4FOIA

Crystal structure of recombinant human hexokinase type i mutant d413n with glucose 1,6-bisphosphate
Total Genus 331
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
331
sequence length
899
structure length
899
Chain Sequence
DDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGVEGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLGVEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVNGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLTKDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Hexokinase-1
publication title DETERMINATION of SITE AFFINITY CONSTANTS FOR PRODUCT INHIBITION OF WILD-TYPE AND MUTANT FORMS OF RECOMBINANT HUMAN HEXOKINASE TYPE I
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 331
structure length 899
sequence length 899
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2012-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4foiA04
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4foiA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4foiA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4foiA03
3HI0A 2VYPA 4CBUA 5KQDA 5KPZA 4CZKA 1U6ZA 3HTVA 2W41A 4WQ4A 4BRIA 2HMPA 2YHXA 2IVNA 4DHYA 2P9KA 1NM1A 2NRHA 4FWMA 5KQ8A 2GEMA 4O5FA 3UKRB 4NO7A 3LDPA 3LM9A 2PAVA 3VEVA 1GLDG 4JNEA 5AZIB 3WEEA 3OHRA 5JLHA 3VGMA 4BROA 1HX1A 4EIAA 3FZLA 4FOEA 4QS9A 4F9OA 3O6WA 3QMLA 4YDUA 2P9UB 5F0XA 2E88A 5BN9A 3DJCA 5BPLA 5ELZA 3O1WA 5AQIA 5AQPA 4BRDA 3SMSA 4I6MA 4BRNA 4DB3A 3QFUA 3LDOA 4A2BA 3EKSA 1T6CA 3VF4A 3WQUA 5JLFA 4EAHD 2ASMA 1EQYA 3SK3A 1OKJA 3VETA 2GWKA 4H0TB 1NGBA 2FLOA 4O8KA 3DXKB 2A41A 3MK6A 1DKGD 2DPNA 4BQZA 1XC3A 4BQLA 5CE3A 4K25A 2CH5A 5E84A 1JCFA 1T44A 4RTFD 2V52B 3WXKA 5BRFA 4WQ5C 3VEZA 4BC3A 4Z94A 5AFUA 4JD2B 4B1UB 2QWOA 3QBWA 3ZETA 2P9IB 2P9NA 3A5OC 3QICA 1R59O 4PKHA 1Z05A 3VOVA 5AZJB 4CZIA 3WXLA 3LDLA 1GLJO 4L3QA 4EHTA 3LDNA 2ASPA 1E4FT 1RGIA 4M63C 3MCPA 4GNIA 4B1XB 4JHDA 5EX5A 4MO5A 4MO4A 2D4WA 2CGLA 2E8AA 4FPBA 4FWRA 3CQXA 1XQSC 5AR0A 3VGKA 1Z6RA 3O5BA 3RSEA 1NBWA 2P9KB 4H5NA 5EXWA 5AQKA 1BOTO 3EL2A 1NLVA 3CJBA 3WXJA 4BR2A 2QW9A 3SJHA 2UYTA 3TPQA 4FPAA 3W0LA 4BR4A 4FWKA 1V4SA 2YHYA 4PL8A 4LC9B 5LJVA 3HSCA 1BG3A 5AQTA 3WEEB 4JAXA 3ID8A 3H6EA 3L6QA 3CQYA 4BRPA 3VGLA 3MN5A 1KAXA 5AQRA 3CJCA 3UB5A 5AQHA 1MA9B 2BTFA 4J8FA 4QS8A 2ZWHA 2CH6A 3S41A 1QQMA 3AY9A 1BDGA 3CI5A 4I6MB 1GLLO 3TU5A 5AQFA 5BPMA 5BRHA 1LCUA 4FSVA 1MWMA 3LDQA 3EZWA 1DEJA 1HKCA 2E20A 2YI1A 1TUUA 4BRHA 3CJ7A 3FZMA 3G25A 3C0BA 4K43A 3GL1A 5TKYA 1GLBG 3CIPA 1NGHA 2IIRA 4QS7A 1TYQA 4FWLA 1NWKA 4BC2A 2P9PA 3H46O 2F9WA 4IZ9A 2I7PA 1HUXA 3QB0A 4AM7A 2VWBA 5AQVA 3ZETB 4XEIA 2P9NB 4PL7A 3ZX3A 3ATUA 1NGAA 4FWSA 4EFHA 5AQOA 2HF3A 3A0IX 2D1KA 4M7XA 4BREA 3CJ9A 4BRGA 3P4IA 4ISGA 4C23A 1K8KA 4YDUC 3GDQA 3H45C 1QZ5A 4H03B 1NGIA 5LJWA 3GE1A 1NGFA 1TUYA 3RSEB 2Q2RA 4FO0A 3FZHA 3U9ZA 4E1JA 5BPNA 4RWTA 3AARA 3CHWA 5AQWA 5I9EB 3M6GA 5BRDA 5AQJA 2ZGYA 3FGUA 2P9SA 1WUAA 5FPNA 2F9TA 4BRFA 3FFKB 3U4LA 3BUZB 3A5MC 4H5WA 1RDWX 4GY2B 3L4IA 2Q97A 1XUPO 2A42A 3VENA 5FPEA 1HPMA 3IMXA 2GTDA 4HTLA 3H3OB 3ULEA 3KVGA 3U9DA 4BG8A 2W40A 5AQNA 2GWJA 2QXLA 3A5LC 1YXQA 5EVZA 3IUCA 2I7NA 3J8AA 1WOQA 4FWNA 1X3NA 5AQYA 3M3ZA 4H5TA 1HKBA 1YVNA 3B8AX 1MWKA 3D2EA 2HOEA 3JS6A 4B1YB 4BRMA 1YAGA 3EKUA 3F9MA 1TYQB 2GUPA 2YJFA 2VCPA 1ATRA 4CJ7A 1C0FA 4AM6A 3D2FA 2P9PB 3O8MA 5ADXH 3FLCO 2Q0UA 3I8BA 4BR0A 4CBXA 3EO3A 3CETA 3O4WA 1X9JA 3FZKA 4K41A 5B8HA 4BGAA 1Y64A 3H1VX 4BRCA 2A5XA 4BVOA 2CGKA 1K8KB 5AQUA 1S22A 1C0GA 3ENHA 1BA0A 2IVPA 3DAWA 4RCHA 2Q1NA 4H0YB 3BEXA 3AAPA 5EOYA 3AAQA 2ITMA 3WXIA 2YCHA 3LM2A 4FL9A 3SMPA 4CZGA 3O08A 3H1QA 3VERA 2AA4A 5BR9A 3ZX0A 1BA1A 3ZX2A 2OANA 5EY4A 2QWMA 5FPMA 5ADXA 1NMDA 3M1FA 4BRLA 4BR9A 4BC4A 5AQLA 5AQGA 3JXUA 2QWQA 2BUPA 4CBWA 4CZFA 4BRAA 2WUSA 1ESVA 5BN8A 4WQ4C 1ATSA 5AQSA 1IG8A 4MLEA 2QWLA 3ULEB 4DCHA 2FSKA 1SAZA 5BREA 1U2VA 4A61A 2E2PA 3W3DA 4JD2A 1KXPA 2EWSA 3WUHA 4B1VA 1GLEG 1D4XA 1QHAA 4IJNA 2FSJA 3D2EB 3R8EA 1G99A 4H0OA 4H5RA 3QDKA 2E2OA 2Q36A 3VESA 3ZEUA 3C7NA 4JHDB 4XH1A 3D2FB 2ZGZA 1QZ6A 1JCEA 2V7ZA 3KZBA 1NGJA 3IFRA 2A3ZA 4FWQA 1NGCA 5F2RA 1KAYA 1BWFO 2CGJA 4H0XB 2YHWA 2P9LA 1DGKN 4BVPA 3A8YA 3DWLA 3DXMA 5AQXA 2QWNA 1IJJA 5KPTA 2PBDA 3BF3A 4XH5A 3GG4A 1QQNA 5AFUH 4BRKA 2ZF5O 4HWIA 4A62A 3BF1A 2E2NA 1GLFO 2Q0RA 4BRQA 3LL3A 3EN9A 4B9QA 4EHUA 2J4RA 1P8ZA 4CZEA 1SQKA 4XH4A 5F1XA 3WQTA 1NGDA 1V4TA 1H1VA 1NGGA 5AQZA 4CZHA 2KHOA 4A2AA 4BR7A 4M7YA 2HF4A 1BUPA 1BO5O 2E1ZA 5E26A 4PKIA 2H3GX 4WYBA 2QM1A 1HKGA 1MDUB 4FOIA 1GLCG 4H5VA 3R9PA 3SLCA 4ISFA 3UKUA 3IDHA 4B1WB 1E4GT 1ZXOA 3CJ1A 3MN7A 3VEWA 5LY3A 3FZFA 3GBTA 1U2VB 1J6ZA 1KAZA 3O1BA 2QWPA 1Q18A 4BR5A 5AQMA 2Q31A 3QBXA 4WQ5A 3VPZA 3ZEUB 3O80A 3UKRA 3C7NB 3HM8A 3KHYA 1HJOA 2QWRA 3H3NO 3MDQA 4PKGA 4FWPA 4BG9A 5AZIA 5AQQA 3CJAA 4CI6A 2FF6A 3MN6A 4IJAA 3VF2A 3BP8A 3UE5A 4JN4A 3R6MA 4B1ZA 2D0OA 1ATNA 4FWOA 2E2QA 1S3XA 1T6DA 2NZTA 2GELA 3A5NC 1QQOA 2A40A 2FF3B 1YUWA 2P9UA 1SZ2A 2A6AA 4BC5A 2V51B 1RFQA 2P9LB 2P9SB 3DXMB 3U8XA 2NLXA 4MLHA 4IWVA 1ZBSA 4IO8A 3VEYA 2AP1A 1X3MA 5KPRA 4KBOA 3HBTA 4K42A 2V7YA 3QFPA 3WT0A 3DXKA 3VF6A 2FSNA 3L0QA 4CD1A 3I33A 2FXUA 3ENOA 4NB4A 4BGBA 2D0PA 4IXCA 4CD3A 1HLUA 3CERA 1CZAN 2ASOA 5JICA 1GLAG 3FR0A 3VEOA 1JCGA 4Y0WA 4ISEA 2P9IA 2IVOA 3GOIA 2YJEA 4H0PA 5FPDA 4CZMA 5JMVA 5AZJA 3FE1A 3D7EO 1NGEA 1ZC6A 2E1YA 3HZ6A 4H0VB 3UKUB 3ATVA 3MN9A 3VEXA 4DQ8A 4CZJA 1BU6O 1LOTB 4CZLA 3MMVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3BZKA 2KLAA 4BWMA 3DLRA 4DTJA 3HT3A 4LFBK 3PSIA 4KH4A 4WQ4A 1QVFM 4BRIA 4J2DA 3CCUN 2YHXA 4AHCA 1NM1A 2HB5A 1EXQA 3AO1A 3UKRB 4NO7A 4O0JA 2I5JA 1BGXT 3NH1A 3N4QA 3OYBA 3LM9A 1GLDG 3NGZA 3CYMA 4JKAA 3L2WA 1WAFA 3WEEA 3LAMA 3L3VA 4BROA 1HX1A 2G8HA 4M42A 3CF5L 2P9UB 4KH6A 1XC9A 4I9QA 5BN9A 3O9QA 1RNHA 1WN7A 4I6MA 3SAFA 4Z4EA 3QFUA 3EKSA 4JI0K 1NGBA 2DPNA 3VA3A 5CE3A 4YOYA 4JI3K 1J5OA 2KFNA 3WXKA 3RR8A 1RTHA 4FLZA 4BY9C 3C94A 3QBWA 1J5EK 4DU1A 1SL0A 2P9NA 3A5OC 2KKZA 5KGWA 4A5BA 1GLJO 3OBYA 4L3QA 1UA0A 4LH4A 1VSEA 3CQ8A 1XNQK 4HCBA 4R5PA 2E8AA 1VQNN 4LF9K 1UOCA 1OH7A 4DSFA 3V9UA 1XQSC 3PLAA 1Q9YA 4C8NA 1C1CA 2O4GA 1NKEA 1VQ7N 1WSHA 1LW0A 5EXWA 5AQKA 3W0LA 1TVRA 2HBJA 4BR4A 4CJWA 4FLYA 4IEEA 1YTUA 5HBMA 4LF8K 4KI6A 3KKRA 5AQRA 3THVA 2BTFA 4E89A 2CH6A 1NK4A 1XHXA 1L3VA 4CJ4A 2HHSA 3AY9A 4CIEA 2NUBA 3PO5A 2Z1GA 3SYZA 1YJWN 1MWMA 1DEJA 2W6LA 3MWTA 4NLBA 3CJ7A 4F8RA 3THWA 3TAGA 1RDAA 4K43A 3CC4N 3QNNA 3NBPA 1TYQA 5CYMA 3SJJA 4FJ7A 5BR8K 2ZJPL 1WLJA 1TGOA 1SKRA 2F9WA 1ZBLA 4AM7A 1XWLA 1T7PA 3ZETB 3D0PA 2O8BA 3ZX3A 1EO1A 3K5OA 4DFJA 3UIQA 3A0IX 1LWFA 1VSIA 1RDBA 2FBVA 3CJ9A 3ASMA 4C23A 1K8KA 5JS2A 3H45C 3RRHA 3RR7A 1HNVA 4N76A 2B4JA 3K59A 4OVLA 5DMRA 5HL7L 4CESA 1QTMA 2WC9A 3FZHA 1CLQA 4BDPA 3DOLA 1HNWK 3VQ8A 4DUYK 5I9EB 2PFUA 2ZGYA 4E3SA 4C8OA 2D5RA 5DK5A 2YHAA 2ZE2A 4BRFA 1NJYA 3RTVA 3RRGA 3KK2A 3BUZB 1U45A 4GY2B 3L4IA 3KLEA 3TTFA 3MEEA 5FPEA 2Z1JA 4HTLA 4B9NA 2W40A 1KVBA 4I9LA 4F2SA 1E3MA 3A5LC 4ID1A 4R79A 1N34K 2IGIA 1HKBA 1TK8A 4LFCK 1D5AA 3I0RA 5SWMA 4M3UA 2HOEA 4B1YB 4DFKA 1R0AA 1W2BM 2PYJA 1ATRA 3D2FA 3S3MA 3O8MA 3LPUA 1WSFA 1DTTA 4B3TK 4FCYA 1T05A 4ILGB 4BR0A 3CETA 3AO4A 4KB0A 2HBLA 1Y64A 4K0KK 2A5XA 2RN2A 4X64K 2OTJN 1XMQK 1WSGA 1S22A 3OYLA 4AHSA 4CJ3A 4LD0A 2DFHA 2IAJA 4YOVA 2G8WA 4GKKK 4RCHA 2Q1NA 3BEXA 2ITMA 3SMPA 4CEOA 3H1QA 1RTJA 2AA4A 4CFCA 3EYZA 4KREA 2O8FB 3TWHA 4Z4FA 3K58A 1NJIO 4B9TA 5ADXA 4BRLA 3AVFA 4BR9A 5AQLA 3JXUA 2YV0X 2BUPA 3EEQA 2E4LA 4U67L 1TAQA 5BN8A 1ATSA 3V9XA 4G1QA 4KTWA 1NG9A 1SAZA 2W42A 5BREA 1K9MO 4FM0A 4CF1A 3CG7A 2EWSA 4DR2K 3MXJA 5M1KA 2G8UA 2WONA 3D2EB 3F2KA 4X65K 3PIPL 3VESA 3ZEUA 4PA1A 1KC8O 2NNWA 1IKWA 4DR1K 5J2MA 1KLMA 3N4PA 4DLEA 2HBMA 4MQ3A 2BDPA 1KRPA 3IFRA 3HM9A 3RMDA 3BDPA 4DF4A 3SAGA 1KAYA 3K5LA 2YHWA 4BVPA 3DXMA 3DLEA 1YT3A 3LALA 3ZSWA 2PBDA 4CJEA 4A62A 2E2NA 3AO5A 2VQFK 3EN9A 5M1PA 3KK1A 1SKSA 4CZEA 4XH4A 1JL2A 5F1XA 1TKZA 1V4TA 1VQLN 4O8UA 4CZHA 4OX9K 1S1VA 1BO5O 1HMVA 4NCGA 3V9SA 1KQSM 2UUAK 4CJKA 1HKGA 2QI2A 2RKIA 4DTSA 4H5VA 2YNGA 2ZQBA 4JEPA 4ISFA 4KV8A 4IG3A 1IKXA 4FJJA 2F4VK 3SQ0A 3CJ1A 4LF6K 3O3HA 4GKJK 5MLCQ 4WE1A 3OS1A 4CHQA 3PX4A 4FJ8A 4BR5A 1S1XA 4E7JA 2HW3A 3QBXA 1LW2A 3CD6N 4FM1A 3KHYA 4RW8A 2QWRA 3T3FA 3H3NO 4CF2A 3MDQA 4PKGA 4X62K 4JI2K 4IOXA 1L3UA 3HPHA 2OPRA 3TAPA 1G15A 2XY5A 3UE5A 4B1ZA 3R6MA 1ATNA 1T6DA 3LPTA 3LWLA 4FLWA 1QQOA 2A40A 3WNHA 1XI1A 1KFSA 5SZTA 5M1OA 1VQKN 2NLXA 3MCAB 3QIPA 4MLHA 1VAZA 3CPEA 1ZBSA 3B6PA 1JLAA 5J1EA 3KKSA 3DLHA 3LP2A 3DXKA 3VF6A 1N8RO 4ELVA 3L0QA 2HNYA 4U7BA 3TSPA 3V4IA 4M3YA 5C25A 4DU4A 3JYTA 3I33A 4CFBA 2FXUA 2HVHA 4CK1A 4IXCA 2P5OA 3IG1A 5JICA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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