF3B 2ASPA 4YNQA 2D5RA 1NOYA 2KZMA 5J2MA 4CIGA 4BACA 2HNZA 3DRPA 1BWFO 3O4QA 2F4VK 1RDBA 3CHWA 3P31A 3OYJA 1BCMA 1YI2N 2RE2A 1NJXA 4M42A 4FJ5A 3EEQA 1HPMA 4BRNA 4CGJA 4J2DA 5CY4A 5AQTA 1JLGA 1YTAA 4DV1K 4BEBA 4CF9A 3V9WA 4MFBA 1NGCA 3HRGA 1JXBA 1IH7A 4KO0A 1SZ2A 1ZXOA 4ISEA 5CHIA 4HTLA 4DTNA 3DM2A 3H6EA 3NCIA 4AQYK 1YXQA 2YHWA 5JMVA 5M1NA 2GUPA 3LDQA 2Q2RA 3LAMA 3L4QA 3KZBA 2X6SA 5JLHA 3QLHA 4PWDA 4PKIA 2UYTA 5FROA 4CEOA 2CH6A 4Z94A 1QS4A 4Z4HA 3VQDA 4C8KA 1Q81O 4EHUA 3MEGA 4MLHA 4DV3K 3LDLA 4CHQA 3SUOA 1TAUA 4FJIA 2DPNA 3MECA 4IOXA 3S3OA 4PY5A 4OLAA 3K5MA 3OYDA 3ZSZA 2GELA 4KHQA 2P9LB 4FVMA 3WXIA 3AY9A 4DSFA 4CJ5A 3LDOA 2B4JA 1OH5A 1OH6A 2FXUA 3DLLL 3VQ7A 4B08A 1VQ7N 4DV6K 1E3MA 5J2PA 4CJPA 3C6UA 1EWRA 4DR7K 4H5NA 4CZEA 3O9SA 3O80A 3VPZA 4MO4A 4JRQA 4DFPA 3R6MA 3VF2A 3HM8A 4I6MA 3D6RA 2O8BA 3K5NA 2ASMA 4LSLA 4RW4A 5CYMA 3SUNA 4NYFA 1HRHA 2KTQA 5C0YA 3ZYYX 1SL1A 2PZSA 3U4LA 2E1ZA 3AAQA 5C12A 3HOSA 4CHPA 1IKVA 3J7YP 3M8SA 1QQOA 4O55A 3LM9A 1JLCA 3PSIA 2YX6A 1KXPA 4IO9L 4DQQA 1BHLA 4LFBK 1ZBFA 1XI1A 1HJOA 4F9OA 2ZJQL 5CZ1A 4AHTA 3TWHA 3OYFA 3HO1A 3C95A 4OVLA 4CW7B 4BRDA 1H1VA 3GE1A 2FSKA 2V7ZA 1KSPA 5AQVA 3BZKA 4YFUA 4FW1A 4JI0K 2PFUA 1MDUB 5HRPA 2CGKA 4L3QA 3ZSVA 4BRAA 1VQNN 2BANA 3ULEB 4AILC 4XJXA 3NF9A 1RNHA 1VQ5N 3RR8A 3D7EO 4FJKA 3VQBA 4HVJA 5JLFA 3L2QA 4E0DA 2ZD1A 4DU3A 2WOMA 2D0AA 2GTDA 3THVA 2P1JA 3L2UA 3S41A 3CCEN 2PAVA 1NGGA 2YHYA 5KQ8A 3PO5A 1TAQA 2HBLA 2I5JA 3ZT1A 3ALYA 3VF6A 4BRPA 2QKKA 4EZ6A 3E9LA 1V4SA 4QAGA 4CK2A 3JXUA 4EP5A 3NH0A 3E66A 1BO5O 3EO3A 2YNIA 1NGBA 1U04A 4IFYA 1FKOA 3OYHA 3ZSYA 3TAQA 4CGFA 1VRTA 4CZFA 4DLEA 3QICA 4FLVA 4IEEA 3LZIA 4C8OA 3BEXA 4JK9A 4QOZB 3KD1E 3H3NO 4GY2B 1W2BM 3GL1A 4CFCA 4FOEA 4M7XA 1RBRA 3Q7BA 3B6OA 1BU6O 4BC3A 2F9WA 5LL6Z 1E4GT 5KGXA 2IGIA 3IG1A 3TSPA 4UY8O 2FSNA 2HHTA 3HVTA 3VQ9A 5AQLA 3G71N 3QNOA 3W3DA 4GKKK 5M1KA 2P5OA 5AQQA 3ID8A 3FGUA 4Z4IA 3CC4N 4YOUA 4BGAA 4JD2B 4JK7A 1HUXA 3THXB 3T3FA 1DLOA 2P9IA 4MQ3A 3OJSA 3TR8A 3ZSOA 3MN9A 2VQEK 1TKDA 3LWMA 2P9PA 2VQFK 2G8UA 1D8YA 4Q0BA 4O5FA 4AHRA 5GINA 1NJYA 2OA8A 3I0RA 4AHCA 3PX4A 1XMOK 4FWNA 4JK8A 3QEPA 2F7TA 3N4PA 4YOTA 3CI5A 3TSUA 1HNZK 4CECA 5I42A 3SAGA 5DK5A 4MDAA 4DUYK 5BPNA 4CEQA 2HHXA 5E26A 3QBXA 4E7LA 2VG5A 2GWKA 1JLBA 2OZSA 3H45C 4AM7A 3DI6A 4EAHD 4JS5A 4ELTA 1VSDA 3V9XA 1FKPA 1VQ9N 3CCVN 1LWCA 5AQZA 3FZHA 1CZ9A 4NLCA 1BA1A 5C25A 1R0AA 4KB1A 5I3UA 1QZ6A 1K73O 3NHGA 4FJJA 3OYIA 3AVLA 3MCPA 5KPRA 1BUPA 3WQUA 4CGGA 3KK1A 3AA4A 4GVMA 4CJVA 4DR5K 3C6AA 4A2BA 3L2RA 1F21A 4DTMA 5JS2A 3PIOL 4BRGA 4ZHRA 1S1UA 4B3MK 4E3SA 2HNYA 1HQUA 3P5JA 5KGWA 3WXJA 1Q9XA 3V81A 4CESA 5M1PA 3WNGA 3ATVA 3HTVA 4NXMK 3ZETB 4LFCK 5LMUK 3GG4A 1SUQA 3U8XA 4FK2A 1CZBA 3OYAA 4BQZA 1J6ZA 4CEBA 2O8BB 4GW6A 2KFZA 1RTJA 1RBTA 2FBYA 1RDAA 4H5WA 4OPHA 1BL3A 3VOVA 1LOTB 3KJVA 1IKXA 4DF8A 3SBGA 4FWKA 4B1XB 1P8ZA 2YJFA 3KHYA 1A5XA 3THYB 4LSNA 2EWSA 2QWOA 4CBWA 4NCGA 1QHAA 1Q8IA 2C1IA 3ULDA 1B9DA 1JCFA 2V51B 3M8RA 2A5XA 4F3OA 4IDKA 5BN8A 1RT5A 2DFFA 2FSJA 1W7AA 1RTDA 3LZJA 1C0UA 4OJRA 1G15A 3CERA 3QESA 1LV5A 3ZX2A 2O8CB 2JWKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1WNS A;  4C1N K;  1ZBL A;  4CBX A;  1Q82 O;  2W6K A;  4CF1 A;  1SL2 A;  3C7N A;  4FPA A;  4WE1 A;  4WFN L;  3SYZ A;  4NXN K;  1JLA A;  3L3V A;  3L6Q A;  4QS7 A;  1SKR A;  3C65 A;  2A42 A;  3NH1 A;  1MWK A;  4DB3 A;  1Y64 A;  2ZWH A;  2XY7 A;  5GAG P;  5AR0 A;  4BR2 A;  3FZM A;  3K2P A;  4JKH A;  3J7Z O;  4B9T A;  3QNN A;  2QK9 A;  4FYD A;  3G10 A;  4JI2 K;  1K8K A;  2F96 A;  1TUY A;  2YJE A;  4DR6 K;  1HYV A;  1TKX A;  3A5N C;  3CJ9 A;  1SQK A;  4IWV A;  4CEE A;  3L4I A;  3LDN A;  5LJW A;  4FJL A;  1XC9 A;  4QS8 A;  4OKJ A;  1YHQ N;  1NOZ A;  1N33 K;  3VEV A;  5A2Q O;  1YIT N;  4ZTF A;  4NB4 A;  2JLE A;  1X3N A;  5DMR A;  4KI4 A;  3HI0 A;  4OKE A;  1OVQ A;  3ZSW A;  4FJN A;  4PL7 A;  5H1S Q;  1YJN N;  5EOY A;  1NGF A;  3HJF A;  5FLX O;  1R59 O;  3PX6 A;  4JV5 K;  2HVI A;  5JVH L;  3S3N A;  1KD1 O;  1XWL A;  2DY4 A;  2W42 A;  3KK3 A;  2FBV A;  4C8N A;  4BRF A;  5HBM A;  2P5G A;  1IBM K;  2YNG A;  4DQS A;  4H5V A;  5ELZ A;  5AZI A;  2A1S A;  3MDQ A;  4CHZ A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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